The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
73
|
structure length |
73
|
Chain Sequence |
b'SMDSRTKSKDYCKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVTLINKDCIDVGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLPPDFEKE'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
SH3 domain-containing kinase-binding protein 1
|
| publication title |
Solution structure of the Sh3-C domain of Cin85
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
7
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| structure length |
73
|
| sequence length |
73
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-10-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PKS A; 3O5Z A; 4HVV A; 3UA7 A; 5FWC A; 3SEM A; 2GGR A; 1T3L A; 2L3S A; 1NEG A; 5GJW B; 3KFV A; 1RUW A; 1YCS B; 4ORZ A; 1NYG A; 2A28 A; 3M0Q A; 2HBW A; 1QKX A; 5EC7 A; 2PNI A; 2W0Z A; 3NHN A; 1GCQ C; 1OEB A; 3IQL A; 3R6N A; 1X6G A; 2AKL A; 2A08 A; 2DL7 A; 1Y57 A; 1XOV A; 3VS7 A; 1UHC A; 2EYY A; 2JS2 A; 1K4U S; 4F17 A; 2K2M A; 4F16 A; 2KNB B; 2YUN A; 2HCK A; 4OMP A; 2YUQ A; 1FMK A; 2LX7 A; 5IHI A; 4AG2 C; 4CC7 A; 1K1Z A; 2CDT A; 1I07 A; 3EG1 A; 2J7I A; 4ZNX A; 5HCK A; 1I0C A; 1HJD A; 1UGV A; 1GBQ A; 1OPK A; 1WXT A; 1WFW A; 3TSZ A; 3PVQ A; 1M30 A; 2RQU A; 1JU5 C; 1AD5 A; 2KYB A; 2O2O A; 2YUO A; 1WIE A; 2KYM A; 1CSK A; 3EG3 A; 2CH4 W; 1YP5 A; 4JZ4 A; 2D1X A; 4RTV A; 1VYU A; 2EYX A; 2DA9 A; 3UAT A; 4GLM A; 3U23 A; 2EYW A; 1AZE A; 1WA7 A; 1M27 C; 2A37 A; 2FG0 A; 2MCN A; 5IXF A; 2RQT A; 2KR3 A; 1AVZ C; 4R0K A; 1MV3 A; 1NLO C; 2MOX A; 2CH4 A; 2DLP A; 3LH5 A; 1KJW A; 2DX1 A; 3FJ5 A; 2QDL A; 2VWF A; 2KRS A; 2YUP A; 3H41 A; 2K7A A; 1NG2 A; 4FSS A; 1K76 A; 1WYX A; 2L3Q A; 1GFC A; 1U3O A; 3VS4 A; 1H8K A; 5IHK A; 2W10 A; 4J9I A; 1PNJ A; 2EGA A; 1UDL A; 2DL8 A; 1G83 A; 2C0I A; 1UJY A; 2C0T A; 