The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
GSSGSSGNTYVALYKFVPQENEDLEMRPGDIITLLEDSNEDWWKGKIQDRIGFFPANFVQRLSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the first SH3 domain of Stac protein
rcsb |
| molecule keywords |
Protein Stac
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
7
|
| structure length |
68
|
| sequence length |
68
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RQW A; 2PNI A; 2EGC A; 4K11 A; 4RTW A; 2YUQ A; 1KJW A; 2LQN A; 3VS6 A; 3QWX X; 4JZ3 A; 2KR3 A; 1UG1 A; 4OMM A; 1KIK A; 1E7O A; 3EG1 A; 2YUP A; 4J9B A; 1MUZ A; 2CH4 A; 1X27 A; 3VS7 A; 2CRE A; 2EBP A; 2J6O A; 4ZNX A; 2LZ6 B; 2RPN A; 4LUE A; 2M0Y A; 1JXM A; 3UAT A; 2KYM A; 2GTJ A; 2FRW A; 2RQV A; 5IH2 A; 2A36 A; 4Z89 A; 2NWM A; 2J06 A; 4CC4 B; 3TSW A; 4HCK A; 3SEM A; 1K9A A; 1K0X A; 4R0K A; 4HVU A; 2YUO A; 1OV3 A; 1BK2 A; 2CT4 A; 1ZBJ A; 3JV3 A; 2DBK A; 3IQL A; 2GNC A; 4AFZ C; 3I35 A; 1WXU A; 2JMC A; 4F16 A; 1SPK A; 1YP5 A; 4DEY A; 1NYF A; 2OI3 A; 3GBQ A; 1WIE A; 1W6X A; 2O88 A; 1SSH A; 1PKT A; 5FWB A; 2YT6 A; 3H0F A; 1GFC A; 2FPD A; 1PWT A; 2KT1 A; 1VA7 A; 3NMZ C; 1E6G A; 1Z9Z A; 2AZS A; 5IHN A; 1UEC A; 1UJ0 A; 2BZX A; 4RUG A; 2HCK A; 4LN2 A; 1PRM C; 1UGV A; 2KNB B; 4ORZ A; 2K3B A; 2EYZ A; 1BU1 A; 1AWX A; 2C0I A; 3ZL7 C; 5I22 A; 1ARK A; 1AZE A; 1ZX6 A; 2EW3 A; 1A0N B; 2DL3 A; 2GGR A; 1U3O A; 1W1F A; 1X43 A; 2M51 A; 3U23 A; 1WYX A; 2O9S A; 1VYT A; 5IHK A; 2VWF A; 1PHT A; 3C0C A; 3VS3 A; 1YNZ A; 1ZUK A; 1M3C A; 1AZG B; 1AD5 A; 1WXT A; 4OMN A; 2BZ8 A; 2F2W A; 2GBQ A; 1AWW A; 1QWF A; 1JEG A; 1X2K A; 2L2P A; 1FYN A; 1I0C A; 1OPK A; 1X6G A; 4OMO A; 2JXB A; 1JU5 C; 1NEG A; 3M0P A; 1VYU A; 2C0O A; 1TUC A; 1Z9Q A; 4J9E A; 1GCQ A; 1K4U S; 1GL5 A; 5GJW B; 1JQQ A; 1OOT A; 2J7I A; 2J05 A; 1GCP A; 2OAW A; 4JZ4 A; 1GBR