The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
GSSGSSGNTYVALYKFVPQENEDLEMRPGDIITLLEDSNEDWWKGKIQDRIGFFPANFVQRLSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Protein Stac
|
| publication title |
Solution structure of the first SH3 domain of Stac protein
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
7
|
| structure length |
68
|
| sequence length |
68
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4E6R A; 2KEA A; 2OAW A; 4HXJ A; 4AFS C; 1Y0M A; 3M0P A; 1AWW A; 2K79 A; 3FJ5 A; 3UAT A; 1X2Q A; 2W10 A; 1VYU A; 1W70 A; 3GBQ A; 2CDT A; 4HVW A; 4IIM A; 1AZE A; 2DL7 A; 5FWB A; 1M3C A; 5ECA A; 1M27 C; 1WXT A; 1ZUK A; 1FYN A; 2J6K A; 2FG0 A; 2KRO A; 2LJ0 A; 1PRM C; 2JTE A; 2JM8 A; 4LUE A; 4CC2 A; 4F14 A; 4JJB A; 2ROT A; 1AWJ A; 2RMO A; 2RQV A; 3R6N A; 2BZY A; 3I5R A; 2FEI A; 5GJV B; 2RPN A; 5IXB A; 1TUD A; 3H41 A; 3VS7 A; 2OI3 A; 1WYX A; 4OMQ A; 2V1R A; 2SEM A; 3H0F A; 2DL8 A; 2A36 A; 1J3T A; 1WLP B; 1MV3 A; 4J9F A; 4OMM A; 3EHR A; 4RTT A; 3VS2 A; 2LX7 A; 1MV0 B; 3JV3 A; 3KFV A; 2KRM A; 2KBT A; 2EYX A; 2GQI A; 2YSQ A; 5EC7 A; 3EGU A; 1K0S A; 1XOV A; 1SRM A; 1UG1 A; 2HCK A; 1ZUY A; 1T3S A; 2JMA A; 3UF4 A; 1QCF A; 1X6G A; 4IIO A; 2HEQ A; 2O9S A; 1X6B A; 3O5Z A; 1MUZ A; 1S1N A; 3REB B; 3H0H A; 2LMJ A; 2RN8 A; 4J9C A; 1AWO A; 4K11 A; 3CQT A; 4J9H A; 2RNA A; 2EBP A; 3NGP A; 1WX6 A; 2YUO A; 1M3A A; 1NYF A; 1M3B A; 1ZBJ A; 1NEB A; 2P4R A; 4ESR A; 1U3O A; 5FW9 A; 1GBR A; 2L2P A; 1HJD A; 3THK A; 1AD5 A; 1OV3 A; 2C0T A; 2RQU A; 3H0I A; 2ED0 A; 2X3W D; 2YUN A; 4AFZ C; 2YUP A; 1YP5 A; 2KXD A; 2EQI A; 3REA B; 2L3S A; 2PZ1 A; 2DYB A; 1OPL A; 1CSK A; 2RF0 A; 4LN2 A; 4D8K A; 2EYW A; 3NHN A; 3TSZ A; 1K9A A; 2DF6 A; 2DL5 A; 5IHK A; 3EG1 A; 3QWX X; 1CKB A; 1E7O A; 2CT4 A; 2GTJ A; 4A63 B; 2JM9 A; 2J06 A; 1K1Z