3A98 A; 2KBT A; 1VYV A; 4J9H A; 3M0S A; 2LNH B; 4GBQ A; 1TUD A; 2GTJ A; 1ZUU A; 2FEI A; 4RTU A; 1YWP A; 2YDL A; 3VS3 A; 4Z89 A; 3H0F A; 5L23 A; 4WCI A; 1H3H A; 1KFZ A; 2D8J A; 1SPK A; 2MIO A; 2J6O A; 1T0H A; 2DNU A; 3EGU A; 3PVL A; 4CC2 A; 4LE9 A; 2JXB A; 2ECZ A; 3EHQ A; 4JJD A; 1YNZ A; 1T0J A; 2DBM A; 4OMM A; 1ABO A; 4AFS C; 1JEG A; 2EW3 A; 1CKB A; 2JMA A; 2NUZ A; 2K79 A; 4HVW A; 3CQT A; 4DEX A; 4A63 B; 2J06 A; 2AK5 A; 1GCP A; 1AZG B; 2KEA A; 4AFZ C; 1X6B A; 2DJQ A; 2DF6 A; 2OAW A; 2RF0 A; 2GTO A; 1ZUK A; 2CT4 A; 3THK A; 1RLQ C; 4OMO A; 4X1V A; 2RNA A; 2AZS A; 3I9Q A; 3NPF A; 2K9G A; 2D8H A; 1WX6 A; 1AEY A; 3QWX X; 4E6R A; 2LQN A; 5FWB A; 1JXM A; 2ABL A; 1AWO A; 1JO8 A; 1ZUY A; 2XMF A; 2LJ3 A; 1ZLM A; 1JQQ A; 1SEM A; 5I22 A; 1PHT A; 1QCF A; 2K6D A; 2I0N A; 2JTE A; 2FPF A; 1ARK A; 3VRY A; 2DIL A; 3M0R A; 4JJC A; 2JM9 A; 1T3S A; 3H0I A; 3TSW A; 1Y0M A; 5IXB A; 2J6K A; 1OOT A; 1WI7 A; 1I1J A; 5FW9 A; 2RPN A; 4J9G A; 2E5K A; 4QT7 A; 1YN8 A; 4JJB A; 2M51 A; 1AWJ A; 1KSW A; 2CT3 A; 2JM8 A; 1BB9 A; 2LJ1 A; 1OV3 A; 3I5R A; 1W1F A; 5GJV B; 3NMZ C; 1QWF A; 1M8M A; 2BZX A; 2JW4 A; 1QKW A; 1SSH A; 2LJ0 A; 3VS6 A; 4LUE A; 2KT1 A; 3M0U A; 3H0H A; 4J9B A; 2X3X D; 4J9D A; 2F2V A; 2A36 A; 2DE0 X; 2HEQ A; 2G6F X; 2OJ2 A; 1BK2 A; 1K9A A; 1M3B A; 1W70 A; 4AFQ C; 1B07 A; 2JS0 A; 1NYF A; 1E6G A; 1UHF A; 1A0N B; 3I5S A; 1V1C A; 2X3W D; 1RI9 A; 1VA7 A; 1BBZ A; 1PKT A; 4EIK A; 1GBR A; 2CUB A; 3JV3 A; 3VS2 A; 1N5Z A; 1GCQ A; 4RTX A; 2K3B A; 2VKN A; 1X27 A; 1S1N A; 2RQW A; 4K11 A; 1ZSG A; 1UTI A; 5IHN A; 4D8K A; 1SRL A; 1HSQ A; 2V1Q A; 2YT6 A; 3VS1 A; 1U06 A; 2ED0 A; 2EGE A; 2LZ6 B; 1NLP C; 1AOJ A; 4HCK A; 5IH2 A; 2DVJ A; 1K0S A; 1PRM C; 1EFN A; 1G2B A; 1HD3 A; 2FO0 A; 4CC3 A; 2M0Y A; 3M0P A; 1QLY A; 3C0C A; 3EHR A; 2BZY A; 2DL4 A; 4AFU C; 2ESW A; 1PWT A; 4OML A; 4D8D A; 1NEB