The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
73
|
structure length |
73
|
Chain Sequence |
SMDSRTKSKDYCKVIFPYEAQNDDELTIKEGDIVTLINKDCIDVGWWEGELNGRRGVFPDNFVKLLPPDFEKE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the Sh3-C domain of Cin85
rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
SH3 domain-containing kinase-binding protein 1
|
| total genus |
7
|
| structure length |
73
|
| sequence length |
73
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-10-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GCP A; 3QWY A; 4K11 A; 1CKB A; 3CQT A; 2GNC A; 4LE9 A; 4IIM A; 2BTT A; 3NHN A; 2MIO A; 2DBM A; 1X43 A; 2DM1 A; 2EPD A; 1CKA A; 1OPL A; 2AKL A; 2J6F A; 2LQW A; 2VWF A; 4AFU C; 1Z9Z A; 1CSK A; 3NPF A; 3EG2 A; 2YT6 A; 2RPN A; 2O9V A; 2DA9 A; 1X69 A; 5IHN A; 4J9E A; 1T3S A; 4Y92 A; 2KXC A; 1AD5 A; 2JM9 A; 1N5Z A; 4HVV A; 4JPB W; 5IXF A; 4F14 A; 1MV0 B; 4M4Z A; 2CH4 A; 2JS2 A; 4HVU A; 1NLP C; 1NM7 A; 1PKT A; 2DNU A; 4LUE A; 2YUN A; 1GCQ C; 3I9Q A; 4QT7 A; 4RTU A; 3PVL A; 2LQN A; 2YDL A; 2A36 A; 4J9D A; 2DJQ A; 1K0X A; 1BBZ A; 2JMC A; 2DL3 A; 1XOV A; 2HEQ A; 1A0N B; 2M51 A; 1VYV A; 4OMQ A; 2X3W D; 2J6O A; 1B3Q A; 1FMK A; 1M8M A; 1GFC A; 1ARK A; 2HDA A; 1WIE A; 4JJC A; 1W1F A; 2ED0 A; 1GBR A; 2RQR A; 4RTZ A; 1U5S A; 1SHF A; 1WDX A; 2JTE A; 1U06 A; 1UEC A; 2LJ1 A; 1LCK A; 2W10 A; 5FWC A; 2K7A A; 1I1J A; 1WLP B; 3RBB B; 1X2K A; 1PNJ A; 1TUD A; 4RUG A; 1ZUK A; 2CH4 W; 2EYZ A; 1B07 A; 2PZ1 A; 3VS6 A; 2AZV A; 2HCK A; 1M3C A; 3VS4 A; 2M0Y A; 4WCI A; 4CC2 A; 4LN2 A; 3RNJ A; 2BZY A; 2ROL A; 3VS3 A; 3H0H A; 4CC4 B; 2DLP A; 4EIK A; 1UJY A; 2OJ2 A; 4AFQ C; 1KIK A; 1PWT A; 1MV3 A; 1M30 A; 1Y0M A; 1HJD A; 4JZ4 A; 1UG1 A; 1UHF A; 1KFZ A; 2RQU A; 2LZ6 B; 2LJ3 A; 3H41 A; 1KJW A; 3VS7 A; 2KRN A; 1X6B A; 5GJW B; 2FPE A; 2BZ8 