The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
62
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structure length |
62
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Chain Sequence |
MDRQGFVPAAYVKKLDSGTGKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Metal binding protein
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| source organism |
Gallus gallus
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| publication title |
Atomic resolution structure of a mutant of the spectrin SH3 domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN
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| total genus |
12
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| structure length |
62
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| sequence length |
62
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-10-18 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1CKB A; 2AZV A; 2LZ6 B; 4RTY A; 1NLP C; 2CSQ A; 1ZUU A; 1WFW A; 1H8K A; 1SHG A; 1AOJ A; 3U23 A; 4IIO A; 2D1X A; 2ESW A; 2L3S A; 2KXD A; 1PWT A; 1GL5 A; 2A37 A; 2J6K A; 4KRT A; 4JZ3 A; 3RNJ A; 2DF6 A; 3FJ5 A; 1K0X A; 1QKX A; 1OV3 A; 1V1C A; 2OI3 A; 2O31 A; 2ED0 A; 1PHT A; 2RN8 A; 3KFV A; 4GLM A; 1YWO A; 4JJB A; 3NMZ C; 1X6G A; 2EQI A; 1UE9 A; 3LH5 A; 2YT6 A; 2CSI A; 3VRZ A; 1RUW A; 4HCK A; 1M3C A; 2E5K A; 4OMN A; 4AG1 C; 1OPL A; 3M0R A; 1WX6 A; 1X6B A; 2A36 A; 1OEB A; 1MV3 A; 2AZS A; 2HEQ A; 1OOT A; 3H0F A; 3I9Q A; 1GFC A; 3PVQ A; 2BZY A; 2EYX A; 3VS0 A; 3C0C A; 2YUQ A; 1Y0M A; 4DEX A; 2LQW A; 2DJQ A; 1TG0 A; 4F14 A; 2KE9 A; 1I0C A; 2EGA A; 1M30 A; 1UDL A; 2ECZ A; 1S1N A; 2C0I A; 4CC4 B; 2KNB B; 2L0A A; 2C0O A; 2NWM A; 1GFD A; 4OMQ A; 1SRM A; 2L3P A; 4AFZ C; 2K3B A; 2SRC A; 3NPF A; 1I07 A; 5FW9 A; 2G6F X; 3NGP A; 2JS0 A; 4RTV A; 1T3S A; 2CUD A; 2GNC A; 2EYZ A; 2KR3 A; 1U3O A; 1TUD A; 2L3Q