The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
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sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
TAGKIFRAMYDYMAADADEVSFKDGDAIINVQAIDEGWMYGTVQRTGRTGMLPANYVEAI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Sh3 domain
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
SH3 in muscles: solution structure of the SH3 domain from nebulin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
NEBULIN
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| total genus |
4
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-08-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3M0U A; 2JS0 A; 3NMZ C; 2BZ8 A; 2EYX A; 4J9C A; 4DEY A; 2XMF A; 3SHW A; 1QCF A; 2M51 A; 1H3H A; 3RNJ A; 4IIO A; 1WI7 A; 2EGA A; 1JQQ A; 1G83 A; 4RTX A; 3UF4 A; 4FSS A; 4RTZ A; 3C0C A; 4GLM A; 4LUE A; 4A63 B; 1UHC A; 5ECA A; 4Y92 A; 2CSI A; 2F2X A; 1PHT A; 1KSW A; 1WXU A; 1OEB A; 2CUD A; 3CQT A; 1NEG A; 2PTK A; 2CH4 W; 3I9Q A; 1RLP C; 2J6F A; 2RPN A; 2LP5 A; 4AG1 C; 5IH2 A; 3M0T A; 5IHK A; 1H8K A; 4X1V A; 3VS3 A; 3KFV A; 1GCQ C; 1YN8 A; 1E6G A; 2FEI A; 1QKX A; 4CC4 B; 2C0T A; 2AK5 A; 2LZ6 B; 3UA6 A; 2ROL A; 2YSQ A; 2RQR A; 2LQW A; 1A0N B; 2BZY A; 4RTT A; 2OJ2 A; 1T3S A; 2ENM A; 4RTU A; 1HJD A; 2LMJ A; 2EGE A; 1RI9 A; 3EG0 A; 2V1R A; 2KBT A; 2YUQ A; 2YUN A; 2JW4 A; 1OPL A; 1VYV A; 4EIK A; 2DLP A; 1CKB A; 2MCN A; 1GFD A; 1SHF A; 2LNH B; 1WXT A; 1QLY A; 4D8D A; 1ZSG A; 2J6K A; 4HVW A; 1ARK A; 2M0Y A; 1ZUK A; 2ED1 A; 3ZL7 C; 2DYB A; 2RNA A; 1W1F A; 1UGV A; 3REB B; 2RQV A; 4JZ3 A; 1K4U S; 4R0K A; 2ED0 A; 2KRM A; 2DL5 A; 1T0H A; 4CC3 A; 2EW3 A; 2KYM A; 1B07 A; 2DF6 A; 5GJW B; 3M0Q A; 4LE9 A; 1CKA A; 4RUG A; 2CT3 A; 2O2O A; 1EFN A; 2MIO A; 4WCI A; 5FWB A; 2J05 A; 1SRL A; 4OMN A; 2L3S A; 1PWT A; 2X3X D; 1M3A A; 5IHI A; 1WX6 A; 3RBB B; 1JEG A; 2KYB A; 3H0F A; 2L2P A; 4RTY A; 3VS7 A; 2J7I A; 1X6G A; 1AD5 A; 2FO0 A; 4OMO A; 1M27 C; 2KR3 A; 2BZX A; 2SRC A; 1RUW A; 1T0J A; 1GBQ A; 