The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
62
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structure length |
62
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Chain Sequence |
MDRQGFVPAAYVKKLDSGTGKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN
|
| publication title |
Atomic resolution structure of a mutant of the spectrin SH3 domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule tags |
Metal binding protein
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| total genus |
12
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| structure length |
62
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| sequence length |
62
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-10-18 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DJQ A; 3I35 A; 2LQW A; 2O9S A; 1W70 A; 1JO8 A; 1BB9 A; 1NYG A; 2VKN A; 3UF4 A; 2K79 A; 1GBQ A; 4AFQ C; 1AZE A; 1WXB A; 2KYM A; 2KRM A; 5ECA A; 2RPN A; 1OPK A; 1JXM A; 2EGA A; 1X2K A; 2CH4 A; 2L0A A; 4LUE A; 1ABQ A; 2KT8 A; 1RUW A; 1AWW A; 1YWP A; 4GLM A; 2EYW A; 2DBK A; 2L3P A; 2L3Q A; 2FG0 A; 2ROT A; 3M0S A; 2C0O A; 5IHI A; 1K0S A; 2CUD A; 2KXD A; 2D1X A; 3SEM A; 5GJV B; 1GCQ C; 1U5S A; 2YDL A; 3PVL A; 1FMK A; 4GBQ A; 2RQR A; 3THK A; 2J6O A; 1QWF A; 2MCN A; 1KJW A; 2YSQ A; 1HD3 A; 2B86 A; 1N5Z A; 4ZNX A; 1QCF A; 1PKT A; 1AZG B; 2K6D A; 2HSP A; 1SHG A; 5FWC A; 1PRL C; 2RMO A; 2FPF A; 3TSZ A; 3IQL A; 1G2B A; 1WXT A; 1AEY A; 3R6N A; 4CC4 B; 2GBQ A; 1JXO A; 2BZX A; 2DLP A; 3CQT A; 2JM9 A; 2M0Y A; 1UG1 A; 1YNZ A; 1ZSG A; 3ZL7 C; 1WA7 A; 2IIM A; 2D8H A; 4A63 B; 2DVJ A; 2LNH B; 4J9E A; 4OMQ A; 1PHT A; 2KYB A; 2RF0 A; 4F14 A; 2LP5 A; 1YN8 A; 1T3S A; 4CC7 A; 2BZY A; 2GTO A; 1ZX6 A; 1YCS B; 3PE0 A; 3FJ5 A; 1UDL A; 1E6H A; 1JQQ A; 2FPD A; 1JU5 C; 4AG2 C; 1M3A A; 1YP5 A; 1E6G A; 2DIL A; 1ZUY A; 1MV3 A; 4AFU C; 4F17 A; 1AOJ A; 2AZV A; 5IXB A; 1CSK A; 1W1F A; 2AKL A; 1GCP A; 2JTE A; 2FRW A; 1EFN A; 2V1R A; 4FSS A; 4HVV A; 1FYN A; 2EGC A; 2YUQ A; 3H41 A; 2JW4 A; 2DNU A; 