The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
62
|
structure length |
62
|
Chain Sequence |
MDRQGFVPAAYVKKLDSGTGKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN
|
| publication title |
Atomic resolution structure of a mutant of the spectrin SH3 domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule tags |
Metal binding protein
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| total genus |
12
|
| structure length |
62
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| sequence length |
62
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-10-18 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CH4 W; 5IHN A; 1QWE A; 1T3S A; 4LUD A; 1QLY A; 3M0T A; 1SRL A; 2KXD A; 3ULR B; 4A63 B; 1WXU A; 1K4U S; 3RNJ A; 2DL5 A; 1H92 A; 4Z89 A; 2LJ0 A; 1TUC A; 2EQI A; 4HXJ A; 1X2K A; 4D8D A; 1M3C A; 2J6K A; 2AK5 A; 2CT3 A; 1PKS A; 1RLQ C; 4F14 A; 2EYW A; 1AWO A; 3EG0 A; 5IXB A; 1FMK A; 4GBQ A; 4HVV A; 4HVW A; 3I5S A; 4J9F A; 2DX1 A; 2P4R A; 2ENM A; 1T3L A; 2A28 A; 4Z8A A; 1M8M A; 2E5K A; 3EHR A; 1HSQ A; 3GBQ A; 2BZ8 A; 1G83 A; 1UFF A; 2RMO A; 2RPN A; 2KRN A; 1YP5 A; 4FSS A; 5FWC A; 2BTT A; 1QKW A; 2V1Q A; 1I07 A; 2YUO A; 1GCP A; 1K1Z A; 2DL7 A; 2FRY A; 4R0K A; 3EHQ A; 4OMP A; 2JT4 A; 3I35 A; 2W0Z A; 2GQI A; 1NEB A; 2EW3 A; 2KNB B; 2RQV A; 4J9E A; 1I1J A; 1NLO C; 3TVT A; 4RTW A; 1MV3 A; 1VA7 A; 1KJW A; 4DEY A; 1X27 A; 2DL3 A; 2KT8 A; 1Z9Z A; 2J7I A; 3NPF A; 3A98 A; 1CKB A; 5IHI A; 1UUE A; 3TSW A; 1WI7 A; 2LX7 A; 2XMF A; 1I0C A; 4J9I A; 2ABL A; 3PVQ A; 4M4Z A; 4OMO A; 1XOV A; 1QWF A; 1X43 A; 1PWT A; 4J9C A; 1H3H A; 2FPD A; 2L3S A; 2AZS A; 4AFQ C; 2C0O A; 2DRM A; 1JEG A; 4F16 A; 1X69 A; 2LQN A; 1UGV A; 1NM7 A; 2K6D A; 1KFZ A; 1PHT A; 5I11 A; 1B3Q A; 2J06 A; 3QWX X; 1WFW A; 1Y0M A; 2DVJ A; 2LMJ A; 2L2P A; 2EYY A; 2RQT A; 1MV0 B; 