The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
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sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
TAGKIFRAMYDYMAADADEVSFKDGDAIINVQAIDEGWMYGTVQRTGRTGMLPANYVEAI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
NEBULIN
|
| publication title |
SH3 in muscles: solution structure of the SH3 domain from nebulin.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Sh3 domain
|
| total genus |
4
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-08-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1RLQ C; 1QWE A; 2KEA A; 1T0J A; 2DM1 A; 1RLP C; 1M3A A; 2F2V A; 1T0H A; 3QWX X; 2K79 A; 1I1J A; 1VYV A; 2ED1 A; 3NMZ C; 2YSQ A; 3NGP A; 2PZ1 A; 1U3O A; 1X2K A; 5IHI A; 2AK5 A; 1BK2 A; 1J3T A; 2F2W A; 1I0C A; 2RN8 A; 4Z8A A; 1JXM A; 2DJQ A; 1M30 A; 2RQW A; 5L23 A; 3THK A; 2SEM A; 2G6F X; 1X2Q A; 4J9H A; 1OEB A; 3SEM A; 2K9G A; 4CC3 A; 2EBP A; 2DRM A; 4HVU A; 4ZNX A; 2LZ6 B; 4Z89 A; 1ZUK A; 1N5Z A; 3EG1 A; 2CUB A; 2K2M A; 2YUO A; 2OI3 A; 4D8K A; 2EGC A; 2V1R A; 1GL5 A; 1CKA A; 1JEG A; 2DL4 A; 2RPN A; 2EVR A; 3VS5 A; 2K6D A; 1QWF A; 3NHN A; 1K4U S; 2CH4 A; 2QDL A; 1A0N B; 2VKN A; 1RI9 A; 2O2O A; 3PE0 A; 2CH4 W; 2J6F A; 1MV0 B; 1WIE A; 3M0S A; 2JM8 A; 3TVT A; 2JS0 A; 1X69 A; 2BTT A; 1AEY A; 4CC2 A; 2YUN A; 4RTW A; 2GNC A; 1PWT A; 1UGV A; 3NPF A; 2P4R A; 3PVQ A; 1BB9 A; 2NWM A; 2J7I A; 2JXB A; 4Y92 A; 2ESW A; 4JJC A; 1WLP B; 1W70 A; 5IXF A; 2CT3 A; 2AKK A; 2JMA A; 3VS1 A; 2EYW A; 1LCK A; 1ZBJ A; 1E7O A; 3U23 A; 1W6X A; 5IHK A; 2KT1 A; 4RTX A; 1E6G A; 2GQI A; 2IIM A; 1CSK A; 2KGT A; 4RTT A; 3REA B; 1ZX6 A; 3VRZ A; 1CKB A; 1OPK A; 2K7A A; 3VS3 A; 1GCQ C; 3ZL7 C; 2C0O A; 1ZUY A; 1UEC A; 1K9A A; 1WXT A; 3LH5 A; 1AVZ C; 1M27 C; 2CUD A; 1NLP C; 2GGR A; 4J9G A; 3M0P A; 1YWP A; 2MOX A; 3GBQ A; 4AFQ C; 1UG1 A; 2EPD A; 1ZSG A; 5I22 A; 4J9B A; 2D0N A; 2KT8 A; 4LE9 A; 3I5S A; 4R0K A; 2I0N A; 2O31 A; 2OAW A; 2X3W D; 1GFD A; 1T3L A; 4QT7 A; 1IO6 A; 