2EYY A; 2FPE A; 4RTU A; 1UEC A; 2X3X D; 5L23 A; 3H0F A; 1OEB A; 1X27 A; 2JT4 A; 3JV3 A; 2K9G A; 3M0R A; 1WIE A; 4HVW A; 4RTT A; 4ESR A; 1PKS A; 4LNP A; 4CC2 A; 1I0C A; 5FW9 A; 3SHW A; 2DM1 A; 1K4U S; 1X69 A; 3I9Q A; 2W10 A; 2J06 A; 1NEB A; 1SEM A; 3KFV A; 2ESW A; 1H3H A; 2YUP A; 2EPD A; 2DL5 A; 1AVZ C; 1Z9Q A; 2E5K A; 2L2P A; 1WDX A; 5EC7 A; 1TUD A; 3UA6 A; 2ENM A; 1GL5 A; 1MUZ A; 1RI9 A; 2EKH A; 4OMM A; 3U23 A; 4D8K A; 2JS2 A; 1RLP C; 5GJW B; 3M0T A; 1WX6 A; 1SSH A; 1LCK A; 4OMN A; 2DRM A; 4RUG A; 2DX1 A; 2DMO A; 2K3B A; 1KIK A; 1VYV A; 2YT6 A; 1UUE A; 2HBW A; 2ED0 A; 5I22 A; 4AFZ C; 2DBM A; 2F2X A; 2DL8 A; 2RQU A; 4JZ4 A; 2RNA A; 1X2Q A; 2GNC A; 4DEX A; 2OAW A; 2KT1 A; 1Y0M A; 5IXF A; 3QWY A; 3EHR A; 3EG0 A; 1X6B A; 3M0P A; 2KRN A; 1HJD A; 1JEG A; 4WCI A; 1QLY A; 2V1Q A; 2HCK A; 2C0T A; 1WLP B; 2AK5 A; 2RQW A; 2G6F X; 1OOT A; 4K11 A; 4LN2 A; 1T0J A; 3LH5 A; 2CT4 A; 2LQN A; 1HSQ A; 1J3T A; 1UJY A; 3NHN A; 1X6G A; 1NLO C; 2KGT A; 1AWO A; 3EG3 A; 2JM8 A; 2RQV A; 3A98 A; 1AWX A; 1K1Z A; 2VWF A; 2KXC A; 2NUZ A; 5IH2 A; 2LJ0 A; 3M0U A; 4HVU A; 2FO0 A; 4Z88 A; 1M3B A; 1NG2 A; 1M8M A; 1NM7 A; 1QWE A; 1VA7 A; 4J9F A; 5IHN A; 2CH4 W; 1T0H A; 2F2W A; 1CKA A; 4CC3 A; 2HEQ A; 4IIO A; 4D8D A; 3VS3 A; 1CKB A; 1GRI A; 3EG2 A; 1AWJ A; 2XMF A; 3NMZ C; 2L3S A; 4OMO A; 2W0Z A; 2CUB A; 1WFW A; 4HCK A; 2EGE A; 4J9H A; 4LE9 A; 2ECZ A; 3RNJ A; 2K2M A; 2M51 A; 4JZ3 A; 2CSQ A; 2O2O A; 2AKK A; 2CRE A; 4DEY A; 2NWM A; 2J05 A; 2OI3 A; 3NGP A; 2GTJ A; 3PVQ A; 4KRT A; 1U3O A; 2JXB A; 4F16 A; 3VS0 A; 2LMJ A; 5FWB A; 4R0K A; 1BU1 A; 2A28 A; 2YUN A; 1WI7 A; 1NYF A; 1A0N B; 2P4R A; 2J7I A; 1VYU A; 2D0N A; 1Y57 A; 1W6X A; 1X43 A; 1M3C A; 1RLQ C; 4X1V A; 4Z89 A; 1GFD A; 2RQT A; 1BBZ A; 1H8K A; 2O9V A; 2HDA A; 1SHF A; 1M30 A; 2YUO A; 3VRZ A; 2KRS A; 1ZUU A; 1MV0 B; 1ZUK A; 3I5S A; 4Y92 A; 4J9G A; 4Z8A A; 2CDT A; 2GQI A; 4J9B A; 1S1N A; 1UJ0 A; 1SPK A; 1Z9Z A; 2A37 A; 2PNI A; 2A36 A; 2AZS A; 1B3Q A; 1QKW A; 1TG0 A; 3C0C A; 4RTW A; 4HXJ A; 4RTX A; 2RN8 A; 3QWX X; 1K0X A; 