The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
GSMGTAGKWVLCNYDFQARNSSELSVKQRDVLEVLDDSRKWWKVRDPAGQEGYVPYNILTPYPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Splicing/signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Structural basis of PxxDY motif recognition in SH3 binding
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Epidermal growth factor receptor kinase substrate 8-like pro
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| total genus |
7
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-04-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FEI A; 2DIL A; 5ECA A; 1ZX6 A; 4X1V A; 4LUD A; 2BTT A; 4AG1 C; 3R6N A; 3TVT A; 1M27 C; 2A28 A; 4RTY A; 4M4Z A; 2DNU A; 1M3C A; 2PZ1 A; 3SEM A; 4GLM A; 2LJ0 A; 1G2B A; 1GCQ A; 2VVK A; 4OMP A; 5GJV B; 5I22 A; 2KEA A; 1PRL C; 2K7A A; 4FSS A; 1AD5 A; 2DM1 A; 2YDL A; 2AKK A; 1K0X A; 2IIM A; 2J7I A; 4JJB A; 2OJ2 A; 1NG2 A; 2KRN A; 2K9G A; 1SSH A; 1QKX A; 4LE9 A; 4RTU A; 1VA7 A; 1K0S A; 1YCS B; 3M0S A; 2F2V A; 2YUO A; 2O9S A; 3NGP A; 1SEM A; 4OMO A; 1M8M A; 1WXB A; 2C0O A; 4JJC A; 1H3H A; 2K2M A; 2JW4 A; 3M0Q A; 1YWO A; 2GTO A; 1JEG A; 4K11 A; 2L2P A; 2ED1 A; 2DL8 A; 2DMO A; 3I5S A; 1W6X A; 2KXC A; 3ZL7 C; 1SHF A; 2KR3 A; 1KJW A; 2FG0 A; 2DRK A; 3VRY A; 1GBQ A; 1G83 A; 4F17 A; 2AK5 A; 2LZ6 B; 1CSK A; 4J9I A; 2DL4 A; 2ED0 A; 1FYN A; 1WLP B; 1KSW A; 2LJ3 A; 2RNA A; 4Z89 A; 4AFS C; 4E6R A; 1UJY A; 1NEB A; 2CT3 A; 1T0H A; 4IIO A; 2ECZ A; 2LQN A; 2W0Z A; 2EPD A; 4HCK A; 2RN8 A; 1TG0 A; 2DYB A; 1WI7 A; 2EYW A; 3M0U A; 1AEY A; 1I1J A; 2HEQ A; 3VS4 A; 1GFD A; 2EVR A; 4AFZ C; 1NLO C; 1UHF A; 1WFW A; 2J6K A; 2KGT A; 4J9H A; 2KRO A; 3RNJ A; 2C0T A; 1SRM A; 1UGV A; 2HSP A; 1QCF A; 1FMK A; 1UFF A; 1E7O A; 2DF6 A; 3I5R A; 3ULR B; 5IH2 A; 1BU1 A; 2M51 A; 1GFC A; 1UJ0 A; 1NM7 