The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
DPKFEAAYDFPGSGSSSELPLKKGDIVFISRDEPSGWSLAKLLDGSKEGWVPTAYMTPYKDTRNTVPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
High-throughput structural genomics of yeast SH3 domains
rcsb |
| molecule keywords |
Myosin-3 isoform
|
| molecule tags |
Contractile protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
12
|
| structure length |
68
|
| sequence length |
68
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-02-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1X27 A; 2K7A A; 4AG1 C; 2AZS A; 1AZG B; 2RN8 A; 3H0F A; 2YUN A; 1KSW A; 4RUG A; 2MIO A; 1B3Q A; 2DRK A; 5IH2 A; 1U5S A; 1KIK A; 2KGT A; 2ESW A; 5FWB A; 2DA9 A; 1QLY A; 2GQI A; 3H0I A; 3REA B; 5IHK A; 5I11 A; 1I07 A; 4RTT A; 2AKK A; 3EG1 A; 2J7I A; 1T3L A; 1UGV A; 3VS0 A; 2W0Z A; 2DRM A; 1GCP A; 2KRS A; 2JXB A; 1QKX A; 2DVJ A; 2KRN A; 4Z89 A; 1ZBJ A; 1WX6 A; 2P4R A; 2KXC A; 2AZV A; 1YP5 A; 1ZLM A; 3FJ5 A; 1NLP C; 4F17 A; 2GTO A; 2DBM A; 2MOX A; 2JT4 A; 3R6N A; 2IIM A; 2ROT A; 2J6O A; 2JS2 A; 3EHQ A; 2HDA A; 1CKA A; 2DL3 A; 1T3S A; 2K3B A; 1JU5 C; 1HSQ A; 2CSQ A; 2FPE A; 4CC7 A; 2KYM A; 3EG2 A; 5GJW B; 2ED1 A; 1MUZ A; 1ABO A; 3VRY A; 3M0T A; 3NPF A; 2YT6 A; 3H0H A; 3EGU A; 3LH5 A; 2O9V A; 1K0S A; 4FSS A; 1ABQ A; 2EYX A; 2CT3 A; 3M0S A; 1JXM A; 2A08 A; 4DEX A; 1T0J A; 2EGE A; 4RTX A; 2RMO A; 2DBK A; 3KFV A; 2CH4 A; 2J6K A; 1GRI A; 2L0A A; 4D8K A; 2H8H A; 1PHT A; 1NEG A; 1SSH A; 2EKH A; 5EC7 A; 5FW9 A; 2ECZ A; 4RTY A; 4J9E A; 2M51 A; 4GLM A; 2KRM A; 3ULR B; 2YSQ A; 4CC2 A; 4R0K A; 1VYT A; 1I0C A; 2GNC A; 1AD5 A; 4AFQ C; 2OJ2 A; 1OPL A; 2LJ3 A; 1EFN A; 2ENM A; 1K9A A; 2HEQ A; 2A28 A; 1UDL A; 2AKL A; 1X2Q A; 1OOT A; 1NG2 A; 4JJD A; 3C0C A; 2EGA A; 2BTT A; 1NM7 A; 3VS2 A; 2RQW A; 1AOJ A; 1SHF A; 2KNB B; 2DL7 