The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
83
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structure length |
83
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Chain Sequence |
AEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT
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| publication title |
Crystal structure of P13K SH3 domain at 20 angstroms resolution.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Phosphotransferase
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| total genus |
21
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| structure length |
83
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| sequence length |
83
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1995-08-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HSP A; 4ESR A; 1YCS B; 2ENM A; 2DVJ A; 2IIM A; 1AZE A; 3I5R A; 4J9I A; 2X3X D; 2LMJ A; 1AZG B; 2QDL A; 3VS1 A; 1TG0 A; 2GBQ A; 2L3Q A; 1VYT A; 2VVK A; 2B86 A; 1UJY A; 2K79 A; 5I11 A; 4LUD A; 2NWM A; 4JZ4 A; 2YUP A; 2LQW A; 1TUD A; 3EG0 A; 1UG1 A; 1PNJ A; 3NMZ C; 2RQU A; 4JJC A; 2F2V A; 1BB9 A; 2MIO A; 2EYX A; 1WFW A; 1E6G A; 1T0J A; 1YNZ A; 1ZLM A; 4IIM A; 2DA9 A; 1IO6 A; 2PZ1 A; 2ROL A; 2AZV A; 3EG3 A; 2DX1 A; 3H0H A; 1JXM A; 1TUC A; 1FMK A; 1S1N A; 4FSS A; 3ULR B; 1WDX A; 3VRY A; 5FWB A; 1PRL C; 2EPD A; 2AZS A; 4DEX A; 1SRM A; 4KRT A; 2KYM A; 5ECA A; 1BK2 A; 3UAT A; 1Z9Z A; 2V1R A; 2E5K A; 2GQI A; 4RTV A; 4J9C A; 4QT7 A; 2DLP A; 4LUE A; 1K9A A; 2KRM A; 2KRN A; 2C0O A; 1ABQ A; 3QWY A; 1M8M A; 2RQT A; 3NGP A; 3VS5 A; 2JM8 A; 1MUZ A; 1OV3 A; 3PVQ A; 2EW3 A; 3VRZ A; 2LJ0 A; 2BZX A; 2CUB A; 2KRO A; 5IHI A; 5IHN A; 2JTE A; 1SRL A; 1ZUK A; 1RUW A; 3SHW A; 2YSQ A; 2SRC A; 3UA7 A; 1HD3 A; 1W70 A; 2X3W D; 2EBP A; 2FRW A; 1X69 A; 1K4U S; 4JJD A; 3THK A; 1QKW A; 3PE0 A; 1WX6 A; 2L3S A; 