A; 4CC3 A; 2KT8 A; 2SRC A; 3EG1 A; 2C0I A; 2VWF A; 1T0J A; 1X2K A; 5IHK A; 2RMO A; 4J9B A; 4J9G A; 2DL5 A; 1WX6 A; 2SEM A; 1OEB A; 2XMF A; 3NPF A; 2D8H A; 2HBW A; 4OMM A; 4J9F A; 1UTI A; 2CDT A; 1H8K A; 1WYX A; 1ZBJ A; 4J9E A; 2MCN A; 3C0C A; 2X3W D; 1PNJ A; 1TUC A; 2KYB A; 2EBP A; 1BB9 A; 3GBQ A; 5EC7 A; 2DL3 A; 1W70 A; 1WA7 A; 2EGC A; 3UAT A; 2EYX A; 2NWM A; 1U06 A; 2V1Q A; 2MOX A; 3EG2 A; 4DEY A; 4IIM A; 4AFU C; 2DLP A; 4GBQ A; 2A08 A; 2DRM A; 3THK A; 1B3Q A; 4OMQ A; 1XOV A; 2D0N A; 1PKS A; 2DJQ A; 2D1X A; 1VYT A; 2QDL A; 1E6G A; 1NLP C; 4HVV A; 2W10 A; 5IXB A; 1M3A A; 2CUB A; 2KXD A; 3TSZ A; 2M0Y A; 3VS5 A; 2K3B A; 4J9C A; 2F2X A; 2AZV A; 1NEG A; 4HXJ A; 2RQT A; 4RTW A; 4RTV A; 5FWB A; 2CRE A; 1Z9Z A; 3VS7 A; 2JM9 A; 5I11 A; 1X2Q A; 1UHC A; 1WIE A; 2PNI A; 1QWF A; 1U3O A; 3H0H A; 4LNP A; 5IHI A; 3TSW A; 4D8D A; 1PHT A; 3PVQ A; 4JPB W; 1UDL A; 5IXF A; 1Z9Q A; 2YUN A; 2J6F A; 4Z88 A; 3VS2 A; 2ESW A; 1JXM A; 3VS6 A; 1K4U S; 2AZS A; 3O5Z A; 4Y92 A; 3VS3 A; 4A63 B; 1OPK A; 3NHN A; 3CQT A; 5FWC A; 1CKA A; 2KT1 A; 2DVJ A; 4R0K A; 4RTX A; 2O31 A; 2BZX A; 3UA6 A; 1JU5 C; 1UG1 A; 5IHN A; 2EYZ A; 1I07 A; 1RUW A; 1V1C A; 4CC4 B; 1OPL A; 1AVZ C; 2LJ1 A; 2GGR A; 2KNB B; 1X27 A; 2CUD A; 2GNC A; 2FRW A; 4DEX A; 2YSQ A; 2LMJ A; 1JXO A; 1M30 A; 2HCK A; 2AKL A; 2JMC A; 2LQW A; 1LCK A; 2E5K A; 2YUQ A; 1A0N B; 2KE9 A; 2K6D A; 3PVL A; 1X6G A; 2EW3 A; 2JS0 A; 2O88 A; 4LUE A; 2GTJ A; 3VS1 A; 1IO6 A; 2BZY A; 2RPN A; 3QWY A; 5FW9 A; 3QWX X; 4QT7 A; 1K76 A; 1KFZ A; 4HVW A; 1T3S A; 2F2W A; 2O9V A; 2J06 A; 1MV0 B; 2I0N A; 2YT6 A; 4F14 A; 2RQR A; 2KRS A; 1ZUU A; 1U5S A; 1WXU A; 4RTZ A; 2G6F X; 2DX1 A; 2HDA A; 2JT4 A; 1YN8 A; 1X69 A; 3M0R A; 4CC7 A; 2L3P A; 4JJD A; 1Y0M A; 1AZE A; 3M0P A; 2RF0 A; 1NYG A; 2GBQ A; 3M0T A; 1RLP C; 3H0F A; 2VKN A; 2OAW A; 1PKT A; 2OI3 