The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
DPKFEAAYDFPGSGSSSELPLKKGDIVFISRDEPSGWSLAKLLDGSKEGWVPTAYMTPYKDTRNTVPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
High-throughput structural genomics of yeast SH3 domains
rcsb |
| molecule tags |
Contractile protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule keywords |
Myosin-3 isoform
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| total genus |
12
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| structure length |
68
|
| sequence length |
68
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-02-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3THK A; 3VS3 A; 1BB9 A; 2J6O A; 2VVK A; 2GQI A; 1X6B A; 1UJY A; 2KRO A; 2RQT A; 2KNB B; 1MV3 A; 3O5Z A; 4OMN A; 1WX6 A; 2A37 A; 1K9A A; 2DL4 A; 2DRM A; 1I0C A; 2DE0 X; 4LNP A; 3R6N A; 4LN2 A; 4D8D A; 3SEM A; 1OPL A; 3NGP A; 3I5R A; 2VKN A; 1IO6 A; 1CKB A; 1TUD A; 2RPN A; 1NLO C; 2EQI A; 1K76 A; 2G6F X; 5FWC A; 2QDL A; 1YNZ A; 4ZNX A; 2YDL A; 2JM9 A; 1TUC A; 3TSZ A; 1FYN A; 1WXT A; 1ARK A; 1RI9 A; 4GBQ A; 1NEB A; 4LUD A; 4FSS A; 3EHQ A; 1QKW A; 2ESW A; 2JT4 A; 1SPK A; 2D8H A; 1RUW A; 3PVL A; 2FRW A; 1ZBJ A; 2BZX A; 2RNA A; 4AG1 C; 1X2Q A; 1OV3 A; 1UG1 A; 1MUZ A; 2AZS A; 3KFV A; 4Y92 A; 2OJ2 A; 1KIK A; 1T0H A; 1AEY A; 2DRK A; 2DVJ A; 2I0N A; 2KRM A; 4ORZ A; 1V1C A; 2GBQ A; 1JO8 A; 1OPK A; 2F2V A; 1NLP C; 2V1Q A; 2EVR A; 1E7O A; 2LZ6 B; 2X3X D; 2KRS A; 2L3P A; 4Z89 A; 2JS2 A; 1YP5 A; 1H8K A; 2LJ3 A; 2K79 A; 4RTZ A; 2DX1 A; 4J9F A; 1Y57 A; 4EIK A; 2F2W A; 4AFZ C; 1T3S A; 2JTE A; 1WA7 A; 2GNC A; 5IXB A; 2RQW A; 4QT7 A; 1WYX A; 4ESR A; 2LQW A; 2AK5 A; 2EYW A; 2O9V A; 1RLQ C; 4OMQ A; 3REB B; 2H8H A; 4JZ3 A; 1ZSG A; 4CC4 B; 1S1N A; 1G83 A; 3H0H A; 1NG2 A; 2O31 A; 2RQU A; 4J9G A; 1M3C A; 1BK2 A; 1KSW A; 2GTJ A; 4OMM A; 3M0T A; 1TG0 A; 1X6G A; 1U3O A; 1NEG A; 2RQR A; 4AFU C; 2EBP A; 3NMZ C; 1X27 A; 1U5S A; 1FMK A; 1ZLM A; 3EG2 A; 3M0Q A; 1K0S A; 1K0X A; 3PVQ A; 4RTY A; 1EFN A; 3EG0 A; 3EG1 A; 4RTU A; 4DEX A; 3VRZ A; 2KGT A; 4RTW A; 1SHF A; 2CT4 A; 2GGR A; 2C0I A; 4F14 A; 1KFZ A; 2LX7 A; 4CC7 A; 1M30 A; 1AWJ A; 1W1F A; 2CRE A; 2EGA A; 2PZ1 A; 1T0J A; 1GFC A; 2W0Z A; 4JJC A; 3CQT A; 1GFD A; 1ZUU A; 2KR3 A; 2KXD A; 1QWE A; 1CKA A; 1UUE A; 2DJQ A; 2XMF A; 2CUB A; 5L23 A; 2C0O A; 1VYV A; 2CDT A; 2BTT A; 2EW3 A; 2LCS A; 2FPF A; 2DMO A; 2ED0 A; 3IQL A; 2B86 A; 2DIL A; 3VS1 A; 3UAT A; 2HCK A; 2ROT A; 1I1J A; 1PKT A; 4IIO A; 4JZ4 A; 1AWO A; 1YCS B; 2MIO A; 2D1X A; 2LJ1 A; 1PRL C; 2CT3 A; 1GBQ A; 2BZ8 A; 1AOJ A; 1PWT A; 1VA7 A; 2P4R A; 2BZY A; 5HCK A; 4K11 A; 3VS7 A; 1W6X A; 1XOV A; 3VS4 A; 4RTX A; 5FW9 A; 5IHK A; 1PRM C; 1PKS A; 2F2X A; 2ROL A; 2A08 A; 2GTO A; 1JU5 C; 1WXB A; 5FWB A; 2PTK A; 2W10 A; 1I07 A; 4JPB W; 1GCQ A; 3VS5 A; 4HVU A; 1E6H A; 1WXU A; 3LH5 A; 2YT6 A; 3M0U A; 2JW4 A; 2RMO A; 1T3L A; 1AZG B; 1UHC A; 2K3B A; 2CSQ A; 2J7I A; 2YUQ A; 5IHN A; 1QLY A; 4J9H A; 5IH2 A; 2KXC A; 4HXJ A; 1WI7 A; 3NPF A; 1GL5 A; 1PNJ A; 1LCK A; 2ECZ A; 2KYM A; 2FG0 A; 4IIM A; 4Z8A A; 3TVT A; 1UFF A; 3ZL7 C; 1H92 A; 4M4Z A; 2JMC A; 4OMO A; 5ECA A; 3SHW A; 1AZE A; 2M0Y A; 3M0P A; 4F16 A; 1JXM A; 1SEM A; 2DYB A; 2RN8 A; 4J9B A; 5GJV B; 4RUG A; 2K7A A; 4J9C A; 3EG3 A; 1GRI A; 4JJD A; 1UEC A; 4F17 A; 2SEM A; 1AVZ C; 5I11 A; 2O2O A; 4AFQ C; 1J3T A; 4LE9 A; 2YUO A; 3H41 A; 1GCP A; 1OEB A; 4LUE A; 2CH4 W; 4OML A; 4X1V A; 2FPD A; 3QWY A; 1G2B A; 2L2P A; 4GLM A; 2FRY A; 2KT8 A; 2K6D A; 1M3B A; 2RF0 A; 2DNU A; 1BU1 A; 2JM8 A; 3QWX X; 3C0C A; 1QCF A; 1YWP A; 1M3A A; 2X3W D; 2LJ0 A; 2DLP A; 2YUP A; 3ULR B; 4E6R A; 2KEA A; 4RTV A; 2RQV A; 1OOT A; 2DL8 A; 2CSI A; 2DBK A; 2AKK A; 2EYZ A; 2VWF A; 3REA B; 3TSW A; 1NM7 A; 4KRT A; 3UA7 A; 4RTT A; 2PNI A; 2O88 A; 1MV0 B; 4Z88 A; 5GJW B; 4HVV A; 4AFS C; 1HSQ A; 1KJW A; 2L3Q A; 2FEI A; 3EHR A; 2D0N A; 4J9E A; 3GBQ A; 2HEQ A; 1SHG A; 1ZX6 A; 5I22 A; 1YN8 A; 1QWF A; 1X2K A; 1UE9 A; 2KYB A; 2EKH A; 2EYY A; 2EGE A; 1W70 A; 1RLP C; 1CSK A; 1K1Z A; 1PHT A; 4JJB A; 2OI3 A; 1Z9Q A; 