1AWJ A; 1PRL C; 3GBQ A; 1WFW A; 2FRY A; 1LCK A; 4HCK A; 4DEX A; 4QT7 A; 4J9B A; 1E7O A; 3THK A; 2CH4 A; 3JV3 A; 5IXF A; 2GTJ A; 2B86 A; 3UAT A; 4F17 A; 4J9H A; 2DL8 A; 4Z89 A; 4OMQ A; 1GCQ A; 4HXJ A; 3EG1 A; 1ABO A; 2DX1 A; 1BB9 A; 1M30 A; 1OOT A; 2LJ3 A; 2KGT A; 1S1N A; 1MUZ A; 1W6X A; 1X27 A; 3I35 A; 1M8M A; 1UEC A; 1WIE A; 4Z88 A; 1U06 A; 3EG2 A; 1UJ0 A; 1Z9Z A; 2F2V A; 2L3Q A; 2D8J A; 4RTW A; 2EYY A; 1YWO A; 1PNJ A; 3QWY A; 4E6R A; 2GBQ A; 2BTT A; 1AZG B; 2DA9 A; 2KT8 A; 2RN8 A; 2RMO A; 1Z9Q A; 2YDL A; 2DRK A; 2J06 A; 4GBQ A; 2DL3 A; 4HVV A; 2AZV A; 5IHN A; 1UHF A; 1HD3 A; 4KRT A; 2LX7 A; 2VVK A; 1TUC A; 2KNB B; 1WDX A; 2D1X A; 1ZUU A; 4OML A; 1TG0 A; 4OMM A; 4ESR A; 3H0I A; 1AVZ C; 2RQW A; 2K79 A; 1PRM C; 3TSW A; 4AFQ C; 1UTI A; 1KJW A; 3REA B; 2CT4 A; 1CSK A; 2I0N A; 2DMO A; 1K76 A; 2CRE A; 2LQN A; 1SRM A; 3O5Z A; 2KRN A; 2V1Q A; 3H41 A; 3R6N A; 3VRY A; 1YWP A; 1YP5 A; 4J9E A; 1VYU A; 2YUO A; 1AZE A; 2KEA A; 3NPF A; 2JM9 A; 1XOV A; 1WA7 A; 2H8H A; 1VA7 A; 1X2K A; 2W0Z A; 1AWO A; 1NYG A; 2O9S A; 4LUD A; 5GJV B; 2ROT A; 2QDL A; 2KE9 A; 3QWX X; 2J6O A; 2C0O A; 1OPK A; 2VWF A; 2EGC A; 1U5S A; 3H0H A; 4D8K A; 2DRM A; 2AKL A; 2YUP A; 1YNZ A; 2HEQ A; 4LNP A; 2AKK A; 3NHN A; 2CUB A; 2HSP A; 3M0S A; 4CC2 A; 2KRS A; 1QWE A; 2CDT A; 2IIM A; 3LH5 A; 1NLO C; 1GRI A; 1HSQ A; 1X6B A; 3IQL A; 2DL7 A; 2LJ1 A; 2YT6 A; 3I5S A; 1Y57 A; 1KIK A; 2GNC A; 1E6H A; 2DJQ A; 2LJ0 A; 2ESW A; 2NWM A; 1I1J A; 1M3C A; 1WLP B; 4OMP A; 1X2Q A; 3VS2 A; 4F14 A; 2EYZ A; 4IIM A; 1JXM A; 3PE0 A; 1W70 A; 1ZLM A; 2HDA A; 2DIL A; 1X69 A; 2KRO A; 1AOJ A; 1I07 A; 2A28 A; 2KT1 A; 3VS5 A; 4AFS C; 1SHG A; 2LCS A; 3NGP A; 1AWW A; 1MV0 B; 1RLQ C; 1SPK A; 2JMC A; 1BK2 A; 1NYF A; 3PVL A; 1K0S A; 2EBP A; 4AFZ C; 2DBK A; 4CC7 A; 3TVT A; 4JPB W; 1G2B A; 5L23 A; 4ZNX A; 3EGU A; 2FG0 A; 2OI3 A; 1AWX A; 3U23 A; 2JMA A; 1SSH A; 1UE9 A; 2KXC A; 4JJD A; 1GBR A; 2ECZ A; 2K3B A; 1PKT A; 1BU1 A; 2DVJ A; 1TUD A; 1JXO A; 1PKS A; 2E5K A; 1K0X A; 1J3T A; 1YCS B; 1I0C