The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3CME Q; 1VQ4 Q; 1VQO Q; 1K9M R; 3CC7 Q; 1VQN Q; 1YJW Q; 1VQP Q; 3CCM Q; 1KC8 R; 1KD1 R; 1VQ6 Q; 1VQ5 Q; 3I56 Q; 1YIJ Q; 3CC4 Q; 3G71 Q; 1QVG P; 1K73 R; 3CCE Q; 3CCQ Q; 1Q81 R; 1YJ9 Q; 3G4S Q; 3I55 Q; 1Q86 R; 1VQ9 Q; 1Q82 R; 2QEX Q; 1NJI R; 1VQ7 Q; 3CCV Q; 1VQM Q; 1JJ2 P; 3OW2 P; 3CCS Q; 1K8A R; 3CD6 Q; 3CCJ Q; 1Q7Y R; 3CC2 Q; 1YIT Q; 1VQ8 Q; 1W2B P; 3CCR Q; 2QA4 Q; 3CXC P; 1QVF P; 1VQK Q; 1VQL Q; 2OTJ Q; 1YHQ Q; 3CPW P; 1M90 R; 2OTL Q; 1M1K R; 3CCU Q; 3CMA Q; 1YI2 Q; 3CCL Q; 1YJN Q; 1S72 Q; 1N8R R; 3G6E Q; 1KQS P; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VQ6 A; 1UJ0 A; 2L5Q A; 3SHW A; 1B07 A; 3RNJ A; 1UHC A; 2I2L A; 4B6M A; 4JS4 A; 5GAM f; 2CH4 A; 6AT1 B; 2MI6 A; 1VYV A; 4XTY A; 3HPW A; 1AHJ B; 2PQW A; 4PJM A; 2XIC A; 4YTL A; 2NUP B; 3BY7 A; 1U8R A; 1PKT A; 2ZPG B; 3ER0 A; 2O88 A; 2DRM A; 2V8I A; 1PC0 A; 3HRS A; 3TSZ A; 4BAC A; 3LX7 A; 3OBY A; 2EIF A; 1HYO A; 2GCX A; 3QDR B; 2K3X A; 2MPX C; 4PJO C; 1U5S A; 2CUD A; 3OYH A; 2MCN A; 5KYX B; 3JB9 F; 2GQV A; 4BDZ A; 1GCQ A; 1M8V A; 2J05 A; 3LH5 A; 4GLK A; 1KG1 A; 1Y57 A; 2HD0 A; 4F7U A; 1KQS P; 4EMK A; 3CQT A; 1NLP C; 1WJQ A; 3VKI A; 2ZPE B; 4M78 D; 3BDU A; 3PT9 A; 2CP7 A; 1B34 A; 2LQN A; 1NYG A; 4M77 D; 2C06 A; 4FSX A; 4PJO F; 3C94 A; 2VYT A; 4LDY A; 2DJZ A; 3CCE Q; 4M4Z A; 4M78 B; 2HKN A; 2ZPH B; 4M77 B; 1NE8 A; 4AT1 B; 2RJD A; 1M8M A; 4KRT A; 1BU1 A; 2K5I A; 5LL6 S; 3EFO B; 2HBP A; 4MMK A; 2A08 A; 4F7U E; 3JRZ A; 4XU3 A; 2FZG B; 2RK1 A; 1R0B G; 5GAN 7; 1M1F A; 1BBZ A; 2FYK A; 2R58 A; 1VQK A; 1AVZ C; 3JCM J; 1NYF A; 4NS5 A; 2JTE A; 2LVM A; 4JUV A; 4IUR A; 2HAX A; 4E6R A; 2YSQ A; 1IGQ A; 3VUB A; 5KYY A; 2K3B A; 2GNC A; 2HCK A; 4RTZ A; 4M75 B; 4N4H A; 3L2U A; 1RAD B; 3THK A; 1YNZ A; 3L2R A; 3MKD A; 3FRN A; 4M78 G; 3CCS Q; 1EIF A; 2QDY B; 2DIL A; 4M77 G; 2QA4 Q; 1OZ2 A; 1HK9 A; 3REA