The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
TAGKIFRAMYDYMAADADEVSFKDGDAIINVQAIDEGWMYGTVQRTGRTGMLPANYVEAI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
SH3 in muscles: solution structure of the SH3 domain from nebulin.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Sh3 domain
|
| molecule keywords |
NEBULIN
|
| total genus |
4
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-08-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1AD5 A; 1X6G A; 2ENM A; 1K4U S; 1UEC A; 2DL3 A; 3I35 A; 1KJW A; 1TG0 A; 2DBK A; 4OMN A; 2DRK A; 2KXD A; 1VA7 A; 2DLP A; 3TSZ A; 2XMF A; 1WLP B; 1BBZ A; 1UJ0 A; 2CUB A; 1GCQ C; 1YN8 A; 1U06 A; 2DL8 A; 1Y0M A; 1ZSG A; 1WI7 A; 2L3S A; 1UG1 A; 1E7O A; 1WA7 A; 1I1J A; 2IIM A; 3M0R A; 1KIK A; 2A28 A; 2EPD A; 3EHR A; 3ULR B; 2EYZ A; 1M3B A; 3VS1 A; 2KEA A; 2BZ8 A; 1H92 A; 2M51 A; 1PHT A; 1SRL A; 2DL7 A; 4OMP A; 4RTZ A; 2LQN A; 2CSI A; 3SEM A; 1KSW A; 2LNH B; 1WFW A; 1UGV A; 2M0Y A; 2V1R A; 2LJ0 A; 5IHN A; 1GCQ A; 2BTT A; 2DBM A; 3TVT A; 1YCS B; 1FYN A; 3GBQ A; 2HDA A; 1UE9 A; 3REB B; 1PRL C; 2DL5 A; 1G2B A; 1GBQ A; 2J6O A; 3KFV A; 1NYG A; 2KRN A; 2YUP A; 2EGC A; 2MCN A; 3QWY A; 4OML A; 4LUD A; 4WCI A; 5IXF A; 1JXO A; 1N5Z A; 1ZLM A; 3H0H A; 1SHF A; 1WDX A; 1QKW A; 2CT3 A; 3UA7 A; 2P4R A; 3H0I A; 1OPK A; 2VVK A; 4A63 B; 3VS0 A; 2K6D A; 5IH2 A; 1NLO C; 1JO8 A; 5I11 A; 2L3Q A; 2D0N A; 2ROL A; 2KBT A; 5L23 A; 5IHI A; 2RQR A; 1K1Z A; 2LQW A; 1PNJ A; 1A0N B; 3REA B; 1WXT A; 2KE9 A; 2CH4 A; 1UJY A; 2ED0 A; 2O31 A; 3VRY A; 1I0C A; 2SEM A; 2NWM A; 2V1Q A; 4FSS A; 2SRC A; 1K76 A; 2DF6 A; 2PNI A; 2K2M A; 1Y57 A; 3EG1 A; 2FRW A; 1B3Q A; 2F2V A; 2DM1 A; 3NPF A; 4LN2 A; 1NLP C; 1UHC A; 2JM9 A; 2JMA A; 4J9D A; 2X3W D; 1EFN A; 2J7I A; 3M0S A; 1SRM A; 2KGT A; 4AFZ C; 3RNJ A; 2VWF A; 