A; 4EIK A; 1ZLM A; 1ZSG A; 1NLP C; 1YN8 A; 2L3Q A; 4JJB A; 1LCK A; 2JS0 A; 1AWO A; 4LNP A; 1AOJ A; 2AZV A; 1AVZ C; 2YDL A; 1SRM A; 3REA B; 1AEY A; 2KRN A; 4OMQ A; 3VS0 A; 3NGP A; 2NUZ A; 4Z88 A; 2ECZ A; 4QT7 A; 1H92 A; 2DE0 X; 1T0H A; 2ESW A; 2I0N A; 1UDL A; 4CC3 A; 2KE9 A; 2EYW A; 4Y92 A; 5IXB A; 2DIL A; 2JW4 A; 2EYX A; 2KEA A; 3PVQ A; 4CC7 A; 1T0J A; 2JTE A; 3VS1 A; 3RNJ A; 3M0R A; 1QWE A; 1UHF A; 2K6D A; 1YWP A; 1ABQ A; 2AK5 A; 3H0I A; 1K76 A; 2KT8 A; 4J9I A; 1E6H A; 2RN8 A; 4J9C A; 1BBZ A; 5HCK A; 2MOX A; 2G6F X; 2DM1 A; 2ED1 A; 2OJ2 A; 1MV3 A; 2CDT A; 1QKX A; 2FPE A; 1JXO A; 1RI9 A; 4AFS C; 4J9H A; 2PZ1 A; 3FJ5 A; 4X1V A; 2GQI A; 2DL7 A; 1NEB A; 1M8M A; 1U06 A; 2AKK A; 3I5R A; 2LJ1 A; 2DJQ A; 4RTY A; 3UA6 A; 1HJD A; 3SHW A; 2E5K A; 2SRC A; 2DL4 A; 4RTV A; 2H8H A; 2CSQ A; 2JMA A; 1G2B A; 1WI7 A; 4Z8A A; 2VKN A; 1X69 A; 3TSZ A; 3THK A; 2A37 A; 2LP5 A; 1WDX A; 2ROL A; 1K0S A; 5I11 A; 2DVJ A; 2L0A A; 2LMJ A; 3M0T A; 2CH4 W; 1NG2 A; 2IIM A; 2MCN A; 1H8K A; 1I07 A; 3REB B; 3EG3 A; 1NLO C; 4J9G A; 1CKB A; 4D8D A; 2BTT A; 2D8J A; 1YWO A; 3I9Q A; 1UHC A; 2B86 A; 4RTX A; 1X6B A; 3EHQ A; 4HVV A; 2KRO A; 1RLP C; 2CUD A; 2DBM A; 1WX6 A; 3M0Q A; 1VYV A; 2LQW A; 2X3X D; 1GRI A; 4OML A; 4AG2 C; 5EC7 A; 2BZY A; 2HEQ A; 2LJ0 A; 2LX7 A; 3I5S A; 1FMK A; 1CKA A; 2DL8 A; 4J9D A; 1BB9 A; 2MIO A; 3A98 A; 4RTT A; 2LNH B; 1TG0 A; 2DNU A; 3H0H A; 3KFV A; 1ZUY A; 1U5S A; 4HXJ A; 2JM8 A; 4D8K A; 1MV0 B; 2EGA A; 2FPF A; 3VRY A; 1XOV A; 2QDL A; 4OMP A; 5GJV B; 2KYB A; 3M0S A; 1QLY A; 1AWJ A; 1YCS B; 2D1X A; 3O5Z A; 2DMO A; 2K7A A; 2A28 A; 4JJC A; 1S1N A; 1N5Z A; 1V1C A; 2F2V A; 3TVT A; 1UTI A; 4AFU C; 2VVK A; 4M4Z A; 2DRK A; 3VS4 A; 5IXF A; 1B3Q A; 2O31 A; 2RQU A; 3VS2 A; 1RUW A; 4RTU A; 2RQT A; 1M30 A; 2W0Z A; 4A63 B; 1HSQ A; 2FO0 