The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
|
sequence length |
53
|
structure length |
53
|
Chain Sequence |
SGKKPVKVKTPAGKEAELVPEKVWALGRVKIGLFKDPETGKYFRHKLPDDYPI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Insights into the interaction between Cren7 and DNA: the role of loop beta 3-beta 4
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Chromatin protein Cren7
|
| molecule tags |
Dna binding protein/dna
|
| source organism |
Sulfolobus solfataricus p2
|
| total genus |
8
|
| structure length |
53
|
| sequence length |
53
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-08-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF11520 | Cren7 | Chromatin protein Cren7 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3KXT A; 4R56 A; 3LWH A; 2JTM A; 4R55 A; 3LWI A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4XTV A; 3FB9 A; 3EGD A; 1HYO A; 4ME7 A; 4M75 C; 4L6V 5; 2EGE A; 4XQ3 A; 2CUB A; 1X43 A; 5CQY A; 4MZT A; 1Q86 R; 1VQK T; 2H3E B; 1K8A U; 4D6W A; 2D0Q B; 2XHC A; 3TU4 K; 2EKH A; 3ER0 A; 3VKI A; 2JXB A; 5CKH A; 2EWN A; 2OTL T; 5D6X A; 1VQ7 Q; 3EG2 A; 2EJF A; 1GBR A; 4JLG A; 3CME T; 2E1H A; 1OZ2 A; 3A98 A; 1NBE B; 1I0C A; 4C0Z A; 2O9S A; 3VS4 A; 4J8O A; 4AG2 C; 4JLI A; 2V1Q A; 5GAN d; 1QKX A; 2RI2 A; 3OSS C; 4RTV A; 4M7D G; 2CP2 A; 2E41 A; 1R77 A; 3RNJ A; 1I81 A; 1PWT A; 3P8B B; 3HPW A; 2DO3 A; 3CC2 A; 2L3P A; 4KH0 B; 2G3R A; 1X69 A; 4HVV A; 1QWE A; 1T3L A; 2DIG A; 1IHV A; 3CPF A; 4HT8 A; 1BI1 A; 3JSC A; 1TU0 B; 2ZPH B; 3CCJ Q; 2CKK A; 2LJ1 A; 5GAM j; 3JV3 A; 1VQM A; 3VRZ A; 3KBG A; 4E7J A; 1VQ4 A; 2FZG B; 2ECZ A; 2KYB A; 4C92 D; 1K4U S; 1YIJ A; 4C8Q B; 3I35 A; 3HRU A; 2OI3 A; 5CKE A; 2E12 A; 2YWW A; 3ZEH A; 3CCS Q; 2DXB A; 2EBP A; 2KSS A; 3HRS A; 4LDW A; 4XTX A; 3H0H A; 4ZTF A; 4PJJ A; 2EQK A; 4RG2 A; 2ZGW A; 3FDR A; 1MV0 B; 1WHL A; 3CCL A; 2D9T A; 1C6V X; 5A0G A; 4PFP A; 1VQN A; 3M58 A; 4LUD A; 1BKB A; 2J06 A; 2RHX A; 5GJV B; 4DBH A; 1WIE A; 3GOX A; 2E10 A; 1QVG P; 4ANJ A; 3UA7 A; 4JS5 A; 2RJF A; 1ZBX A; 3MKD A; 1Q95 G; 1K1Z A; 1WI7 A; 4BUG A; 2XG8 D; 5GAO n; 2CP0 A; 2FG0 A; 3EG3 A; 2XMF A; 1X6G A; 1RAG B; 1Y71 A; 2E6Z A; 2K2M A; 3CCL T; 3EGX A; 1D1B A; 1BIA A; 2EYW A; 3RES A; 4JDS A; 3VU3 C; 3UPU A; 1X6B A; 2D8H