The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
73
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structure length |
73
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Chain Sequence |
SMDSRTKSKDYCKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVTLINKDCIDVGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLPPDFEKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the Sh3-C domain of Cin85
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
SH3 domain-containing kinase-binding protein 1
|
| total genus |
7
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| structure length |
73
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| sequence length |
73
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-10-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VYT A; 2LJ3 A; 1K0X A; 2E5K A; 2QDL A; 2DA9 A; 2KYB A; 4RTY A; 1WX6 A; 2AK5 A; 2AZS A; 1SHG A; 1TG0 A; 2J6O A; 3IQL A; 1KJW A; 2DRM A; 1PNJ A; 2DNU A; 1H3H A; 1WXT A; 1AOJ A; 4IIO A; 4Y92 A; 1RLQ C; 2JTE A; 2P4R A; 4AFU C; 1ABQ A; 2ROL A; 2DL4 A; 2ENM A; 5IHI A; 3EG0 A; 1JU5 C; 2RQR A; 4E6R A; 2A37 A; 4RTZ A; 2RNA A; 4M4Z A; 1OEB A; 2ECZ A; 1SPK A; 3FJ5 A; 3THK A; 2CDT A; 3EHQ A; 2LJ0 A; 3KFV A; 1ABO A; 1OPK A; 2EW3 A; 1UTI A; 1FMK A; 1H92 A; 1JO8 A; 2BZY A; 4J9E A; 1WIE A; 4A63 B; 2D8J A; 1WI7 A; 4D8D A; 1UGV A; 2D0N A; 2ESW A; 4LN2 A; 3VS6 A; 2IIM A; 2SEM A; 1YWO A; 1PKT A; 2AKK A; 4QT7 A; 2X3W D; 2CH4 A; 2LZ6 B; 1I0C A; 3H41 A; 1Z9Z A; 3ZL7 C; 4JJB A; 2EGC A; 2NWM A; 1K9A A; 1AD5 A; 2ED1 A; 3CQT A; 3UF4 A; 4J9C A; 1UHF A; 3QWX X; 1YWP A; 4DEX A; 3O5Z A; 3TSW A; 1GCP A; 3NMZ C; 1X6B A; 1AEY A; 2DL5 A; 1BB9 A; 1SRM A; 1GCQ A; 1T0J A; 2L3P A; 3I9Q A; 3EHR A; 1U5S A; 1KSW A; 2KRO A; 5FW9 A; 2I0N A; 2D8H A; 1KIK A; 3ULR B; 1UEC A; 4AFQ C; 3VS3 A; 1GRI A; 2CH4 W; 1OV3 A; 2ED0 A; 4J9B