The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
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sequence length |
68
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structure length |
68
|
Chain Sequence |
IFDIYVVTADYLPLGAEQDAITLREGQYVEVLDAAHPLRWLVRTKPTKSSPSRQGWVSPAYLDRRLKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
OBSCURIN
|
| publication title |
Solution Structure of the SH3 Domain of Obscurin
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Sh3-domain
|
| total genus |
4
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| structure length |
68
|
| sequence length |
68
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| ec nomenclature |
ec
2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase. |
| pdb deposition date | 2004-04-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2V1R A; 1W1F A; 2V1Q A; 2GBQ A; 2EYX A; 2JMC A; 2BZ8 A; 1AVZ C; 2M51 A; 1I0C A; 2K7A A; 5IHI A; 3RNJ A; 2EPD A; 1N5Z A; 2ROL A; 1UUE A; 2E5K A; 3A98 A; 3VS3 A; 2RPN A; 1B07 A; 2CSI A; 1K76 A; 4J9I A; 2D1X A; 2DL5 A; 2KR3 A; 4A63 B; 1MUZ A; 2NUZ A; 4JJC A; 4RTU A; 5ECA A; 1WX6 A; 1X6G A; 2FG0 A; 4CC7 A; 2FRY A; 1AZG B; 4Z88 A; 1X2Q A; 2HCK A; 2LQW A; 4OML A; 1OV3 A; 3CQT A; 2EYY A; 3EHR A; 1GFC A; 3ULR B; 2C0T A; 2EW3 A; 5IXF A; 2CH4 A; 4R0K A; 4D8D A; 5IHK A; 2EGA A; 4RTY A; 1PNJ A; 2ROT A; 4FSS A; 5IH2 A; 1GL5 A; 2LP5 A; 3SHW A; 1NEG A; 2LCS A; 2DRM A; 2BZY A; 1K1Z A; 1PKT A; 1HSQ A; 2BTT A; 1E6H A; 2P4R A; 2EQI A; 3H0H A; 3RBB B; 4JZ3 A; 5GJV B; 1MV0 B; 1SHF A; 2JS2 A; 2KRN A; 1BB9 A; 1OEB A; 3LH5 A; 4HVU A; 2FRW A; 2OI3 A; 1KIK A; 4GLM A; 1TUC A; 1RLQ C; 1X43 A; 4HVV A; 1YCS B; 1A0N B; 2JTE A; 3TVT A; 1QCF A; 2KRO A; 2ABL A; 1UGV A; 1JQQ A; 5L23 A; 4AG1 C; 1GBQ A; 2DYB A; 2EGC A; 4D8K A; 2EYW A; 4DEY A; 1PWT A; 1M3C A; 4J9B A; 2DJQ A; 1T3L A; 2ENM A; 3QWY A; 3THK A; 4F16 A; 2I0N A; 3IQL A; 4JJD A; 4AG2 C; 1GFD A; 3M0Q A; 2G6F X; 2KT8 A; 5I22 A; 1GCQ A; 4CC4 B; 2YT6 A; 1WDX A; 1U3O A; 2DE0 X; 3NMZ C; 4QT7 A; 2F2V A; 1SEM A; 2RQR A; 3GBQ A; 4IIO A; 3UA7 A; 4K11 A; 1Y57 A; 4Z89 A; 2K6D A; 1UDL A; 2O88 A; 1I07 A; 1BBZ A; 4JJB A; 1JO8 A; 4J9H A; 1CKB A; 1ZUY A; 3REA B; 1V1C A; 1PKS A; 1UFF A; 1W6X A; 3UAT A; 4LUD A; 1JU5 C; 2JM8 A; 2LJ0 A; 3EG2 A; 1VYU A; 1UEC A; 2GTJ A; 3I35 A; 2GQI A; 2EGE A; 2PTK A; 1ABO A; 4M4Z A; 3VS4 A; 1UE9 A; 1QLY A; 1CSK A; 1RUW A; 1WI7 A; 