A; 5IHK A; 2J05 A; 2KNB B; 2KEA A; 1ZX6 A; 1QKW A; 1PRM C; 2LJ0 A; 2D0N A; 2O31 A; 4GBQ A; 2F2W A; 4J9F A; 2HSP A; 1SRM A; 1AVZ C; 1WXU A; 1H8K A; 2L3S A; 2EYW A; 3ULR B; 1UTI A; 2FPD A; 2G6F X; 4GLM A; 2RQV A; 1YNZ A; 2DL4 A; 2GGR A; 3SHW A; 2J6K A; 1GL5 A; 3QWX X; 1M3A A; 3UA7 A; 2GQI A; 3M0U A; 3UAT A; 3FJ5 A; 1ZLM A; 1QCF A; 2CUB A; 5EC7 A; 1GCQ A; 2KYB A; 1X2Q A; 1K1Z A; 2DX1 A; 1QWF A; 2L3P A; 2A37 A; 3KFV A; 1MUZ A; 2CUD A; 1QWE A; 2DE0 X; 2FRW A; 2LX7 A; 2YSQ A; 3H0I A; 3VS0 A; 3M0S A; 2LMJ A; 2L0A A; 1NEB A; 2RQW A; 1SRL A; 2RN8 A; 1VYT A; 2FO0 A; 5IH2 A; 4LUD A; 4D8K A; 2K9G A; 1GBQ A; 2KE9 A; 2CDT A; 2C0T A; 4J9C A; 2GTJ A; 2W0Z A; 4IIO A; 4A63 B; 3THK A; 2LNH B; 1Z9Q A; 1EFN A; 4ZNX A; 2K79 A; 2DMO A; 2O2O A; 2V1Q A; 5ECA A; 2ESW A; 2FG0 A; 2F2X A; 1AZE A; 4F16 A; 1UDL A; 2AZS A; 1K76 A; 3PVQ A; 1W6X A; 2JS0 A; 2KXD A; 1H92 A; 4D8D A; 1AZG B; 1G83 A; 1M3B A; 2RNA A; 4Z88 A; 1FYN A; 1ZUU A; 3M0Q A; 1TUC A; 2SEM A; 1YP5 A; 1S1N A; 2OAW A; 1GFD A; 3TSW A; 2LP5 A; 5I22 A; 2KRS A; 3REA B; 1AWX A; 4JJB A; 1AOJ A; 2KBT A; 1KSW A; 1YN8 A; 4HVW A; 2JMA A; 1WFW A; 2YUP A; 2PNI A; 2YUO A; 2KYM A; 1AWJ A; 3VS1 A; 1T0J A; 1WA7 A; 1ZSG A; 2DYB A; 4RTW A; 1JEG A; 1E7O A; 1PRL C; 2FPF A; 3PE0 A; 1UUE A; 2KT1 A; 2HBW A; 4F17 A; 2CSI A; 2C0I A; 2EVR A; 2DVJ A; 1K4U S; 5I11 A; 2DL5 A; 4X1V A; 4AG2 C; 3C0C A; 2GBQ A; 5FWB A; 2V1R A; 2PTK A; 1ZUY A; 3VS5 A; 3TVT A; 2RF0 A; 4OMO A; 4DEX A; 4OMM A; 2A08 A; 2EBP A; 2NWM A; 4AG1 C; 1I0C A; 1HD3 A; 2CSQ A; 3EG0 A; 3UA6 A; 2DL8 A; 1UHC A; 1UJ0 A; 1NYF A; 2DRK A; 2QDL A; 1YWP A; 1JXM A; 1E6H A; 2C0O A; 1SPK A; 2JW4 A; 3REB B; 2O88 A; 2E5K A; 1WXT A; 4OMN A; 1AWO A; 3VS2 A; 3UF4 A; 5IXB A; 1NEG A; 4RTT A; 4ORZ A; 5FW9 A; 2VKN A; 2I0N A; 1QKX A; 1VYU A; 1RLP C; 1AEY A; 1K9A A; 1OEB A; 1U3O A; 