The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
83
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structure length |
83
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Chain Sequence |
AEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Crystal structure of P13K SH3 domain at 20 angstroms resolution.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT
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| total genus |
21
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| structure length |
83
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| sequence length |
83
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1995-08-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2MOX A; 2L3S A; 5IHK A; 3I35 A; 2LX7 A; 1WFW A; 1UJ0 A; 4Y92 A; 4JZ4 A; 1BU1 A; 2HSP A; 5EC7 A; 3UA6 A; 1QKW A; 3H0I A; 4EIK A; 1NEG A; 2E5K A; 2NUZ A; 1LCK A; 1W70 A; 2MCN A; 2KBT A; 1GBQ A; 4J9G A; 2ED1 A; 3C0C A; 5FWC A; 1PKT A; 2G6F X; 4OML A; 2SEM A; 1UJY A; 1GCP A; 1UEC A; 1K4U S; 1TUC A; 2BZY A; 2F2X A; 3H0H A; 4JZ3 A; 4HCK A; 2BTT A; 2O9S A; 1E6G A; 1NM7 A; 1OPK A; 1X27 A; 1WA7 A; 1XOV A; 2DBK A; 2LJ1 A; 2JMC A; 4KRT A; 1M30 A; 3PVL A; 2FRY A; 2JM9 A; 5L23 A; 4AFU C; 4HVV A; 1H3H A; 3U23 A; 2RNA A; 1IO6 A; 1OV3 A; 3M0T A; 2CT4 A; 2GTJ A; 2JT4 A; 1PHT A; 5FW9 A; 2D8J A; 1AZG B; 4IIO A; 1CSK A; 4ORZ A; 4Z8A A; 1JXM A; 3RBB B; 4J9B A; 3PVQ A; 2KE9 A; 2ECZ A; 4D8K A; 1HSQ A; 2KGT A; 3SEM A; 3VS5 A; 3EGU A; 1JU5 C; 4DEX A; 2DLP A; 1EFN A; 1OOT A; 3UA7 A; 2D8H A; 2DL4 A; 2XMF A; 4Z88 A; 3VS6 A; 1BBZ A; 1SSH A; 1MV0 B; 2L2P A; 1AD5 A; 2O88 A; 2A28 A; 2CH4 A; 2C0O A; 4D8D A; 1K0X A; 2YSQ A; 1H8K A; 2J6F A; 2L3Q A; 1MUZ A; 1SHG A; 2K9G A; 2KT1 A; 4DEY A; 2LP5 A; 1NG2 A; 2DRK A; 2M0Y A; 4LUD A; 1QLY A; 2DMO A; 2GNC A; 1UHF A; 1WDX A; 2V1Q A; 3SHW A; 4CC3 A; 3UAT A; 2X3X D; 3GBQ A; 2D1X A; 2IIM A; 1YWP A; 2A37 A; 3EG2 A; 2VWF A; 2KYM A; 2A08 A; 4HVW A; 3O5Z A; 2YT6 A; 1RUW A; 2CSI A; 1ZUU A; 1J3T A; 1GCQ A; 1S1N A; 2ENM