A; 2D8J A; 1CSK A; 4LNP A; 4RTT A; 1M3B A; 2FPF A; 1TUC A; 5IXF A; 2OJ2 A; 1BK2 A; 2LJ1 A; 1EFN A; 2V1R A; 1AD5 A; 1YCS B; 1QWE A; 4J9B A; 3VS4 A; 2K6D A; 5FWC A; 3M0U A; 2EGC A; 1SSH A; 2ENM A; 1KFZ A; 4D8D A; 1PNJ A; 4J9C A; 1KIK A; 3UAT A; 3M0Q A; 4RTZ A; 3SHW A; 2J7I A; 1SEM A; 1XOV A; 1VYV A; 4JJC A; 1AWO A; 2DRK A; 2JM8 A; 1JXM A; 2LNH B; 2OAW A; 2CT3 A; 2KYM A; 1RI9 A; 2F2X A; 2JW4 A; 3A98 A; 2DNU A; 4F17 A; 5IHK A; 3CQT A; 2VKN A; 2KXC A; 2J6O A; 2FPD A; 4JJD A; 4OMP A; 2XMF A; 5IHN A; 1GRI A; 3VRY A; 2IIM A; 1WIE A; 2AKL A; 2YDL A; 4RTU A; 2FEI A; 1G83 A; 3IQL A; 1RLQ C; 2RQT A; 1NEB A; 1UJY A; 1GCP A; 4RTW A; 1YNZ A; 2KBT A; 5IHI A; 2RQV A; 2RNA A; 1IO6 A; 2YSQ A; 4LUE A; 1M27 C; 1WXB A; 3EHR A; 3M0T A; 1U06 A; 1T3L A; 2D8H A; 3NHN A; 4OML A; 4IIM A; 2LP5 A; 3PE0 A; 2VWF A; 4Z8A A; 4X1V A; 1ZBJ A; 2BTT A; 1PRM C; 4K11 A; 2DBK A; 4CC7 A; 1H92 A; 2FG0 A; 2YUO A; 1M8M A; 2O9V A; 1SPK A; 2DX1 A; 1WXU A; 4LE9 A; 2ED1 A; 1W1F A; 2D0N A; 4CC3 A; 1X27 A; 3PVL A; 2W0Z A; 2YUP A; 2K9G A; 1YWP A; 3VS2 A; 4OMO A; 2KT8 A; 2DYB A; 1PKS A; 2O88 A; 2X3W D; 2RQR A; 3REA B; 2FO0 A; 1WI7 A; 2FPE A; 2PTK A; 2FRW A; 3UA7 A; 2LJ0 A; 5IXB A; 1GBR A; 3H41 A; 1NEG A; 5ECA A; 2GTO A; 3UF4 A; 1NLO C; 4ESR A; 2A08 A; 1K4U S; 1LCK A; 2GGR A; 4HVV A; 2F2W A; 1AZG B; 1MV0 B; 4HXJ A; 3H0H A; 3I5S A; 2H8H A; 3VS7 A; 1Z9Q A; 1ZSG A; 1JO8 A; 5L23 A; 1AWW A; 3VS5 A; 2JMC A; 2CRE A; 2MIO A; 1ZUY A; 3M0P A; 4JPB W; 4J9E A; 1X2K A; 1YN8 A; 4RUG A; 2DL7 A; 2L2P A; 4ZNX A; 2DLP A; 2M51 A; 3REB B; 2RMO A; 2K79 A; 4J9G A; 4HVW A; 2EVR A; 2DL3 A; 1HJD A; 1WDX A; 1WXT A; 2CT4 A; 4WCI A; 5EC7 A; 2P4R A; 2DL4 A; 1AWJ A; 1NM7 A; 1WLP B; 5GJV B; 2F2V A; 2HBW A; 1KSW A; 2AK5 A; 2EW3 A; 2ROT A; 2LQN A; 2EYY A; 4ORZ A; 2I0N A; 2KRS A; 1Z9Z A; 2RQU A; 2BZ8 A; 3THK A; 3EGU A; 4J9F A; 2HDA A; 2YUN A; 2DA9 A; 2A28 A; 1UHC A; 1VYU A; 