The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3CCQ Q; 3CC2 Q; 3CCM Q; 1QVF P; 3CCL Q; 1Q7Y R; 1K73 R; 1N8R R; 1YJW Q; 1NJI R; 3I55 Q; 3CCJ Q; 1VQK Q; 2QEX Q; 3CME Q; 1YIT Q; 1VQ7 Q; 2OTL Q; 1VQN Q; 1S72 Q; 1QVG P; 1Q81 R; 2OTJ Q; 3CCR Q; 3CMA Q; 1VQ4 Q; 3OW2 P; 3G6E Q; 2QA4 Q; 1K8A R; 1M1K R; 3CCE Q; 3CD6 Q; 3G4S Q; 1K9M R; 3CXC P; 1VQO Q; 1W2B P; 3CCS Q; 3CC7 Q; 1M90 R; 1KC8 R; 3CCU Q; 1KD1 R; 1VQ9 Q; 1KQS P; 1YIJ Q; 1YHQ Q; 1JJ2 P; 1VQ6 Q; 1VQM Q; 3G71 Q; 3CPW P; 3CCV Q; 1YJN Q; 1VQL Q; 1YI2 Q; 1VQ5 Q; 1YJ9 Q; 1VQP Q; 1Q86 R; 1VQ8 Q; 3I56 Q; 1Q82 R; 3CC4 Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 3HKS A; 3URG A; 3LGF A; 3V7C A; 3VYG A; 4JRK A; 4II1 A; 2O31 A; 4RTZ A; 5I11 A; 1VQN Q; 5DY9 A; 3RBB B; 4C5I A; 2OX7 A; 1BI1 A; 2CUB A; 4C92 D; 1YP5 A; 3DB3 A; 4PJO D; 3E2U A; 4D6W A; 1K0S A; 2F2W A; 1WHG A; 3T9N A; 2NUT A; 2DL3 A; 5AT1 B; 2NYS A; 2OTJ A; 2HBW A; 1K73 U; 3M0Q A; 3JCM P; 3CCR T; 1JJ2 S; 2RI3 A; 1VQP Q; 2DVE A; 1G3Y A; 2H3E B; 2RHU A; 4BE0 A; 2H3J A; 5IXF A; 3U23 A; 3UF4 A; 3JCM d; 2G3R A; 3EHQ A; 2K9G A; 2DF6 A; 2KYB A; 4OMQ A; 3CMA Q; 4LDY A; 3CME T; 1MMN A; 3VRZ A; 2Y4Y A; 2QA4 A; 1IHW A; 3JV3 A; 2YT6 A; 4JDS A; 3G4S T; 5FU6 C; 1LVK A; 4M77 D; 1VQ9 A; 1D1B A; 2KVQ G; 1FMV A; 4J9H A; 1VQL A; 3TRE A; 4F17 A; 2RJC A; 4DBH A; 4C92 E; 4EDU A; 3CCJ Q; 4M75 D; 3OYI A; 3VS0 A; 3EAE A; 4J9D A; 4PJO E; 5GJW B; 1M90 C; 3M0T A; 4DOW A; 2RQT A; 4KT0 E; 1N9S A; 4J6X A; 2F69 A; 2GNC A; 1Q7Y U; 1K1Z A; 1IB8 A; 5CKD A; 1SHG A; 2J7I A; 1CKA A; 1N6A A; 2EKH A; 2J6K A; 1K8A U; 1VQ5 A; 5LJ3 f; 1NEB A; 1KQ1 A; 2HL3 A; 3TVT A; 4Z8A A; 3OYD A; 2CP6 A; 1UE9 A; 2X51 A; 2EQI A; 2V8J A; 4X9C A; 4LXC A; 3VKI A; 1BB9 A; 4MDW A; 3CEY A; 2DXT A; 2SRC A; 5ECA A; 1KQS A; 2XHC A; 1M2V B; 4HVU A; 5LJ5 j; 3ZBD A; 3JCM V; 5LJ5 h; 3O5Z A; 4R0K A; 1YI2 Q; 3I9Q A; 4XU2 A; 1RAE B; 1TXQ A; 4FSX A; 5GAN