The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
VTLFVALYDYEAWTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
SH3 domain specificity
rcsb |
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Fyn
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
11
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2009-04-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HDA A; 2JM8 A; 3PE0 A; 1X27 A; 2J6O A; 2F2X A; 2P4R A; 3RNJ A; 3TSW A; 1T3S A; 1E7O A; 2EQI A; 1UTI A; 2DRM A; 2DL4 A; 2EVR A; 2DMO A; 5L23 A; 2LJ3 A; 1NLO C; 1PRL C; 5FWB A; 1ZSG A; 1HD3 A; 3RBB B; 2LMJ A; 1UJ0 A; 2DA9 A; 2EYY A; 4DEX A; 2LX7 A; 3GBQ A; 5IHI A; 4A63 B; 1AWJ A; 2F2V A; 2F2W A; 4RTT A; 1M3A A; 1WXT A; 1GCP A; 2PNI A; 2FEI A; 1AVZ C; 2H8H A; 1UHC A; 1SHG A; 1WXU A; 2KXC A; 2DF6 A; 1BB9 A; 1NYF A; 1YCS B; 4LN2 A; 4F17 A; 2D1X A; 2L3P A; 2JMC A; 3KFV A; 1E6G A; 1QLY A; 1TUC A; 2V1Q A; 2K2M A; 2CRE A; 1FMK A; 3I5R A; 4OMP A; 1AWO A; 4OMM A; 5I22 A; 4D8D A; 2GQI A; 1OPL A; 1U5S A; 2CSI A; 2KEA A; 2X3X D; 2EYX A; 3CQT A; 2EGE A; 3PVL A; 3M0Q A; 3O5Z A; 2CH4 A; 3NPF A; 1UHF A; 3M0T A; 4GBQ A; 3EHQ A; 2A08 A; 2L3Q A; 4AFZ C; 2VWF A; 3LH5 A; 1WIE A; 3TSZ A; 2ABL A; 2FPD A; 2B86 A; 1UE9 A; 1RLQ C; 4IIM A; 2LZ6 B; 1PNJ A; 3NMZ C; 2ROT A; 2KNB B; 1GL5 A; 1UEC A; 4JJB A; 2AKK A; 2CUD A; 3VS6 A; 2D8H A; 1ABQ A; 1SPK A; 3EGU A; 1W70 A; 2AK5 A; 2A28 A; 4LE9 A; 2DM1 A; 4EIK A; 2ED0 A; 2L2P A; 1AWW A; 2J6K A; 3M0P A; 2FPE A; 1I1J A; 1UGV A; 2QDL A; 1NEG A; 3H0H A; 2L3S A; 2K6D A; 1MV3 A; 2KRN A; 1JU5 C; 3H41 A; 1JEG A; 1GCQ A; 1YWO A; 1QCF A; 2VVK A; 1A0N B; 2DL7 A; 2RQR A; 2O2O A; 1U3O A; 1WXB A; 2M51 A; 2YUQ A; 2GGR A; 4AFS C; 4Z88 A; 4Z8A A; 1TG0 A; 1M30 A; 1AOJ A; 1ZUY A; 4OMN A; 1CSK A; 2CUB A; 4AFQ C; 4HXJ A; 2K9G A; 2CT3 A; 1U06 A; 1MUZ A; 1RI9 A; 1EFN A; 1Y0M A; 2ED1 A; 1Z9Q A; 5FW9 A; 1KIK A; 1K76 A; 2J06 A; 2YUO A; 1FYN A; 5ECA A; 2DLP A; 2HCK A; 4LUE A; 2RMO A; 2OI3 A; 2LCS A; 5IHN A; 1RUW A; 2GTJ A; 1M3C A; 3VS4 A; 2KT8 A; 1GBQ A; 1AWX A; 2MIO A; 1ARK A; 1ZBJ A; 2XMF A; 1UJY A; 4RTX A; 4J9D A; 1AZE A; 2LNH B; 2DL8 A; 1ZLM A; 2CSQ A; 1V1C A; 1B3Q A; 2W0Z