The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
TFVALYDYESRTEDDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGRTGYIPSNYVAPSD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein/peptide
|
| source organism |
Gallus gallus
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| publication title |
Atomic resolution structures of the c-Src SH3 domain in complex with two high-affinity peptides from classes I and II.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
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| total genus |
12
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2012-11-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZLM A; 2M0Y A; 2DA9 A; 2X3X D; 2CSI A; 2XMF A; 1YWO A; 1AWX A; 2X3W D; 4HXJ A; 2O31 A; 2D1X A; 3GBQ A; 2HEQ A; 1I07 A; 2LP5 A; 4IIO A; 2JTE A; 1AZG B; 4LE9 A; 1X6G A; 1VA7 A; 2JM8 A; 1X2K A; 4AG1 C; 2DIL A; 3EG1 A; 4AFS C; 4KRT A; 1Z9Z A; 2K79 A; 2V1R A; 1E7O A; 2K7A A; 4X1V A; 2LMJ A; 4D8D A; 5GJW B; 2AKK A; 3REB B; 1QLY A; 2FO0 A; 3EHQ A; 2D0N A; 1FMK A; 2JMC A; 2I0N A; 4Z89 A; 1UEC A; 2HSP A; 1ABO A; 4Z88 A; 4J9I A; 2KE9 A; 3M0S A; 1SRL A; 3M0Q A; 1TUD A; 1T3L A; 2FEI A; 2J6K A; 2O9V A; 2VKN A; 1WA7 A; 1Y0M A; 3PVL A; 3VS5 A; 1M3B A; 4F14 A; 3VS1 A; 5IHK A; 2EQI A; 2RQU A; 2DRK A; 4J9H A; 3UA7 A; 2O88 A; 2EYW A; 2EGC A; 4OMN A; 2O9S A; 4ESR A; 2YUN A; 2HDA A; 3NGP A; 2KBT A; 5IXB A; 4CC4 B; 1Y57 A; 2KYB A; 2DE0 X; 1E6H A; 2NUZ A; 1OOT A; 2ED1 A; 1JQQ A; 4CC7 A; 3M0U A; 4JPB W; 1WIE A; 1AWO A; 5FW9 A; 1G2B A; 2L3S A; 1WXT A; 3PE0 A; 2JS0 A; 4HVW A; 3ZL7 C; 1T3S A; 1A0N B; 2K9G A; 2KT1 A; 2KYM A; 2LJ3 A; 1TUC A; 1MV0 B; 4AG2 C; 1UJY A; 2KRN A; 1J3T A; 3SHW A; 1ABQ A; 2H8H A; 3C0C A; 2GNC A; 5I11 A; 2L2P A; 1UTI A; 1ARK A; 4RTW A; 1RUW A; 2F2X A; 2KRS A; 3UF4 A; 4OML A; 1NLP C; 4J9B A; 1QWE A; 2MIO A; 4D8K A; 1I1J A; 1FYN A; 4M4Z A; 2K2M A; 1YN8 A; 4J9F A; 1IO6 A; 3VS0 A; 1S1N A; 3M0T A; 2YUP A; 3CQT A; 1GFC A; 1YP5 A; 2YUQ A; 3NHN A; 1BU1 A; 1U3O A; 5ECA A; 2A37 A; 4OMM A; 1WYX A; 1UHC A; 4JJB A; 3I9Q A; 3H0H A; 2J6F A; 1PNJ A; 2EPD A; 4DEX A; 2RQV A; 1RLP C; 2LQN A; 2LQW A; 4EIK A; 1M8M A; 5GJV B; 2CT3 A; 2DX1 A; 2EYZ A; 4LUD A; 4JZ4 