A; 4A63 B; 2CDT A; 4IIO A; 2FPD A; 1RUW A; 3M0P A; 4LUE A; 4ORZ A; 2L3S A; 1K0X A; 2KRO A; 2A36 A; 2EYW A; 1TUD A; 2KT1 A; 2DM1 A; 4LNP A; 1QWF A; 3TSW A; 2DE0 X; 2KYB A; 2ED0 A; 1K1Z A; 3GBQ A; 1WIE A; 2F2V A; 1M8M A; 2G6F X; 1H92 A; 4AFS C; 1U06 A; 2HCK A; 2BZ8 A; 2LZ6 B; 2OI3 A; 4OMN A; 2DL4 A; 1GCQ C; 1A0N B; 2RQT A; 1M3A A; 2KBT A; 1GFC A; 1H8K A; 2EPD A; 4JZ3 A; 1IO6 A; 1YNZ A; 1U3O A; 4RTU A; 2CUB A; 3EHR A; 3ZL7 C; 1WYX A; 1HJD A; 2LQW A; 4X1V A; 1YCS B; 2C0O A; 3VS4 A; 2K9G A; 3VS6 A; 4OML A; 2CUD A; 2V1R A; 3REB B; 2B86 A; 1UJ0 A; 2JM9 A; 2CT4 A; 2HSP A; 4IIM A; 1OPK A; 5HCK A; 2MCN A; 3H41 A; 1ZX6 A; 1W70 A; 3EG0 A; 1T0H A; 1BU1 A; 2FEI A; 3NHN A; 1ARK A; 1TG0 A; 2CH4 W; 4RTZ A; 2KR3 A; 1TUC A; 1Z9Z A; 4ESR A; 1MV0 B; 1J3T A; 1NLO C; 2FG0 A; 2EYY A; 1M30 A; 3PVL A; 2D8H A; 1K4U S; 2BZY A; 1NYG A; 1PKT A; 2SEM A; 2OAW A; 2VKN A; 2YUP A; 3EG3 A; 1M27 C; 2D1X A; 1Y0M A; 3O5Z A; 2NWM A; 3RBB B; 4HVU A; 2FPF A; 1AWW A; 2LP5 A; 2JS0 A; 1AWX A; 2FRY A; 1UEC A; 3UAT A; 2J05 A; 3VS3 A; 3QWY A; 4AFZ C; 1NEB A; 2F2W A; 3RNJ A; 1WI7 A; 4OMO A; 4GBQ A; 1QCF A; 1H3H A; 1BK2 A; 4F14 A; 4J9G A; 4AFU C; 1E7O A; 1S1N A; 4JJB A; 1KFZ A; 2GGR A; 3THK A; 2J6F A; 2EW3 A; 2W10 A; 4OMM A; 2DNU A; 4OMP A; 2VWF A; 1RLQ C; 1PKS A; 2K79 A; 1CKB A; 1SRL A; 1GCQ A; 3PVQ A; 3JV3 A; 3NGP A; 1GBR A; 4AG2 C; 4J9D A; 2DYB A; 4D8D A; 2LJ1 A; 1PWT A; 1X6B A; 1WXB A; 1JO8 A; 2EVR A; 2AK5 A; 2I0N A; 2E5K A; 2LNH B; 1ZSG A; 1PRM C; 1UHF A; 1AWO A; 1JXO A; 1BB9 A; 3UA7 A; 5IXF A; 1GFD A; 3SHW A; 2JMC A; 1NYF A; 1QWE A; 5IHN A; 4EIK A; 1V1C A; 1VYV A; 2O31 A; 1MV3 A; 4LUD A; 1AEY A; 1X6G A; 2ABL A; 2DMO A; 1UJY A; 1Y57 A; 1SRM A; 1AZE A; 2QDL A; 2SRC A; 1ZUU A; 3M0Q A; 2YUQ A; 3M0U A; 4Y92 A; 3I5S A; 2J06 A; 2FRW A; 1LCK A; 4RTV A; 4F16 A; 1QKW A; 2L2P A; 