The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
2
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
ELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Gallus gallus
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| publication title |
Structure of a protein determined by solid-state magic-angle-spinning NMR spectroscopy
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN, BRAIN
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| total genus |
2
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-07-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2X3X D; 4QT7 A; 1HD3 A; 2LP5 A; 1U06 A; 1WX6 A; 2OI3 A; 1QKW A; 1BB9 A; 2K6D A; 2CUB A; 2G6F X; 5FWB A; 2DE0 X; 4RTZ A; 4CC2 A; 1KSW A; 2AZS A; 2AZV A; 2EQI A; 5FW9 A; 2FRW A; 1WFW A; 1RLQ C; 4A63 B; 3NHN A; 2LNH B; 2J6K A; 2RQV A; 2C0T A; 1H3H A; 2D1X A; 3UA7 A; 3QWY A; 1SSH A; 1WYX A; 3M0U A; 1X27 A; 2JT4 A; 2GNC A; 1QWF A; 1U5S A; 1GBR A; 2D8J A; 1ABQ A; 2EPD A; 2AKL A; 1X43 A; 2NWM A; 4J9F A; 2VVK A; 4HVW A; 2L3P A; 2DL3 A; 1QCF A; 2DL8 A; 4RUG A; 2RQW A; 4IIM A; 4F14 A; 3REA B; 1ZLM A; 2DVJ A; 2KXD A; 2A37 A; 2NUZ A; 5IHK A; 1KJW A; 1JO8 A; 1QLY A; 2L3Q A; 1UFF A; 3TSZ A; 2P4R A; 3R6N A; 2KRM A; 3I35 A; 1NG2 A; 1GCP A; 2CSQ A; 1N5Z A; 1B3Q A; 3NGP A; 5IHI A; 1X2Q A; 4GBQ A; 2FPE A; 1K0S A; 1UJY A; 4J9E A; 2F2X A; 2X3W D; 2LQN A; 2BZ8 A; 2I0N A; 4HCK A; 1AOJ A; 5IH2 A; 1GBQ A; 3I5R A; 1WI7 A; 4LE9 A; 1BBZ A; 1WXU A; 1TUC A; 1Y57 A; 1YWP A; 3VRZ A; 5L23 A; 2ED0 A; 2QDL A; 3SHW A; 4JJB A; 4RTU A; 2CSI A; 2FPD A; 2LCS A; 1HJD A; 4D8K A; 1K9A A; 4ORZ A; 3H41 A; 4ZNX A; 2RN8 A; 1WA7 A; 1QKX A; 4M4Z A; 1Y0M A; 2J6O A; 2M51 A; 1YWO A; 1CKB A; 2OAW A; 2DIL A; 1J3T A; 4Y92 A; 2E5K A; 1SEM A; 2L3S A; 2JXB A; 2C0O A; 2JM8 A; 1PHT A; 1K4U S; 2O31 A; 2KR3 A; 4OMM A; 2GTO A; 3IQL A; 1ZUY A; 2D8H A; 1HSQ A; 2DYB A; 4F17 A; 2DNU A; 2JW4 A; 1SRM A; 1UJ0 A; 1K76 A; 2DBM A; 1WLP B; 5GJW B; 4EIK A; 1AZG B; 2DL4 A; 2HCK A; 2ROT A; 1TG0 