A; 1ZUU A; 1ABO A; 2AKL A; 2JT4 A; 3VS5 A; 3EHR A; 5IHI A; 4F14 A; 4IIM A; 2K79 A; 3UF4 A; 2EGE A; 2FRY A; 4J9F A; 2FEI A; 2KBT A; 2KGT A; 3EG0 A; 3CQT A; 2RMO A; 2JS2 A; 1H3H A; 2CUB A; 2F2X A; 1JO8 A; 2EKH A; 1UUE A; 2EPD A; 4CC2 A; 2EYY A; 3H41 A; 1QKW A; 4HVW A; 1SEM A; 1J3T A; 2P4R A; 4FSS A; 2LCS A; 2DLP A; 3NHN A; 2CT3 A; 1QCF A; 2EVR A; 1SHF A; 3EG2 A; 4LE9 A; 1WXB A; 4DEX A; 5ECA A; 3M0U A; 2ROT A; 2KRS A; 5L23 A; 1UJY A; 1T3L A; 2O2O A; 2YSQ A; 1HD3 A; 1GFD A; 1K1Z A; 1IO6 A; 1M3B A; 3R6N A; 2DX1 A; 2DA9 A; 1EFN A; 2X3W D; 2RQR A; 1G83 A; 1Y0M A; 2C0T A; 1RLQ C; 2K2M A; 1GBQ A; 1NM7 A; 1M27 C; 1OPL A; 2L3S A; 4F17 A; 2KXC A; 2FG0 A; 2DRM A; 1SHG A; 3LH5 A; 5FW9 A; 2XMF A; 4WCI A; 1CSK A; 2KXD A; 2D8H A; 2ED0 A; 2CSI A; 2PTK A; 4KRT A; 2V1Q A; 1B07 A; 2K9G A; 2DYB A; 1PKS A; 2ENM A; 2HSP A; 1KFZ A; 4LUD A; 1NYG A; 3PE0 A; 3UA7 A; 1X2Q A; 1PRL C; 2LJ3 A; 2DL5 A; 3ULR B; 1OEB A; 4GBQ A; 5FWC A; 3VRZ A; 2L3P A; 1SRL A; 1T3S A; 2V1R A; 2EQI A; 2O9V A; 2W10 A; 2D0N A; 4E6R A; 2KRM A; 1WLP B; 2YUN A; 4ESR A; 2RNA A; 1KSW A; 2J6K A; 1UE9 A; 1TUD A; 2HDA A; 4JJD A; 1W70 A; 2DF6 A; 3NPF A; 1M3A A; 2GTO A; 1Y57 A; 2HBW A; 1WFW A; 2JM9 A; 2J6F A; 4AG1 C; 4GLM A; 2A08 A; 1UFF A; 3RBB B; 2RF0 A; 3EGU A; 1I1J A; 1GCQ C; 3QWY A; 1PNJ A; 4IIO A; 4JPB W; 2ABL A; 1WA7 A; 4AFQ C; 2SEM A; 4RTZ A; 3PVL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4MZT A; 5DY9 A; 2PNI A; 1R77 A; 5GAN h; 1YI2 T; 2LQN A; 3VS6 A; 1KIK A; 3LW5 E; 3CCL T; 3QZ9 B; 4ATO A; 1RAD B; 5HKC A; 3OS0 A; 2CH4 A; 4C92 B; 5GAO p; 4M78 B; 5LL6 S; 1OX8 A; 2WSC E; 2RPN A; 4M77 E; 3UPU A; 3I55 Q; 5D6Y A; 4M78 D; 3I56 Q; 3OS5 A; 3LLR A; 3RUX A; 4NL2 A; 2A36 A; 2NWM A; 4HCK A; 4LDW A; 1K9A A; 4QW2 A; 1RAF B; 2IG0 A; 1YJ9 A; 2JOY A; 4PJJ A; 3RMQ A; 