A; 2J6F A; 1TG0 A; 2DIL A; 1NEG A; 1PNJ A; 1JQQ A; 4HCK A; 2D0N A; 2EGE A; 4KRT A; 1Y57 A; 3M0U A; 1UHF A; 1RI9 A; 2O88 A; 2YT6 A; 2G6F X; 1PKS A; 2K9G A; 2KNB B; 3ULR B; 5IXF A; 2JMC A; 5GJW B; 1EFN A; 1G2B A; 4JZ4 A; 4RTZ A; 2FPE A; 2F2X A; 3UA6 A; 4RTV A; 5I22 A; 2PTK A; 2FRY A; 1KJW A; 5IH2 A; 1E6G A; 1YWP A; 2A28 A; 2EW3 A; 4OMP A; 4RUG A; 4R0K A; 2EYY A; 2MIO A; 1IO6 A; 2K6D A; 2K2M A; 2CH4 A; 1GCQ A; 4RTY A; 2KXC A; 2K7A A; 1NLO C; 2BTT A; 2DX1 A; 5FWC A; 4AFU C; 1QKW A; 1WI7 A; 1FMK A; 2ENM A; 3M0T A; 2CUD A; 1JXM A; 2LNH B; 3VS4 A; 2FRW A; 4X1V A; 2JW4 A; 2JS2 A; 4CC3 A; 2KYB A; 1M8M A; 1KIK A; 1X27 A; 2MCN A; 4CC4 B; 3EG3 A; 1B07 A; 2JS0 A; 4M4Z A; 4RTW A; 1GRI A; 4HVV A; 4J9B A; 1GCQ C; 1OPK A; 2DVJ A; 2ESW A; 1UJY A; 1UE9 A; 2K3B A; 2MOX A; 2HDA A; 3VS6 A; 1WDX A; 2VWF A; 1B3Q A; 3EG0 A; 2LZ6 B; 4LUD A; 5L23 A; 3LH5 A; 4DEX A; 1X2K A; 2H8H A; 2DMO A; 1UGV A; 3NPF A; 1ZSG A; 4AG2 C; 2VKN A; 3VRY A; 2DA9 A; 1RUW A; 2EKH A; 1GFC A; 1E6H A; 2F2W A; 4JJD A; 2EVR A; 1H3H A; 2GTO A; 1H8K A; 1QWE A; 4JZ3 A; 1JO8 A; 3RNJ A; 1SEM A; 3PE0 A; 1PRL C; 2AZS A; 1GL5 A; 2JT4 A; 2KRN A; 2XMF A; 2GNC A; 2CT3 A; 2F2V A; 2O31 A; 1X43 A; 1Z9Z A; 1YNZ A; 2DNU A; 2C0O A; 2L3Q A; 4J9G A; 1AWX A; 1UDL A; 2SRC A; 2QDL A; 1UHC A; 1SHG A; 2A37 A; 3IQL A; 5I11 A; 1YCS B; 2CUB A; 4AG1 C; 4J9I A; 1ZUU A; 2A08 A; 1SRL A; 3I35 A; 1QWF A; 1QKX A; 3I5S A; 1SPK A; 1X69 A; 1WXB A; 2DBM A; 1AZG B; 3VRZ A; 1WA7 A; 1BB9 A; 1V1C A; 1WFW A; 1UJ0 A; 2GBQ A; 1ARK A; 2C0I A; 1SHF A; 4ZNX A; 2M0Y A; 1JU5 C; 2AZV A; 2YUQ A; 1GCP A; 2CRE A; 2W0Z A; 2KR3 A; 2EGC A; 1GFD A; 2NUZ A; 2BZ8 A; 1K0X A; 2ABL A; 1ABO A; 1K4U S; 1BBZ A; 2LJ3 A; 2AKK A; 4Z89 A; 2DBK A; 1I07 A; 3A98 A; 1Z9Q A; 4JJC A; 2DM1 A; 1PHT A; 2DL4 A; 3QWY A; 1WIE A; 1YWO A; 1VYV A; 