The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
61
|
structure length |
61
|
Chain Sequence |
NQVYFAVYTFKARNPNELSVSANQKLKILEFKDVTGNTEWWLAEVNGKKGYVPSNYIRKTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
DYNAMIN-BINDING PROTEIN
|
| publication title |
Structural Details of Human Tuba Recruitment by Inlc of Listeria Monocytogenes Elucidate Bacterial Cell-Cell Spreading.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
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| structure length |
61
|
| sequence length |
61
|
| chains with identical sequence |
C, E, G
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-10-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QKX A; 1K76 A; 1BU1 A; 2DM1 A; 2O31 A; 1NYG A; 2DL8 A; 1AVZ C; 4M4Z A; 2DE0 X; 5FWC A; 1PRL C; 4Z88 A; 2E5K A; 2F2X A; 3TSW A; 2CRE A; 4OMM A; 2BZX A; 2L3Q A; 3NMZ C; 2I0N A; 1B07 A; 3CQT A; 4HCK A; 1I07 A; 2EVR A; 3M0S A; 4FSS A; 1JU5 C; 4AFQ C; 2KT8 A; 2LJ0 A; 1MV0 B; 5HCK A; 2EGC A; 2FPE A; 1NG2 A; 1ZUY A; 2J05 A; 4RTZ A; 2YUQ A; 2LNH B; 2AZS A; 1U3O A; 2ESW A; 3SHW A; 2JS0 A; 2KYM A; 1KJW A; 1X69 A; 2EYW A; 2FO0 A; 2KGT A; 4EIK A; 1M3C A; 2ABL A; 1M3A A; 5I22 A; 1RI9 A; 1OPK A; 1K1Z A; 2IIM A; 2L2P A; 1K4U S; 1WX6 A; 2JM9 A; 1I1J A; 1YNZ A; 5IXB A; 1VYV A; 1UHF A; 1SHG A; 3H0F A; 2LQW A; 1GCQ C; 1E6G A; 4J9F A; 4ESR A; 3VRZ A; 2M51 A; 2A08 A; 2K9G A; 5IHK A; 1XOV A; 1ZLM A; 2H8H A; 4RUG A; 3VS6 A; 4A63 B; 2DL7 A; 1OOT A; 3NHN A; 2O9V A; 1UDL A; 1G2B A; 2D8J A; 1JXO A; 2DA9 A; 2DL3 A; 2FRW A; 3ZL7 C; 4AFU C; 2LJ3 A; 2GQI A; 4ZNX A; 5GJW B; 1BK2 A; 4Z8A A; 3VS7 A; 3H41 A; 2DL4 A; 1QWE A; 2GGR A; 1TUC A; 2O88 A; 1K0S A; 4AFZ C; 1W6X A; 3KFV A; 2BTT A; 4AG2 C; 3EG3 A; 2PNI A; 3R6N A; 1MUZ A; 2KEA A; 2J6F A; 2YUN A; 1QLY A; 2NUZ A; 1WYX A; 2W0Z A; 1CKB A; 2ROT A; 3NPF A; 