A; 3H0I A; 3I35 A; 3I9Q A; 1SRL A; 2K79 A; 1YNZ A; 2ENM A; 4RTT A; 1E6H A; 1GCQ C; 1UEC A; 2DL7 A; 3UF4 A; 1GL5 A; 3VS0 A; 2B86 A; 2P4R A; 2JMA A; 2KBT A; 2EKH A; 2EGA A; 5GJW B; 2FO0 A; 2LNH B; 4F16 A; 1H92 A; 1AWX A; 2ROL A; 1J3T A; 1SPK A; 2DBM A; 4JZ4 A; 1JO8 A; 1ZUK A; 3JV3 A; 1WXT A; 3REA B; 1SHG A; 1GCP A; 1NYF A; 2A37 A; 2ROT A; 3A98 A; 1ARK A; 1AWJ A; 3FJ5 A; 2X3X D; 2V1R A; 2FPF A; 3VRZ A; 3UA7 A; 2RQV A; 1EFN A; 4CC2 A; 5L23 A; 2CT4 A; 1K1Z A; 4D8K A; 1HD3 A; 1K9A A; 2JM8 A; 1AOJ A; 1AWW A; 3EHQ A; 1KIK A; 1X43 A; 2KYM A; 2DBK A; 1UUE A; 2KRM A; 2LCS A; 1TUD A; 1M3B A; 2EYY A; 1QKW A; 1QLY A; 1WDX A; 4AFQ C; 1HSQ A; 1YWP A; 5HCK A; 3EHR A; 4OML A; 1ABQ A; 1ZLM A; 1GBR A; 2O2O A; 1Y57 A; 2RQW A; 2CH4 W; 2MIO A; 2H8H A; 4J9D A; 4LN2 A; 2EQI A; 1PWT A; 4RUG A; 2LP5 A; 1AWO A; 1AZG B; 1CKB A; 4OMN A; 2D8J A; 1VYU A; 2L3Q A; 4ESR A; 2YUP A; 4AG2 C; 2ABL A; 1N5Z A; 3H41 A; 2GQI A; 1UE9 A; 2DA9 A; 3EGU A; 3LH5 A; 4ORZ A; 1MUZ A; 2J6O A; 3NMZ C; 1GRI A; 4Z8A A; 2JS2 A; 2JXB A; 1PRM C; 4ZNX A; 3RBB B; 3KFV A; 3PE0 A; 1X6B A; 3U23 A; 3SHW A; 1T3L A; 2RQU A; 2LX7 A; 2A36 A; 3EG0 A; 1ZUY A; 2J05 A; 2BZ8 A; 2L3S A; 1OV3 A; 2FRY A; 1MV3 A; 4EIK A; 1BK2 A; 4HVU A; 3IQL A; 1B07 A; 4KRT A; 1OOT A; 1ZSG A; 3REB B; 1JQQ A; 1YP5 A; 2FPE A; 1I0C A; 1RLQ C; 1QWE A; 2FPD A; 1RI9 A; 3EG3 A; 2L0A A; 1HJD A; 4WCI A; 2CSQ A; 1ABO A; 2CSI A; 2CH4 A; 1S1N A; 2PTK A; 4JZ3 A; 2NUZ A; 1W1F A; 1BBZ A; 2EGE A; 1VYV A; 2JTE A; 2DE0 X; #chains in the Genus database with same CATH topology 3BDL A; 1K8A U; 4PFZ A; 3J7A F; 1NZ9 A; 2QEX T; 3L2V A; 4BI4 A; 4X1V A; 1JBM A; 2CZ7 B; 4BY6 B; 3CCM Q; 3TVT A; 3FB9 A; 3CCU T; 1M27 C; 4RTY A; 2GF7 A; 3UT1 A; 1M3C A; 1N27 A; 2LJ0 A; 1LPL A; 4FSS A; 4FW2 A; 2YLB A; 5GAN 7; 1RAC B; 1LOJ A; 4M77 G; 1VQ8 A; 3A8M B; 1QP3 A; 2KRN