A; 1QCO A; 3G4S A; 1VQ8 A; 2FEI A; 4HXJ A; 2LX9 A; 4A4E A; 3MHX A; 2RM4 A; 1MMG A; 4L5G A; 3V7R A; 4ELZ C; 1ZLM A; 4O5V A; 1VQP A; 1YP5 A; 2Y4Y A; 2FYK A; 5A0D A; 1GXI E; 2GGR A; 2G6F X; 4M77 E; 1TUD A; 2XDD A; 4CC7 A; 5FU7 B; 4C92 B; 1VQO Q; 4F16 A; 4OB0 B; 2PVG B; 4BI3 A; 1QVF S; 2XDB A; 1GBQ A; 4M75 D; 3EFR A; 2M0O A; 2XID A; 2COW A; 2QQ9 A; 3G4S T; 2E5K A; 1IRE B; 1ZHI A; 3OBW A; 1VQ5 Q; 2KY9 A; 5GAM e; 2JM8 A; 2F1L A; 3CCQ Q; 3C94 A; 1PRM C; 3QWY A; 2LZ6 B; 2QA4 A; 1VQ9 Q; 1IZ6 A; 3HKS A; 4BE2 A; 3L2Z A; 3QO3 A; 2WSC E; 4AMC A; 4Z8A A; 1JEG A; 4FYY B; 4AFQ C; 2KRN A; 2JMC A; 2K5F A; 2DNU A; 3CC4 Q; 3SB2 A; 1N8R R; 3EGU A; 5IH2 A; 4R55 A; 4E7I A; 3J7A F; 2R58 A; 4RUG A; 2LTO A; 2AKK A; 1D1A A; 4HCK A; 3IQL A; 4DEX A; 4FW1 A; 2QDY B; 4UC4 A; 2QA4 T; 2B8A A; 4M78 G; 4ZTJ A; 4QVZ A; 5KE3 A; 2NUP B; 2CZ6 B; 9ATC B; 1H3H A; 2CZ7 B; 1D1C A; 3G6E A; 1OX8 A; 2DTI A; 3OY9 A; 1M5Q 1; 3QUI A; 1VQK Q; 1GFC A; 1UJY A; 2CH4 A; 4HKE A; 3E9F A; 3M9Q A; 1OEB A; 1WJR A; 4M77 G; 2YHT A; 2FPD A; 4CI0 C; 2OTL Q; 1D3B B; 2E5Q A; 2LQK A; 1SHF A; 2RHY A; 1MGQ A; 5C6S A; 2F69 A; 3PFS A; 4PLI A; 3CME Q; 2LQ8 A; 2A36 A; 3C12 A; 3G6E T; 1FMK A; 4M78 C; 2AIR B; 1EZZ B; 2LMJ A; 3J81 E; 3M54 A; 2DIL A; 3M0Q A; 1UGV A; 4MDX A; 2KDS A; 1JBM A; 4C5I A; 2FO0 A; 1FX7 A; 2NUZ A; 2XI9 A; 2K3B A; 4PJO G; 3EFS A; 3ULR B; 4M7A G; 3JB9 H; 5CR2 A; 3CCV Q; 3JCM Q; 2J6O A; 2P0Q A; 1G5V A; 1H3Z A; 3PTA A; 1WJQ A; 1XTD A; 1D09 B; 1WX6 A; 2QGF B; 2MIO A; 2XD0 A; 3MCA B; 2COY A; 3O5Z A; 1VQL T; 2HEQ A; 3DLM A; 1YJN T; 2PQW A; 2DMO A; 3OYE A; 1QCF A; 2ZZD A; 2KVQ G; 2X4W A; 4Z88 A; 1WHK A; 1UGP B; 2M1H A; 1B34 B; 1VQ7 A; 2FZK B; 4HCC A; 2O4X A; 3EG9 B; 4MMK A; 4PJO C; 4M7A C; 2EW3 A; 4M7D B; 2KYM A; 3OS1 A; 1LCK A; 1NJI R; 2KRO A; 4C92 E; 4EDU A; 3J80 E; 3G71 Q; 1D0Y A; 3CCR T; 1LVK A; 4QQD A; 3A8H B; 3KXT A; 4OGE A; 1Q7Y C; 4E7Z A; 3BE3 A; 1PSF A; 2BIV A; 2WSE E; 5A0L A; 3OS0 A; 2X51 A; 1CKA A; 4MZM A; 3X28 B; 2ATC B; 2RHI A; 1PHT A; 2QAZ A; 2VV5 A; 2KRM A; 1Q7Y U; 2DFU A; 3INZ A; 2DTH A; 1AEY A; 1M30 A; 2QI2 A; 2WSF E; 2EGA A; 4ZN3 A; 1BU1 A; 3OW2 S; 3CCJ A; 1WJS A; 3L1A A; 4X9D A; 3V7S A; 1M90 C; 1I5O B; 3O8V A; 5J26 A; 2DZ9 A; 4EMH A; 1XJW B; 2P0P A; 4C5E A; 1IB8 A; 1BIB A; 4OF1 A; 3X26 B; 