A; 2RQU A; 3UA6 A; 1ARK A; 4DEY A; 1SRL A; 2J06 A; 1W1F A; 1ZSG A; 2KRN A; 4R0K A; 1LCK A; 1UE9 A; 3VS0 A; 3NPF A; 1GFD A; 4LNP A; 2MOX A; 1M8M A; 2H8H A; 2HBW A; 3VS4 A; 4Z88 A; 1PKS A; 1JXM A; 3VRY A; 4J9H A; 2EYX A; 2YUN A; 3TVT A; 1ZUU A; 2KRO A; 4X1V A; 3UAT A; 3H0H A; 1XOV A; 1Z9Z A; 2O9V A; 4RTW A; 1MUZ A; 2DBK A; 1FYN A; 1NLO C; 1SPK A; 2EW3 A; 2PNI A; 4Z8A A; 1Z9Q A; 2DA9 A; 4IIO A; 1M3A A; 1OEB A; 2J7I A; 2KYM A; 1AEY A; 3A98 A; 2PTK A; 1GL5 A; 2CT3 A; 2LMJ A; 4J9B A; 4LUE A; 2GQI A; 2KE9 A; 1T3L A; 3UF4 A; 3JV3 A; 2YUQ A; 1SHF A; 1WDX A; 3M0R A; 3EHQ A; 3THK A; 1QWE A; 3CQT A; 3VS7 A; 4HVU A; 4WCI A; 1UDL A; 4D8D A; 2LX7 A; 2OJ2 A; 3NMZ C; 2CUD A; 2V1Q A; 2K9G A; 3C0C A; 5IXF A; 1UG1 A; 4J9C A; 4JZ4 A; 2GGR A; 4K11 A; 5I22 A; 1UTI A; 1W6X A; 1UHF A; 1AWX A; 2JTE A; 2LZ6 B; 2K3B A; 2B86 A; 2CRE A; 4J9I A; 1VYV A; 1H8K A; 3LH5 A; 3M0Q A; 3VS5 A; 1NEG A; 3PVL A; 2RNA A; 1GFC A; 1NYG A; 4KRT A; 2DX1 A; 1PNJ A; 1E6G A; 3ULR B; 1OPK A; 1A0N B; 2EVR A; 1NEB A; 2LJ1 A; 3EHR A; 2RMO A; 1RLP C; 1NLP C; 3REB B; 1PRL C; 2FG0 A; 4OMQ A; 1W70 A; 1T0J A; 2K2M A; 1G83 A; 2YUP A; 4RTY A; 2JS2 A; 4J9G A; 1G2B A; 1H92 A; 2A36 A; 1AD5 A; 2CH4 A; 4JJD A; 4ESR A; 4RTV A; 2RF0 A; 4CC4 B; 1BK2 A; 1PKT A; 2F2V A; 1JU5 C; 2VKN A; 2DF6 A; 4AFQ C; 2DMO A; 2ECZ A; 2JS0 A; 5ECA A; 1UGV A; 4F16 A; 2KYB A; 4HVV A; 1GRI A; 1I1J A; 2EGC A; 4J9D A; 1OOT A; 2PZ1 A; 4OMN A; 2AK5 A; 2A08 A; 4FSS A; 1AVZ C; 1X2K A; 2CDT A; 2DLP A; 2RQT A; 4LUD A; 4JJC A; 1K1Z A; 2DL5 A; 2XMF A; 4JZ3 A; 1CKA A; 2KRS A; 1KIK A; 2JMC A; 4RTX A; 2KXC A; 5IXB A; 5EC7 A; 3H0F A; 1YP5 A; 1E6H A; 2LJ0 A; 1ABO A; 2GBQ A; 3ZL7 C; 1UEC A; 1ZBJ A; 2DRM A; 1ZX6 A; 2FPF A; 4AFZ C; 2AKK A; 4GLM A; 2M0Y A; 3EG3 A; 1E7O A; 2MIO A; 2HDA A; 2HSP A; 2DM1 A; 3PVQ A; 4AFS C; 1B07 A; 2ROL A; 1FMK A; 2YT6 A; 2GTJ A; 3GBQ A; 2CT4 A; 1VYU A; 1I0C A; 1X6B A; 2V1R A; 5FWC A; 2VWF A; 3VS2 A; 1BU1 A; 1PRM C; 2L2P A; 2EGA A; 2ENM A; 2KT1 A; 1UUE A; 2W10 A; 3H0I A; 4Z89 