The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
74
|
structure length |
74
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Chain Sequence |
GSRRASVGSMEAIAKYDFKATADDELSFKRGDILKVLNEECDQNWYKAELNGKDGFIPKNYIEMKPHPEFIVTD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Orientation of peptide fragments from Sos proteins bound to the N-terminal SH3 domain of Grb2 determined by NMR spectroscopy.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
GROWTH FACTOR RECEPTOR-BOUND PROTEIN 2
|
| molecule tags |
Signal transduction protein
|
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
7
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| structure length |
74
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| sequence length |
74
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1994-08-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QDL A; 2JXB A; 2VWF A; 3U23 A; 1MUZ A; 2LCS A; 1K0X A; 1G83 A; 3CQT A; 1ABQ A; 4J9B A; 1X43 A; 4HVV A; 1AWJ A; 2AZV A; 2JM8 A; 4OMQ A; 1X2K A; 4J9E A; 2J6F A; 2ROT A; 2D8H A; 3UAT A; 5I22 A; 3I35 A; 1QLY A; 1GRI A; 3PVL A; 5IXB A; 4LN2 A; 1W1F A; 1UJ0 A; 3REB B; 2IIM A; 3ULR B; 2X3W D; 1SEM A; 2PNI A; 4X1V A; 3REA B; 1SHG A; 2YUO A; 1OPK A; 2V1R A; 4LUD A; 2KR3 A; 1GBQ A; 1Y57 A; 1KJW A; 2DA9 A; 2KRN A; 4GLM A; 4JZ4 A; 3R6N A; 3TVT A; 1UE9 A; 2CT4 A; 4A63 B; 2HCK A; 2EGC A; 4OMO A; 1UHF A; 2CT3 A; 2LZ6 B; 2EPD A; 3UA6 A; 1JXM A; 1UUE A; 4AFZ C; 1ARK A; 4LE9 A; 1K0S A; 4R0K A; 3M0P A; 2KRM A; 1XOV A; 2GTJ A; 2RPN A; 4OMM A; 5IH2 A; 1M3B A; 4LNP A; 2L3P A; 2CSQ A; 3VS7 A; 1TG0 A; 3NHN A; 1JXO A; 1ZUU A; 1AVZ C; 1K9A A; 2C0O A; 4OMN A; 1B07 A; 2J6O A; 4F14 A; 1M27 C; 2EW3 A; 2BTT A; 2EYW A; 1V1C A; 2JM9 A; 2OJ2 A; 5FWB A; 1OOT A; 4JJB A; 1NLO C; 3EG1 A; 4F17 A; 1M8M A; 2CRE A; 2I0N A; 1X6B A; 2HDA A; 1PKT A; 1Z9Z A; 1U06 A; 4RTV