3VS1 A; 2PZ1 A; 2KEA A; 2LJ1 A; 1QKX A; 2EQI A; 2DYB A; 2EVR A; 2JS0 A; 2LJ3 A; 1I1J A; 4JJB A; 1UE9 A; 3I5R A; 4RTV A; 2JMA A; 2LZ6 B; 3VS2 A; 5IHK A; 3H0I A; 4J9D A; 3UAT A; 1K9A A; 4E6R A; 2EBP A; 1H92 A; 2A08 A; 2DE0 X; 2I0N A; 2D8J A; 2C0I A; 2H8H A; 2KNB B; 2LCS A; 2GGR A; 4M4Z A; 3VRY A; 4RTY A; 4ORZ A; 1WYX A; 3M0Q A; 3VS7 A; 2DF6 A; 2DRK A; 4OMP A; 2J6K A; 2DL7 A; 2EW3 A; 1WXU A; 2X3W D; 2ROL A; 4EIK A; 1OPL A; 1T3L A; 1PWT A; 1UFF A; 1OV3 A; 1UHC A; 2LX7 A; 2SRC A; 3NPF A; 3RBB B; 3TSW A; 1PNJ A; 1U06 A; 1VYT A; 2DL3 A; 2SEM A; 4JPB W; 3REA B; 1YWO A; 1PRM C; 2JMC A; 2KE9 A; 2KRO A; 4AFS C; 2KBT A; 1GBR A; 3EHQ A; 1UTI A; 1M27 C; 3EGU A; 3TVT A; 1KSW A; 4AG1 C; 2QDL A; 3VS5 A; 2FEI A; 1IO6 A; 2BTT A; 1KFZ A; 5I11 A; 1ABO A; 1AD5 A; 1UGV A; 2DL4 A; 2O88 A; 2CT3 A; 2OJ2 A; 1E7O A; 4JJC A; 3ULR B; 2ED1 A; 4J9C A; 2BZ8 A; 2VVK A; 4RTZ A; 1K76 A; 3H0H A; 2EYZ A; 1GCQ A; 2MOX A; 1G83 A; 1NLP C; 1TUC A; 4LUD A; 1ZLM A; 2O31 A; 1NEG A; 1BK2 A; 2ABL A; 3REB B; 3EG1 A; 4JJD A; 2CSI A; 1B07 A; 2MIO A; 4IIM A; 4QT7 A; 2DA9 A; 1SRM A; 1XOV A; 3O5Z A; 2F2V A; 3GBQ A; 2EYX A; 1UHF A; 2FRY A; 2J6F A; 2K7A A; 4OML A; 2KR3 A; 3VS6 A; 3VS4 A; 1ZBJ A; 1GFC A; 1SRL A; 1ARK A; 3UA7 A; 4J9I A; 5HCK A; 2PTK A; 1I07 A; 1V1C A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CC7 Q; 2E64 A; 3I35 A; 2CP6 A; 5GAN 7; 1JO8 A; 5GAN g; 4ZN1 A; 1QP2 A; 3BE3 A; 1B34 A; 4PKC C; 3CEY A; 3UF4 A; 2K79 A; 1QVF P; 2RI2 A; 3A8G B; 2XDD A; 2EWN A; 5D6W A; 4E47 A; 2YRC A; 3FB9 A; 2M0O A; 3L42 A; 5GAM j; 2OTJ T; 1G3T A; 4LUE A; 1IRX A; 4A54 A; 1YHQ T; 1MMG A; 1AWW A; 2P4T A; 4C92 D; 4JLI A; 2L3P A; 4M77 D; 3CC4 Q; 2HZY A; 3JCM V; 3M0S A; 2C0O A; 2DXT A; 2DXU A; 3CCS Q; 2JUF A; 5KYX B; 4XU0 A; 3QZ9 B; 4C8Q C; 3P8D A; 1Q82 U; 4OF1 A; 1VQO A; 1VQN Q; 3JCM Q; 3A8O B; 4HCC A; 2QAS A; 4PJO C; 1FMK A; 2D6F A; 2ZPE B; 4GY5 A; 2A0F B; 4LXC A; 4X34 A; 3CBM A; 3QHS A; 1HD3 A; 1N5Z A; 1IB8 A; 1WPY A; 2X35 A; 2K6D A; 2HSP A; 5GAO r; 4DBH A; 2FPF A; 4M7A B; 3M55 A; 3M9Q A; 4Y28 E; 