3UA6 A; 1NEG A; 1ZBJ A; 3TSW A; 1QWE A; 2RF0 A; 1PWT A; 2K7A A; 2A37 A; 1GL5 A; 1B07 A; 1FMK A; 2LCS A; 3M0Q A; 3O5Z A; 4J9I A; 3VS2 A; 1PKT A; 3EGU A; 4RTW A; 4J9F A; 2JW4 A; 1JEG A; 2MIO A; 2ECZ A; 1CKA A; 2LP5 A; 2KR3 A; 1JQQ A; 1QKX A; 3SHW A; 2O88 A; 2EYY A; 1NEB A; 1I07 A; 2OI3 A; 1WX6 A; 1M30 A; 1Z9Z A; 1UFF A; 1NG2 A; 1X43 A; 4F16 A; 1W1F A; 2W10 A; 2PTK A; 1AZG B; 4CC4 B; 2FPD A; 1JU5 C; 3M0U A; 3EG3 A; 4D8K A; 5IHK A; 2ESW A; 4HVW A; 4RTV A; 1M27 C; 2FG0 A; 3IQL A; 2AZS A; 1LCK A; 4AFQ C; 2DYB A; 3I5S A; 2DJQ A; 2KYB A; 2ABL A; 3ZL7 C; 4IIO A; 3FJ5 A; 1UHF A; 2DE0 X; 2FPF A; 4OMM A; 4ZNX A; 2GTJ A; 3C0C A; 4RUG A; 2KRS A; 2EBP A; 2RQV A; 1OEB A; 1ZUY A; 2FRY A; 1YNZ A; 4GLM A; 1AZE A; 1QLY A; 1J3T A; 4Z89 A; 1X6B A; 1YP5 A; 1WYX A; 2AZV A; 1HSQ A; 5GJV B; 2HSP A; 3EG0 A; 3UAT A; 4IIM A; 4J9E A; 4KRT A; 1K9A A; 5EC7 A; 2AKL A; 1X2Q A; 2QDL A; 5FWC A; 2GGR A; 3VS4 A; 2NUZ A; 2PZ1 A; 3JV3 A; 4AFS C; 2F2X A; 1E6G A; 2C0I A; 2LMJ A; 3M0P A; 1X2K A; 1GCP A; 1ABQ A; 2F2W A; 1TUD A; 4Z88 A; 2KYM A; 1H8K A; 3NGP A; 2RNA A; 2D8J A; 3I9Q A; 2ED1 A; 4DEX A; 2W0Z A; 1T0J A; 1SHG A; 3M0T A; 4RTX A; 1AOJ A; 1MV3 A; 1QCF A; 3THK A; 2DA9 A; 2EQI A; 1HD3 A; 1JXM A; 2RQT A; 4F17 A; 1WXB A; 3PVL A; 4Y92 A; 2YT6 A; 1T3L A; 2D1X A; 2RPN A; 5FW9 A; 1ZX6 A; 1HJD A; 2JMC A; 1MUZ A; 4RTU A; 2CSQ A; 2GTO A; 1PKS A; 1GFC A; 4DEY A; 1U5S A; 4JJC A; 1X69 A; 2JM8 A; 2I0N A; 1RUW A; 2HEQ A; 4X1V A; 2O9S A; 2BZY A; 3LH5 A; 2A08 A; 2EYW A; 2J6F A; 1ABO A; 1BU1 A; 1BB9 A; 4J9C A; 1VYT A; 4OMO A; 2DX1 A; 2MOX A; 3I5R A; 2KNB B; 4JPB W; 2O2O A; 1VYV A; 1E6H A; 4GBQ A; 3NMZ C; 4CC2 A; 2EGE A; 5ECA A; 3R6N A; 3VS3 A; 4AG1 C; 1YWP A; 1G83 A; 2YSQ A; 2J6K A; 2B86 A; 4J9B A; 2FEI A; 4AG2 C; 1GBR A; 2H8H A; 2KRO A; 2GBQ A; 2OJ2 A; 1AEY A; 1UUE A; 