A; 3TVT A; 2RQV A; 3EG2 A; 1VYT A; 2IIM A; 5I11 A; 1IO6 A; 1ZX6 A; 1AWX A; 2DL5 A; 1SRM A; 2AZV A; 2FRW A; 1RLP C; 4Z88 A; 4KRT A; 2AKK A; 4RTW A; 1PRL C; 1MUZ A; 2O88 A; 2RN8 A; 4CC4 B; 3GBQ A; 1UFF A; 1E7O A; 4LUD A; 1M3A A; 2EGC A; 4ESR A; 3EG0 A; 2O31 A; 4J9C A; 4AG1 C; 1GFD A; 2HDA A; 2KE9 A; 4DEY A; 1B3Q A; 3UF4 A; 2EYZ A; 2YSQ A; 4RTT A; 2CRE A; 1U5S A; 1X2Q A; 2LMJ A; 3VRZ A; 2V1R A; 1UJ0 A; 4JZ3 A; 2FPD A; 1K0X A; 2ED1 A; 1LCK A; 2VVK A; 1AWW A; 1X69 A; 2CSI A; 4HXJ A; 3PE0 A; 4M4Z A; 2LQW A; 2DMO A; 2RQR A; 2OI3 A; 2PTK A; 4IIO A; 4J9F A; 2D0N A; 2LCS A; 2HSP A; 2BZ8 A; 2O9V A; 2ENM A; 1GRI A; 2RMO A; 1MV0 B; 2JMC A; 2DBK A; 1GL5 A; 2CSQ A; 4RTZ A; 5ECA A; 2JT4 A; 2O9S A; 3I35 A; 1WDX A; 2C0O A; 1WXB A; 3RNJ A; 1UEC A; 3VS5 A; 2EVR A; 2F2X A; 1ABQ A; 2ROT A; 4RUG A; 2FRY A; 1QWE A; 2DL3 A; 2BTT A; 2GBQ A; 3REA B; 2CUD A; 3ZL7 C; 2EPD A; 2NWM A; 4J9E A; 4F14 A; 4RTY A; 3UA6 A; 1SHF A; 1JXO A; 2KT8 A; 4Z8A A; 1YWO A; 3ULR B; 4Y92 A; 2DRK A; 4LNP A; 1UUE A; 2KRN A; 1J3T A; 3SHW A; 2L2P A; 3NGP A; 2GNC A; 2EKH A; 1E6H A; 2J05 A; 1WXU A; 1Z9Q A; 4JPB W; 1SHG A; 2F2W A; 2GQI A; 3QWY A; 3M0T A; 1Z9Z A; 4OMQ A; 1ZBJ A; 1BU1 A; 2KXC A; 4IIM A; 1FYN A; 1CKA A; 1WLP B; 2DRM A; 2SRC A; 2ROL A; 2P4R A; 1W6X A; 3VS0 A; 2KRO A; 1M3C A; 1OPL A; 2PZ1 A; 2J6F A; 4LN2 A; 1TUC A; 1X2K A; 2SEM A; 1X43 A; 2B86 A; 2L0A A; 3REB B; 4HVU A; 2LP5 A; 2KXD A; 2KGT A; 2FPE A; 2EBP A; 1UE9 A; 2H8H A; 1NM7 A; 4OMN A; 1H92 A; 3RBB B; 2DM1 A; 2DYB A; 2L3P A; 1KIK A; 2KRM A; 1TG0 A; 1UG1 A; 2EQI A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3C4S A; 2F1L A; 3O5Z A; 4JRI A; 4KUI A; 3VJP A; 1KQS A; 1OU8 A; 3CC4 A; 1KQS S; 1T3L A; 5C0M A; 5GAM e; 4ORZ A; 1DJ7 B; 4E7L A; 1QKX A; 2W0Z A; 3NHN A; 4L5G A; 1YHQ T; 3MKD A; 3R6N A; 4IUP A; 1XOV A; 2YHT A; 1KQ2 A; 2EYY A; 4ZN3 