A; 1T3S A; 5HCK A; 2KBT A; 1AWW A; 1M3C A; 1I07 A; 1WIE A; 1TUD A; 3U23 A; 3M0T A; 5I11 A; 2KT8 A; 1X69 A; 1YNZ A; 1S1N A; 2HEQ A; 2W0Z A; 2EYY A; 1UHC A; 2CH4 W; 2DRK A; 1OPL A; 2D0N A; 2DL7 A; 2KEA A; 1NYF A; 1VYT A; 1M27 C; 4AG2 C; 3RBB B; 2O88 A; 1OV3 A; 1AWJ A; 2YSQ A; 1AZE A; 1WXB A; 1RI9 A; 3M0P A; 2LQW A; 2MCN A; 1RUW A; 4DEX A; 1GCQ A; 3TSW A; 4LN2 A; 3O5Z A; 3VS1 A; 1JEG A; 2FRY A; 1MV0 B; 3I9Q A; 1YCS B; 2BZY A; 1AWO A; 2EYZ A; 2YUO A; 1NM7 A; 4OMO A; 3VS6 A; 2ESW A; 2L0A A; 3EG2 A; 1IO6 A; 2J05 A; 2O2O A; 3EG1 A; 2EKH A; 1M3B A; 1JXO A; 5GJV B; 1GCQ C; 2FO0 A; 4CC3 A; 3SEM A; 2J6F A; 3FJ5 A; 1MV3 A; 1V1C A; 1VA7 A; 2EGE A; 2EYW A; 1SHG A; 3M0S A; 2FEI A; 4E6R A; 2YDL A; 2ABL A; 2EBP A; 4HXJ A; 1EFN A; 2DJQ A; 1ZUK A; 1WXT A; 2BTT A; 4RTT A; 3EG0 A; 3RNJ A; 2KGT A; 2RQR A; 2SRC A; 3I5S A; 2F2W A; 2K79 A; 2O9S A; 2JM9 A; 2SEM A; 2A28 A; 2BZX A; 2RPN A; 2LJ3 A; 4AFU C; 2KNB B; 1U3O A; 2ED1 A; 2C0I A; 3QWX X; 1JQQ A; 2JMA A; 4AG1 C; 1PWT A; 1YN8 A; 3EGU A; 4JPB W; 3PE0 A; 1M30 A; 4OML A; 3KFV A; 4OMP A; 1CSK A; 1KFZ A; 2IIM A; 5IHN A; 2K7A A; 3VS3 A; 1X6G A; 1T0H A; 4CC7 A; 1K0X A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1IRX A; 2X3X D; 1HD3 A; 2LP5 A; 1U06 A; 2OI3 A; 4EDU A; 1KD1 R; 4JS4 A; 3A8M B; 2G6F X; 2DE0 X; 2AZS A; 1YJN A; 3CCE T; 5KE3 A; 4KUI A; 3MEV A; 2RQV A; 2C0T A; 1H3H A; 1YCY A; 2D1X A; 2CP7 A; 3UPU A; 4B6M A; 1RAC B; 2E65 A; 3QWY A; 1WYX A; 3JCM c; 4F7U B; 4PJO A; 2DTI A; 1LVK A; 3G4S A; 3SDZ A; 2H3E B; 3OMC A; 1NJI U; 2CP2 A; 2AKL A; 3M59 A; 3R6O A; 4JJN K; 2C06 A; 2DL8 A; 1Q82 U; 2KXD A; 3TEE A; 1M1K C; 1Q81 R; 5IHK A; 1KJW A; 1JO8 A; 2P0Q A; 1M90 C; 4M77 E; 1KQS P; 3TSZ A; 4PJN A; 3R6N A; 4A54 A; 3OYJ A; 1PD1 A; 1NG2 A; 3V8J A; 2CSQ A; 3G71 Q; 3CCE Q; 3RIR A; 1B3Q A; 1UJY A; 2F2X A; 3C12 A; 1KC8 R; 4ATO A; 4DBR A; 1K73 U; 3V7C A; 2V8K A; 1YJW Q; 2I0N A; 4M78 C; 3I5R A; 4AMC A; 3A8G B; 1PC0 A; 2EQJ A; 3SB2 A; 1Y57 A; 5AT1 B; 1Y96 B; 2ED0 A; 2QDL A; 2CZ1 B; 