B; 2D6F A; 2QTX A; 3MET A; 3DLL A; 1N8R R; 1RL2 A; 4JJC A; 1K9A A; 3CBP A; 2FZK B; 2VAS A; 2DPP B; 4Y28 E; 4J83 A; 1ZBJ A; 2RB6 A; 2XD0 A; 2PVO B; 2DVJ A; 4HCZ A; 4QW2 A; 2A3L A; 3A8G B; 3VS4 A; 3LWI A; 2RQW A; 4JRK A; 5CR2 A; 2FO0 A; 4Y92 A; 2DL3 A; 1UGR B; 2A0F B; 5IXB A; 1UB4 A; 1RAC B; 2F2X A; 1BI1 A; 1VQM T; 4FYV B; 1K0X A; 2O2O A; 3I55 A; 1SHG A; 1VA7 A; 4HVV A; 1M1K U; 1Q82 U; 2C0I A; 1KQS S; 4M75 G; 3CC2 A; 4IUV A; 2ZZD A; 2KRN A; 2PUO B; 3H0I A; 2LCS A; 1G5V A; 4FSS A; 1WDX A; 3EG0 A; 1OEB A; 3CCL A; 3O5Z A; 4AG2 C; 3MP6 A; 3J80 E; 1PWT A; 5A2Q E; 1TU0 B; 5GAM d; 1FMK A; 1QQJ A; 1YJ9 T; 3EH1 A; 4B9W A; 3I56 A; 1WYX A; 3PIP A; 2ECZ A; 3CD6 T; 3OB9 A; 1NBE B; 4JLI A; 1Q81 C; 2LQ8 A; 3DKM A; 1BCM A; 2EQK A; 4O5V A; 1WXB A; 4RUG A; 1WJS A; 1BK2 A; 2CZ1 B; 4PFP A; 4PNO A; 2DD5 A; 1RI0 A; 2ZCF B; 2EJG A; 2E10 A; 1QVF P; 1Y96 A; 5IH2 A; 2K2M A; 3JCM V; 1K1Z A; 3HTR A; 2KXC A; 3EHQ A; 1X01 A; 3VS5 A; 3CCR T; 3QWX X; 2KBT A; 3PIO A; 1YIT A; 1K9M U; 1PG5 B; 5I21 A; 1TG0 A; 1Z9Z A; 1AWJ A; 1W2B A; 2RF0 A; 1U3O A; 3M53 A; 2DFU A; 3CC7 A; 1RLP C; 2BZY A; 1XQH A; 5HY6 A; 1H64 1; 4MDW A; 5GAM j; 1VQ5 A; 2LT4 A; 2VUB A; 4PFO A; 4Z8A A; 5EC7 A; 2K6D A; 3CD6 A; 1YFN A; 2OI3 A; 3LH0 A; 2WSF E; 2L3S A; 5M9O A; 1XNI A; 2KQW A; 2D9T A; 4KUI A; 4F04 B; 4ZTF A; 2LQK A; 1FX7 A; 1TWB A; 1S72 Q; 4XTV A; 1N9S A; 2RHZ A; 1Q7Y U; 1M9S A; 4J7I A; 3MP1 A; 1ZA2 B; 1UHF A; 1G3T A; 4HT8 A; 5DY9 A; 4C92 D; 1WJR A; 2DXC A; 1VQO T; 2DO3 A; 1VQ7 Q; 4JZ4 A; 3OSV A; 3OYN A; 3NTI A; 3CEY A; 4C92 B; 1K73 U; 1PD0 A; 2DM1 A; 4DQ2 A; 2FL7 A; 5GMK l; 2DXT A; 1X75 C; 2QAZ A; 8AT1 B; 3OW2 S; 2OAW A; 4C8Q A; 4RG8 A; 1YHQ T; 3URG A; 1OX9 A; 1K4U S; 1I81 A; 2ZPF B; 4C8Q F; 2CDT A; 2HBW A; 3G71 A; 4ZTJ A; 2RO0 A; 2AT1 B; 3PGG A; 3L1A A; 1V76 A; 3RER A; 2E4H A; 2H8H A; 4E7L A; 1GXI E; 1AWX A; 3NTH A; 1X43 A; 4QT7 A; 1HXD A; 2D8J A; 