1WX6 A; 3NGP A; 3JV3 A; 4CC7 A; 2CRE A; 1OOT A; 2FRY A; 1H3H A; 1RI9 A; 4HXJ A; 2KGT A; 3EHR A; 4FSS A; 4RTX A; 2XMF A; 2KRO A; 4RTV A; 3LH5 A; 3VRY A; 4E6R A; 1ABO A; 1K0S A; 2P4R A; 2OI3 A; 2MOX A; 3H0F A; 4AFZ C; 1T3L A; 3I5S A; 1E6G A; 1I07 A; 3IQL A; 3R6N A; 1AWW A; 2GTO A; 4OMP A; 1RUW A; 2NUZ A; 1WI7 A; 1JO8 A; 2K6D A; 1SHG A; 2DBK A; 4OML A; 2EGA A; 1BU1 A; 1IO6 A; 2EYX A; 2JT4 A; 2RMO A; 3M0T A; 4HCK A; 2DIL A; 4KRT A; 5L23 A; 3NMZ C; 1JQQ A; 2A28 A; 3U23 A; 2EGE A; 4ESR A; 1OV3 A; 2EQI A; 4Z89 A; 1ZBJ A; 2J06 A; 3A98 A; 1WYX A; 1V1C A; 2EKH A; 1JU5 C; 2EW3 A; 2LCS A; 2KRM A; 2VVK A; 1J3T A; 3O5Z A; 1TG0 A; 3M0P A; 1UE9 A; 1W70 A; 2ENM A; 2CT3 A; 1Y57 A; 2O9S A; 3M0R A; 1ABQ A; 2KT8 A; 2EGC A; 2YUQ A; 2JXB A; 4RTY A; 2SRC A; 1RLQ C; 4LNP A; 2DL7 A; 1G2B A; 2EYY A; 3VRZ A; 4R0K A; 1HSQ A; 1UFF A; 2ECZ A; 1VA7 A; 4J9I A; 4DEY A; 2KR3 A; 1OPK A; 1X27 A; 2X3X D; 3ZL7 C; 1GRI A; 2ED1 A; 3TSZ A; 1NLO C; 1M27 C; 1YCS B; 1X6G A; 2BZX A; 2DRM A; 2D1X A; 2MCN A; 2IIM A; 2K2M A; 2RQT A; 2D8J A; 1T0H A; 2ABL A; 5IHI A; 1NG2 A; 2JM8 A; 2ROT A; 2J7I A; 2L3Q A; 4Z8A A; 4CC3 A; 1UGV A; 1WXB A; 1PHT A; 3I5R A; 4JZ3 A; 3EG3 A; 1QLY A; 1SEM A; 3GBQ A; 1NYG A; 4J9G A; 4J9B A; 4J9H A; 1YWO A; 3EG1 A; 1BK2 A; 2AK5 A; 2B86 A; 1SSH A; 1BB9 A; 2K3B A; 4JJD A; 2DF6 A; 2CT4 A; 5HCK A; 3EHQ A; 2FEI A; 4AFS C; 2F2V A; 2H8H A; 2AKK A; 3EGU A; 2D8H A; 2L2P A; 5GJV B; 3SEM A; 3I35 A; 1JXO A; 1PKS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1OI1 A; 3JCM g; 1CKB A; 2GNC A; 3PT9 A; 4M75 F; 2BTT A; 2MIO A; 2VAS A; 2MMP A; 3C4S A; 1Q82 C; 1BI2 A; 1CKA A; 1JJ2 P; 1OPL A; 1B34 B; 1VQP A; 4AFU C; 2PVD B; 1YI2 Q; 3PTA A; 2YT6 A; 2RPN A; 3GP8 A; 2DA9 A; 5IHN A; 1N27 A; 3J80 E; 3CPW S; 1OUL A; 1B7T A; 4JS4 A; 4BD3 A; 1AD5 A; 1N5Z A; 4HVV A; 4MZP A; 