A; 2DE0 X; 2FPD A; 3ULR B; 1B3Q A; 4JJC A; 2A08 A; 2JM8 A; 1SEM A; 3FJ5 A; 1V1C A; 2F2W A; 4JJB A; 3VS6 A; 4RTV A; 2HCK A; 2JT4 A; 1UJY A; 1GL5 A; 3VS1 A; 4HVU A; 2ABL A; 2DBM A; 2K6D A; 4J9G A; 1H92 A; 4JZ4 A; 1UG1 A; 1BBZ A; 2RF0 A; 2FPF A; 5FW9 A; 1U3O A; 3SEM A; 1NEB A; 2K7A A; 2RQT A; 1UDL A; 3UA7 A; 3EHQ A; 1VYT A; 2OAW A; 4AG2 C; 2JTE A; 5FWC A; 2SEM A; 2K9G A; 3PVQ A; 3TSZ A; 1ABQ A; 1UFF A; 2P4R A; 4J9I A; 2PZ1 A; 4K11 A; 5EC7 A; 1K9A A; 2GQI A; 2GTO A; 2NUZ A; 2CSQ A; 2EPD A; 1QWF A; 1K1Z A; 1X43 A; 2EVR A; 5I22 A; 1IO6 A; 1NM7 A; 3EG3 A; 2O88 A; 3I5R A; 2GGR A; 5HCK A; 3VRZ A; 1KFZ A; 3A98 A; 4LN2 A; 1MV3 A; 2C0I A; 2JXB A; 1N5Z A; 1NLP C; 2L0A A; 2L3P A; 4ORZ A; 5I11 A; 1ZUY A; 2FRW A; 1M3B A; 1ZBJ A; 2PNI A; 2HBW A; 1UUE A; 2G6F X; 2DM1 A; 1FYN A; 2FPE A; 2D0N A; 2X3W D; 2VKN A; 3M0P A; 2AZS A; 3M0R A; 5IXB A; 1Y0M A; 1JU5 C; 2DL4 A; 4J9D A; 1QKW A; 2O31 A; 2KXD A; 2EYW A; 1GCP A; 4M4Z A; 2EKH A; 1FMK A; 2JS2 A; 2K2M A; 4F16 A; 1WXB A; 1GFC A; 3VS4 A; 1OV3 A; 1ZX6 A; 2DNU A; 1AEY A; 2O9V A; 1WYX A; 1T3L A; 2A37 A; 4AFU C; 2W10 A; 3EHR A; 2D8H A; 3VS0 A; 2EQI A; 1NG2 A; 2RQU A; 4Z8A A; 4J9F A; 2A36 A; 1JO8 A; 2MOX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2MWO A; 2BZ8 A; 3SFM A; 4M7D F; 2P4T A; 5KCO A; 4FYV B; 2XMF A; 3SHW A; 1QCF A; 5GAM h; 3PMI A; 4PK4 A; 2MAM A; 1WI7 A; 2XI9 A; 4RTX A; 3UF4 A; 3CCS Q; 1U1T A; 4GLM A; 4A63 B; 1VQN A; 4Y92 A; 2F2X A; 1QMC A; 3CQT A; 5GAN 5; 3M56 A; 3CMA T; 2CH4 W; 3L2V A; 2XDD A; 4QVD A; 2RPN A; 2YRV A; 3M0T A; 3OYL A; 4FYY B; 3JCM b; 1MMN A; 4II1 A; 4XQ3 A; 4CI0 C; 1BI0 A; 3KFV A; 2DAQ A; 2RHX A; 4CC4 B; 2YWW A; 3H6Z A; 3X24 B; 5J3B A; 2LZ6 B; 3LW5 E; 1OU8 A; 2RQR A; 4M78 D; 2K5I A; 4M75 F; 4JUV A; 2ENM A; 2JN0 A; 1I81 A; 1HJD A; 2E65 A; 4PFO A; 1Y96 A; 1Q82 U; 2RK2 A; 1KD1 R; 1BI2 A; 4IKF A; 4M78 C; 1OPL A; 4XTZ A; 4A4K A; 5IAY A; 5EG2 A; 2OTL Q; 1D1C A; 3LLR A; 4BI3 A; 1GFD A; 2XIC A; 1NBE B; 3SDZ A; 2CS7 A; 1ZSG A; 4L59 A; 4D8D A; 1QP3 A; 2G3R A; 