4LN2 A; 5IHN A; 2ECZ A; 3A98 A; 2NUZ A; 4JZ4 A; 1BU1 A; 1V1C A; 3TSW A; 4JPB W; 2DA9 A; 4RTZ A; 2KXC A; 2RF0 A; 2SRC A; 1GBR A; 2LX7 A; 1JO8 A; 1K0S A; 2ABL A; 2YUQ A; 3M0U A; 2JM9 A; 2JTE A; 5EC7 A; 4OML A; 4D8D A; 4LUD A; 2CT4 A; 1WDX A; 1NLO C; 1GBQ A; 4J9D A; 4AFU C; 2PTK A; 4FSS A; 3SHW A; 3PVL A; 1EFN A; 2HDA A; 3UAT A; 3TSZ A; 4DEX A; 1I07 A; 3EGU A; 1HD3 A; 1MUZ A; 2JT4 A; 4RTU A; 4AG2 C; 2RMO A; 2XMF A; 1JQQ A; 2JW4 A; 3UA6 A; 2M0Y A; 1GFC A; 3H0H A; 4LUE A; 1H3H A; 3H0F A; 2LP5 A; 2GTJ A; 5IXB A; 1X6G A; 4WCI A; 2A36 A; 4J9F A; 1NG2 A; 1KSW A; 1TUD A; 2VWF A; 2J05 A; 2EW3 A; 3ULR B; 3M0Q A; 2DF6 A; 1K1Z A; 1YCS B; 1MV3 A; 2FPF A; 2EGE A; 2DIL A; 4ORZ A; 2RQV A; 1AZG B; 2B86 A; 2VVK A; 3EG2 A; 4J9I A; 1YN8 A; 1VYU A; 1X6B A; 1UJ0 A; 2DBK A; 2GTO A; 2KBT A; 2H8H A; 2EKH A; 2RQR A; 4GLM A; 4ESR A; 1B07 A; 4IIM A; 1AZE A; 1UE9 A; 5GJW B; 2DMO A; 3UA7 A; 2LMJ A; 2A37 A; 5I11 A; 2LQW A; 1GCQ A; 1M3C A; 1PRM C; 2JS2 A; 2FO0 A; 2KXD A; 2DL5 A; 2DYB A; 2DBM A; 1UHC A; 2KRN A; 2EYX A; 2YDL A; 2CDT A; 2BZX A; 2ROL A; 2YT6 A; 3H0I A; 4OMO A; 4OMQ A; 1PRL C; 1OV3 A; 1SHF A; 1PKS A; 4HXJ A; 4RUG A; 1M3B A; 2AZV A; 1Y0M A; 1VA7 A; 2ENM A; 4J9C A; 1Y57 A; 1WI7 A; 2FG0 A; 1JXO A; 3IQL A; 1GCP A; 1SHG A; 1WXB A; 3JV3 A; 1OOT A; 2PNI A; 4M4Z A; 1AOJ A; 1SPK A; 2LQN A; 2RNA A; 5IH2 A; 1VYT A; 1KJW A; 1G2B A; 2M51 A; 1BBZ A; 1UFF A; 4Z88 A; 1Z9Z A; 2MCN A; 2EGA A; 2KRO A; 4AFS C; 1QKW A; 2DVJ A; 2L3S A; 2E5K A; 2KE9 A; 2DE0 X; 1GRI A; 1QLY A; 5FWB A; 4J9E A; 4RTY A; 2DL3 A; 5ECA A; 3O5Z A; 1HJD A; 2L0A A; 2DLP A; 1NEG A; 2RQT A; 1W1F A; 2O9S A; 2RQU A; 2O88 A; 2D8H A; 3VS2 A; 1NYF A; 3VS7 A; 3VS4 A; 1QKX A; 2J6K A; 3I35 A; 1H8K A; 5FW9 A; 1YWO A; 3C0C A; 3R6N A; 2KYB A; 1SEM A; 1E6H A; 1AD5 A; 1YP5 A; 3RNJ A; 3I5R A; 1ZUU A; 3M0R A; 3VRY A; 3EHR A; 3EG0 A; 1QCF A; 1WXU A; 1KFZ A; 2GBQ A; 4CC7 A; 1X27 A; 1SRL A; 1S1N A; 4K11 A; 1ARK A; 1TG0 A; 2W0Z A; 2A28 A; 1X43 A; 2AKL A; 3VS0 A; 2KYM A; 1AWW A; 1OPL