2DYI A; 1M1G A; 1MV0 B; 2JS2 A; 1VQ7 Q; 2OX7 A; 2NUP B; 2DNU A; 4M75 E; 3GLX A; 1GCQ C; 3I9Q A; 1VIF A; 4RKU E; 2K3Y A; 4E2F B; 3CBM A; 2CP3 A; 2JMC A; 8ATC B; 1XOV A; 1VYV A; 1QVF P; 2X3W D; 1WIE A; 4JJC A; 1W1F A; 1GBR A; 3JB9 I; 1KK7 A; 1U06 A; 5KE3 A; 3QYG B; 1TUG B; 1WHH A; 3FIF A; 1KD1 R; 1OYX A; 4Q5W A; 2RA2 A; 3BDU A; 2O01 E; 1VQO T; 4PJM A; 3CCR T; 5AYF A; 2RHY A; 5A2Q E; 3MEA A; 3VS6 A; 2HCK A; 3I55 A; 1Q81 C; 1VQ5 A; 3VS4 A; 1B34 A; 5GAM g; 4CC2 A; 3RNJ A; 4QQ6 A; 1LPL A; 2K4Y A; 4CC4 B; 3E9F A; 1UJY A; 2LVM A; 3V7C A; 3RR6 A; 3OSS C; 1Y0M A; 1M30 A; 1HJD A; 4JZ4 A; 2QYZ A; 1UG1 A; 5GAM f; 2ZPE B; 1KFZ A; 3QG1 A; 3VUB A; 3CCJ T; 1KJW A; 2QA4 T; 2NUP A; 2B8A A; 3VS7 A; 2KRN A; 3RIR A; 1KC8 C; 2HQE A; 2J05 A; 4E7Z A; 3SWN B; 3JCM V; 2KMT A; 3A8M B; 3LWH A; 2M1H A; 4GBQ A; 4J9F A; 4UC4 A; 2V26 A; 2HSP A; 1JB0 E; 4XTV A; 1WXU A; 4J6X A; 4OGC A; 1M90 C; 3A8H B; 3ULR B; 1QVG A; 5KYU B; 3OYY A; 4BI4 A; 4KT0 E; 2IVW A; 3QWX X; 2COZ A; 3UA7 A; 5CR2 A; 3FJ5 A; 1QCF A; 2CUB A; 4P5N A; 1K9M C; 2MF2 A; 4NS5 A; 2XDB A; 3S3M A; 2RJF A; 1MUZ A; 2M0O A; 1EZZ B; 3X24 B; 2YSQ A; 2LX7 A; 2E70 A; 3H0I A; 4FM4 B; 2MWO A; 4C8Q D; 1ZQ1 A; 1NJI U; 1XQH A; 3JB9 F; 1BIA A; 2NUT B; 2V8I A; 1YIJ Q; 1LNX A; 2GQV A; 2CDT A; 5CCA A; 3OYN A; 2EJ9 A; 2HQH A; 1EFN A; 3CCV A; 1UB4 A; 1Q86 C; 1V29 B; 2DMO A; 4MML A; 3SWN A; 2V1Q A; 5ECA A; 2ESW A; 3HRU A; 1WHG A; 3CCM T; 1D1A A; 1OU8 A; 3I56 Q; 4R56 A; 4WF2 A; 3OBY A; 1K76 A; 2PVO B; 3CPW A; 3PVQ A; 5CKE A; 2X9H A; 2AHJ B; 2VXE A; 2KXD A; 4WTO B; 1M3B A; 3CCE A; 3M4G A; 3M0Q A; 4XTU A; 4J7I A; 5GMK h; 1YP5 A; 1QCN A; 3A5Z B; 2GFA A; 1S1N A; 3TSW A; 1VQP T; 1YCY A; 5I22 A; 3REA B; 2DZ9 A; 2XID A; 4LD9 K; 4EMK B; 4EPC A; 1AWX A; 2COY A; 1AOJ A; 4XTY A; 1TOV A; 2HD0 A; 1ZSZ C; 3G4S A; 4C0D B; 3A8G B; 1O9S