The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
EYVEALYQFDPQQDGDLGLKPGDKVQLLEKLSPEWYKGSCNGRTGIFPANYVKPAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Ypr154wp
|
| publication title |
Structural genomics of yeast SH3 domains
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
10
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1TUC A; 4JJD A; 2B86 A; 4FSS A; 1UJ0 A; 2DL4 A; 1K9A A; 4K11 A; 1CKA A; 2CH4 W; 1WXU A; 1UFF A; 1Z9Z A; 1T3L A; 2EYZ A; 2FEI A; 4F16 A; 1U06 A; 2F2V A; 2CRE A; 4ESR A; 1B07 A; 1UUE A; 2ECZ A; 2CUB A; 2DM1 A; 2KXD A; 1BK2 A; 2LJ3 A; 2RPN A; 3FJ5 A; 4DEY A; 4CC4 B; 2L0A A; 1ABO A; 2AK5 A; 2EW3 A; 2P4R A; 2L2P A; 4HXJ A; 2DL5 A; 2KNB B; 1GCQ A; 3VS4 A; 1M3A A; 2J6F A; 2RN8 A; 4RTX A; 4AG2 C; 4AFU C; 5IHK A; 3GBQ A; 2JMA A; 2EGC A; 1VYT A; 4ORZ A; 1ZUK A; 2H8H A; 4M4Z A; 2AZS A; 3CQT A; 1KSW A; 1UEC A; 2FPD A; 2O2O A; 4OMM A; 1HJD A; 3EGU A; 1Z9Q A; 3NMZ C; 1QCF A; 2LQN A; 1YWP A; 2ABL A; 4A63 B; 2K79 A; 2VVK A; 1AZE A; 1SRM A; 3EG1 A; 3SHW A; 1FMK A; 2AKL A; 2YUN A; 3REB B; 1JXO A; 2YUP A; 1G2B A; 1M27 C; 2ROT A; 4KRT A; 2DYB A; 1WI7 A; 5ECA A; 3RBB B; 3QWX X; 1CSK A; 1K4U S; 1WXT A; 1PHT A; 1AWJ A; 4LE9 A; 2OI3 A; 2J06 A; 1M8M A; 1GCP A; 1NEG A; 1NEB A; 2GBQ A; 1PWT A; 4Z89 A; 1LCK A; 3M0P A; 1IO6 A; 2KBT A; 2K6D A; 1M30 A; 3EG3 A; 4CC3 A; 1OOT A; 1X2K A; 2BZY A; 2PZ1 A; 1RI9 A; 1WYX A; 3I5R A; 4OML A; 2DNU A; 2GNC A; 2DLP A; 2D8J A; 2CSQ A; 2K7A A; 4J9D A; 2LQW A; 2DJQ A; 4AFQ C; 2EGE A; 4EIK A; 1YN8 A; 1I07 A; 3ZL7 C; 1GFD A; 3PE0 A; 4Z88 A; 4RUG A; 3NPF A; 1X2Q A; 4F14 A; 1GBR A; 1ZSG A; 1RLP C; 1E6G A; 3H0H A; 2JT4 A; 1X6B A; 2DBK A; 5IXB A; 3LH5 A; 1TUD A; 3VS1 A; 1QWF A; 2HEQ A; 1MUZ A; 1JO8 A; 3NGP A; 4LN2 A; 1M3B A; 1ZUU A; 2LZ6 B; 1JXM A; 1PNJ A; 4JZ4 A; 1J3T A; 1NYF A; 3VRZ A; 2YUQ A; 2I0N A; 2FO0 A; 4JJC A; 3TSZ A; 1AOJ A; 4J9E A; 4D8K A; 2LX7 A; 1NM7 A; 4J9G A; 1JQQ A; 2J6O A; 2VKN A; 1QWE A; 2K9G