A; 3ULR B; 4CC2 A; 1QWE A; 2DF6 A; 3NMZ C; 2AZV A; 4LNP A; 1PRL C; 2LNH B; 1T0H A; 2EKH A; 2W0Z A; 4AFS C; 2JM8 A; 1TG0 A; 1WXU A; 2OI3 A; 1RLQ C; 3THK A; 5GJW B; 4X1V A; 2EBP A; 5IXB A; 2YUQ A; 4R0K A; 2LCS A; 1ZLM A; 2J6K A; 1FMK A; 3NHN A; 4RTT A; 1JXO A; 2CH4 W; 2EGE A; 2EGA A; 3KFV A; 1X6B A; 1RI9 A; 2KEA A; 1I07 A; 2V1R A; 3M0Q A; 4HXJ A; 3H41 A; 2M51 A; 2GGR A; 1QCF A; 1W1F A; 3UF4 A; 2HEQ A; 4WCI A; 2YUO A; 1RLP C; 2KRM A; 1U06 A; 2DBM A; 2JMA A; 2DL5 A; 3ZL7 C; 1KIK A; 4OMO A; 1GFC A; 3REA B; 1KJW A; 1CKA A; 2RQU A; 3I5R A; 2ROL A; 1UUE A; 1KFZ A; 1QKX A; 1X6G A; 4RUG A; 2CDT A; 2CUD A; 2BZ8 A; 1I0C A; 1AOJ A; 4AG1 C; 4AG2 C; 1BB9 A; 1JO8 A; 2CT3 A; 2PNI A; 3EG1 A; 2DIL A; 2F2V A; 2AZS A; 1AWX A; 1NYF A; 3CQT A; 4IIM A; 4RTY A; 4RTU A; 1E7O A; 2KRN A; 2KYB A; 1T3S A; 2QDL A; 3TSW A; 2MIO A; 3EHR A; 2BZX A; 2GQI A; 2HCK A; 3VRZ A; 2JS0 A; 3JV3 A; 4RTV A; 2D0N A; 2K79 A; 2GBQ A; 1A0N B; 2DNU A; 2FPF A; 4FSS A; 2C0T A; 1Y0M A; 4F14 A; 1UFF A; 1NLO C; 2DJQ A; 2DA9 A; 4J9F A; 4OMM A; 5ECA A; 5IHN A; 1FYN A; 3TSZ A; 4GBQ A; 3REB B; 2C0I A; 1K76 A; 1K0S A; 1M3C A; 1T0J A; 5HCK A; 1AVZ C; 1N5Z A; 2OAW A; 4LN2 A; 1AWW A; 3VS3 A; 2KRO A; 2RF0 A; 1PKS A; 3NGP A; 4F17 A; 1X2Q A; 1Z9Z A; 2ED0 A; 2FRW A; 4OMP A; 2EPD A; 4JJB A; 1NLP C; 1AWJ A; 4CC4 B; 2DL3 A; 2B86 A; 2KXC A; 1U5S A; 2AKL A; 2F2W A; 2ABL A; 2P4R A; 1G2B A; 2LZ6 B; 1GBR A; 1CKB A; 1WIE A; 2CSQ A; 1ZUK A; 5IHI A; 1V1C A; 4J9C A; 4AFQ C; 3A98 A; 2HDA A; 1BK2 A; 3VRY A; 2AKK A; 3EG3 A; 1H92 A; 4J9H A; 3VS7 A; 1OEB A; 1UG1 A; 1E6H A; 4JJC A; 2O31 A; 1UGV A; 4QT7 A; 2VVK A; 2O9V A; 1VYV A; 3LH5 A; 2K2M A; 2SRC A; 1ABO A; 2EYZ A; 2JS2 A; 1KSW A; 1JQQ A; 2DE0 X; 2H8H A; 2LJ0 A; 1MV3 A; 1YWO A; 2CUB A; 3M0R A; 3TVT A; 5GJV B; 1HD3 A; 5I22 A; 1SPK A; 2OJ2 A; 3FJ5 A; 5FWB A; 1HJD A; 2RQR A; 2YDL A; 2KNB B; 1WLP B; 1B07 A; 1VYU A; 2LMJ A; 2RQW A; 1M8M A; 3NPF A; 2RQV A; 3VS0 A; 2DL7 A; 2PZ1 A; 5IH2 A; 1UTI A; 4JJD A; 1SRL A; 2DM1 A; 2GTO A; 2J7I A; 2X3W D; 1M3B A; 2L0A A; 