2O9V A; 4C8Q E; 3CPW S; 1WXT A; 1R77 A; 3WXM B; 3SWN C; 3OMG A; 2DYI A; 1PSF A; 3VJP A; 4E7J A; 1VQO A; 2B8A A; 3M0P A; 2KYB A; 5HK0 A; 2RD1 A; 3JSC A; 4RKU E; 2ROT A; 3GNF B; 4KUD K; 2AZV A; 2CT3 A; 3GOX A; 1RAG B; 1ZQ1 A; 5ECA A; 3EG9 B; 4N4G A; 3CCU T; 4E7Z A; 2JM9 A; 4OGC A; 1I8F A; 3GBQ A; 3X25 B; 1JQQ A; 3A98 A; 3PVQ A; 4FYX B; 1KC8 U; 1KHC A; 1E6H A; 4X1V A; 1D3B B; 1JBM A; 3JAM E; 1MUZ A; 5GAN 3; 4JZ3 A; 3CCQ T; 1QVG S; 1G2B A; 4QVC A; 2EGA A; 3NPF A; 2JS0 A; 4X34 A; 1MMN A; 3V7C A; 2DTI A; 2J6O A; 1N9R A; 1TUG B; 1VUB A; 3HP9 A; 3PNW C; 4FIB A; 2HNI A; 4C0D C; 3CMA A; 3O8V A; 2NYS A; 3CCM T; 1QLY A; 4M7D D; 4HCK A; 5DLQ E; 4R56 A; 1UGV A; 3JCM h; 1SRL A; 4X9D A; 3NHN A; 4NOY A; 3OS1 A; 1SKU B; 4M7D B; 3RMS A; 1IO6 A; 2D0Q B; 2MIO A; 3C0C A; 3AT1 B; 3H41 A; 2QEX Q; 2ATC B; 3S3O A; 2OTJ A; 1JJ2 A; 1AEY A; 2RPN A; 3OYY A; 2J6F A; 2RQT A; 2QTV A; 1JO8 A; 3CC4 A; 4IUU A; 3I5R A; 2KVQ G; 1TS9 A; 1KHI A; 3A8H B; 2F69 A; 2M0O A; 3SEM A; 4HCC A; 4OMO A; 4PJJ A; 4CC2 A; 2D8H A; 2W0Z A; 1PRM C; 3H9N A; 2OTL A; 1VQL Q; 3RKW A; 2QAS A; 1JU5 C; 2KGT A; 1GBQ A; 2E64 A; 2CP6 A; 2YRD A; 4FW2 A; 3OYE A; 3CCM A; 1LCK A; 2XDB A; 3R6O A; 1X69 A; 4PJN A; 2JZ2 A; 3QKJ A; 1TSF A; 4M7D G; 3G6E T; 3CME T; 5DLO A; 3NGP A; 3CCJ Q; 3NMZ C; 3BFM A; 5LJ3 h; 4LDV A; 1M5Q 1; 2VV5 A; 5KYX A; 4CRI A; 2B86 A; 4BE2 A; 4J9E A; 2FRW A; 5CQX A; 2VXE A; 2LQW A; 2FPD A; 4KH1 B; 2DAQ A; 2JTF A; 1AWW A; 2JTM A; 4Z89 A; 2L2P A; 4OMP A; 3TVT A; 3MEW A; 1QP3 A; 3LGL A; 4BE0 A; 2EW3 A; 3OMC A; 4M7A C; 4R55 A; 3UA7 A; 4M78 A; 3VS6 A; 2QK0 A; 4DEY A; 1H3H A; 2DTO A; 3U23 A; 2CP0 A; 3A8L B; 1Q95 G; 2EWN A; 1ZSZ A; 2P84 A; 2EYY A; 3EFO A; 3IQL A; 2GFA A; 4Y91 A; 2HKQ B; 5GAO p; 5GMK h; 2MOX A; 2IG0 A; 2HL5 C; 1OU8 A; 3QII A; 2BTT A; 3WVD B; 3E2U A; 3CCV Q; 1SPK A; 2MWO A; 4M7A F; 2GFU A; 3JCM e; 3G6E A; 5L8R E; 3M54 A; 1YP5 A; 2EQM