The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
55
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structure length |
55
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Chain Sequence |
ELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Spectrin alpha chain, brain
|
| publication title |
Crystal Structure of the alpha spectrin SH3 domain at pH 9
rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule tags |
Structural protein
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| total genus |
11
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| structure length |
55
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| sequence length |
55
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-05-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QKX A; 3THK A; 4JJD A; 3I5S A; 5I11 A; 1X27 A; 2KT8 A; 1N5Z A; 2KYM A; 1AWO A; 2KNB B; 2KXD A; 4RTX A; 1PKS A; 3U23 A; 2A28 A; 3RBB B; 1XOV A; 1UHF A; 2DF6 A; 2DX1 A; 4J9F A; 5IH2 A; 2ECZ A; 2AZV A; 4JZ3 A; 1PKT A; 2FPF A; 1RUW A; 2L3Q A; 5FWC A; 1QCF A; 2K6D A; 2ROL A; 2DIL A; 4K11 A; 4CC3 A; 1M27 C; 1B07 A; 2J05 A; 2KT1 A; 2D8H A; 1K76 A; 2EYW A; 5IHI A; 2LJ1 A; 2NWM A; 1BB9 A; 3TVT A; 2C0O A; 1AEY A; 1J3T A; 2P4R A; 1KJW A; 1JQQ A; 2EKH A; 1HD3 A; 1GFC A; 4JJC A; 3VS0 A; 2X3X D; 2EPD A; 2A37 A; 2GTJ A; 2K79 A; 3O5Z A; 2EW3 A; 4CC4 B; 1UFF A; 2RQV A; 1KSW A; 2O9S A; 2O9V A; 1ZBJ A; 2YUQ A; 2DMO A; 2CDT A; 1SRM A; 2HSP A; 2VWF A; 1WXU A; 1ARK A; 2DRK A; 2YDL A; 1AZG B; 1AOJ A; 1E6H A; 1QLY A; 1M8M A; 1BU1 A; 2DM1 A; 4RTZ A; 2LMJ A; 3I9Q A; 2FO0 A; 2GNC A; 2MIO A; 4D8K A; 3VS4 A; 3VS6 A; 2GQI A; 2HEQ A; 2NUZ A; 3I35 A; 2EGA A; 2KGT A; 1Y57 A; 4RTU A; 1WXB A; 1AVZ C; 1QKW A; 3REB B; 2QDL A; 5FW9 A; 4LUD A; 2YUO A; 3EGU A; 1PRM C; 2KBT A; 4HVU A; 1K4U S; 1X2K A; 2ENM A; 1JXM A; 1YNZ A; 1KFZ A; 1B3Q A; 2RF0 A; 2DL5 A; 4OMN A; 2DJQ A; 1GBQ A; 3VS7 A; 1K1Z A; 1AWJ A; 1ABQ A; 3VS3 A; 2A36 A; 2LZ6 B; 1CKA A; 2DLP A; 5GJW B; 2J06 A; 3TSW A; 3QWY A; 1YN8 A; 4RTT A; 2CUD