2M0Y A; 2DIL A; 1UTI A; 2W10 A; 2KR3 A; 1E6H A; 1JXM A; 2EBP A; 3VS1 A; 1CKA A; 1OV3 A; 2AKK A; 2DE0 X; 2VWF A; 5FWB A; 1N5Z A; 4X1V A; 2ROL A; 4JJC A; 4CC7 A; 4F17 A; 4LUE A; 5ECA A; 2O31 A; 2OI3 A; 1NYF A; 3PE0 A; 2KYM A; 2ED0 A; 5GJW B; 2KRO A; 1AWJ A; 1YN8 A; 2AZV A; 2KEA A; 1M27 C; 2CT4 A; 1VYV A; 2J6O A; 1SSH A; 1ZLM A; 4AG1 C; 1SPK A; 3VS3 A; 2DL8 A; 3EG2 A; 1U3O A; 2O9S A; 3NGP A; 5HCK A; 2ESW A; 2KE9 A; 1GL5 A; 2EGA A; 1KIK A; 3TSZ A; 4RTZ A; 1WX6 A; 1J3T A; 2O88 A; 3H41 A; 1K0S A; 1NLP C; 1YNZ A; 1BBZ A; 1WLP B; 2PTK A; 5FW9 A; 2YDL A; 4J9B A; 1ABQ A; 2X3X D; 2RNA A; 2SRC A; 4CC4 B; 1E7O A; 2DMO A; 3JV3 A; 1OOT A; 2FO0 A; 4OMN A; 2EGE A; 3I5R A; 4RTT A; 2QDL A; 1WIE A; 2K2M A; 3VRZ A; 1CSK A; 2KT1 A; 1BB9 A; 1X6G A; 5GJV B; 2D0N A; 2RQU A; 2DA9 A; 3U23 A; 3UAT A; 1T0J A; 4IIM A; 3VS0 A; 3THK A; 3IQL A; 2KRM A; 4JJD A; 1JU5 C; 4ESR A; 2GGR A; 3VS7 A; 2GTJ A; 2ROT A; 2CDT A; 4CC3 A; 4ZNX A; 2JMC A; 2CRE A; 3UA7 A; 3NMZ C; 2DL4 A; 2DRK A; 2CSI A; 3H0I A; 2LJ1 A; 3EGU A; 3LH5 A; 2YUN A; 2EKH A; 3CQT A; 1AZG B; 1QKX A; 2FPF A; 2JXB A; 1JQQ A; 1UHF A; 4J9H A; 1PRM C; 4RTV A; 1ABO A; 4OML A; 2HCK A; 1GBR A; 2K9G A; 2NUZ A; 1SEM A; 2YUQ A; 1UJ0 A; 1WA7 A; 1V1C A; 1YWP A; 2PZ1 A; 2D8J A; 1WXT A; 2H8H A; 2D8H A; 4AG2 C; 4LN2 A; 1GFD A; 2JS0 A; 1AVZ C; 1GRI A; 2OAW A; 3M0U A; 5I22 A; 3VS2 A; 4GLM A; 1W6X A; 2J6F A; 2PNI A; 1GBQ A; 2K3B A; 2DNU A; 4AFU C; 1BK2 A; 2JW4 A; 1ZSG A; 1K0X A; 1S1N A; 4LE9 A; 1M3B A; 1VYT A; 2DF6 A; 2EPD A; 4ORZ A; 1NG2 A; 1BU1 A; 1U06 A; 2D1X A; 2L3P A; 2AKL A; 2IIM A; 1PRL C; 1HJD A; 2K79 A; 3REA B; 2X3W D; 2BZY A; 2EGC A; 4Z88 A; 2EVR A; 3REB B; 1RUW A; 1E6G A; 1A0N B; 1AWW A; 1LCK A; 1ZUY A; 2K7A A; 4EIK A; 2DLP A; 2HEQ A; 2C0T A; 2FEI A; 1AD5 A; 2F2W A; 1W1F A; 3SEM A; 2KRS A; 4E6R A; 2O9V A; 2C0I A; 3R6N A; 2GBQ A; 3FJ5 A; 1YCS B; 1NYG A; 2JM8 A; 2KXC A; 2L3Q A; 2A37 A; 2FPE A; 1PKT A; 1WXB A; 3PVL A; 1ARK A; 1GCQ A; 3ZL7 C; 2HBW A; 1JXO A; 2LP5 A; 3M0Q A; 1Y57 A; 2LZ6 B; 3H0H A; 4HVU A; 4JZ3 A; 2GTO A; 2CUD A; 4WCI A; 1X2Q A; 2GNC A; 4RTU A; 2I0N A; 1M3A A; 2M51 A; 2A36 A; 2VKN A; 2ECZ A; 3H0F A; 4OMM A; 2FRW A; 1AOJ A; 3UF4 A; 3C0C A; 1RLP C; 1OPK A; 1X6B A; 3EG1 A; 3VS6 A; 2ED1 A; 1SHF A; 1K9A A; 2DBM A; 2DBK A; 1IO6 A; 2LNH B; 4HCK A; 4AFS C; 1AWX A; 3QWY A; 1WDX A; 4J9D A; 2YSQ A; 2YUP A; 1G2B A; 2YT6 A; 4QT7 A; 2L0A A; 1ZUU A; 3I9Q A; 2JS2 A; 4KRT A; 1UJY A; 4IIO A; 5IXF A; 3UA6 A; 4AFZ C; 2F2V A; 4LNP A; 4RUG A; 4JPB W; 4RTX A; 1SHG A; 3VRY A; 1GCQ C; 4DEX A; 1ZX6 A; 1B07 A; 5IH2 A; 3SHW A; 2LQW A; 2EYX A; 1RI9 A; 2DM1 A; 1T0H A; 3RBB B; 2DJQ A; 2F2X A; 2RQW A; 1ZUK A; 1EFN A; 1HD3 A; 1ZBJ A; 4JZ4 A; 4Y92 A; 4CC2 A; 1VYU A; 2EYZ A; 1UG1 A; 1AZE A; 2MIO A; 1SRM A; 2KGT A; 2KYB A; 5EC7 A; 4K11 A; 2HDA A; 1Z9Q A; 1QCF A; 4D8K A; 1H8K A; 2FG0 A; 2CSQ A; 2MOX A; 1PNJ A; 2RQR A; 2RF0 A; 2V1R A; 2VVK A; 4RTY A; 1UHC A; 2JM9 A; 2NWM A; 2CH4 A; 3EG3 A; 3M0P A; 1TG0 A; 1FYN A; 2B86 A; 1JO8 A; 2DYB A; 1MUZ A; 1M30 A; 2J05 A; 1TUD A; 1OPL A; 3M0S A; 2CUB A; 2LCS A; 5IHK A; 1NEG A; 1OEB A; 1YWO A; 1UEC A; 2O2O A; 2A08 A; 2G6F X; 3O5Z A; 1UDL A; 4J9G A; 4OMQ A; 2RN8 A; 5L23 A; 3VS4 A; 3KFV A; 2BZX A; 3VS5 A; 1UE9 A; 3NHN A; 1K76 A; 1U5S A; 2OJ2 A; 2SEM A; 4JJB A; 1AEY A; 2HSP A; 1W70 A; 2LJ3 A; 1WYX A; 3M0R A; 2JMA A; 1KSW A; 2KBT A; 2MCN A; 2JTE A; 1GFC A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DVE A; 3CCM A; 3DB3 A; 4LUD A; 2HAX A; 1TWB A; 2H3J A; 1PD1 A; 2HQE A; 4C8Q B; 1OU9 A; 4CRI A; 4HXJ A; 4LDW A; 1DJ7 B; 4RCC A; 1EX4 A; 4BB7 A; 3UT1 A; 3E19 A; 5CR2 A; 1OQK A; 1FMK A; 3HFO A; 4GBQ A; 4BE2 A; 2DX1 A; 3RKX A; 1D1C A; 3CC2 T; 2RK1 A; 5CCA