2G6F X; 3QWX X; 2RN8 A; 1J3T A; 2RPN A; 1UJ0 A; 3M0Q A; 3U23 A; 2V1R A; 4ORZ A; 2KRS A; 2LMJ A; 2AK5 A; 3GBQ A; 4J9I A; 1VYT A; 1NEG A; 2KRN A; 1AD5 A; 5GJV B; 1N5Z A; 1NLO C; 2FPD A; 2HBW A; 4OMP A; 5FW9 A; 1KSW A; 2KR3 A; 1W70 A; 1WDX A; 4Y92 A; 2YUP A; 4LUE A; 2K6D A; 1UHC A; 2D1X A; 4HVU A; 1E6H A; 2AZV A; 3REA B; 1SHF A; 1WXU A; 1UE9 A; 2LCS A; 2MOX A; 1AZG B; 3EG1 A; 3TVT A; 1RLQ C; 3EG0 A; 1NLP C; 3QWY A; 2LZ6 B; 4E6R A; 1B3Q A; 1AWO A; 4RTX A; 1UEC A; 2F2W A; 3RBB B; 1H8K A; 2X3W D; 2W10 A; 5EC7 A; 2K3B A; 1SRL A; 2DRK A; 1RLP C; 2CSI A; 1ZBJ A; 1YN8 A; 1ZX6 A; 1ABO A; 1IO6 A; 2DX1 A; 3ULR B; 2CUD A; 1BBZ A; 1JO8 A; 2JMC A; 1NM7 A; 3UA6 A; 4IIM A; 2YSQ A; 4OMQ A; 5L23 A; 1BB9 A; 1ZUK A; 1I0C A; 3H0I A; 3PVL A; 3O5Z A; 3VS4 A; 2RF0 A; 3UF4 A; 2EGE A; 1QWF A; 3RNJ A; 1OV3 A; 1YWP A; 1KIK A; 3VRY A; 1SPK A; 1UJY A; 1UFF A; 1HD3 A; 3VS5 A; 2CT4 A; 1K0X A; 2PZ1 A; 2YUO A; 2VWF A; 1SRM A; 4J9B A; 4OML A; 1M30 A; 2VVK A; 1YP5 A; 2RNA A; 1H3H A; 1E7O A; 2OJ2 A; 2XMF A; 4J9E A; 1QCF A; 2O2O A; 4QT7 A; 3EG2 A; 1UG1 A; 2FEI A; 2KE9 A; 2LX7 A; 2AKK A; 1G83 A; 3EHQ A; 1JEG A; 2F2V A; 1ABQ A; 3VS2 A; 2C0I A; 2EYY A; 2K79 A; 2MCN A; 4CC3 A; 4LNP A; 4X1V A; 4JJD A; 5ECA A; 1Z9Q A; 2LQN A; 2VKN A; 2M0Y A; 2DL5 A; 2C0O A; 4JPB W; 5IXF A; 2DJQ A; 3FJ5 A; 4D8D A; 4D8K A; 1UTI A; 4JZ4 A; 5FWB A; 2ED1 A; 1TUD A; 5IHN A; 1AWW A; 2B86 A; 4K11 A; 2KXD A; 1AWX A; 1VA7 A; 2ROL A; 2K2M A; 1H92 A; 2EGA A; 2DLP A; 2JTE A; 3I9Q A; 2LJ1 A; 4HVW A; 3REB B; 2JW4 A; 2DIL A; 2RQW A; 3M0U A; 3PVQ A; 1PWT A; 3C0C A; 1T0H A; 4CC4 B; 5IH2 A; 2DBK A; 3I5S A; 4LUD A; 3EHR A; 2X3X D; 1ZSG A; 1FMK A; 3UA7 A; 1ARK A; 2L3S A; 2RQV A; 2EPD A; 4F14 A; 2JXB A; 2AKL A; 2A36 A; 2L3P A; 1Y0M A; 2YT6 A; 1X2K A; 2NWM A; 2BZ8 A; 3I35 A; 2EYX A; 4R0K A; 1QKW A; 2YDL A; 1VYU A; 2KYB A; 4RTY A; 4F17 