A; 1VOM A; 1TXQ A; 3DB3 A; 2E6Z A; 2QDY B; 2LX7 A; 1G3W A; 3CCM A; 2ZPG B; 4CC7 A; 1W4S A; 3ZEH A; 1KC8 C; 4MZM A; 4F7U B; 4N4I A; 4OGC A; 3SFM A; 4LDY A; 3HTR A; 3QYG B; 4ZNX A; 3JB9 F; 1MMA A; 3LX7 A; 4PJN A; 4XTU A; 1HJD A; 1UGV A; 4M75 A; 3TSZ A; 3PVQ A; 3KXT A; 2RI5 A; 2LCC A; 2D0Q B; 4OB3 B; 2RQU A; 2KYB A; 3TRE A; 4C0F A; 2YLC A; 3EAE A; 1VQ8 T; 3OS0 A; 2CH4 W; 1VQP T; 4JZ4 A; 2D1X A; 1VYU A; 1D1C A; 2V8I A; 4JS4 A; 5M9O A; 3U23 A; 3INZ A; 1YJ9 Q; 1WA7 A; 1Y96 A; 3V8J A; 3CCU Q; 3UT1 A; 3CCE Q; 2MCN A; 2X9H A; 4JS5 A; 2KR3 A; 4HCZ A; 2CH4 A; 2K4Y A; 1TTH B; 3FJ5 A; 3MEV A; 1KK7 A; 1OX8 A; 4OMF B; 1M2V A; 3X25 B; 4Y28 E; 2XKO C; 4QVZ A; 4M7D C; 3VS4 A; 2DIG A; 3JCM d; 2CZ0 B; 2FB7 A; 1VQL A; 3CPF A; 3O8V A; 4J9I A; 4RMO A; 2DL8 A; 3ER0 A; 3A8O B; 4J5Y A; 2B8A A; 1BIA A; 3J80 E; 1VYV A; 4OB0 B; 4C8Q E; 3BFM A; 2VV5 A; 4GBQ A; 3EFR A; 2GTJ A; 4JRP A; 4BDY A; 3CCL A; 3H0F A; 1AT1 B; 3CCJ T; 5IAY A; 4II1 A; 3SB2 A; 1SPK A; 5GAM j; 3M57 A; 3CC4 Q; 2DNU A; 2GF7 A; 3PVL A; 4ZTJ A; 2CYZ B; 1VQ6 A; 4JJD A; 1YNZ A; 1B34 A; 2DBM A; 4C0G A; 2YWW A; 4AFS C; 2E3H A; 2WSF E; 2EW3 A; 4XK8 E; 2F5T X; 2JMA A; 3CMA T; 3CXC A; 1MGQ A; 2DEQ A; 1KHC A; 3CXC S; 4IKF A; 1YIT A; 1WNL A; 4PJO F; 2HQH A; 4RG8 A; 1I5O B; 2RF0 A; 2CZ7 B; 3V7C A; 3THK A; 1RLQ C; 2H3E B; 3G71 A; 3OYB A; 2AZS A; 2DAQ A; 4BUG A; 1WX6 A; 3JCM e; 3MP1 A; 4PNO A; 2E64 A; 4OB1 B; 1QP2 A; 5HK3 A; 4FCY A; 1AWO A; 1ZUY A; 4J83 A; 5GAO r; 5A0L A; 3RIR A; 4JRK A; 1ZLM A; 1IHV A; 3FEO A; 1SEM A; 5I22 A; 1PHT A; 2Y4X A; 1N8R R; 2CP0 A; 2BE9 B; 4JLI A; 5I2M A; 3J7A F; 4C92 A; 3M0R A; 4JJC A; 3H0I A; 3TSW A; 3E1S A; 5D6Y A; 3RDV A; 1I1J A; 5FW9 A; 2RPN A; 2E5K A; 4C8Q D; 4JJB A; 2CT3 A; 3V7S A; 2LJ1 A; 3MJX A; 1IXD A; 2NUP A; 3L42 A; 4ZGD B; 1GXI E; 2WSC E; 3OYG A; 5CIU A; 1WHM A; 1IRX A; 4LUE A; 4XU3 A; 1SG5 