The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
DPKFEAAYDFPGSGSSSELPLKKGDIVFISRDEPSGWSLAKLLDGSKEGWVPTAYMTPYKDTRNTVPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
High-throughput structural genomics of yeast SH3 domains
rcsb |
| molecule keywords |
Myosin-3 isoform
|
| molecule tags |
Contractile protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
12
|
| structure length |
68
|
| sequence length |
68
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-02-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5IH2 A; 2FG0 A; 2DYB A; 3EG0 A; 3UA6 A; 1QWE A; 2C0T A; 2LNH B; 2DNU A; 1JXM A; 2PNI A; 1S1N A; 1OOT A; 2EW3 A; 3EG2 A; 1SRL A; 1K0X A; 1OV3 A; 2DF6 A; 2LX7 A; 3I35 A; 2ROL A; 4RTU A; 4OMN A; 1WXB A; 2AKK A; 2KYM A; 2YDL A; 2NUZ A; 2D8H A; 2EVR A; 1I07 A; 1KSW A; 1TG0 A; 2I0N A; 2MIO A; 2HEQ A; 1WI7 A; 2C0I A; 2J7I A; 4RUG A; 2JXB A; 2KGT A; 2DLP A; 3M0U A; 4ZNX A; 1ZSG A; 2RF0 A; 2V1Q A; 5I11 A; 1NLP C; 1BU1 A; 2DL5 A; 2KXC A; 1X27 A; 2K6D A; 1GFD A; 3THK A; 2KT8 A; 4JZ4 A; 3EGU A; 1VA7 A; 1N5Z A; 3VRZ A; 1J3T A; 5I22 A; 2JS0 A; 2HBW A; 4OMM A; 2HDA A; 2EGC A; 3VRY A; 2FEI A; 4RTW A; 2GTO A; 2F2V A; 3NHN A; 2FPD A; 3PE0 A; 4RTX A; 2EYX A; 2DL3 A; 1YWO A; 2QDL A; 2CSI A; 1ZUU A; 1M27 C; 5IHK A; 2EYZ A; 2JMC A; 3NPF A; 2LZ6 B; 1UUE A; 4J9I A; 1X2Q A; 1Z9Q A; 2A28 A; 4AFZ C; 2YUP A; 2EGA A; 2C0O A; 3RNJ A; 4Z8A A; 2A08 A; 2PZ1 A; 1UE9 A; 1X6B A; 1QKW A; 2KNB B; 1M3C A; 1YN8 A; 2AZV A; 2SEM A; 1UG1 A; 2H8H A; 2LJ0 A; 3KFV A; 2J06 A; 3TVT A; 2JM8 A; 5FWC A; 1ZUK A; 4LUE A; 4GLM A; 1UJY A; 1YCS B; 2ED0 A; 2KRS A; 1WA7 A; 2EYY A; 5IHN A; 2K7A A; 1CKA A; 2K3B A; 3EG3 A; 3VS2 A; 4CC7 A; 1K1Z A; 2LMJ A; 4CC4 B; 5IXF A; 1H3H A; 2K9G A; 1UEC A; 1M3B A; 1UDL A; 3A98 A; 1PKT A; 1JEG A; 2OI3 A; 1OPL A; 1A0N B; 4X1V