A; 4LE9 A; 1VA7 A; 2WSC E; 2F2V A; 2BIV A; 3QDF A; 4ME7 A; 1SEM A; 3OYH A; 6AT1 B; 3VUZ A; 3CCQ Q; 4OMO A; 1M8M A; 4JJC A; 2KSS A; 4ZGD B; 1KQ1 A; 2LX9 A; 2VXE A; 1TWB A; 4BE0 A; 3J80 E; 4C92 F; 2DXB A; 3OYE A; 1D1B A; 1W6X A; 2KXC A; 5J26 A; 3ZL7 C; 2P0K A; 2ZPB B; 2K3Y A; 4C92 G; 4GY5 A; 3VRY A; 4MZP A; 1G83 A; 3P8D A; 1M2V B; 3C4S A; 3NTK A; 2FL7 A; 5GMK h; 1M1F A; 5GAN f; 2HSE B; 1KSW A; 2R5M A; 4Z89 A; 4AFS C; 4R55 A; 1NEB A; 2CT3 A; 2EQJ A; 2X9H A; 2QGF B; 2QGG A; 3CCR A; 4HCK A; 2L8D A; 3OMC A; 3INZ A; 1W4S A; 1VQ8 T; 1ZBX A; 1WI7 A; 4PJM A; 3M0U A; 4PJO G; 2PVD B; 4M78 B; 2HEQ A; 2EVR A; 3SFM A; 2DIG A; 4J9H A; 1UGR B; 2KGT A; 1YBY A; 5GAO n; 1Q86 C; 3RR6 A; 1KQS S; 3AT1 B; 1UGV A; 2QAZ A; 2NUP B; 4DOV A; 1FMK A; 1UFF A; 4X9D A; 3I5R A; 3G6E T; 2VUB A; 4M75 D; 1DJ7 B; 4ATO A; 2DTO A; 1P92 A; 1WQW A; 2NUT A; 3AHU A; 2SRC A; 1M1K U; 3CC2 T; 3EG1 A; 3CMA A; 1EX4 A; 4J9B A; 2ZZD A; 3OYC A; 3OYK A; 1WX6 A; 3CPW P; 3ZBD A; 2LNV A; 4OMF B; 3OYL A; 4Y91 A; 2D8H A; 5LJ3 d; 1PD0 A; 3L2Z A; 1U1S A; 1GXI E; 5LJ5 g; 1VUB A; 2MCN A; 4MMK A; 3LGL A; 2PUO B; 4ZTF A; 3C0C A; 1D0Z A; 5FRM A; 3VU3 C; 1X6O A; 1RL2 A; 3CCR T; 5EC7 A; 2CYZ B; 2QXF A; 3PIP A; 2DKG A; 2MF2 A; 2NWM A; 5GAN 5; 2V1Q A; 2MOX A; 3EG2 A; 4DEY A; 4AFU C; 4F7U B; 2NLU A; 1XJW B; 1OU9 A; 1B3Q A; 1PC0 A; 3CXC P; 1XOV A; 2D0N A; 2D1X A; 3FRN A; 2X35 A; 3OB9 A; 1Q81 C; 4M78 E; 1N8R U; 3SDZ A; 5AT1 B; 3OS1 A; 1VQM A; 4J7I A; 1LNX A; 5LJ5 e; 3JCM g; 1H64 1; 2CP5 A; 1JB0 E; 2M0Y A; 2MWP A; 4XU3 A; 4IUR A; 2F2X A; 5FU7 C; 2RD1 A; 4OVA A; 3V8L A; 2HQH A; 3S3O A; 3CMA T; 2DTH A; 3PNW C; 5IAY A; 1NBE B; 3QDR B; 3VS7 A; 1VQO A; 2JM9 A; 2Y4Y A; 5I11 A; 4E7I A; 2E3I A; 2WAC A; 3PMI A; 2GFU A; 1KQ2 A; 3CCM A; 1QCO A; 3OY9 A; 2FHD A; 5IXF A; 2YUN A; 2FZG B; 2J6F A; 2D6F A; 4Z88 A; 4ZTJ A; 