A; 5LJ3 f; 5LJ5 f; 1M1F A; 5GMK l; 2F2V A; 2A36 A; 1U1T A; 2Z0W A; 2RJF A; 4KUD K; 4OVA A; 1W70 A; 3LLR A; 1A0N B; 4VUB A; 3I5S A; 1RI9 A; 1ZSZ B; 3CD6 Q; 1VA7 A; 2HD0 A; 1PKT A; 3G4S A; 2K3B A; 3QHS A; 4KH0 B; 4C5H A; 2RQW A; 1RI0 A; 2A3L A; 3E9G A; 5IHN A; 1KHI A; 1SRL A; 2D6F A; 2LX9 A; 2DJZ A; 3ASK A; 4HCK A; 2DVJ A; 3OMG A; 3CCQ T; 4L6V 5; 1EFN A; 2K3X A; 1G2B A; 1OI1 A; 3CC7 Q; 1VQ9 T; 3MP6 A; 4CC3 A; 2M0Y A; 4PJO C; 2MAM A; 5KYU B; 4RCB A; 2I2L A; 3TVT A; 3EG2 A; 2DTO A; 1ZX6 A; 2DL5 A; 5FLX E; 2ZZD A; 1YJN T; 1VQN Q; 1RLP C; 4MMK A; 2QQA A; 3JB9 G; 2QAS A; 2RN8 A; 1D0Y A; 3PT9 A; 9ATC B; 3EG0 A; 2X51 A; 2HDA A; 3RES A; 4KGV B; 1PD1 A; 1B3Q A; 3AHU A; 1Q82 C; 2EYZ A; 3LGF A; 3OYA A; 2EQM A; 2AIR B; 1U5S A; 1X2Q A; 1QW1 A; 2VVK A; 4EMK B; 1Q82 R; 3PE0 A; 3CCR T; 2LQW A; 2PTK A; 3JAM E; 4IIO A; 5CVI A; 2D0N A; 3F70 A; 1BIB A; 2LCS A; 1VIF A; 3M56 A; 4FYY B; 2RMO A; 2DBK A; 1GL5 A; 2CSQ A; 4E7S A; 5ECA A; 2M0O A; 2KSS A; 2M1H A; 2DZC A; 4BI3 A; 4PFP A; 5GAN f; 3EFO B; 1UEC A; 3VS5 A; 2F2X A; 1C1A A; 1Q81 U; 2FRY A; 1QWE A; 2LCL A; 2BTT A; 3CME T; 4QKU A; 2CZ1 B; 3UA6 A; 4XTV A; 1BCO A; 3GLX A; 4XU1 A; 2HKN A; 3I55 A; 2EFI A; 4IUR A; 4A4E A; 4BE2 A; 2QAZ A; 3GNF B; 1J3T A; 2J05 A; 1Z9Q A; 1M9S A; 4RCC A; 4ELY C; 2GQI A; 3OY9 A; 3QWY A; 4IIM A; 2MI6 A; 2G3R A; 1NJI U; 1K9M U; 1CKA A; 1WLP B; 2DRM A; 2HL3 A; 2ROL A; 2PVD B; 1VQO T; 2BUD A; 1M3C A; 1OPL A; 2PZ1 A; 1X2K A; 2L0A A; 4JRQ A; 3Q1J A; 2FVU A; 2LP5 A; 2KXD A; 3JB9 I; 3G4S Q; 1UE9 A; 2H8H A; 3PMI A; 3X28 B; 3N5B B; 1KG1 A; 4V2S A; 4BI4 A; 2DYB A; 2JZ2 A; 2K57 A; 2X4J A; 2KRM A; 4M78 D; 4M7D E; 1TG0 A; 2EQI A; 2X4Y A; 3UA7 A; 5FWC A; 3RR6 A; 5KYY B; 1D3B B; 4MZP A; 1VQM Q; 1PD0 A; 4J7F A; 1RUW A; 4PJO G; 1MMG A; 1NYG A; 2DIQ A; 4LDV A; 2PNI A; 1GCQ C; 1OEB A; 3RKW A; 4QVD A; 3IQL A; 4M78 F; 