2CUD A; 2EGA A; 1SEM A; 4ESR A; 2DL4 A; 3VS7 A; 1W6X A; 2D8H A; 1M3A A; 4EIK A; 1TUC A; 3UF4 A; 2OAW A; 1X27 A; 5IXB A; 1BK2 A; 4HXJ A; 1CSK A; 3EHQ A; 1AVZ C; 2YUN A; 3EG2 A; 3RBB B; 1S1N A; 2RQW A; 2JXB A; 1YWO A; 2DRM A; 2JS2 A; 3VS5 A; 2G6F X; 1PRM C; 4E6R A; 1ZUK A; 1ZUU A; 1T3S A; 1OV3 A; 2JS0 A; 1GFD A; 4ORZ A; 2C0O A; 4HCK A; 2K9G A; 2YDL A; 2J05 A; 1QWF A; 2A36 A; 2RQU A; 2FPE A; 4HVU A; 1RLP C; 1XOV A; 2RN8 A; 2EVR A; 1UDL A; 1SSH A; 4JJB A; 4RTY A; 3VS6 A; 1V1C A; 1W70 A; 3PE0 A; 2EKH A; 4JZ3 A; 1WXU A; 1T0H A; 1H3H A; 2DMO A; 2EYX A; 2ROT A; 1OOT A; 5GJW B; 2KT1 A; 2YUQ A; 4LE9 A; 3VRZ A; 1IO6 A; 2K79 A; 3H41 A; 2LJ3 A; 1GRI A; 1UTI A; 2HBW A; 5HCK A; 2AKK A; 2O9V A; 2J06 A; 2K3B A; 2E5K A; 1AWW A; 4CC3 A; 1M8M A; 2AK5 A; 2GNC A; 1ARK A; 2KXC A; 4CC7 A; 2DVJ A; 2JTE A; 2HCK A; 2BZX A; 1K0S A; 2GQI A; 1M3C A; 4AFU C; 4R0K A; 1AWX A; 3H0F A; 3CQT A; 2DIL A; 3A98 A; 1RI9 A; 1WIE A; 3PVQ A; 1K0X A; 4OMQ A; 4F14 A; 1NYF A; 4K11 A; 1SPK A; 4JJD A; 1CKB A; 1MV0 B; 5I22 A; 2LX7 A; 2LZ6 B; 2KT8 A; 4J9G A; 2FO0 A; 2X3X D; 4LNP A; 2CT4 A; 4RTT A; 2CH4 W; 4D8D A; 4QT7 A; 1NM7 A; 1KFZ A; 1RLQ C; 2LJ1 A; 1AWO A; 2L0A A; 2YUO A; 4J9H A; 2JT4 A; 2DNU A; 4M4Z A; 3QWX X; 4JZ4 A; 2KRM A; 2CRE A; 4Z8A A; 2L2P A; 5FWB A; 2VKN A; 4LUE A; 1U3O A; 1VYU A; 2CDT A; 2EW3 A; 1Z9Q A; 2L3P A; 3U23 A; 1OPL A; 3NHN A; 2C0T A; 4HVV A; 2RMO A; 1AWJ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OS5 A; 2ENM A; 2P0P A; 1EZZ B; 1B7T A; 3CC2 Q; 4EDU A; 1IGU A; 3E1S A; 4QQG A; 4BY6 B; 1K9M C; 3A8O B; 4N4G A; 1WLP B; 3V8K A; 3CBO A; 3CMA Q; 2KSS A; 1GCQ C; 3UWN A; 3CME T; 1YJ9 T; 3FJP A; 1VQ9 Q; 2A28 A; 4XTZ A; 3V7R A; 4LDV A; 3G6E T; 2X35 A; 1M3B A; 1WNL A; 2KEA A; 4LDW A; 1PCX A; 7AT1 B; 5I21 A; 2DL7 A; 4OMP A; 4PLL A; 4RTZ A; 2LQN A; 