1JXM A; 4M7A A; 4OB3 B; 3MP1 A; 4C8Q A; 5KYX A; 4M7D C; 1K73 C; 4O5V A; 3JCM e; 2EWN A; 3O5Z A; 3TRE A; 2CZ1 B; 2XKO C; 3MEW A; 1CKA A; 3QYG B; 2BZX A; 2P0Q A; 2E1H A; 3JB9 I; 1UG1 A; 5IHN A; 1KD1 R; 2GCX A; 1YIJ Q; 1RUW A; 1V1C A; 1OPL A; 2Z0W A; 2LJ1 A; 2GGR A; 2OTL Q; 2FRW A; 1PSE A; 1YJ9 A; 1FX7 A; 4FYW B; 1VQM T; 2HCK A; 4E7S A; 2AKL A; 1FMV A; 2JTM A; 1S72 T; 2P84 A; 2YUQ A; 1VQ7 T; 4C8Q F; 2NUT B; 4M78 D; 1HK9 A; 3URG A; 3R6O A; 2KE9 A; 3JB9 F; 4ELY C; 1X6G A; 2JS0 A; 2GTJ A; 3VS1 A; 1SF9 A; 2BZY A; 3CBO A; 3QWY A; 1TS9 A; 2RJE A; 5FW9 A; 3QWX X; 1VQO T; 4XQ3 A; 5CKD A; 3HTR A; 5KYU A; 3ZEH A; 1MMN A; 1T3S A; 3CCM T; 2F2W A; 2J06 A; 1MV0 B; 2HAX A; 1UEB A; 1ZSZ A; 2KRS A; 1ZUU A; 5LJ3 j; 1RI0 A; 1WHJ A; 3LX7 A; 4RTZ A; 2DX1 A; 3DLL A; 3M0R A; 1ZHI A; 3M0P A; 2RF0 A; 3GNG A; 2GBQ A; 4MZT A; 3LWH A; 1PKT A; 3I35 A; 3HFO A; 4RCB A; 4DOW A; 2ENM A; 4J5Y A; 2E6N A; 3UF4 A; 3FJP A; 1YJ9 T; 4C92 C; 1W2B A; 3UDC A; 2JMA A; 1IHV A; 2E65 A; 4PJN A; 2CZ6 B; 4HCZ A; 2XHC A; 5IN1 A; 4J7F A; 3HRT A; 1SPK A; 1K8A C; 2QYZ A; 2QQ9 A; 3MEA A; 1NYF A; 2A37 A; 1UB4 A; 4XTX A; 1TOV A; 4OGE A; 2X3X D; 3HKS A; 3NTH A; 1H3Z A; 1UGP B; 2MWO A; 2VAS A; 3VKI A; 1G5V A; 3CME Q; 1VQ6 A; 1K9A A; 2M16 A; 3QPH A; 2JM8 A; 1V29 B; 3JCM b; 1JJ2 P; 5KYX B; 2MYS A; 2KYM A; 5LJ5 d; 1R0B G; 3OQ5 A; 3JCM V; 2LCS A; 3CCV A; 1D1C A; 3LW5 E; 4OB0 B; 4FT2 A; 4J8O A; 3VYG A; 1M3B A; 3M53 A; 3G1J A; 3OYI A; 4KT0 E; 2XDB A; 2ZPH B; 1PWT A; 5KCO A; 3M56 A; 4LD6 A; 3CCL A; 2JZ2 A; 4OMN A; 5HKC A; 4KUL A; 2D8J A; 1Q7Y R; 1FWZ A; 2CP3 A; 4MZM A; 3KUF A; 5GAO q; 2K2V A; 3QO3 A; 4LDY A; 2DA9 A; 3GF5 A; 3JCM d; 4E7H A; 2HL3 A; 1VQ9 A; 1MUZ A; 1GRI A; 1VQP A; 2JXB A; 2KVQ G; 3QYH B; 3MPU B; 3KFV A; 1OU8 A; 1TU0 B; 3FLG A; 2LX7 A; 1ZSZ B; 2BZ8 A; 4C5H A; 4J6W A; 5DY9 A; 1WHM A; 5GAM g; 