A; 2DVJ A; 2RQT A; 2EGA A; 2KT8 A; 4CC4 B; 2RF0 A; 1CKA A; 2C0T A; 2YUP A; 3M0S A; 2YSQ A; 4ZNX A; 1M3A A; 1A0N B; 2BZY A; 2GQI A; 1AZE A; 1YN8 A; 2KRO A; 5EC7 A; 3PE0 A; 4AFS C; 2PZ1 A; 2DF6 A; 2L0A A; 3IQL A; 1NLP C; 1ABO A; 2O88 A; 3NGP A; 2FEI A; 2DX1 A; 1VYV A; 2DL7 A; 2KYB A; 4WCI A; 2AKK A; 4LUE A; 2EYZ A; 2MCN A; 2KXC A; 1WXB A; 2O9S A; 4GBQ A; 4Z89 A; 4DEX A; 1YCS B; 3A98 A; 3H0I A; 1UDL A; 3SEM A; 3TSZ A; 2DIL A; 2DLP A; 2YT6 A; 2JMA A; 1WI7 A; 2JW4 A; 4JJC A; 4D8K A; 3UA7 A; 2DL4 A; 1RUW A; 4FSS A; 2CSI A; 2VVK A; 1YWP A; 1NEB A; 4J9I A; 1X6G A; 2J06 A; 1UG1 A; 3EG3 A; 1T0H A; 3ZL7 C; 2JMC A; 1MV3 A; 2OAW A; 4RUG A; 3M0U A; 1FMK A; 1TUC A; 2J6K A; 3QWX X; 3THK A; 1CKB A; 1ZX6 A; 1WFW A; 2FPF A; 3KFV A; 3VS4 A; 4RTY A; 1QCF A; 4HVW A; 2XMF A; 1AD5 A; 1BK2 A; 2EGE A; 2EVR A; 4Z88 A; 1QKX A; 1SPK A; 5IHI A; 3M0R A; 2DRK A; 4OMP A; 2K7A A; 2KRS A; 4OML A; 3VRY A; 1H8K A; 1RLQ C; 2KGT A; 1PHT A; 2NUZ A; 2CH4 W; 2JT4 A; 1VYT A; 4RTZ A; 4ESR A; 3I9Q A; 1BBZ A; 2FO0 A; 1WXU A; 2C0I A; 2J05 A; 1GCQ A; 2KEA A; 2W0Z A; 3O5Z A; 1T3L A; 1N5Z A; 2RQW A; 4JZ3 A; 2LQW A; 2HEQ A; 2EBP A; 2X3X D; 1FYN A; 1WXT A; 4D8D A; 4HCK A; 2G6F X; 2LJ1 A; 4IIO A; 2CH4 A; 1BU1 A; 3LH5 A; 3I5S A; 1EFN A; 3VS0 A; 1GFD A; 4CC3 A; 2LJ0 A; 1W70 A; 2D8J A; 2RQR A; 2A36 A; 4RTX A; 1Y0M A; 5GJV B; 2CDT A; 4DEY A; 1S1N A; 2ESW A; 2VKN A; 2YUQ A; 2AK5 A; 3UF4 A; 1UHC A; 2V1Q A; 3EGU A; 1T0J A; 1GFC A; 2KE9 A; 2W10 A; 1NEG A; 2FPE A; 4K11 A; 2A28 A; 3H41 A; 2B86 A; 1HD3 A; 2GNC A; 1K1Z A; 1UFF A; 2K6D A; 2O2O A; 4M4Z A; 2LX7 A; 3M0Q A; 2E5K A; 1ZBJ A; 2MIO A; 1H92 A; 1NYG A; 2BZX A; 2P4R A; 1X27 A; 3VS2 A; 4AG2 C; 3JV3 A; 2FPD A; 1KFZ A; 5FW9 A; 1ZUY A; 2RQV A; 1G2B A; 5IXF A; 2K79 A; 1CSK A; 2KBT A; 1K4U S; 2YDL A; 1WX6 A; 2J7I A; 1UEC A; 2PTK A; 2DYB A; 3EHQ A; 4AG1 C; 1J3T A; 3EG2 A; 3I5R A; 1JO8 A; 3TSW A; 