4GLM A; 1SHF A; 3QWX X; 4ESR A; 3PE0 A; 3I9Q A; 2KRS A; 2L3P A; 2ESW A; 1YCS B; 3R6N A; 3M0U A; 1X69 A; 1ZSG A; 2LQW A; 1JEG A; 1QWF A; 1M3A A; 4J9I A; 2AK5 A; 1WYX A; 1VA7 A; 2EYW A; 1SRM A; 3EHQ A; 2RQT A; 2J05 A; 1W6X A; 1NYG A; 2J06 A; 2A36 A; 4RTX A; 3H0F A; 1Z9Q A; 1K9A A; 2DL8 A; 4J9E A; 3VS1 A; 2RMO A; 4CC7 A; 2JXB A; 4J9D A; 4JPB W; 2EW3 A; 1ARK A; 1X43 A; 1T3L A; 2JTE A; 2W10 A; 1ZBJ A; 1X2K A; 4Z89 A; 1U3O A; 3I5S A; 4ZNX A; 4A63 B; 3RNJ A; 3QWY A; 1SEM A; 1WXB A; 2KXD A; 1Y57 A; 1AEY A; 4K11 A; 5I11 A; 2K6D A; 2LJ3 A; 1WXT A; 2DVJ A; 4OMQ A; 2KR3 A; 4F16 A; 2FPD A; 1WX6 A; 3IQL A; 1ZX6 A; 2O2O A; 1WI7 A; 1VYT A; 4E6R A; 1GCQ C; 2FPE A; 1NEB A; 4RTW A; 2YUN A; 1UDL A; 1PWT A; 2CRE A; 4LUE A; 1K1Z A; 2FO0 A; 2JW4 A; 2RPN A; 2EVR A; 1ZUY A; 1PNJ A; 2DX1 A; 1YP5 A; 4HVU A; 1YNZ A; 1I1J A; 1OPL A; 5IXF A; 1TUD A; 1AZE A; 3M0S A; 2J6O A; 4M4Z A; 2HBW A; 4LE9 A; 2EQI A; 2I0N A; 3VS4 A; 1AWO A; 2K3B A; 1YN8 A; 4RTZ A; 2LQN A; 1G83 A; 2FEI A; 2DRM A; 1ABQ A; 2PTK A; 1B3Q A; 2VKN A; 1M27 C; 2RN8 A; 4OMN A; 1GFD A; 1GRI A; 2ROT A; 1GL5 A; 1PRM C; 2EYY A; 3VS2 A; 3EG0 A; 2EYX A; 3M0P A; 2K7A A; 2EGC A; 2DYB A; 1UE9 A; 1UHC A; 2NWM A; 2KT8 A; 2YUP A; 2FG0 A; 4AFZ C; #chains in the Genus database with same CATH topology 4QVZ A; 2VXF A; 3UA6 A; 4PJO G; 1QKW A; 3CCV Q; 4QQ6 A; 3C0C A; 2HSE B; 3C94 A; 2E6N A; 2SEM A; 1UJY A; 1K73 R; 1Y7X A; 4M78 C; 1TUC A; 2V8J A; 4A4F A; 4JZ3 A; 4HCK A; 3LWH A; 1E6G A; 1XOV A; 3R6O A; 4EMK B; 4KRT A; 1ZSZ A; 2MPX C; 1RAB B; 4HVV A; 2V8I A; 2RNA A; 1FMV A; 1OV3 A; 3C4S A; 2GTJ A; 4ORZ A; 1CSK A; 1JXM A; 3CME Q; 5LJ3 d; 2KE9 A; 3I55 Q; 2ZPI B; 1RAI B; 1HSQ A; 5FU6 C; 3EGU A; 1JU5 C; 3TU4 K; 3WXM B; 2LC4 A; 4M78 A; 1EFN A; 1OOT A; 4DEX A; 3QSU A; 4B9X A; 1YJ9 T; 3JRZ A; 1TWB A; 4JRK A; 3D7S B; 1LOJ A; 4V2S A; 3VS6 A; 2QA4 A; 1VUB A; 2OTL A; 1Q81 U; 5CCA A; 2ZPB B; 3CCQ Q; 1RI0 A; 4C92 D; 1LVK A; 4IUU A; 2CH4 A; 2C0O A; 4D8D A; 1K0X A; 4FM4 B; 4M75 E; 1H8K A; 3S3M A; 3EGX B; 1MNE A; 4KGZ B; 2DRK