The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
68
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structure length |
68
|
Chain Sequence |
GSSGSSGNTYVALYKFVPQENEDLEMRPGDIITLLEDSNEDWWKGKIQDRIGFFPANFVQRLSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Solution structure of the first SH3 domain of Stac protein
rcsb |
| molecule keywords |
Protein Stac
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| total genus |
7
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| structure length |
68
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| sequence length |
68
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1W70 A; 1WDX A; 1QLY A; 1M27 C; 2P4R A; 4K11 A; 1TUC A; 4CC2 A; 3VS2 A; 4J9B A; 3KFV A; 3O5Z A; 3UF4 A; 2DE0 X; 1U3O A; 2EVR A; 1QCF A; 2A28 A; 1GCQ C; 2PTK A; 3IQL A; 2I0N A; 4ESR A; 2JS0 A; 4CC7 A; 4OMN A; 4CC3 A; 1HJD A; 4RTY A; 4OMQ A; 1GCP A; 4LN2 A; 2DX1 A; 3VS6 A; 1ZUU A; 2J05 A; 3VS1 A; 2CH4 A; 2RPN A; 2DL3 A; 4JJB A; 1YNZ A; 1H8K A; 1X2K A; 5IH2 A; 1RI9 A; 1XOV A; 4Z88 A; 3I5R A; 3ZL7 C; 2LX7 A; 2CT3 A; 5IHK A; 2KEA A; 2HEQ A; 3UA6 A; 1T0J A; 1ZUY A; 1HD3 A; 2AK5 A; 4CC4 B; 2KGT A; 1VA7 A; 2JMA A; 1ABQ A; 1PKT A; 3LH5 A; 5HCK A; 2AZS A; 1WX6 A; 2ROL A; 1FYN A; 1LCK A; 2LCS A; 2CDT A; 1N5Z A; 2DIL A; 2W0Z A; 2XMF A; 1AEY A; 5L23 A; 3VS4 A; 3PE0 A; 2GTO A; 1JXO A; 4OML A; 1OV3 A; 1ZX6 A; 2E5K A; 3NGP A; 2LQN A; 1Y57 A; 1A0N B; 3UA7 A; 3FJ5 A; 4RUG A; 2A36 A; 3NHN A; 1H92 A; 3JV3 A; 4JZ4 A; 1CKA A; 2MIO A; 1G2B A; 4AFU C; 3M0T A; 5GJW B; 4OMO A; 4Z89 A; 3TSZ A; 2ENM A; 2FPF A; 2CT4 A; 1MUZ A; 3ULR B; 2SRC A; 2CSI A; 1AZE A; 4J9E A; 1NM7 A; 3C0C A; 3QWY A; 4J9I A; 4LE9 A; 1B07 A; 1JQQ A; 2KRM A; 1E6H A; 2LZ6 B; 2M51 A; 1QKX A; 1X43 A; 2DJQ A; 3I35 A; 2PNI A; 3PVL A; 4IIM A; 4DEY A; 1BU1 A; 4HXJ A; 2VVK A; 1PRL C; 2YUP A; 4J9F A; 2GGR A; 1W6X A; 1X69 A; 1YCS B; 2L2P A; 1VYU A; 1JXM A; 2G6F X; 2K2M A; 2KRS A; 2FPD A; 1WXT A; 1U06 A; 3M0U A; 1K0X A; 2NWM A; 1RLQ C; 1TUD