e; 1VQ6 T; 1LCK A; 3VS2 A; 5GAM d; 2YUP A; 3CCM A; 1X75 C; 1SF9 A; 2O01 E; 2J06 A; 2O4X A; 3M54 A; 3CC2 T; 2QG9 B; 1RI9 A; 1UGV A; 2DEQ A; 3JCM g; 4M77 E; 2M0Y A; 4M4Z A; 1W2B S; 1KIK A; 2R5M A; 2MK5 A; 1BI3 A; 3GLX A; 5KE3 A; 1WHL A; 4M75 E; 4KUL A; 4MMK A; 2AKK A; 2DET A; 1GFD A; 1OX8 A; 4ME7 A; 4JPB W; 5A0D A; 1G83 A; 4MZM A; 1G5V A; 4QVD A; 1Y57 A; 2COY A; 3HSB A; 3OYH A; 5IHI A; 1MGQ A; 3JCM f; 2X9H A; 4JJB A; 1S72 T; 3OSS C; 3X20 B; 3C95 A; 2GQI A; 4LD9 K; 2QTX A; 1N9R A; 2VXE A; 1I8F A; 2A7Y A; 1VQL Q; 1YJ9 Q; 3CC7 T; 2MOX A; 4JJN K; 3JB9 D; 2MAM A; 1RAF B; 2MF2 A; 1WNL A; 3FDR A; 2OTL Q; 1AWJ A; 1AWX A; 3A1P A; 2RQR A; 4C5G A; 3AHU A; 5A0L A; 4HA8 A; 3NTI A; 5IT9 E; 3WVE B; 4GY5 A; 3EGD B; 2E12 A; 2MIO A; 3QDF A; 3RES A; 3H41 A; 3HL8 A; 3MPU B; 4BE2 A; 2L3P A; 1K73 R; 3VS5 A; 3CCQ T; 2HD0 A; 4X34 A; 1YIT A; 4PJJ A; 4OMF B; 2I0N A; 5GAO p; 2VAS A; 4M7A B; 4AFZ C; 4XU3 A; 3J80 E; 1HSQ A; 4J7F A; 3CCU A; 3TQ7 P; 1EFN A; 4M78 F; 2JS2 A; 2RQU A; 5GAO l; 1IRX A; 2FYK A; 1W70 A; 1PSF A; 4QVZ A; 1R0B G; 1M8M A; 5GAM f; 1VQ7 A; 4D8D A; 3A8L B; 4OF1 A; 3OYA A; 1X6G A; 3QDR B; 2H8H A; 2DXB A; 3KXT A; 4NS5 A; 3GIB A; 3VS3 A; 4A54 A; 4AFS C; 3RR6 A; 5GAO q; 3H6Z A; 3CPW S; 1X6B A; 1YJN T; 2YUN A; 3JAM E; 1Q7Y R; 2LZ6 B; 1KSW A; 3GBQ A; 5CO7 A; 1D0X A; 1X27 A; 3G6E Q; 1ZA2 B; 4IIM A; 5GAN 5; 2VYT A; 2FEI A; 2V1Q A; 4F7U E; 4C8Q D; 2XI9 A; 4B9X A; 2JT4 A; 5CQX A; 3LWI A; 2A08 A; 1Q82 R; 2DO3 A; 3G1J A; 3OYY A; 1YIJ T; 1AD5 A; 4EMK B; 2KBT A; 1QVF P; 1TH7 A; 1VOM A; 3OYN A; 2RHZ A; 3CPF A; 1VQK T; 1UHC A; 2RJE A; 2W10 A; 2XDB A; 1JJ2 A; 2RHX A; 1A0N B; 2PQW A; 4KGZ B; 1KQS P; 2NUP A; 3EFO B; 3OYE A; 4E47 A; 5CKH A; 3PT9 A; 4VUB A; 4RTY A; 3QYG B; 1KG1 A; 2DTI A; 5CVI A; 1TUD A; 1SSH A; 2DTO A; 1OI1 A; 5A0G A; 3CCR Q; 2QEX T; 2MWP A; 1C0M A; 1OX9 A; 4E7Z A; 4DEY A; 1BI0 A; 4JS5 A; 2QAZ A; 2A28 A; 