A; 4C8Q G; 2M0Y A; 4CI0 C; 3KUF A; 1N27 A; 3CCM T; 2R58 A; 4M75 F; 3SHW A; 2YLB A; 3JCM X; 3UAT A; 2M16 A; 2P0K A; 5GAM g; 1VQ7 A; 2IIM A; 1YWP A; 1U8R A; 2VWF A; 3EFO A; 4HVW A; 3O5Z A; 2QK0 A; 4LXC A; 3PIO A; 2HKQ B; 1ZUU A; 1AHJ B; 4CC2 A; 3C12 A; 2NUP B; 1VQL Q; 2DF6 A; 3OYE A; 1ZA1 B; 2L8D A; 2W0Z A; 4AFS C; 2JM8 A; 3HTR A; 1UEB A; 1IHV A; 3LW5 E; 1JRI A; 1QVF P; 3J7A F; 4F7U B; 3A8L B; 1IXD A; 4QVD A; 1M1K R; 3CCV T; 2D9T A; 3OW2 P; 1OI1 A; 4ZN3 A; 3KFV A; 1X6B A; 1RI9 A; 4NOY A; 1IGQ A; 3M0Q A; 2P84 A; 2P0Q A; 1JB0 E; 2GGR A; 2QAZ A; 4WCI A; 5AYF A; 2F5K A; 1RLP C; 2KRM A; 2DL5 A; 3ZL7 C; 3RER A; 2OTJ A; 3VUZ A; 3JCM f; 3REA B; 1M1F A; 4C92 E; 5A0G A; 2RQU A; 2VAS A; 1UUE A; 3EG9 A; 3BFM A; 1KFZ A; 1X6G A; 2DFU A; 2CUD A; 2BZ8 A; 1I0C A; 1AOJ A; 4AG1 C; 4AG2 C; 1BB9 A; 2CT3 A; 2PNI A; 4C0F A; 4IIM A; 5KE3 A; 3JCM W; 5GMK m; 7AT1 B; 4M75 G; 4PLI A; 3CME T; 2RHX A; 3EHR A; 2COZ A; 3I55 T; 1QVF A; 2HCK A; 4RTV A; 3LGL A; 1FX7 A; 1UGP B; 1K8A R; 1A0N B; 1PM3 A; 4X9C A; 3OW2 A; 5GAN h; 2FPF A; 2IG0 A; 4DBR A; 3PIP A; 1G3S A; 3L2Z A; 3QO3 A; 4O5V A; 1KQS P; 4XTW A; 2KSS A; 3X20 B; 4FCY A; 2YRC A; 4ANJ A; 4LN2 A; 1B34 B; 1PD1 A; 1AWW A; 5KCO A; 3VS3 A; 3CMA Q; 4KUD K; 3OA6 A; 3OBY A; 3DB3 A; 1QP2 A; 1X2Q A; 1YJ9 A; 3FLG A; 4OMP A; 4JJB A; 1AWJ A; 5KYU B; 4CC4 B; 2B8A A; 2F2W A; 2AKL A; 2O4X B; 1D0Z A; 1K8A U; 4WTO B; 1G2B A; 3JCM d; 1GBR A; 1CKB A; 3H9N A; 2QQB A; 2YLC A; 2DTH A; 4AFQ C; 3OYN A; 1H92 A; 2EJG A; 1I5O B; 1OEB A; 1N8R R; 4JJC A; 2M02 A; 2O31 A; 3CCM A; 4RCC A; 4Y91 A; 3V7R A; 4KT0 E; 3RKX A; 1VQL T; 1OX8 A; 3PMI A; 5GAO p; 3SWN B; 3OYF A; 3VYH B; 1HYO A; 1WJQ A; 3LH5 A; 5AT1 B; 2X4Y A; 2K2M A; 1KQS A; 4M7D E; 1YFN A; 3CBO A; 1SG5 A; 2WSC E; 1JQQ A; 4LDY A; 3JCM Q; 3G71 Q; 5J39 A; 3M4Y A; 2LQ8 A; 4M7D F; 3ZEH A; 1KK7 A; 5CVI A; 4PKC C; 2OJ2 A; 2X35 A; 2GFU A; 2DXC A; 2RQR A; 1WHL A; 1M90 C; 4XK8 E; 2YDL A; 4PJO B; 2KNB B; 1WLP B; 1N8R U; 1VYU A; 1RAA B; 4HCB A; 2DER A; 1M8M A; 2RQV A; 3L1A A; 3CCE T; 2PZ1 A; 