A; 2DRK A; 2V1Q A; 2D8H A; 2EQI A; 2RQR A; 2AZV A; 2EYX A; 3REA B; 2DYB A; 2OI3 A; 2L3Q A; 2RQU A; 4X1V A; 5GJV B; 3R6N A; 1M30 A; 1AZG B; 1WYX A; 2K79 A; 3EG0 A; 2YT6 A; 1YN8 A; 4RTZ A; 4AFS C; 3RNJ A; 1QKW A; 1SHF A; 4J9G A; 2DMO A; 4FSS A; 1IO6 A; 1K0S A; 2A37 A; 3REB B; 2KRO A; 1T3L A; 1SSH A; 2KE9 A; 2EW3 A; 3SEM A; 1S1N A; 2J7I A; 1X27 A; 1JEG A; 1VYV A; 1ARK A; 2F2V A; 1PRM C; 4LUE A; 1Z9Q A; 2RQV A; 5FW9 A; 1YWP A; 4JPB W; 1UJY A; 2FG0 A; 1PKS A; 2RMO A; 2OJ2 A; 1MV0 B; 2HSP A; 4E6R A; 1CSK A; 1WIE A; 3VS3 A; 2DL4 A; 1GRI A; 1YWO A; 2EYY A; 1JO8 A; 1BB9 A; 2KXD A; 1KIK A; 3EG2 A; 3I5S A; 1E6G A; 2CH4 W; 2FPE A; 1BBZ A; 2O2O A; 4GLM A; 1AWX A; 1I07 A; 4RTV A; 5IXB A; 3A98 A; 1UHF A; 2YDL A; 3EG1 A; 3VS0 A; 2F2W A; 2KT8 A; 2DA9 A; 3U23 A; 2DRM A; 4AG2 C; 2W10 A; 3EHR A; 4EIK A; 4R0K A; 2K7A A; 2L3P A; 4JJC A; 1ZBJ A; 4JZ3 A; 2RF0 A; 1GFC A; 1GL5 A; 2BZ8 A; 1PHT A; 1GBQ A; 2ROT A; 1AVZ C; 1NLP C; 1K1Z A; 4GBQ A; 1U5S A; 4J9D A; 2X3X D; 3THK A; 1OOT A; 4A63 B; 2KR3 A; 1SRM A; 2JM8 A; 1I0C A; 1MV3 A; 4ZNX A; 1JU5 C; 2H8H A; 4Y92 A; 2JS2 A; 1AWW A; 2DLP A; 2RN8 A; 4OMP A; 1GCQ A; 2FRY A; 2KNB B; 2K6D A; 2HBW A; 3VS7 A; 2YUO A; 1SPK A; 2O88 A; 4D8K A; 1UG1 A; 3EG3 A; 1KJW A; 3H0F A; 2IIM A; 1AOJ A; 2L3S A; 2CRE A; 4QT7 A; 2LNH B; 1UE9 A; 2RNA A; 1X6B A; 5IXF A; 1EFN A; 5EC7 A; 2EGA A; 1YP5 A; 2J06 A; 5FWC A; 2MCN A; 2DL7 A; 2JW4 A; 1B3Q A; 2A08 A; 2GNC A; 2DL8 A; 1AWJ A; 1PNJ A; 2LJ0 A; 4J9C A; 1KSW A; 2DBM A; 1T3S A; 4HVV A; 1ZSG A; 2GBQ A; 5IHI A; 1WLP B; 1WXB A; 2KT1 A; 2QDL A; 4RTX A; 1NEB A; 3VRZ A; 2JM9 A; 1RUW A; 1QWF A; 1UFF A; 2OAW A; 2NUZ A; 1GBR A; 2HCK A; 2YUN A; 1UGV A; 1ZLM A; 1KFZ A; 2YUQ A; 3NPF A; 1OPK A; 2VWF A; 4M4Z A; 2PZ1 A; 1AWO A; 1SHG A; 4RTU A; 2ABL A; 4RTT A; 2L0A A; 2ED0 A; 4LNP A; 2ESW A; 4KRT A; 1M3A A; 2EKH A; 1GFD A; 3EGU A; 2B86 A; 4AFZ C; 1Z9Z A; 2LP5 A; 2JMC A; 1WXU A; 4D8D A; 2O31 A; 2GQI A; 4F14 A; 1K76 A; 3M0R A; 1BK2 A; 4IIO A; 2DBK A; 1NYF A; 2AKL A; 4HCK A; 1NYG A; 