2A28 A; 3TSZ A; 1RLP C; 2IIM A; 1HJD A; 4J9C A; 2KGT A; 2DL3 A; 4X1V A; 2CT4 A; 2DVJ A; 3NHN A; 4DEX A; 1OPL A; 3EGU A; 1M27 C; 4J9G A; 4AFS C; 2A37 A; 5FWC A; 1OOT A; 1UG1 A; 2ECZ A; 2EYZ A; 1UTI A; 1UJY A; 2O31 A; 4HVW A; 2YUP A; 1PHT A; 3M0R A; 4LE9 A; 2LMJ A; 3C0C A; 2GGR A; 2EVR A; 1ABQ A; 1AWX A; 1UHF A; 2GTO A; 1H8K A; 1T0H A; 3R6N A; 1QKX A; 2J7I A; 5I11 A; 4RUG A; 1RI9 A; 1Z9Z A; 2M0Y A; 5HCK A; 3REB B; 2DX1 A; 2FEI A; 2FPE A; 2DA9 A; 2LJ1 A; 1ARK A; 5GJW B; 2DLP A; 2A36 A; 4Z8A A; 5FWB A; 3EG3 A; 3SEM A; 3I5S A; 2BZX A; 2HEQ A; 1NM7 A; 2LNH B; 3VS5 A; 2F2W A; 4KRT A; 1JXO A; 3VS6 A; 2D0N A; 4AFQ C; 1X69 A; 4ORZ A; 1G2B A; 1IO6 A; 2PNI A; 2W0Z A; 2DIL A; 1ZLM A; 2RQT A; 2YSQ A; 4WCI A; 1YN8 A; 2YUO A; 2L3P A; 2AKK A; 1PRL C; 1MV3 A; 2HDA A; 4EIK A; 2O9S A; 3EG1 A; 1LCK A; 2KYM A; 1TG0 A; 1FYN A; 1VA7 A; 5FW9 A; 2D8J A; 1WXU A; 2SEM A; 2DL8 A; 3UA6 A; 2CRE A; 2PZ1 A; 1NYF A; 2DM1 A; 1SHG A; 1VYT A; 1WFW A; 2QDL A; 4HXJ A; 1M30 A; 4LNP A; 1GBR A; 2DMO A; 2H8H A; 2O2O A; 4ESR A; 1U06 A; 3I9Q A; 3KFV A; 2OAW A; 4JZ4 A; 1KSW A; 3NPF A; 4OMP A; 4OMO A; 3PVL A; 4RTZ A; 1B3Q A; 2KEA A; 3PVQ A; 2X3X D; 4CC3 A; 2RN8 A; 1JXM A; 1QWF A; 2CSQ A; 1M3B A; 1I1J A; 1UHC A; 2RQU A; 1SRL A; 1X2K A; 3VS7 A; 1QWE A; 1WYX A; 2KE9 A; 1T3S A; 1AEY A; 2OJ2 A; 1ZSG A; 2CUD A; 2AKL A; 3H41 A; 4OMN A; 2FPF A; 4J9F A; 2CT3 A; 1AWO A; 1M8M A; 3M0U A; 2DL4 A; 1JEG A; 2X3W D; 1EFN A; 2MOX A; 2DBK A; 2ED0 A; 2MIO A; 2KRS A; 2CUB A; 2YUQ A; 2VWF A; 1K9A A; 1KJW A; 2ESW A; 2YUN A; 3PE0 A; 3I5R A; 4OMQ A; 1BU1 A; 1Y0M A; 2W10 A; 2J05 A; 2VVK A; 3M0T A; 2JS0 A; 1ZUU A; 2J6F A; 3M0P A; 1U5S A; 1GRI A; 1WA7 A; 4RTX A; 2K9G A; 2VKN A; 2J6O A; 4RTV A; 2AZS A; 1UJ0 A; 3VS0 A; 1E6G A; 2AZV A; 3EHQ A; 5IHN A; 1K0X A; 2JM9 A; 2LZ6 B; 1NG2 A; 2DL7 A; 3U23 A; 3VRY A; 4F14 A; 4F17 A; 2B86 A; 2SRC A; 2L3S A; 2GNC A; 2J6K A; 2L0A A; 2AK5 A; 1SPK A; 4CC2 A; 1FMK A; 2K2M A; 4J9D A; 1VYV A; 4Y92 A; 2JW4 A; 2O9V A; 4RTT A; 2RNA A; 3QWX X; 2KXC A; 2HSP A; 1WLP B; 1X6B A; 2J06 A; 4ZNX A; 1NEB A; 4JPB W; 3H0I A; 4LUE A; 1H3H A; 1K0S A; 4IIM A; 3EG0 A; 5EC7 A; 2NWM A; 1HD3 A; 1PRM C; 3JV3 A; 2EKH A; 2K3B A; 2RQV A; 1NYG A; 2C0O A; 1BK2 A; 2RQW A; 2DF6 A; 2DRK A; 2FPD A; 3TSW A; 3VS1 A; 1WXB A; 4HCK A; 3NGP A; 3UF4 A; 2L3Q A; 5IXB A; 1E7O A; 1G83 A; 2EBP A; 2JT4 A; 3FJ5 A; 2LQN A; 1OPK A; 2CDT A; 1YNZ A; 2KNB B; 4LN2 A; 2A08 A; 2XMF