A; 2DBK A; 4K11 A; 2D8H A; 2VWF A; 4J9G A; 3SEM A; 3EG3 A; 4AFZ C; 1QCF A; 4IIM A; 2EVR A; 1OEB A; 1K9A A; 4RUG A; 1PHT A; 2JM9 A; 1UFF A; 1H8K A; 1V1C A; 2EYX A; 4AFQ C; 1PKS A; 2J05 A; 3QWY A; 3KFV A; 1HD3 A; 1X27 A; 1N5Z A; 1M30 A; 2FG0 A; 1VYU A; 2RF0 A; 3R6N A; 1CKA A; 1M3C A; 3FJ5 A; 1ZUU A; 2C0O A; 1JU5 C; 1QKW A; 1WI7 A; 2RQR A; 1NEB A; 1BK2 A; 2B86 A; 2A28 A; 2JS2 A; 2DJQ A; 1WX6 A; 4QT7 A; 2EBP A; 1K76 A; 2YSQ A; 1UE9 A; 2DYB A; 2KT8 A; 1B3Q A; 2EW3 A; 3A98 A; 2DRM A; 2KR3 A; 3ULR B; 1AZE A; 1SPK A; 2RN8 A; 2KEA A; 1U06 A; 3O5Z A; 2QDL A; 3EGU A; 2KXC A; 3I5R A; 3THK A; 4E6R A; 3I5S A; 4GLM A; 3PVQ A; 4RTU A; 1X6B A; 2DF6 A; 1W1F A; 1X2Q A; 1T0H A; 2KNB B; 3EG0 A; 1UDL A; 2OAW A; 2C0T A; 1MV3 A; 3LH5 A; 3U23 A; 3H0I A; 5FWC A; 2DL7 A; 2KXD A; 2FPD A; 2AZV A; 2J6O A; 1WDX A; 2LZ6 B; 2SRC A; 1ZUK A; 2RQT A; 2D8J A; 2ENM A; 5L23 A; 1EFN A; 2A36 A; 4A63 B; 2LNH B; 1WFW A; 1AVZ C; 3M0P A; 1KJW A; 2KRO A; 4JJC A; 1TG0 A; 2CUB A; 2CUD A; 2FRW A; 4J9E A; 2FPE A; 1XOV A; 2RQW A; 1VYV A; 2MOX A; 3VRY A; 1HSQ A; 1GL5 A; 4OMQ A; 5FWB A; 5HCK A; 1X43 A; 1CKB A; 1W70 A; 4AFU C; 2ED0 A; 4JJD A; 2DLP A; 1JXM A; 2RNA A; 3QWX X; 1YWP A; 4J9C A; 2EKH A; 1NEG A; 2CT4 A; 2SEM A; 1KFZ A; 2DL3 A; 2GQI A; 2LCS A; 1WXU A; 3TVT A; 4F17 A; 1AOJ A; 3TSW A; 4LN2 A; 3EG2 A; 2PZ1 A; 1E6G A; 2JMA A; 2LX7 A; 2FPF A; 1CSK A; 4RTZ A; 2EGA A; 4HCK A; 1Z9Q A; 1RLQ C; 1JEG A; 5EC7 A; 2ROT A; 2L3Q A; 1NLO C; 2LJ0 A; 3IQL A; 1UHF A; 5IH2 A; 1K1Z A; 2J7I A; 1PRL C; 2GTJ A; 3REA B; 2BZ8 A; 2OI3 A; 3M0R A; 5IXF A; 4HVU A; 1NM7 A; 2A08 A; 1JO8 A; 1W6X A; 2LJ1 A; 2NWM A; 2W0Z A; 1NYF A; 4Z8A A; 2CRE A; 2FRY A; 4LNP A; 1YNZ A; 3VS7 A; 2JW4 A; 1G83 A; 2AK5 A; 1YCS B; 1K0S A; 1K4U S; 4F16 A; 2DL4 A; 3JV3 A; 2PTK A; 1UUE A; 1X69 A; 2GTO A; 1LCK A; 1OPK A; 2KRM A; 3RBB B; 2PNI A; 2J06 A; 2P4R A; 4OMP A; 1AEY A; 1SSH A; 1GCP A; 1MUZ A; 1GRI A; 1GBR A; 1H92 A; 1UJ0 A; 2AZS A; 4R0K A; 1PRM C; 3RNJ A; 2DVJ A; 5I22 A; 4JZ3 A; 4CC2 A; 4OMO A; 2CH4 W; 1PKT A; 1QKX A; 4GBQ A; 1K0X A; 2F2W A; 1GBQ A; 1OV3 A; 2DL5 A; 2GGR A; 2EYY A; 2O2O A; 2YUO A; 2E5K A; 4RTT A; 3NMZ C; 3VS2 A; 1AWW A; 3I35 A; 4RTY A; 2DBM A; 2DNU A; 2BTT A; 1H3H A; 4ORZ A; 1BBZ A; 3H0F A; 5IHI A; 1SHG A; 4J9D A; 4WCI A; 2F2V A; 2CDT A; 5IHN A; 3EHR A; 1UGV A; 2ESW A; 2OJ2 A; 2HBW A; 4HVV A; 2L3P A; 1GCQ A; 1AWJ A; 1ZX6 A; 1QWF A; 4LUE A; 1U5S A; 1GCQ C; 4CC3 A; 1RI9 A; 1ZUY A; 3TSZ A; 2BZY A; 2JXB A; 4FSS A; 2V1Q A; 4Y92 A; 1HJD A; 2EGE A; 1WXB A; 1NG2 A; 1ZBJ A; 4RTV A; 2CH4 A; 2ECZ A; 2M51 A; 2K3B A; 2MCN A; 3H41 A; 2RPN A; 2DMO A; 4RTX A; 3VS3 A; 2GBQ A; 2DM1 A; 3UAT A; 1I0C A; 2IIM A; 2YDL A; 2W10 A; 2BZX A; 2DL8 A; 3UA6 A; 2RMO A; 2HCK A; 2YT6 A; 4DEY A; 1PWT A; 1SEM A; 1KSW A; 1OPL A; 1M3A A; 2K6D A; 2VVK A; 1AD5 A; 1UG1 A; 1NYG A; 1SHF A; 1JXO A; 3VRZ A; 1VYT A; 4ZNX A; 1B07 A; 1ZSG A; 1KIK A; 2C0I A; 1BB9 A; 2G6F X; 2JT4 A; 2L0A A; 3VS6 A; 1T0J A; 2AKL A; 1M27 C; 1WLP B; 2CSQ A; 3NPF A; 2ROL A; 1GFD A; 2ABL A; 2KGT A; 1SRM A; 3VS4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4LDU A; 2CSI A; 5GAO n; 2XMF A; 1RAA B; 2X3W D; 1IHV A; 1ZSZ C; 3ASK A; 2LX9 A; 1I07 A; 2EFI A; 1N9R A; 3OW2 S; 3SWN B; 2E5Q A; 3EG1 A; 3G6E Q; 1R0B G; 1Z9Z A; 1BKB A; 1QP2 A; 1E7O A; 2DK3 A; 2WAC A; 4M78 F; 4D8D A; 1M5Q 1; 5FU7 B; 5GJW B; 3CD6 A; 3MET A; 1YJ9 T; 3EHQ A; 5GMK j; 1X75 C; 2D0N A; 1FMK A; 4R55 A; 4NL2 A; 3QPH A; 1VQP Q; 4JUV A; 5FRN A; 1JRI A; 3M0Q A; 1TUD A; 5A0G A; 2LRQ A; 5CK9 A; 3OS2 A; 2VKN A; 3CCU T; 1Y0M A; 3PVL A; 4M75 C; 2EJG A; 3VS1 A; 5GMK h; 4FW2 A; 1M1F A; 1TSF A; 3X28 B; 1WHJ A; 2DRK A; 3PTA A; 1RAF B; 2EYW A; 3GF5 A; 5LJ5 j; 4N4I A; 1LOJ A; 1NPP A; 2H3J A; 4XU0 A; 2QAS A; 1RAE B; 4YTL A; 2KBT A; 3L2U A; 1BI1 A; 1Q86 U; 1M2V B; 2L89 A; 1WHH A; 2DE0 X; 1JQQ A; 4CC7 A; 1WIE A; 1K9M U; 1JB0 E; 3I56 Q; 1RAD B; 2L3S A; 2RHX A; 9ATC B; 1Q81 U; 2K9G A; 2KT1 A; 3CBM A; 3JCM W; 1WQ7 A; 2OAU A; 4AG2 C; 3QDF A; 2KRN A; 1D1C A; 2Y4X A; 2ZGW A; 1KD1 C; 2H8H A; 3C0C A; 1UB4 A; 3CCJ T; 1NJI R; 3WXM B; 2B8A A; 3FIF A; 2MK5 A; 5I11 A; 1VIE A; 2VGN A; 2M02 A; 3MP8 A; 5CVI A; 2KRS A; 4OML A; 1NLP C; 3M55 A; 1QWE A; 4D8K A; 1I1J A; 1YIJ T; 1IO6 A; 3VS0 A; 1KQS S; 3M0T A; 1UGR B; 3VUZ A; 2NUT B; 3E19 A; 2COZ A; 3F70 A; 4PJO F; 3CC7 T; 5ECA A; 2A37 A; 2XK0 A; 5GAN d; 3G71 T; 1VQK Q; 2DAQ A; 2J6F A; 2QDY B; 3RR6 A; 5GAM d; 3NFC A; 2EPD A; 2RQV A; 3CMA T; 1RLP C; 1VOM A; 2YRD A; 