3EG2 A; 1GBQ A; 2RF0 A; 1ABO A; 2DE0 X; 1ABQ A; 2LJ3 A; 2CDT A; 2KEA A; 1KJW A; 4GBQ A; 2KRM A; 1HSQ A; 2DM1 A; 1T0J A; 2EYW A; 1BB9 A; 2JT4 A; 1K1Z A; 3EG0 A; 3I35 A; 1GCQ C; 2K7A A; 3UA6 A; 4JZ4 A; 4J9I A; 3VS3 A; 4LN2 A; 1UEC A; 1E6G A; 2JMA A; 2JTE A; 3JV3 A; 1JU5 C; 1WYX A; 2GQI A; 2JS2 A; 1PRL C; 1E7O A; 2PNI A; 1VYT A; 3EHQ A; 1VA7 A; 2DIL A; 2DBM A; 1U5S A; 4FSS A; 4LUD A; 2KYB A; 2DL8 A; 1UJ0 A; 2RPN A; 4F16 A; 1W70 A; 1G2B A; 2EKH A; 1NYG A; 3O5Z A; 2BZX A; 1E6H A; 1A0N B; 2MCN A; 4R0K A; 2ABL A; 3QWX X; 2EBP A; 3TSZ A; 2KT1 A; 2HSP A; 2JXB A; 2M0Y A; 2AKK A; 1AEY A; 1BU1 A; 1UG1 A; 1I1J A; 4AFU C; 2KGT A; 2J06 A; 2MOX A; 4RTX A; 1QLY A; 4CC2 A; 1FMK A; 2FRY A; 1ARK A; 1SRL A; 2CH4 W; 1ZUK A; 2ROL A; 4M4Z A; 1JQQ A; 2GTJ A; 1JXO A; 1AVZ C; 4Y92 A; 3EG3 A; 3EG1 A; 1X69 A; 1SHF A; 2DRM A; 1MUZ A; 2LX7 A; 1UTI A; 5GJW B; 2DVJ A; 2HCK A; 1WA7 A; 1FYN A; 2KRO A; 4D8K A; 4EIK A; 1B07 A; 1OPK A; 1NYF A; 1J3T A; 1AWX A; 1BBZ A; 4DEY A; 3TSW A; 1QWF A; 2VVK A; 3QWY A; 1K9A A; 2O9S A; 2QDL A; 2KRN A; 3TVT A; 1GCQ A; 1ZLM A; 4J9H A; 1YP5 A; 2RQW A; 2C0T A; 5IH2 A; 1UUE A; 1ZX6 A; 2CUB A; 2J05 A; 4A63 B; 3VS6 A; 1RLP C; 5I22 A; 2JM9 A; 3ZL7 C; 4Z88 A; 5I11 A; 3M0S A; 4OMM A; 1PKT A; 2W10 A; 2LCS A; 3GBQ A; 1UFF A; 2O2O A; 2B86 A; 5FWB A; 2V1Q A; 3R6N A; 1UHF A; 4AG2 C; 5HCK A; 1M3A A; 1B3Q A; 1X43 A; 3RBB B; 1AZE A; 2LMJ A; 1QKW A; 1CKA A; 3I5R A; 2EGE A; 2SEM A; 2PZ1 A; 2NUZ A; 1N5Z A; 2K2M A; 1K0S A; 2GBQ A; 1QCF A; 2CH4 A; 2EPD A; 1UGV A; 3H0I A; 4AFS C; 1NG2 A; 1W6X A; 4QT7 A; 3SEM A; 1X2Q A; 2J6F A; 4J9D A; 4AFQ C; 1K76 A; 4HVU A; 4Z89 A; 1T0H A; 4E6R A; 2DL5 A; 1Y57 A; 1JEG A; 2DMO A; 3VS1 A; 3ULR B; 2X3X D; 1H3H A; 1HD3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2LZ6 B; 1TS9 A; 2CSQ A; 1ZUU A; 2QQS A; 1WFW A; 2L5Q A; 3RKW A; 2KXD A; 1PWT A; 3SDZ A; 3RNJ A; 2JJ9 A; 4D6W A; 