1Y96 A; 1Z9Z A; 1LPL A; 2ABL A; 2DJZ A; 3CCS A; 3R6O A; 1M90 U; 2P4T A; 1V76 A; 1G83 A; 2QGG A; 1E6H A; 1UEC A; 3A8M B; 3VYG A; 2E4H A; 3LWH A; 2L2P A; 4C0D C; 2LVM A; 2JS0 A; 3TEE A; 4OMF B; 1FMV A; 2E3I A; 2J05 A; 2V8J A; 3REB B; 5GAM h; 2JOY A; 5GAN j; 1R0C B; 1RAF B; 2NYS A; 1NEB A; 2RK1 A; 3MEV A; 2GFA A; 5CO7 A; 1U1T A; 2JTF A; 2H8H A; 4KBM B; 3A5Z B; 4LD6 A; 4C92 F; 2RA2 A; 3REA B; 4BI8 B; 2K2V A; 4IUU A; 3OYY A; 2QTX A; 2YLC A; 5HKC A; 4F7U A; 3CXC P; 2HKN A; 5KCH A; 4M75 E; 4M78 D; 2KR3 A; 4EMK C; 4EIK A; 3C95 A; 3OYC A; 1UGQ B; 1X6O A; 5GAM g; 2MOX A; 3OBY A; 3OSV A; 1RL2 A; 3SFM A; 1BYM A; 5IHN A; 5GAM f; 2J6K A; 3QWX X; 1UFF A; 3H0F A; 3M53 A; 1Q81 C; 2DA9 A; 4FIB A; 1G3S A; 4LDX A; 2ESW A; 4FW2 A; 3JCM X; 1W1F A; 3CPW P; 3PVL A; 2YRD A; 3JAM E; 1TTH B; 4LDV A; 5J3B A; 1I07 A; 1OX9 A; 3OYM A; 1W2B P; 2JNG A; 1SRM A; 1VQO A; 1Q81 U; 3NTK A; 2D1X A; 3OYK A; 2CDT A; 1TS9 A; 1YJW T; 3I55 T; 1TSF A; 1Z9Q A; 2BTT A; 3BDU A; 4O6J A; 3PIO A; 5IT9 E; 1VQ5 A; 1CKB A; 2DD5 A; 4QQ6 A; 2M9U A; 2DXT A; 3A1P A; 4KGZ B; 4LUE A; 3JCM c; 1Q82 R; 4Y28 E; 5D6W A; 1SRL A; 2DL4 A; 2HBW A; 3CC7 Q; 3GPL A; 3CCQ A; 3H6Z A; 5KYX B; 1VQ9 A; 1SHG A; 4DQ2 A; 4B6M A; 2EAY A; 1M1G A; 2YUP A; 2K4Y A; 3DB3 A; 3EAE A; 4PJO D; 4M7A D; 3L2R A; 3LGL A; 1ZBJ A; 2L0A A; 1KK7 A; 1MMD A; 1NPR A; 1RI0 A; 3AHU A; 2BUD A; 4M75 F; 3OYH A; 3CC4 A; 2X4J A; 3I56 T; 1OUL A; 1JJ2 S; 2PNI A; 2CYZ B; 4N4I A; 5GAN e; 1YIT Q; 1Y7X A; 1SSH A; 1KQS A; 1Y0M A; 2DBM A; 1UGS B; 2R5A A; 4JUV A; 3VUZ A; 1ZUK A; 2DVJ A; 1WZO A; 1K9M C; 4PKC C; 1FYN A; 2JVV A; 1UG1 A; 2JT4 A; 4M77 B; 3CC4 T; 1VQL Q; 1VQK A; 1YJN Q; 3VS2 A; 4R0K A; 1F1B B; 3H8Z A; 4N0A C; 3GF5 A; 2NUT B; 4F17 A; 2OTL A; 4FCY A; 2QQB A; 2RQU A; 3CME A; 4PK4 A; 3ZBD A; 2DPP B; 1K8A C; 5FU6 C; 1MHN A; 2EYZ A; 2RQT A; 1MND A; 1W70 A; 1YI2 T; 3PMI A; 1VOM A; 3CCR Q; 2DL7 A; 1NM7 A; 3OB9 A; 1VYT A; 2GCX A; 1RLQ C; 2CZ0 B; 1VYV A; 2E3H A; 2RI3 A; 1OQK A; 2HSE B; 2PUO B; 2KE9 A; 2VKN A; 1QWF A; 4M7A B; 1UHC A; 3SHW A; 2EVR A; 4M4Z A; 1N9R A; 1I4K 1; 1AD5 A; 3S6W A; 2LCC A; 4J6W A; 3NTI A; 4BDZ A; 2O88 A; 1ABQ A; 4M7D F; 1QCN A; 3CCV A; 4BI4 A; 5A2Q E; 3M4G A; 1WNL A; 2LJ3 A; 4C8Q A; 1AOJ A; 2GF7 A; 1E7O A; 4JZ3 A; 2EQU A; 5FRN A; 2MMP A; 1MMN A; 