A; 5IHN A; 2HCK A; 2KGT A; 4KRT A; 3M0T A; 1M3C A; 1UFF A; 2JM9 A; 2L3S A; 2C0O A; 2FEI A; 1UJ0 A; 1WXB A; 1QWF A; 1ZSG A; 2W0Z A; 2LQN A; 2DBK A; 3PE0 A; 3JV3 A; 3REB B; 3I5R A; 1W6X A; 1OOT A; 4J9F A; 3VS1 A; 4ESR A; 1Y0M A; 2OAW A; 2X3X D; 4OMM A; 2LQW A; 1VA7 A; 4OMP A; 3EG3 A; 4AFS C; 1M8M A; 1MUZ A; 1RUW A; 4CC4 B; 5L23 A; 1MV0 B; 2ABL A; 5IHK A; 2A28 A; 3REA B; 1OPL A; 2KR3 A; 1AVZ C; 2DBM A; 2MIO A; 4RTX A; 1UE9 A; 1V1C A; 2KBT A; 2A08 A; 2K6D A; 4OMO A; 1AWO A; 1AWJ A; 1VYV A; 1SEM A; 5FWB A; 4CC3 A; 2GNC A; 3M0R A; 1RLP C; 1YP5 A; 1AZE A; 4ORZ A; 1Z9Q A; 4EIK A; 2LNH B; 2LP5 A; 5GJV B; 1HJD A; 3M0P A; 1QKX A; 2EYZ A; 1AWX A; 4RTV A; 3M0Q A; 2EYY A; 1K1Z A; 1TUC A; 1UG1 A; 4J9D A; 1X2Q A; 3GBQ A; 2DRK A; 1ZUU A; 4LNP A; 2K3B A; 2DE0 X; 1GFC A; 1X27 A; 1BK2 A; 1JQQ A; 1JEG A; 1CKB A; 1NYG A; 3SHW A; 1BBZ A; 3PVQ A; 2RN8 A; 3VS4 A; 1K4U S; 2JM8 A; 4HVV A; 1NLO C; 1QWE A; 1K0S A; 2C0I A; 2EGA A; 2RQW A; 2CUB A; 2KNB B; 2DX1 A; 4J9I A; 4F17 A; 2KT8 A; 1GBR A; 2EPD A; 1GCQ C; 4JJD A; 2DYB A; 3I5S A; 3UA7 A; 2J6K A; 1U3O A; 2BZ8 A; 4F14 A; 1I07 A; 1X43 A; 1ZUK A; 4HCK A; 4D8K A; 2H8H A; 1A0N B; 1PWT A; 4OML A; 1BU1 A; 1XOV A; 2KRS A; 1ZLM A; 1E6H A; 2LX7 A; 5ECA A; 1B07 A; 2MOX A; 3H0H A; 4GLM A; 2L3Q A; 3C0C A; 4X1V A; 2YSQ A; 1MV3 A; 5I11 A; 5FWC A; 4AFZ C; 2PTK A; 1LCK A; 3VRY A; 1T3S A; 3H0F A; 2GQI A; 2V1Q A; 2HEQ A; 2RQU A; 2EBP A; 2K7A A; 1SSH A; 4JZ3 A; 1AWW A; 1QKW A; 2HDA A; 2KXC A; 4IIM A; 1WLP B; 2DVJ A; 2YUQ A; 2G6F X; 2FO0 A; 2L0A A; 2A36 A; 2LMJ A; 3EGU A; 1IO6 A; 1WFW A; 2CSQ A; 1WDX A; 2O9V A; 3EG2 A; 4FSS A; 1T3L A; 2KT1 A; 1HSQ A; 2DF6 A; 2CSI A; 1YN8 A; 3TSZ A; 1ZX6 A; 1FYN A; 2FPE A; 2FRY A; 4RTU A; 2VWF A; 1NEG A; 1PRM C; 1WA7 A; 2EKH A; 1ZBJ A; 5HCK A; 5I22 A; 3QWY A; 4OMN A; 1M3B A; 2DLP A; 4R0K A; 2F2W A; 3M0U A; 2RPN A; 5IH2 A; 3UAT A; 1X69 