A; 1WIE A; 4AG1 C; 2I0N A; 2KEA A; 1K0X A; 2HDA A; 2ROT A; 1OPK A; 2K2M A; 1SRL A; 4AG2 C; 1NLO C; 1H3H A; 2AKL A; 1UHC A; 1CKB A; 2KE9 A; 2KXC A; 3REA B; 1T3S A; 2FG0 A; 3I5R A; 4GBQ A; 1NM7 A; 3UA6 A; 1MV0 B; 2JS2 A; 1OV3 A; 3R6N A; 2LJ3 A; 2OJ2 A; 1X6G A; 1FYN A; 2XMF A; 1SEM A; 3ZL7 C; 2DL3 A; 3UAT A; 5L23 A; 2DL4 A; 4D8D A; 2ED0 A; 1UG1 A; 1HSQ A; 3NMZ C; 1WDX A; 1WA7 A; 2RQT A; 2KRO A; 4Z88 A; 3RNJ A; 4GLM A; 2RQU A; 2LP5 A; 1JO8 A; 1VYT A; 4J9E A; 3TSZ A; 3VRY A; 2SEM A; 1IO6 A; 1NYF A; 1ZUY A; 2FPD A; 1PRL C; 3VS1 A; 1W1F A; 2LX7 A; 2M51 A; 3VRZ A; 3EG2 A; 5IHN A; 4J9G A; 2DBM A; 2GTO A; 1AWX A; 4AFZ C; 5GJV B; 3M0P A; 2EQI A; 2CUB A; 2C0T A; 3EG0 A; 2JT4 A; 3EHQ A; 4RTW A; 1BK2 A; 1RLQ C; 2D0N A; 4HCK A; 1H92 A; 2EVR A; 1T0J A; 3FJ5 A; 2LCS A; 4FSS A; 4AFU C; 1SHG A; 1MUZ A; 1UJ0 A; 4LNP A; 3M0R A; 4J9D A; 5IXF A; 3GBQ A; 1HJD A; 3UA7 A; 1WI7 A; 3QWX X; 1E7O A; 2F2X A; 1AD5 A; 3SHW A; 1M30 A; 1A0N B; 2RN8 A; 3M0T A; 2DBK A; 2LQW A; 2CH4 W; 2LQN A; 3VS5 A; 3EG3 A; 4F14 A; 3JV3 A; 2C0I A; 4OMO A; 2BZY A; 1YCS B; 2KRN A; 1E6G A; 2L0A A; 2BZX A; 2L2P A; 1OEB A; 1YWO A; 4J9I A; 2RQR A; 1I0C A; 2L3P A; 2OI3 A; 4OMP A; 1WX6 A; 4ESR A; 1RLP C; 2AZS A; 2O2O A; 2J6F A; 5ECA A; 1UE9 A; 2DVJ A; 4R0K A; 1UDL A; 2EYY A; 2D8J A; 2EGE A; 4OML A; 1YP5 A; 2KR3 A; 4HVV A; 2EBP A; 1ZSG A; 4Z8A A; 2M0Y A; 1M3A A; 2YUN A; 1I07 A; 1BBZ A; 4J9H A; 2K3B A; 1Z9Z A; 3KFV A; 4WCI A; 2RMO A; 4JJB A; 2SRC A; 2W10 A; 4JZ4 A; 2RPN A; 1QWE A; 1NLP C; 2W0Z A; 3NHN A; 3PE0 A; 1ZX6 A; 1GCP A; 2DL8 A; 3ULR B; 2FRY A; 1TUC A; 4HVW A; 1AWW A; 4LUE A; 1MV3 A; 1Y0M A; 4KRT A; 4LN2 A; 3A98 A; 1OOT A; 1WFW A; 3M0S A; 1GCQ A; 1PWT A; 1WLP B; 2DYB A; 2EYZ A; 2PZ1 A; 2VVK A; 2EGC A; 3UF4 A; 1FMK A; 2PNI A; 2CH4 A; 2CT3 A; 2KRM A; 1JXO A; 3NGP A; 4RTY A; 2ED1 A; 2F2V A; 2K7A A; 2RNA A; 4HXJ A; 1K0S A; 1VYU A; 2V1R A; 3CQT A; 3IQL A; 5FWB A; 2JXB A; 4AFQ C; 2FEI A; 2E5K A; 3NPF A; 1LCK A; 1K9A A; 2J7I A; 5HCK A; 1X6B A; 2HBW A; 4F16 A; 2J6K A; 5IHK A; 2KRS A; 3H0I A; 1JU5 