The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ribosome
|
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
|
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
18
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| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| Q | PF01157 | Ribosomal_L21e | Ribosomal protein L21e |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3CC2 Q; 1YHQ Q; 3CPW P; 1KD1 R; 1VQ4 Q; 1VQ7 Q; 1S72 Q; 2OTL Q; 1YIT Q; 1VQP Q; 1Q86 R; 3CCQ Q; 1YJW Q; 3CD6 Q; 2OTJ Q; 1NJI R; 3CMA Q; 3CC4 Q; 1YJ9 Q; 3I56 Q; 1Q82 R; 3CCJ Q; 1VQM Q; 1QVG P; 1Q81 R; 1YJN Q; 1JJ2 P; 3G6E Q; 3I55 Q; 1VQ9 Q; 1K8A R; 3CCS Q; 3CCU Q; 1Q7Y R; 3CCE Q; 1W2B P; 3CC7 Q; 1QVF P; 3CME Q; 1K73 R; 3G71 Q; 2QA4 Q; 3CCV Q; 1YIJ Q; 1VQK Q; 1VQ5 Q; 3OW2 P; 1VQO Q; 1KC8 R; 3G4S Q; 1N8R R; 1VQN Q; 1K9M R; 1M90 R; 1VQL Q; 1KQS P; 3CCM Q; 1VQ8 Q; 2QEX Q; 1M1K R; 3CXC P; 3CCL Q; 1VQ6 Q; 3CCR Q; 1YI2 Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 1NEB A; 4F7U B; 3A8H B; 4C8Q E; 5GAN f; 1ZA2 B; 3OBW A; 3JB9 G; 4C5G A; 5KYY B; 1VA7 A; 2RQU A; 2ED1 A; 2QK0 A; 4C8Q F; 3HFO A; 5IHI A; 2EJG A; 5GAN 4; 1VYV A; 2E64 A; 2VC8 A; 2M02 A; 2KRS A; 1BBZ A; 1GBR A; 2BUD A; 2JMC A; 2OTL Q; 5KYU B; 2O4X A; 5GAN 8; 4KGV B; 3G6E Q; 1ZX6 A; 2JZ2 A; 1ZHI A; 4LN2 A; 4XAX B; 4HCB A; 5D6W A; 1QQJ A; 5IHK A; 4A4G A; 4M77 A; 2DXC A; 5HCK A; 3FIF A; 2EFI A; 5I11 A; 3LLR A; 5D6X A; 1G3W A; 2M9U A; 4HCZ A; 4E7I A; 3MEV A; 1YJN Q; 4FL6 A; 2KQW A; 1U8R A; 3CCE Q; 1TSF A; 1Y71 A; 1UGV A; 5GAN 3; 3CCM A; 3THK A; 1BYM A; 5I22 A; 3JCM Q; 1WDX A; 4RCC A; 2KT1 A; 2CH4 A; 2D8J A; 2FPF A; 1KD1 R; 5GAN g; 2HEQ A; 4KGZ B; 3JCM J; 5DM7 R; 2XKO C; 3CC4 Q; 2LP5 A; 2P0P A; 2QXF A; 3JB9 H; 4FYY B; 4LUE A; 4RTZ A; 5GMK j; 2O31 A; 1OPK A; 4J9D A; 4LD6 A; 1D1C A; 2BZY A; 4J6W A; 2XMF A; 4N0A A; 4CC7 A; 2PNI A; 4DA4 A; 4LDU A; 1UHF A; 4D8D A; 1QVF A; 1M2V B; 2X4X A; 4R56 A; 2P0Q A; 3CCM T; 4BUG A; 