The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
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sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
TAGKIFRAMYDYMAADADEVSFKDGDAIINVQAIDEGWMYGTVQRTGRTGMLPANYVEAI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
NEBULIN
|
| publication title |
SH3 in muscles: solution structure of the SH3 domain from nebulin.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Sh3 domain
|
| total genus |
4
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-08-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4AFZ C; 1M8M A; 3REA B; 2VKN A; 2CRE A; 2DYB A; 2HDA A; 3TSZ A; 2E5K A; 4RTV A; 2PZ1 A; 3QWX X; 4Z88 A; 1K4U S; 1GBR A; 1RUW A; 1NLO C; 2GTO A; 4LE9 A; 1ABQ A; 3EGU A; 5FWB A; 4F14 A; 1UFF A; 2DJQ A; 4IIM A; 3VS0 A; 2OI3 A; 3EHQ A; 1V1C A; 2CT4 A; 1AVZ C; 2DNU A; 3SEM A; 3THK A; 1WI7 A; 1KSW A; 1OV3 A; 2LNH B; 1NEB A; 2L3Q A; 2ECZ A; 3GBQ A; 1RLP C; 1UDL A; 3NPF A; 3PE0 A; 1NYF A; 2EYX A; 4GBQ A; 3UA7 A; 2GNC A; 1GL5 A; 1BBZ A; 2HBW A; 2O2O A; 4RTY A; 3UAT A; 2LX7 A; 2JS2 A; 2CDT A; 1I0C A; 1MV0 B; 2QDL A; 1ABO A; 2L2P A; 4HVV A; 4Z8A A; 1WIE A; 2DLP A; 1B07 A; 1HSQ A; 1AWO A; 3I9Q A; 4DEX A; 1AEY A; 4D8D A; 1W1F A; 2RNA A; 1OPK A; 2SRC A; 2JW4 A; 2X3W D; 2VWF A; 1M30 A; 3ZL7 C; 1QCF A; 2D1X A; 1ARK A; 3I5S A; 2YUP A; 2B86 A; 2K6D A; 2HCK A; 4EIK A; 1ZLM A; 1Z9Z A; 2ED1 A; 3H0F A; 2EQI A; 1K0X A; 2JXB A; 2KEA A; 1ZBJ A; 2W0Z A; 1ZUK A; 4RUG A; 4F17 A; 2LJ1 A; 3M0S A; 1N5Z A; 2GTJ A; 1PHT A; 1QLY A; 3VS7 A; 4LN2 A; 1IO6 A; 4OMN A; 1WXB A; 2KRO A; 2NUZ A; 2LCS A; 4X1V A; 3NHN A; 2YUO A; 1T0H A; 1GCQ A; 2ED0 A; 2KXD A; 2DRM A; 2CUB A; 2VVK A; 5ECA A; 2CT3 A; 2RMO A; 2C0I A; 3RBB B; 1SSH A; 2RPN A; 1ZUY A; 1EFN A; 4OMM A; 1E6H A; 5IHN A; 2JT4 A; 1YNZ A; 2CH4 A; 4J9H A; 3UA6 