1ZUY A; 3U23 A; 3I9Q A; 5IHI A; 2CRE A; 4K11 A; 1AWJ A; 4JPB W; 2EYZ A; 2DF6 A; 3I35 A; 2RNA A; 1N5Z A; 1WXU A; 1UE9 A; 1PNJ A; 5FWC A; 1SHG A; 4LN2 A; 1BBZ A; 1G83 A; 2X3X D; 3A98 A; 1WFW A; 1WXT A; 3SEM A; 4J9F A; 3QWX X; 2BZX A; 2D8J A; 3UA6 A; 1FYN A; 2CSI A; 1UHC A; 2DLP A; 2K2M A; 2JTE A; 2EBP A; 5L23 A; 2DL5 A; 2M0Y A; 1JEG A; 2FO0 A; 2DL8 A; 1YWP A; 2LCS A; 1G2B A; 1Z9Q A; 1E6G A; 5GJV B; 2PNI A; 1WLP B; 1B07 A; 1JQQ A; 1VYU A; 3VS7 A; 4CC4 B; 1K76 A; 2L3P A; 2JMA A; 1GL5 A; 4OMQ A; 1RI9 A; 4JJC A; 5ECA A; 2VVK A; 2K6D A; 1XOV A; 4E6R A; 2C0I A; 1X2K A; 1UG1 A; 1RLP C; 4KRT A; 1SPK A; 2YDL A; 2GBQ A; 2F2X A; 1GBQ A; 2PTK A; 4HXJ A; 1FMK A; 2DIL A; 1WA7 A; 2LQN A; 2L3Q A; 2A37 A; 4M4Z A; 1YN8 A; 2KT8 A; 2EQI A; 1UTI A; 2ROL A; 3VS1 A; 1E6H A; 2RQU A; 4CC3 A; 1YWO A; 4QT7 A; 2D0N A; 4J9H A; 3M0R A; 1M3C A; 1I1J A; 2DX1 A; 1UUE A; 5I22 A; 2RPN A; 2DJQ A; 1SEM A; 3NMZ C; 3PE0 A; 1WDX A; 1X43 A; 3UF4 A; 2KEA A; 4HVW A; 2C0T A; 1KJW A; 2YUO A; 5IXB A; 4Z88 A; 2O9S A; 1VA7 A; 3TVT A; 1CSK A; 2LMJ A; 2V1Q A; 1PRL C; 4J9I A; 2RQR A; 2NUZ A; 2LJ0 A; 1UFF A; 4LE9 A; 2PZ1 A; 4WCI A; 3CQT A; 2RQV A; 4J9C A; 4J9B A; 3I5R A; 2KE9 A; 2X3W D; 3VRZ A; 4RTW A; 1ZUK A; 2O88 A; 2KXD A; 4DEY A; 1W6X A; 2RF0 A; 1W1F A; 3TSZ A; 2HBW A; 1M3B A; 4HCK A; 4JZ4 A; 1AVZ C; 2O2O A; 1OEB A; 2JW4 A; 2XMF A; 3VS5 A; 4Z8A A; 2LX7 A; 4HVV A; 1X69 A; 2EGC A; 1OV3 A; 2JM8 A; 4ZNX A; 3IQL A; 2GTJ A; 1HD3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2COZ A; 2DFU A; 2AZS A; 3P8H A; 2RN8 A; 3JCM e; 4RUG A; 2DRK A; 1NZ9 A; 1JBM A; 4O5V A; 4OB2 B; 2QA4 T; 3M55 A; 2GQI A; 4FYX B; 3REA B; 3OW2 S; 1HK9 A; 3CD6 Q; 4M7D D; 2COW A; 4RTT A; 2AKK A; 2QXF A; 3EG1 A; 3V7S A; 3CPW A; 3RR6 A; 4JRI A; 1QKX A; 3G4S Q; 2DVJ A; 2HQH A; 2H3E B; 4Z89 A; 1ZBJ A; 5CO7 A; 