A; 1CSK A; 2DM1 A; 2F2V A; 2W10 A; 4AG1 C; 4JZ4 A; 3PVL A; 3LH5 A; 1S1N A; 2EGE A; 1JXO A; 1JXM A; 2VKN A; 3I35 A; 2GTJ A; 4LUD A; 1T0H A; 2CRE A; 1ARK A; 2JS2 A; 2FPF A; 1PKS A; 1GBQ A; 2YUP A; 2YUO A; 2JMA A; 2VVK A; 2FRW A; 1G2B A; 3R6N A; 1H8K A; 2ROT A; 3RNJ A; 4J9H A; 2AKL A; 3RBB B; 2NUZ A; 1J3T A; 1SRL A; 2M51 A; 2FG0 A; 2JS0 A; 2DL7 A; 2LJ1 A; 2DJQ A; 2OI3 A; 2YDL A; 2AZV A; 1M27 C; 2EVR A; 3NGP A; 1W70 A; 1NG2 A; 1B3Q A; 3TVT A; 4RTT A; 1G83 A; 4F16 A; 1UHC A; 4OMQ A; 2GTO A; 4LUE A; 3SEM A; 4HVW A; 2GGR A; 1M30 A; 2K79 A; 2RMO A; 2RF0 A; 1QCF A; 2JW4 A; 2EQI A; 5GJW B; 1TUD A; 1I1J A; 4CC2 A; 1VYU A; 1M3A A; 2DIL A; 1UJY A; 3VS5 A; 2J05 A; 2KRM A; 2DL8 A; 2K9G A; 1NEB A; 2BTT A; 2DL3 A; 1YNZ A; 1QLY A; 1U06 A; 1CKA A; 2V1R A; 2BZX A; 3EG1 A; 2GBQ A; 1UDL A; 2RQT A; 4Z8A A; 2D1X A; 1YCS B; 1Y57 A; 2L2P A; 1AZG B; 3VS0 A; 2KYM A; 4HVU A; 5IXF A; 2O31 A; 4ZNX A; 2LCS A; 2J06 A; 1RI9 A; 2B86 A; 2HBW A; 3NPF A; 2J6F A; 2KRN A; 1UUE A; 2F2X A; 4AG2 C; 3H0I A; 2O88 A; 1NM7 A; 2YT6 A; 2HSP A; 2PZ1 A; 1ZUY A; 4Z89 A; 1GFD A; 1K76 A; 2C0T A; 1X6G A; 2O9S A; 1E7O A; 4GBQ A; 3U23 A; 1SHF A; 2JMC A; 3UA6 A; 1KFZ A; 2JXB A; 4HXJ A; 2DMO A; 4JJC A; 2FPD A; 3VS2 A; 2CT4 A; 2SRC A; 1GL5 A; 2J7I A; 4Z88 A; 1EFN A; 4J9G A; 4WCI A; 1NLP C; 1WXU A; 3VS7 A; 4DEY A; 2EYX A; 2EYW A; 1E6G A; 3A98 A; 1WYX A; 2PNI A; 4CC7 A; 2KE9 A; 2KXD A; 4LE9 A; 2YUN A; 2JT4 A; 1W1F A; 2CUD A; 2RQV A; 1N5Z A; 1HD3 A; 4RUG A; 4JPB W; 1X2K A; 3M0S A; 1PHT A; 4RTW A; 3VRZ A; 2CT3 A; 2K2M A; 2KEA A; 1NYF A; 2M0Y A; 2O2O A; 2OJ2 A; 3NHN A; 1PRL C; 2MCN A; 4K11 A; 5EC7 A; 5IXB A; 2XMF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VYT A; 2ZPE B; 2QDL A; 2KYB A; 2ZCF B; 4M78 A; 4M7A E; 1MMA A; 1JRI A; 2KY9 A; 4BE2 A; 1YJW A; 2XHC A; 2DRM A; 1PNJ A; 3I55 A; 4F7U G; 3P8D A; 5FRM A; 1AOJ A; 3QUI A; 2NUT