2V1R A; 4C8Q B; 4L5G A; 1BYM A; 4DBF A; 1FYN A; 2NUP B; 4A4H A; 2DEQ A; 1G3T A; 4M78 E; 2J6O A; 2KI7 A; 2KRN A; 3GPL A; 2EGC A; 1NPP A; 2MCN A; 3LWH A; 1D0X A; 3QDR B; 3CCL Q; 2QTX A; 4Q5W A; 1ZLM A; 2XI9 A; 3HP9 A; 4ZN1 A; 5GMK i; 3M56 A; 3OYH A; 1SHF A; 1TTH B; 2CT3 A; 3UA7 A; 2P4R A; 3OY9 A; 2K4Y A; 3C94 A; 2VVK A; 2WSF E; 1TUG B; 3CMA T; 3GIB A; 1NLO C; 1JO8 A; 5I11 A; 4M7A A; 1TXQ A; 1WHH A; 1KC8 C; 4M7D E; 3HRT A; 1M1K U; 1M1K R; 4C0D B; 1YHQ T; 1PNJ A; 1A0N B; 2RJC A; 3TEE A; 3OS1 A; 4KGX B; 4PJJ A; 2ED0 A; 5LJ5 e; 3TU4 K; 2V8I A; 3M5A A; 2NWM A; 3WXM B; 2LVM A; 3V7S A; 3G7Z A; 1K76 A; 2PNI A; 1YI2 Q; 4FYV B; 4LN2 A; 5DM7 R; 3VJP A; 1YIJ T; 1UGS B; 3QZ9 B; 2JJ9 A; 2X3W D; 3M53 A; 1XQH A; 2XDP A; 4PJO D; 3OA6 A; 1HYO A; 1OZ3 A; 3JCM V; 5HKC A; 1VQO A; 2E41 A; 3BE3 A; 1ZBJ A; 1QWE A; 3QYG B; 1Q82 U; 2OTL Q; 3S3O A; 2K7A A; 4M77 C; 1B07 A; 3PT9 A; 2LCS A; 3O5Z A; 3CCS T; 1D09 B; 1HK9 A; 3TCJ A; 2XHC A; 1N6A A; 2A0F B; 4J9F A; 1UEB A; 2JW4 A; 4BD3 A; 1QVF P; 2RB6 A; 4FW1 A; 2ECZ A; 3I56 Q; 1ZHI A; 4EPC A; 1KD1 U; 3CCM A; 4GY5 A; 3CBM A; 4NOY A; 1V76 A; 1VQ6 A; 3LWI A; 1I07 A; 3CCV A; 1Z9Z A; 1NG2 A; 2DD5 A; 4DBQ A; 2DJZ A; 4AMC A; 1WJQ A; 4JRK A; 1MMD A; 2A7Y A; 2DAQ A; 2QYZ A; 2LT1 A; 1K8A C; 3L2R A; 3PMT A; 4FW2 A; 5GAN 7; 1G8X A; 2HSE B; 2AZS A; 4AFQ C; 3MP8 A; 3LGL A; 3JB9 J; 3QII A; 1D0Z A; 5IAY A; 5KYU A; 1RAH B; 4BI8 B; 2GTJ A; 2ZPH B; 3JB9 I; 4RUG A; 3RMQ A; 1QLY A; 4M77 E; 1J3T A; 2E64 A; 3ZBD A; 4Z89 A; 1WHJ A; 1X6B A; 1WYX A; 2AZV A; 2OTJ Q; 1WHM A; 4RCB A; 2HSP A; 3EG0 A; 3UAT A; 4C92 B; 1VQ5 T; 3QUI A; 4A4K A; 3CXC S; 4KRT A; 4M78 F; 1U8R A; 5I2S A; 2VYT A; 4KUL A; 2RHZ A; 1OU9 A; 1D1A A; 1PD1 A; 2DET A; 2PZ1 A; 2F2X A; 1MND A; 1X2K A; 2F2W A; 1D1C A; 3HFO A; 3VYG A; 5GAN 2; 3NTI A; 2RJD A; 3UDC