A; 3EHR A; 1HSQ A; 3QDF A; 2RHU A; 2K5F A; 5LJ3 h; 4PFP A; 3I56 T; 2HKQ B; 4F7U F; 2QQB A; 2A0F B; 1YP5 A; 2A3L A; 5FWC A; 4C92 G; 4KGZ B; 3F70 A; 1LJO A; 1K1Z A; 3EHQ A; 2JT4 A; 2GQI A; 5KYU B; 1K8A R; 1N6A A; 4XAX B; 2IPO B; 2M0O A; 3DLM A; 3O8V A; 3TVT A; 3M4G A; 1VA7 A; 3PMI A; 4DEY A; 4LD9 K; 1WHJ A; 4M7D G; 3G71 Q; 4XU2 A; 8AT1 B; 3G71 A; 2KT8 A; 1Z9Z A; 1MNE A; 1CKB A; 3LX7 A; 2LT1 A; 4IUV A; 5GMK h; 3QO3 A; 4XTY A; 3PVQ A; 1LNX A; 1X43 A; 1YI2 T; 3LYI A; 1H3H A; 4AFQ C; 5GAM g; 2VGM A; 3CCQ T; 3CCU Q; 3OB9 A; 1X69 A; 1UGV A; 3LLR A; 4B9X A; 3CCU A; 5CQX A; 1PHT A; 2DEU A; 1QMC A; 3GNF B; 5D6Y A; 3FLG A; 1RAA B; 2RQT A; 3JCM V; 2DIL A; 1UTI A; 5KCH A; 2HD0 A; 3UDC A; 3VUB A; 1U8R A; 1OV3 A; 1XNI A; 3CCS A; 1N5Z A; 4JJC A; 1VQ4 Q; 1O75 A; 2RK2 A; 1VQ4 A; 4LUE A; 1K73 U; 5GAO l; 5ECA A; 5GAO n; 1I81 A; 5CKH A; 2O31 A; 2IVW A; 3PE0 A; 4Y28 E; 2LC4 A; 4PJN A; 1AWJ A; 1M27 C; 4C8Q F; 3X20 B; 2DL8 A; 3A1P A; 3C12 A; 1NJI U; 2ESW A; 3JCM P; 2EGA A; 4C92 C; 1KIK A; 3TSZ A; 1VQ5 T; 5GAN 7; 4BDY A; 4RTZ A; 4EMG A; 1WX6 A; 2D9T A; 5GAN e; 1WLP B; 2LQK A; 2ZZD A; 1KQ2 A; 2VB6 A; 2FO0 A; 3SWN C; 2EGE A; 2VXF A; 1CSK A; 1G3S A; 1PG5 B; 5GAN j; 4HCC A; 2V8J A; 2E10 A; 2D0N A; 4M7D C; 3A8L B; 3UAT A; 4JUV A; 4IIM A; 3VS0 A; 4C92 B; 1NJI R; 1RAD B; 2AIR B; 4L6V 5; 4OB2 B; 2VGN A; 1YCY A; 3CCL T; 1BI1 A; 1G5V A; 1WQW A; 2QQA A; 4M77 A; 2ROT A; 3G4S T; 2FYK A; 4ZNX A; 4M75 A; 4NL2 A; 3UA7 A; 3BDL A; 3L2W A; 3SWN B; 2EIF A; 3CQT A; 2EKH A; 1OYX A; 2X4W A; 4A54 A; 3I56 Q; 1K8A C; 1AZG B; 4RG8 A; 2FPF A; 5FRN A; 4M7D B; 4C0Z A; 3I56 A; 4M7A C; 5DM7 R; 4FL6 A; 1QCO A; 4OB3 B; 2XG8 D; 1ABO A; 2HCK A; 3MP6 A; 2NUZ A; 1MMA A; 2PZ1 A; 1YWP A; 2DTO A; 1WXT A; 2OTJ T; 1UGQ B; 3HFN A; 1VQP T; 5GAN 6; 3JCM c; 1H3Z A; 1GRI A; 4MDX A; 2EJ9 A; 2EQJ A; 5LJ3 d; 1AT1 B; 4BY6 