5LJ3 j; 4FT4 A; 2BZX A; 3CME Q; 4C0F A; 1I5O B; 3BDU A; 2XI9 A; 4ELZ C; 3ZL7 C; 3X20 B; 2D8H A; 3CCE Q; 1MMD A; 2QEX A; 2IPO B; 2DIQ A; 4XAX B; 4XTW A; 2LNH B; 1BYM A; 1TS9 A; 2RF0 A; 4ZTF A; 4V2S A; 3QKJ A; 5CVI A; 4BY6 B; 5I21 A; 1YN8 A; 1V76 A; 5DY9 A; 2GTO A; 1YI2 T; 3PE0 A; 3FJ5 A; 1UDL A; 4M77 E; 1OI1 A; 1JU5 C; 2FPD A; 4LDX A; 5GMK i; 1E6G A; 2KMT A; 1MV3 A; 3HP9 A; 4NS5 A; 3MHX A; 5CKF A; 1YJW Q; 2AZV A; 3VKI A; 5CCA A; 1W1F A; 2CZ1 B; 4NL2 A; 4M7A C; 2OTL A; 3HPW A; 2EAY A; 1K8A R; 2O4X A; 2RJC A; 1N6A A; 2YUQ A; 4NL3 A; 3H41 A; 4M75 D; 1UEC A; 2LT4 A; 2NUP B; 3H0F A; 4KUL A; 1OEB A; 1X27 A; 3HFN A; 2JT4 A; 3QUI A; 4LDV A; 4RTT A; 4ESR A; 3SD4 A; 3CC2 T; 2QQB A; 5FW9 A; 5AYF A; 2JVV A; 3I55 T; 1VQ5 A; 1VQ9 T; 1X69 A; 1AHJ B; 4C0D B; 4DBQ A; 4C8Q E; 3G71 Q; 3HFO A; 2YUP A; 2EPD A; 4PJO E; 3KXT A; 3VU3 C; 2L2P A; 1WDX A; 1IGQ A; 1KD1 R; 2EQM A; 1MUZ A; 1RI9 A; 2EKH A; 1TTH B; 4D8K A; 1VQP T; 2OAU A; 2WSE E; 5GJW B; 1RAD B; 2QK0 A; 3CPF A; 4WF2 A; 1M90 C; 1M2O A; 2ZPF B; 6AT1 B; 2ATC B; 4A4K A; 3S3N A; 1UUE A; 2XID A; 1BIA A; 2DVE A; 2YHT A; 5GAO m; 4L5G A; 2QEX T; 3QXE B; 1OUL A; 1BIB A; 3CC7 T; 3LH0 A; 1KC8 R; 4OB3 B; 1AT1 B; 1QCO A; 3ER0 A; 3GPL A; 3ME9 A; 4C0D C; 4MZM A; 2L3R A; 1Y0M A; 3EHR A; 3GF5 A; 1QVG P; 4WCI A; 4B9X A; 3OYK A; 2BE9 B; 3UPU A; 3CPW P; 4KBM B; 2DTO A; 2RHX A; 3CC4 T; 4BE1 A; 2HAX A; 1IXD A; 3CCS T; 1X6G A; 2KGT A; 4M7A E; 1AWX A; 3M5A A; 2VWF A; 2KXC A; 1VQN T; 3CCU A; 3OA6 A; 2MAM A; 2LX9 A; 2FO0 A; 2V8K A; 1ZQ1 A; 1RAH B; 2H3J A; 5IHN A; 2F2W A; 2XD0 A; 1FWZ A; 1Q86 R; 3QZ5 B; 2IG0 A; 4M78 G; 4JRI A; 1OZ2 A; 4OMO A; 2DD4 A; 1SF9 A; 1FXX A; 4JDS A; 1RAG B; 4J9H A; 2PVO B; 3CME T; 2WSF E; 1KK7 A; 2RJD A; 1G5V A; 2AKK A; 2QQA A; 4MMK A; 4DEY A; 2M02 A; 2NWM A; 2F5T X; 3CCE T; 2GTJ A; 4KRT A; 2Y4X A; 2P84 A; 2LMJ A; 4R0K A; 1BU1 A; 4KGZ B; 2J7I A; 1VYU A; 4BDZ A; 1PD1 A; 1W6X A; 2K4Y A; 3PT9 A; 5LJ5 h; 1GFD A; 3UDC A; 2Y90 A; 3I56 Q; 4EMK B; 2O4X B; 2O9V A; 4MDW A; 1IHV A; 2HDA A; 3VRZ A; 1PC0 A; 1ZUK A; 