A; 2J6K A; 2FPF A; 3PE0 A; 1K9A A; 2KT1 A; 3VS3 A; 2RQR A; 2HEQ A; 1YCS B; 1OEB A; 4RTT A; 1GRI A; 2ECZ A; 2FRY A; 4KRT A; 4J9G A; 2GBQ A; 4RTW A; 1HSQ A; 4F16 A; 1JQQ A; 2EBP A; 2SRC A; 3M0T A; 2D8H A; 1WA7 A; 2KBT A; 3A98 A; 2DMO A; 2J06 A; 4CC7 A; 1S1N A; 1X27 A; 4AG1 C; 2LP5 A; 1SSH A; 4OMO A; 4RTU A; 1X2Q A; 1GFC A; 1FYN A; 1T3L A; 1OPL A; 3M0P A; 5IHI A; 2EYZ A; 1M27 C; 1PKS A; 2ENM A; 1NYF A; 1JXM A; 4LN2 A; 4CC2 A; 1CKA A; 1GBQ A; 2EW3 A; 4HVV A; 3I5R A; 1WI7 A; 2KNB B; 2GNC A; 2DYB A; 2A28 A; 1T3S A; 3UAT A; 4DEX A; 1AWJ A; 4IIO A; 3VS0 A; 3SEM A; 1AOJ A; 1M3B A; 1AZE A; 3JV3 A; 4JJC A; 3IQL A; 2RMO A; 2C0T A; 1NEB A; 1GCQ A; 3THK A; 1PKT A; 1MV3 A; 2EQI A; 1AEY A; 2JMA A; 3M0R A; 3EGU A; 1SEM A; 2CH4 W; 2GTJ A; 1ZUU A; 1UUE A; 2OAW A; 2DRM A; 1PRM C; 1X6B A; 4AFS C; 2FG0 A; 4RTV A; 2K7A A; 2RQT A; 2JM8 A; 2EKH A; 2HDA A; 4GLM A; 4HXJ A; 2BZY A; 1EFN A; 2CDT A; 2J6O A; 1Z9Z A; 2KXC A; 5I11 A; 2SEM A; 2KRO A; 2CUB A; 1WIE A; 2L0A A; 1X6G A; 1UGV A; 1WXB A; 2GTO A; 1PHT A; 1Y57 A; 1PNJ A; 4J9H A; 2JT4 A; 4JZ3 A; 1WLP B; 1YWO A; 2V1Q A; 1A0N B; 2PTK A; 1RUW A; 2CH4 A; 1T0J A; 2O9S A; 1GCP A; 1TG0 A; 4LE9 A; 3TSZ A; 1WFW A; 2MIO A; 4Z89 A; 2DNU A; 2JS2 A; 2QDL A; 1GL5 A; 1LCK A; 2RQU A; 1GFD A; 4J9D A; 2ED0 A; 1WXT A; 2CSQ A; 2DVJ A; 2D0N A; 3VS1 A; 1X43 A; 2HSP A; 4JJB A; 2CT3 A; 3LH5 A; 1GBR A; 2KRM A; 4J9C A; 3H0H A; 2DF6 A; 2HCK A; 2OI3 A; 1U5S A; 1M8M A; 4DEY A; 4GBQ A; 2A37 A; 2J7I A; 4OMN A; 1W1F A; 1U06 A; 1CSK A; 1V1C A; 1HJD A; 3NGP A; 2P4R A; 1KFZ A; 4WCI A; 2DBM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2WSE E; 2O31 A; 2DL8 A; 1UEB A; 1QQJ A; 3VYG A; 1IZ6 A; 4M7A B; 2DE0 X; 3FDR A; 1O75 A; 2LX9 A; 2E5K A; 3TSW A; 1WHK A; 4FYV B; 4KUI A; 2RHI A; 4FM4 B; 4Z02 A; 3F70 A; 3J81 E; 3UDC A; 4DOV A; 3AHU A; 2L3Q A; 1KD1 U; 4PJO A; 4EMK