A; 1N6A A; 3MEV A; 1YJW A; 3JB9 H; 2XID A; 4M78 E; 1GFC A; 2V1Q A; 5GMK m; 4M77 E; 4XTX A; 1QP2 A; 5KCO A; 3UT1 A; 4BE1 A; 1VQP Q; 1VQN Q; 4HCB A; 1RAF B; 4JRQ A; 2L3Q A; 5FRO A; 1EFN A; 2DJQ A; 2LNV A; 5LJ5 h; 2COZ A; 3VS7 A; 2HQH A; 3I35 A; 2E1H A; 4DA4 A; 5CK9 A; 2OAU A; 3OYM A; 1M1K R; 1YI2 Q; 1Q82 R; 2QI2 A; 1TH7 A; 1YIJ A; 3E9G A; 3JCM b; 5D6X A; 2Z0W A; 1FYN A; 4HA8 A; 1NG2 A; 4KGZ B; 1VQ6 Q; 2WSC E; 2DBM A; 3G1J A; 3G4S Q; 1RAH B; 2DEU A; 2L8D A; 3X26 B; 3ZBD A; 3OS2 A; 1GBR A; 3QJY A; 3QJ6 A; 2CT4 A; 8ATC B; 2QYZ A; 2ENM A; 3PMT A; 3EGD B; 2E6N A; 1GCQ C; 1K8A U; 4FYY B; 2RK2 A; 3RUX A; 4DBH A; 2O01 E; 1HSQ A; 5GAN 8; 4CC4 B; 1VQK T; 1XJW B; 4EMK C; 1UGQ B; 2NUT B; 3QWY A; 4GLM A; 1K0S A; 1VQ4 T; 1VIE A; 2D0N A; 5LJ3 e; 3JCM g; 1VQ8 Q; 2JUF A; 3M57 A; 1H8K A; 2FHD A; 2JM8 A; 2KAF A; 4JS5 A; 4C0Z A; 2LC4 A; 4X9C A; 1MMA A; 1V29 B; 1K9M R; 3M4G A; 3VYH B; 1O9S A; 1IRX A; 1U1S A; 4F7U F; 4J9H A; 1OV3 A; 2QXF A; 2YLB A; 4EPC A; 4BB7 A; 2FVU A; 4D6W A; 5FW9 A; 1JEG A; 2A36 A; 2LX7 A; 1D0Z A; 2AK5 A; 1W2B P; 2KXD A; 1PSE A; 3MEU A; 2GQI A; 4OMQ A; 1ZUK A; 4RTY A; 4XTZ A; 3X20 B; 2X3X D; 2JNG A; 2YLC A; 3X24 B; 5FRM A; 4N4I A; 3CCE A; 5FLX E; 1IRE B; 3EG1 A; 2JN0 A; 1D0Y A; 2LNH B; 5GMK e; 1WHK A; 2BKD N; 4PJL A; 3RKX A; 1Q7Y R; 1ZSG A; 2RHU A; 5C0M A; 3R6N A; 3RDV A; 1VQ4 A; 5FU6 B; 2JVV A; 4M75 D; 1WQ7 A; 4ATO A; 3I55 T; 2OX7 A; 3OS5 A; 2O31 A; 1FWZ A; 4ZGJ B; 3QZ9 B; 3M55 A; 3CC2 T; 4N0A A; 5KYW B; 2CZ0 B; 2CYZ B; 1K73 R; 3CCL T; 2RJC A; 4KT0 E; 5LJ5 e; 1BI3 A; 2QGF B; 5LJ3 g; 2K4Y A; 5CO7 A; 5GAN h; 1W70 A; 2EKH A; 2IPO B; 2RQR A; 2M0Y A; 3I56 T; 3MO8 A; 1QCN A; 3ULR B; 2MAM A; 4E7S A; 3J81 E; 1N5Z A; 4A4K A; 1I0C A; 4LN2 A; 5FWB A; 2Y90 A; 4E2F B; 3GPL A; 3CCS A; 2KR3 A; 2WAC A; 2O4X B; 1Y07 A; 4PLL A; 4NL3 A; 2YXY A; 3M56 A; 2JS2 A; 2GBQ A; 2W10 A; 4DOW A; 1RAB B; 3GF5 A; 4QQG A; 4FYW