A; 5FU6 C; 2EFI A; 1SHG A; 2E10 A; 1QCN A; 1QCF A; 2K5I A; 4A4G A; 2EQI A; 1JXM A; 2E4H A; 2YXY A; 5IT9 E; 9ATC B; 2G3R A; 2E65 A; 3PVL A; 1T3L A; 2DO3 A; 2M0O A; 4C92 E; 2L5Q A; 1KC8 U; 1BI1 A; 1KD1 R; 5FW9 A; 1HJD A; 1MUZ A; 2CSQ A; 1VQL Q; 3BFM A; 1OZ2 A; 4VUB A; 3JRZ A; 1X69 A; 4KH0 B; 4RG2 A; 3GNF B; 2BE7 D; 5KYW A; 2BZY A; 2JNG A; 1O9S A; 2A08 A; 4XTV A; 2J6F A; 1ABO A; 1FWZ A; 2CP0 A; 4OMO A; 3I5R A; 4M78 C; 2MYS A; 3DLM A; 4JPB W; 5GAN 6; 2O01 E; 2B8A A; 1JBM A; 3BDL A; 2KY9 A; 4DBH A; 4J5Y A; 2YSQ A; 2XG8 D; 5KE2 A; 4DA4 A; 2ZZD A; 2B86 A; 4BUG A; 5KE3 A; 2MF2 A; 4J9B A; 3PIP A; 4AG2 C; 1YJW Q; 2H8H A; 5HK0 A; 2GBQ A; 2OJ2 A; 1WQ7 A; 1QVP A; 1SEM A; 2GQV A; 2P84 A; 4M75 C; 4ESR A; 3D7S B; 2D8H A; 4EIK A; 4F7U G; 1OYX A; 2LTO A; 1Y07 A; 2H3E B; 3VUZ A; 4LXC A; 2IG0 A; 3EG2 A; 3EGX B; 3M9Q A; 3RBB B; 4B9X A; 4ZGJ B; 2RQW A; 3CCV Q; 2JXB A; 2MWO A; 1NZ9 A; 3CPF A; 2VB6 A; 3VS5 A; 1PRM C; 5GAM f; 1TSF A; 3M55 A; 3G6E Q; 4E7H A; 2R58 A; 1GFD A; 2C0O A; 5KYN A; 2M16 A; 1ZSZ A; 2RQU A; 2EVR A; 1R77 A; 1SSH A; 4JJB A; 2LDM A; 2HBP A; 1WXU A; 1VQ6 T; 1T0H A; 4ZTJ A; 1WJR A; 2YRV A; 2DMO A; 2XIC A; 2KT1 A; 3MP6 A; 2IPO B; 1BI3 A; 2VV5 A; 2YUQ A; 4D6W A; 4R56 A; 3H41 A; 2E12 A; 1GRI A; 1M8V A; 2K3B A; 2E5K A; 1AWW A; 4M77 F; 5CCA A; 1G3Y A; 1W2B A; 3QXE B; 4M77 G; 1ARK A; 4MDW A; 2KXC A; 4IUU A; 3S3N A; 1VQ8 A; 1P92 A; 5D7U A; 1M3C A; 3OMC A; 1S72 A; 3CQT A; 4M77 A; 4IKF A; 1RI9 A; 1KK7 A; 1K0X A; 2DTI A; 1M1K C; 5GAO q; 3JCM g; 2OX7 A; 3OBY A; 5KYY A; 3MKD A; 1VQO Q; 3A8L B; 5KYW B; 3CD6 Q; 4J9G A; 3QHS A; 8AT1 B; 2AT1 B; 4PJN A; 2QG9 B; 4FT2 A; 3EGD A; 3OYY A; 2ZAE A; 5CK9 A; 1Q7Y R; 3OSS C; 5EG2 A; 3I55 Q; 1AWO A; 2L0A A; 5GAN g; 2DKG A; 4OP0 A; 2KRM A; 2CRE A; 5GAO m; 3MJX A; 3CCU Q; 5FWB A; 4F7U F; 1NPR A; 1QVG