The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
|
sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
IFDIYVVTADYLPLGAEQDAITLREGQYVEVLDAAHPLRWLVRTKPTKSSPSRQGWVSPAYLDRRLKL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Sh3-domain
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Solution Structure of the SH3 Domain of Obscurin
rcsb |
| molecule keywords |
OBSCURIN
|
| total genus |
4
|
| structure length |
68
|
| sequence length |
68
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2004-04-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3EG1 A; 4GLM A; 4D8D A; 4A63 B; 2J6O A; 3I5R A; 2V1R A; 2RQW A; 1TUC A; 2RQV A; 3QWY A; 2KNB B; 1ZSG A; 1SEM A; 2LMJ A; 1K9A A; 2C0I A; 2DBK A; 2DNU A; 1YP5 A; 1X6G A; 4JJC A; 5I22 A; 1SHG A; 1A0N B; 2LJ1 A; 3GBQ A; 4AG1 C; 2J6F A; 4M4Z A; 5ECA A; 3M0R A; 2DX1 A; 3R6N A; 1GBQ A; 2DL4 A; 4OML A; 4RTW A; 1YCS B; 1GCP A; 2KR3 A; 1JXO A; 2LP5 A; 1WA7 A; 1RI9 A; 1QKX A; 2ENM A; 2L3P A; 1PWT A; 2DBM A; 1JXM A; 1GFD A; 2CRE A; 3ZL7 C; 2EPD A; 3EG2 A; 4J9G A; 2H8H A; 4RTU A; 2KBT A; 1E7O A; 4AG2 C; 3EG0 A; 2J7I A; 1PKT A; 1U06 A; 2GBQ A; 3O5Z A; 3VS6 A; 2K2M A; 2K3B A; 1PRL C; 3KFV A; 2LQW A; 2VWF A; 4CC4 B; 1RLP C; 1NLP C; 2M0Y A; 4RTZ A; 1S1N A; 1OV3 A; 2HSP A; 1K0X A; 3VRY A; 2YUN A; 4RTV A; 2YSQ A; 2EYY A; 2A08 A; 1ABQ A; 2YUQ A; 4Z88 A; 4GBQ A; 1HD3 A; 4X1V A; 1QKW A; 4J9D A; 2FEI A; 1I1J A; 1OOT A; 2FPE A; 3TSW A; 1PHT A; 4LUE A; 2PTK A; 1YWP A; 4AFZ C; 2AKL A; 1H3H A; 2AKK A; 5IHI A; 5L23 A; 4AFS C; 3C0C A; 1WIE A; 1RUW A; 2EYZ A; 4HXJ A; 1KFZ A; 2GTJ A; 3EGU A; 2DYB A; 2LZ6 B; 1CSK A; 1CKB A; 1NM7 A; 1SPK A; 1K4U S; 2DL7 A; 2ROL A; 1JEG A; 2ABL A; 2HEQ A; 1UG1 A; 2DRK A; 3A98 A; 1NYG A; 3VS7 A; 3SEM A; 2FPD A; 2KT8 A; 3NPF A; 1H8K A; 2P4R A; 1MUZ A; 2OJ2 A; 1KIK A; 1PNJ A; 2KRM A; 1BK2 A; 2A37 A; 2J06 A; 1PRM C; 1JQQ A; 4J9I A; 1YWO A; 4Z8A A; 2IIM A; 1T0H A; 5IH2 A; 1T3L A; 1TG0 A; 1RLQ C; 2DM1 A; 3M0Q A; 2X3X D; 1J3T A; 2O31 A; 