2DL8 A; 5IHK A; 2DJQ A; 2DE0 X; 2D1X A; 4HVU A; 1VA7 A; 1T3S A; 1VYU A; 3VS6 A; 1PNJ A; 2L3S A; 2K9G A; 5IHN A; 1HSQ A; 5GJW B; 1GL5 A; 2A08 A; 3C0C A; 3RBB B; 1X69 A; 4HXJ A; 4QT7 A; 2KXD A; 1E7O A; 3EHR A; 4J9G A; 1B3Q A; 1YP5 A; 1AOJ A; 1SRL A; 3RNJ A; 1SRM A; 1YWO A; 2LQN A; 1I07 A; 2L3Q A; 2A37 A; 2SRC A; 1I1J A; 4J9D A; 1JEG A; 2HSP A; 2JS0 A; 3NMZ C; 4JJD A; 2RNA A; 2M51 A; 5I11 A; 1E6G A; 1QKW A; 1ZSG A; 1WA7 A; 1WYX A; 2ROL A; 3H0H A; 1KIK A; 1U3O A; 2CUD A; 1NM7 A; 3VRZ A; 1K76 A; 4CC7 A; 1LCK A; 1AEY A; 1UGV A; 2ED0 A; 3GBQ A; 1W6X A; 1OV3 A; 4ORZ A; 4RTW A; 4Z8A A; 2OI3 A; 3NPF A; 2LJ3 A; 2LP5 A; 2RQU A; 2MOX A; 1RLP C; 4J9F A; 3VS1 A; 1QWF A; 1JU5 C; 3QWY A; 1BB9 A; 2DNU A; 2RN8 A; 4JPB W; 1PRL C; 3SHW A; 2FG0 A; 1Z9Q A; 4J9H A; 2RMO A; 2AZS A; 1X2Q A; 1AZG B; 2F2V A; 2DM1 A; 4KRT A; 2GGR A; 1IO6 A; 2ECZ A; 4J9C A; 4CC2 A; 2F2X A; 1I0C A; 1ZUK A; 1NG2 A; 2K3B A; 1JQQ A; 1NYF A; 1ZLM A; 2GBQ A; 1E6H A; 1GBR A; 2D0N A; 2CUB A; 2O9V A; 2GTO A; 4EIK A; 2AKL A; 1PKS A; 2DBK A; 2H8H A; 3M0T A; 2DRM A; 1AWW A; 4IIM A; 1SSH A; 1U5S A; 2LNH B; 2DL3 A; 2SEM A; 2LMJ A; 2HBW A; 2JTE A; 3H0F A; 1M3C A; 5FWC A; 3FJ5 A; 1WIE A; 2FRY A; 4Y92 A; 2YUN A; 1PRM C; 3EG0 A; 2BZ8 A; 4AFU C; 1OPL A; 2M0Y A; 1MV0 B; 2EYY A; 2JS2 A; 2KYM A; 1AWO A; 1UTI A; 2EYX A; 1GCP A; 4RTU A; 1PWT A; 2KT1 A; 1TUD A; 2O31 A; 2KNB B; 1SHF A; 1QWE A; 1WDX A; 1GCQ C; 3VS3 A; 1H3H A; 4F16 A; 1WLP B; 5L23 A; 2EKH A; 1HJD A; 3VS5 A; 2L2P A; 5HCK A; 2NWM A; 4RTT A; 1YNZ A; 2F2W A; 1AWX A; 2ED1 A; 1UJY A; 2DMO A; 3PVQ A; 2K2M A; 4AFQ C; 1M30 A; 2ENM A; 5ECA A; 2ABL A; 1KSW A; 2DL5 A; 2EQI A; 4E6R A; 1OEB A; 1RI9 A; 2FRW A; 2DBM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5CAI A; 2JXB A; 3T9N A; 1IHW A; 1MUZ A; 5GMK h; 4FYY B; 1K0X A; 3ZBD A; 4J9B A; 1VQ8 A; 1X43 A; 4M75 A; 4HVV A; 4BDY A; 3OYI A; 2VXE A; 