4KGV B; 1WXU A; 3MJX A; 2JMC A; 4RCC A; 1KC8 C; 3CC4 Q; 2OI3 A; 5LJ3 e; 2DTI A; 3GBQ A; 2DK3 A; 4ZN3 A; 4E7Z A; 1M4Z A; 3CC2 Q; 4C5G A; 1PKT A; 1GFC A; 2FPD A; 3CCV A; 2OTJ T; 2KT1 A; 5IHN A; 4PJL A; 5C0M A; 4KH0 B; 2HCK A; 5LJ5 h; 3G6E A; 1PRM C; 2EJF A; 2YRC A; 5I22 A; 2IPO B; 3PIP A; 2E65 A; 3CCJ Q; 1Q7Y U; 2DVE A; 1A0N B; 3JCM X; 2GGR A; 1TSF A; 1U3O A; 1W1F A; 2EJG A; 2M51 A; 1N8R C; 4E7H A; 1AHJ B; 5FRM A; 4X9C A; 1Q81 C; 4Y91 A; 1TUG B; 1W2B S; 3VS3 A; 1YNZ A; 2D6F A; 3BW1 A; 1KQ2 A; 1N9S A; 4XAX B; 4OMN A; 1VIF A; 4ZGJ B; 2PUO B; 1AWW A; 1QWF A; 1K9M R; 4C8Q E; 2LCL A; 2ZPF B; 1KK7 A; 2Y90 A; 1RAH B; 2DYI A; 1Z9Q A; 4FU6 A; 4OB3 B; 2CZ0 B; 2YWW A; 3EFR A; 3FIF A; 2Y4Y A; 2J7I A; 2XD0 A; 4F7U E; 5KYU A; 1ZLM A; 2XHC A; 3JCM h; 1ZSG A; 4N4G A; 3O8V A; 3GNF B; 1R0C B; 1ZBX A; 2AZV A; 4NS5 A; 2QEX A; 1KD1 C; 2QEX T; 1AVZ C; 3PGG A; 3VJP A; 5CKD A; 3CXC S; 3NGP A; 2NUZ A; 2QI2 A; 1TTH B; 5FRO A; 3QO3 A; 4QT7 A; 2DE0 X; 3JB9 F; 2I0N A; 2KE9 A; 4Y92 A; 2DIL A; 2EYX A; 2KEA A; 4RCB A; 4CC7 A; 4E7L A; 2JTE A; 3VS1 A; 4LD6 A; 3HFN A; 2K6D A; 5GAM g; 3TRE A; 1C1A A; 5KCH A; 2FVU A; 5HCK A; 2MOX A; 2EAY A; 2NUT A; 4C92 E; 4M78 E; 2K3Y A; 3EGD A; 3OMC A; 4J9H A; 1VQP A; 1ZSZ C; 3SWN A; 1NEB A; 2PVG B; 5GMK l; 3CPW P; 5GAN g; 2LJ1 A; 2DJQ A; 1G3Y A; 4MZP A; 3OS1 A; 1OUL A; 4RTV A; 5GAO n; 1EX4 A; 1G2B A; 1M1F A; 2QQ9 A; 2OTL A; 3RER A; 4Z8A A; 1M90 R; 5CKE A; 1SKU B; 1K0S A; 5I11 A; 2LT1 A; 1YIT Q; 5DLQ E; 2CH4 W; 1NG2 A; 1V76 A; 2IIM A; 2MCN A; 4KGZ B; 1WJS A; 3MEV A; 2D8J A; 2E1H A; 1XNI A; 1YWO A; 1UHC A; 4R56 A; 5I2S A; 1X6B A; 2HBP A; 3I56 A; 1AT1 B; 2CUD A; 2DBM A; 1WX6 A; 3M0Q A; 1EZZ B; 2R5M A; 1GRI A; 4AG2 C; 1YCY A; 4PJO D; 3CBP A; 5KYX A; 1RAB B; 2V26 A; 1M2V B; 3L2W A; 2HQH A; 2QA4 Q; 4OB1 B; 3EH2 A; 