2L0A A; 4HCK A; 2KE9 A; 5IHI A; 2YUN A; 1AWW A; 2IIM A; 3VRY A; 1VYT A; 3EGU A; 1U06 A; 1X43 A; 2SRC A; 2LNH B; 3I35 A; 2DL3 A; 2MOX A; 2JMA A; 2DA9 A; 1Y0M A; 2JS0 A; 3VS6 A; 1HJD A; 2J6F A; 1AD5 A; 2CH4 A; 2LP5 A; 1E6G A; 2FO0 A; 3NHN A; 3RNJ A; 1GCQ C; 2HBW A; 2DM1 A; 2ED1 A; 2LQN A; 1UTI A; 2A36 A; 2EPD A; 3VS0 A; 1GBR A; 3PE0 A; 1X69 A; 4CC3 A; 2EGC A; 1UHF A; 4CC2 A; 1JEG A; 3RBB B; 2CUD A; 5IXF A; 1SRM A; 4HVW A; 1HD3 A; 2OAW A; 3UA6 A; 1SSH A; 4AG2 C; 1K4U S; 2JXB A; 2DF6 A; 4DEY A; 2DBM A; 1UDL A; 1VYU A; 2D8J A; 2V1R A; 1WLP B; 4OMP A; 1JQQ A; 3M0S A; 1M8M A; 2DL7 A; 2DL5 A; 1JXO A; 3JV3 A; 1N5Z A; 2KBT A; 1Z9Z A; 1SRL A; 1YWO A; 3A98 A; 3M0R A; 2A28 A; 2YSQ A; 2J6K A; 3UF4 A; 1WIE A; 4J9I A; 3U23 A; 4R0K A; 2KRN A; 3I9Q A; 1ABO A; 1ZUY A; 2L3S A; 5EC7 A; 1BBZ A; 2AZV A; 2C0T A; 1A0N B; 2ABL A; 2J05 A; 1WFW A; 1B3Q A; 1QKX A; 2EYX A; 2O9S A; 4J9D A; 1NYG A; 3H0I A; 2KT1 A; 2ENM A; 1M27 C; 4D8K A; 2J06 A; 2HSP A; 4A63 B; 2E5K A; 2M51 A; 3H0F A; 2FPE A; 2AKL A; 1NYF A; 1ABQ A; 4WCI A; 2NUZ A; 2LMJ A; 1B07 A; 2NWM A; 1H3H A; 2K9G A; 2HDA A; 3I5S A; 2MCN A; 3VS2 A; 1ZUK A; 3FJ5 A; 1UJ0 A; 1UGV A; 2K2M A; 1WDX A; 1AWX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1BB9 A; 4XTY A; 3UPU A; 2XKO C; 3MEA A; 3OMC A; 1VQ8 T; 1IXD A; 3O5Z A; 2XI9 A; 4FIB A; 1K9A A; 1HXD A; 3RER A; 4PJO D; 5LJ3 g; 4KH1 B; 2QGF B; 4MZM A; 3NGP A; 3I5R A; 2VKN A; 4JRI A; 2RPN A; 3CD6 T; 1M2V A; 5CKF A; 2WAC A; 3OW2 S; 3JCM f; 5FWC A; 4M75 D; 2DTI A; 2DER A; 5GAN e; 4OB3 B; 3EFO B; 4ZNX A; 1FYN A; 2MWP A; 4PFO A; 5GAN 5; 3VU3 C; 1NEB A; 4LUD A; 4C8Q E; 3EHQ A; 5KCO A; 2JT4 A; 3H8Z A; 5DM7 R; 1BI0 A; 4C0D B; 2V8K A; 2K3Y A; 1IRX A; 2BZX A; 4PJO C; 1X2Q A; 3LX7 A; 2RM4 A; 2CS7 A; 4M77 B; 3X20 B; 2ZPF B; 1KIK A; 3CBO A; 2DRK A; 1VQ9 A; 3M55 A; 2ZGW A; 1BIA A; 2JJ9 A; 2V1Q A; 4HKE A; 4B9X A; 1E7O A; 4M75 C; 2LZ6 B; 2X3X D; 2L3P A; 2CP5 A; 2K79 A; 4J9F A; 2RJD A; 1X6O A; 3M5A A; 3BW1 A; 2O01 E; 4MZT A; 3OQ5 A; 4EMK C; 1B34 B; 4RMO A; 2K5F A; 2GNC A; 5IXB A; 5KYU A; 3I56 A; 3ZEH A; 4QT7 A; 3PIP A; 4FW1 A; 4Y28 E; 4ESR A; 2LQW A; 4OB2 B; 2RI5 A; 1RAE B; 1VQ6 T; 2LCC A; 1ZSZ A; 1FXX A; 3C4S A; 2EYW A; 3SD4 A; 3CC4 Q; 4C8Q G; 1VQN Q; 1N9S A; 1ZSG A; 4CC4 B; 3CC4 T; 2ZPI B; 4ELZ C; 4ANJ A; 4MML A; 4J9G A; 5DLQ E; 3ASK A; 2L89 A; 3MET A; 3TCJ A; 2E6N A; 2BIV A; 2HMA A; 2R57 A; 4C92 A; 5CKD A; 1ZLM A; 1EFN A; 1VQM T; 3OW2 A; 4C5I A; 4PLL A; 4F14 A; 1RAF B; 5FRN A; 1KFZ A; 1NJI C; 2LX7 A; 4FT4 A; 1M30 A; 2DO3 A; 1AWJ A; 5FU7 C; 1WHM A; 2M1H A; 2RHX A; 4JJC A; 5LJ5 f; 1GFD A; 2KR3 A; 2KXD A; 2RI2 A; 1G5V A; 2CUB A; 3M4G A; 5L23 A; 3GP8 A; 3X25 B; 3CCV Q; 4C8Q F; 2EW3 A; 4PFZ A; 2ED0 A; 2PVD B; 4WF2 A; 2CZ0 B; 1RAA B; 2QTV A; 5GAN j; 1I1J A; 3L42 A; 2CZ7 B; 3E9F A; 1GBQ A; 2DZ9 A; 2M02 A; 1I4K 1; 1Q7Y C; 4ZTF A; 4WTO B; 5GAN 4; 3CCE Q; 3SFM A; 1VQP A; 4TVR A; 1W6X A; 4PJJ A; 1XOV A; 3QUI A; 4E7J A; 5GAN g; 1PRM C; 2F2X A; 1N8R U; 1JU5 C; 1BYM A; 1B34 A; 3JCM W; 1QCO A; 3GLX A; 3JB9 G; 3CPF A; 5DLO A; 4JPB W; 1YIT A; 4BY6 B; 3ZBD A; 2PVG B; 2ZZD A; 1F1B B; 4ATO A; 2A3L A; 4XAX B; 4HVU A; 4KBM B; 2RMO A; 2MMP A; 1AZG B; 2LC4 A; 1MMN A; 4E7Z A; 2K3B A; 1QLY A; 4M78 E; 2DIG A; 1ZA2 B; 2K2V A; 1RAB B; 1GXI E; 3NPF A; 1I8F A; 1YJW Q; 5M9O A; 1NJI R; 1UFF A; 2YLC A; 1VUB A; 3QG1 A; 4MZP A; 4M4Z A; 2EYQ A; 2JMC A; 4C8Q A; 3SHW A; 2QAS A; 4C92 D; 2M0Y A; 4EMH A; 4L6V 5; 1Y07 A; 5GJV B; 2RN8 A; 4QW2 A; 3HL8 A; 3JCM g; 4X9D A; 3MO8 A; 4L59 A; 3JB9 F; 2E65 A; 4NL3 A; 2KDS A; 1WPY A; 1AVZ C; 4AFQ C; 2OTL A; 1ZSZ C; 1RAI B; 3L1A A; 2NUP B; 7AT1 B; 1GCP A; 4A53 A; 1VQL Q; 2FPD A; 3QWY A; 2COW A; 1BKB A; 2DXB A; 2DXU A; 5KCH A; 1Q7Y R; 2COY A; 1TUG B; 1NPP A; 5GAN 3; 1BU1 A; 1VQ4 A; 2MWO A; 3M59 A; 3C0C A; 1VIE A; 1YWP A; 4C92 C; 2X3W D; 2E3H A; 3SWN B; 2YUP A; 4E6R A; 2KEA A; 2RQV A; 4FM4 B; 2CSI A; 1M5Q 1; 1Q82 U; 2AKK A; 3JRZ A; 4E7I A; 4E7H A; 4KUI A; 2NLU A; 2O4X A; 4E7S A; 1NM7 A; 4KRT A; 2WSC E; 3A8M B; 2JTF A; 4J7I A; 4KUL A; 2A0F B; 1MV0 B; 4HVV A; 