4DEY A; 3I9Q A; 4OMQ A; 2D1X A; 5L23 A; 1PRM C; 5IXF A; 2ECZ A; 2J6F A; 2F2X A; 3RNJ A; 2O9S A; 4AFZ C; 2HDA A; 3SEM A; 2C0I A; 2A28 A; 1AEY A; 1SEM A; 1M3A A; 4OMM A; 4Z8A A; 2M51 A; 1JO8 A; 4F17 A; 3EG1 A; 4RTZ A; 1NLO C; 4CC4 B; 2LQN A; 5HCK A; 2HBW A; 2A37 A; 1YWO A; 2KXC A; 2AKL A; 2F2W A; 2EYZ A; 2AK5 A; 3C0C A; 2KGT A; 1QLY A; 1JXO A; 1GCQ C; 2EGA A; 4Y92 A; 1RLP C; 2J6K A; 1WXT A; 2DL7 A; 1WIE A; 5GJW B; 4GBQ A; 2CSI A; 1UHC A; 2JS0 A; 3TSW A; 2DL5 A; 1WA7 A; 4J9H A; 4ZNX A; 2J05 A; 4A63 B; 1GFC A; 2RQR A; 3H41 A; 3QWX X; 2CH4 A; 2RQV A; 2CH4 W; 1CKB A; 1E6H A; 4HVV A; 1PKS A; 2YDL A; 3IQL A; 2L2P A; 5IHK A; 1JEG A; 2MOX A; 5IH2 A; 2DL4 A; 1VA7 A; 2YUQ A; 3H0I A; 4AG2 C; 2JXB A; 2JMA A; 4J9D A; 3REA B; 2FO0 A; 2VKN A; 1K1Z A; 3VS2 A; 1G83 A; 2YUN A; 5GJV B; 1UHF A; 2W0Z A; 4IIO A; 3EGU A; 4E6R A; 1YWP A; 1U06 A; 1W1F A; 3TSZ A; 2ED0 A; 2EYW A; 1NYF A; 2JMC A; 2W10 A; 2D8J A; 2K2M A; 2KR3 A; 1A0N B; 1JQQ A; 1KSW A; 4ORZ A; 1I07 A; 5EC7 A; 2DL8 A; 4EIK A; 1I1J A; 1GCP A; 3EHR A; 1T3S A; 2A36 A; 2FPF A; 3VS4 A; 1BBZ A; 4AFS C; 1B07 A; 4JJB A; 1ZUU A; 1KJW A; 2ESW A; 1CKA A; 1MV0 B; 2CT4 A; 1WYX A; 2CRE A; 1SHG A; 2LZ6 B; 2RQW A; 2LCS A; 2BZ8 A; 2H8H A; 4RTW A; 2ROT A; 2VWF A; 4RTY A; 1XOV A; 4J9B A; 4WCI A; 1QWF A; 2CDT A; 2FPE A; 2KXD A; 1UJ0 A; 3A98 A; 4JPB W; 2KBT A; 2FPD A; 4M4Z A; 1AWJ A; 1M30 A; 1X2Q A; 1QWE A; 1Z9Q A; 2CT3 A; 5IXB A; 1NLP C; 2J7I A; 4HCK A; 4LN2 A; 1UUE A; 2GTO A; 4LNP A; 1ZX6 A; 1W6X A; 2XMF A; 1NM7 A; 2DIL A; 2EYY A; 1T0H A; 2OAW A; 1G2B A; 1U5S A; 2DRK A; 2PNI A; 4JZ3 A; 3KFV A; 2EGC A; 3TVT A; 2LX7 A; 2EVR A; 4RTT A; 2CUD A; 3UA6 A; 4OML A; 1X2K A; 4AG1 C; 3M0S A; 3CQT A; 1AWX A; 3ZL7 C; 3O5Z A; 1ZSG A; 4J9G A; 3VS0 A; 1SPK A; 2L0A A; 4F16 A; 2J6O A; 1X6G A; 1GBR A; 2SEM A; 2O88 A; 1X27 A; 4CC3 A; 1QCF A; 4AFU C; 2DF6 A; 1E7O A; 2K3B A; 