2K5I A; 1D0X A; 3QYG B; 2CSI A; 1VQ8 Q; 5DY9 A; 4C0Z A; 4L6V 5; 4YTL A; 4EMG A; 1AT1 B; 4C8Q A; 1H3Z A; 4C92 G; 4M7D C; 3OYY A; 4ZNX A; 1EZZ B; 4DBQ A; 5GAO m; 2QEX A; 2LCC A; 3NTI A; 4X9C A; 1CKB A; 5GAN e; 3QUI A; 4PKC C; 4M7A B; 2YLC A; 2O01 E; 4IUP A; 3QJ6 A; 2GTO A; 3S3M A; 2DXC A; 2HZY A; 1HSQ A; 3RMQ A; 4MML A; 5GJW B; 1BKB A; 3QO3 A; 1S72 T; 2DL4 A; 2HCK A; 1M4Z A; 2CKK A; 1YIT A; 4ZTF A; 5FU7 C; 3UA6 A; 3N5B B; 4IUT A; 2L8D A; 3UDC A; 4TVR A; 2QTV A; 3NPF A; 1PSF A; 1NPR A; 1M8M A; 1VQ4 T; 4BDZ A; 3VRY A; 1YJ9 Q; 4J9H A; 1VQ8 A; 4N4G A; 1ZUU A; 2YLB A; 2KRO A; 2LC4 A; 3A1P A; 4X1V A; 3SD4 A; 2XDP A; 2QGF B; 3HFN A; 3RMS A; 2O9V A; 4RTW A; 2DBK A; 2R57 A; 4FW2 A; 1NLO C; 1SPK A; 2F5T X; 4RG8 A; 3ME9 A; 3EG9 A; 1VQ7 T; 4XTZ A; 1Z9Q A; 5CIU A; 2COW A; 2LQK A; 4IIO A; 2MWO A; 2DD4 A; 3CC7 T; 2J7I A; 1N9S A; 2P0K A; 2PTK A; 3SFM A; 2LMJ A; 3L1A A; 4LUE A; 9ATC B; 1SKU B; 2KE9 A; 2YWW A; 1T3L A; 1U1T A; 2RJC A; 2LQ8 A; 1WDX A; 3M0R A; 3EHQ A; 3JB9 G; 5CO7 A; 4HVU A; 1PSE A; 2BUD A; 2OJ2 A; 4C92 F; 3QYH B; 2V1Q A; 3C0C A; 4M77 A; 4FIB A; 1YI2 A; 4J9C A; 5GAN 7; 2QA4 A; 1WJS A; 4QKU A; 1OX9 A; 3CD6 A; 2VV5 A; 4NL2 A; 2JTE A; 4J9I A; 4RCB A; 1X01 A; 1UGR B; 1H8K A; 1YJ9 A; 2RI3 A; 1NEG A; 2JTM A; 3HRU A; 3OBY A; 4NS5 A; 2DX1 A; 2ZZD A; 1I8F A; 2X35 A; 4BUG A; 4ANJ A; 5A0G A; 4LDY A; 5LJ5 h; 3E19 A; 3MP8 A; 2RHY A; 2YRV A; 3ER0 A; 4E7J A; 2HSE B; 5M9O A; 4M75 A; 1I5O B; 4A4E A; 1G2B A; 2A3L A; 3L2R A; 2DZ9 A; 4RTV A; 4CC4 B; 2LT1 A; 1TWB A; 1SSF A; 3DB3 A; 5GAM e; 4J6X A; 1WHM A; 1QCO A; 6AT1 B; 1R0B G; 1D0Y A; 1H64 1; 2X4Y A; 5KE2 A; 5GAO n; 1V29 B; 4FSS A; 4FU6 A; 4F7U E; 1AVZ C; 1X2K A; 1KG1 A; 2XMF A; 2DJZ A; 1IHW A; 2KXC A; 3H0F A; 1E6H A; 2E6N A; 3CCJ T; 4PJO G; 2EWN A; 2PUO B; 2VC8 A; 4EMK B; 3ZEH A; 3OS5 A; 3CME T; 4PJL A; 4GLM A; 2D6F A; 1MGQ A; 1R8O B; 4C0D B; 2HDA A; 4MDX A; 2YT6 A; 4KGZ B; 5KYN A; 1I0C A; 2V1R A; 1BU1 A; 2KT1 A; 3MHX A; 2XK0 A; 4ME7 A; 2KBT A; 2PU9 B; 2DIG A; 1M3C A; 