2PVD B; 2YXY A; 3OYL A; 4M78 D; 3TVT A; 2DET A; 1V29 B; 2RN8 A; 1KG1 A; 3EHQ A; 4V2S A; 1YFN A; 1N9S A; 3RIR A; 2YRV A; 4J9F A; 3NPF A; 3HSB A; 1NG2 A; 2QG9 B; 2ZPG B; 1VQK Q; 1C0M A; 1ZUU A; 2VUB A; 1JQQ A; 4B6M A; 2VYT A; 5IXB A; 5KH6 A; 4YTL A; 2RO0 A; 2QEX T; 3INZ A; 3M56 A; 2D0Q B; 4QVZ A; 3KXT A; 1M90 U; 3BW1 A; 2BZX A; 5C6S A; 2RMO A; 1BCO A; 4EMK A; 1UGR B; 2EBP A; 4JUV A; 4KBM B; 3CCV Q; 1YI2 A; 1HD3 A; 1H8K A; 3M0P A; 5A2Q E; 1UJ0 A; 1KQS P; 2EQJ A; 3QJ6 A; 5IAY A; 4M77 C; 3I56 A; 4FT2 A; 3H0F A; 1PKS A; 1T0J A; 1K8A C; 4LXC A; 5GAM h; 2KRN A; 1NE8 A; 4L5G A; 2BIV A; 4F04 B; 1GFC A; 2EQU A; 5CQX A; 1SPK A; 2V8K A; 5FLX E; 2D0N A; 3PVQ A; 4M75 A; 2CT4 A; 4M77 E; 3G6E A; 4F16 A; 5LJ3 h; 1I4K 1; 4RTW A; 1YI2 T; 2DM1 A; 3MHX A; 3QDR B; 4M7D D; 4OMM A; 1PC0 A; 3TU4 K; 4M77 F; 5LJ5 e; 3VS0 A; 1WIE A; 1WA7 A; 3I56 T; 3SWN A; 2C06 A; 4N0A C; 1N5Z A; 1WGS A; 3JB9 I; 3T9N A; 4JJN K; 2GFU A; 4ELZ C; 1Q86 R; 3HHT B; 4ANJ A; 1QWF A; 5FU6 C; 1AT1 B; 2DER A; 3M9Q A; 1T0H A; 2DL5 A; 4MMK A; 2R5A A; 4IUV A; 2QAZ A; 2KRM A; 2DAQ A; 2IG0 A; 2CKK A; 2L8D A; 3ZEH A; 4NL2 A; 3CC4 A; 1VYT A; 1W2B A; 1K73 U; 1OI1 A; 1RAE B; 4GLM A; 2VWF A; 2PVO B; 2RJD A; 4VUB A; 4J9H A; 2EKH A; 3RKY A; 4EMK C; 3UF4 A; 1N8R C; 2K7A A; 2BE7 D; 4BE1 A; 2P0K A; 3MEA A; 4M78 A; 3TRE A; 4M78 G; 2F1L A; 3ER0 A; 2RI3 A; 4XQ3 A; 2DL8 A; 5GJW B; 1KHI A; 4JS4 A; 1VQ9 A; 2KR3 A; 2M1H A; 3NTH A; 2F69 A; 5I2S A; 1I1J A; 4J7I A; 4ORZ A; 1WI7 A; 4C8Q D; 1KJW A; 1N8R R; 2AZV A; 2KSS A; 2JTM A; 2EW3 A; 3FB9 A; 5GMK i; 3QSU A; 4X1V A; 1AZE A; 4M75 C; 5GAM f; 2K5L A; 3R6N A; 2DMO A; 4M7A A; 3VS1 A; 3E2U A; 1QKX A; 2QTX A; 3QXE B; 1UB4 A; 1IRX A; 1VQO A; 4FM4 B; 1K9M C; 3BDU A; 3SWN C; 2MAM A; 3CQT A; 2QDL A; 2RD1 A; 1VUB A; 3URG A; 1ZUK A; 2RH2 A; 1R0C B; 2SEM A; 4JRI A; 2AKL A; 1VQ9 T; 4XTW A; 1W70 A; 1TWB A; 3PMT A; 3LH5 A; 1RAC B; 5LL6 S; 5LJ3 f; 3CMA A; 1VQ6 Q; 4HT9 A; 5CKD A; 4M75 E; 2DL3 A; 4C0F A; 2HBP