1FYN A; 2RF0 A; 1V1C A; 3M0U A; 1OPL A; 2O9V A; 1H92 A; 1K0S A; 3VS6 A; 2LNH B; 1Y0M A; 2KRS A; 3NHN A; 1AOJ A; 1ZBJ A; 3M0Q A; 4RTU A; 4RTX A; 1M27 C; 2DMO A; 3M0T A; 1AWO A; 3U23 A; 1NEB A; 5FW9 A; 2JW4 A; 3I5S A; 4D8D A; 1EFN A; 2K6D A; 2DM1 A; 1QKX A; 4HVW A; 2DE0 X; 3GBQ A; 1UTI A; 1GL5 A; 1BU1 A; 1Y57 A; 1SSH A; 1AVZ C; 3I35 A; 3REB B; 2AKK A; 1UFF A; 2FRY A; 4LE9 A; 1WXB A; 2LJ3 A; 1WLP B; 1YP5 A; 3M0P A; 4RUG A; 2RMO A; 1KIK A; 2KT1 A; 1ZUY A; 1UGV A; 2D8H A; 2DBK A; 1X43 A; 1UE9 A; 2DRM A; 1K76 A; 1RI9 A; 4X1V A; 1OOT A; 4R0K A; 3NPF A; 2JS2 A; 2O31 A; 4K11 A; 4HXJ A; 2L3P A; 2GNC A; 1AWW A; 2ABL A; 1GCQ A; 1B3Q A; 2OJ2 A; 1KFZ A; 1GRI A; 1UDL A; 2KE9 A; 3VS7 A; 2KEA A; 2YUO A; 3UF4 A; 2PTK A; 1M3B A; 1SHF A; 4OMP A; 4D8K A; 1MV3 A; 2K9G A; 3JV3 A; 1JU5 C; 2MCN A; 2K7A A; 2ED1 A; 2FEI A; 1AD5 A; 4Z88 A; 1NEG A; 3EHQ A; 1X6B A; 2RPN A; 4OMN A; 1VYU A; 1VYV A; 2JM9 A; 1H3H A; 2KNB B; 1CSK A; 2DBM A; 3H0F A; 1HSQ A; 2JT4 A; 2EKH A; 2M0Y A; 1N5Z A; 2GTJ A; 5I22 A; 2DJQ A; 2EGE A; 1M3C A; 2BZY A; 3RBB B; 2KYB A; 1OPK A; 2DNU A; 2V1Q A; 1T3L A; 2NUZ A; 2BTT A; 1J3T A; 1GBQ A; 2KT8 A; 3VS3 A; 1OEB A; 5FWC A; 1H8K A; 1PKT A; 4F14 A; 3EG2 A; 1RLQ C; 1ABO A; 2DYB A; 2D0N A; 2HCK A; 4AFQ C; 2OI3 A; 1PHT A; 1WI7 A; 3LH5 A; 1YN8 A; 4HVU A; 1K0X A; 1I0C A; 4J9F A; 2J06 A; 2LP5 A; 1U3O A; 1LCK A; 2LJ1 A; 2I0N A; 1HJD A; 2O2O A; 2RN8 A; 3R6N A; 4CC7 A; 4GLM A; 1PWT A; 3PVL A; 2A08 A; 2GGR A; 1WXU A; 3M0R A; 1NG2 A; 2P4R A; 2RNA A; 4OMO A; 2DL3 A; 2EQI A; 2G6F X; 2HEQ A; 1ARK A; 4CC2 A; 1GFD A; 1UEC A; 3FJ5 A; 2CSQ A; 1NYG A; 2YT6 A; 4Z89 A; 2C0T A; 2FG0 A; 4J9E A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VQP A; 2ENM A; 1Q7Y U; 2IIM A; 1EX4 A; 2E1H A; 1K8A R; 1NBE B; 3I5R A; 3LGF A; 3RMS A; 1AZG B; 1VQN T; 4IKF A; 1TSF A; 3CC2 Q; 2K3X A; 2GBQ A; 4A4F A; 1YJW T; 2L3Q A; 