2X51 A; 4ATO A; 3CCV A; 4OF1 A; 3HPW A; 4JJD A; 4JRI A; 1SRL A; 4FYW B; 3QBY A; 5KYY B; 3GIB A; 2L0A A; 1SHF A; 4ESR A; 1NJI R; 2XU8 A; 3INZ A; 5GAN j; 2RHI A; 3M0U A; 3AT1 B; 1FMW A; 3JSC A; 1Q82 C; 1I5L A; 3P8H A; 3M4G A; 1WHK A; 5DLQ E; 1YIJ Q; 2AK5 A; 4XU3 A; 2YXY A; 5KYX B; 1D3B B; 3OQ5 A; 4IUQ A; 3EHQ A; 2CZ6 B; 2RQT A; 2I2L A; 2E70 A; 5FRM A; 2ATC B; 4KUL A; 3HSB A; 1K9A A; 2EWN A; 2NUT B; 1KD1 R; 3BY7 A; 2CS7 A; 1X6O A; 2LVM A; 4JPB W; 4E2F B; 4ZGJ B; 3H8Z A; 3CME A; 1T3L A; 2JTE A; 1N9S A; 4OGE A; 9ATC B; 1ZBJ A; 1NJI U; 1U3O A; 5GAN 4; 1ZA2 B; 3LX7 A; 4F7U F; 2KQW A; 5GAN e; 3CMA T; 1WXB A; 3OS5 A; 1AEY A; 2JN0 A; 4K11 A; 2E10 A; 2QQS A; 2CZ7 B; 1RAC B; 4BB7 A; 4M7D G; 5CKB A; 4C8Q B; 1IB8 A; 2P0P A; 2IVW A; 4OMQ A; 4F16 A; 3TRE A; 3IQL A; 2JNG A; 3CPF A; 1KD1 U; 1KHI A; 5CK9 A; 1NZ9 A; 2VGN A; 1BIB A; 1FXX A; 2HD0 A; 1D0X A; 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3SEM A; 1MMA A; 3RKY A; 2LT4 A; 2K3X A; 2DL4 A; 2XMF A; 4Z88 A; 3CMA A; 3GP8 A; 3OYA A; 3P8B B; 2QQA A; 4XU2 A; 5GAN 3; 4A4K A; 2MMP A; 5LL6 S; 2CP0 A; 3HRU A; 5GAN 8; 1UGQ B; 1KC8 R; 1PG5 B; 2J6F A; 2L3Q A; 1QVG A; 5CQY A; 5GAO m; 4X9D A; 2YRV A; 1I4K 1; 2DMO A; 3RIR A; 2V1Q A; 2DXT A; 1VQ5 T; 2CYZ B; 2X3X D; 2X4J A; 4C92 B; 3GBQ A; 4E7Z A; 3HFN A; 3V8J A; 1I81 A; 2A08 A; 4NS5 A; 1N6A A; 2YT6 A; 3M57 A; 2GQV A; 1J3T A; 2XD0 A; 4KGX B; 3WVD B; 3RKW A; 5LJ3 f; 2NLU A; 3RR6 A; 3G71 A; 3NMZ C; 1KC8 U; 5CKD A; 4XU0 A; 2RI2 A; 1Y96 B; 4JDS A; 1PRL C; 4VUB A; 4OB1 B; 1T0H A; 1RLQ C; 1IGU A; 1TUG B; 5KYW A; 4RG2 A; 2EBP A; 4EPC A; 1YJW Q; 4R0K A; 2LCS A; 2LX9 A; 2COY A; 4Y28 E; 5FU7 C; 2J6K A; 4M77 E; 3VU3 C; 1FMK A; 4RTT A; 4C8Q F; 2GF7 A; 1WQ7 A; 4BE2 A; 4A4E A; 1NBE B; 2EGA A; 3T9N A; 2V1R A; 2XDB A; 4HXJ A; 3UWN A; 3SDZ A; 3UF4 A; 4M7A A; 2YUO A; 1YIT Q; 4JLG A; 3QG1 A; 3URG A; 4J6X A; 2DBM A; 2JMA A; 4RG8 A; 5GMK l; 1VQ4 A; 1KIK A; 3G6E T; 1TS9 A; 2JOY A; 2K5L A; 3I5R A; 3EGD B; 1QKX A; 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