4M7D D; 4PL6 A; 2LQW A; 1JJ2 S; 3QO3 A; 2CT3 A; 2DXT A; 2DX1 A; 5LJ3 e; 1WJR A; 1C0M A; 5GAN g; 4LUD A; 2DTH A; 4C92 E; 3C4S A; 1IB8 A; 2DBK A; 5GAM g; 2VWF A; 3OYG A; 3BDL A; 4EPC A; 3A8O B; 2EVR A; 3SD4 A; 1OEB A; 1VQN A; 4M7A F; 1PHT A; 4C5G A; 3M59 A; 1UFF A; 2HQX A; 2KY9 A; 4EMK A; 2QQB A; 2VAS A; 4AFQ C; 2J05 A; 1VQM Q; 1M1G A; 3EGX A; 1N5Z A; 2MWO A; 2C0O A; 1O75 A; 2X9H A; 1QKW A; 4B9X A; 1XQH A; 2QXF A; 2A28 A; 1YI2 A; 2QQ9 A; 4WF2 A; 3CD6 T; 4QT7 A; 1UGS B; 1K76 A; 1ZSZ B; 1UE9 A; 2YSQ A; 3OYJ A; 1M90 U; 3A98 A; 2E3H A; 2KR3 A; 1VQP T; 1SPK A; 3JB9 D; 4ZTF A; 3CCM Q; 4E6R A; 3EG0 A; 3FB9 A; 2JN0 A; 2OAW A; 1H64 1; 4M7D G; 4OB3 B; 1MV3 A; 3LH5 A; 4B9W A; 4JRQ A; 2DL7 A; 2DXU A; 3MEU A; 1S72 A; 1KC8 R; 2FPD A; 4PK4 A; 4RMO A; 2RQT A; 2D8J A; 4DOV A; 2HNI A; 3CCR Q; 4IKF A; 4PFO A; 2CP5 A; 2KAF A; 3R6O A; 5GAN j; 1TG0 A; 3SB2 A; 3VYH B; 2FPE A; 3OY9 A; 1MGQ A; 1MND A; 1VYV A; 1HSQ A; 4OMQ A; 5FWB A; 4M75 B; 3QG1 A; 1CKB A; 1JXM A; 4J9C A; 1YIT A; 3QZ5 B; 1BIB A; 2GQI A; 3JCM V; 3CC4 A; 3MHX A; 3TSW A; 4E7H A; 3EG2 A; 2JMA A; 4AT1 B; 2FPF A; 3JB9 G; 4RTZ A; 4C8Q F; 5KCO A; 3CCQ Q; 1QVF P; 3RDV A; 1OZ2 A; 2KK4 A; 1IGU A; 1QCN A; 5EC7 A; 2QEX Q; 3ZFJ A; 2L3Q A; 1NLO C; 1D3B B; 1SSF A; 1I5O B; 3REA B; 2OI3 A; 4FU6 A; 4RCB A; 4HVU A; 2W0Z A; 3OYE A; 1NYF A; 4C8Q C; 4ELY C; 1KHC A; 2X4Y A; 2DKG A; 3M9Q A; 2AK5 A; 1K0S A; 5CKE A; 2F5T X; 4F16 A; 3ER0 A; 3JV3 A; 2EAY A; 3JCM d; 3X24 B; 1KQ2 A; 3A8G B; 2ZAE A; 3JCM X; 3OYB A; 5KYU A; 4MZM A; 1GCP A; 1XJW B; 1GRI A; 8ATC B; 4WTO B; 1GBR A; 1H92 A; 1UJ0 A; 5KYY A; 4O6J A; 1NE8 A; 3JCM g; 3JAM E; 4MDX A; 4PLL A; 2CH4 W; 1QKX A; 2NLU A; 2HAX A; 1GBQ A; 3PNW C; 2O2O A; 2MWP A; 2E5K A; 2O4X B; 4Z02 A; 1VQO A; 3VS2 A; 4XTZ A; 2DEQ A; 4HCC A; 2DBM A; 2YLB A; 2QI2 A; 1H3H A; 1VQN T; 5IHI A; 5CIU A; 3RKY A; 2CDT A; 1M9S A; 3CBP A; 3EHR A; 3KXT A; 3X20 B; 4RG2 A; 2QTV A; 1GCQ A; 1WPY A; 1UGQ B; 1QP3 A; 5KYX B; 2V1Q A; 4Y92 A; 4A4E A; 2PQW A; 3D7S B; 3GLX A; 3LWH A; 2K3B A; 3QSU A; 4PJN A; 5DY9 A; 2R57 A; 3G7Z A; 3VV0 A; 3UAT A; 2IIM A; 4KUL A; 3GP8 A; 4E7I A; 2BZX A; 4ZGJ B; 2LCC A; 4BD3 A; 4J8O A; 4LDX A; 1PWT A; 1FMV A; 1SEM A; 1OPL A; 2OTL A; 1M3A A; 2VVK A; 