A; 1UUE A; 2JMC A; 2ED0 A; 2FRW A; 3M0T A; 2FEI A; 2L3P A; 4DEY A; 2D1X A; 1PHT A; 1G83 A; 4HVW A; 4CC4 B; 2LJ1 A; 2X3X D; 4E6R A; 1TUC A; 2HSP A; 4KRT A; 5HCK A; 1WYX A; 1RUW A; 2KR3 A; 2DNU A; 3UF4 A; 3CQT A; 2DRK A; 2J06 A; 1FYN A; 4JZ3 A; 2CSI A; 2LJ3 A; 1XOV A; 2HBW A; 2C0I A; 1Z9Q A; 1ZLM A; 1HSQ A; 1WA7 A; 4JJB A; 2DX1 A; 2AZS A; 1PNJ A; 4F17 A; 1AWX A; 3QWY A; 2LJ0 A; 2A08 A; 1UJY A; 1ABO A; 4RTV A; 1K76 A; 3REB B; 2KRM A; 2CSQ A; 2L2P A; 2YUP A; 2O9V A; 2FPD A; 1PKT A; 4OMN A; 3VS6 A; 1NEB A; 4EIK A; 2CRE A; 3EG3 A; 3RBB B; 4JJD A; 1ABQ A; 2BZY A; 1H92 A; 2C0T A; 4HVV A; 2BZ8 A; 1JU5 C; 2V1Q A; 1SSH A; 1M8M A; 4F16 A; 2K3B A; 1K0X A; 3I9Q A; 2OJ2 A; 1U5S A; 2KRS A; 2L3Q A; 1T3S A; 4OMM A; 4X1V A; 4AG1 C; 2DL8 A; 1AWJ A; 2LNH B; 4AFZ C; 4LNP A; 4A63 B; 1AWO A; 1UHF A; 1WFW A; 2LCS A; 2J6O A; 2KNB B; 2EQI A; 2MIO A; 2HEQ A; 4GBQ A; 1YNZ A; 4F14 A; 2ROT A; 3FJ5 A; 1NYG A; 3H41 A; 1WX6 A; 1FMK A; 2DL7 A; 4HCK A; 4OMP A; 3EHQ A; 2HCK A; 3KFV A; 2D8J A; 2FRY A; 1SRM A; 5GJV B; 1U06 A; 2W10 A; 1KIK A; 1NM7 A; 4IIO A; 5FWC A; 2EYY A; 2F2X A; 1UDL A; 1B3Q A; 1UTI A; 2EYZ A; 2FPE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1XJW B; 3DLM A; 4M78 A; 1T0J A; 2DM1 A; 4B6M A; 3PGG A; 4HCC A; 2F2V A; 2YRC A; 1VQO T; 3QWX X; 1I81 A; 2MAM A; 3GF5 A; 4XTY A; 3NMZ C; 2ED1 A; 1VQ5 Q; 3NGP A; 1U3O A; 4M77 B; 4L59 A; 1J3T A; 2F2W A; 2RN8 A; 4XTU A; 1NPR A; 1K73 U; 1D0X A; 2P84 A; 2RQW A; 1ZQ1 A; 2RD1 A; 2G6F X; 2QTV A; 3PMI A; 2QQB A; 4FL6 A; 3RES A; 1WQW A; 5GAM g; 2K2V A; 1KQS A; 2GFA A; 2DPP B; 1ZHI A; 1OYX A; 3EG1 A; 1N5Z A; 2CUB A; 1KD1 C; 1NE8 A; 4ZGD B; 4D8K A; 1JJ2 S; 5I21 A; 2V1R A; 2JJ9 A; 3OYK A; 1QVF P; 3AHU A; 2OTJ T; 4LDW A; 2Y90 A; 2HBP A; 4RCC A; 3I56 T; 5CQX A; 2M16 A; 4X9C A; 3M9Q A; 1MV0 B; 3MP1 A; 1LJO A; 1Q81 C; 1S72 Q; 4M7D F; 1X69 A; 4DA4 A; 3CD6 T; 4EMK B; 4PJO A; 1D3B A; 3S6W A; 2GNC A; 1PWT A; 4ATO A; 5GAN 5; 5LJ5 f; 4TVR A; 3CPF A; 4KT0 E; 2NWM A; 2J7I A; 3VUZ A; 1G3T A; 