1IHW A; 2VUB A; 3CCQ A; 1BIA A; 5LJ5 f; 2B86 A; 1UJY A; 5I11 A; 3QUI A; 2NWM A; 1FMW A; 4KUL A; 4JZ4 A; 2YUP A; 1S72 A; 4M7A A; 3LX7 A; 2MWO A; 2LNV A; 3BDL A; 2E6Z A; 4M75 A; 1JRI A; 2LX9 A; 2MIO A; 3MEV A; 1O75 A; 1VQ6 Q; 1R77 A; 1VQ4 A; 2PZ1 A; 1SG5 A; 2ROL A; 3EFS A; 3I55 T; 3EG3 A; 4UC4 A; 4J5Y A; 2P0Q A; 2PVO B; 2KDS A; 2QEX T; 3HSB A; 2VGM A; 2EQK A; 3ULR B; 2R57 A; 3VU3 C; 1WDX A; 2ZZD A; 4XAX B; 3MP1 A; 1ZHI A; 2AZS A; 3OW2 P; 2E41 A; 1LVK A; 2KSS A; 1BK2 A; 4M7D D; 1VQ9 Q; 1G3T A; 1D1A A; 3NTH A; 3L2Q A; 3OBW A; 3OYL A; 2K57 A; 3MO8 A; 1FXX A; 5LJ5 h; 1YIJ T; 2EJG A; 3MET A; 3LWH A; 3R6O A; 1M1K C; 2QGG A; 5CAI A; 1ABQ A; 1YJN A; 2RQT A; 1OV3 A; 3PVQ A; 4XK8 E; 2EW3 A; 3VRZ A; 4C0F A; 2BZX A; 3EGX A; 1EZZ B; 4M7A B; 2Y4X A; 3JCM V; 2YSQ A; 2SRC A; 1ZSZ A; 4FYW B; 2XDD A; 2EBP A; 3V7S A; 1K4U S; 2COZ A; 5LJ5 j; 2L3S A; 4CI0 C; 4QVC A; 4LXC A; 1PRM C; 1VQM T; 2QQR A; 5D7U A; 3LW5 E; 1YJW Q; 1VQ7 Q; 3RNJ A; 3M53 A; 1QCN A; 3SEM A; 4PJO D; 3P8H A; 1W2B S; 1WGS A; 4Z8A A; 5GAN e; 1JBM A; 3OMC A; 4RTZ A; 4CC4 B; 5A0D A; 1XTD A; 2LQN A; 1UEB A; 1M1F A; 2F2W A; 3HTR A; 2RH2 A; 3RR6 A; 4MZM A; 1VUB A; 4F04 B; 3QJ6 A; 4A4K A; 3JCM J; 1RLP C; 1QW1 A; 5GJW B; 1VQ6 A; 1IHV A; 1I81 A; 2E65 A; 3GOX A; 4F7U G; 2ZPB B; 2DL5 A; 1WA7 A; 4ZNX A; 1GFC A; 1ZBX A; 2RQR A; 3QWX X; 4OMF B; 1E6H A; 5LJ5 d; 3IQL A; 2L2P A; 4C8Q F; 1BCO A; 2ZAE A; 4B9W A; 2COW A; 1MMG A; 3PNW C; 1WPY A; 3BDU A; 1VA7 A; 4M77 F; 4XU2 A; 1BKB A; 4C0D C; 1N27 A; 3DB3 A; 4OGC A; 3REA B; 1VQ9 A; 4HCB A; 1G83 A; 4KT0 E; 2YUN A; 3OYI A; 2EIF A; 4AMC A; 4DBH A; 2ED0 A; 2EYW A; 1NYF A; 2YWW A; 4LD9 K; 2NUP A; 1LNX A; 4RG2 A; 5HK3 A; 1JQQ A; 3L1A A; 2E3I A; 4II1 A; 1TWB A; 4L5G A; 3PIP A; 3G4S Q; 1B07 A; 1KQ2 A; 1CKA A; 4QVD A; 3JRZ A; 2A7Y A; 4JUV A; 2LZ6 B; 2LCS A; 2E3H A; 3MKD A; 3CCS Q; 1VQM Q; 4M78 G; 3VJP A; 