1UFF A; 2RQW A; 2DRM A; 2FPF A; 1KFZ A; 1A0N B; 4GBQ A; 4ORZ A; 1ZLM A; 2J05 A; 1HSQ A; 3EHQ A; 4LE9 A; 2OJ2 A; 4CC7 A; 3VS0 A; 4D8D A; 4JPB W; 1W6X A; 2DL3 A; 2PNI A; 2FPD A; 2GGR A; 1TUC A; 2LP5 A; 3VS1 A; 1AVZ C; 3UA7 A; 2KRS A; 2IIM A; 1T0J A; 2I0N A; 1SSH A; 4AFQ C; 1OEB A; 3EG2 A; 3C0C A; 1NLP C; 2NWM A; 4EIK A; 1U06 A; 1I0C A; 4F17 A; 4WCI A; 5HCK A; 3SHW A; 4DEY A; 3M0R A; 5IHI A; 2LQW A; 2CSQ A; 3VS3 A; 2AKL A; 2EYZ A; 2CH4 W; 3VS5 A; 1N5Z A; 2V1Q A; 1K76 A; 1I1J A; 2YDL A; 2KT1 A; 2DJQ A; 2M51 A; 1GBQ A; 2DRK A; 2D8J A; 2ROL A; 2VVK A; 4GLM A; 3PVL A; 2LCS A; 1AEY A; 2KGT A; 3RBB B; 2ECZ A; 2LJ1 A; 4RTU A; 2D1X A; 4FSS A; 1HD3 A; 4OMO A; 4RTX A; 2RQR A; 2EGA A; 1U5S A; 4J9E A; 4J9D A; 4QT7 A; 1NM7 A; 1LCK A; 4HVU A; 2O2O A; 2RQT A; 1YN8 A; 2DE0 X; 3TVT A; 1JEG A; 4OML A; 2HSP A; 1UTI A; 2O9V A; 3U23 A; 4Z88 A; 1M30 A; 1RLP C; 3ZL7 C; 3I9Q A; 1PWT A; 2EPD A; 1CKA A; 1ABQ A; 2ED1 A; 2KE9 A; 5IHN A; 1WXU A; 1OOT A; 1BU1 A; 1G83 A; 2J7I A; 2X3X D; 1RLQ C; 1KSW A; 1T3L A; 2KT8 A; 2AK5 A; 1W1F A; 3TSW A; 1AOJ A; 2JXB A; 1UUE A; 4F16 A; 4Z8A A; 3M0Q A; 1PKT A; 2CSI A; 1NG2 A; 1VYT A; 1UEC A; 4Y92 A; 2J6O A; 1NYG A; 1H92 A; 4LNP A; 3M0S A; 3SEM A; 2BZX A; 2E5K A; 2D8H A; 2FO0 A; 4OMN A; 1JXO A; 2HBW A; 1T0H A; 2B86 A; 1QLY A; 1ZX6 A; 3PVQ A; 2L3P A; 3NMZ C; 1BK2 A; 2DLP A; 2KYM A; 2L0A A; 1VA7 A; 2LQN A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4E6R A; 4HXJ A; 5GAM h; 4M75 G; 4AFS C; 1Y0M A; 4OF1 A; 2HQE A; 2M02 A; 2M9U A; 2OX7 A; 1QP3 A; 2AT1 B; 2ZCF B; 3GBQ A; 4IIM A; 2CDT A; 2VGM A; 1W2B A; 2DL7 A; 5FWB A; 1NJI R; 4B6M A; 1BKB A; 3EH1 A; 4ELZ C; 2RJE A; 2J6K A; 3JAM E; 3DKM A; 2KRO A; 2EYQ A; 5KH6 A; 3BE3 A; 4FYV B; 3OBW A; 2RMO A; 1SG5 A; 2RQV A; 3R6N A; 3I5R A; 4M77 E; 1VQK T; 4QQ6 A; 1TUD