3PVL A; 4F17 A; 4CC7 A; 2YDL A; 2DVJ A; 2V1Q A; 1W6X A; 5HCK A; 3VS0 A; 2KXD A; 2KGT A; 2BZ8 A; 1WXB A; 2RN8 A; 4Y92 A; 1B3Q A; 3I9Q A; 4CC3 A; 1M30 A; 2DRM A; 1OPK A; 1AZG B; 4J9E A; 1LCK A; 2L3Q A; 1CKA A; 4D8K A; 2F2W A; 3H0H A; 1K1Z A; 2KRS A; 2O9S A; 1M3A A; 1NG2 A; 5I11 A; 1X27 A; 2W0Z A; 1X43 A; 2CH4 W; 1SRM A; 2DIL A; 2YT6 A; 1Z9Q A; 1AVZ C; 2O88 A; 1FYN A; 1ARK A; 1ZUY A; 2EW3 A; 3NGP A; 1SHF A; 4IIO A; 1UEC A; 1ZUU A; 2FO0 A; 1NYF A; 4EIK A; 1MV3 A; 3RNJ A; 2HBW A; 2JS0 A; 1ZX6 A; 2PNI A; 4AFQ C; 3VS2 A; 2LCS A; 4RTT A; 1X69 A; 4CC2 A; 2EVR A; 2RMO A; 2EBP A; 4AFU C; 1TUD A; 2L3S A; 2J6K A; 1NLO C; 2A28 A; 1WLP B; 4JJB A; 2DMO A; 3M0U A; 1T3S A; 4E6R A; 3UF4 A; 1GCQ A; 2LNH B; 3I5S A; 4RUG A; 2ECZ A; 2M51 A; 4OMP A; 2D8H A; 5IHK A; 2PZ1 A; 3VS3 A; 1WI7 A; 4OMO A; 2AK5 A; 1SSH A; 1T0J A; 2YUO A; 1VYV A; 2NWM A; 2OI3 A; 4OMN A; 1MV0 B; 1AD5 A; 1U5S A; 4Z89 A; 2VKN A; 2KEA A; 2JXB A; 2K7A A; 2A36 A; 2J05 A; 2CT4 A; 2RNA A; 4ZNX A; 2O2O A; 2L0A A; 1KJW A; 2CSI A; 1W70 A; 2EGE A; 3H0I A; 2KXC A; 1Y0M A; 4WCI A; 1ABO A; 2DA9 A; 3NHN A; 2BTT A; 2MOX A; 3M0P A; 2FG0 A; 1PKS A; 2KYB A; 1E6H A; 1QCF A; 2JTE A; 2D1X A; 5GJV B; 2GGR A; 1IO6 A; 4HVW A; 1NEB A; 3EG3 A; 2CT3 A; 1WXT A; 1GBR A; 2FRY A; 1G2B A; 1GRI A; 2MCN A; 3ULR B; 3UA6 A; 2E5K A; 2LX7 A; 1BU1 A; 5FW9 A; 4HVU A; 1V1C A; 3IQL A; 4F16 A; 1UJY A; 3NMZ C; 2JW4 A; 2RQT A; 2G6F X; 1X2K A; 2EGC A; 2JM9 A; 2QDL A; 1QLY A; 1UGV A; 1QWF A; 2F2X A; 5EC7 A; 1G83 A; 1X2Q A; 2K79 A; 3REA B; 1I07 A; 1UTI A; 1WDX A; 2NUZ A; 3RBB B; 1UHC A; 2HCK A; 1AOJ A; 1E6G A; 2BZY A; 2F2V A; 1AWO A; 2I0N A; 1FMK A; 1NEG A; 4OMQ A; 4R0K A; 2CUD A; 2EGA A; 2XMF A; 1QWE A; 4IIM A; 1U3O A; 4OMM A; 2DF6 A; 1JU5 C; 2KRO A; 2K9G A; 1B07 A; 2JM8 A; 3M0T A; 4RTX A; 3CQT A; 2ED0 A; 1K76 A; 3QWX X; 3TVT A; 3M0S A; 4JZ3 A; 1XOV A; 4QT7 A; 5FWB A; 4DEX A; 2LJ3 A; 1YNZ A; 4JPB W; 3VRZ A; 4RTY A; 1GFC A; 2D0N A; 1AWW A; 3REB B; 1M3C A; 1N5Z A; 2C0T A; 2CUB A; 2RF0 A; 3H0F