A; 2DBK A; 2AZS A; 2ENM A; 1BK2 A; 4RTZ A; 4RTT A; 3VS0 A; 1NYF A; 2FPE A; 1AWX A; 3U23 A; 1T0H A; 4J9B A; 1NM7 A; 2HSP A; 2E5K A; 1K4U S; 1AZE A; 3ULR B; 1GCP A; 1OEB A; 2W0Z A; 1GBR A; 2GTJ A; 1FMK A; 4JJC A; 2JMA A; 1U5S A; 2RNA A; 2GGR A; 1PRM C; 2DM1 A; 1HSQ A; 2VKN A; 2RQW A; 3VS6 A; 2YUQ A; 3GBQ A; 2DX1 A; 4J9D A; 2RQU A; 2ECZ A; 4CC3 A; 3M0P A; 2CDT A; 2V1R A; 4HXJ A; 2JS2 A; 3NMZ C; 1M3A A; 1GL5 A; 2BZX A; 5IXB A; 5EC7 A; 4D8D A; 2CRE A; 2J6O A; 3M0Q A; 3H0H A; 3C0C A; 2ED1 A; 2EQI A; 1X69 A; 1T3L A; 1HD3 A; 1ZX6 A; 1KFZ A; 1AWO A; 1IO6 A; 4A63 B; 2J6K A; 1KIK A; 2JW4 A; 4JJD A; 2DE0 X; 4EIK A; 4M4Z A; 3RBB B; 5GJW B; 1NEB A; 5GJV B; 1GCQ C; 2BZ8 A; 1WYX A; 1QCF A; 1TUC A; 2CH4 A; 3SHW A; 4LE9 A; 1GCQ A; 3H41 A; 2DJQ A; 3NGP A; 3LH5 A; 3UF4 A; 2MCN A; 1I1J A; 4GBQ A; 3TSZ A; 4AFS C; 1ZBJ A; 1MV3 A; 3SEM A; 4AG1 C; 1HJD A; 2DL4 A; 1GFC A; 3M0R A; 2KYB A; 2YSQ A; 1Y0M A; 3FJ5 A; 4K11 A; 2KBT A; 2RQV A; 3REB B; 1YP5 A; 4ORZ A; 2EBP A; 4F16 A; 2O2O A; 1H8K A; 1YNZ A; 1BBZ A; 1W1F A; 2KR3 A; 1KJW A; 2NWM A; 1AZG B; 2X3X D; 2ESW A; 2VVK A; 4Z88 A; 1AEY A; 4J9C A; 2SRC A; 1X43 A; 4IIM A; 3O5Z A; 1JO8 A; 2YUO A; 3I9Q A; 2L2P A; 2O31 A; 2DBM A; 4LN2 A; 3EG1 A; 3M0S A; 1MV0 B; 2KE9 A; 1I0C A; 2D8J A; 4HVV A; 1ZUY A; 2J05 A; 2O88 A; 4F14 A; 1GRI A; 2J6F A; 2KRO A; 1SHF A; 4HVW A; 1Z9Z A; 2DA9 A; 1H92 A; 2A37 A; 1MUZ A; 2LQW A; 2RMO A; 1M8M A; 1UFF A; 3VS7 A; 3I5S A; 2LCS A; 2DL8 A; 2L0A A; 1T0J A; 1RUW A; 1BB9 A; 3I5R A; 1X6G A; 2FPF A; 2HCK A; 4IIO A; 2RPN A; 2P4R A; 1AWJ A; 1CSK A; 2K79 A; 2JM9 A; 5FWB A; 3IQL A; 1YWP A; 1K76 A; 1V1C A; 2M0Y A; 4LUD A; 1E7O A; 3R6N A; 2FO0 A; 4FSS A; 4Z89 A; 1RI9 A; 1XOV A; 1E6H A; 3M0T A; 4J9F A; 4CC2 A; 1UGV A; 2L3Q A; 4DEY A; 2RQT A; 4J9G A; 3VS4 A; 1WLP B; 2A36 A; 5FW9 A; 2DRM A; 1OPK A; 