C; 5HY6 A; 1GBQ A; 2K3B A; 3JCM Q; 4JJN K; 1BK2 A; 4XK8 E; 5HKC A; 4FT4 A; 5FLX E; 4FW2 A; 1VYT A; 3GOX A; 3CCJ T; 4M7A B; 1N8R R; 2D1X A; 4MML A; 2QEX T; 4E7Z A; 1HJD A; 3REA B; 4E7J A; 2LCL A; 5I2M A; 1B34 A; 3REB B; 5FRO A; 3TCJ A; 5GAM h; 4AMC A; 1E6G A; 1A0N B; 5CKE A; 4BY6 B; 4DBQ A; 2HMA A; 4EIK A; 4HT9 A; 2FEI A; 2HKN A; 1AD5 A; 2YWW A; 2GBQ A; 5IAY A; 2NUP A; 4M77 E; 2WSE E; 2KXC A; 1PKT A; 3PVL A; 4XTW A; 2DJZ A; 3KBG A; 5LJ5 e; 3ZL7 C; 5GMK i; 2HBW A; 3M0Q A; 2LZ6 B; 4IUR A; 4N0A C; 5LL6 S; 1X2Q A; 2EQM A; 3VKI A; 2VKN A; 5LJ5 j; 1FMW A; 2P0K A; 5J26 A; 1HK9 A; 3GPL A; 1X6B A; 1Q86 R; 3EG1 A; 4EMH A; 1KQ1 A; 4B6M A; 3P8H A; 4PJO D; 4BUG A; 2DBK A; 2E3I A; 1VQL T; 4J6X A; 2YT6 A; 3FB9 A; 4BI8 B; 4JRI A; 2CP0 A; 3I9Q A; 2JS2 A; 1NPP A; 1D09 B; 1BI2 A; 1UJY A; 2MAM A; 3UA6 A; 4C92 F; 3EGX A; 1BI0 A; 2F2V A; 1VQ5 Q; 1GCQ C; 1VQ5 A; 3OS1 A; 1FX7 A; 1R8O B; 2X4J A; 5CKB A; 1NJI C; 1YFN A; 2K3Y A; 2LQW A; 2LCC A; 1MMG A; 2JN0 A; 2DM1 A; 2JVV A; 3MPU B; 5CAI A; 2V26 A; 4MDW A; 5GMK e; 4HCZ A; 1WHG A; 2CP2 A; 4M7D F; 1ZBJ A; 1ZHI A; 4CC2 A; 1VYU A; 3L2Z A; 4DBR A; 3QJY A; 4QQG A; 1KG1 A; 2KGT A; 2VUB A; 3LH0 A; 1VQN T; 4K11 A; 3OYN A; 5GMK j; 1NE8 A; 1Z9Q A; 4D8K A; 1WHK A; 4LDV A; 2CSQ A; 3CCL A; 1PNJ A; 2RF0 A; 3G4S Q; 4JLG A; 3FIF A; 3EG3 A; 2X35 A; 4PK4 A; 3G4S A; 2CS7 A; 4NOY A; 2R57 A; 4V2S A; 4M7A F; 2DTI A; 3OBW A; 1NEG A; 4PJM A; 1YWO A; 3J80 E; 4BD3 A; 2QGG A; 2A08 A; 1D1A A; 4A4G A; 2F69 A; 4PKC C; 3O5Z A; 3V8K A; 1N8R C; 3CMA T; 2OTJ Q; 5LJ3 f; 3ASK A; 3CPF A; 1VQP Q; 2OTJ A; 3VS5 A; 1VQP A; 3VV0 A; 4JJB A; 3ZFJ A; 1W2B P; 3X28 B; 2PVO B; 2EQU A; 2KBT A; 3M55 A; 2JTE A; 3WVE B; 1QVF P; 1R0C B; 1RL2 A; 4Y91 A; 3CCJ A; 2COW A; 4QW2 A; 5KH6 A; 3M0T A; 4QVZ A; 3ULR B; 3OS0 A; 4A63 B; 2QEX A; 2MI6 A; 2CP3 A; 4PNO A; 3JCM b; 2DL5 A; 