A; 2DYB A; 2ECZ A; 2JM9 A; 4KRT A; 2RNA A; 1B07 A; 2LP5 A; 3JV3 A; 2J7I A; 1PWT A; 2J6F A; 2PTK A; 1JQQ A; 4JZ4 A; 2EYZ A; 4OML A; 2NUZ A; 2IIM A; 1GFD A; 4M4Z A; 2ESW A; 1VA7 A; 2BZX A; 2K3B A; 1E6H A; 2EBP A; 1BU1 A; 1YP5 A; 1WYX A; 2DX1 A; 2JW4 A; 2E5K A; 2LQN A; 3I9Q A; 4J9F A; 2MOX A; 1X2Q A; 1CKB A; 2BTT A; 3M0U A; 4FSS A; 1ZX6 A; 2HSP A; 4ORZ A; 2EGA A; 5IXF A; 2GTO A; 1JO8 A; 1NYG A; 4JJD A; 2GNC A; 1NEB A; 2I0N A; 2BZY A; 3THK A; 1ZUK A; 3R6N A; 1NG2 A; 5FWC A; 4F16 A; 2AZS A; 2DRK A; 2EW3 A; 1GCQ C; 2PZ1 A; 2SRC A; 1NM7 A; 2LJ1 A; 2YT6 A; 1J3T A; 2JS2 A; 2FO0 A; 1QWF A; 1K0X A; 4J9G A; 1MV0 B; 2G6F X; 2KYB A; 2O88 A; 1HSQ A; 4J9C A; 4RTY A; 1SHF A; 3QWY A; 1WX6 A; 2EYW A; 1X43 A; 3VS3 A; 3UF4 A; 1K4U S; 2RF0 A; 2A37 A; 1YNZ A; 1H8K A; 2A36 A; 1I07 A; 1OOT A; 2HEQ A; 3QWX X; 1K1Z A; 2C0T A; 1UG1 A; 1X6G A; 1VYT A; 1OV3 A; 1PKT A; 1PHT A; 5EC7 A; 4RTW A; 2SEM A; 1ZUU A; 4OMQ A; 2EGC A; 2VKN A; 3H0I A; 4E6R A; 3VS2 A; 1BK2 A; 3UA7 A; 2X3W D; 5GJW B; 4ZNX A; 1W6X A; 2HBW A; 1T3L A; 1WFW A; 4RTV A; 1G83 A; 4AG1 C; 1LCK A; 1GFC A; 3ULR B; 2FRY A; 1WLP B; 2MCN A; 3TVT A; 5I11 A; 4RTZ A; 3NGP A; 1X2K A; 3UA6 A; 2KR3 A; 1S1N A; 2JS0 A; 1KFZ A; 3C0C A; 1T0H A; 2DNU A; 3SHW A; 2ROL A; 2RQT A; 3I35 A; 1RLP C; 2J05 A; 2ENM A; 4DEY A; 3EG1 A; 2LJ0 A; 1SSH A; 4OMO A; 1UUE A; 1QKX A; 4Z89 A; 2NWM A; 4CC4 B; 2C0O A; 3EG2 A; 2KE9 A; 2O9S A; 2GBQ A; 2D0N A; 1PRM C; 3VRZ A; 3EG3 A; 1JXM A; 4GLM A; 3VS0 A; 4RTU A; 1K9A A; 1WDX A; 1X69 A; 1YN8 A; 3VS7 A; 2AKL A; 4JPB W; 2BZ8 A; 4F14 A; 1AZG B; 4CC3 A; 2FRW A; 5HCK A; 4JZ3 A; 1BBZ A; 4CC7 A; 4HVW A; 3EG0 A; 4J9B A; 3EHR A; 2DIL A; 4CC2 A; 4J9I A; 1AD5 A; 4LUD A; 1PKS A; 3VRY A; 3VS1 A; 4HVU A; 5IHK A; 1AEY A; 2YDL A; 2KBT A; 1IO6 A; 3NHN A; 2RQU A; 2O9V A; 2FG0 A; 3UAT A; 2CT4 A; 1ABO A; 1KSW A; 1SRL A; 2OJ2 A; 3VS5 A; 1SEM A; 2EKH A; 1N5Z A; 3U23 A; 1GRI A; 2RPN A; 4JJC A; 1JXO A; 1XOV A; 2EPD A; 1T0J A; 2L0A A; 1Y57 A; 1M3B A; 2DBK A; 1SRM A; 3M0S A; 5GJV B; 3A98 A; 4J9H A; 1OEB A; 4Y92 A; 1W1F A; 2DL5 A; 3FJ5 A; 1CKA A; 1GBR A; 2FPF A; 2V1R A; 3REA B; 2LQW A; 1M8M A; 5IH2 A; 1WI7 A; 1I0C A; 1QKW A; 