B; 3INZ A; 3CQT A; 5LJ3 h; 1JBM A; 1JU5 C; 3RMS A; 4AFQ C; 1YJN T; 2F1L A; 5KYW B; 2FPE A; 1NG2 A; 3CBM A; 3M56 A; 3L2W A; 2Y4X A; 4MMK A; 4E7H A; 1G8X A; 4C5H A; 1KJW A; 1X69 A; 3OS1 A; 3CCL A; 1G3T A; 1RAB B; 2ABL A; 2EJ9 A; 5AYF A; 1HXD A; 1RI9 A; 1Q7Y U; 1K4U S; 4L59 A; 4LD9 K; 2JM9 A; 5KE2 A; 2NLU A; 2XI9 A; 1UHF A; 2DAQ A; 3H0F A; 1GCQ C; 3S3M A; 1MGQ A; 2RK1 A; 4J83 A; 1OZ3 A; 3OYE A; 2A08 A; 3EFS A; 2MAM A; 2JTM A; 2DIQ A; 5IHK A; 2BUD A; 3VS6 A; 5KYU A; 1OOT A; 3G71 Q; 2DA9 A; 2OTL A; 2DL3 A; 2FRW A; 3ZL7 C; 2X35 A; 2XKO C; 2VGM A; 4ELY C; 3L2Q A; 4J7I A; 2A3L A; 1JB0 E; 1BK2 A; 3EAE A; 3VS7 A; 4C5I A; 2DL4 A; 3MEU A; 4XTW A; 5HY6 A; 5GAN 8; 4FW2 A; 1MUZ A; 2J6F A; 2YUN A; 2NUZ A; 1WYX A; 1JRI A; 1VQ6 A; 2ROT A; 2NUT B; 4BUG A; 1M90 U; 4VUB A; 1J3T A; 3M0Q A; 1G3Y A; 4DBH A; 4ORZ A; 3OSS C; 1UGS B; 3A8H B; 2OTL T; 4MZT A; 4C5G A; 3OW2 S; 1RAA B; 4A4E A; 1NEG A; 4E7S A; 2HBW A; 3PTA A; 2FPD A; 1RAH B; 4OMP A; 1RAD B; 4RCC A; 1VQP T; 1VQ5 T; 1KSW A; 4Y92 A; 3CCU T; 1UHC A; 1NE8 A; 3SWN A; 2JUF A; 4JDS A; 5GAN 5; 3CPF A; 2P0P A; 4M75 F; 1AZG B; 1VQ6 T; 3EG0 A; 5LJ5 j; 3QWY A; 2LZ6 B; 2GFU A; 5GAM d; 2OTJ A; 1KQS P; 3RBB B; 5IT9 E; 2Y4Y A; 2C06 A; 4KT0 E; 2EIF A; 2K5I A; 1ZX6 A; 5GAN d; 2ZAE A; 4KGX B; 4M7A C; 2JMC A; 2YLC A; 3A8M B; 3UA6 A; 1I4K 1; 3MP8 A; 4OGE A; 3H0I A; 3FEO A; 3QDF A; 2E3I A; 3QUI A; 5LJ3 d; 1OV3 A; 1O9S A; 1OU9 A; 2QDY B; 1HD3 A; 3VS5 A; 3CME T; 3OA6 A; 1K0X A; 3LX7 A; 4QKU A; 4EMK C; 4J9B A; 2HKN A; 3RDV A; 3X20 B; 3GIB A; 1Q82 R; 1E7O A; 2OJ2 A; 3LGF A; 3V7C A; 2OTJ T; 2XMF A; 2YLB A; 1QCF A; 2EFI A; 3H6Z A; 2AKK A; 1M2V A; 1G83 A; 5KE3 A; 3CXC P; 3VS2 A; 4HKE A; 2JNG A; 1YJ9 Q; 4XU0 A; 4PNO A; 3G71 A; 4LNP A; 4X1V A; 1C1A A; 3QYH B; 1B34 A; 2VKN A; 1WHM A; 2M0Y A; 5GAN 6; 2DJQ A; 3OY9 A; 1R0B G; 5FWB A; 3JCM b; 4JS4 A; 