4KBM B; 4BDY A; 4HCB A; 2KI7 A; 2CP2 A; 4F17 A; 1TTH B; 2HSE B; 2JT4 A; 4OF1 A; 3I56 T; 3JCM V; 3P8D A; 4EMG A; 2EQJ A; 1K8A U; 2L5Q A; 2QAZ A; 4B9W A; 1CKA A; 2K3B A; 2D9T A; 4JLG A; 2ZPB B; 4RKU E; 3LWH A; 2DYI A; 4OMF B; 2XID A; 1Q86 C; 3ASK A; 2YT6 A; 5A0D A; 1K0S A; 2XKO C; 4FSS A; 1ABQ A; 3RDV A; 2EYX A; 1ZQ1 A; 2HBP A; 3M0S A; 4E2F B; 4L5G A; 3CXC A; 2RMO A; 2CH4 A; 3FJP A; 2XI9 A; 3CEY A; 1EZZ B; 1PHT A; 4E7K A; 2ZPI B; 2EKH A; 1ZSZ B; 1VQ9 A; 1W2B P; 1WHK A; 3VYG A; 2M51 A; 5GAN h; 2KRM A; 2DZC A; 1VYT A; 4DBR A; 1AD5 A; 2PVO B; 2OJ2 A; 1VQL T; 1OPL A; 1EFN A; 3OYM A; 4M77 G; 2ENM A; 2E12 A; 1UDL A; 2AKL A; 3TCJ A; 1VQ4 A; 4JJD A; 2HL3 A; 2EGA A; 2RK2 A; 5KYN A; 1NM7 A; 1VQO A; 1SHF A; 4M7D F; 1BI0 A; 4A63 B; 2CDT A; 4LUE A; 1K0X A; 2VGM A; 2HL5 C; 4UC4 A; 3OMG A; 4J7F A; 1IRE B; 3VV0 A; 2DM1 A; 4LNP A; 2DE0 X; 2CZ7 B; 2FVU A; 3GBQ A; 1WIE A; 5D6W A; 4Y28 E; 3E9F A; 1Y71 A; 2K3Y A; 3VYH B; 2PU9 B; 3A8M B; 2HCK A; 4PJO G; 2LZ6 B; 1A0N B; 3URG A; 3V8J A; 3X24 B; 2DAQ A; 2DTI A; 2KBT A; 1VQ6 A; 1QMC A; 3CCQ A; 1IO6 A; 1V76 A; 2NYS A; 5LJ5 h; 3EHR A; 1WYX A; 2LQW A; 4X1V A; 3VKI A; 3CPW S; 1RAH B; 3VS4 A; 2K9G A; 5LJ3 g; 4BAC A; 4OB0 B; 4PJO E; 3E2U A; 2V1R A; 2B86 A; 3OYJ A; 2JM9 A; 3Q1J A; 3M57 A; 2HSP A; 4IIM A; 1O75 A; 3RMQ A; 3CCE Q; 3CCL A; 1ACM B; 2V8K A; 1W70 A; 5CIU A; 4E47 A; 1YJN A; 3NHN A; 4M77 D; 2JJ9 A; 4RTZ A; 2LX9 A; 1Z9Z A; 2CYZ B; 2QQA A; 4C92 C; 3OY9 A; 1MV0 B; 1NLO C; 1M30 A; 3OS0 A; 4AT1 B; 2D8H A; 1K4U S; 3CBP A; 1NYG A; 2SEM A; 2VKN A; 1VQ5 A; 2GFA A; 3BW1 A; 2FPF A; 3TQ7 P; 2JS0 A; 4EDU A; 4F7U G; 3UAT A; 1RL2 A; 4J6X A; 4A54 A; 3CXC S; 2FYK A; 5GAM g; 3JCM J; 1NEB A; 4OVA A; 4JJN K; 1QCF A; 1BK2 A; 2E70 A; 4PJO D; 4PFP A; 4AFU C; 4E7I A; 1LVK A; 4PKC C; 3JCM f; 4M7A B; 3THK A; 4LDW A; 3OYI A; 2EW3 