A; 1MMD A; 1M5Q 1; 3VS7 A; 2RHU A; 4KUD K; 3H0F A; 5GAO q; 4JJN K; 1WLP B; 3G71 T; 1G3W A; 4KBM B; 1Q81 U; 5D6Y A; 2FB7 A; 2XK0 A; 3NTI A; 4J7F A; 2KRM A; 2EYX A; 2GQI A; 3JCM V; 3OB9 A; 5KYY B; 3EGU A; 3G6E A; 4RMO A; 2K3Y A; 1SRM A; 1UG1 A; 2FL7 A; 2HCK A; 3CMA T; 4XU3 A; 1B34 B; 1YI2 T; 1T3S A; 2JMA A; 3L2W A; 5LJ3 e; 4IIO A; 2HEQ A; 5CCA A; 5GAN 8; 1X6B A; 1NPR A; 4AT1 B; 3UPU A; 1KC8 C; 1NJI U; 2GFA A; 3SDZ A; 2RN8 A; 2DTI A; 5D7U A; 3EGD A; 3OY9 A; 2PUK B; 3GPL A; 4J9H A; 1BCO A; 3GLX A; 2LTO A; 2EBP A; 3I55 T; 2XI9 A; 1TXQ A; 3PTA A; 5CKD A; 1TUG B; 1KQ2 A; 4OB1 B; 1HJD A; 1Q82 C; 4M77 G; 1XNI A; 3RUX A; 2LRQ A; 2LCL A; 1DJ7 B; 2YUP A; 1OU9 A; 3M54 A; 2KXD A; 2QTV A; 2PZ1 A; 1OPL A; 1CSK A; 2QAZ A; 2E1H A; 1K9A A; 4PFZ A; 1GXI E; 4M7A F; 1UEB A; 5IHK A; 1YBY A; 4M7D A; 1CKB A; 1E7O A; 2X4Y A; 1U1T A; 2J06 A; 4QVD A; 2FVU A; 4M75 F; 1WJS A; 2K3X A; 5AYF A; 4KRT A; 4IUQ A; 1RAC B; 3M0U A; 2WSE E; 1UHF A; 1D3B B; 2K5L A; 4XTU A; 2VUB A; 3WXM B; 2OTJ A; 3LH0 A; 4N0A A; 1YIT Q; 2K2V A; 2MAM A; 1FX7 A; 3RKX A; 2E6N A; 4M7D C; 3BDU A; 1VQN A; 4N4H A; 2QEX Q; 3QUI A; 2PTK A; 5IH2 A; 4OMP A; 3SD4 A; 1EZZ B; 2DEU A; 5FU7 B; 2LCC A; 2CH4 A; 1MGQ A; 1KQS A; 3L42 A; 4N0A C; 4ZN1 A; 1QVP A; 2BE7 D; 3M0T A; 2LNH B; 4X1V A; 1VQ9 Q; 2JW4 A; 2DXU A; 2JS2 A; 2KYB A; 5FU6 C; 1X27 A; 2KVQ G; 4CC4 B; 3EH2 A; 1GRI A; 2A3L A; 2DVJ A; 1BI1 A; 1UJY A; 1SSF A; 4XTW A; 1MMA A; 5KYX B; 1KD1 C; 3TQ7 P; 1B3Q A; 4RCB A; 3QZ5 B; 2XKO C; 1VQL Q; 2P0K A; 3F70 A; 3J81 E; 5GAM f; 4J6W A; 1KQ1 A; 1E6H A; 4BB7 A; 2F2W A; 2ZPH B; 1VQ7 Q; 4JJD A; 1H3H A; 1AT1 B; 1KHC A; 3MO8 A; 4EMH A; 3LW5 E; 2NUP A; 4FW2 A; 4A4E A; 4BI3 A; 4PJM A; 2AZS A; 4XK8 E; 5LJ3 j; 2XD0 A; 2F2V A; 1TOV A; 4X34 A; 1X43 A; 4J9G A; 3EGX B; 1SHG A; 1YCS B; 3MKD A; 3CXC P; 