2CT4 A; 2YT6 A; 1E6G A; 1W6X A; 2CUD A; 2JT4 A; 1T3S A; 4WCI A; 2F2W A; 1B07 A; 2LP5 A; 1WXT A; 2KXD A; 1LCK A; 2XMF A; 1VYT A; 2AKL A; 2CSQ A; 2KEA A; 1TUD A; 2KRN A; 1WDX A; 4DEX A; 2RN8 A; 2GNC A; 4AG2 C; 1VYV A; 2GBQ A; 1W70 A; 4OMQ A; 4F17 A; 1G83 A; 1JQQ A; 2EYW A; 2DIL A; 1JU5 C; 1QLY A; 2LJ3 A; 2BZY A; 1M30 A; 1PKS A; 1NG2 A; 1NYG A; 1RLQ C; 2DRK A; 4J9E A; 2GQI A; 4AFU C; 1NEG A; 1JXO A; 2DMO A; 2KRM A; 2L3S A; 3REA B; 2O9V A; 1EFN A; 2OAW A; 5L23 A; 2EPD A; 2KT1 A; 5HCK A; 2G6F X; 4JZ3 A; 1PHT A; 1U06 A; 4HVU A; 5ECA A; 2FRW A; 3H0I A; 3CQT A; 1UJ0 A; 2O9S A; 2ROT A; 2W10 A; 1AWW A; 1PWT A; 1PNJ A; 4Y92 A; 4OML A; 1QKX A; 2L3P A; 2LQN A; 1X2K A; 3VS5 A; 1PRL C; 2YUN A; 4AFQ C; 4JPB W; 2RQR A; 1AOJ A; 1G2B A; 1K9A A; 1K0S A; 2CUB A; 2DVJ A; 4LNP A; 2M51 A; 2JTE A; 2DL7 A; 1ABO A; 1ABQ A; 1ZLM A; 1UHC A; 2AK5 A; 1B3Q A; 1U3O A; 3H0F A; 4QT7 A; 1VYU A; 1NLO C; 4OMP A; 2CH4 W; 1SRM A; 1UHF A; 2FRY A; 2VWF A; 2EGE A; 4ESR A; 2K2M A; 4R0K A; 4KRT A; 3PVL A; 3EHR A; 1CKB A; 5IHI A; 4J9H A; 1RLP C; 2EKH A; 3PVQ A; 1SHG A; 4OMO A; 2BTT A; 4JJB A; 1WX6 A; 2LJ1 A; 2X3W D; 4E6R A; 3UAT A; 3VS3 A; 3VS1 A; 3EHQ A; 4RTV A; 1Y57 A; 1WIE A; 1GBQ A; 2MOX A; 3TSW A; 2F2X A; 3QWY A; 1SSH A; 4RTY A; 3ZL7 C; 2CT3 A; 2IIM A; 1WFW A; 3UA7 A; 4HCK A; 2B86 A; 2ABL A; 1WXU A; 3JV3 A; 2D0N A; 1ARK A; 1SPK A; 4D8K A; 2PTK A; 1UTI A; 1AD5 A; 1QWF A; 3QWX X; 1FYN A; 2D1X A; 1SEM A; 2OJ2 A; 1AVZ C; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DYB A; 1QWE A; 2RHZ A; 1IXD A; 5GAM e; 3EG2 A; 2X51 A; 2K4Y A; 2EQU A; 4M7A F; 2QA4 Q; 2RI5 A; 2YHT A; 4RTU A; 1BYM A; 4BAC A; 2AKK A; 2EKO A; 3RIR A; 2YDL A; 3EGX B; 3OYC A; 5J26 A; 2HEQ A; 4RUG A; 5GMK j; 4M75 G; 1X75 C; 2DLP A; 4OGC A; 1BU1 A; 4M77 F; 2DL5 A; 3OSV A; 3OYL A; 3QG1 A; 4QVC A; 1Q7Y C; 