2LT4 A; 1WIE A; 2B8A A; 3M0T A; 3CME Q; 4Y91 A; 2XIC A; 5LJ3 g; 2XID A; 2PVD B; 2DKG A; 2ZPB B; 3CCQ T; 2JTF A; 1WHJ A; 2HEQ A; 2E6Z A; 2HQH A; 2W0Z A; 1NPP A; 3QBY A; 2QQB A; 5AYF A; 3A8O B; 1M27 C; 1D1C A; 3RBB B; 2O88 A; 1BIA A; 1VQN Q; 4M7A E; 4C8Q G; 4LDW A; 5GAN 2; 1AZE A; 1ACM B; 3G6E T; 4PFO A; 2GFA A; 4IUU A; 3L2Q A; 1IRE B; 1GCQ A; 2L5Q A; 3VS1 A; 2FRY A; 1MV0 B; 1WGS A; 3OYK A; 3JCM P; 2ZPF B; 5HK0 A; 2L0A A; 4M7A D; 1NJI R; 2PUK B; 1WQ7 A; 1IB8 A; 5GJV B; 2EJ9 A; 3CCQ Q; 1LPL A; 3CXC A; 4V2S A; 2KQW A; 3MO8 A; 4VUB A; 3JCM f; 4PJO F; 5GAO p; 1BCM A; 2NUT A; 2ABL A; 2E5Q A; 5GAN h; 1FWZ A; 1QVG S; 2DJQ A; 3CCV Q; 3EG0 A; 5C6S A; 4L5G A; 2RQR A; 1D3B A; 5GAN 5; 3JCM X; 2BZX A; 1VQP T; 2LJ3 A; 3BY7 A; 1OU8 A; 1U3O A; 2F5K A; 2JMA A; 4XQ3 A; 4AG1 C; 1WJQ A; 3CBM A; 2KI7 A; 4QQ6 A; 3RDV A; 4LDV A; 1W2B A; 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3H6Z A; 2JM8 A; 2OX7 A; 2O31 A; 4RG2 A; 1UGS B; 4OMM A; 1VQM A; 1HXD A; 4JUV A; 1SRM A; 1M1F A; 5EG2 A; 2DBM A; 2EQM A; 3E9F A; 4X34 A; 3G1J A; 2DXB A; 4M77 F; 1M1K R; 1M90 R; 2VB6 A; 1W1F A; 1ZSG A; 4R0K A; 1LCK A; 1TU0 B; 5KYX B; 5GMK l; 1GFD A; 2MOX A; 2VXE A; 4IKF A; 1VQO A; 2K5F A; 3CBP A; 3OY9 A; 2KY9 A; 4BE1 A; 4IUV A; 1PKS A; 3L42 A; 1JXM A; 3QDF A; 3HHT B; 3G71 T; 2YUN A; 2M0O A; 1D0Z A; 3QZ9 B; 3UAT A; 2EQU A; 2MMP A; 3H0H A; 1XOV A; 1Z9Z A; 2KAF A; 3HL8 A; 4C92 B; 3DLM A; 5CR2 A; 1YJW T; 1LNX A; 5IN1 A; 3MEU A; 4PLI A; 2BE7 D; 3OYE A; 3RES A; 4E7L A; 5LJ3 h; 1KK7 A; 5L8R E; 3RKW A; 2QEX Q; 3HTR A; 4M75 F; 1M3A A; 1OEB A; 3A98 A; 3GLX A; 1DJ7 B; 2GFU A; 1GL5 A; 3RUX A; 3QG1 A; 2CT3 A; 3OYF A; 4J9B A; 1VQ8 T; 1WHK A; 2RI2 A; 3JV3 A; 3FRN A; 1SHF A; 5LJ5 d; 4E7Z A; 4L59 A; 3THK A; 5A0D A; 1UDL A; 2QQ9 A; 3NMZ C; 1I5L A; 2FHD A; 2L89 A; 2CUD A; 2RJF A; 4KGV B; 2K9G A; 5IXF A; 2K57 A; 2M1H A; 2QQA A; 1YIT Q; 2ZGW A; 2MAM A; 3ZBD A; 2GCX A; 1MMA A; 4X9D A; 2LZ6 B; 1JRI A; 1N27 A; 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