2CUB A; 1PD0 A; 4AG1 C; 5GAO n; 5IT9 E; 3E1S A; 4E2F B; 2CZ0 B; 1IRE B; 2DEQ A; 3I5S A; 1SPK A; 3OYI A; 2QK0 A; 4M7A A; 1RI0 A; 5FLX E; 1AZG B; 2DET A; 1Y7X A; 4M75 A; 2RHZ A; 1NBE B; 1VQP Q; 4C0G A; 1R77 A; 2DPP B; 3JB9 H; 2M0Y A; 1QVG A; 3P8D A; 1GCP A; 2QGF B; 5DY9 A; 3KUF A; 4MZP A; 4PNO A; 2Y4Y A; 2M1H A; 1K4U S; 4M7A C; 4OGE A; 4C92 B; 1YIJ Q; 2XID A; 2FZG B; 3LWI A; 2R57 A; 4M75 C; 1KG1 A; 3CCQ A; 4OB2 B; 1YJN A; 1FWZ A; 2DL4 A; 1YIT T; 3QJ6 A; 3JCM J; 1Q81 C; 2QEX T; 1RAH B; 1ZA1 B; 2RQW A; 4F04 B; 5DLO A; 3UWN A; 1ZLM A; 5LJ5 d; 3HSB A; 4CC7 A; 1D0Y A; 4D8D A; 1W6X A; 2DL3 A; 2H3J A; 3TU4 K; 2FPD A; 2E64 A; 2H3E B; 2LQ8 A; 5CQX A; 3VS1 A; 1F1B B; 1HXD A; 2CZ6 B; 1NJI C; 2I0N A; 2BUD A; 1SSH A; 1MMN A; 3C0C A; 5KYY A; 3CCJ A; 2E65 A; 4X9D A; 3OSS C; 1VQ9 T; 2E6Z A; 2VV5 A; 2FZK B; 2DIG A; 1B34 A; 3EG9 B; 5CQY A; 3G4S A; 3OYM A; 3MET A; 2RI5 A; 5IHI A; 1K8A R; 3CCV A; 9ATC B; 2HBP A; 3LWH A; 4P5N A; 1YHQ A; 3CCU Q; 3CC4 Q; 4A54 A; 3OYY A; 4FW1 A; 3A1P A; 2DJQ A; 2M51 A; 3S3O A; 4A53 A; 1O9S A; 5CAI A; 1VQL T; 2KGT A; 3LGL A; 2D1X A; 4FSS A; 4OVA A; 4RTX A; 4M77 A; 5GMK h; 1OU8 A; 4R55 A; 4J9D A; 4PJL A; 1VQ7 T; 4HVU A; 3EFS A; 2RQT A; 3M56 A; 1RAA B; 1TWB A; 3TVT A; 4BI4 A; 3C4S A; 4M78 B; 4M78 G; 2LX9 A; 1PWT A; 3P8H A; 2EPD A; 1ABQ A; 2ZPB B; 2F5K A; 1LNX A; 2RJF A; 3OYB A; 4C8Q B; 1OOT A; 1G83 A; 2VAS A; 2XDD A; 3OYL A; 2NUT B; 2VYT A; 1BIA A; 1W2B P; 2X3X D; 1RLQ C; 3CBP A; 3TSW A; 2AK5 A; 1AOJ A; 4J83 A; 4JUV A; 2E70 A; 1K8A U; 1VUB A; 1W4S A; 1UEC A; 2CP0 A; 2D9T A; 4BY6 B; 1D3B A; 3A8M B; 1VOM A; 3OS5 A; 1TH7 A; 4MMK A; 2QA4 A; 3MHX A; 4OMF B; 4C92 F; 2HBW A; 1M4Z A; 3INZ A; 1IRX A; 1WHM A; 1QLY A; 4EMK B; 1BI3 A; 1I8F A; 4V2S A; 1WGS A; 1QW1 A; 5GMK l; 1VQP T; 4PJO D; 1M1K R; 1MNE A; 2QXF A; 4HCB