1OPL A; 2RQT A; 3H0H A; 3TVT A; 1UEC A; 2KBT A; 5IHN A; 2F2X A; 2C0O A; 2BZX A; 2J6O A; 1V1C A; 1PWT A; 3SHW A; 2EGE A; 1HSQ A; 2LJ1 A; 1UJ0 A; 1OEB A; 2EYZ A; 1K4U S; 5ECA A; 3M0P A; 5FWB A; 2EPD A; 4ORZ A; 3M0S A; 4AFQ C; 2J6K A; 3QWX X; 2D8J A; 2EBP A; 2KRN A; 1ABO A; 2C0I A; 1E7O A; 1UTI A; 1M3C A; 4OMM A; 3CQT A; 2JTE A; 5I11 A; 1T0H A; 1K9A A; 2FRW A; 3VRY A; 2YSQ A; 2FO0 A; 1WFW A; 4LUD A; 2SEM A; 1WI7 A; 2O9V A; 1CKB A; 2KYB A; 2HDA A; 2CUB A; 2DF6 A; 2LMJ A; 3VS5 A; 4WCI A; 3TSW A; 4F17 A; 1G83 A; 2KYM A; 1QWE A; 1TG0 A; 2RQW A; 3PVQ A; 2D0N A; 2D1X A; 2BZY A; 1NEG A; 3NMZ C; 2KXC A; 1UUE A; 1UDL A; 3H41 A; 3RBB B; 1AD5 A; 2ECZ A; 4RTW A; 4HVW A; 2CUD A; 4AG1 C; 2O9S A; 2VKN A; 2BTT A; 2AKK A; 3I9Q A; 2JXB A; 3H0I A; 1X6G A; 2DNU A; 1Y0M A; 1X2Q A; 2ED1 A; 1M3B A; 2DVJ A; 2J6F A; 2EGC A; 3GBQ A; 1I1J A; 2GTJ A; 4Z8A A; 1SRL A; 2JT4 A; 1FMK A; 1WA7 A; 2X3W D; 2FEI A; 1SEM A; 3UAT A; 4JJD A; 3M0Q A; 2EYW A; 2C0T A; 2DM1 A; 4DEX A; 4F16 A; 1M8M A; 1UHC A; 2MOX A; 1RLP C; 2V1R A; 2CSQ A; 2LQW A; 1H3H A; 4HVU A; 1NLO C; 1ZUK A; 3EHQ A; 1VYT A; 1W1F A; 4J9H A; 2DL5 A; 2M0Y A; 2K9G A; 1NG2 A; 2K3B A; 1J3T A; 2LJ3 A; 5I22 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5I2M A; 5FU6 B; 1EX4 A; 3CCE Q; 3QII A; 2JTM A; 1M27 C; 4M77 B; 4K11 A; 1TUC A; 2HMA A; 4CC2 A; 3S3M A; 3V7C A; 2EQM A; 2M02 A; 4IUP A; 2XID A; 4P5N A; 3AT1 B; 1QCF A; 3EGD B; 2A28 A; 2JVV A; 2QDY B; 4CC3 A; 2JOY A; 3CME A; 1UB4 A; 2MYS A; 1AHJ B; 3CPW S; 4OMQ A; 1GCP A; 1N8R C; 3SWN C; 4M7D F; 4B9X A; 4M78 F; 1MMA A; 3Q1J A; 2D9T A; 3PNW C; 2ATC B; 1X2K A; 2LCL A; 3OSS C; 3HTR A; 1Q86 U; 1ZSZ B; 1DJ7 B; 2BE9 B; 1SSF A; 4KGX B; 1X75 C; 3X26 B; 1TSF A; 1QVF S; 5FLX E; 4E7I A; 2YHT A; 2DXC A; 4IUU A; 1HD3 A; 5KYU B; 1S72 A; 1JJ2 A; 1QVP A; 2QQ9 A; 2LCS A; 4II1 A; 2DIL A; 2W0Z A; 1AEY A; 4ZGJ B; 4N0A A; 5L23 A; 2Y4X A; 2NUP A; 1PM3 A; 2E5K A; 1Y57 A; 3CCJ T; 2QK0 A; 1K9M C; 2PVD B; 3UA7 A; 3QZ5 B; 4FL6 A; 1VQ6 Q; 5GMK h; 5LL6 S; 5LJ5 d; 