A; 2RQT A; 2DL4 A; 2CSQ A; 2EPD A; 2H8H A; 2FRY A; 4OML A; 1WX6 A; 4ORZ A; 2K2M A; 2KE9 A; 2GBQ A; 1UJ0 A; 1SRL A; 2FEI A; 3UF4 A; 2KRS A; 4LNP A; 3M0Q A; 4CC4 B; 1JQQ A; 1VYV A; 1PKS A; 5FW9 A; 2JM8 A; 3VS4 A; 2O88 A; 2RQU A; 2LJ3 A; 2F2V A; 3REB B; 1AZG B; 1S1N A; 1AOJ A; 2DVJ A; 5GJW B; 4HXJ A; 2A28 A; 1JO8 A; 2C0T A; 2EW3 A; 2EYZ A; 2DF6 A; 2EBP A; 2DBK A; 5HCK A; 1X6G A; 1G2B A; 2AKK A; 1UJY A; 1K76 A; 1HJD A; 4J9F A; 2XMF A; 1GCP A; 2MIO A; 1SPK A; 1W70 A; 2KT8 A; 3H0I A; 4Z89 A; 1A0N B; 2ESW A; 2P4R A; 3M0P A; 1WXU A; 1X69 A; 1JU5 C; 4CC3 A; 3ULR B; 3M0U A; 4FSS A; 2G6F X; 1VA7 A; 2RQV A; 1AD5 A; 3O5Z A; 1E6G A; 2J6F A; 4OMQ A; 1RI9 A; 3VS1 A; 2YSQ A; 1YWO A; 1KJW A; 1SRM A; 4HVW A; 1Y0M A; 1PWT A; 3LH5 A; 1YWP A; 1U3O A; 2CH4 W; 2DA9 A; 1UGV A; 4OMP A; 1SHF A; 2ROT A; 1GRI A; 4Y92 A; 5IHI A; 4J9D A; 1YN8 A; 2CSI A; 2JS0 A; 2CUD A; 1BB9 A; 1HD3 A; 1SHG A; 1UTI A; 2D0N A; 4KRT A; 4JPB W; 1X2K A; 4JZ3 A; 3VS2 A; 4J9E A; 1CKB A; 2MOX A; 2YDL A; 3VRY A; 4JZ4 A; 2LZ6 B; 1CSK A; 4LUD A; 3VRZ A; 5EC7 A; 2RQR A; 3PVQ A; 1U06 A; 2AZS A; 2AK5 A; 1H3H A; 4RTX A; 4K11 A; 2EYW A; 2YUQ A; 3KFV A; 1TUC A; 2L3S A; 1JXO A; 2M51 A; 2V1Q A; 1X27 A; 1RLQ C; 2EYY A; 2HEQ A; 1OOT A; 2EVR A; 2LMJ A; 2BTT A; 2LP5 A; 2DL8 A; 5I11 A; 1WXT A; 2F2W A; 4CC2 A; 2KRN A; 1UG1 A; 1UUE A; 2J7I A; 1I07 A; 1UHC A; 1PRL C; 1X43 A; 4ZNX A; 4E6R A; 2O31 A; 5IHK A; 1YCS B; 1B3Q A; 2FG0 A; 1ZX6 A; 1AWJ A; 2DX1 A; 1XOV A; 1BU1 A; 2DL7 A; 1WYX A; 2EKH A; 2EGE A; 1E7O A; 2M0Y A; 2DE0 X; 1J3T A; 1KFZ A; 2KYM A; 3VS5 A; 2F2X A; 3IQL A; 2FPD A; 2A37 A; 2FRW A; 1U5S A; 2RN8 A; 2D8J A; 1GFD A; 1NG2 A; 2K9G A; 1AWX A; 1PKT A; 2ABL A; 1GBQ A; 2BZ8 A; 2KYB A; 2KRM A; 1MV3 A; 2DMO A; 2FO0 A; 3TSW A; 1LCK A; 2OAW A; 2ROL A; 4J9C A; 4JJD A; 1H92 A; 2J06 A; 2KXC A; 3M0T A; 5IH2 A; 