1QWF A; 2AHJ B; 4EDU A; 1VQN A; 2XU8 A; 4CRI A; 1UJ0 A; 3A98 A; 1YJW A; 2KBT A; 2EWN A; 4L59 A; 4LDV A; 3QYG B; 1AWJ A; 1M30 A; 3CD6 Q; 2QI2 A; 5IN1 A; 3BW1 A; 2EQU A; 3EH2 A; 1NLP C; 2J7I A; 4HCK A; 4LN2 A; 3CC7 T; 1UUE A; 1B34 A; 1OU9 A; 4PJO A; 1KHC A; 3CCV Q; 3QPH A; 4M7A E; 3QZ9 B; 1V76 A; 3MP8 A; 4ZGE B; 2OAU A; 2OAW A; 2Z0W A; 4N4G A; 1WHH A; 4C5E A; 3PIO A; 3M5A A; 2EGC A; 2OX7 A; 1RAI B; 3UA6 A; 2EKO A; 4X9C A; 5FLX E; 1UGQ B; 3QII A; 1VQ5 T; 3CQT A; 3ZL7 C; 3I55 A; 3O5Z A; 2DIG A; 1ZSG A; 5CK9 A; 3RMQ A; 1M5Q 1; 4RKU E; 1SF9 A; 1GBR A; 1TH7 A; 1UB4 A; 2O88 A; 2JVV A; 2QEX A; 3X25 B; 4CC3 A; 1QCF A; 1E7O A; 1KD1 R; 2K3B A; 1OPL A; 4M77 D; 4YTL A; 2GFA A; 3NHN A; 1NJI C; 1AOJ A; 1WNL A; 1ZBJ A; 1IXD A; 4RTU A; 2DMO A; 3M0T A; 1VQK T; 8AT1 B; 5GAM g; 4M78 B; 2GF7 A; 1Q82 R; 2NYS A; 3U23 A; 1YIJ A; 4M78 C; 4EMK C; 3I5S A; 4XTY A; 1X01 A; 2QTX A; 1IGQ A; 4E2F B; 2CP6 A; 3GBQ A; 1GL5 A; 2CS7 A; 1AVZ C; 1D3B B; 2K5F A; 2M1H A; 4N4H A; 1K8A U; 2HNI A; 1BI1 A; 5GMK m; 1VQ8 Q; 1KIK A; 2RI5 A; 2KT1 A; 1X43 A; 2DRM A; 5CQX A; 2QAS A; 4PJM A; 1RI9 A; 4X1V A; 4R0K A; 1UGS B; 2O31 A; 3QG1 A; 2L3P A; 1VQM A; 1AWW A; 2LVM A; 1B3Q A; 2LCL A; 2OJ2 A; 3H8Z A; 1UDL A; 5GAN 4; 2KEA A; 2K5L A; 2LRQ A; 2IVW A; 3JV3 A; 3CC7 Q; 1M90 C; 2K7A A; 2FEI A; 1PC0 A; 1AD5 A; 3QKJ A; 1KQS S; 1X6B A; 1OU8 A; 1VYU A; 2M9U A; 3CCQ T; 3GNF B; 4WTO B; 1CSK A; 4M7A F; 4ELZ C; 3H0F A; 1HSQ A; 2JT4 A; 1NE8 A; 1N5Z A; 1P92 A; 5I22 A; 5KYX A; 2DJQ A; 2BIV A; 1BIB A; 1M3C A; 2FYK A; 1QVP A; 3CCJ T; 1T3L A; 2NUZ A; 4F7U E; 3CC4 T; 3ER0 A; 1GBQ A; 3PMT A; 5FWC A; 3X28 B; 1UGR B; 2DYB A; 5LJ5 e; 1MGQ A; 2DIQ A; 4KGZ B; 1BI2 A; 4IUT A; 4HVU A; 4XU0 A; 1VQL Q; 4ZN1 A; 2DAQ A; 2YRV A; 1VQK Q; 1QVG A; 2LP5 A; 3CME T; 2LJ1 A; 3I56 T; 1HJD A; 2O2O A; 2BKD N; 4CC7 A; 2HKN A; 1R8O B; 3JCM X; 4B6M A; 2ZCF B; 5FU6 C; 3M0R