3MET A; 3NHN A; 2MIO A; 3VUZ A; 1VQL A; 4OMO A; 3TSZ A; 1Q7Y R; 1N6A A; 1QVF P; 1MUZ A; 4NS5 A; 4OB1 B; 5A2Q E; 2EYQ A; 3MP8 A; 1OYX A; 1JQQ A; 4HT8 A; 3I35 A; 1U1T A; 2QA4 T; 4IIM A; 2RK2 A; 4DEY A; 8AT1 B; 2GF7 A; 3RIR A; 2ZAE A; 2VVK A; 2HKQ B; 1PRL C; 2HBP A; 2YRC A; 3VUB A; 1W6X A; 1YCS B; 1QW1 A; 1VYU A; 4R55 A; 1JXM A; 1VQ9 A; 1D1B A; 2YRV A; 3CCR A; 1K0X A; 2NWM A; 4MML A; 3M59 A; 3QG1 A; 2V1Q A; 3OMC A; 5GAN g; 2AZV A; 1EZZ B; 4EPC A; 2DYB A; 1BIA A; 4M7A F; 3OBY A; 5GJV B; 2LCC A; 3X28 B; 2K79 A; 2YT6 A; 1VQN T; 1YN8 A; 2MI6 A; 4AFS C; 4IUR A; 2DEU A; 1QKW A; 4A4F A; 4PJL A; 2VC8 A; 3CCU Q; 3REB B; 1T3L A; 1Y07 A; 3BFM A; 2FB7 A; 1NJI R; 2J7I A; 1OUL A; 2R58 A; 1PRM C; 4LUE A; 5KE3 A; 2XI9 A; 2A0F B; 2QGG A; 4XTZ A; 4Z02 A; 1YWP A; 1C6V X; 2X35 A; 1VQ7 A; 1Q81 C; 4IKF A; 1TTH B; 3FJP A; 2OJ2 A; 2P4T A; 4FYW B; 2V26 A; 2EYY A; 5CO7 A; 1QCO A; 1JO8 A; 3OS2 A; 3OYL A; 4KH0 B; 2DXT A; 1Q82 R; 2FPE A; 1IRX A; 2DYI A; 5IXB A; 3EG1 A; 2F2W A; 2DAQ A; 2DA9 A; 3U23 A; 1M1K R; 3L1A A; 2NUT B; 3LH0 A; 1YHQ Q; 2DZ9 A; 4EIK A; 3EHR A; 4R0K A; 2QI2 A; 4MZP A; 3R6O A; 4C8Q G; 4JZ3 A; 3BE3 A; 4NL2 A; 2RF0 A; 1GFC A; 2RM4 A; 1GL5 A; 1PHT A; 2QQR A; 1SF9 A; 1WHM A; 4ZTJ A; 1R0C B; 5GAN h; 3MP1 A; 4A63 B; 1B34 B; 1YBY A; 3CCE T; 1AWW A; 4OMP A; 2BIV A; 1SG5 A; 2RK1 A; 2K6D A; 4PKC C; 1OI1 A; 3OYY A; 4PFO A; 1W2B P; 2YUO A; 1SPK A; 2EJ9 A; 4M77 A; 1UG1 A; 2RJC A; 3CBO A; 5GAO r; 2IIM A; 4HCC A; 2CRE A; 3ME9 A; 2F69 A; 5KE2 A; 4RG8 A; 2RNA A; 3EGD A; 3CCL A; 1YP5 A; 2J06 A; 3BDU A; 1KQ2 A; 2MCN A; 1K9M R; 3JCM Q; 2WAC A; 3EAE A; 1SKU B; 1QVF A; 2GBQ A; 4N4I A; 2DEQ A; 4B6M A; 2QDL A; 2X9H A; 1IB8 A; 4PJO D; 2VUB A; 1YJW A; 1WHK A; 2E1H A; 2JM9 A; 1MNE A; 2VXF A; 5CQY A; 1QWF A; 2OAW A; 2X4W A; 2NUZ A; 1C0M A; 4BE2 A; 1IRE B; 3M4G A; 3CC7 Q; 5KYU A; 2YUQ A; 5LJ5 g; 4PLL A; 3CCM Q; 1OPK A; 1VQ5 Q; 2PZ1 A; 1R77 A; 1AWO A; 2YXY A; 4E7H A; 1WHL A; 3OW2 P; 2EQJ A; 1M4Z A; 1VQ6 T; 4N0A C; 4C92 D; 4FSX A; 1VQP Q; 4IUT A; 5FU7 