A; 3CME A; 1YIJ A; 2CSI A; 2ZGW A; 2DVE A; 3HTR A; 3GNG A; 3OQ5 A; 4M75 F; 3PGG A; 4MZP A; 2CS7 A; 4J83 A; 4KH1 B; 2E5K A; 3HFN A; 1KQ1 A; 5GAO p; 3L2U A; 1IO6 A; 2FB7 A; 1OOT A; 4CC4 B; 4M7D G; 1Y57 A; 1VQO T; 2HSE B; 3OYD A; 4GY5 A; 1OQK A; 1YCS B; 4PJM A; 1WNL A; 2QQB A; 2KXC A; 2E5Q A; 3H0I A; 3F70 A; 1GCP A; 2LTO A; 5CK9 A; 2XDP A; 1PD1 A; 1YIT T; 3CMA T; 2DBK A; 2DJZ A; 4J8O A; 1TXQ A; 4PNO A; 4WF2 A; 2OI3 A; 2DRM A; 3J81 E; 3RNJ A; 5GMK l; 5GJV B; 4M78 C; 1VQ8 Q; 4EMG A; 3CME T; 1YIJ T; 5KYU A; 3RKW A; 1OX8 A; 1Y96 A; 3DLL A; 1I5O B; 1AWO A; 3PT9 A; 2A0F B; 3REA B; 3M55 A; 1QVG P; 2DPP B; 1XTD A; 3LW5 E; 5GAO r; 1WQ7 A; 3VUZ A; 3FC3 A; 2RJE A; 1UE9 A; 1G2B A; 2G6F X; 3UT1 A; 1U1S A; 3NGP A; 4LE9 A; 1Q82 U; 5GMK h; 1VQN Q; 1UHC A; 3M4Y A; 3HRU A; 1ZSG A; 1E7O A; 3RKX A; 1BU1 A; 1UEB A; 4E7S A; 4M7A C; 2EIF A; 1KC8 U; 1GXI E; 3JCM d; 1WYX A; 4PJJ A; 1QCO A; 3FEO A; 1NPP A; 5D6Y A; 2AHJ B; 2FYK A; 2ROT A; 1BI2 A; 4JRP A; 1A0N B; 3RES A; 2J06 A; 1NPR A; 4PL6 A; 2DA9 A; 3ULR B; 3V8K A; 2LC4 A; 2L3S A; 3KFV A; 1IXD A; 2A3L A; 4EPC A; 1IHW A; 3A8L B; 3DKM A; 1UJY A; 4PLI A; 4C8Q A; 4C8Q G; 3EGD B; 4AG2 C; 1YP5 A; 1SSF A; 1TUD A; 4M7A E; 2BZ8 A; 4CRI A; 2JT4 A; 2V8I A; 4FU6 A; 2ABL A; 2O9V A; 3HRS A; 5KCH A; 4M7A F; 4L59 A; 1RI0 A; 2QQ9 A; 5HKC A; 2MI6 A; 3GP8 A; 1YHQ A; 2NUZ A; 1SHF A; 4IUT A; 2DIQ A; 1M2V A; 4HXJ A; 1CKA A; 3J80 E; 2DTH A; 2L3R A; 2P4T A; 1T3L A; 2GCX A; 4O5V A; 1MMN A; 3SDZ A; 1Q7Y R; 2LJ3 A; 4M77 D; 1AEY A; 3CPW A; 3UPU A; 2YRC A; 2H3J A; 3C0C A; 2J6K A; 2QQA A; 2BKD N; 4TVR A; 2LZ6 B; 1EX4 A; 1VQ7 A; 1G5V A; 4F7U E; 2RA2 A; 2W0Z A; 4Q5W A; 4RKU E; 2D9T A; 3CCU A; 4RMO A; 1YHQ T; 2MWP A; 1M1K U; 4F7U F; 1I81 A; 2ZPB B; 3JCM e; 1K1Z A; 2PVG B; 2PTK A; 1AWX A; 2EQM A; 2X4W A; 2KDS A; 3C95 A; 3UWN A; 2D8H A; 1BK2 A; 3E1S A; 1WX6 A; 2L3Q A; 1IB8 A; 2JTE A; 3VYG A; 2X35 A; 3TSW A; 5KYW B; 2X3W D; 1PHT A; 3ZFJ A; 1VQ7 T; 3H0H A; 1KIK A; 1H92 