A; 2KRM A; 2W0Z A; 1CKB A; 2EYY A; 4QT7 A; 1HSQ A; 2E5K A; 3VS7 A; 4IIO A; 4RTV A; 2F2X A; 4HVW A; 2AKK A; 3VS2 A; 2O9V A; 1X6G A; 1ZX6 A; 2O9S A; 2KRO A; 2HDA A; 2FRW A; 1B3Q A; 4OMQ A; 1UDL A; 2L3S A; 2OAW A; 1QKW A; 2CDT A; 5GJV B; 2M51 A; 2V1R A; 2EPD A; 4CC7 A; 2DX1 A; 2CT4 A; 2XMF A; 4OMP A; 1AWX A; 2LP5 A; 1I1J A; 3PVQ A; 2LJ0 A; 2L3P A; 2C0O A; 1PRL C; 2KT8 A; 2CUD A; 4R0K A; 4GLM A; 1X43 A; 4AFZ C; 3ULR B; 1RUW A; 2EKH A; 2FRY A; 2DL7 A; 1U5S A; 3VS5 A; 4JPB W; 1SPK A; 2LCS A; 2KYM A; 2GQI A; 3REA B; 1SSH A; 2X3W D; 5FWC A; 2RNA A; 2J7I A; 4F17 A; 2AZV A; 2IIM A; 2D1X A; 2GTO A; 1Y0M A; 3RNJ A; 4J9I A; 2FPE A; 2JXB A; 1H3H A; 1GBQ A; 1H92 A; 1UHF A; 4J9H A; 4HVU A; 5HCK A; 2DVJ A; 2CSI A; 4ZNX A; 4Y92 A; 3C0C A; 2DA9 A; 2EQI A; 4LUE A; 2KR3 A; 5FWB A; 1SEM A; 2A37 A; 1KFZ A; 2K3B A; 1X69 A; 2JS0 A; 3EG0 A; 3U23 A; 2EYW A; 1UJY A; 4HCK A; 3I9Q A; 1TG0 A; 1HD3 A; 3M0Q A; 5L23 A; 1YCS B; 3UA6 A; 2D0N A; 3UF4 A; 2DL8 A; 1W70 A; 3TVT A; 2JW4 A; 2J05 A; 2KRN A; 2LNH B; 1YP5 A; 2A28 A; 2KRS A; 3IQL A; 2GGR A; 3A98 A; 2YDL A; 1T0H A; 2GTJ A; 1VYV A; 1JEG A; 5FW9 A; 4J9F A; 2MCN A; 3KFV A; 2DIL A; 1E7O A; 2VWF A; 4LUD A; 2YT6 A; 3NHN A; 3VRY A; 2SRC A; 1AEY A; 2KYB A; 2FG0 A; 2F2W A; 3EHQ A; 4LNP A; 5EC7 A; 2HBW A; 2O88 A; 1WA7 A; 4CC2 A; 3EHR A; 3PVL A; 1NLP C; 3QWY A; 4X1V A; 4E6R A; 1OPK A; 1UHC A; 2DBM A; 1QKX A; 5IH2 A; 1FYN A; 1NG2 A; 2BZX A; 1MV0 B; 2RQT A; 1WDX A; 2KGT A; 4OMO A; 3O5Z A; 5I22 A; 4J9C A; 2NWM A; 1UE9 A; 1AWW A; 3I35 A; 2C0I A; 3M0S A; 1K0X A; 1N5Z A; 2BTT A; 2QDL A; 2KT1 A; 2RQR A; 2W10 A; 2DRM A; 1AWO A; 2V1Q A; 1PRM C; 2OJ2 A; 4RTT A; 1ZUY A; 1V1C A; 1UG1 A; 2RF0 A; 3I5S A; 4AG1 C; 2LJ1 A; 2ED1 A; 3UA7 A; 4GBQ A; 1YNZ A; 1VA7 A; 1EFN A; 4DEX A; 1VYU A; 2CH4 A; 1U3O A; 4OMN A; 1Y57 A; 4WCI A; 3UAT A; 2DMO A; 1S1N A; 2M0Y A; 1NYG A; 1E6H A; 2JM9 A; 2ROL A; 5IXF A; 1OEB A; 2BZ8 A; 4D8D A; 2JM8 A; 4JZ3 A; 3VS0 A; 4IIM A; 1MV3 