C; 2AK5 A; 1GL5 A; 5I22 A; 4RUG A; 2BZ8 A; 1G2B A; 2A08 A; 4QT7 A; 1ZUU A; 1KIK A; 4OMM A; 2CSQ A; 2MCN A; 2H8H A; 2VKN A; 5IXB A; 1OPL A; 1U5S A; 1PHT A; 1UTI A; 4A63 B; 2L3S A; 4IIO A; 1W70 A; 2DNU A; 2YT6 A; 1GRI A; 1T0H A; 1GCQ C; 2FRW A; 1M3B A; 4AFS C; 1TUD A; 1ZLM A; 1H8K A; 2JMA A; 4OMQ A; 1UUE A; 1I1J A; 4J9B A; 2JTE A; 1JEG A; 2DRM A; 1NEB A; 2DL7 A; 4RTV A; 1UEC A; 4J9C A; 1U06 A; 2ESW A; 4IIM A; 2O88 A; 4JPB W; 2OAW A; 2D1X A; 2JM8 A; 1CSK A; 4ORZ A; 2J6O A; 1X43 A; 2CRE A; 1GFD A; 4EIK A; 2BTT A; 1V1C A; 1WYX A; 4M4Z A; 2CSI A; 1S1N A; 3H0F A; 3VS2 A; 2LJ0 A; 1SHF A; 4DEX A; 3PVL A; 4CC7 A; 4ZNX A; 1VYV A; 1EFN A; 2AKK A; 4E6R A; 3EHR A; 1X2Q A; 2B86 A; 2HCK A; 4LE9 A; 1G83 A; 1SPK A; 2JMC A; 1ZUK A; 2KYB A; 1Z9Q A; 1TG0 A; 3PVQ A; 3H0H A; 1X69 A; 1M3C A; 4DEY A; 2YSQ A; 2EYX A; 2V1Q A; 2ABL A; 3EG1 A; 2JW4 A; 1AZE A; 2JM9 A; 1UGV A; 2YUP A; 2O31 A; 2G6F X; 2FPE A; 2X3W D; 2DA9 A; 3C0C A; 2DE0 X; 1NG2 A; 1ABO A; 2K9G A; 2LNH B; 2MOX A; 1UJY A; 1RI9 A; 2F2W A; 2IIM A; 2PTK A; 3H41 A; 2GBQ A; 4Z89 A; 4CC2 A; 1QWF A; 1T3L A; 5EC7 A; 1GBR A; 3M0U A; 1W6X A; 2JS0 A; 2CT4 A; 1NYG A; 4Y92 A; 1YWP A; 2GGR A; 3M0Q A; 2RQW A; 3SEM A; 3LH5 A; 1NEG A; 1VA7 A; 4X1V A; 1WXT A; 4F17 A; 1PNJ A; 1U3O A; 1SSH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2G3R A; 4MMK A; 4M75 E; 4JJD A; 5FU7 B; 3OYB A; 5GMK j; 3I5S A; 1KQS P; 5I11 A; 5LJ5 d; 5C0M A; 1N5Z A; 3UPU A; 2F5T X; 3MEA A; 2RI2 A; 4C8Q F; 3OYL A; 4IUQ A; 4C92 F; 3U23 A; 5FU6 C; 5A0G A; 1ZA1 B; 2DX1 A; 1BI0 A; 1XJW B; 2B8A A; 5IH2 A; 1EX4 A; 4B9X A; 4JZ3 A; 2JOY A; 2K57 A; 1BKB A; 2IPO B; 4C8Q C; 1HK9 A; 1QCF A; 2ROL A; 4C92 C; 3EGX A; 2E1H A; 2QQA A; 3CCV Q; 4B6M A; 3BW1 A; 1VQ8 Q; 1K8A C; 2D8H A; 4E7Z A; 2EYW A; 2LT4 A; 1WHJ A; 3JCM f; 1RAG B; 3M9Q A; 1KJW A; 1JQQ A; 1HD3 A; 5GMK h; 2HZY A; 4GY5 A; 1I8F A; 2DTH A; 5KYU B; 2QQR A; 1W2B A; 3O5Z A; 2K79 A; 3CCM Q; 4KGX B; 4A54 A; 3CPF A; 1M90 C; 3E2U A; 3KUF A; 2DZC A; 1TWB A; 4EPC A; 4L59 A; 3CME T; 2HSP A; 3JAM E; 1AZG B; 