2J6F A; 3UAT A; 2R57 A; 3PVL A; 3VKI A; 4LDU A; 1SF9 A; 3FB9 A; 3OYK A; 4PJO A; 4EMG A; 2ZPG B; 5I2M A; 3FJP A; 1NZ9 A; 3REA B; 4XK8 E; 4HCZ A; 3NTI A; 2YUO A; 2COZ A; 3GLX A; 1Q81 R; 2KRN A; 1KJW A; 4JZ4 A; 4F7U F; 4IUP A; 3CD6 Q; 4C92 D; 2HCK A; 2QAS A; 2BKD N; 2CT3 A; 2VXF A; 4JJN K; 1K73 C; 2HQE A; 3GF5 A; 4LE9 A; 7AT1 B; 3CCQ T; 2DK3 A; 4M7D E; 1M2V A; 1XQH A; 1JB0 E; 2LQK A; 2RPN A; 3RES A; 3M4G A; 3LYI A; 1VQ6 Q; 1M1G A; 4KUD K; 2VUB A; 3EH2 A; 3VS7 A; 1TG0 A; 1NPP A; 3P8B B; 4M75 D; 1K9A A; 3UT1 A; 2P4T A; 3CMA Q; 4OMN A; 1M27 C; 2EW3 A; 5GMK l; 5GAO m; 4M7A C; 2BTT A; 2GQV A; 5DLQ E; 4M7D F; 2OJ2 A; 1OOT A; 4JJB A; 3HP9 A; 4PJO D; 5CKF A; 2K3Y A; 1X6B A; 3CCU Q; 4BDZ A; 1U06 A; 2RQT A; 3OYM A; 2H3J A; 1SSF A; 3M0S A; 2RHU A; 2YSQ A; 3JCM P; 2MYS A; 2QTV A; 4BI3 A; 3OYD A; 1M90 R; 2ATC B; 1KK7 A; 1Q82 R; 2E6Z A; 4CI0 C; 3QYH B; 1JRI A; 1YN8 A; 2E65 A; 5EC7 A; 2QEX A; 4AFS C; 2LTO A; 3CXC S; 2DF6 A; 5CKD A; 1QP2 A; 4IUR A; 1F1B B; 2F1L A; 4A4E A; 1WHL A; 3C4S A; 3PT9 A; 3OY9 A; 4DBR A; 1TWB A; 4GBQ A; 2O9S A; 1Q81 C; 4DEX A; 1HXD A; 2RK1 A; 4ZGE B; 1QVP A; 4BE2 A; 2JMA A; 1WI7 A; 1PSF A; 2JW4 A; 4C8Q A; 5LJ3 j; 1BI2 A; 4M78 E; 1LJO A; 3QII A; 3CPW S; 1VQ4 Q; 2AHJ B; 3G6E Q; 1I5O B; 4JUV A; 2VVK A; 1YWP A; 3OYA A; 2OTJ T; 3MP8 A; 3RMQ A; 2Y4Y A; 3ZL7 C; 2EYQ A; 2JMC A; 1MV3 A; 2OAW A; 2J6K A; 1TUC A; 2QA4 Q; 1YIT T; 1CKB A; 2FPF A; 3VS4 A; 4RTY A; 4MDW A; 5FRM A; 2XMF A; 5GAN j; 4J7I A; 1D3B A; 3OS1 A; 2EGE A; 1BK2 A; 2EVR A; 1QKX A; 1SPK A; 2R5M A; 2DRK A; 1KQS P; 3A8M B; 4OML A; 1YIJ Q; 2CP7 A; 3QKJ A; 2D6F A; 3G1J A; 2DFU A; 4HT9 A; 3CCS A; 2JT4 A; 4RTZ A; 1VQP T; 1BBZ A; 1WXU A; 2C0I A; 5J26 A; 1Q82 C; 4M7A G; 5A2Q E; 4C8Q D; 1R77 A; 4EMH A; 5GAM f; 4OF1 A; 3FDR A; 4C92 C; 1N6A A; 1BU1 A; 1VQ6 A; 3HTR A; 1W70 A; 2D8J A; 1VQM Q; 4GLK A; 3DKM A; 4RTX A; 5KYU A; 1YCY A; 2L89 