2Y4Y A; 4A4E A; 4AFS C; 1TTH B; 2QA4 A; 1VQ9 Q; 3JAM E; 1HSQ A; 1KJW A; 5CO7 A; 1LNX A; 5GAM f; 2FB7 A; 3EHR A; 4C0D C; 1Q86 R; 3EH1 A; 2CP7 A; 3NFC A; 4O6J A; 1SHG A; 4C0F A; 3VYH B; 5KE2 A; 1YN8 A; 1QWF A; 2AHJ B; 2KYB A; 1M4Z A; 1Y7X A; 3I55 Q; 2K57 A; 3NTI A; 3PFS A; 3TQ7 P; 3CME A; 2RH2 A; 2E12 A; 4KT0 E; 4M7D F; 2K4Y A; 3L2U A; 2EQU A; 4JJB A; 4M78 F; 1MMG A; 2CP6 A; 1D09 B; 2KE9 A; 5IHI A; 2XDD A; 3I56 T; 2HQX A; 3CCS A; 2IIM A; 4R56 A; 2CP0 A; 1VYT A; 2SRC A; 4OGE A; 1QVG P; 3I35 A; 5KYY B; 1YI2 A; 3CPW P; 4C8Q D; 2QDY B; 1PC0 A; 3QDR B; 3RNJ A; 2DM1 A; 3JCM V; 1HK9 A; 3HP9 A; 2A36 A; 3VS0 A; 5LJ5 g; 4PJO B; 2NUP A; 1X69 A; 1WHG A; 5FRO A; 2JN0 A; 4OGC A; 4N0A A; 4HA8 A; 1JEG A; 1MMA A; 2OX7 A; 4MDX A; 2EFI A; 3OBY A; 5HKC A; 3CEY A; 4ELY C; 1SSH A; 4M75 B; 4DEY A; 1QVF S; 1UDL A; 2QK0 A; 4OF1 A; 4OMP A; 2P0P A; 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3EFS A; 1U8R A; 4AMC A; 2DX1 A; 5GMK l; 2V8I A; 1Y57 A; 3OMG A; 5AYF A; 2ZPE B; 3AT1 B; 5I2M A; 3S3O A; 5GAM g; 2PQW A; 1WA7 A; 3JCM Q; 4N0A C; 2QEX T; 2XHC A; 2LCL A; 2XU8 A; 1KC8 R; 2K3X A; 3OS1 A; 3T9N A; 5J3B A; 4ZGE B; 1K73 C; 3SWN C; 1KD1 C; 2QA4 Q; 1NG2 A; 2O31 A; 1ZHI A; 1M3C A; 1BK2 A; 2QA4 T; 2GTJ A; 4OMM A; 2DXT A; 3M0T A; 4M7A A; 5CVI A; 4BDZ A; 3TEE A; 5AT1 B; 3PMI A; 1D0Y A; 3OYF A; 3MP1 A; 2BE9 B; 1QW1 A; 3G1J A; 4AFU C; 1M1K U; 3MP6 A; 3LWI A; 3M0Q A; 2IVW A; 1WQ7 A; 1K0X A; 4FCY A; 1OYX A; 1MNE A; 3EG9 A; 5GMK i; 3CME Q; 2KGT A; 3D7S B; 2C0I A; 1QP3 A; 3V7C A; 3PGG A; 4OVA A; 3L2V A; 3CCS Q; 2ATC B; 2H3J A; 4E7L A; 4F7U F; 2CRE A; 3V8L A; 4IUT A; 2CKK A; 2W0Z A; 4C92 B; 1ZUU A; 1UUE A; 3RDV A; 1YI2 Q; 1Q81 R; 3SB2 A; 1UGQ B; 4JS4 A; 1W2B A; 1YI2 T; 2CDT A; 2BTT A; 1VQL A; 2FPF A; 3QYG B; 5FLX E; 1H64 1; 3OSS C; 2ROT A; 4CI0 C; 4QVC A; 1PKT A; 3VJP A; 3V7S A; 5GAO n; 3HRT A; 1R0B G; 1KQS P; 2BZ8 A; 1AOJ A; 1VA7 A; 2DEU A; 5CR2 A; 3FB9 A; 2F1L A; 5HCK A; 1M1G A; 1D1A A; 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