3M54 A; 5KYX B; 1M1K U; 1M90 C; 4F04 B; 3G71 A; 2P84 A; 3QUI A; 2AIR B; 5I22 A; 2JS0 A; 3EGD B; 4OMM A; 1QVG S; 2HDA A; 3VRY A; 5LJ3 e; 2FVU A; 4ZGD B; 3CCU A; 3NHN A; 4RTX A; 5LJ5 g; 2EYX A; 2Z0W A; 4CRI A; 4M75 B; 2QDL A; 1VQ9 Q; 1ZSZ C; 1ZUU A; 4XK8 E; 2EYZ A; 3I56 Q; 1EX4 A; 5KYN A; 2BIV A; 2BE7 D; 4YTL A; 1X2Q A; 4AFZ C; 1YIJ A; 1RAH B; 1VQ8 T; 1X6B A; 3G4S T; 1QKW A; 1TTH B; 3JB9 I; 3HSB A; 2SEM A; 1W2B S; 2EYQ A; 3TVT A; 2XD0 A; 2JM8 A; 3CMA Q; 1ZUK A; 3T9N A; 1YCS B; 3OYM A; 1WA7 A; 4J8O A; 2EYY A; 3JCM Q; 1WJQ A; 3CCR A; 1CKA A; 2K3B A; 3EG3 A; 2RJC A; 1KHC A; 2FL7 A; 2E3H A; 4XTY A; 4F7U F; 3KUF A; 1JEG A; 4GLK A; 1PSF A; 2YLC A; 2YRD A; 1IZ6 A; 4X1V A; 2DBK A; 1N9R A; 3M59 A; 1JJ2 A; 1R8O B; 2CZ7 B; 3CC4 T; 4HT9 A; 1OX8 A; 1LVK A; 2DXU A; 2K3Y A; 1MMG A; 4J5Y A; 3ULR B; 1GCP A; 1VQO Q; 1FWZ A; 1GBR A; 4BE0 A; 1RAG B; 5LL6 S; 2JMA A; 2RNA A; 1RL2 A; 4MZT A; 3CCL A; 1VIE A; 2DM1 A; 1HSQ A; 2RQW A; 3V7R A; 2PQW A; 4C8Q E; 3VS6 A; 1PC0 A; 5GAM g; 2Y4X A; 3CPW S; 4J9D A; 2QYZ A; 4E7L A; 4QW2 A; 4CC3 A; 5A0L A; 4C8Q D; 2XKO C; 5CVI A; 4N4H A; 3BE3 A; 3CME Q; 1YJ9 A; 4RKU E; 3F70 A; 1UB4 A; 2MYS A; 2CRE A; 2DJZ A; 4IUP A; 1G3W A; 3C0C A; 3OW2 P; 5HY6 A; 5IAY A; 1HD3 A; 2KVQ G; 1M1K R; 1YHQ Q; 2J6K A; 1ZSZ B; 2Y4Y A; 4ELY C; 4M4Z A; 3FB9 A; 5GJW B; 1BIA A; 1NEB A; 2GQV A; 1HK9 A; 2X4J A; 4QKU A; 8AT1 B; 1GCQ C; 4MML A; 3VV0 A; 4R55 A; 1NJI R; 1QCF A; 4M75 F; 3SHW A; 4E7Z A; 2DER A; 2FB7 A; 5GAN e; 3HTR A; 2DJQ A; 3CCQ A; 1QP2 A; 1JRI A; 3NGP A; 1O9S A; 1MV3 A; 1HJD A; 2LVM A; 3CXC P; 4X34 A; 3LW5 E; 3CC4 Q; 2KYB A; 4K11 A; 3OS0 A; 2KBT A; 5C0M A; 3E1S A; 4PK4 A; 1H8K A; 3OA6 A; 2IG0 A; 2QAS A; 2KR3 A; 2I2L A; 5KYU A; 2EQJ A; 4IUV A; 3OY9 A; 4J9C A; 2DD4 A; 1XNI A; 1IGU A; 2E41 A; 4IIM A; 3I55 A; 3O5Z A; 3I9Q A; 2YUO A; 3JB9 