A; 1T0J A; 1K1Z A; 2DRK A; 3VS6 A; 1GRI A; 3EG2 A; 1SHG A; 1WFW A; 1GL5 A; 4Z8A A; 5IHI A; 2EBP A; 2EYX A; 1X27 A; 4HVV A; 1GCQ C; 2A36 A; 3M0R A; 1YWO A; 1M3C A; 2ENM A; 2RMO A; 1BU1 A; 2JS2 A; 1K76 A; 4JJB A; 2ED0 A; 2YUO A; 3M0T A; 1ZLM A; 2NUZ A; 2JMC A; 1BBZ A; 2KXC A; 2FPF A; 2HCK A; 3SEM A; 1AVZ C; 1WX6 A; 1SRL A; 1G83 A; 1JU5 C; 2PTK A; 1W1F A; 1T3S A; 2RQU A; 2RQV A; 1WXB A; 3R6N A; 1XOV A; 1WIE A; 3H0I A; 2C0T A; 2G6F X; 4RTU A; 3H0F A; 1A0N B; 2CT3 A; 2DL3 A; 1KIK A; 2PNI A; 2O31 A; 1ZBJ A; 2YSQ A; 3H41 A; 4RTY A; 2A08 A; 1RLQ C; 1PKT A; 1SHF A; 4RTZ A; 1OV3 A; 4AFS C; 1ABQ A; 2X3X D; 2K2M A; 1WLP B; 4RTW A; 5IHN A; 2J6K A; 1ARK A; 1UGV A; 1QLY A; 1UTI A; 5I11 A; 1OPL A; 2HSP A; 2EGA A; 5GJW B; 1W6X A; 2KE9 A; 2JTE A; 3JV3 A; 2L3Q A; 2LMJ A; 1GFC A; 3VS3 A; 4J9B A; 1NLO C; 1K0S A; 3THK A; 2SEM A; 2EVR A; 2KEA A; 1H8K A; 3TSW A; 1PKS A; 1BB9 A; 2ESW A; 1I0C A; 1AD5 A; 2DF6 A; 2MOX A; 3M0U A; 1KJW A; 2D8H A; 2MIO A; 2RQW A; 1AZG B; 2DE0 X; #chains in the Genus database with same CATH topology 1ZA2 B; 1MGQ A; 1QP2 A; 4A4K A; 3G4S A; 2DTO A; 2DL4 A; 4M7A E; 4A54 A; 4PFP A; 5GAN f; 1Z9Z A; 1KQS S; 4F16 A; 4E2F B; 2FEI A; 2XG8 D; 4C0G A; 1B07 A; 2K5L A; 2CUB A; 2KXD A; 1BK2 A; 2XU8 A; 1ABO A; 2RHU A; 1KQS P; 1HXD A; 5GAN 3; 1WHK A; 3OSV A; 2HKN A; 2H3J A; 3VS4 A; 2A3L A; 5GAN g; 2RN8 A; 1K9M C; 3V8K A; 2DXB A; 2EGC A; 2K2V A; 1VYT A; 3VKI A; 3L2U A; 3OYD A; 3OYM A; 1VQ6 Q; 1C0M A; 3A5Z B; 2H8H A; 4M4Z A; 1KSW A; 1M8V A; 2DFU A; 4C92 B; 3L1A A; 2R57 A; 3J80 E; 5I2M A; 3CCV A; 1YJ9 A; 2O2O A; 1KD1 R; 2LT1 A; 2LQN A; 1YWP A; 1OU9 A; 4A63 B; 2Z0W A; 3I55 A; 4N0A C; 2VVK A; 2JTM A; 3SHW A; 1OUL A; 3CCU T; 4M7D E; 3REB B; 4M77 A; 1VQ8 A; 2LC4 A; 4XQ3 A; 1TXQ A; 3QUI A; 1HK9 A; 1VQM Q; 3FC3 A; 5LJ5 e; 2E65 A; 4KRT A; 2HAX A; 3OYL A; 3JCM W; 1AWJ A; 2KQW A; 4E7L A; 2J06 A; 4NL2 A; 2DVE A; 2LX9 A; 4C8Q A; 1NPP A; 3M0P A; 2E12 A; 1D1C A; 4M77 B; 1OOT A; 