A; 1RI9 A; 1FX7 A; 2AKK A; 2H8H A; 2ROL A; 4JPB W; 3CCU T; 4FSS A; 2YWW A; 2CP7 A; 2DTI A; 2HSP A; 2YUP A; 1VIE A; 1UUE A; 5CKB A; 3X28 B; 1KSW A; 3QUI A; 4C8Q C; 3LWH A; 2DXU A; 2PU9 B; 2OTJ Q; 3OYJ A; 2MIO A; 1LJO A; 4IIM A; 2K57 A; 1PG5 B; 1X43 A; 3S3M A; 2C0I A; 4BI4 A; 3CCS Q; 3CCQ T; 1FXX A; 1VQL A; 3GLX A; 4F17 A; 3D7S B; 5HK0 A; 4DOW A; 2FZC B; 1ABQ A; 2CRE A; 3HL8 A; 4XTU A; 4BD3 A; 1Q81 U; 1MUZ A; 2E70 A; 2JXB A; 1N9R A; 1JJ2 S; 2JN0 A; 1H64 1; 2DKG A; 1M2O A; 4J5Y A; 2RQR A; 2DD4 A; 1SF9 A; 3ZBD A; 5IHN A; 3CD6 T; 2ZPF B; 2RJC A; 1U1T A; 2RJF A; 3UA7 A; 2M0O A; 2K5I A; 3OYI A; 1AWJ A; 4FYX B; 2DL7 A; 1IZ6 A; 1WJS A; 3MKD A; 2ZPH B; 3CC2 Q; 1V76 A; 1M3B A; 3VU3 C; 1VQL T; 1EIF A; 4J9E A; 1NJI R; 2R5M A; 4QW2 A; 3VYH B; 3A8O B; 3JRZ A; 3G71 A; 2JM8 A; 4QVD A; 2BE9 B; 1KD1 U; 4M75 D; 1X27 A; 1M1F A; 3PNW C; 1YBY A; 3GF5 A; 3OW2 P; 3WVD B; 2DBM A; 4ZGJ B; 3CBO A; 1RAG B; 4M77 G; 1FMV A; 2HNI A; 3EG3 A; 1QMC A; 1HSQ A; 3G7Z A; 2FO0 A; 1SRL A; 1UFF A; 3OYG A; 3JV3 A; 5GAO l; 3QO3 A; 2DZ9 A; 3LWI A; 3RBB B; 2WSC E; 2LCC A; 2WAC A; 2VKN A; 4XTV A; 5FU7 B; 1QKW A; 1ZUY A; 1S72 A; 2FEI A; 3G71 T; 3O5Z A; 1PM3 A; 4FYW B; 3V7C A; 1JXM A; 3QKJ A; 4PFP A; 2RK1 A; 2FG0 A; 4MZM A; 5GAM e; 2DEU A; 3BDL A; 3J7A F; 4C92 B; 2DFU A; 1ZBX A; 1QWE A; 4ZN1 A; 1O9S A; 2YLC A; 1C6V X; 2QA4 Q; 1I07 A; 1JRI A; 1PWT A; 1VQ5 Q; 3M53 A; 4XTZ A; 2DX1 A; 2K2M A; 1TH7 A; 1WXU A; 5EC7 A; 3L2R A; 4J6X A; 2MF2 A; 4D6W A; 3QZ9 B; 1M1G A; 1PSF A; 4JLI A; 5LJ5 d; 3OW2 S; 2H3E B; 4FT4 A; 4ZTJ A; 2ZCF B; 3GNF B; 4RTV A; 1S72 T; 4LD9 K; 1BIA A; 3EFO B; 2LQ8 A; 3SB2 A; 3VS3 A; 1NJI C; 2QI2 A; 3QPH A; 1WXT A; 5DY9 A; 5L8R E; 3P8B B; 4ATO A; 1UTI A; 4FCY A; 3VS7 A; 1Y0M A; 4J9G A; 5CIU A; 3M4G A; 2ZZD A; 4M7A D; 1VIF A; 4PJN A; 4DBR A; 4RTT A; 1JJ2 A; 2CH4 W; 2K79 A; 2RQV A; 3V7S A; 3OB9 A; 3QHS A; 2E1H A; 2I0N A; 2IPO B; 1WHL A; 2YT6 A; 3PVL A; 2K9G A; 4OMO A; 4J7F A; 2DEQ A; 2ZAE A; 3HPW A; 