J; 2O31 A; 1BI2 A; 4LN2 A; 1UEB A; 3M0S A; 1YJW A; 1MV0 B; 2D8J A; 3JAM E; 4F14 A; 2J6F A; 3JCM d; 4ZN1 A; 1KQ2 A; 4WF2 A; 2LQW A; 2RMO A; 4C92 C; 4IUU A; 1TOV A; 1UFF A; 2DL8 A; 2L0A A; 3C4S A; 1BB9 A; 3I5R A; 2R5A A; 4M77 A; 4MZP A; 1YI2 Q; 2HCK A; 1WJR A; 4IIO A; 3CC2 A; 1AWJ A; 3EH1 A; 2K79 A; 2JM9 A; 5FWB A; 3IQL A; 1V1C A; 3E2U A; 2M0Y A; 4LUD A; 3VYG A; 4M7D C; 5CCA A; 3MEA A; 4PKC C; 1U1T A; 2RHI A; 3CCV A; 1SSF A; 1VQM A; 4J9G A; 5FW9 A; 2RH2 A; 4DOV A; 3CCU T; 1E6G A; 4FU6 A; 1W6X A; 2MAM A; 2ZPG B; 3OBY A; 2FZK B; 2COW A; 3CBO A; 1WXT A; 2KXD A; 1LCK A; 2XMF A; 2NLU A; 5A0G A; 5D6Y A; 3ME9 A; 2E6N A; 1YIJ T; 4JLG A; 2KEA A; 1TUD A; 3AT1 B; 1S72 A; 4AG2 C; 2CP0 A; 1VYV A; 4F17 A; 2KQW A; 5GAN g; 2CP3 A; 1JU5 C; 4FYV B; 3CCJ A; 2BZY A; 4C92 G; 4BDZ A; 2XIC A; 1IB8 A; 1KQS A; 4DQ2 A; 1NYG A; 1H3Z A; 4J83 A; 5HK3 A; 2EIF A; 4JUV A; 3OYN A; 4AFU C; 2RM4 A; 1JXO A; 2DMO A; 3WVE B; 2BE9 B; 4OGE A; 1N6A A; 2VB6 A; 5L23 A; 1B7T A; 1UGQ B; 4JZ3 A; 5ECA A; 2ZPF B; 3CQT A; 4M7A E; 3A5Z B; 2ROT A; 4M7D G; 2W10 A; 3SWN A; 3CCE Q; 4M7A D; 2L3P A; 4C92 B; 3JRZ A; 3JB9 G; 1ZBX A; 1QMC A; 4RG8 A; 1K73 C; 2EQM A; 1Y07 A; 1WHH A; 1VQL A; 3CCL T; 5HK0 A; 3JCM b; 2RB6 A; 1OU8 A; 5LJ3 h; 2DVJ A; 3EGX A; 2JTE A; 1AT1 B; 5GAN 7; 1XJW B; 2HNI A; 3OYY A; 2DL7 A; 3EAE A; 3TRE A; 1ZLM A; 3G71 Q; 2ZPE B; 1KG1 A; 4L6V 5; 4LD9 K; 4QT7 A; 1VYU A; 4OMP A; 4M7D B; 2MK5 A; 4JLI A; 3PIO A; 4C0Z A; 4ESR A; 1VQ6 A; 5KYX A; 4PL6 A; 4KRT A; 1D0X A; 9ATC B; 5A0D A; 1CKB A; 2RI3 A; 5FU7 C; 3EGD A; 2CP5 A; 1RLP C; 2EKH A; 3PVQ A; 3MEU A; 1D1C A; 4C5H A; 2QQS A; 1YIJ Q; 4JJB A; 4BD3 A; 2GCX A; 2X3W D; 3OS5 A; 4E6R A; 4E7I A; 4M75 A; 1WJS A; 4RTV A; 1Y57 A; 3TSW A; 2F2X A; 3X24 B; 1PM3 A; 1VQP A; 4BE2 A; 3QWY A; 1SSH A; 3OYD A; 3G6E Q; 1QVG P; 1G3Y A; 4R56 A; 