A; 2DL3 A; 1VYT A; 1HSQ A; 1JO8 A; 4J9B A; 2D8J A; 4JZ4 A; 2ED1 A; 5IXB A; 2DJQ A; 2CDT A; 2DL5 A; 2RPN A; 2FRW A; 2RQU A; 3EHQ A; 1AWX A; 3UA7 A; 3UAT A; 5FWC A; 1Z9Z A; 4HVV A; 1I0C A; 2SEM A; 1OEB A; 3JV3 A; 3I35 A; 2DE0 X; 1AZE A; 1YN8 A; 3FJ5 A; 1GCQ C; 4LUD A; 4ESR A; 4K11 A; 2KT1 A; 3SHW A; 4F14 A; 3U23 A; 2X3W D; 1BB9 A; 2JMC A; 1UHF A; 4J9F A; 3PVQ A; 3THK A; 2ESW A; 2DL8 A; 1HJD A; 2EYX A; 3VS4 A; 2W10 A; 4HCK A; 1UJ0 A; 2AZS A; 1WXU A; 2HDA A; 1UDL A; 1WFW A; 2VVK A; 1ZLM A; 1M3B A; 2DLP A; 2GTO A; 3VS5 A; 1W1F A; 4LE9 A; 1M27 C; 2LJ0 A; 2O9V A; 5GJW B; 2AZV A; 4J9H A; 2LQN A; 3LH5 A; 3PE0 A; 2GNC A; 1Y57 A; 2EQI A; 2BZX A; 1ZUK A; 2EKH A; 1WX6 A; 4LN2 A; 3EHR A; 1EFN A; 1K0S A; 2FPF A; 2YUP A; 4FSS A; 1VYU A; 2CH4 A; 1WYX A; 1X6B A; 2KE9 A; 4ORZ A; 2JMA A; 2SRC A; 3VS1 A; 2RQR A; 2ROT A; 1M8M A; 3TSZ A; 1UFF A; 2OAW A; 2L2P A; 4J9C A; 1UE9 A; 5IHN A; 1UUE A; 1BBZ A; 2JS2 A; 1VA7 A; 2MIO A; 2CSQ A; 2B86 A; 1GL5 A; 2C0O A; 2EYW A; 2K6D A; 2JT4 A; 1ZBJ A; 2GQI A; 3H41 A; 4KRT A; 1AEY A; 4LNP A; 1AWJ A; 5IXF A; 2KYM A; 1SRL A; 1H92 A; 2KRN A; 1KSW A; 4DEY A; 1OPL A; 4JJD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2LQ8 A; 4L5G A; 4L6V 5; 2YRC A; 2M16 A; 1OI1 A; 3OYA A; 2KNB B; 1G3Y A; 4MDW A; 1RAI B; 2LMJ A; 1M1K R; 3CXC P; 5KYY A; 2P0Q A; 3MJX A; 2HAX A; 3GNG A; 4HT9 A; 4ZGD B; 1SHG A; 1X75 C; 4M78 A; 4M75 A; 3R6N A; 1TUG B; 4A4H A; 4RTW A; 3CCE A; 1GCP A; 2BE9 B; 2KR3 A; 4J6X A; 1JXO A; 5AT1 B; 1WA7 A; 3CXC A; 5I2M A; 2HD0 A; 1YIJ Q; 4M78 C; 1PWT A; 3UPU A; 2CRE A; 4N4G A; 2EPD A; 2OAU A; 3CC4 T; 4M77 B; 1VIF A; 3X20 B; 2OTJ A; 3M4Y A; 4C92 B; 1K9M U; 2K2M A; 3OW2 S; 3FC3 A; 3G4S Q; 2K3B A; 1PRL C; 3H6Z A; 4LDV A; 2VWF A; 4TVR A; 4CC4 B; 3X26 B; 3CD6 Q; 3CMA A; 4M77 C; 1K0X A; 2YUN A; 4C92 C; 4RTV A; 3HKS A; 2YSQ A; 1QVG S; 1GXI E; 3BE3 A; 4XK8 E; 2P84 A; 4FSX A; 4GBQ A; 4M7A D; 4DQ2 A; 3QKJ A; 1I1J A; 2HKQ B; 2IVW A; 3HFN A; 4OB3 B; 2LNV A; 4GY5 A; 5GAN 2; 5GAM f; 3OY9 A; 