2E70 A; 4PJJ A; 9ATC B; 3H9N A; 4PFP A; 2E6Z A; 4D6W A; 3WXM B; 4RTZ A; 2LMJ A; 1PM3 A; 4D8K A; 4KUD K; 3JCM g; 5GAM f; 3VS4 A; 3QKJ A; 3TU4 K; 3VS6 A; 4FIB A; 3OA6 A; 2EGA A; 5KE3 A; 5J26 A; 5LJ3 d; 3A8L B; 3REB B; 1UEB A; 2AHJ B; 2YUO A; 4C5G A; 5CR2 A; 1K4U S; 4M7D D; 4HKE A; 2YWW A; 2ENM A; 4C5H A; 1B3Q A; 4OB2 B; 5KCO A; 3OSS C; 5GAN f; 3VS7 A; 1YBY A; 1ABQ A; 1Q7Y C; 1BI3 A; 2J06 A; 3CCL Q; 4ELZ C; 4RTT A; 2PU9 B; 1Q81 C; 3OS2 A; 2LT1 A; 2K2M A; 5GAM g; 3OW2 P; 1NLO C; 2AKL A; 1UHC A; 4M7D F; 1Y96 A; 2KXC A; 5GAM j; 1HYO A; 3I5R A; 2PQW A; 4M77 G; 1YIT A; 2QA4 Q; 3OS5 A; 5LJ5 e; 3ZL7 C; 4M7D C; 4X34 A; 1MHN A; 3EGD B; 3M53 A; 2DK3 A; 3GPL A; 3I55 A; 1UG1 A; 4LDU A; 2RJD A; 2XDP A; 4EMK C; 5GAN g; 1WA7 A; 1V29 B; 2HL5 C; 4GLM A; 2LP5 A; 2CP2 A; 3OMC A; 4J9E A; 1M1G A; 5GAN j; 3V7R A; 1NYF A; 1ZUY A; 3G4S A; 2FPD A; 1PRL C; 3VS1 A; 2DZ9 A; 1FXX A; 4KH1 B; 2M51 A; 4C0D B; 5IHN A; 1MND A; 1OU8 A; 5GAM h; 4M78 D; 3OMG A; 1Q86 C; 3EFS A; 1LOJ A; 2EQI A; 4M77 A; 3EHQ A; 3C12 A; 1RLQ C; 4HCK A; 2DXC A; 1RAC B; 4LDY A; 2EVR A; 3CCE Q; 2CP0 A; 2LCS A; 3MJX A; 2DD5 A; 4AFU C; 1PD1 A; 1VQO Q; 2BE7 D; 1UJ0 A; 2YLC A; 3GBQ A; 4PLI A; 1G3T A; 2F2X A; 1AD5 A; 3VJP A; 2QYZ A; 4BI8 B; 5GAN h; 1Q82 C; 1A0N B; 1M90 U; 4M78 F; 3J7A F; 3LGL A; 2FB7 A; 2DBK A; 2WSC E; 3QYG B; 1K73 R; 4LDW A; 2C0I A; 4OMO A; 2HKN A; 2KRN A; 1QVG S; 3QJ6 A; 4M7A G; 2QEX Q; 4XQ3 A; 3HFN A; 4MDW A; 4M78 C; 1YI2 A; 1I0C A; 1IHV A; 1LVK A; 2OTL Q; 2L3P A; 1WX6 A; 3FIF A; 1RLP C; 2Y90 A; 2Y4X A; 4E7L A; 2J6F A; 1B7T A; 5ECA A; 2QAS A; 4M75 D; 1I4K 1; 2EJG A; 5GMK l; 4KGZ B; 2EGE A; 2PUO B; 4OML A; 1YP5 A; 4M77 E; 3CCR Q; 2EBP A; 4Z8A A; 3CCJ A; 4FSX A; 4J9H A; 4J6X A; 3BDU A; 1U8R A; 3L2Z A; 3VU3 C; 4E7I A; 2RMO A; 2EAY A; 2SRC A; 2EQK A; 3OYD A; 2RPN A; 1WNL A; 1TTH B; 2QGG A; 3FJP A; 5LL6 S; 4FYX B; 3G71 A; 3RER A; 4M75 F; 4M7A A; 1ZX6 A; 1GCP A; 1Q7Y U; 5HKC A; 1G3W A; 1MV3 A; 1Y0M A; 4J7F A; 2KI7 A; 4P5N A; 1YJN T; 1OOT A; 2VVK A; 6AT1 B; 2EGC A; 3UF4 A; 4M75 C; 4E7S A; 