A; 5KYY B; 3QUI A; 1QCO A; 2VWF A; 2QYZ A; 1VQN Q; 2K79 A; 1CKB A; 3JCM W; 1WJR A; 4IUQ A; 2EJG A; 4WTO B; 2RD1 A; 2E65 A; 2XK0 A; 3PVQ A; 3P8B B; 4KUI A; 1Q81 C; 1G3W A; 2LJ1 A; 1WXB A; 3UWN A; 4N0A A; 2I0N A; 4OB1 B; 2GCX A; 1KC8 C; 1ZSG A; 1YBY A; 2ATC B; 4BE1 A; 3V8L A; 8ATC B; 1TWB A; 3C94 A; 4N4G A; 1VYV A; 1AEY A; 1Y96 A; 1D0X A; 4QQD A; 1RAF B; 3H9N A; 1Y57 A; 1SRM A; 4C5E A; 1KQ2 A; 2BIV A; 4M77 F; 4KT0 E; 3L1A A; 4C92 A; 4F16 A; 4LD9 K; 1Q7Y U; 4YTL A; 1ZUY A; 3I9Q A; 4R56 A; 2RI2 A; 2DPP B; 3BDL A; 4XU2 A; 1QP2 A; 2DF6 A; 3I35 A; 1SKU B; 1PNJ A; 1SHG A; 3A98 A; 4M7D C; 1VIF A; 1DJ7 B; 2QI2 A; 3J81 E; 3PMI A; 1YIJ Q; 2V8I A; 3PIO A; 1IXD A; 1UHC A; 4E7L A; 1M2V A; 1EIF A; 2K2M A; 4OGE A; 2JTE A; 2EBP A; 4Q5W A; 4DOW A; 2M0Y A; 4PJO F; 3C4S A; 1PC0 A; 1E6G A; 4FW2 A; 2P0P A; 2PNI A; 3CPW P; 1K76 A; 3MEV A; 5FU7 C; 3CCJ Q; 2RJD A; 2DEQ A; 5GMK h; 5ECA A; 1VQK Q; 1XOV A; 1WHG A; 3PT9 A; 5HY6 A; 3GIB A; 2GBQ A; 3KXT A; 2JN0 A; 2XDD A; 3CBM A; 1WA7 A; 1PG5 B; 3LYI A; 5GAN g; 1PD1 A; 1WHL A; 3HSB A; 3HL8 A; 2RQU A; 1K8A R; 4QT7 A; 1NPP A; 4J9H A; 2Y4Y A; 2NUP A; 1I5O B; 2RI3 A; 2ZGW A; 2JTF A; 5I22 A; 1KQ1 A; 5GMK l; 2HMA A; 1VQM Q; 3DB4 A; 2LCC A; 3OYL A; 4A4K A; 2KEA A; 3CCE T; 4HVW A; 1FWZ A; 2VUB A; 5IXB A; 4J6W A; 5DLQ E; 4F7U F; 2RQR A; 2LJ0 A; 3CQT A; 3CC4 A; 3QZ5 B; 2NLU A; 3R6O A; 2KE9 A; 1MMA A; 1KQS A; 4M7D A; 4DEY A; 1W1F A; 4BE2 A; 1Q82 C; 2OTL Q; 1OEB A; 2JW4 A; 1HXD A; 4E7S A; 2FZK B; 2QQR A; 2OTJ A; 3M9Q A; 5LJ5 g; 5KCO A; 5M9O A; 1SF9 A; 1JRI A; 5A2Q E; 4J5Y A; 3QDR B; 1OYX A; 4M75 G; 3FLG A; 3E19 A; 4ZN3 A; 1B3Q A; 4J6Y A; 5IH2 A; 1VQP Q; 1U5S A; 2KGT A; 2R57 A; 2ESW A; 1UEB A; 2DA9 A; 3CD6 A; 2X35 A; 1QLY A; 3H0I A; 5I11 A; 3TU4 K; 1I07 A; 3RMS A; 1M1K U; 1T3L A; 1VQN T; 2W0Z A; 2R58 A; 3G4S A; 2DRM A; 