A; 2O4X B; 3FB9 A; 2PUO B; 3OQ5 A; 1NPP A; 4OMO A; 1I5L A; 2HEQ A; 1X75 C; 4CC2 A; 3G71 T; 1UEC A; 2F5K A; 1I5O B; 2FB7 A; 3LLR A; 2XDB A; 2YT6 A; 4Z89 A; 2FG0 A; 5CKE A; 2NUT A; 1K73 C; 3NTI A; 4R55 A; 2JTF A; 1MND A; 1U8R A; 4J9I A; 4N0A A; 3GPL A; 8ATC B; 4NL2 A; 2O01 E; 5CKD A; 3VS1 A; 1TOV A; 5A0G A; 3HHT B; 4J6X A; 4FT4 A; 5KYX B; 4M78 E; 5CKH A; 2B8A A; 3M4G A; 4JLI A; 4BI8 B; 3EG0 A; 3NMZ C; 4VUB A; 4JJC A; 2F2V A; 3CC7 A; 1TU0 B; 3RKX A; 3CC2 T; 3L2Z A; 1YNZ A; 3H9N A; 1RI0 A; 3CCM Q; 4M7A D; 2LC4 A; 4KBM B; 1QVG P; 3M9Q A; 4JRK A; 1BI3 A; 2EAY A; 2D0Q B; 2ATC B; 4O5V A; 2AZV A; 1JXM A; 2F5T X; 3QZ5 B; 2HBP A; 1G5V A; 3HRT A; 9ATC B; 1VQ5 A; 3CC4 Q; 2EPD A; 4DEX A; 4KRT A; 2LQK A; 3LWI A; 3OYD A; 2V1R A; 1H64 1; 5FRN A; 4DOW A; 2Y4Y A; 4RTV A; 1KC8 R; 4J9C A; 2MK5 A; 4QW2 A; 2DLP A; 4LUE A; 1K9A A; 2KRM A; 1VQK A; 2KRN A; 2C0O A; 2NLU A; 4A53 A; 1M8M A; 2JM8 A; 4MZT A; 5GAN 6; 4E7Z A; 2CP5 A; 3OS5 A; 1VQ9 T; 2JUF A; 3OS2 A; 3KUF A; 4PKC C; 4PJN A; 1ZUK A; 1RUW A; 4X34 A; 4JRQ A; 4AT1 B; 4C5G A; 2FRW A; 1X69 A; 2E12 A; 3QXE B; 1QKW A; 3PE0 A; 3X20 B; 4DEY A; 2D1X A; 2ECZ A; 5GAN g; 2J6F A; 1AHJ B; 1K9M C; 1M1K U; 4C92 G; 5I2S A; 3J80 E; 2HDA A; 2A28 A; 4PLL A; 1JJ2 S; 1AEY A; 1SEM A; 4OMM A; 4M78 F; 4P5N A; 4F17 A; 1NLO C; 2CZ1 B; 3UT1 A; 4D6W A; 1RAG B; 4Y91 A; 2A37 A; 2WSF E; 2BUD A; 3HP9 A; 4E7L A; 1YWO A; 2LT1 A; 2OTL Q; 1QLY A; 3WVE B; 1VQ7 T; 1GCQ C; 2MI6 A; 3DB4 A; 2EGA A; 4Y92 A; 5GAN 8; 1N9S A; 1WIE A; 4GBQ A; 4PJO F; 2JS0 A; 3TSW A; 2XIC A; 2EJ9 A; 2J05 A; 4DBF A; 3H41 A; 3C4S A; 4MDX A; 2CH4 A; 2CP7 A; 4IUQ A; 2FZK B; 2CH4 W; 1CKB A; 1KD1 U; 4MDW A; 3QBY A; 4DBQ A; 3CCJ A; 2AIR B; 1XQH A; 2JZ2 A; 2PU9 B; 3CC4 A; 4A4H A; 3CPW A; 5IH2 A; 2DL4 A; 5GAO l; 1IGU A; 2QA4 Q; 2JMA A; 1Q82 U; 1OX8 A; 2FO0 A; 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