3L2Z A; 3EFS A; 1W1F A; 4JS4 A; 2DEQ A; 4JZ3 A; 2CZ0 B; 3L42 A; 2OTJ Q; 4R0K A; 2KI7 A; 2DL5 A; 4CC3 A; 1NZ9 A; 2EW3 A; 2KYM A; 2DF6 A; 1CKA A; 4PLI A; 4RUG A; 2CT3 A; 2MIO A; 4WCI A; 4FYX B; 1BIA A; 2L3S A; 4HKE A; 4FT2 A; 3MHX A; 5DLQ E; 2DER A; 1WPY A; 4DBF A; 1KQS A; 3QSU A; 2KYB A; 4J6X A; 3E9F A; 3VS7 A; 3SD4 A; 1IB8 A; 3NFC A; 4OMO A; 1VQ9 A; 5DY9 A; 2KR3 A; 1IGU A; 2RJF A; 4JLG A; 1T0J A; 3JCM c; 3M5A A; 4X34 A; 1GBQ A; 1AWJ A; 3LYI A; 4M7D A; 1Y96 B; 3I56 Q; 4QT7 A; 1E7O A; 2B86 A; 1RAF B; 4F17 A; 4J9H A; 4HXJ A; 4XK8 E; 1ABO A; 2DX1 A; 3L2W A; 1M30 A; 2KGT A; 3HSB A; 1W6X A; 3I35 A; 3E19 A; 3OMC A; 1ZBX A; 2IPO B; 3JCM V; 3OYB A; 3G4S T; 4Z88 A; 2QDY B; 2DYI A; 4M7D C; 3X25 B; 1YWO A; 1QP2 A; 3QWY A; 3L2U A; 2E41 A; 3EGD A; 2BTT A; 3JCM h; 1AZG B; 4Z02 A; 4ZGD B; 4LXC A; 3V7S A; 1WHL A; 3I56 T; 3CCV Q; 4E7I A; 3BY7 A; 4M7A A; 2YDL A; 4LDX A; 4C8Q F; 4M75 A; 2DRK A; 1IZ6 A; 4HVV A; 1UHF A; 3LWI A; 1ZQ1 A; 3OSS C; 4VUB A; 5D7U A; 3V7R A; 5C6S A; 2KVQ G; 2D1X A; 1TG0 A; 4M78 E; 3KBG A; 4M7A D; 1ZSZ A; 1BCM A; 2RQW A; 3CCS A; 5GAN g; 4M7D B; 3RIR A; 2JTM A; 1EZZ B; 2QYZ A; 2DMO A; 1K76 A; 4IUP A; 4FSX A; 4M7A C; 2VGN A; 4NL2 A; 1D09 B; 2LQN A; 4M75 C; 3O5Z A; 2KRN A; 2F5T X; 2DIG A; 4HT9 A; 5A0G A; 3CCV T; 2DXU A; 9ATC B; 4E2F B; 1WA7 A; 4CRI A; 1IRX A; 2QAZ A; 2W0Z A; 1M1G A; 1NYG A; 4XU3 A; 2O9S A; 3DLL A; 1KC8 U; 1ZSZ C; 2QDL A; 2ZPG B; 3PMT A; 2XK0 A; 5D6X A; 5GAM g; 3OW2 P; 1X01 A; 1U5S A; 3EH1 A; 2WAC A; 2HAX A; 3EGD B; 3FB9 A; 3EG9 A; 4D8K A; 2OTL A; 3MEA A; 4M7A B; 4PLL A; 4M7D G; 4M75 B; 2ZAE A; 3IQL A; 2DL7 A; 3R6O A; 1Q82 R; 2OTJ A; 3EH2 A; 2DFU A; 1Y57 A; 1KIK A; 2GNC A; 3CCQ A; 2LJ0 A; 2NWM A; 3URG A; 3VS2 A; 1JXM A; 1W70 A; 1ZSZ B; 2HSE B; 2DIL A; 4N0A A; 2EFI A; 1I07 A; 3A5Z B; 2MK5 A; 5FRO A; 4Y91 A; 3I55 A; 3OS5 A; 1RLQ C; 2P0K A; 1G3S A; 5KYY A; 1SPK A; 4BAC A; 3PVL A; 5CCA A; 4AFZ C; 1PD0 A; 5L23 A; 5LJ3 h; 3EGU A; 4QQ6 A; 2RHZ A; 4BDZ A; 4M7D E; 2VGM A; 1MMD A; 1SSH A; 2K5L A; 4M75 