1R8O B; 4EMK C; 3E9G A; 1MND A; 3FJ5 A; 4M7D E; 1QCN A; 1V1C A; 1MGQ A; 1PHT A; 4M77 G; 3SWN C; 5GMK h; 2GF7 A; 1U1T A; 3NMZ C; 2DPP B; 2HD0 A; 4IUU A; 3MEU A; 4FIB A; 3LH5 A; 3HFN A; 4LDU A; 4MZM A; 2DXB A; 4HCK A; 2K4Y A; 3R6O A; 2HEQ A; 2LRQ A; 1OOT A; 5KCH A; 1NZ9 A; 5LJ3 e; 2EJF A; 4XK8 E; 2F1L A; 5CQY A; 3JB9 G; 4PJO E; 1X01 A; 3OYK A; 1RAC B; 1QMC A; 1VQP Q; 2KE9 A; 1UEB A; 3V8L A; 3I55 T; 1VQ8 Q; 1C0M A; 3LX7 A; 2KNB B; 2C0O A; 5D6Y A; 3CCR A; 3VKI A; 1SRM A; 4AFZ C; 4FCY A; 4EDU A; 3OYF A; 4QKU A; 3DLL A; 3JB9 H; 3NPF A; 3JCM W; 3OYL A; 1I07 A; 2HNI A; 3EFO B; 1VQ6 T; 4E7L A; 1N9R A; 4M7A C; 1K9M U; 2GNC A; 4PFO A; 1X75 C; 3CD6 A; 4X9C A; 3EGX A; 5GAM f; 1CSK A; 4CI0 C; 1M3B A; 1N6A A; 2CP0 A; 5IXF A; 1RAG B; 1EFN A; 3PFS A; 3SB2 A; 2HSE B; 1MMD A; 3G71 T; 1QWE A; 3CC7 A; 1UGS B; 1W4S A; 3VS4 A; 4WTO B; 1D3B A; 3RKX A; 5GAO q; 5A0L A; 1SSH A; 4PJO D; 1QVG P; 1KIK A; 2J7I A; 1XOV A; 2X35 A; 2P84 A; 2XD0 A; 2LNH B; 2RJF A; 4OMF B; 2F2X A; 2JW4 A; 1HXD A; 3P8B B; 3A98 A; 1Q82 R; 5GAN 6; 1WGS A; 4M7A F; 2KXC A; 2J6O A; 1PG5 B; 2CGH A; 2MI6 A; 4C8Q A; 4M7D C; 1ZHI A; 4ZGD B; 3NTK A; 2XMF A; 2YDL A; 4RTU A; 2E6Z A; 1YJ9 A; 1RLQ C; 3HSB A; 1G3Y A; 2DZ9 A; 2DIQ A; 1YNZ A; 5IHI A; 2JUF A; 3OYN A; 4DBH A; 1EX4 A; 1IO6 A; 2EKO A; 3PTA A; 3URG A; 1T3L A; 5M9O A; 4KT0 E; 1WHL A; 2QQ9 A; 2CP5 A; 2VXF A; 1SF9 A; 1VQK T; 4Z8A A; 4X1V A; 1PRM C; 1Q7Y U; 1YIJ T; 4K11 A; 1B34 B; 2DBK A; 4E7J A; 3FJP A; 1Q81 U; 3VJP A; 3JAM E; 4E7K A; 4PJO C; 1EIF A; 2O9V A; 3OYC A; 1SPK A; 2DX1 A; 3CCS A; 2D0N A; 5GAN 3; 2Y4Y A; 1YWP A; 4XTV A; 2DK3 A; 2EQU A; 4OMO A; 4C0D B; 4FYY B; 2CZ6 B; 5LJ3 f; 2X3W D; 3QSU A; 3REA B; 2P0P A; 4M7D F; 3TRE A; 3CCU A; 4FT2 A; 2GTO A; 3RKY A; 1NLO C; 4DOV A; 3OBY A; 1K4U S; 4CRI A; 2PU9 B; 2V8J A; 1AZG B; 3OYH A; 3I56 Q; 1OI1 A; 3H0H A; 1KQ1 A; 3FLG A; 3VUZ A; 2JMC A; 1VQ4 T; 2COY