A; 1OX8 A; 1VQ9 Q; 1IZ6 A; 2FZC B; 1D09 B; 2RM4 A; 2Z0W A; 4O6J A; 3AT1 B; 3FC3 A; 2NUT A; 1ZSG A; 3CC4 A; 3G71 A; 3CCU Q; 2HMA A; 2CP2 A; 2DXU A; 2EQJ A; 2KT1 A; 3GOX A; 2C0I A; 3L1A A; 5EG2 A; 3VKI A; 5A0L A; 2BIV A; 4X1V A; 4IKF A; 3C0C A; 2NLU A; 3CXC P; 3OYI A; 1ZUY A; 3VS5 A; 3TVT A; 4OMO A; 1YHQ A; 1C1A A; 1TXQ A; 2FZK B; 4AG1 C; 2PUO B; 3CME A; 3UA6 A; 4A4K A; 5KYY B; 4XAX B; 1QMC A; 1VQ4 A; 2AIR B; 3QZ5 B; 2C06 A; 4BE0 A; 1WXT A; 4OMN A; 1V76 A; 3VS2 A; 3UF4 A; 4DBF A; 3I55 T; 2I0N A; 4EMK A; 4FT2 A; 1RLP C; 3MEV A; 1PG5 B; 1OOT A; 4QVD A; 4HXJ A; 1NZ9 A; 4J8O A; 5GAO q; 5J26 A; 4BI3 A; 3AHU A; 2R58 A; 4RTX A; 2YWW A; 2R57 A; 2XMF A; 1KHC A; 1Q7Y R; 2P4R A; 2MOX A; 2QI2 A; 3I5S A; 2V8K A; 1MNE A; 3H8Z A; 3EFO B; 2QAZ A; 4RG2 A; 1QVG P; 1WI7 A; 1SHG A; 8AT1 B; 3OS2 A; 2JT4 A; 2RMO A; 2P0P A; 3P8B B; 4HCK A; 4Z02 A; 3O8V A; 4KRT A; 3NMZ C; 2EGE A; 5I2S A; 1VQ8 A; 1FMW A; 1OV3 A; 2EQI A; 4Z89 A; 2J06 A; 3EGD B; 5KYY A; 3RER A; 1D3B B; 4J83 A; 5LJ5 d; 2DD4 A; 2EW3 A; 1D0Z A; 1D1C A; 2XK0 A; 2VVK A; 3G6E A; 1K8A R; 2ZZD A; 3M0P A; 3CD6 A; 4M77 C; 4PLI A; 1Y57 A; 2O9S A; 1HYO A; 3M0R A; 2KT8 A; 2JXB A; 1MMD A; 5DY9 A; 5FRM A; 2SRC A; 3PFS A; 2AT1 B; 1G2B A; 3DB4 A; 3V7S A; 3DLM A; 5CO7 A; 1UFF A; 1HXD A; 3ASK A; 3RUX A; 2FL7 A; 1VQM A; 2OTJ A; 4ZGD B; 1KD1 C; 1ZA2 B; 4AT1 B; 3OYG A; 2KR3 A; 2KI7 A; 4TVR A; 4N0A A; 1KC8 R; 2MAM A; 3URG A; 3CPW P; 2ED1 A; 3TSZ A; 1WQ7 A; 1M27 C; 1YCS B; 1X6G A; 3P8D A; 1YIT Q; 3CCV T; 1VUB A; 4MDX A; 4NL2 A; 3MP8 A; 3EFO A; 4F7U G; 1VQ6 Q; 2ABL A; 4HA8 A; 3MEW A; 1KQS P; 3MET A; 5LJ5 j; 4M77 F; 5GAN 5; 2O4X B; 2K5I A; 2RI3 A; 2MWP A; 3FJP A; 6AT1 B; 1VQN A; 1M90 R; 1BKB A; 2EFI A; 3LGF A; 5GMK i; 4Y28 E; 1N9R A; 3LLR A; 4M78 C; 3M54 A; 1MND A; 3CCE T; 2LTO A; 1SEM A; 4C0Z A; 4C5H A; 1NYG A; 