G; 1UE9 A; 4C8Q A; 1PKT A; 4ME7 A; 4N0A C; 2E5K A; 2M9U A; 3CCM Q; 1YCS B; 2F5K A; 5GAN 7; 5CR2 A; 3ULR B; 3JB9 H; 2E5Q A; 3EG9 B; 4JLI A; 1JJ2 A; 1V1C A; 1NJI U; 1V76 A; 1VQ4 Q; 4PNO A; 2MPX C; 1MMG A; 2VV5 A; 1HXD A; 4RTV A; 2ZPI B; 3RUX A; 2JT4 A; 3HTR A; 3JCM W; 2HNI A; 4WTO B; 2E10 A; 2K6D A; 4J9G A; 4JZ4 A; 2FPF A; 4M77 F; 1U3O A; 2KSS A; 1TU0 B; 4QVC A; 4PJO D; 2IG0 A; 2X4Y A; 3NTI A; 4KGX B; 3UA7 A; 3SWN A; 3EHQ A; 3BDU A; 4FCY A; 2SEM A; 3TSZ A; 2XU8 A; 4BDY A; 1UFF A; 4M7A E; 4PJO C; 2PZ1 A; 4M75 E; 4RCB A; 2QEX T; 1YFN A; 3CCM T; 1VQL Q; 4E47 A; 1MNE A; 5A0D A; 5KYY B; 1X43 A; 2F69 A; 5I22 A; 1VQ4 T; 3GOX A; 2GGR A; 2DTO A; 3VRZ A; 4A4E A; 2NYS A; 3VJP A; 1G5V A; 1UGS B; 4LN2 A; 2JXB A; 3SWN C; 2L3P A; 1OX9 A; 2E6Z A; 1M3B A; 2HBW A; 1UUE A; 5GMK l; 2K5F A; 3KXT A; 2G6F X; 1FYN A; 2FB7 A; 2O4X A; 4C8Q B; 1YHQ Q; 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1RI0 A; 3GNG A; 1CKB A; 1LOJ A; 1SHF A; 2Y4Y A; 2LNH B; 2V26 A; 4R55 A; 2CP5 A; 2M0Y A; 1ZUK A; 2LRQ A; 3ZL7 C; 1Q81 U; 2DYB A; 2E3I A; 1UGV A; 2V8K A; 4XTW A; 3GIB A; 4A54 A; 3PGG A; 2KRM A; 1T0H A; 3OYF A; 2VUB A; 4ZGE B; 2QQR A; 4FW2 A; 5LJ3 g; 1NJI R; 4OVA A; 3QDF A; 2A7Y A; 3OB9 A; 2O2O A; 1EFN A; 3OS2 A; 2DVE A; 4M77 B; 1VQL A; 1PWT A; 3PT9 A; 2NLU A; 5FLX E; 4KUD K; 4Y28 E; 4DBQ A; 1M3A A; 5J39 A; 5FRN A; 2GCX A; 1JEG A; 4RTY A; 4DA4 A; 5KYX A; 2RB6 A; 2FZG B; 1KD1 C; 2PUO B; 1U1S A; 1I5L A; 1M27 C; 2KDS A; 4C92 D; 1AT1 B; 1RUW A; 3GBQ A; 2JNG A; 5CKE A; 3OA6 A; 1YHQ A; 2JZ2 A; 2FRY A; 4FW1 A; 4HCK A; 4DEX A; 1VQO A; 3LH0 A; 4J6Y A; 1S72 Q; 2CH4 A; 4Z89 A; 3QO3 A; 2LJ3 A; 3VUB A; 2VB6 A; 1UGQ B; 1S1N A; 1X27 A; 1M8M A; 3SB2 A; 2PU9 B; 3VKI A; 3S3O A; 2COZ A; 3CCL A; 4M77 G; 3TQ7 P; 1WIE A; 5DLO A; 4A4H A; 4LD9 K; 1UJ0 A; 3CPF A; 1IHV A; 4BB7 A; 4RTW A; 2QA4 Q; 4M78 A; 4E6R A; 2LTO A; 1WHM A; 3JCM X; 4EDU A; 2EQJ A; 2O01 E; 1Z9Q A; 3CBP A; 2LVM A; 4RG8 A; 5GAN d; 2J06 A; 2EYQ A; 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