S; 1M90 C; 4LD6 A; 4HA8 A; 1IRX A; 5GAN d; 3U23 A; 4OMF B; 2K5F A; 3NHN A; 4E47 A; 3CCQ Q; 4ANJ A; 1QVG A; 2HKQ B; 1X6G A; 1K4U S; 2DL3 A; 2V8K A; 3I35 A; 4X9D A; 2E1H A; 1TG0 A; 2DBK A; 5HK3 A; 2RK1 A; 2KXD A; 1FXX A; 2FYK A; 2QQR A; 4CRI A; 1BBZ A; 4QVC A; 4F7U A; 1N9R A; 1UJ0 A; 1D0Y A; 1NBE B; 1MMG A; 4N0A C; 3CCU T; 1YN8 A; 1U06 A; 3GP8 A; 4CI0 C; 1WI7 A; 2ZCF B; 5LJ5 g; 1VQM A; 1I1J A; 3H9N A; 1KIK A; 2OTJ A; 4C92 A; 3VS1 A; 1N9S A; 3F70 A; 2V8J A; 2BZ8 A; 2M51 A; 3JB9 G; 3SEM A; 1KSW A; 2M0Y A; 3OW2 A; 3V8J A; 1GCQ A; 5GAN e; 3TVT A; 1YCS B; 2O4X B; 2RO0 A; 3GNG A; 2NLU A; 3GBQ A; 2P4T A; 3MCA B; 4NS5 A; 2HDA A; 3REB B; 3INZ A; 1PRL C; 4Y28 E; 2JTM A; 2YUP A; 3QWY A; 3LX7 A; 4WCI A; 5IXF A; 5FRN A; 4N0A A; 1N5Z A; 2PQW A; 2CP6 A; 1WZO A; 2Z0W A; 3ZFJ A; 1IRE B; 1QKW A; 4II1 A; 3A8H B; 4PFZ A; 1N8R C; 1Q7Y C; 2BIV A; 4A63 B; 3VS0 A; 5FU6 B; 5CQY A; 5KYY B; 2K57 A; 1YHQ A; 2L3Q A; 3TRE A; 2D0N A; 3N5B B; 4J7F A; 1M1G A; 5KCO A; 2KBT A; 2QGG A; 5L23 A; 8ATC B; 2LQW A; 1Y96 B; 2RHX A; 3L1A A; 1VQN T; 3BY7 A; 3JB9 D; 3J7A F; 4HKE A; 3H8Z A; 3VRY A; 4C0G A; 2HMA A; 5GAO l; 4C92 C; 4M7A C; 2DF6 A; 3CPW A; 3KBG A; 2FZK B; 1S72 Q; 2FRW A; 2F2V A; 3NPF A; 5GAN f; 2XDB A; 3JCM c; 1NLP C; 1UHC A; 4LDX A; 3OQ5 A; 2HAX A; 3M0S A; 4BE1 A; 1VQN A; 2KGT A; 4AFZ C; 3RNJ A; 2DIG A; 2K2V A; 1Q82 C; 4IUV A; 2D9T A; 2L8D A; 2LQ8 A; 2QA4 T; 4PK4 A; 4Y91 A; 2RI3 A; 2NUT A; 3M0Q A; 2VGN A; 5AT1 B; 3I55 A; 2KK4 A; 4JRQ A; 1PKT A; 3EGU A; 3QPH A; 1S72 T; 1OUL A; 1LOJ A; 2FZC B; 5GMK l; 4EMH A; 2GFA A; 4QVZ A; 3M57 A; 1CKA A; 3G6E A; 2LP5 A; 3FB9 A; 4FIB A; 5C6S A; 3OYF A; 3CCQ A; 1QKX A; 4M75 E; 3G1J A; 2XID A; 1FMV A; 1UFF A; 1X43 A; 1VQ7 A; 1W1F A; 2W10 A; 2PTK A; 1LNX A; 2E3I A; 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