4J9G A; 5KYX A; 2RM4 A; 5KYU A; 2K79 A; 4RMO A; 2C06 A; 4XAX B; 3ASK A; 5DLQ E; 1GFC A; 1WFW A; 4N4G A; 1AVZ C; 2ENM A; 5I22 A; 3CME Q; 2COW A; 4XTX A; 2VB6 A; 4C8Q E; 3GP8 A; 4E7J A; 3KUF A; 4J83 A; 2QQ9 A; 3G4S Q; 4C92 A; 2MI6 A; 1QVP A; 4JZ3 A; 2CZ6 B; 1N8R U; 1U1T A; 2PTK A; 1WHH A; 1M1F A; 4PJO A; 2DZ9 A; 2KRS A; 1FX7 A; 2O9S A; 1FYN A; 5I21 A; 3TU4 K; 2KNB B; 1AHJ B; 4PNO A; 3EG9 A; 2CZ7 B; 4LD6 A; 1GCP A; 2CGH A; 4Z89 A; 2AZV A; 2NUZ A; 2KQW A; 2YSQ A; 2QGG A; 2SEM A; 4X1V A; 3JB9 H; 4N4H A; 2BUD A; 2LCC A; 1IZ6 A; 2QDY B; 4XTY A; 2DD4 A; 1IGU A; 1ZSZ C; 3CCV T; 4IUQ A; 1QVF S; 4FCY A; 4RTU A; 5FU6 B; 1YJW A; 1OZ3 A; 1BK2 A; 1QVG S; 1AZG B; 1D1A A; 1WYX A; 1ACM B; 1Y71 A; 4E7S A; 2LCL A; 4QQG A; 1M4Z A; 3CXC P; 2OTJ T; 2WSC E; 4IUU A; 4RCB A; 1VQ6 Q; 2KGT A; 3N5B B; 2KE9 A; 1BBZ A; 2BZ8 A; 1VQM A; 4M7D C; 3JCM h; 4M78 C; 4BY6 C; 3CC2 Q; 4OB0 B; 2EGE A; 1G8X A; 3EG1 A; 3JCM X; 2KT1 A; 4O5V A; 4PLI A; 2VC8 A; 3M57 A; 5KYW A; 2K2V A; 2OAW A; 1ZLM A; 1OZ2 A; 1XJW B; 3RMS A; 1K73 C; 2P4T A; 4KRT A; 2J05 A; 3PMT A; 2DIG A; 2QA4 T; 5GAN 3; 4B6M A; 2J6F A; 4JUV A; 2DBM A; 2YUQ A; 4A4K A; 2XU8 A; 5LJ5 e; 5GAO n; 4BAC A; 1VQ9 T; 2R58 A; 1R8O B; 4JLG A; 3MJX A; 2JM9 A; 4NL3 A; 1S72 Q; 3P8D A; 2EIF A; 1SPK A; 3M4Y A; 3UT1 A; 1PD1 A; 2HL5 C; 2QAS A; 4GBQ A; 3CC7 Q; 2RB6 A; 2D8J A; 3GNG A; 2L2P A; 3GPL A; 5J39 A; 3QSU A; 4DBR A; 9ATC B; 1GL5 A; 3PVQ A; 2YRV A; 3R6O A; 3GF5 A; 4R55 A; 2FO0 A; 1JBM A; 1WHJ A; 3OYL A; 1VQ5 T; 1KD1 C; 4J9I A; 2YHT A; 1W6X A; 5KYN A; 2DLP A; 2D9T A; 2E6Z A; 1RAA B; 2RK1 A; 1GXI E; 2EGC A; 5M9O A; 1D3B A; 4KGV B; 4C92 G; 1RAG B; 1Q7Y C; 4KH0 B; 3FEO A; 1X69 A; 2FG0 A; 4PJO G; 3S3M A; 1H64 1; 2JN0 A; 2K4Y A; 1JJ2 P; 2KRO A; 2E70 A; 5HK3 A; 4E7L A; 1B3Q A; 3NGP A; 2KRM A; 3CCQ Q; 2HDA A; 2E41 A; 4N0A A; 4E7H A; 4C8Q F; 2FZG B; 3R6N A; 1FMK A; 1WI7 A; 1WXU A; 1IXD A; 3BE3 