4DEY A; 3NGP A; 4HCK A; 1GFC A; 2SEM A; 1QKX A; 3EG3 A; 2A36 A; 3I5R A; 1JXM A; 2W10 A; 2LQW A; 4JJB A; 2KGT A; 4IIO A; 3FJ5 A; 2HSP A; 5L23 A; 3EG0 A; 4ESR A; 4RTU A; 1OPL A; 1UE9 A; 3I35 A; 2K7A A; 3QWY A; 1NYG A; 2FPF A; 1OEB A; 1QWF A; 1QKW A; 2IIM A; 1I1J A; 1T0J A; 2FPE A; 1TG0 A; 2PNI A; 1AZE A; 2JMA A; 3JV3 A; 3VS3 A; 4AFQ C; 1WA7 A; 2AZV A; 1Z9Q A; 3M0R A; 2ENM A; 1W6X A; 3RNJ A; 1GCQ C; 3CQT A; 4OMO A; 4RTZ A; 2YT6 A; 2DIL A; 2MCN A; 2DBM A; 4RTT A; 1M3B A; 2K79 A; 2A08 A; 1PRM C; 1VYT A; 2RF0 A; 1K1Z A; 2AKL A; 2YUN A; 4AFS C; 5I22 A; 2I0N A; 1FMK A; 2L0A A; 2DRK A; 1KIK A; 2DL5 A; 4R0K A; 2O9S A; 1G83 A; 1WLP B; 4AG2 C; 3A98 A; 1T3L A; 4JJC A; 2O9V A; 1X6B A; 2KR3 A; 3EHR A; 2L3P A; 2LJ0 A; 4J9G A; 1M3A A; 1NLP C; 1Y57 A; 2JM9 A; 1UHF A; 3NMZ C; 5GJV B; 2GGR A; 1M27 C; 2X3X D; 3TVT A; 3C0C A; 4LUE A; 4A63 B; 1H8K A; 2GQI A; 5FWC A; 5IXB A; 2KNB B; 2LQN A; 4AFU C; 1K0S A; 4J9I A; 1WDX A; 4CC7 A; 2KT1 A; 4QT7 A; 2PTK A; 1X2Q A; 1JEG A; 1NM7 A; 5IXF A; 3R6N A; 4F16 A; 2EGC A; 2J6O A; 1CKA A; 3H41 A; 3H0H A; 2C0O A; 1MUZ A; 2J05 A; 2BZY A; 4D8K A; 3U23 A; 1PNJ A; 1AWW A; 4AG1 C; 4HVU A; 3SHW A; 2KBT A; 2EGA A; 3EG1 A; 4M4Z A; 1VYU A; 2J6K A; 1T3S A; 1ZUU A; 2K3B A; 2JMC A; 1FYN A; 2OJ2 A; 2NWM A; 1SEM A; 4WCI A; 2D8H A; 4J9B A; 1WFW A; 1NEG A; 2BZX A; 3EG2 A; 1QWE A; 2V1R A; 1M3C A; 1K9A A; 4GLM A; 1TUD A; 3PVL A; 4RTW A; 1ZSG A; 1BK2 A; 2DL3 A; 2RQW A; 2JTE A; 1UEC A; 2DM1 A; 1YP5 A; 3VS6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1G3Y A; 1M8M A; 3REA B; 3OS0 A; 2A0F B; 2E5K A; 4RTV A; 2LX9 A; 4XAX B; 5I2M A; 3S3N A; 4HCZ A; 1GBR A; 1EX4 A; 2KMT A; 1G3T A; 1NLO C; 3CC4 T; 4EMG A; 1IXD A; 4ELY C; 1MND A; 5IAY A; 2LQK A; 4B9W A; 3EHQ A; 4MZP A; 2CT4 A; 3PNW C; 4ME7 A; 4J6W A; 3THK A; 2WSF E; 1MHN A; 5LJ5 g; 1NEB A; 