A; 3I55 Q; 1VQ9 Q; 2CDT A; 4N0A A; 1BIA A; 3CMA A; 3A8H B; 2ESW A; 5IN1 A; 1GFC A; 2W10 A; 3TCJ A; 4BAC A; 1NEG A; 4K11 A; 3L2W A; 3SWN A; 4ME7 A; 4M75 C; 5FU7 C; 1OZ3 A; 2MI6 A; 1HD3 A; 2M1H A; 2YLB A; 1K1Z A; 1TU0 B; 4M4Z A; 4J6W A; 2LX7 A; 2MIO A; 2DIG A; 3VJP A; 3CCJ Q; 1X27 A; 1Q7Y R; 4C5E A; 2FPD A; 4PJO C; 2RO0 A; 3RKY A; 2RQV A; 3SDZ A; 2GFA A; 5IXF A; 1ZA2 B; 1W2B A; 5LJ5 f; 1CSK A; 4IUT A; 3CC7 Q; 1OQK A; 5CQY A; 3QDR B; 2JOY A; 3JCM g; 2EJ9 A; 3L2U A; 1M1K R; 1RAA B; 1UEB A; 1VQL T; 2OTL Q; 4NL3 A; 4HVU A; 1T3S A; 1KG1 A; 2YXY A; 2QQS A; 4BI8 B; 5GJW B; 2DZ9 A; 2ZPF B; 1GL5 A; 2E64 A; 1Q86 R; 2A08 A; 2BIV A; 4M7A F; 1YJ9 Q; 3OBY A; 2DER A; 4M77 F; 2RHX A; 5KE2 A; 3RBB B; 1KHC A; 2NYS A; 4QT7 A; 2KXD A; 4J9G A; 1YP5 A; 2VYT A; 4E7K A; 2L3Q A; 3EH1 A; 2A37 A; 2RI2 A; 1VQK Q; 4IUU A; 3FRN A; 2JS0 A; 2RJC A; 3BFM A; 4FM4 B; 2JN0 A; 5I11 A; 1QKW A; 2EJF A; 4KH0 B; 3QJ6 A; 3H0H A; 1YHQ T; 3JB9 I; 1FMV A; 1KIK A; 1YIJ A; 3BW1 A; 2CUD A; 1NM7 A; 2EQK A; 2V8J A; 2FVU A; 2K5I A; 2MF2 A; 1LCK A; 4C92 G; 4AT1 B; 1AEY A; 4M7D B; 4A4G A; 1W6X A; 4RTW A; 4Z8A A; 1YI2 Q; 2E1H A; 2HL3 A; 3BDL A; 1ZBX A; 2COY A; 2F5T X; 3S3N A; 4FT2 A; 1QWF A; 4QQG A; 2DNU A; 2XDB A; 3I56 T; 1Z9Q A; 4J9H A; 4M75 G; 1B34 B; 1M1K C; 3A5Z B; 4KH1 B; 2FB7 A; 3OYB A; 1IO6 A; 4J9C A; 1V29 B; 4C8Q C; 4YTL A; 4DQ2 A; 1I0C A; 5GAN 4; 1JQQ A; 3OQ5 A; 4PJO G; 3I55 A; 1KQ1 A; 1VQ9 A; 2DAQ A; 4HCC A; 4FL6 A; 3JB9 D; 2D0N A; 3OYL A; 2GTO A; 2AKL A; 3F70 A; 4AMC A; 2DBK A; 2CP2 A; 1K8A R; 3MEW A; 2Y90 A; 4E7H A; 4IIM A; 3OYN A; 1U5S A; 2HBW A; 3CCJ A; 2E3H A; 1M3C A; 5FWC A; 3FJ5 A; 1WIE A; 2FRY A; 4Y92 A; 2QQB A; 2YUN A; 2BZ8 A; 4AFU C; 4X9C A; 3CC7 A; 1MV0 B; 2EYY A; 3H8Z A; 1NPR A; 2XG8 D; 4RTU A; 1VQN A; 1NJI R; 2M02 A; 1SHF A; 2DTO A; 4C92 F; 3JAM E; 3BY7 A; 2OTL A; 4M78 D; 1WLP B; 1C0M A; 3EG9 B; 1G3T A; 1UGP B; 