1SEM A; 1M90 C; 4BI8 B; 3OBY A; 3LGL A; 1Q86 U; 3HKS A; 3G4S Q; 2QYZ A; 2OTL A; 4AMC A; 3CXC P; 2CP2 A; 3CCL Q; 4Y91 A; 2GQV A; 3EG2 A; 4M75 G; 2XIC A; 1YIT Q; 1YJW Q; 2JTF A; 4A63 B; 3EGU A; 2LRQ A; 4B9X A; 3I55 Q; 1K8A R; 2KAF A; 1IRE B; 1TU0 B; 1N6A A; 3VRY A; 3OYE A; 4RTY A; 1MNE A; 2JUF A; 4LNP A; 1CSK A; 5J26 A; 4LDX A; 1E6G A; 3I9Q A; 1GFD A; 4PJO E; 1UGS B; 3EGD A; 1EFN A; 4HCC A; 3TQ7 P; 2X4Y A; 4PK4 A; 1WZO A; 1YJN A; 1M3A A; 3QYH B; 4AFQ C; 3P8H A; 3CCE A; 3X26 B; 1TTH B; 3SFM A; 4MZT A; 2PUO B; 4JJB A; 4BE2 A; 4ESR A; 2OTL T; 3CC7 Q; 1ZA1 B; 2E6N A; 4IIO A; 1KQS S; 5FRM A; 3ASK A; 3E9F A; 2ECZ A; 3G6E T; 2RHI A; 3WXM B; 3DLM A; 4DQ2 A; 3OS0 A; 2CUD A; 2AT1 B; 2OAW A; 2OX7 A; 2A08 A; 3EHR A; 3AHU A; 4L6V 5; 2A7Y A; 2YRD A; 1OU8 A; 2F5T X; 1VQP Q; 2X9H A; 2M16 A; 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1VQ4 Q; 2K3B A; 5DLO A; 1YJ9 Q; 2E3H A; 4BY6 B; 4KUI A; 1KQS A; 1UGP B; 2GFA A; 2X4J A; 1LCK A; 1OUL A; 4EMK B; 3RR6 A; 1AOJ A; 5A0G A; 1X69 A; 1X6B A; 2FL7 A; 2COY A; 4LDV A; 3HRT A; 3RMS A; 5AYF A; 5GAO q; 2EPD A; 4E7H A; 4EIK A; 1WXB A; 1IGQ A; 2MK5 A; 4CC3 A; 4C5I A; 1WFW A; 2KT8 A; 1HK9 A; 3E19 A; 2KRO A; 6AT1 B; 2WSF E; 3M0Q A; 4OGC A; 4XK8 E; 4DBF A; 1Q7Y U; 1Y07 A; 2L3P A; 1Q82 C; 2K2V A; 3JCM b; 2DYI A; 4C92 A; 4XTX A; 2RB6 A; 3BY7 A; 5ECA A; 1BCM A; 5GAO m; 3MO8 A; 3KUF A; 1KC8 C; 2DJQ A; 3LGF A; 3NTK A; 3CBP A; 3JB9 D; 3L2Q A; 2K3Y A; 1LVK A; 5CCA A; 3VS5 A; 2EYQ A; 3JB9 J; 1KK7 A; 3QYG B; 2XID A; 2IIM A; 2AIR B; 2YUO A; 1H3H A; 1QVG S; 4GLK A; 1Q95 G; 4JZ3 A; 2DIG A; 4ZTF A; 1JXO A; 1SKU B; 3PMI A; 2JJ9 A; 1Q82 R; 4XTY A; 3OA6 A; 1UEC A; 3JCM c; 1RAD B; 3OYC A; 5CVI A; 2F2W A; 1QVF P; 2J6O A; 3L42 A; 3S3N A; 1M4Z A; 1D09 B; 4E7L A; 2HKQ B; 1VQ6 A; 1QP2 A; 2PUK B; 1ARK A; 1PKT A; 1M8M A; 3PE0 A; 1PSE A; 1ZQ1 A; 4ZGD B; 4P5N A; 2ENM A; 1VOM A; 4N4G A; 4PJO D; 4XU3 A; 3U23 A; 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