2HAX A; 1RLP C; 4IKF A; 1NYF A; 5KYX A; 3I56 Q; 3A5Z B; 2DTH A; 5HK3 A; 1YIT T; 2HBW A; 1K9M U; 1R0C B; 5J39 A; 2CDT A; 2YLB A; 4ELZ C; 4HVV A; 4Z8A A; 2P0Q A; 2DLP A; 2CZ1 B; 4UC4 A; 3I9Q A; 2X4J A; 1AEY A; 2V26 A; 4D8D A; 3MEA A; 3KBG A; 4R56 A; 2SRC A; 1M30 A; 3I5S A; 2DD5 A; 3MCA B; 4EIK A; 3CXC A; 4A4E A; 1JJ2 A; 3PFS A; 2EAY A; 4A4G A; 3QDR B; 2X51 A; 1YFN A; 3QZ5 B; 3JRZ A; 4MDX A; 4M7A G; 2LJ1 A; 1Y96 A; 1N5Z A; 4E7L A; 4DBH A; 1QLY A; 4XQ3 A; 1VQ4 T; 3EFO A; 4EMK A; 1IO6 A; 3RR6 A; 2DET A; 1UGQ B; 1BI3 A; 1QCN A; 1YJN T; 4M7D D; 4PKC C; 3CD6 Q; 3FJP A; 1UGS B; 2YUO A; 1VQP A; 2CUB A; 2YRC A; 4C8Q B; 4IUV A; 1U8R A; 2C0I A; 3OSS C; 3CCV Q; 4C92 D; 3CC4 A; 1YI2 A; 1TUG B; 5FU7 C; 4ZGD B; 3LH0 A; 1VQO Q; 2RQT A; 2DL4 A; 2H8H A; 2FRY A; 3CC2 Q; 2JTM A; 3VUB A; 2KE9 A; 1Y07 A; 4LDV A; 2P84 A; 3QJ6 A; 3MHX A; 3C94 A; 5EG2 A; 5LJ5 e; 1YIT A; 2YXY A; 3NTH A; 1VYV A; 2PUO B; 3F70 A; 2D6F A; 1YJ9 T; 2RQU A; 2JVV A; 2NUT B; 3REB B; 2Z0W A; 2DVJ A; 4C92 B; 2HD0 A; 5IN1 A; 3HRT A; 1BIA A; 1N8R R; 1YIJ Q; 4ZGE B; 3FEO A; 2BUD A; 4N4G A; 2EBP A; 2RB6 A; 2O4X B; 2DBK A; 2R5A A; 3OB9 A; 4F7U E; 2L5Q A; 1M1K C; 4IUU A; 2KT8 A; 1VQ8 Q; 4A53 A; 2VAS A; 3H0I A; 1Q86 U; 3JCM P; 3URG A; 4ZTJ A; 3UPU A; 1WXU A; 4KH1 B; 4CC3 A; 4RKU E; 4FSS A; 3MP8 A; 1YJN A; 2RJE A; 3OYL A; 3G6E T; 5DM7 R; 3OW2 P; 1RAG B; 4OMQ A; 1RI9 A; 1LOJ A; 1YWO A; 1OZ3 A; 1PWT A; 2K3Y A; 5J3B A; 1U3O A; 2QEX Q; 1M8V A; 3BE3 A; 4OMP A; 4NL3 A; 1RL2 A; 1BCM A; 1KD1 U; 1RAF B; 3LWI A; 2KSS A; 4J9D A; 3CCJ A; 5LJ5 f; 4KRT A; 2CUD A; 1SHG A; 1UTI A; 2D0N A; 2K4Y A; 2QK0 A; 2EJ9 A; 3QII A; 3A8H B; 4XTU A; 4LXC A; 4JZ3 A; 4C5I A; 2Y90 A; 1HK9 A; 4KH0 B; 2P4T A; 4LUD A; 2OTJ T; 2DPP B; 5EC7 A; 2RQR A; 5CK9 A; 1WHM A; 2AK5 A; 4YTL A; 4N0A A; 1H3H A; 3OYY A; 2EYW A; 4FT2 A; 1D1B A; 