4M7A C; 3CC4 A; 2RB6 A; 3HTR A; 2CP2 A; 3V8K A; 1NJI C; 2EJ9 A; 4MMK A; 5GAM e; 2EGA A; 1XOV A; 2QDL A; 4O6J A; 4OMP A; 3PIO A; 1QLY A; 3OY9 A; 2D1X A; 3CD6 A; 3QDF A; 3O5Z A; 4DBH A; 2DMO A; 1G3S A; 2A28 A; 1VQ9 Q; 1G3W A; 2F2V A; 1V1C A; 1IGQ A; 1EIF A; 1UGR B; 2QYZ A; 1R0B G; 3DLL A; 3QKJ A; 1B3Q A; 1RUW A; 2E4H A; 1FWZ A; 4RTU A; 1D1A A; 2RQT A; 1WHH A; 2W0Z A; 4A63 B; 2XU8 A; 3CCQ T; 1ABO A; 1Y71 A; 2AKL A; 3M55 A; 1F1B B; 1ZA1 B; 5GMK e; 2EGE A; 2FRY A; 2FEI A; 1VQK Q; 2KGT A; 2JZ2 A; 2CP0 A; 4QVC A; 5KYU B; 1YHQ T; 5CQX A; 1JO8 A; 2EKH A; 3C95 A; 1S72 A; 2XI9 A; 4FYX B; 3JCM g; 3OBY A; 4RG8 A; 3MP6 A; 4BI8 B; 4BUG A; 2P4R A; 1I5O B; 4FSS A; 3VU3 C; 2JTM A; 2LC4 A; 2FL7 A; 1QCF A; 4NL3 A; 1D1C A; 1VQ7 T; 3EGX A; 1SHF A; 4EMK B; 4M7D D; 2MWO A; 5ECA A; 2ROT A; 2KRS A; 1T3L A; 2EYQ A; 2O2O A; 1BI1 A; 1GFD A; 1BI3 A; 1K1Z A; 2DXT A; 4C0D C; 2LQK A; 1TWB A; 1G8X A; 2QAS A; 3CCM T; 1U8R A; 4JLG A; 5HY6 A; 3QG1 A; 4FW2 A; 1G83 A; 3P8D A; 2XDD A; 1RLQ C; 1GBQ A; 5M9O A; 1OPL A; 2L3S A; 2NUT B; 4KBM B; 3SDZ A; 1SG5 A; 4C5H A; 4FSX A; 3CCS A; 1M5Q 1; 3OYM A; 3BY7 A; 3JCM W; 5LJ3 h; 3VUZ A; 4WCI A; 1CSK A; 3SWN B; 1KG1 A; 1LPL A; 2KXD A; 3M9Q A; 3CME A; 1TOV A; 2PTK A; 4JRK A; 2XIC A; 2CP5 A; 4C8Q G; 3OYB A; 1PKS A; 1PD0 A; 1H64 1; 9ATC B; 5C6S A; 4IUR A; 4LUD A; 3PTA A; 1PRL C; 2BE7 D; 3ULR B; 1VQ5 T; 4GBQ A; 3VRZ A; 4N4I A; 4F7U G; 2V1R A; 3HHT B; 1I8F A; 4E6R A; 3HKS A; 2JTF A; 2BE9 B; 3TU4 K; 4JJN K; 2RNA A; 1KSW A; 2VGN A; 4C92 A; 1UE9 A; 4M78 A; 5KYY B; 1TUD A; 1Q82 C; 4JJD A; 4PLL A; 4E2F B; 2LT4 A; 1Y57 A; 4KUL A; 2JM9 A; 2J6F A; 4GLM A; 1UGQ B; 4M77 C; 3CCR T; 3MP8 A; 3CC7 A; 1Q86 C; 1K73 U; 3A8O B; 1GCQ C; 3L2Q A; 3QWY A; 2XK0 A; 2RH2 A; 4DA4 A; 1NZ9 A; 2HNI A; 3DB3 A; 5KYX B; 1ZHI A; 1HXD A; 4PFZ A; 3CCV Q; 2AT1 B; 5GAO l; 2VC8 A; 4M7A F; 2RI3 A; 4DOW A; 3G6E Q; 1M1G A; 4QQG A; 2KR3 A; 4OMM A; 1YJN A; 1I4K 1; 3LGL A; 3EG1 A; 4C92 G; 4QQD A; 4M78 G; 1JBM A; 3VS7 A; 1WQW A; 2HKQ B; 1BKB A; 3S6W A; 2CGH A; 2EBP A; 1WGS A; 4JRI A; 4EDU A; 4XQ3 A; 3VYH B; 2L3R A; 3OYI A; 2FRW A; 2QA4 A; 5IH2 A; 2EIF A; 5GAN j; 2J06 A; 2EWN A; 2NUP A; 5L8R E; 1O75 A; 3JAM E; 1K0X A; 3M56 A; 2F69 A; 3PMT A; 4IUU A; 4LDX A; 4R0K A; 4HVU A; 2FYK A; 3CMA T; 1BK2 A; 2CT4 A; 3FEO A; 1ZBJ A; 3JV3 A; 5CAI A; 1XTD A; 1TH7 A; 4RKU E; 4AFZ C; 3I35 A; 3S3N A; 1XJW B; 1VQ9 A; 3JB9 J; 3OSV A; 2EFI A; 3MET A; 3MKD A; 4GY5 A; 2QQA A; 1G5V A; 3HRU A; 5GAO q; 3H0F A; 5IAY A; 2QEX Q; 3FRN A; 2A7Y A; 3BDL A; 1E6G A; 2KY9 A; 1UEC A; 4KUI A; 1UJ0 A; 3EGX B; 5GAN f; 1WPY A; 1BU1 A; 1AWX A; 2C0I A; 1AZE A; 3AHU A; 3ZBD A; 4QQ6 A; 1KC8 R; 3MPU B; 2DL3 A; 1M1K U; 1X43 A; 1K8A C; 1VYT A; 3A5Z B; 2DZC A; 2GQV A; 2VWF A; 5GAM d; 1PHT A; 4C0F A; 1VQL A; 1ZUK A; 4IUV A; 3T9N A; 4A4H A; 1AZG B; 3UDC A; 3CCE A; 3S3M A; 3CCE T; 1QCO A; 4BDY A; 1OZ3 A; 5LJ5 j; 2VV5 A; 1FYN A; 1I0C A; 5KH6 A; 1VQP Q; 1VQO T; 1JU5 C; 4FYV B; 1BCM A; 2C0O A; 2FB7 A; 1TUC A; 3X25 B; 4FW1 A; 4FYY B; 1JQQ A; 3NTI A; 1N8R R; 1GCP A; 2OAW A; 2M9U A; 2JS0 A; 1AWO A; 5DM7 R; 1AOJ A; 2COY A; 1BCO A; 5HK0 A; 1IHV A; 2BKD N; 2EKO A; 3OYE A; 1YI2 A; 4L5G A; 5GAN 5; 3MEU A; 2X35 A; 3CCL A; 2KK4 A; 1RAE B; 5J3B A; 2CYZ B; 2ZPB B; 4FM4 B; 2NLU A; 2MMP A; 2ESW A; 2E12 A; 1VQ8 T; 2Z0W A; 1UDL A; 2EYW A; 4M75 C; 2HD0 A; 4M77 F; 4DBR A; 3VYG A; 3G4S T; 3VKI A; 2I2L A; 3M5A A; 3JB9 D; 3VUB A; 4J9I A; 2RN8 A; 4J9C A; 1BBZ A; 3HSB A; 4PL6 A; 2MI6 A; 2G6F X; 5DLO A; 1KD1 R; 2ED1 A; 2GCX A; 2OJ2 A; 2DD5 A; 1MV3 A; 3V7C A; 3OYK A; 1RI9 A; 2DJZ A; 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