A; 3CCM T; 2FB7 A; 4EMG A; 3UPU A; 4CC2 A; 4EIK A; 1Q82 C; 2DJQ A; 1B34 B; 1NM7 A; 1NPR A; 2LNH B; 4J8O A; 4RTX A; 4F14 A; 3M58 A; 5IH2 A; 2BTT A; 4CC7 A; 2CUD A; 1N8R R; 4ZGE B; 3DB4 A; 1FMW A; 3FJ5 A; 4HXJ A; 4JS4 A; 2WSF E; 4HCZ A; 2D8H A; 4OGE A; 4ATO A; 2VXF A; 2HSP A; 3EGX B; 3X25 B; 3CCE A; 2L8D A; 3CCS A; 2PUK B; 1YJN Q; 2CKK A; 1JU5 C; 2JS0 A; 2KEA A; 1WJS A; 4F7U A; 4A53 A; 1HD3 A; 4JRI A; 1WJR A; 1RAH B; 1M2O A; 3FJP A; 4N0A C; 4AFQ C; 4ZN1 A; 3PNW C; 1VUB A; 3SFM A; 1YIJ Q; 5GMK i; 2CYZ B; 4A4E A; 3HRU A; 5GAN d; 1Q81 U; 2HQX A; 2M02 A; 3CCV A; 4O6J A; 3SWN A; 1IGQ A; 1T3L A; 1W4S A; 1QW1 A; 1VQK Q; 3SB2 A; 2ZZD A; 1QKX A; 2JUF A; 1WLP B; 1TU0 B; 3M59 A; 3IQL A; 3PE0 A; 1NG2 A; 1YIT T; 1E7O A; 1XTD A; 1W2B P; 3S6W A; 2GCX A; 2X35 A; 2DL4 A; 3EG3 A; 5CQY A; 2LP5 A; 4QT7 A; 3OMC A; 4C5H A; 3CCU T; 5IXB A; 3RER A; 3FLG A; 2QEX Q; 3H9N A; 1H8K A; 2DNU A; 5GAN 4; 2MYS A; 1VQ7 T; 3E9G A; 4HCC A; 1OOT A; 2RJD A; 1GCQ A; 4C8Q A; 4M7A D; 5KYY B; 5LJ3 g; 2RQW A; 3L2W A; 2VGM A; 2K7A A; 4WCI A; 3CC4 A; 1BCM A; 2EYQ A; 1KD1 U; 5GAN 7; 1YNZ A; 1EIF A; 1KHC A; 4BB7 A; 1WXB A; 5FRN A; 4PL6 A; 1KQ2 A; 3CBP A; 1JO8 A; 1VQO A; 3X24 B; 1XNI A; 2EQU A; 4ANJ A; 3JB9 G; 1QVF A; 2PUO B; 1TSF A; 3LGL A; 1V1C A; 5CK9 A; 5GAN g; 3VRY A; 4PKC C; 1EX4 A; 4ORZ A; 1UEC A; 1QVG A; 4LDU A; 2X4Y A; 1PHT A; 4D8K A; 1QCF A; 3HTR A; 4TVR A; 1Q82 U; 1AEY A; 2DEU A; 3VS7 A; 1IO6 A; 2ZPH B; 1YCY A; 1B07 A; 3EG2 A; 1PRM C; 2RH2 A; 2VWF A; 4YTL A; 3L42 A; 2KDS A; 3O8V A; 3G71 T; 1I1J A; 1TWB A; 2B8A A; 3M55 A; 4F7U G; 1QQJ A; 2DL7 A; 5GAN f; 5KCO A; 3MP8 A; 2HZY A; 4M7A E; 3C94 A; 4AG1 C; 2ZGW A; 1G3W A; 2OTJ Q; 4DQ2 A; 1C6V X; 2DIQ A; 1VQ4 A; 2K2M A; 2EQK A; 2EVR A; 3J7A F; 2LNV A; 3A8O B; 4RTW A; 3CPW P; 1B7T A; 2A36 A; 2DZC A; 1NEG A; 4LNP A; 4ESR A; 1WPY A; 5FW9 A; 3THK A; 4FIB A; 4B9W A; 3QPH A; 3I55 A; 3M0R A; 8AT1 