2AKL A; 2XHC A; 5GMK e; 2CYZ B; 2FZK B; 5L23 A; 1N8R R; 2VXE A; 4JRP A; 2PVO B; 3HTR A; 1QP3 A; 2RHU A; 1RUW A; 2EYZ A; 3SFM A; 1H64 1; 4HXJ A; 3MEA A; 2GTJ A; 2QG9 B; 4M78 E; 4LD9 K; 1CSK A; 4M75 E; 1NM7 A; 2ROL A; 1JEG A; 4R55 A; 4L59 A; 1C0M A; 1KG1 A; 5CR2 A; 2QXF A; 3LWI A; 3CPW S; 2XG8 D; 1D1A A; 4F7U A; 3RES A; 1YJN Q; 2L3R A; 2FYK A; 4J5Y A; 5CKE A; 3CCU T; 4OF1 A; 3ZEH A; 2CP2 A; 3I56 A; 2KT8 A; 3JB9 H; 2OJ2 A; 2KRM A; 2A37 A; 3L2Q A; 4OB2 B; 3CCS Q; 4JLG A; 2M02 A; 1DJ7 B; 3C95 A; 3M0Q A; 3M53 A; 2X3X D; 3OYL A; 2HSE B; 4F17 A; 2YDL A; 1VQN T; 2V1Q A; 2COZ A; 2D9T A; 2XDD A; 1W6X A; 3OYB A; 1YI2 Q; 2LX9 A; 2KXD A; 3VKI A; 4XU0 A; 1WXB A; 2RN8 A; 1YJW Q; 5J3B A; 3P8B B; 4ELZ C; 2DTO A; 4NL3 A; 4FM4 B; 4IKF A; 1M30 A; 1FXX A; 4R56 A; 1NJI R; 2QQA A; 4M7D D; 3G71 A; 2KVQ G; 2L3Q A; 5M9O A; 5CQY A; 4D8K A; 4E7L A; 2EQK A; 5LJ5 e; 3M57 A; 1U1T A; 4WF2 A; 3QDR B; 3FB9 A; 2ZPE B; 4P5N A; 5GAO m; 1YIJ T; 2RI5 A; 2EQM A; 3OYK A; 3ZFJ A; 3H9N A; 4F7U E; 4IIO A; 4IUQ A; 2PU9 B; 1MV3 A; 3A5Z B; 2X4Y A; 3UDC A; 3G4S T; 3VS2 A; 3OYD A; 3X28 B; 4RTT A; 2RMO A; 2AIR B; 4DBF A; 3A8L B; 3PIO A; 1TUD A; 5GAO p; 3CD6 T; 1VQ8 A; 1TOV A; 1ZHI A; 4NOY A; 2OX7 A; 2J6K A; 1VQ7 Q; 2K4Y A; 1N6A A; 4HCZ A; 1WLP B; 5LJ3 f; 4XU2 A; 1TSF A; 1C6V X; 1D3B B; 5HKC A; 1M1K U; 2R58 A; 2XIC A; 2RO0 A; 2ECZ A; 2MI6 A; 4XU3 A; 2E64 A; 1M90 C; 5IHK A; 2PZ1 A; 2RI2 A; 1YIT Q; 5GAN 4; 3TEE A; 3KBG A; 2RA2 A; 4HCC A; 1RAE B; 4Z89 A; 5GAN 3; 2X4X A; 2JXB A; 2DZ9 A; 1FMV A; 2RNA A; 4PLL A; 4ZNX A; 1YJN T; 3L2V A; 3GF5 A; 3AT1 B; 3QHS A; 1BCO A; 2WAC A; 2CP0 A; 1M2V B; 1W70 A; 2EGE A; 2RHI A; 3BY7 A; 4PFP A; 3CCL Q; 1Y0M A; 4PKC C; 4WCI A; 1ABO A; 1RAC B; 2BTT A; 1MNE A; 1R77 A; 3CCS T; 5FRM A; 2LVM A; 2FG0 A; 1IHV A; 1Q81 U; 1C1A A; 1PG5 B; 3VUB A; 2GGR A; 1IO6 A; 3CC4 A; 1RAF B; 1NEB A; 1VQO Q; 2WSF E; 1WXT A; 3EG9 B; 4XQ3 A; 4Q5W A; 1M2O A; 2KY9 A; 1YI2 T; 1WHK A; 2MCN A; 3CCE Q; 3UA6 A; 2E5K A; 1PM3 A; 1NPP A; 3EGD A; 1BU1 