2DL7 A; 4DOW A; 1C0M A; 3OB9 A; 4F17 A; 4F16 A; 2YUQ A; 3MEA A; 2QG9 B; 4BE0 A; 3LYI A; 2FZK B; 1ACM B; 4B9X A; 2LC4 A; 1RAE B; 3MEW A; 4E7H A; 3EG9 A; 5L8R E; 1Q86 U; 4XTX A; 1OUL A; 3EFO A; 2QA4 A; 3X20 B; 5A0G A; 1WFW A; 4BY6 B; 3V8L A; 1M30 A; 2VGM A; 4X9D A; 4C8Q A; 2XG8 D; 2HKQ B; 3TQ7 P; 2O2O A; 2MWO A; 2X4W A; 2IG0 A; 2QQR A; 1H64 1; 1G8X A; 4HCC A; 2QYZ A; 3KUF A; 2GCX A; 1WIE A; 3MPU B; 2KYM A; 2MYS A; 3E19 A; 3EG3 A; 4F7U F; 2QGF B; 4RG2 A; 4KH1 B; 1Q7Y U; 4GLM A; 2EYW A; 3L1A A; 1AZE A; 3M53 A; 1M27 C; 2A37 A; 4M75 B; 2FG0 A; 1YJ9 T; 4FSX A; 5IXF A; 2RQT A; 1R8O B; 1KQS P; 3CCU T; 3CCE T; 1U1S A; 5GAO q; 2MOX A; 1YIJ Q; 2DX1 A; 2JUF A; 5HKC A; 3I55 Q; 2YRV A; 2VWF A; 3H41 A; 4PFO A; 1NG2 A; 3GOX A; 1GFC A; 1U3O A; 5CKB A; 2L8D A; 2XK0 A; 2KMT A; 5IHK A; 2EKO A; 2OX7 A; 4C0Z A; 2IVW A; 5DY9 A; 2W10 A; 3A8H B; 8ATC B; 1YI2 A; 2EGA A; 4HT8 A; 3OYM A; 4M7A B; 2C0I A; 3VU3 C; 2C0T A; 2DXT A; 3A98 A; 1M2V B; 1D3B A; 2CP2 A; 4J9H A; 1TUD A; 1WHJ A; 3NTI A; 1RAG B; 4RTU A; 1YJW A; 2YDL A; 3JCM J; 4IUU A; 4Z89 A; 3OYL A; 1K8A U; 2YLB A; 2VXE A; 1D0X A; 3OYC A; 4M78 C; 1RAH B; 4WCI A; 4JJN K; 1VQK A; 2OTL Q; 4OP0 A; 1M1K U; 3EGU A; 3X24 B; 4LE9 A; 3CC4 T; 2ECZ A; 1I81 A; 4OMM A; 3JB9 D; 2E10 A; 1OX9 A; 4KT0 E; 3RKY A; 5GAM f; 2D9T A; 2NUZ A; 2K79 A; 4M77 G; 3CC2 A; 5DM7 R; 2OTJ A; 4XU0 A; 3CPW A; 4IUV A; 3CPW S; 1VQ4 A; 1AZG B; 1RAI B; 1TH7 A; 3NFC A; 1X6B A; 2DJQ A; 1B34 B; 3QPH A; 2O01 E; 1Q95 G; 1OYX A; 1KC8 R; 5GAN 4; 2RNA A; 1MMN A; 3I9Q A; 1K73 U; 3DKM A; 2D8H A; 4J6X A; 4BD3 A; 4PJO E; 1AEY A; 1TS9 A; 2K5F A; 4E6R A; 1FMV A; 3QUI A; 1JO8 A; 2GFU A; 1D1B A; 2LRQ A; 4MML A; 3OYH A; 4KBM B; 2LJ3 A; 2RHX A; 1VQ7 Q; 2I0N A; 3VV0 A; 2CKK A; 4CI0 C; 1U8R A; 3VUZ A; 4A54 A; 1ARK A; 6AT1 B; 2MPX C; 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