1YJW T; 4Z8A A; 1S1N A; 1UJ0 A; 2F5K A; 1WHM A; 2A36 A; 2L89 A; 2NUT A; 2RD1 A; 1B3Q A; 4RTW A; 4RTX A; 4OB0 B; 2RN8 A; 3OYN A; 1K0X A; 1B7T A; 3VS1 A; 2KEA A; 5IN1 A; 3JB9 H; 1QKX A; 2JS0 A; 1TH7 A; 2LJ3 A; 4E7L A; 4JJB A; 1K73 U; 3URG A; 2JMA A; 5IHK A; 3UAT A; 3M56 A; 2QA4 Q; 3RES A; 2D8J A; 2C0I A; 5CKE A; 2R5A A; 2O01 E; 3MP1 A; 2LCS A; 1X75 C; 4PLI A; 3VRY A; 2LRQ A; 1IRE B; 2CZ6 B; 3M0Q A; 1JBM A; 3HHT B; 2DL7 A; 3G71 T; 3PIP A; 1YJ9 A; 4ELY C; 1OPL A; 1T3L A; 1UFF A; 3G6E A; 2SRC A; 3P8H A; 3S6W A; 3RBB B; 3TSW A; 3CXC S; 1U06 A; 2DL3 A; 1S72 Q; 2JTF A; 5CQY A; 2KE9 A; 3OYM A; 5A0G A; 2K5L A; 4J83 A; 2XDB A; 4QQG A; 1EZZ B; 3F70 A; 3LGL A; 4O6J A; 1QMC A; 4FIB A; 4AMC A; 3L2Q A; 3VS5 A; 1IO6 A; 1M2V B; 1ABO A; 4C5G A; 1UGV A; 5M9O A; 2O88 A; 4AT1 B; 2FB7 A; 1YJN A; 1M9S A; 2BZ8 A; 2PUO B; 4A4E A; 2RO0 A; 4RTZ A; 3EFO B; 5CKB A; 3H0H A; 2EYZ A; 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3E9F A; 4J8O A; 1D0X A; 2GBQ A; 2E10 A; 4FYY B; 4DOW A; 2JM9 A; 2M0Y A; 2JTM A; 3JSC A; 4M7A F; 1ZSG A; 1XQH A; 2QA4 T; 4A63 B; 2F1L A; 4A4F A; 1VIF A; 2HBP A; 2KYB A; 3CPW A; 5CIU A; 4X9C A; 3RDV A; 1VQO Q; 1T3S A; 1ZX6 A; 4EMH A; 4AG2 C; 2NUP A; 3V8K A; 2PUK B; 3V7C A; 3GP8 A; 4WTO B; 4ATO A; 4QVZ A; 5LJ5 d; 1CSK A; 1Y71 A; 1Q95 G; 4FW1 A; 1RAE B; 1FX7 A; 3M4Y A; 1C0M A; 4IUQ A; 1S72 T; 2ZPG B; 2FRW A; 2X4X A; 4GLK A; 4UC4 A; 2V1R A; 1R0C B; 2FPE A; 5L23 A; 4QVC A; 1I81 A; 2E6N A; 1WIE A; 4Y91 A; 5CR2 A; 1PKS A; 4CC2 A; 5CAI A; 3RKX A; 1M8V A; 2RK1 A; 4PJL A; 4ZN3 A; 3OYY A; 3CCQ T; 1SEM A; 3H6Z A; 1U1T A; 3KFV A; 1H3H A; 1VQ4 T; 1M1F A; 1AVZ C; 2E5K A; 2QTV A; 5EC7 A; 5CO7 A; 3UA6 A; 3U23 A; 2NLU A; 5A2Q E; 4B9W A; 4M7D G; 3A8L B; 8AT1 B; 2OTL Q; 1Y96 A; 3EG9 B; 3CCJ A; 3JB9 J; 1RAC B; 1LNX A; 3ASK A; 2LTO A; 1KIK A; 4HCB A; 4FL6 A; 2CZ0 B; 5GAO p; 1NJI R; 2EYQ A; 1KQ2 A; 4AFZ C; 1K73 R; 5GMK h; 1C6V X; 2F2X A; 4JZ4 A; 4HKE A; 4C5E A; 2A7Y A; 2QXF A; 2RNA A; 1VQ5 Q; 1LJO A; 2HD0 A; 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