B; 1JB0 E; 2VGN A; 4C92 A; 2FZC B; 3VS3 A; 3JCM P; 1YIT T; 4JJB A; 1UE9 A; 1OZ3 A; 3A8O B; 4C92 F; 4A54 A; 2QGG A; 2K57 A; 3OA6 A; 4OB1 B; 1BB9 A; 2CH4 W; 2P0P A; 4FU6 A; 2P4R A; 3CC7 T; 3UWN A; 5IHN A; 3FLG A; 1WQW A; 1KK7 A; 2D1X A; 2EVR A; 3ZFJ A; 1VQ5 T; 2H3E B; 3TEE A; 4DBF A; 4LDW A; 5CKB A; 4FM4 B; 1ZUY A; 4RCC A; 4JPB W; 2IIM A; 1O75 A; 2EBP A; 4PJO D; 3RBB B; 1KC8 R; 4C92 E; 3RMQ A; 5CIU A; 5LJ5 g; 1BCO A; 3OYD A; 1EX4 A; 1EZZ B; 5GAN 4; 1PKS A; 3FDR A; 2F1L A; 4AFZ C; 2FB7 A; 4PJO B; 4E7I A; 3M4Y A; 1M1K C; 1Q82 C; 1OOT A; 1QCO A; 3PMI A; 4C5I A; 4ORZ A; 4ZGE B; 2X3W D; 5CAI A; 3PE0 A; 1W1F A; 1C6V X; 3EHR A; 3TU4 K; 5AYF A; 1UEB A; 1U1T A; 5KYN A; 2KRS A; 4FT4 A; 2K3Y A; 2QDL A; 1VQM Q; 4MZT A; 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2MF2 A; 3L2V A; 1QVF S; 3EFS A; 3CMA T; 5GAO q; 1VIF A; 1A0N B; 3QZ5 B; 1UGS B; 2ZPI B; 1N8R C; 4LD6 A; 4HVW A; 2PNI A; 2HEQ A; 1XOV A; 1D0X A; 1Y71 A; 2ZGW A; 1VQO Q; 1QKX A; 3LLR A; 1M4Z A; 2XMF A; 2OTJ T; 4FT2 A; 1R0C B; 2M1H A; 1P92 A; 2V8K A; 4LNP A; 1UUE A; 2C0O A; 3OW2 A; 2FPE A; 2LP5 A; 1CSK A; 2LTO A; 1PCX A; 2P4T A; 3QHS A; 1YHQ Q; 3CC4 T; 4A53 A; 2E70 A; 3VRZ A; 1NJI U; 2X4X A; 4HXJ A; 4ZN1 A; 1IGU A; 2XI9 A; 4PK4 A; 4RMO A; 3RKY A; 1WX6 A; 1ACM B; 2L3R A; 5DM7 R; 2OTL T; 3QUI A; 1WHL A; 1I5O B; 4ME7 A; 2KRM A; 2VWF A; 3L2Q A; 3CPW A; 5A0G A; 1I07 A; 1Q86 U; 2LDM A; 3OYF A; 1KC8 C; 1QWE A; 1IZ6 A; 2LJ3 A; 1AZG B; 5FU7 C; 1RAA B; 2ED0 A; 3SB2 A; 2LX9 A; 2XG8 D; 2DL5 A; 3QXE B; 1K8A R; 3BDL A; 3MJX A; 3CCU Q; 4ESR A; 3ASK A; 1SG5 A; 4L5G A; 3I9Q A; 3FC3 A; 2K2V A; 2BIV A; 5CKH A; 5GAO n; 2AHJ B; 5J3B A; 3CXC S; 2QEX A; 2PUK B; 1Y7X A; 1QVG A; 3CCQ Q; 2ED1 A; 1ZA1 B; 3DLM A; 1T3S A; 4E7H A; 1TOV A; 3EFR A; 1X2Q A; 1ABO A; 2E6Z A; 1WHH A; 2XKO C; 3JCM f; 3OBW A; 4C5G A; 4C8Q B; 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