3OYE A; 2IIM A; 1VQ8 A; 1VQK A; 7AT1 B; 3CCR Q; 3CBP A; 3CBM A; 3G4S A; 4B9X A; 1M1F A; 1BI1 A; 3X20 B; 2HAX A; 4HCK A; 3JCM f; 5KCH A; 3CCQ T; 2B86 A; 5GMK m; 4ZTJ A; 4F7U E; 3OYI A; 1SPK A; 2L3R A; 3HPW A; 2F1L A; 3PTA A; 2RJE A; 4DBH A; 2PTK A; 2NUP B; 3QKJ A; 4E2F B; 3HKS A; 3QWX X; 2HQE A; 4FSX A; 3JCM J; 2FG0 A; 3UA6 A; 1JBM A; 2C0T A; 1N8R U; 4N0A C; 2K5L A; 1JXM A; 1S1N A; 2EW3 A; 2X4Y A; 3EFR A; 1K8A C; 2XID A; 3V7S A; 4FYY B; 1WQ7 A; 3I35 A; 1KD1 R; 4D6W A; 5CR2 A; 1K9M C; 2FHD A; 2NUZ A; 3I55 T; 2R58 A; 2EVR A; 1IRE B; 2OTJ T; 3MP8 A; 1WI7 A; 2J7I A; 4KH0 B; 1YJW T; 1RAI B; 3E9F A; 3QYG B; 3FRN A; 4XU2 A; 6AT1 B; 4C92 F; 4C5E A; 1YJ9 Q; 1X27 A; 3M53 A; 4ME7 A; 4Q5W A; 2KAF A; 1Q82 C; 4A54 A; 1JJ2 S; 2LDM A; 3OYK A; 2ATC B; 2WSC E; 1BCM A; 2HBW A; 2ZAE A; 4A4G A; 2EGC A; 2FEI A; 4BI4 A; 2YRC A; 2FPD A; 5FU7 B; 1RAE B; 3N5B B; 1BKB A; 5GAN 4; 2E6Z A; 4Y91 A; 2CSI A; 4B9W A; 2JMC A; 5GMK l; 3UPU A; 5D6X A; 4RCB A; 1ZSZ A; 3ZEH A; 1NBE B; 2A28 A; 1C6V X; 1LNX A; 3RNJ A; 2PZ1 A; 1UE9 A; 1M3C A; 1YN8 A; 4FW1 A; 3CCQ Q; 1UG1 A; 2H8H A; 2LJ0 A; 1VQM T; 2J06 A; 3UT1 A; 2HBP A; 5FWC A; 1UJY A; 2AT1 B; 4BUG A; 1QP3 A; 5IHN A; 2K7A A; 3S3M A; 5KCO A; 4CC7 A; 3GNF B; 2IVW A; 5FLX E; 5M9O A; 2LMJ A; 3PT9 A; 2K9G A; 3S3O A; 1UEC A; 1M3B A; 3M56 A; 1G3S A; 3EG9 B; 1S72 T; 3LH0 A; 3RMS A; 1BK2 A; 2PU9 B; 2LRQ A; 1AWX A; 3U23 A; 1T0H A; 3SB2 A; 2XHC A; 1VIF A; 1OZ2 A; 3I55 Q; 1K4U S; 1AZE A; 1R0B G; 2OTL A; 4JJC A; 1YJW Q; 1UGP B; 2GGR A; 4C5G A; 1N8R R; 3OQ5 A; 2VKN A; 2BUD A; 1D0Y A; 4PJO E; 2ECZ A; 4J7I A; 5GMK i; 1VQ4 T; 2V1R A; 1H64 1; 3V8J A; 4PJO D; 1M3A A; 2COZ A; 3NFC A; 1MMD A; 5I2M A; 2ZPI B; 1VQL T; 3CC2 Q; 2QGG A; 4D8D A; 2J6O A; 3M0Q A; 1X69 A; 4E7J A; 3X28 B; 2KDS A; 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