B; 1RLQ C; 1QVP A; 2RK2 A; 3CCJ Q; 2HSE B; 3NFC A; 4AFU C; 2OTJ Q; 3CCV Q; 4FW1 A; 5C0M A; 2ENM A; 1R0C B; 5IHI A; 1JU5 C; 2RQR A; 2EQU A; 2QK0 A; 3M5A A; 3RKY A; 4E6R A; 3I56 T; 2A37 A; 2QTV A; 3BY7 A; 3QXE B; 1OEB A; 2XU8 A; 1YJW T; 4E7I A; 3RUX A; 2CDT A; 3LLR A; 2D9T A; 3CCL Q; 1OPK A; 1WGS A; 2E6Z A; 3CME T; 1JO8 A; 1WIE A; 4MDW A; 2MK5 A; 1DJ7 B; 4PJN A; 4D8D A; 2YXY A; 2OTL Q; 4GLK A; 4BY6 C; 2ESW A; 1YIJ Q; 5CIU A; 3JCM W; 3VV0 A; 4IUP A; 1LJO A; 1UGQ B; 2SEM A; 1G5V A; 3QZ9 B; 2X3W D; 3RKW A; 1KK7 A; 1Z9Z A; 4JJB A; 2EGC A; 3HTR A; 3SWN B; 3UF4 A; 5GAN g; 4J9C A; 1UHF A; 1QCN A; 1LOJ A; 2E4H A; 2MPX C; 1JJ2 S; 4DOV A; 1R0B G; 3SWN A; 4FSX A; 2HQH A; 4TVR A; 1AEY A; 4JLG A; 2RJF A; 1BB9 A; 1SRM A; 2L3P A; 2KRO A; 4LXC A; 2I0N A; 4L59 A; 3QJ6 A; 3ULR B; 4RCC A; 2DIQ A; 5HK0 A; 2RHZ A; 2H3E B; 4J9B A; 2HL3 A; 1W2B P; 4KH1 B; 1YBY A; 5IHN A; 2HCK A; 2KGT A; 5FU7 C; 2G3R A; 1WHG A; 1VQK A; 2K2V A; 1M3C A; 2FEI A; 1ZSG A; 4MDX A; 2GQV A; 2LQN A; 5GAN 8; 1YIT T; 2PQW A; 3I5R A; 3A8L B; 1VQK T; 4C8Q C; 2EQJ A; 1AHJ B; 4HKE A; 2V26 A; 1Q86 C; 3NTK A; 3MO8 A; 5HY6 A; 4JRI A; 1K73 R; 3CD6 A; 3JCM c; 1TXQ A; 1QVF A; 1M8M A; 1Q82 C; 3HHT B; 2BUD A; 2A28 A; 1OPL A; 2ZZD A; 5KYU A; 5CR2 A; 2DBM A; 2MIO A; 4RTX A; 2V8J A; 3JCM X; 2QQS A; 2XDD A; 3CD6 Q; 4IUU A; 3QII A; 1M90 C; 2V8K A; 1VYV A; 4CC3 A; 3M0R A; 2JJ9 A; 5KCO A; 1YP5 A; 4ORZ A; 2DXU A; 1Z9Q A; 3KUF A; 2LP5 A; 4IUQ A; 3EAE A; 1VQN T; 1X6O A; 3QYG B; 4JRQ A; 3M0P A; 4LDU A; 4EDU A; 2OTL A; 2GCX A; 3OMG A; 2PVD B; 1AWX A; 1U1T A; 3HP9 A; 1NE8 A; 1UG1 A; 5KE2 A; 3SD4 A; 4J9D A; 2E12 A; 3OYB A; 3G71 T; 4LDV A; 3GBQ A; 3CCQ Q; 4LNP A; 2JZ2 A; 3L2W A; 3I56 A; 4FYW B; 3SHW A; 5LJ5 g; 1BBZ A; 1OU8 A; 4NOY A; 1NLO C; 1Y7X A; 2I2L A; 1QWE A; 1IHV A; 1KQS P; 4M77 A; 4M77 E; 4X34 A; 3UWN A; 5KYX A; 4C8Q F; 1Y96 B; 5I2S A; 2KNB