B; 4PJO C; 1TS9 A; 1WXU A; 1Q86 R; 4X9D A; 5EG2 A; 4F14 A; 3EG9 A; 1JBM A; 1IGU A; 2F1L A; 2KK4 A; 4MMK A; 2DBK A; 4HCK A; 4XU0 A; 1RAE B; 5HY6 A; 2RQT A; 3BDL A; 2WSF E; 4CRI A; 4M7D D; 5I2S A; 4M78 D; 3WXM B; 1WJQ A; 4C92 C; 2FHD A; 1XNI A; 3CCS A; 1KQS S; 5GAN 5; 3BY7 A; 1D09 B; 1K4U S; 3I56 A; 3OA6 A; 3CCQ Q; 3G4S Q; 3QYG B; 2J6K A; 3OB9 A; 3QWX X; 5FRN A; 4QW2 A; 1ABO A; 4M7D C; 4OMM A; 2LQ8 A; 2HL3 A; 3VRY A; 2HL5 C; 3CCU T; 5LJ5 h; 1OZ3 A; 3V8L A; 5LJ3 d; 3QO3 A; 3M53 A; 5DLO A; 2HDA A; 4PJJ A; 1KQS P; 2DF6 A; 4M77 G; 4J6W A; 3TSW A; 4F17 A; 3LGL A; 1G83 A; 1QWE A; 2EIF A; 3FIF A; 3RKY A; 2QEX Q; 1NEG A; 3NMZ C; 5KYW B; 2KXC A; 1H64 1; 1UDL A; 3OYJ A; 3H41 A; 3UWN A; 3RBB B; 3UT1 A; 3A8O B; 2CUD A; 3VKI A; 1YCY A; 1I8F A; 2VKN A; 3G6E A; 1Q7Y U; 2BTT A; 3I9Q A; 2JXB A; 2KSS A; 1X6G A; 3OYD A; 5AYF A; 3GBQ A; 4Y91 A; 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1A0N B; 1VQP T; 3FJ5 A; 1S72 Q; 3JV3 A; 1CKA A; 4A4K A; 3M0T A; 5GJW B; 2D6F A; 3CXC S; 4E7L A; 1V29 B; 1N8R U; 5KYX A; 2E65 A; 4DA4 A; 2YLB A; 3C0C A; 3KBG A; 1RAB B; 3JCM c; 5IAY A; 1BCO A; 2KRM A; 2LZ6 B; 2M51 A; 4JDS A; 1QKX A; 2DO3 A; 2DJQ A; 3PMT A; 1KK7 A; 4LDY A; 3OYM A; 1VQL Q; 1KQS A; 1BU1 A; 4Q5W A; 1RAD B; 2GFU A; 2QQS A; 4FT4 A; 5DM7 R; 4PJO F; 1Q95 G; 2K2M A; 1BIB A; 2FPD A; 2LNV A; 1M90 C; 1WXT A; 4BI8 B; 5GAM j; 3CCQ T; 3G4S T; 2IVW A; 1K73 C; 2GFA A; 1TUD A; 2DRK A; 2D8H A; 2EQI A; 1K9M U; 3REA B; 3KUF A; 5LJ3 g; 2JN0 A; 4XTV A; 1FXX A; 1WYX A; 3EG0 A; 2NYS A; 1PG5 B; 3OYA A; 2QGF B; 3GLX A; 4C92 F; 2XDD A; 3RNJ A; 1SHF A; 4J9G A; 3CCR Q; 2P0K A; 6AT1 B; 3ASK A; 3QJ6 A; 2Y90 A; 1WHH A; 2EW3 A; 3C12 A; 3MEA A; 1PCX A; 2QEX T; 3SEM A; 1S1N A; 3PTA A; 1QQJ A; 3QUI A; 2RQV A; 3EGX B; 1ZA2 B; 1N9R A; 4FYV B; 4JPB W; 2RI2 A; 2A3L A; 1TOV A; 2RMO A; 3OSV A; 5KYW A; 3VS3 A; 4FIB A; 4WTO B; 1GRI A; 4PJN A; 2XDB A; 2RHY A; 1BB9 A; 2KXD A; 3EG2 A; 3I5S A; 1M5Q 1; 2DD4 A; 3NTK A; 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