3PVQ A; 4LNP A; 4WCI A; 2AZV A; 2KRO A; 2D8J A; 3M0R A; 2DE0 X; 1X6B A; 2JTE A; 2YSQ A; 1H92 A; 3I5S A; 2RQW A; 2C0I A; 1WA7 A; 1TUD A; 2DBM A; 2OAW A; 4HVV A; 2KT1 A; 1UDL A; 4ESR A; 1HJD A; 1VYU A; 2KYM A; 1YWP A; 4RUG A; 1M27 C; 1UFF A; 4D8K A; 2DL3 A; 2JT4 A; 4AG2 C; 2KGT A; 2KRM A; 2RQV A; 2JXB A; 2CH4 W; 1QWE A; 1H3H A; 1VYV A; 2K7A A; 2KXD A; 1OPK A; 2W10 A; 3ZL7 C; 4K11 A; 2RN8 A; 4HCK A; 4AFU C; 3IQL A; 3REB B; 5IXB A; 4X1V A; 3SEM A; 2DVJ A; 1Z9Z A; 2YUP A; 2DJQ A; 2JMA A; 2KRS A; 4IIO A; 1G2B A; 1NLP C; 1K0S A; 2CDT A; 1KJW A; 3H0F A; 4J9E A; 2M0Y A; 2O31 A; 4R0K A; 2YUN A; 2K79 A; 4QT7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2VGM A; 2ZAE A; 4PJL A; 1G5V A; 2EQU A; 3HHT B; 3TSW A; 4PLI A; 2EQI A; 3X26 B; 4E7K A; 2DRM A; 2NUP A; 2GCX A; 4ELZ C; 4B9W A; 2RM4 A; 4C92 D; 1QQJ A; 1AWJ A; 2F2V A; 2H3J A; 3JCM g; 4DA4 A; 4LDW A; 2YRC A; 1GCP A; 2KSS A; 1YIT A; 1ZA1 B; 2DO3 A; 1IZ6 A; 2H8H A; 1WXU A; 2YLC A; 1C0M A; 2O4X A; 4C0D C; 3P8H A; 2L3P A; 1EZZ B; 2JMC A; 1K8A U; 2EJF A; 2K2M A; 2ZGW A; 1BCO A; 1YJN A; 1FMK A; 4M77 D; 2CZ7 B; 3RKW A; 4D8D A; 3OMC A; 5LJ5 j; 2RHU A; 2E3H A; 3CQT A; 2X3X D; 2EGE A; 3PVL A; 2K2V A; 3EFS A; 4LDY A; 3NPF A; 3G71 A; 5GAN d; 1N27 A; 4BE2 A; 1K8A C; 2FZK B; 4C0G A; 1OU9 A; 4AFZ C; 1VQM Q; 1QP2 A; 2MAM A; 2ABL A; 2B86 A; 4HT8 A; 1K8A R; 1M8V A; 1B7T A; 2VGN A; 5GAN 3; 1PG5 B; 1OYX A; 1GL5 A; 2VUB A; 2CUD A; 1W70 A; 4LE9 A; 5GAO l; 3QZ5 B; 2ED0 A; 4JRI A; 1VQ5 A; 1IRX A; 2FPE A; 1I81 A; 4M75 D; 2KK4 A; 2L3S A; 1KQS S; 3I56 A; 1JU5 C; 1LOJ A; 3VUB A; 1QVG A; 1JEG A; 2YRD A; 2VVK A; 1A0N B; 4M78 G; 2LTO A; 2EQK A; 2M51 A; 3CME Q; 1KHI A; 1UB4 A; 5AT1 B; 3URG A; 1D09 B; 2EQM A; 2XDB A; 2JJ9 A; 1AOJ A; 1QW1 A; 5GAM j; 1VQM T; 2CT3 A; 1EFN A; 3CCU T; 3A8L B; 3LYI A; 3A8O B; 5ECA A; 4R55 A; 4LUE A; 2RMO A; 3MP8 A; 3EG9 B; 5GAN f; 3TU4 K; 1O75 A; 4C8Q E; 3VS4 A; 3BDU A; 2Z0W A; 2FB7 A; 1GBQ A; 4ZN3 A; 2MIO A; 3FB9 A; 1JJ2 A; 2CP0 A; 4CRI A; 3LX7 A; 2E70 A; 2A0F B; 3A5Z B; 5FU7 C; 2DEQ A; 2CSQ A; 1WNL A; 1R0B G; 2LP5 A; 3H9N A; 3JV3 A; 3CC7 Q; 1WHL A; 1PWT A; 2J7I A; 1RAE B; 2J6F A; 4C8Q F; 1JQQ A; 4QQ6 