A; 4PL6 A; 4C5E A; 2MIO A; 2RB6 A; 4JPB W; 3HRU A; 1YN8 A; 2DL7 A; 3MJX A; 1I8F A; 2FB7 A; 3A8M B; 4PJO F; 1BIA A; 3CCJ Q; 2RMO A; 2K79 A; 2EVR A; 1OYX A; 3LWI A; 2DL3 A; 1HJD A; 3V7S A; 3CC2 T; 4EMK B; 5LL6 S; 4JRI A; 5EC7 A; 2P4R A; 5FU6 C; 2RHZ A; 3BFM A; 2WSE E; 5GJV B; 4ZN1 A; 1KSW A; 2AK5 A; 4EMH A; 3MP6 A; 3EFO A; 3PMT A; 3JCM c; 2RQU A; 4BUG A; 3THK A; 3CCV Q; 2YUN A; 3A8H B; 1VQL Q; 2QI2 A; 4NOY A; 1KC8 R; 3CPF A; 1GBQ A; 2RF0 A; 2DE0 X; 1ABQ A; 2A0F B; 3G4S Q; 2XIC A; 1WPY A; 5J39 A; 2KRM A; 2E3H A; 1YJN Q; 4FYX B; 2DM1 A; 1LOJ A; 2JT4 A; 3Q1J A; 1MMN A; 4N4I A; 1YI2 T; 3EG0 A; 4BI4 A; 2P0Q A; 3I55 A; 2DTO A; 2FL7 A; 4J6W A; 1GCQ C; 5LJ5 h; 4M78 E; 4LN2 A; 2DJZ A; 4BDY A; 1IGU A; 3CCL Q; 4M7A B; 3OW2 P; 2JMA A; 3OMC A; 2VYT A; 1VQO A; 3JV3 A; 5DM7 R; 4DBQ A; 1WYX A; 2YRV A; 2F69 A; 4M7A G; 3F70 A; 1VQ6 A; 2DIL A; 3VV0 A; 1U5S A; 4FSS A; 1K73 C; 2AT1 B; 2DL8 A; 3OYG A; 2ZZD A; 3HFO A; 4FW1 A; 4PFZ A; 2YXY A; 2LTO A; 2E6N A; 3O5Z A; 5CIU A; 3OYI A; 3LLR A; 5I2M A; 3QWX X; 3QJ6 A; 2JXB A; 1RAF B; 3GNG A; 1V76 A; 4AFU C; 3CMA T; 4PNO A; 2RA2 A; 2KGT A; 2J06 A; 1D1B A; 3L2Z A; 1V29 B; 2MWP A; 2MOX A; 3A1P A; 3BW1 A; 3QHS A; 2QTX A; 4XU2 A; 3H6Z A; 4JLG A; 8AT1 B; 3OYE A; 4LDW A; 2V8K A; 1ARK A; 3EH1 A; 3OSV A; 1SRL A; 2OTL T; 2CH4 W; 1ZUK A; 1M1F A; 2ROL A; 1B34 A; 1RAH B; 1VQ8 A; 2KY9 A; 2JTF A; 4N0A C; 5CQX A; 2LCL A; 1OU8 A; 1QVG S; 4XQ3 A; 5KYN A; 1SHF A; 2DRM A; 4M7D B; 5GAN e; 4M78 D; 2MAM A; 3MP8 A; 3MCA B; 2KRO A; 4M7D G; 1B07 A; 1OPK A; 1M1K U; 1BBZ A; 3QWY A; 2XU8 A; 1JJ2 A; 3TVT A; 5IH2 A; 4J7I A; 2YHT A; 4YTL A; 3DB3 A; 2ZPG B; 1ZX6 A; 2CUB A; 3CME T; 5HKC A; 3VS6 A; 3CD6 Q; 1RLP C; 4PJO B; 2LCS A; 2DFU A; 2LQ8 A; 2M1H A; 1UFF A; 5FWB A; 4DBR A; 1S72 T; 2K5F A; 4QW2 A; 1VQK A; 4PJO G; 1WHK A; 1M3A A; 1B3Q A; 1YIJ A; 2DTI A; 3CC7 Q; 1X43 A; 2VV5 A; 3EFR A; 4EMK A; 3OYD A; 