1SKU B; 2ESW A; 1W70 A; 5IXF A; 3QJY A; 2CT3 A; 2AKK A; 4N0A C; 2XDP A; 1E7O A; 3U23 A; 2CS7 A; 1UGQ B; 1BCO A; 2X4X A; 1E6G A; 3M56 A; 4RTX A; 2QK0 A; 1Y96 B; 2DD4 A; 2IIM A; 4BI8 B; 1ZX6 A; 4C8Q G; 2QQR A; 2V8K A; 1CKB A; 2ZPB B; 1YJW Q; 1GCQ C; 4M75 E; 2C0O A; 1UEC A; 1D1C A; 1WXT A; 4M77 C; 5KCO A; 4PJL A; 1NLP C; 3M0P A; 5GMK h; 5GAN j; 1WGS A; 4AFQ C; 3MP6 A; 2EPD A; 3C4S A; 4E47 A; 4J9B A; 2EJF A; 3EH1 A; 1M8V A; 1Q7Y R; 3JCM f; 2I0N A; 2E12 A; 3CMA A; 2DO3 A; 2KK4 A; 1IO6 A; 1Y07 A; 4IUR A; 5LJ3 j; 2QEX T; 2NUZ A; 3S3M A; 4O6J A; 1V1C A; 3TSW A; 4C8Q B; 2RF0 A; 2FB7 A; 3EGD A; 2LX7 A; 1JO8 A; 1Q95 G; 4B9W A; 1K0S A; 3CXC P; 2JM9 A; 3OBY A; 3VYG A; 4OML A; 5J3B A; 2FYK A; 2JN0 A; 4M78 G; 1NLO C; 3FC3 A; 4AFU C; 2A7Y A; 1VQO Q; 3LLR A; 1I07 A; 2X4J A; 1VQM T; 1MUZ A; 1LOJ A; 2PVD B; 2XMF A; 4Y28 E; 2JW4 A; 4RG8 A; 1GFC A; 3H0H A; 1PM3 A; 4EMK C; 1R77 A; 4QQD A; 5I2M A; 2DIQ A; 5GAM e; 4J9F A; 3NTI A; 2VUB A; 1VQ6 A; 3R6O A; 4C8Q D; 2EW3 A; 2JTF A; 2NYS A; 3PIP A; 3JB9 F; 5CAI A; 2RHX A; 1YCS B; 3L2R A; 3A8L B; 1JJ2 A; 1M9S A; 2VVK A; 4LD6 A; 2NUP A; 2E4H A; 1UJ0 A; 3QSU A; 1Q82 C; 4GLM A; 1BKB A; 1B07 A; 1VQ9 A; 1AZE A; 1UE9 A; 2DTI A; 5GJW B; 3CCV T; 1ZSZ A; 4QVD A; 4M7A G; 4FU6 A; 2P0K A; 4HT8 A; 1F1B B; 3HKS A; 2YXY A; 2DYB A; 5GMK l; 1DJ7 B; 3CCJ T; 4JS5 A; 1UHC A; 2E3I A; 3CCQ Q; 2DK3 A; 1PRL C; 4HXJ A; 2E1H A; 1I4K 1; 1X6O A; 2GQV A; 3A5Z B; 4FSX A; 4M78 D; 1VA7 A; 1M90 C; 3M53 A; 2JNG A; 3CCS T; 1Y57 A; 1OX9 A; 1NZ9 A; 5AYF A; 4C8Q C; 1VQ4 Q; 1JXO A; 1SHG A; 2XDD A; 5CCA A; 4XAX B; 4ANJ A; 5IH2 A; 1VYT A; 4M77 F; 3L2Z A; 2P4T A; 1K8A U; 2K5L A; 4Z88 A; 1R0C B; 2MCN A; 3OA6 A; 2HMA A; 1QKW A; 2L3S A; 2QAS A; 2E5K A; 2HQH A; 2KE9 A; 2DXB A; 4OB2 B; 3S3N A; 3E2U A; 4PLI A; 3V7R A; 3E19 A; 3TRE A; 2DD5 A; 2L0A A; 2DLP A; 4E7L A; 2RQT A; 2O9S A; 2RQU A; 4PJO B; 3WVD B; 3CC7 T; 1D3B B; 3VS2 A; 2DEQ A; 4NL2 A; 1H8K A; 5FW9 A; 1YWO A; 2X4W A; 3URG A; 2E5Q A; 5IT9 E; 3JCM h; 1QW1 A; 2YRD