5HCK A; 5A0G A; 3TU4 K; 4IUV A; 4LD6 A; 4BI4 A; 1M9S A; 3L2V A; 2WSF E; 3G71 T; 3CCL A; 3WVD B; 5CIU A; 2HL5 C; 4M75 F; 1M30 A; 2DPP B; 1M4Z A; 2EQI A; 3CCM Q; 2CP3 A; 5FRO A; 3CC2 A; 3JCM e; 4N0A C; 3E9F A; 1WPY A; 1VQO Q; 2QDL A; 4XAX B; 3RER A; 3QUI A; 4PJO F; 1QW1 A; 3JCM J; 9ATC B; 3SWN C; 4PNO A; 5LJ3 d; 2XKO C; 2HQX A; 1ABQ A; 1S72 A; 3CXC A; 2FHD A; 4XQ3 A; 4XTV A; 3QZ9 B; 4OMQ A; 4J9E A; 1BYM A; 3MO8 A; 1VIE A; 3HFN A; 1K8A C; 4C8Q G; 1YI2 A; 1VUB A; 3MEV A; 3V7C A; 3EFR A; 2IIM A; 1TH7 A; 3JCM b; 2PNI A; 1I4K 1; 3DB4 A; 5GAN d; 3CPW A; 4MMK A; 1D1B A; 5GAO p; 2CS7 A; 2V1R A; 4OVA A; 2IVW A; 5KYW B; 2ZPH B; 1QP3 A; 1NJI C; 5C0M A; 2MAM A; 1K73 U; 2CT4 A; 3E1S A; 4OMO A; 1UHF A; 2LZ6 B; 3UA6 A; 1G3Y A; 1QVF S; 1JXM A; 1UUE A; 1VQ7 Q; 1PM3 A; 4N4H A; 4R0K A; 3M0P A; 2KRM A; 1XOV A; 1QCN A; 5GAO l; 4DOW A; 3CCE Q; 1IHV A; 4LNP A; 3QJY A; 2E70 A; 4TVR A; 3NHN A; 4PFZ A; 1AVZ C; 2X35 A; 4V2S A; 3QDF A; 2J6O A; 4PJJ A; 4M77 B; 1JBM A; 1B7T A; 1YBY A; 2DYI A; 2WSE E; 3JCM W; 3G4S Q; 5CVI A; 1M8M A; 2CRE A; 4OB3 B; 1Z9Z A; 1VQ8 T; 2EGA A; 2KT8 A; 3S3O A; 2C0T A; 2HBP A; 2YUP A; 1TTH B; 3PNW C; 4ZNX A; 1D1A A; 4ELY C; 1M3A A; 3TEE A; 1A0N B; 3CCV A; 4JS5 A; 1AZE A; 4C8Q F; 3PE0 A; 3C94 A; 2CZ0 B; 5HKC A; 2CYZ B; 1SG5 A; 2ZAE A; 3Q1J A; 2O88 A; 1RAB B; 3NGP A; 2DX1 A; 1Q81 U; 2PVG B; 5CO7 A; 4PJM A; 2KYB A; 2MWP A; 1GXI E; 2EYZ A; 4FW1 A; 2MCN A; 3OS2 A; 1WXB A; 1D0Z A; 3DB3 A; 2ZPI B; 3A98 A; 3MEA A; 2QGF B; 3H0I A; 2LCL A; 3SEM A; 1PD1 A; 2K5F A; 2LCC A; 3CCQ Q; 4D8K A; 4BY6 B; 3OS0 A; 4FSS A; 2CSI A; 4J83 A; 2RK2 A; 2K4Y A; 5KYX B; 4J9I A; 2YHT A; 1VQO A; 1VIF A; 1UGQ B; 1X6G A; 2ZZD A; 1IGU A; 1UG1 A; 4A4F A; 2LDM A; 3M4Y A; 3QXE B; 4RUG A; 3CC4 A; 1FMK A; 1MHN A; 5GAO r; 2HNI A; 1QCF A; 4E47 A; 4F7U E; 5GAM g; 2FYK A; 3A8O B; 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