1ACM B; 3JSC A; 4ZGJ B; 2LDM A; 4ZN3 A; 3JB9 H; 3I55 T; 3QDF A; 3CMA Q; 2L3S A; 1JXO A; 2V1Q A; 3J7A F; 1RLQ C; 3OYJ A; 2DAQ A; 2K5I A; 2YRV A; 1NZ9 A; 2EYY A; 1OOT A; 2LMJ A; 4XTV A; 1QVF A; 2K3X A; 2LRQ A; 3L2Q A; 1WXT A; 1VQ7 Q; 1OZ2 A; 3RIR A; 4CC2 A; 3MO8 A; 2KRN A; 4EMH A; 1PRL C; 2IG0 A; 2E6Z A; 2KQW A; 1WJR A; 2ZCF B; 4E2F B; 3QUI A; 3V8K A; 1XOV A; 3ER0 A; 1WYX A; 2K5L A; 1E7O A; 4OB3 B; 2M0Y A; 1VQN A; 3VS5 A; 2F2X A; 1KC8 R; 5FU6 B; 2FPD A; 4ZTF A; 2A37 A; 2FRW A; 1U5S A; 2D8J A; 3TQ7 P; 2C06 A; 3RKW A; 1VQK Q; 2KYB A; 1QVG A; 4J9C A; 2MK5 A; 1LNX A; 3L42 A; 4LDU A; 4HCK A; 2W10 A; 4EPC A; 4BD3 A; 2VGN A; 2KGT A; 4IIO A; 2CZ0 B; 2QQS A; 3GPL A; 1PD0 A; 3FJ5 A; 4ESR A; 2AT1 B; 3CCU T; 4E7Z A; 1OPL A; 3JB9 F; 5KCH A; 2XDD A; 1VQ5 T; 1OEB A; 3OYE A; 2OTJ A; 2FPE A; 1TG0 A; 2PNI A; 4EMK C; 1RAD B; 2JMA A; 1V29 B; 4BY6 C; 2YHT A; 1Q82 C; 4AFQ C; 3I56 T; 5CR2 A; 4PJO D; 4ZN1 A; 3I55 A; 3LGF A; 4KGV B; 2QA4 T; 2MCN A; 1RAH B; 5KYW A; 3GF5 A; 1M3B A; 2A08 A; 2CP5 A; 1VYT A; 2E3I A; 2YUN A; 5I22 A; 3G4S A; 2L0A A; 1P92 A; 3M56 A; 1OU9 A; 3E9F A; 1G83 A; 4WF2 A; 3RDV A; 4AG2 C; 3A98 A; 2O9V A; 3SFM A; 4N4H A; 3EGX B; 1X01 A; 3EHR A; 2LJ0 A; 4J9G A; 3ZFJ A; 4M78 F; 2FZG B; 1K9M R; 1U1S A; 1NPP A; 4C8Q A; 1AT1 B; 3H9N A; 4PJO B; 2HMA A; 2RHI A; 1YCY A; 2GQI A; 1YBY A; 5GAN 4; 1I4K 1; 4J9I A; 2DZ9 A; 3EFR A; 4DOV A; 1PD1 A; 4QT7 A; 1ZSZ B; 2PTK A; 3CCR Q; 3CCV T; 5CIU A; 3R6N A; 4KGZ B; 4F16 A; 2MF2 A; 4J7I A; 3H41 A; 9ATC B; 5KYU B; 1WGS A; 4JRI A; 1MUZ A; 3CC2 T; 2QAZ A; 3OA6 A; 3RER A; 2E41 A; 2NUT A; 4D8K A; 4PJJ A; 1K73 C; 1W2B A; 2K5F A; 1C6V X; 4HVU A; 1BYM A; 4L6V 5; 4C92 A; 5KE2 A; 2ZGW A; 2EGA A; 5CQX A; 3I56 A; 1XNI A; 1T3S A; 4HT9 A; 2E4H A; 2O01 E; 3OMG A; 2O4X A; 4F7U A; 2DIQ A; 1SEM A; 2JNG A; 3OYI A; 3GP8 A; 2ATC B; 4J7F