B; 4Z02 A; 4J9I A; 4R56 A; 1GCQ C; 2L89 A; 4ZN3 A; 4C0D C; 5CQY A; 1WPY A; 3E1S A; 3CCU T; 2BZ8 A; 5GAO n; 3CPW S; 4A4H A; 1KG1 A; 4X9C A; 2QDY B; 4BE1 A; 1XOV A; 2KRS A; 2XIC A; 2O4X A; 4C5H A; 5ECA A; 2MOX A; 3M9Q A; 2RA2 A; 2PTK A; 9ATC B; 2ZAE A; 3VRY A; 4V2S A; 5FU6 B; 2FYK A; 2GQI A; 3VKI A; 3G71 A; 2HEQ A; 2RQU A; 2MWP A; 2M16 A; 2WSE E; 1SSH A; 3JRZ A; 2LVM A; 1UGR B; 4PJO G; 5GAM f; 4M7D C; 2FHD A; 3OYD A; 2IG0 A; 3EGX A; 2DAQ A; 2L3R A; 5GAO m; 3QKJ A; 2FO0 A; 2A36 A; 2LMJ A; 3EGU A; 4O5V A; 2C06 A; 3MKD A; 2O9V A; 1M2V A; 1T3L A; 1D0Y A; 2RHI A; 4OP0 A; 1ACM B; 2EKO A; 1D1C A; 5CKB A; 3OY9 A; 1ZX6 A; 2FRY A; 4N4H A; 2KQW A; 1PRM C; 1WHL A; 1B34 A; 1M1K C; 4ZGE B; 4PJO A; 1ZBJ A; 5A0L A; 3DB4 A; 1KC8 U; 4IUT A; 4BE0 A; 3MEV A; 4OMN A; 1M3B A; 2F2W A; 4BD3 A; 5IH2 A; 1MND A; 3G1J A; 3UAT A; 2M0O A; 1X69 A; 2K5I A; 4M78 C; 2JVV A; 3OYA A; 2FZC B; 5D6X A; 4KUL A; 4JZ4 A; 3C4S A; 4OMF B; 3LH5 A; 5LJ3 e; 3GF5 A; 4LUD A; 3I55 Q; 2LQ8 A; 4PFZ A; 1VQL A; 1PKS A; 3MEW A; 1VQ5 T; 4L6V 5; 3FLG A; 3V8K A; 1ZA2 B; 1PD0 A; 5J3B A; 2YUO A; 4J7F A; 1J3T A; 1PCX A; 4C0F A; 1SRL A; 2M51 A; 5LL6 S; 4PKC C; 3CXC A; 4AMC A; 1GXI E; 1SG5 A; 2EVR A; 3VU3 C; 4FYV B; 1W70 A; 1B3Q A; 1G83 A; 2L5Q A; 1UHC A; 4IUR A; 5KYU B; 2QQA A; 1B34 B; 4LUE A; 3BW1 A; 5CKF A; 1YIT A; 2A3L A; 1WJS A; 5KCH A; 3H9N A; 2JW4 A; 2AIR B; 3AHU A; 4CC2 A; 2NUP A; 1PC0 A; 3WVE B; 1UJY A; 3VS5 A; 1N9R A; 2BTT A; 4M75 E; 4GY5 A; 3CCE A; 2LRQ A; 3EH2 A; 2V1R A; 1TUG B; 1VUB A; 2WAC A; 1VQ9 A; 4HCZ A; 4PJM A; 2O31 A; 2DER A; 3EH1 A; 1G3W A; 4OB3 B; 2DK3 A; 4XTY A; 4AG2 C; 3OA6 A; 2YT6 A; 4M7A G; 1EZZ B; 4HCB A; 2C0T A; 3OSS C; 1YJN Q; 1M2V B; 1EIF A; 4VUB A; 5GAM h; 2DD4 A; 1Q95 G; 3U23 A; 2K5L A; 3ZEH A; 8ATC B; 1SHF A; 2JMC A; 2JXB A; 4JDS A; 4HXJ A; 2QEX Q; 3VS2 A; 3JB9 H; 2CT4 A; 2SRC A; 1NZ9 A; 2J7I A; 3CME