3L42 A; 1VIF A; 2SEM A; 3MHX A; 5CR2 A; 2GBQ A; 3SWN A; 1PSF A; 1QCF A; 4OGE A; 4M78 C; 4QVC A; 1KG1 A; 2L8D A; 1W6X A; 2M02 A; 4QT7 A; 2KQW A; 4B9X A; 3C95 A; 1IRE B; 3QYG B; 4HVU A; 2ZPH B; 3CCQ T; 4J8O A; 2DL5 A; 3VS1 A; 2RO0 A; 4ZTF A; 1HD3 A; 4AG2 C; 4A4G A; 1VQ9 Q; 4RKU E; 3WVE B; 2H3J A; 2ZPF B; 2DTH A; 1H8K A; 1SHG A; 1AOJ A; 4F04 B; 2D1X A; 2K2V A; 2ESW A; 4FSX A; 2JVV A; 5FU6 B; 2C06 A; 2J6K A; 4JZ3 A; 4XAX B; 3BE3 A; 4AT1 B; 5IN1 A; 2OI3 A; 4Y91 A; 1K9M C; 2ED0 A; 4M78 F; 3GPL A; 4GLM A; 2EWN A; 1YJW Q; 2NUT B; 1YFN A; 1UE9 A; 1D0Z A; 3CCS Q; 4M7A A; 5GMK e; 2CSI A; 2L89 A; 4OMN A; 1OPL A; 1QP3 A; 1WX6 A; 1X6B A; 4C92 E; 4RMO A; 1OEB A; 4X34 A; 2VUB A; 3TU4 K; 1Q86 U; 4PLI A; 2EYX A; 3C0C A; 3I56 A; 2Y4X A; 4P5N A; 5CKF A; 2YUQ A; 3G6E T; 1WJQ A; 2DJQ A; 5GAN f; 3OMG A; 1LPL A; 3EH2 A; 1TUG B; 2ECZ A; 2C0I A; 2R57 A; 2EQJ A; 2NWM A; 1GFD A; 4KH1 B; 2LT4 A; 1K73 U; 2DKG A; 4A4E A; 1YI2 A; 5FW9 A; 5CKE A; 5GAM j; 2RI2 A; 3FB9 A; 2BE7 D; 2G6F X; 2YLC A; 2JS0 A; 1VUB A; 1ZA2 B; 3OQ5 A; 4M7D A; 2EYZ A; 2KR3 A; 1TUD A; 4MML A; 2D8J A; 2DEQ A; 4L5G A; 3OW2 S; 4LNP A; 4EPC A; 4RTT A; 4EMG A; 1TUC A; 2DAQ A; 3QUI A; 2BIV A; 1AD5 A; 3V7R A; 2E41 A; 2GFA A; 1Q7Y C; 1Q81 C; 2DIG A; 4F7U E; 4XU0 A; 1KFZ A; 4D8D A; 1PNJ A; 1YIT T; 3G4S A; 3OS1 A; 4PFP A; 4PJO A; 3C12 A; 4JJC A; 4BE0 A; 2JM8 A; 2OTL A; 1NJI U; 2OAW A; 2KYM A; 1RI9 A; 4BE1 A; 1I4K 1; 5AYF A; 2DNU A; 4F17 A; 5HK3 A; 3CQT A; 1O9S A; 4ZTJ A; 5KCO A; 2RM4 A; 2FPD A; 4OMP A; 4BY6 C; 3VRY A; 3CCL A; 2IIM A; 3I55 Q; 1G83 A; 3IQL A; 2RQT A; 1QVF A; 2RNA A; 4M77 B; 1R77 A; 1VQO Q; 2MWO A; 4C92 C; 1WXB A; 3M0T A; 3ASK A; 3L2Q A; 3CPW A; 1VQ6 Q; 3CME A; 2X51 A; 2XKO C; 4R56 A; 4CC7 A; 1EZZ B; 1N8R U; 1H92 A; 1WXU A; 4LE9 A; 3PVL A; 2WAC A; 1R0C B; 3VS2 A; 2QQR A; 4X9D A; 2O88 A; 3OA6 A; 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