3QYH B; 2JJ9 A; 2GQI A; 1WGS A; 2HL3 A; 3LW5 E; 4LDY A; 1M8M A; 2P0K A; 4J9F A; 2RJE A; 2DBK A; 2ZPI B; 1PD1 A; 4J7I A; 2CT3 A; 4IUQ A; 5L23 A; 3H9N A; 3GBQ A; 2A28 A; 2L3S A; 1VIF A; 3CCV T; 2VXF A; 2EPD A; 1Q86 C; 4PJM A; 4HT9 A; 2KK4 A; 2L89 A; 2CH4 W; 3PNW C; 1HD3 A; 2LJ0 A; 1BI0 A; 3QDF A; 1ZSZ B; 1AHJ B; 1KSW A; 2XK0 A; 1TUG B; 4DBR A; 4EMG A; 3G71 A; 4C0D B; 1Q86 U; 4DOV A; 4PJN A; 2COZ A; 2VB6 A; 2HNI A; 1PD0 A; 4OB2 B; 2XU8 A; 6AT1 B; 3LH5 A; 1UE9 A; 4NOY A; 2BZ8 A; 1WXT A; 4J9I A; 4P5N A; 4OB3 B; 3FJP A; 3ZL7 C; 2RQR A; 5KYU B; 2KXC A; 2KRS A; 1V29 B; 4XTU A; 4KUD K; 4OGC A; 4QKU A; 2MF2 A; 5LJ3 d; 3LWI A; 3G1J A; 2RB6 A; 2QEX T; 2LX7 A; 3G71 T; 5GAN 7; 3RER A; 2I0N A; 3LH0 A; 3UAT A; 2FL7 A; 5EG2 A; 4C92 A; 4EMK B; 4J6Y A; 1ARK A; 3BFM A; 1KHC A; 4OMM A; 2F2X A; 3MP6 A; 5GAN 8; 1ZUY A; 1RI9 A; 1ZQ1 A; 1IRX A; 1KD1 R; 5ECA A; 2KBT A; 4M78 E; 2HBP A; 2FRW A; 1YJW Q; 3I55 Q; 4DOW A; 2KAF A; 1PKT A; 2C0T A; 1OU9 A; 4NS5 A; 1M2O A; 3CMA Q; 1D0Z A; 2HCK A; 2C06 A; 3M5A A; 1K73 R; 1G2B A; 2EQI A; 2PUK B; 1QVG S; 1YJ9 Q; 2K79 A; 2KI7 A; 3S3M A; 3JB9 J; 5J39 A; 5GMK m; 3CXC A; 3OYD A; 1QVF P; 4Z02 A; 4KH1 B; 2L3Q A; 3EG1 A; 3QSU A; 1K0X A; 2B86 A; 2MCN A; 2ENM A; 1M1K R; 2BKD N; 2JTE A; 4X1V A; 2OAW A; 3C4S A; 5KCO A; 2AK5 A; 3X25 B; 1RAC B; 1KC8 R; 1BCM A; 4X34 A; 3P8H A; 4XTZ A; 3I56 Q; 5GAN h; 5CKD A; 3CPW A; 3GNG A; 2EGC A; 4JJD A; 3CBO A; 1WQW A; 2VWF A; 2RMO A; 1W2B A; 1OI1 A; 1EX4 A; 2NUP A; 2D0N A; 4IKF A; 2X3W D; 2DL8 A; 3I5R A; 2DD4 A; 1HSQ A; 2VVK A; 4OMN A; 5IXF A; 4PJO E; 1YCS B; 2CP7 A; 1M2V B; 4M7A E; 4FSX A; 4L59 A; 1JQQ A; 2DL3 A; 4II1 A; 3JRZ A; 4J5Y A; 4AFU C; 2ZPB B; 2M02 A; 2MK5 A; 1D3B A; 4V2S A; 1VIE A; 4M78 F; 5GAN g; 2JM9 A; 3SWN C; 1S72 T; 1WXU A; 5GAN f; 2BE7 D; 2AKL A; 3CC7 A; 4X9C A; 1C1A A; 3X20 B; 3HP9 A; 1LOJ A; 4IIO A; 2FHD A; 3M0P A; 3FIF A; 1MNE A; 4M77 F; 1KQS P; 1YI2 Q; 1WHM A; 5HK3 A; 4AFZ C; 2MYS A; 3URG A; 4Y91 A; 3PT9 A; 2OTJ T; 3GLX A; 1X2K A; 3H41 A; 5I21 A; 2F5K A; 5FWB A; 2IIM A; 5DM7 R; 1YCY A; 5FU6 B; 1NZ9 A; 4M75 B; 3QJY A; 2RO0 A; 1TG0 A; 4WCI A; 4OMQ A; 1YIT A; 3EH1 A; 3UA6 A; 3CC7 T; 4OMO A; 3VRY A; 2YUN A; 3JB9 G; 4A4H A; 1CSK A; 3HTR A; 3HSB A; 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