1GCP A; 2KRS A; 2CP5 A; 2ZPG B; 3OMC A; 4JDS A; 5J26 A; 3M4Y A; 5CQX A; 2KXC A; 1YP5 A; 3FJ5 A; 4IUU A; 2MOX A; 1M1K C; 3GP8 A; 4CRI A; 1JJ2 S; 1S72 A; 2D6F A; 3S3O A; 3N5B B; 2IIM A; 2ROT A; 3HTR A; 5GAO m; 1ZBX A; 2JUF A; 3EHQ A; 4D6W A; 2HDA A; 2JZ2 A; 3WVD B; 2M02 A; 1M90 C; 4FYW B; 3OYD A; 2R5A A; 3EGD A; 1N8R U; 3MCA B; 5GAO r; 4CC7 A; 1K9M C; 1RAD B; 3OSS C; 1MUZ A; 2HQX A; 3VRY A; 4EPC A; 2R5M A; 3M0T A; 1B34 A; 3LH5 A; 2WSF E; 1BI3 A; 5CKH A; 1BYM A; 2A08 A; 1VQ6 T; 4ZGE B; 3CME Q; 2DBK A; 1OZ2 A; 1Y96 B; 2MPX C; 2J6K A; 4M75 D; 3DLM A; 3H8Z A; 4D8K A; 2H8H A; 1M2O A; 4PJO C; 4M7D E; 2ECZ A; 3HRT A; 1V29 B; 4RTY A; 1YIJ T; 4J9E A; 4XTU A; 1RI0 A; 3D7S B; 4C92 B; 3CCL T; 1M1F A; 3CCU Q; 8AT1 B; 3RUX A; 1YJN T; 1QCN A; 5KYX A; 1K9A A; 2HEQ A; 4FT2 A; 1OOT A; 1X2Q A; 3CC4 Q; 3C0C A; 2BTT A; 1YCY A; 2P84 A; 4XQ3 A; 2DXT A; 1KQS S; 3NTK A; 3CCJ T; 2EQK A; 2QEX Q; 4IIO A; 3OQ5 A; 2FPD A; 1RUW A; 2QG9 B; 3M0P A; 1R0C B; 2KRO A; 4OGC A; 1VQK T; 2A36 A; 4LDY A; 4M78 G; 4BE0 A; 3MJX A; 2LT1 A; 5D7U A; 1M2V B; 4MMK A; 2IPO B; 3S3M A; 5C0M A; 1Y07 A; 1K1Z A; 2F2V A; 1MNE A; 2YXY A; 1WQW A; 4M77 A; 4M78 E; 3JCM Q; 2DEU A; 4AFS C; 2H3J A; 4HT8 A; 4ELZ C; 3JCM b; 3CC2 Q; 4FM4 B; 4OMN A; 2DL4 A; 1GCQ C; 4OP0 A; 3QJY A; 3PGG A; 2RQT A; 5CKD A; 2E3H A; 4C0D C; 3HPW A; 1M3A A; 1GFC A; 2EPD A; 4RG8 A; 2HD0 A; 4HKE A; 4XTW A; 4RTU A; 1VQM T; 3PFS A; 4OML A; 2CUD A; 1UJ0 A; 2XU8 A; 4XTX A; 2CT4 A; 1OPK A; 4FL6 A; 3CCE A; 1WZO A; 4ATO A; 1B7T A; 1S72 Q; 2I2L A; 2AHJ B; 4M75 F; 2K5F A; 4Z02 A; 3RES A; 5AT1 B; 1U8R A; 2NUP B; 2CZ0 B; 1Q86 U; 1TG0 A; 4PJO A; 4BB7 A; 2KR3 A; 1RAE B; 1Q7Y R; 3JCM h; 2MF2 A; 2OTL T; 4ESR A; 2DK3 A; 2FG0 A; 1NJI U; 3PVL A; 1IGQ A; 3OYH A; 2A3L A; 4PJM A; 2K57 A; 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