A; 3G6E A; 2EQJ A; 3RNJ A; 1ZUU A; 2GCX A; 1TTH B; 5CKB A; 1QCF A; 2CP3 A; 4E7S A; 1RL2 A; 2LX9 A; 1X27 A; 3QZ9 B; 1YBY A; 4J7I A; 3FIF A; 4M7A D; 2FZC B; 4KGZ B; 3GIB A; 4FW1 A; 2LRQ A; 4MZM A; 1YHQ Q; 3OS2 A; 1Y71 A; 2Y4Y A; 1UUE A; 2JMC A; 2VGN A; 5CKH A; 4CI0 C; 4X9D A; 3VV0 A; 5GAO r; 2EQM A; 2FEI A; 1NBE B; 5CIU A; 1TUG B; 1Q82 R; 2RI5 A; 1PHT A; 4CC4 B; 3CC2 Q; 1H3Z A; 2HSP A; 5HCK A; 3HSB A; 2DIG A; 3CCL T; 4FW2 A; 5D7U A; 2DNU A; 3UF4 A; 3CQT A; 1VQ8 A; 4BE0 A; 7AT1 B; 2J06 A; 4JZ3 A; 2WSE E; 3JCM W; 4CRI A; 1Z9Q A; 3OW2 A; 1Q86 C; 1AWX A; 2LJ0 A; 3CC4 T; 2A08 A; 4YTL A; 3EGD B; 4RKU E; 1N6A A; 2CSQ A; 3TCJ A; 1M90 R; 1O9S A; 1JBM A; 2FPD A; 1NEB A; 2CP6 A; 5GAN h; 1ABQ A; 4OP0 A; 3GLX A; 3EFR A; 1BIB A; 1M8M A; 1SSH A; 4FYY B; 2OJ2 A; 4RMO A; 2K3Y A; 2MK5 A; 3FB9 A; 5KYU B; 5LJ3 h; 2OTL T; 1MGQ A; 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3MHX A; 1N9S A; 1GXI E; 4Y92 A; 4JJC A; 1WLP B; 4M75 C; 2BIV A; 4L6V 5; 1RAE B; 2ZPF B; 4OB3 B; 1M1K U; 3MEV A; 5IN1 A; 1LCK A; 4E7I A; 2RI3 A; 4E7Z A; 3CC4 Q; 1W6X A; 4MZT A; 2M0O A; 2LQ8 A; 4PJO F; 4PFP A; 2M02 A; 3M4G A; 3VRZ A; 4M7A E; 1AT1 B; 5AT1 B; 1ZSZ C; 1KG1 A; 5GAM f; 3KBG A; 5KE3 A; 1U8R A; 4C92 D; 2VAS A; 5HK0 A; 3GP8 A; 3JRZ A; 3CCQ A; 2MOX A; 2F1L A; 3QBY A; 3L42 A; 3DB3 A; 1ZSG A; 5I22 A; 3CD6 A; 3I5S A; 3G1J A; 4R0K A; 2O31 A; 3SB2 A; 1T3L A; 4QT7 A; 4LN2 A; 2ECZ A; 1VQ4 A; 5LJ5 j; 1BU1 A; 5DLQ E; 4LDX A; 4JPB W; 4A54 A; 2DA9 A; 4RTZ A; 4BB7 A; 5A0D A; 3X28 B; 2SRC A; 2AIR B; 1B7T A; 1VOM A; 2YUQ A; 3MEA A; 1Q7Y C; 4D8D A; 3OYN A; 3EFS A; 4LUD A; 1OZ3 A; 2CT4 A; 2FHD A; 3OYG A; 3JCM Q; 1VQ8 Q; 3SHW A; 5FRN A; 3WVE B; 1V29 B; 1EFN A; 3UAT A; 4A4K A; 3OMG A; 1K8A R; 2DTO A; 2F5T X; 1HD3 A; 2R57 A; 4JJN K; 3O8V A; 2E41 A; 3CME Q; 2K4Y A; 8AT1 B; 4XK8 E; 1VQP Q; 4R56 A; 2M0Y A; 5GAN 7; 4F7U E; 1H3H A; 4II1 A; 1QVP A; 2OX7 A; 2RJE A; 1H64 1; 4J6Y A; 1KSW A; 1TUD A; 2VWF A; 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