A; 2L0A A; 2DKG A; 3QJY A; 3HTR A; 2MYS A; 4JRP A; 2KEA A; 2OAW A; 3CXC A; 3HFO A; 1VQ5 Q; 2K79 A; 2MWP A; 2X4X A; 3FJ5 A; 3X25 B; 3OS2 A; 1YIJ T; 3QSU A; 1RAG B; 1X2Q A; 1N9R A; 4HVW A; 4QQD A; 4ATO A; 3I56 Q; 3CME A; 4LXC A; 3S6W A; 3C12 A; 4IUU A; 5FU7 C; 3ME9 A; 3A5Z B; 2JTE A; 2MI6 A; 4LUE A; 4JJB A; 3SB2 A; 4BE1 A; 1PCX A; 1XQH A; 1I81 A; 5GAN 2; 2C06 A; 1S72 Q; 5GAN 6; 5KCH A; 5GJV B; 5KYX A; 1RAE B; 2RPN A; 1WHL A; 4C5G A; 3CC7 Q; 2LC4 A; 3OW2 P; 2V1R A; 2SEM A; 2DL8 A; 1ZSZ B; 4NS5 A; 4OMM A; 1YJW Q; 3EHR A; 3ER0 A; 3JCM X; 2E5Q A; 3RIR A; 1M1K U; 4E7Z A; 2LX7 A; 1MV0 B; 4M77 D; 2KBT A; 5EC7 A; 5LJ3 d; 1HK9 A; 2XU8 A; 1RL2 A; 1XOV A; 3CCM Q; 1K73 R; 3CD6 A; 2WAC A; 2VGN A; 3CCU T; 3CC4 T; 1X6G A; 4LDY A; 4D6W A; 1S1N A; 2CP2 A; 2X51 A; 2YWW A; 4M75 E; 4M78 F; 3PNW C; 3JB9 D; 2EQM A; 3QO3 A; 4RCC A; 2O4X B; 2COZ A; 3EGX A; 2KQW A; 3CPW A; 2OAU A; 3CQT A; 4C8Q F; 7AT1 B; 3CCS Q; 1VQO A; 2CP5 A; 1NYF A; 3JCM e; 4J8O A; 1U3O A; 2F5T X; 4EPC A; 3MP8 A; 1AD5 A; 1WJQ A; 2AHJ B; 2RQU A; 2LT1 A; 2ZPG B; 3H0I A; 2YUN A; 1M2V B; 2HD0 A; 4HKE A; 4O5V A; 4MZT A; 2L3S A; 4LN2 A; 3QKJ A; 3T9N A; 3TSZ A; 1OYX A; 1KQS P; 2RK2 A; 3QWX X; 5I2M A; 2QQ9 A; 3CCL A; 2CT4 A; 2GTJ A; 1IXD A; 4A63 B; 2JTM A; 1FMW A; 2IG0 A; 2GFU A; 5I2S A; 1D0X A; 2J6F A; 2QQR A; 2DIL A; 1K73 U; 1NEG A; 4OB0 B; 1JQQ A; 2D0N A; 4HA8 A; 2EGE A; 4J5Y A; 1Y57 A; 2E3H A; 3PIP A; 3M55 A; 1RI9 A; 2O88 A; 3OBY A; 2JJ9 A; 3X28 B; 2YT6 A; 2G6F X; 2K9G A; 2KNB B; 4C5I A; 2JMC A; 3KBG A; 1G2B A; 3CCQ Q; 3J7A F; 2FPE A; 4C92 C; 1YJN Q; 2F2X A; 3ZEH A; 1YWP A; 4C0D B; 4C5E A; 4LDU A; 4RUG A; 2XIC A; 2JVV A; 2MIO A; 1VQ5 T; 2K2M A; 3SFM A; 4LDV A; 2K7A A; 2HZY A; 3FEO A; 3I56 T; 2DX1 A; 1X6O A; 3PIO A; 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