2KDS A; 4J9G A; 4J9B A; 1D3B A; 4M7D C; 1K9M R; 1LJO A; 2E4H A; 4JS5 A; 4JJD A; 1U1S A; 5GAN j; 3HPW A; 5HCK A; 3EHQ A; 3SDZ A; 4AFS C; 5GMK m; 2AKK A; 5GJV B; 4OB2 B; 1I5O B; 4M77 E; 2RI5 A; 1JXO A; 3CCQ Q; 3CC2 A; 4K11 A; 2QGG A; 3T9N A; 1ZA1 B; 2E1H A; 2DBM A; 3CC4 T; 3G71 T; 1Q82 U; 1GXI E; 4M78 F; 3OYL A; 1I5L A; 2LQW A; 1ACM B; 5C0M A; 4A4H A; 1D0X A; 1Q86 R; 3MO8 A; 4M7D F; 2O9V A; 1X69 A; 3X28 B; 4BE1 A; 1VIE A; 3HTR A; 5LJ3 g; 2A7Y A; 4ZGJ B; 5IXF A; 4EDU A; 1YHQ T; 3OYK A; 4M4Z A; 4C92 B; 1YJW A; 2QXF A; 2O4X A; 1NLP C; 4M75 G; 4HT9 A; 5LJ3 f; 1PKT A; 1R77 A; 2XI9 A; 1VQ4 T; 4C8Q B; 4M78 E; 1VQL Q; 2DXC A; 4DBH A; 2DJQ A; 3JCM X; 4M7D E; 2F5T X; 2DK3 A; 4OB1 B; 3CCR Q; 3M58 A; 1FMK A; 1M8M A; 4QKU A; 1I8F A; 4RTZ A; 1SHF A; 4LD6 A; 4C92 G; 4LDX A; 4PFO A; 4J6Y A; 5LJ5 g; 5GAM d; 3EFR A; 2QEX A; 3E2U A; 2K5F A; 1I1J A; 1WLP B; 5GAO l; 3V7R A; 1M2V B; 5GAM h; 5LJ5 f; 4PFZ A; 2CH4 W; 1Q81 U; 2PZ1 A; 4YTL A; 1M3C A; 2ZGW A; 3QJ6 A; 3CPF A; 5A0G A; 2OTL T; 2H3E B; 2KQW A; 5GAN g; 2DTO A; 1MV3 A; 1UHF A; 2QDY B; 2RQU A; 4ZN1 A; 4C92 A; 2LZ6 B; 4XK8 E; 2L5Q A; 3C94 A; 3H41 A; 1VQ8 T; 5GAN f; 4NOY A; 1KC8 U; 1X6B A; 2FPE A; 2BZ8 A; 4PJO C; 3PIO A; 1LOJ A; 1XNI A; 3LGL A; 3G6E T; 1C0M A; 1QKW A; 4ZN3 A; 3EH2 A; 3CD6 T; 4BY6 C; 2O31 A; 4BUG A; 3MHX A; 4C0F A; 4RCC A; 2JTM A; 1H8K A; 1M90 U; 1YI2 A; 2MYS A; 1RAD B; 2L3S A; 1M1F A; 3OMC A; 2XG8 D; 5FRO A; 2YRD A; 2RQV A; 3JCM e; 1WNL A; 2XD0 A; 5D6Y A; 2DL4 A; 1VQM T; 2J6K A; 4PK4 A; 4PJL A; 4PNO A; 3UAT A; 1ZLM A; 1M2V A; 1GCQ A; 3HL8 A; 1K9M U; 1K1Z A; 4PJO F; 2LT4 A; 1KQ2 A; 1BCM A; 2RHU A; 1VQ7 A; 3KFV A; 1U1T A; 3H9N A; 4FU6 A; 2CUD A; 1QWE A; 2LX9 A; 3RES A; 3M0S A; 2LMJ A; 1IRX A; 2L0A A; 2RQW A; 4O5V A; 1SRL A; 3JCM P; 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