4ZGE B; 5CAI A; 2DAQ A; 1C6V X; 2XI9 A; 2Z0W A; 2CH4 A; 1QP3 A; 3JB9 I; 1JXO A; 3CD6 T; 3S3O A; 2RNA A; 4BD3 A; 3ZEH A; 2MYS A; 3A1P A; 4ZTJ A; 4PL6 A; 5D6X A; 5CKF A; 1JJ2 P; 5LJ5 f; 2JXB A; 4AFQ C; 1X6B A; 3LLR A; 3UT1 A; 2DEQ A; 2CGH A; 1LPL A; 2RHZ A; 3H0I A; 1JU5 C; 4OF1 A; 2RHY A; 1GXI E; 4RMO A; 4F7U E; 2IVW A; 1KIK A; 4OMM A; 1R8O B; 1WHL A; 3CCS T; 4A63 B; 4ZTF A; 4IIO A; 3PIO A; 2OTJ A; 2P0K A; 4ME7 A; 1GCQ C; 2FRW A; 1M3B A; 1TUD A; 1IRE B; 4BDY A; 2H3J A; 3S6W A; 4OMQ A; 5CQX A; 2ZPF B; 4RTV A; 2R58 A; 3AHU A; 4J9C A; 1U06 A; 2RA2 A; 5LJ5 g; 3PIP A; 4C0F A; 4JPB W; 1VQN T; 1N9R A; 2HQH A; 1AHJ B; 3QJY A; 2COY A; 5LJ5 j; 4EIK A; 2BTT A; 5GAO m; 2DEU A; 2JN0 A; 4XTY A; 1Q82 U; 3C95 A; 2LJ0 A; 1SHF A; 2COZ A; 3TQ7 P; 1I5L A; 4CC7 A; 4ZNX A; 1R0B G; 1BCO A; 1VQK A; 5D6W A; 4XTV A; 4VUB A; 5GAN d; 2FYK A; 5KYU A; 1X69 A; 1M3C A; 1M2V A; 3NTH A; 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4ATO A; 1AOJ A; 1YIT T; 2GF7 A; 4C8Q B; 1Y07 A; 4Y28 E; 4AT1 B; 3M54 A; 2DM1 A; 3CCQ A; 1XQH A; 4C92 B; 2DD4 A; 3GNF B; 4OP0 A; 3I55 T; 2ZAE A; 1M2O A; 1BCM A; 2E41 A; 4M77 F; 5GAN 6; 2JTM A; 2GQI A; 2HEQ A; 1I81 A; 3MEV A; 5CKD A; 1LNX A; 1NE8 A; 2KGT A; 1ZSZ A; 3X26 B; 3ZBD A; 4RTU A; 1QVF A; 5FW9 A; 5GAO r; 3G4S T; 3EGU A; 1PRM C; 3UWN A; 4NL3 A; 2QAZ A; 1X2K A; 1IHW A; 1KC8 R; 3V8L A; 2RF0 A; 1LJO A; 2LTO A; 2DL5 A; 3JRZ A; 1AWJ A; 1IB8 A; 4XU3 A; 3VS3 A; 3CXC A; 1YHQ A; 2DLP A; 2L8D A; 5IAY A; 1R77 A; 2NYS A; 1VQ7 Q; 3TSW A; 1YN8 A; 4AG1 C; 5KYX B; 2L89 A; 1YJN Q; 4N4I A; 3JCM P; 2ROT A; 1OPK A; 3I56 Q; 1SRL A; 4JJN K; 4AG2 C; 2KY9 A; 1YIJ A; 1UGQ B; 3JCM X; 2RHI A; 2M16 A; 3R6N A; 2QQ9 A; 3D7S B; 2EQM A; 5GAN 2; 2HNI A; 3UAT A; 4D8D A; 2DIG A; 4XTX A; 4BUG A; 2RH2 A; 1HSQ A; 1C1A A; 3OS1 A; 1VQL A; 5IT9 E; 1SKU B; 2RQT A; 2ZZD A; 1TOV A; 3OYJ A; 1YI2 T; 2RQU A; 1JO8 A; 4HA8 A; 3TSZ A; 4F7U F; 3VRY A; 4BAC A; 3OYE A; 5CQY A; 4IUR A; 1RAD B; 1W1F A; 1G8X A; 1VQ4 A; 4PJO A; 3RKX A; 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