A; 3M58 A; 2DZ9 A; 5FU6 C; 2FZG B; 4J9G A; 1VQ8 Q; 2KMT A; 4WCI A; 1BI3 A; 1K9M U; 1NLP C; 3VS7 A; 1RI0 A; 3HPW A; 3CCR A; 5J39 A; 4ELZ C; 3TQ7 P; 2LT1 A; 1FMV A; 1SF9 A; 6AT1 B; 1HD3 A; 3M56 A; 4JPB W; 1X2K A; 3CCE T; 2E10 A; 2CT3 A; 1ZHI A; 4PLI A; 2QA4 A; 3CCM T; 3O8V A; 3RR6 A; 4M75 F; 3MP1 A; 2F5T X; 1VIF A; 3MET A; 5C6S A; 4PJJ A; 5GMK l; 4RTY A; 2AK5 A; 3X26 B; 2E1H A; 4M75 B; 1SHG A; 3CCQ A; 1TG0 A; 2KK4 A; 1KJW A; 3JCM J; 1C6V X; 1H3H A; 1M4Z A; 4A4F A; 3OYK A; 2YRV A; 3KXT A; 3CC2 T; 3BDU A; 1PG5 B; 3MHX A; 3DLM A; 1IXD A; 4C92 G; 1H64 1; 2K5F A; 3M4G A; 3MEA A; 3DKM A; 3EG0 A; 4DQ2 A; 4XU3 A; 1SPK A; 3GLX A; 2RHY A; 3RER A; 2KI7 A; 3KFV A; 1ABO A; 5M9O A; 1UTI A; 2BZY A; 3OBY A; 1UB4 A; 2D8J A; 1TH7 A; 3RMQ A; 1WZO A; 1VQO T; 3VS6 A; 2IIM A; 4BDZ A; 2X9H A; 1YWO A; 4OF1 A; 4QT7 A; 1FMW A; 2LZ6 B; 5I21 A; 2V8I A; 1I0C A; 3ZL7 C; 3NTI A; 5LJ3 j; 1VQP A; 2ED1 A; 2AHJ B; 3NTH A; 1YJ9 Q; 2QAZ A; 3QWX X; 2RB6 A; 3O5Z A; 1Q7Y R; 1IRE B; 1G3Y A; 1ZSZ A; 3NMZ C; 1X6B A; 5J26 A; 2DL5 A; 1M1G A; 5CAI A; 1N27 A; 4FT4 A; 1BIA A; 1KSW A; 5DM7 R; 5FW9 A; 4RCB A; 2D8H A; 4M75 C; 1KIK A; 1UEC A; 3VS3 A; 4F04 B; 3EGD A; 2CH4 W; 2ED0 A; 2F1L A; 4OGE A; 3QDR B; 4RG8 A; 3CCV T; 3CBP A; 1UFF A; 1WXB A; 2W0Z A; 2DBK A; 2CZ6 B; 3JV3 A; 3REB B; 2XI9 A; 1FWZ A; 2QAS A; 1W6X A; 2XDP A; 2COZ A; 1OOT A; 4J9F A; 2YRC A; 1XQH A; 3CME Q; 4ESR A; 1QQJ A; 1TTH B; 4J8O A; 4QVZ A; 3V7S A; 1IB8 A; 1VA7 A; 4KUI A; 4Y28 E; 5FRO A; 3G6E Q; 1S72 A; 4OMP A; 1YIJ T; 2XD0 A; 2XK0 A; 2E41 A; 3E9G A; 2E64 A; 3RMS A; 5IHK A; 3INZ A; 2QTX A; 1D1B A; 2Y4X A; 4XK8 E; 1AVZ C; 1UE9 A; 1V1C A; 4B9W A; 3OYI A; 2A08 A; 4E2F B; 3PFS A; 1AWJ A; 1M8V A; 4BY6 B; 2GNC A; 1QP3 A; 4NL3 A; 4DA4 A; 4PJO F; 5GJV B; 1SSF A; 4C0Z A; 2NUT A; 3CCJ A; 1VQ4 T; 1KQS S; 1HJD A; 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