A; 4JZ4 A; 2CZ6 B; 1KHC A; 4OML A; 4JRK A; 1MND A; 1VOM A; 1D3B B; 1GFD A; 1VQ6 T; 2RHY A; 1VA7 A; 3N5B B; 4N4G A; 2JN0 A; 3MO8 A; 1YP5 A; 3SB2 A; 1HK9 A; 2LQN A; 3AHU A; 4O6J A; 5KYX B; 4FSS A; 5IXF A; 1IGQ A; 2GTO A; 1NYG A; 4JJD A; 4XK8 E; 1VQK A; 2FZC B; 3CCL Q; 3JCM h; 3CCJ Q; 3QZ9 B; 4XTY A; 3SWN A; 4II1 A; 4M78 E; 5FWC A; 4F16 A; 4J8O A; 2PZ1 A; 4PJO G; 5IT9 E; 2R5M A; 3NTI A; 4DBR A; 3O8V A; 4R56 A; 3FDR A; 1MV0 B; 2O88 A; 1VQL T; 4BI4 A; 3GNF B; 4J6X A; 1WX6 A; 1TSF A; 3UF4 A; 5GAN 6; 9ATC B; 2RF0 A; 2DD5 A; 2P0Q A; 1YNZ A; 1LVK A; 1OOT A; 2KMT A; 3NFC A; 3GF5 A; 3CPW S; 3OW2 S; 4M7D F; 4N0A A; 4LDV A; 2HEQ A; 1X6G A; 1OV3 A; 5LL6 S; 1Q86 C; 4FL6 A; 4MDX A; 2SEM A; 3JCM V; 4OMQ A; 1B34 B; 2EWN A; 3H0I A; 3LGL A; 3HTR A; 3UA7 A; 2VXF A; 2XDP A; 5GJW B; 3S3M A; 1T3L A; 2CGH A; 1WFW A; 3CCL T; 1Q86 R; 3VKI A; 4AG1 C; 3CCJ T; 1GFC A; 3ULR B; 2FRY A; 1WLP B; 2IVW A; 3RIR A; 8ATC B; 1U1S A; 5I11 A; 2QDY B; 4QKU A; 1QVG P; 2OTJ A; 5GAN 5; 1ZA2 B; 3QKJ A; 4F7U G; 4QQD A; 4A54 A; 3ER0 A; 2ZPH B; 3MHX A; 3H6Z A; 2JS0 A; 1T0H A; 2RJF A; 1FWZ A; 3LWH A; 1W4S A; 3G7Z A; 1KQ2 A; 1M1K U; 1TU0 B; 2J05 A; 5KYU A; 1PM3 A; 2DK3 A; 3CBM A; 3RDV A; 1ZQ1 A; 1KD1 U; 4Z89 A; 2YXY A; 2C0O A; 3EG2 A; 3I55 A; 1Y96 A; 4C8Q C; 1HXD A; 2QK0 A; 3OA6 A; 1YIT Q; 3CEY A; 2HAX A; 4OF1 A; 3VRZ A; 4PNO A; 1M1K C; 4RTU A; 1K9A A; 2AKL A; 4JPB W; 4F14 A; 1W2B S; 1KD1 C; 2O01 E; 1JJ2 P; 4M7A G; 1I5L A; 3EGX A; 4PJO E; 4M77 F; 3FC3 A; 1M1K R; 3V7S A; 2VB6 A; 1ZSZ A; 4CC7 A; 1Y07 A; 3G71 Q; 1YI2 A; 1KD1 R; 2DIL A; 3E19 A; 3EFO A; 3NTK A; 2KBT A; 1IO6 A; 3RKY A; 4DBH A; 2O9V A; 1M2O A; 5C0M A; 4L5G A; 2V8J A; 2HZY A; 1ABO A; 3MP6 A; 2OJ2 A; 3VS5 A; 3JSC A; 4N4I A; 1WHM A; 1N5Z A; 2VC8 A; 3DLM A; 3ZEH A; 3S3O A; 3BW1 A; 3NTH A; 5GMK h; 3KUF A; 3HFN A; 1JXO A; 1XOV A; 2DKG A; 2I2L A; 1VQ5 Q; 1WJS A; 3OYJ A; 3LGF A; 1YIT T; 3QBY A; 3L2Z A; 5GJV B; 1Y71 A; 4M78 C; 3CCE Q; 4E7Z A; 4M75 F; 3FJ5 A; 2V1R A; 1M8M A; 3JCM e; 5I2S A; 4BE0 A; 1WI7 A; 1YJN T; 4C5H A; 4F7U E; 1QKW A; 3PVQ A; 2AZV A; 2KRO A; 4FU6 A; 2KQW A; 2EIF A; 2DPP B; 3M0R A; 2QTX A; 1VQP A; 2COZ A; 1ACM B; 3G71 T; 