2E3H A; 1RI9 A; 2AHJ B; 3A8H B; 4M78 C; 2DLP A; 2FZG B; 2K7A A; 3RKW A; 1KK7 A; 3CCR A; 2LDM A; 2LQW A; 2DJQ A; 2O01 E; 4AFQ C; 5KYN A; 2RK1 A; 4EIK A; 3ZL7 C; 8AT1 B; 1TSF A; 1D0X A; 5KH6 A; 1X2Q A; 3X28 B; 4BI8 B; 4B9W A; 3GNG A; 3H0H A; 2JT4 A; 1X6B A; 1JBM A; 3OB9 A; 3R6O A; 5GAM e; 1QWF A; 1K8A C; 4B6M A; 2LZ6 B; 3FB9 A; 2M02 A; 3X24 B; 4BE1 A; 2X9H A; 2FO0 A; 4JJC A; 3CPW S; 2HMA A; 4BY6 B; 4D8K A; 4PJL A; 3I56 T; 1SF9 A; 1YI2 Q; 5LJ5 d; 3RR6 A; 2VKN A; 3CPW P; 2K9G A; 4FW2 A; 2W0Z A; 5HK3 A; 1AT1 B; 2Y4X A; 2E64 A; 2F5T X; 1JJ2 S; 4RTV A; 3JCM X; 1VQN Q; 2F2X A; 3TU4 K; 4JJN K; 2JJ9 A; 2KRO A; 2FRW A; 1B3Q A; 3OBW A; 1VOM A; 3VJP A; 2E41 A; 2E6N A; 3JAM E; 4PKC C; 4FCY A; 2M51 A; 4DOW A; 3RIR A; 2OTL T; 2EPD A; 3JCM Q; 3CXC A; 4RKU E; 2LP5 A; 1MNE A; 1PRL C; 3VYH B; 4C92 D; 3PFS A; 3DLM A; 1QVF S; 3OYN A; 2K3X A; 4F7U F; 2QA4 A; 2DIQ A; 2V26 A; 4PJO G; 2K3Y A; 4C0Z A; 2MWP A; 5J3B A; 2DXC A; 3G71 T; 3CCQ T; 1YJN T; 2KYM A; 2GQI A; 3RES A; 4F17 A; 1QVG P; 3MEA A; 2D1X A; 2MK5 A; 4N4H A; 2FPE A; 1H3H A; 1H92 A; 3CC2 Q; 2RI5 A; 5HCK A; 4M78 A; 4ZNX A; 2XD0 A; 3C0C A; 2DA9 A; 1MMD A; 3G4S T; 3QYG B; 2LQ8 A; 4LUE A; 1FWZ A; 3DB4 A; 2FZC B; 3HRT A; 3PMT A; 2COY A; 3EFR A; 3DLL A; 5CKD A; 3CBO A; 1YJW A; 2YRV A; 2JS0 A; 3M54 A; 1MMA A; 3MPU B; 3M59 A; 4DQ2 A; 3QXE B; 4HCK A; 2RHX A; 4M77 D; 1F1B B; 1JB0 E; 1TG0 A; 3M0Q A; 1YCS B; 4M75 C; 3UF4 A; 1G3T A; 1WZO A; 3AT1 B; 2NLU A; 1YIJ Q; 2J05 A; 4RG2 A; 2HKQ B; 2KRN A; 4PLL A; 2A0F B; 5GMK j; 3LH0 A; 2QI2 A; 3KFV A; 1UGP B; 1VQO Q; 5IAY A; 5HKC A; 2VB6 A; 4F7U E; 3OYK A; 3NHN A; 3EFO B; 3RKX A; 4C8Q D; 4BE2 A; 2KYB A; 1I81 A; 2FG0 A; 5EC7 A; 2O88 A; 5GAN 5; 1ZSZ A; 3EHR A; 3CCV T; 4OGE A; 4E6R A; 1R0B G; 2DD5 A; 1QKX A; 1UEB A; 1FYN A; 4HA8 A; 1NG2 A; 2BZX A; 3CCE A; 2RQT A; 2KGT A; 2G3R A; 5D7U A; 4OMO A; 4OP0 A; 2NWM A; 2YWW A; 3CCL Q; 3PMI A; 1VQ7 A; 1UE9 A; 1AWW A; 3I35 A; 2EAY A; 5AT1 B; 3OYC A; 