1AD5 A; 3CXC P; 5CO7 A; 1QQJ A; 3EGD B; 5CAI A; 3CCR T; 1VYT A; 1B07 A; 3KUF A; 4ZN3 A; 1KIK A; 3OYA A; 2C0I A; 1VQ8 T; 1TOV A; 4X9C A; 3SFM A; 4M77 G; 1OX8 A; 3AHU A; 4L5G A; 2ROL A; 2ABL A; 1N8R U; 2DEU A; 1YJ9 A; 4M7D A; 1JJ2 A; 2E1H A; 1PG5 B; 3GBQ A; 2YXY A; 3OSS C; 4M7D E; 3CCL Q; 3FEO A; 4KUD K; 1SKU B; 2JTE A; 5GAN 8; 1X6G A; 3HRT A; 4C92 D; 1R0C B; 1X2K A; 4PFZ A; 3QUI A; 1KD1 R; 2X4X A; 4A54 A; 2V8I A; 3QZ9 B; 3E9F A; 3CCU A; 2V1R A; 2K7A A; 2LMJ A; 2DZC A; 3PMT A; 1NPR A; 4KBM B; 3J81 E; 4RKU E; 2I0N A; 2K2V A; 4RCC A; 2HSP A; 2F1L A; 2PVG B; 3CCV T; 2LT1 A; 2V8K A; 2VB6 A; 1RAH B; 2A0F B; 1YHQ Q; 1T3L A; 2COW A; 2RHZ A; 1D1A A; 1RAC B; 5CKB A; 2FEI A; 3ME9 A; 1RAB B; 4N0A A; 3JSC A; 3VS5 A; 3PIO A; 1M3B A; 1D1B A; 5IHK A; 2EJF A; 5HK0 A; 1YBY A; 4C8Q B; 3LX7 A; 2EQI A; 4X34 A; 1HK9 A; 4J9H A; 2PVD B; 1WHK A; 4OVA A; 2O88 A; 4PLI A; 4D6W A; 1VQO T; 2O9S A; 3PGG A; 2HDA A; 2DER A; 3NGP A; 1M8V A; 3E9G A; 3TCJ A; 1Y57 A; 1OUL A; 2KYB A; 4C92 G; 4JJN K; 3CME Q; 2NUZ A; 3EG9 B; 1OOT A; 1Y96 A; 2P4T A; 1AT1 B; 2LTO A; 5C6S A; 1WXT A; 2JS0 A; 4HVW A; 1K73 C; 3J80 E; 1TS9 A; 1EIF A; 1A0N B; 2KYM A; 1Q82 U; 1YIJ A; 4QW2 A; 2X35 A; 1TUC A; 1MV0 B; 1J3T A; 4DBF A; 1ABQ A; 4J7I A; 3GNF B; 5CQX A; 3HRU A; 3LW5 E; 5GAO l; 3OYC A; 3M53 A; 4QQG A; 3H6Z A; 1NBE B; 1UTI A; 2HBP A; 1U8R A; 3GPL A; 2FVU A; 4IUU A; 1ARK A; 3MP1 A; 4RTW A; 4EMG A; 1OX9 A; 2F2X A; 3M57 A; 3MPU B; 4Y91 A; 1I8F A; 3UF4 A; 4J9B A; 2MIO A; 4M4Z A; 2K2M A; 1VQL Q; 1K8A C; 4J9F A; 2QAZ A; 2OTL T; 2YUP A; 4BAC A; 3LYI A; 1GFC A; 4HKE A; 1YP5 A; 3J7A F; 1GXI E; 4FYW B; 1WYX A; 1UHC A; 3CCS Q; 3H0H A; 2XD0 A; 2JTM A; 3RKW A; 2A3L A; 4QVZ A; 1MHN A; 2LQN A; 2L8D A; 1N9S A; 1D0X A; 5GJV B; 4C5H A; 1NZ9 A; 2ZCF B; 5GAN 2; 1QMC A; 4J83 A; 3CXC A; 5CR2 A; 4OF1 A; 2RO0 A; 4J9G A; 4AFZ C; 1QCF A; 3TU4 K; 3C94 A; 2AHJ B; 4BE1 A; 1K9A A; 4M75 F; 1VQP A; 4RUG A; 3ZEH A; 2FYK A; 1W2B A; 1PKS A; 2JZ2 A; 1Q7Y C; 4EMK C; 1M30 A; 2ATC B; 2VC8 A; 5D7U A; 2RF0 A; 3V8J A; 1M3C A; 1VUB A; 5GMK e; 3L2W A; 2RQR A; 3PIP A; 1NEB A; 1BK2 A; 2B86 A; 3I55 Q; 1YJW T; 2HKQ B; 2VGM A; 2EBP A; 5LJ3 d; 4A4G A; 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