3I5S A; 2ZCF B; 4QW2 A; 4XTX A; 2E41 A; 4KBM B; 4HVV A; 3V7R A; 1UDL A; 4N4H A; 1HJD A; 4DBF A; 1NE8 A; 3CXC A; 4D8K A; 2DIG A; 5FU6 B; 4AG2 C; 5LJ3 g; 2KGT A; 2KRM A; 3EGD A; 2RQV A; 3PMI A; 2DET A; 3ZFJ A; 1VYV A; 2V26 A; 2MYS A; 2OTL A; 2W10 A; 1P92 A; 4OB3 B; 2KY9 A; 2EJ9 A; 3REB B; 4M7A E; 4RCC A; 3JB9 J; 3CME A; 3CCV A; 1VQ5 T; 5AYF A; 2QI2 A; 5CKF A; 4IIO A; 4PK4 A; 1G2B A; 1YJW Q; 1N8R C; 2BE7 D; 4RG8 A; 3P8B B; 2L3R A; 4E47 A; 2HKQ B; 3I56 T; 2O31 A; 1OQK A; 4R0K A; 2YUN A; 3MEU A; 3OYK A; 2XHC A; 4C0F A; 3JB9 G; 1N8R R; 2J6O A; 1Q81 U; 1UGS B; 2H3E B; 1M2V A; 2F2X A; 1G3W A; 5CCA A; 1E7O A; 3ZBD A; 1G3T A; 1UTI A; 2DL4 A; 1H3Z A; 4Y28 E; 1R0C B; 2QAZ A; 4HA8 A; 2LMJ A; 1UJ0 A; 5CKD A; 3SWN C; 2EYY A; 4DEX A; 1Q81 C; 3A1P A; 1NZ9 A; 4A63 B; 4IUV A; 3JB9 I; 2F2W A; 1NJI U; 1WQW A; 1UEB A; 4RCB A; 2CP3 A; 2LVM A; 4C92 B; 1UHC A; 3CC7 A; 1NYF A; 2D1X A; 4PJO C; 3C94 A; 1Q81 R; 5EG2 A; 3KFV A; 1E6G A; 1TUC A; 4PFO A; 3SFM A; 1NJI C; 2M02 A; 5FRN A; 1BYM A; 5D6Y A; 2V8K A; 2B8A A; 4IUQ A; 4RMO A; 1NJI R; 2A08 A; 5A0D A; 1QVF A; 2RA2 A; 2LNV A; 4HT9 A; 3LH5 A; 5LJ3 d; 2R58 A; 2A3L A; 1Q7Y U; 3VYG A; 1UE9 A; 1RLQ C; 1BI0 A; 4XTU A; 2MMP A; 4IIM A; 2QYZ A; 3M4G A; 1VQN A; 3OYE A; 4V2S A; 4PJN A; 3VS6 A; 1ABQ A; 2AK5 A; 2DM1 A; 2CP5 A; 1Q7Y C; 4FIB A; 2L2P A; 5GMK e; 3G6E Q; 5GAN j; 1I1J A; 1VQK T; 3EAE A; 4LD6 A; 4OP0 A; 2X4J A; 3TEE A; 4PJM A; 3QG1 A; 3GLX A; 4JRP A; 2KRN A; 3GOX A; 4M75 B; 2MPX C; 2OTJ Q; 1Q7Y R; 1IXD A; 2VV5 A; 5KE2 A; 1SKU B; 4ATO A; 2O2O A; 3HKS A; 3M56 A; 2YUQ A; 2LCC A; 1I5O B; 4KUL A; 4AFS C; 4Z8A A; 4OMN A; 2MI6 A; 2DXU A; 2E6N A; 3UWN A; 2K9G A; 3MEA A; 2RI3 A; 3CXC P; 1KK7 A; 1MUZ A; 1RI9 A; 3I55 Q; 1K76 A; 1FYN A; 1KC8 U; 5HY6 A; 2HCK A; 4M7A C; 2OI3 A; 4XU2 A; 5LJ3 h; 4TVR A; 4BY6 C; 2HL5 C; 3C12 A; 3CBP A; 1VQ8 A; 1ARK A; 1ZBJ A; 1UJY A; 5LJ3 f; 3ASK A; 2RB6 A; 4ANJ A; 1KC8 C; 3CMA A; 4A4F A; 2DL8 A; 3QHS A; 3PMT A; 4HCZ A; 2DIQ A; 3OQ5 A; 1NPR A; 1YI2 Q; 1B3Q A; 2JM9 A; 1B07 A; 3E2U A; 2OTJ T; 2JUF A; 1KC8 R; 1Y96 B; 2E1H A; 1PD1 A; 2EYZ A; 1XJW B; 3BFM A; 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