1TUD A; 4XK8 E; 2LT1 A; 3UT1 A; 4KH0 B; 3FLG A; 4K11 A; 1VA7 A; 2JTF A; 2HQH A; 4Q5W A; 4RCB A; 1H92 A; 4P5N A; 2ZPB B; 1QVF A; 2JTE A; 3I9Q A; 3REB B; 4M78 F; 2XDP A; 3M0U A; 2PVO B; 3CD6 T; 5IH2 A; 1EX4 A; 5GAM g; 3G71 T; 3M5A A; 5GAO l; 1M9S A; 1Y96 A; 2XG8 D; 1R77 A; 2DTI A; 1QVG P; 2EPD A; 5GAN g; 2QQR A; 1IHW A; 3V8K A; 3OBW A; 1X2K A; 4M75 D; 5I2M A; 3OMG A; 4PJO E; 3OYI A; 1QKW A; 2J6K A; 3C95 A; 5LJ3 g; 3OYC A; 1M4Z A; 2FPF A; 3JCM d; 2M1H A; 2KT1 A; 1VQ7 Q; 1PD0 A; 1F1B B; 3EFO B; 4BE0 A; 3AT1 B; 4RTT A; 4E7I A; 4KRT A; 3KBG A; 5GMK h; 1WZO A; 3V8L A; 2E12 A; 3TRE A; 1HSQ A; 2VGN A; 4F16 A; 1Q82 C; 2LDM A; 1VQ8 T; 4TVR A; 3S3O A; 4NOY A; 3L2V A; 4CC7 A; 5FRM A; 1PSE A; 2LP5 A; 1VIF A; 4M77 A; 9ATC B; 2XHC A; 1BI0 A; 4CRI A; 2NYS A; 1GFC A; 1FYN A; 4L5G A; 1TS9 A; 1D3B A; 5J26 A; 3UPU A; 2RHY A; 3M53 A; 2EYZ A; 1PKS A; 4CC2 A; 2O01 E; 3I5R A; 4DOW A; 3BDU A; 5GAM f; 1K73 U; 2A28 A; 5GAN 4; 4C8Q A; 3UAT A; 3V7R A; 4DEX A; 2KQW A; 3SEM A; 3ZFJ A; 2VXE A; 1YJ9 A; 5GAN f; 3IQL A; 2PUO B; 1PKT A; 1MV3 A; 2GF7 A; 2CZ6 B; 4ELZ C; 1SEM A; 4XU3 A; 5LJ3 f; 1W4S A; 5LJ5 h; 3JCM P; 1PRM C; 1X6B A; 1VOM A; 5LL6 S; 4C0D B; 2BZY A; 1EFN A; 4PKC C; 2CDT A; 1UB4 A; 1KD1 R; 3CC7 Q; 2KXC A; 3A8G B; 2VXF A; 4M78 D; 2XID A; 4OB3 B; 3CEY A; 2ZPF B; 3G1J A; 2L0A A; 2P0K A; 4M7D D; 4UC4 A; 3QHS A; 3QDR B; 3JCM g; 1N8R U; 3HL8 A; 2EKO A; 4C8Q D; 3OSV A; 1RUW A; 1GCP A; 2X4J A; 2L3R A; 1WFW A; 2FHD A; 2JS2 A; 4DBQ A; 1SKU B; 2G3R A; 4M7A G; 1RAE B; 4A53 A; 2QDL A; 1D0Y A; 4O6J A; 2KVQ G; 1LCK A; 2AT1 B; 4HCC A; 5A0D A; 1WXT A; 2YHT A; 1MNE A; 2DD4 A; 4JJB A; 2K5F A; 2EQM A; 1YJN Q; 1GBR A; 1BCM A; 3HP9 A; 3DLM A; 4BE1 A; 2V8J A; 4M7A E; 3RMQ A; 2HCK A; 1U5S A; 1VQ7 A; 4GBQ A; 2E70 A; 3P8B B; 1U06 A; 4BB7 A; 4J8O A; 3L2Z A; 2DBM A; 2RJF A; 1RAF B; 4PJO B; 4FSX A; 2WSF E; 