A; 5FW9 A; 1V1C A; 3HPW A; 1QVP A; 3MO8 A; 1TS9 A; 3NMZ C; 1YJW T; 1N8R U; 2RQT A; 3S3N A; 2K57 A; 4RG2 A; 5LJ3 j; 2DEQ A; 3REA B; 4LD6 A; 1UTI A; 1WDX A; 5GMK i; 1AWO A; 2DXB A; 3WVD B; 1VQM Q; 4QKU A; 3M59 A; 3CMA Q; 3SD4 A; 3JCM f; 5GAO r; 1BIB A; 2MF2 A; 5CVI A; 1VQP Q; 3MCA B; 2ED0 A; 3OSS C; 2EJ9 A; 1U8R A; 3VRZ A; 2LT4 A; 4EMK A; 4M77 D; 3CCU A; 2AT1 B; 4C92 D; 1M4Z A; 2CUB A; 1VQ7 T; 2EJG A; 3QYH B; 1VQK Q; 1JO8 A; 4J9B A; 3M9Q A; 4AT1 B; 4PK4 A; 3MEU A; 2LTO A; 1NJI U; 3EHQ A; 3UA7 A; 1AWX A; 2LCC A; 2RHZ A; 1YIT T; 1VQN A; 2JN0 A; 3E9F A; 1W2B P; 4ME7 A; 4HVV A; 2VXF A; 4J6W A; 3JV3 A; 4KT0 E; 3JB9 D; 1WHL A; 5IN1 A; 5IT9 E; 4F04 B; 1ZA2 B; 2DE0 X; 1Y96 B; 4JDS A; 1GCQ C; 4LUD A; 1WQ7 A; 4K11 A; 2KT1 A; 4XTX A; 4ZGE B; 1Q82 C; 3LGF A; 2DEU A; 2JMC A; 3RKY A; 3RMS A; 2BE7 D; 2QDY B; 1W2B A; 3PVQ A; 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1OU8 A; 2L3P A; 1KK7 A; 2DBM A; 5KYN A; 1JXM A; 1YI2 A; 1GFD A; 2ZPG B; 3ZL7 C; 4RTU A; 4AG2 C; 2JJ9 A; 3EG0 A; 5C6S A; 1YJW A; 2ZCF B; 1HK9 A; 3G6E Q; 4O5V A; 4C8Q B; 4JRQ A; 3KFV A; 3PFS A; 3P8H A; 2M0Y A; 4KH0 B; 1K8A C; 3VRY A; 1JJ2 P; 4DBH A; 2A08 A; 2E5Q A; 4C8Q C; 2RJE A; 4Z88 A; 4X1V A; 3FLG A; 3BDL A; 2LT1 A; 2CP6 A; 3KXT A; 4JS5 A; 5KYX A; 1PHT A; 4PFZ A; 4LUE A; 4AFZ C; 1PD1 A; 2QQB A; 2RJD A; 2RK2 A; 2AKK A; 5J39 A; 1WIE A; 5GAN g; 2CGH A; 3OYM A; 4FYX B; 3GOX A; 3EGU A; 3CC2 Q; 2LZ6 B; 5KE3 A; 1ZBX A; 1SPK A; 3CEY A; 3JCM b; 1N9S A; 2ABL A; 3EGX B; 4LDY A; 2HEQ A; 5LJ5 h; 4IUT A; 1UG1 A; 3JCM g; 3MPU B; 3A98 A; 3SEM A; 3AHU A; 1JB0 E; 4BB7 A; 1YJ9 T; 3I55 T; 2P4R A; 1KIK A; 4V2S A; 2J06 A; 1PRM C; 3OYE A; 4Z8A A; 2IIM A; 4IUP A; 3QXE B; 5IH2 A; 1OQK A; 1T3L A; 2DM1 A; 3RIR A; 2H3J A; 4DOV A; 3M54 A; 3DLL A; 4OVA A; 1VQ6 T; 2O31 A; 4J7F A; 2YHT A; 2DVJ A; 4A4G A; 2XU8 A; 5KYU A; 5HCK A; 1W4S A; 1Q86 U; 2L89 A; 2KGT A; 2BZ8 A; 4ZN1 A; 2YRD A; 4EMG A; 2G3R A; 4J83 A; 1QQJ A; 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