2DRM A; 2ZPG B; 1AWO A; 3OW2 S; 2RF0 A; 3T9N A; 3I5S A; 4AG1 C; 1H3Z A; 1D3B B; 1LJO A; 3VYG A; 1YNZ A; 9ATC B; 3A8G B; 1QCO A; 1RL2 A; 2CH4 A; 3OW2 P; 1Y57 A; 3UAT A; 4LD6 A; 1NYG A; 3M57 A; 2O4X B; 2HD0 A; 3INZ A; 1RAH B; 1VIE A; 2HQE A; 2L5Q A; 4D8D A; 2LRQ A; 3JCM J; 4JZ3 A; 2QQR A; 4NL3 A; 1TWB A; 4IIM A; 3MEU A; 2EWN A; 1SHG A; 3OYB A; 3P8H A; 2PUK B; 1SKU B; 1WQ7 A; 3RDV A; 1ZA1 B; 3JB9 F; 2XDP A; 1M3C A; 3HRS A; 5C6S A; 5LJ5 h; 2V8I A; 1VQ9 A; 2ED0 A; 3M0T A; 5GMK i; 2NUZ A; 3VUB A; 4JRK A; 2KXC A; 2HNI A; 4P5N A; 5GAO p; 1Q86 U; 1VQP Q; 1M5Q 1; 3UPU A; 5CKH A; 1WX6 A; 4M75 A; 1JU5 C; 4M7A A; 1W1F A; 1Q95 G; 1T3S A; 4UC4 A; 4ME7 A; 2RQU A; 1VQL Q; 1WXB A; 2E4H A; 3R6N A; 2CP3 A; 3CEY A; 2CT3 A; 1D09 B; 4HCC A; 2O31 A; 2DIG A; 1BYM A; 3A8M B; 1ZBJ A; 3M58 A; 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4E7K A; 4E7S A; 1B7T A; 2YUP A; 3M4G A; 1Q86 R; 2ROT A; 1YIT Q; 3CCE T; 4CI0 C; 3PGG A; 1Y96 B; 3QWX X; 5GMK m; 2BE7 D; 4JRQ A; 1Q82 C; 4RMO A; 1M4Z A; 2RJE A; 2ZPE B; 5KYU A; 4XU1 A; 2DYI A; 1PHT A; 1VQ7 T; 1OX8 A; 3TCJ A; 1OYX A; 1M8M A; 4DBH A; 5LJ3 j; 2COZ A; 4Z89 A; 1LCK A; 1EX4 A; 4A4G A; 3JCM d; 1I4K 1; 3QKJ A; 2K6D A; 2ZGW A; 3H6Z A; 4CC3 A; 2BZY A; 3MEW A; 1YFN A; 4OML A; 4PJO F; 4C5E A; 2DNU A; 2VC8 A; 1VQ6 A; 3EGX A; 2MMP A; 2CSQ A; 1WHH A; 4QQ6 A; 3BFM A; 4M75 D; 1XQH A; 2FVU A; 4J6W A; 3CCS Q; 2QQA A; 1YN8 A; 4KGZ B; 4R56 A; 3PE0 A; 3G71 A; 4Z88 A; 3CCQ A; 1YJN A; 2ZPF B; 4XAX B; 5GAM f; 1ZSG A; 2P0Q A; 1IHW A; 4XTZ A; 2QEX Q; 3GOX A; 3SB2 A; 3GF5 A; 5IXB A; 2RJF A; 2HEQ A; 4XTY A; 1MUZ A; 1BI3 A; 3NGP A; 4LN2 A; 2EJF A; 3EGX B; 3QJ6 A; 1M3B A; 1VQ9 T; 2YXY A; 4JZ4 A; 1VUB A; 1J3T A; 2I0N A; 4OVA A; 2K4Y A; 5CAI A; 3L42 A; 3TSZ A; 1AOJ A; 4J9E A; 2LX7 A; 1NM7 A; 4J9G A; 1JQQ A; 3UWN A; 1R77 A; 1QWE A; 5GAO r; 4L5G A; 1SSF A; 3MEV A; 5LJ3 f; 5FU7 C; 2EYY A; 1M90 U; 4QT7 A; 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