2LRQ A; 1NYG A; 5GAO p; 4M4Z A; 2DZ9 A; 5FWC A; 1PRL C; 4Z88 A; 2F2X A; 2CRE A; 1MMN A; 2D0Q B; 3D7S B; 3DLL A; 2VV5 A; 1VQ4 Q; 3QKJ A; 3NMZ C; 2I0N A; 1B07 A; 3VUZ A; 4HCK A; 1I07 A; 3JB9 I; 2R5A A; 3JCM f; 1FMV A; 1MV0 B; 5HCK A; 3JCM X; 1EIF A; 2X9H A; 2K3Y A; 4RTZ A; 2NUP A; 3BE3 A; 1C0M A; 1QCN A; 4EDU A; 2KGT A; 2DKG A; 1M3C A; 5KYU B; 1KD1 C; 4N4H A; 1M3A A; 4JLI A; 1DJ7 B; 1YNZ A; 1KQS S; 4JRK A; 1VQK T; 5CIU A; 4J9F A; 2M51 A; 1VUB A; 3G6E T; 5A0G A; 4A63 B; 4MDW A; 4C92 A; 2O9V A; 1UDL A; 1WHL A; 2D8J A; 3HHT B; 1M1K U; 1JXO A; 8ATC B; 1HYO A; 2OTL Q; 3DB3 A; 4GY5 A; 4AFU C; 2LCL A; 2GQI A; 4E7K A; 4ZNX A; 1YCY A; 5DY9 A; 3CC7 A; 3V7S A; 4PL6 A; 1VQP Q; 1QWE A; 1TUC A; 2JVV A; 1K0S A; 1VQ5 Q; 2CP6 A; 3EG3 A; 3CCU Q; 2EQJ A; 3R6N A; 1VIE A; 4J6W A; 3SDZ A; 2KEA A; 3PMI A; 4C0D C; 2IPO B; 1K8A R; 2VUB A; 3QJ6 A; 4OVA A; 2P0Q A; 2QQS A; 3QZ5 B; 3NPF A; 3PIO A; 2HL3 A; 2RPN A; 7AT1 B; 3CXC S; 4LDX A; 5D6Y A; 4N0A A; 2L5Q A; 2QQB A; 3HRS A; 1WQ7 A; 1LVK A; 1XQH A; 3SWN B; 2ZCF B; 4J9I A; 4XTX A; 1YJN A; 1U1T A; 5FRO A; 1AD5 A; 3G4S T; 5GJV B; 1NLO C; 4PFO A; 2QGF B; 2ZGW A; 4ZN1 A; 3HRT A; 4M77 E; 1Q81 U; 5GAM e; 4HCB A; 1X01 A; 3CME Q; 2HD0 A; 1E6H A; 3CPW P; 2DTO A; 5GAN 2; 2QA4 T; 4EMH A; 1UE9 A; 1VQ9 T; 5GAN e; 4LDW A; 3M59 A; 2RB6 A; 2OTJ Q; 1OI1 A; 1B3Q A; 1AWO A; 4RTX A; 2F2W A; 2JZ2 A; 5GMK l; 4JLG A; 5GAO m; 2X51 A; 3ASK A; 3QG1 A; 4FU6 A; 4B9X A; 1VQ4 A; 1ZHI A; 2RM4 A; 4PJO C; 1SRL A; 2DEQ A; 1ZBJ A; 3X25 B; 2DYI A; 3ULR B; 2CUD A; 3JB9 G; 3JCM c; 4ANJ A; 3X26 B; 3A1P A; 4PJL A; 3GPL A; 2YSQ A; 3GP8 A; 3QPH A; 3R6O A; 1FXX A; 3QJY A; 5CAI A; 4PFP A; 2RF0 A; 3JCM V; 4F04 B; 3RNJ A; 1RI0 A; 1M2V B; 1UFF A; 2YUO A; 2HMA A; 2VWF A; 3EGX A; 1RAG B; 1SRM A; 1UGQ B; 3JRZ A; 1YP5 A; 1B34 B; 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