1B07 A; 4M75 A; 3E19 A; 4M7A E; 3REB B; 1IGQ A; 1JQQ A; 1YJN A; 3CC4 A; 4C8Q E; 2EKO A; 3RUX A; 2FPD A; 3T9N A; 4B9X A; 3EG3 A; 3EH2 A; 2BKD N; 1VQN Q; 2L0A A; 1Q86 R; 2QTX A; 5A0G A; 2PTK A; 1C6V X; 1LVK A; 3A5Z B; 3OYJ A; 3PGG A; 5D6X A; 3N5B B; 3CCL T; 2IG0 A; 1M1K C; 3I55 Q; 3SWN B; 2DIL A; 3RKW A; 4ZN3 A; 5ECA A; 4A4G A; 3QUI A; 3QSU A; 2A28 A; 4M75 F; 4M4Z A; 3JCM W; 2D9T A; 1F1B B; 2PZ1 A; 1KG1 A; 1VQP T; 1G2B A; 4QKU A; 3X26 B; 2KEA A; 4JLI A; 5FRO A; 1Q82 U; 2RK1 A; 2YDL A; 3QG1 A; 1MMD A; 1YIT Q; 4A4H A; 2LQ8 A; 3CCE Q; 4XAX B; 2KAF A; 1K9M U; 1W2B S; 2F5T X; 4QVC A; 4RTU A; 2E64 A; 2XID A; 2O4X A; 4Y28 E; 5J39 A; 1WPY A; 2RJF A; 2YUO A; 2LVM A; 3NGP A; 3GPL A; 2RA2 A; 1WXB A; 4E2F B; 2VGM A; 2K2M A; 1N8R C; 5LJ5 j; 3OYA A; 2V26 A; 5I21 A; 4M7A C; 4C8Q C; 2OTL T; 3QJ6 A; 2DL8 A; 1BIA A; 2DMO A; 2VC8 A; 4QQ6 A; 1IGU A; 3OYM A; 3I5S A; 2KR3 A; 2JNG A; 5GAN 8; 4IUV A; 4BI8 B; 2VYT A; 1NJI U; 4PJJ A; 1SSF A; 1GBQ A; 4F17 A; 5IT9 E; 2XU8 A; 2DL4 A; 4UC4 A; 2ED0 A; 1FYN A; 2QEX A; 2NYS A; 4ANJ A; 2RNA A; 4KH0 B; 1OI1 A; 1M2V A; 1M9S A; 4FYY B; 2ECZ A; 1YJW Q; 2EPD A; 2EQU A; 4LDV A; 1QVP A; 2X4J A; 2RN8 A; 3CBM A; 3V8K A; 1WJQ A; 2YLC A; 2L5Q A; 4L6V 5; 2QK0 A; 2EJ9 A; 4E7L A; 2JOY A; 1I1J A; 2XIC A; 2DXU A; 4ZN1 A; 3RNJ A; 4C0D B; 2C0T A; 1SRM A; 2BE9 B; 3P8H A; 2D0Q B; 4M7D G; 4FYV B; 1ZSZ C; 2NUP A; 1NM7 A; 2LDM A; 1TTH B; 1X2K A; 2VWF A; 4Q5W A; 4J9G A; 5GAN 4; 4LDX A; 3PFS A; 1QP2 A; 2XMF A; 5KYN A; 4OB2 B; 5C6S A; 2HBW A; 5GMK i; 2A0F B; 1M90 U; 3OW2 P; 2MPX C; 2RH2 A; 4OMM A; 3FEO A; 3DLM A; 3A8L B; 3E1S A; 3EG9 B; 4M78 F; 2LT4 A; 4M77 A; 3OYF A; 4QQD A; 2KYB A; 2V8J A; 3PMT A; 1BB9 A; 1VIE A; 1VQ5 Q; 4HT9 A; 3E9F A; 2EQM A; 1WA7 A; 2EGC A; 4TVR A; 4F04 B; 3ASK A; 4GBQ A; 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