A; 2DXU A; 2BZX A; 2MAM A; 1M3C A; 1TUD A; 1ZSG A; 2RQW A; 4BI3 A; 2JTE A; 3A8M B; 2KVQ G; 1YP5 A; 1UB4 A; 2VKN A; 2DTI A; 2HDA A; 4N4I A; 2XU8 A; 1YJW Q; 3X24 B; 4JS4 A; 1VQ8 T; 3UT1 A; 2OTL Q; 2V8I A; 3X25 B; 2JJ9 A; 1ABQ A; 3EGU A; 5FWB A; 4F14 A; 4M78 C; 2DJQ A; 2ZPH B; 4IIM A; 3OBW A; 1K8A C; 3EG9 B; 2JZ2 A; 4C8Q G; 1D0Z A; 4M77 D; 3CD6 A; 1AVZ C; 4C0Z A; 5GAN 6; 4OB0 B; 3CXC P; 3PMT A; 1JJ2 P; 5LL6 S; 1KSW A; 3KUF A; 2L3Q A; 1TTH B; 1UDL A; 4Q5W A; 3CPF A; 2QQB A; 4GBQ A; 3CCV A; 3PT9 A; 2QEX T; 2RJF A; 4RTY A; 3UAT A; 2JUF A; 1VQO A; 1ABO A; 1FX7 A; 3OYM A; 3CC2 A; 4KT0 E; 5LJ5 j; 1AWO A; 4DEX A; 4CI0 C; 5D7U A; 1W1F A; 3PGG A; 1OPK A; 1PC0 A; 5GAO p; 2VWF A; 3ZL7 C; 5GAN d; 1ARK A; 1BI0 A; 1N9R A; 4OF1 A; 1Z9Z A; 3VYG A; 4F04 B; 3NFC A; 2JXB A; 3MPU B; 2GQV A; 3L2R A; 2RI2 A; 2W0Z A; 4RUG A; 5LJ5 d; 2LTO A; 4XU1 A; 1Q81 C; 1KD1 R; 2GTJ A; 4F7U G; 3CMA T; 3VS7 A; 1YIJ A; 3FRN A; 1W4S A; 5GAO m; 1JB0 E; 4X1V A; 2E10 A; 4A4F A; 4M7D F; 1T0H A; 2KXD A; 1SF9 A; 1RAI B; 1YHQ Q; 3WVD B; 2RM4 A; 4M78 B; 4BDY A; 1VQ8 A; 4J5Y A; 3PIO A; 4PJN A; 4C92 F; 5GAO r; 2PVD B; 5IHN A; 2RH2 A; 2CS7 A; 4O5V A; 1VUB A; 2D0Q B; 5GAN 5; 1B34 B; 1SRL A; 1ZA1 B; 2FEI A; 2E6N A; 4LNP A; 2QEX A; 1PM3 A; 4J8O A; 4QVC A; 2RHU A; 1VQK T; 3JCM Q; 1VQ6 Q; 1PKS A; 4JRK A; 3OS2 A; 1RAB B; 2JM8 A; 4M75 D; 2O88 A; 1JBM A; 1AZG B; 3FLG A; 1VQP T; 1AOJ A; 2FHD A; 3OYC A; 4HXJ A; 2C0T A; 1JO8 A; 3SD4 A; 2EW3 A; 1IGQ A; 3JCM W; 2EYZ A; 2DF6 A; 3VV0 A; 4C8Q C; 2HQX A; 1YI2 T; 1BI2 A; 1KHC A; 3CCM Q; 2AKK A; 2HSE B; 3P8D A; 4C5E A; 1UJY A; 1K76 A; 2F1L A; 4J9F A; 1IHW A; 2XMF A; 1LVK A; 1SPK A; 1V76 A; 3RES A; 3WVE B; 5KYN A; 4BDZ A; 2HL5 C; 2CKK A; 4VUB A; 4EDU A; 3M0P A; 3CMA A; 5GAN 7; 4A4K A; 1M2V A; 1HXD A; 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