1H92 A; 2H3E B; 4OB0 B; 4PJJ A; 3QJ6 A; 4D8D A; 2EAY A; 2CT3 A; 4ELZ C; 1PKS A; 2PVD B; 4RCB A; 1YIT T; 3JSC A; 1AWO A; 2CZ6 B; 2JTF A; 2BE9 B; 4HVW A; 3I5S A; 2ENM A; 1RAE B; 3EGD B; 3MHX A; 1TTH B; 2DTH A; 1YJW Q; 1M8M A; 5CKF A; 2CZ1 B; 3G71 T; 1WGS A; 3H9N A; 3PIP A; 5GAM d; 2X4Y A; 2RMO A; 2E65 A; 2QGF B; 1Q86 C; 2KRN A; 2XDP A; 1KQS S; 1MMD A; 1JJ2 P; 1TU0 B; 1I07 A; 2QK0 A; 2BIV A; 1GCP A; 1OI1 A; 2FRY A; 3QG1 A; 3PIO A; 4J83 A; 2OTL Q; 1M9S A; 3JAM E; 2RQV A; 4J9E A; 5DY9 A; 5CKD A; 2O4X A; 2OAU A; 2YXY A; 1N9R A; 4RTW A; 1D3B B; 1VQL Q; 3CPW P; 1X27 A; 3RKY A; 5GAO q; 4PJO E; 1K9M U; 1VQL A; 1QVG S; 2PU9 B; 5GAO r; 1W2B A; 4ZGJ B; 3NPF A; 3A98 A; 2IG0 A; 1X01 A; 1BCO A; 5GAN 4; 4KUD K; 3TSW A; 1KQS P; 1QVF A; 4X9C A; 2FZC B; 8ATC B; 2NUT B; 4M78 E; 3DB4 A; 4M4Z A; 1VQ4 T; 1QWF A; 4J8O A; 2MWO A; 2GCX A; 3PTA A; 3RMS A; 3A8G B; 4WF2 A; 4F16 A; 1YJN Q; 1X75 C; 2WSC E; 2LQN A; 3JB9 I; 3PNW C; 1NM7 A; 1YJN A; 1K9M R; 1KFZ A; 1B3Q A; 4OP0 A; 2V8K A; 2K57 A; 3QWX X; 4DOW A; 1QVG P; 2LMJ A; 1BKB A; 3VU3 C; 2EYY A; 2E12 A; 2HL3 A; 3OS2 A; 1VQN Q; 2KR3 A; 1E6H A; 1QP3 A; 1YBY A; 1VQN A; 2EBP A; 3MET A; 1CKA A; 2DE0 X; 2AKK A; 3OSV A; 1RAC B; 5A2Q E; 1JJ2 A; 4F17 A; 1ZSZ A; 2RM4 A; 3OYA A; 2E4H A; 2JTM A; 2RH2 A; 1NYF A; 1EIF A; 1N27 A; 2KYM A; 2ATC B; 2KEA A; 2KRO A; 2XK0 A; 2L8D A; 3CMA Q; 2FB7 A; 3CMA A; 2R5A A; 3EG2 A; 2BE7 D; 3OYJ A; 1U3O A; 3MO8 A; 3JCM g; 3NGP A; 4DOV A; 3CPW A; 3HRT A; 2MWP A; 2XID A; 2ZPI B; 4E2F B; 1VQM T; 2ZGW A; 2RHY A; 1YNZ A; 2PTK A; 4J7I A; 2DKG A; 2X3X D; 2RNA A; 4CC4 B; 2CZ7 B; 1SF9 A; 1E7O A; 3JCM J; 2COZ A; 4OMN A; 4R56 A; 1R77 A; 2QDL A; 1WIE A; 2K2M A; 4ME7 A; 2KT1 A; 4JRP A; 1GXI E; 3RIR A; 1TSF A; 3QZ9 B; 2RQU A; 1M2V A; 2BUD A; 3OBY A; 3THK A; 2R5M A; 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