B; 1ZSZ B; 2QA4 Q; 2XMF A; 2E65 A; 1RAC B; 5KE2 A; 5KYX B; 1VQ9 Q; 2KXC A; 3JSC A; 1K0X A; 1MND A; 3RUX A; 1YN8 A; 3OY9 A; 2P0P A; 4HCK A; 1PWT A; 4J5Y A; 3JCM e; 3A8H B; 2ZAE A; 5L8R E; 4CI0 C; 7AT1 B; 3JRZ A; 1Q81 R; 2DJZ A; 3VS6 A; 4M7D B; 4M78 B; 4BY6 B; 4Y28 E; 4R56 A; 1N8R C; 4HVW A; 4OP0 A; 4C8Q G; 2CSQ A; 1ZBJ A; 2HSE B; 2L3S A; 5CKF A; 1VQ5 Q; 5D7U A; 3FB9 A; 2YRC A; 4ELZ C; 5CAI A; 3EG9 B; 1Y96 B; 3P8B B; 2E10 A; 2ED1 A; 2COZ A; 2WAC A; 5GAM g; 2QI2 A; 2BE9 B; 2K3X A; 2RF0 A; 1YJW T; 1ZUY A; 3CXC A; 4KBM B; 3BDL A; 1MV0 B; 2BZX A; 1I07 A; 4Y92 A; 2ROL A; 2OJ2 A; 3H0I A; 1NLO C; 3LX7 A; 3QYH B; 1H3Z A; 3CCM Q; 1VQM T; 1AWW A; 4C92 F; 2RJF A; 3A5Z B; 3X26 B; 1BIA A; 2HNI A; 4PJO F; 3VS4 A; 1JQQ A; 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5LJ3 h; 3I5R A; 2QYZ A; 3S3O A; 2EQM A; 3CMA T; 1WQ7 A; 3EH2 A; 1LOJ A; 3CCE T; 3I5S A; 3CCS T; 2QTV A; 5GAO r; 3OQ5 A; 3X28 B; 4RKU E; 2K6D A; 3OS1 A; 2FHD A; 1UJ0 A; 4BDZ A; 2DRK A; 3OBY A; 5GMK l; 1TTH B; 1WQW A; 4E7I A; 3V8L A; 1OUL A; 5GAN j; 3C12 A; 5GAN h; 1F1B B; 5KH6 A; 5GJV B; 5HY6 A; 3EGD A; 1ZUU A; 1PM3 A; 4ZTF A; 3OMG A; 1MV3 A; 3SDZ A; 2HAX A; 2CH4 A; 3I56 A; 2JM8 A; 3JB9 F; 3SHW A; 4QW2 A; 2JZ2 A; 1W2B A; 1V76 A; 2EYZ A; 4ZNX A; 3QWY A; 1U3O A; 4FYY B; 2JTM A; 4M7A A; 3PMI A; 3G71 Q; 4M77 A; 4FM4 B; 1Q81 C; 3A8G B; 3PVL A; 1JRI A; 5GAO m; 1T3S A; 4LE9 A; 4C92 C; 2NUT B; 3RMQ A; 1ZA1 B; 2ECZ A; 4P5N A; 1KJW A; 4M75 A; 3MEW A; 3WXM B; 4PJO C; 4JJD A; 4XQ3 A; 3REA B; 3M0S A; 1TOV A; 5FWB A; 2K5I A; 4F7U F; 1I5L A; 4RG8 A; 1NYG A; 1YHQ A; 2J6O A; 2JMC A; 3OYF A; 4DA4 A; 3BY7 A; 2ABL A; 1Y07 A; 3QJY A; 5LJ5 f; 3CCL A; 3CC4 T; 1AWO A; 1OU8 A; 4KH1 B; 1IRE B; 1KK7 A; 3ER0 A; 2HEQ A; 2DL5 A; 3CD6 A; 3RKY A; 2HCK A; 1M27 C; 2X4X A; 2JOY A; 1VQO T; 1MNE A; 5IHK A; 1SHF A; 2W0Z A; 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