A; 2KBT A; 3M0S A; 2JXB A; 1TUD A; 2KYB A; 1GCP A; 4J9E A; 2LX7 A; 1SSH A; 2L2P A; 1SRM A; 2FO0 A; 1WIE A; 1W70 A; 3VRZ A; 1GCQ C; 3VS2 A; 1ZX6 A; 2JMA A; 2DBM A; 1CKA A; 2MCN A; 1H92 A; 1YWP A; 2CH4 W; 1WXT A; 2YDL A; 1NLP C; 1S1N A; 4OMM A; 2C0I A; 2HBW A; 1AZE A; 1K4U S; 3H0F A; 2KRM A; 1YP5 A; 2F2X A; 4AFU C; 2DNU A; 4E6R A; 1NLO C; 2RF0 A; 1M3A A; 4AFZ C; 1AWW A; 4GBQ A; 3ZL7 C; 1ZUK A; 2LJ3 A; 1YWO A; 1T0J A; 2K79 A; 2ED1 A; 1Z9Q A; 1ZBJ A; 3O5Z A; 2RMO A; 1KFZ A; 1J3T A; 1AWJ A; 2KXD A; 2D8H A; 4RTW A; 1QKW A; 1XOV A; 1X27 A; 1AOJ A; 2KT1 A; 1AD5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1W1F A; 2QK0 A; 5GAN 8; 1OX9 A; 3JCM J; 1I0C A; 1N5Z A; 4PLL A; 1UUE A; 3A98 A; 5FRM A; 2D1X A; 2DL5 A; 4XU1 A; 3G4S T; 2CP5 A; 1YCY A; 4JJC A; 3HL8 A; 2FRY A; 1AZG B; 3OB9 A; 2RH2 A; 1OU8 A; 3G7Z A; 4JDS A; 4EPC A; 1TSF A; 3ULR B; 4DBQ A; 2E6Z A; 1TS9 A; 2EJ9 A; 1Q7Y C; 2LQK A; 4BE1 A; 4FYV B; 1OX8 A; 5IHK A; 2PVO B; 4M75 E; 4RTY A; 4FSS A; 2KK4 A; 1PD1 A; 3CCE Q; 2YRD A; 4KGV B; 1KQS A; 2X4Y A; 2BTT A; 2P4R A; 2EQI A; 2PVG B; 3JCM W; 3CCQ T; 2JS2 A; 2KRN A; 1BB9 A; 4HVU A; 2ZAE A; 1RAF B; 1KIK A; 4GLM A; 3HKS A; 2HQH A; 2Y90 A; 5A2Q E; 4IUQ A; 4C8Q G; 2JTE A; 3TVT A; 1QCF A; 2ABL A; 2KRO A; 5L23 A; 4M78 C; 5LJ3 j; 4OGC A; 5D6X A; 4BDZ A; 5GAN 6; 1NPP A; 2DJQ A; 1T3L A; 2ENM A; 3QWY A; 3MHX A; 2X9H A; 4F16 A; 2AHJ B; 2FVU A; 4AG2 C; 3M0Q A; 3BE3 A; 1GCQ A; 4CC4 B; 2YT6 A; 4HT9 A; 2DE0 X; 2X4J A; 1EX4 A; 5LJ5 e; 2F69 A; 3JCM X; 1SEM A; 2WAC A; 3INZ A; 3OYN A; 2O01 E; 5A0G A; 1QP2 A; 2MWP A; 1YIT A; 2VAS A; 4J9H A; 1CKB A; 1ZUY A; 1VYU A; 1PCX A; 2GTJ A; 3GF5 A; 1VQ7 A; 3G6E Q; 2PTK A; 1ABO A; 1NBE B; 4X9C A; 3VS4 A; 3R6O A; 2A28 A; 1VQ9 A; 1RAA B; 4KBM B; 1RLP C; 4DBR A; 2VXE A; 5CKB A; 3X20 B; 4J9C A; 2KGT A; 5GAM h; 3CC4 A; 2DVJ A; 3KBG A; 1OPL A; 2M1H A; 1VQ8 T; 1UG1 A; 2EYZ A; 3VUZ A; 3JB9 H; 4EMK A; 5CKE A; 2RD1 A; 5CCA A; 3OYL A; 3Q1J A; 5GAN 5; 4N0A A; 3R6N A; 1QKX A; 2YLB A; 3LX7 A; 2J7I A; 2HL5 C; 5I11 A; 4RUG A; 4BUG A; 4NL2 A; 1M90 C; 1FWZ A; 4PJO D; 1M4Z A; 5HCK A; 3REB B; 4ZGD B; 1UGR B; 5HY6 A; 2FEI A; 1HK9 A; 1M1G A; 1KD1 U; 4JRK A; 5GJW B; 2DAQ A; 4Z8A A; 4XTU A; 1OI1 A; 5FWB A; 3I5S A; 2BZX A; 4KRT A; 1JXO A; 3VS6 A; 4RKU E; 4AFQ C; 1M9S A; 1X69 A; 4ORZ A; 4C92 A; 3G71 A; 3A8L B; 2L8D A; 1PRL C; 1YIT Q; 4EIK A; 1KD1 R; 2O9S A; 2DXB A; 1JBM A; 3CPW A; 2K5L A; 1FYN A; 5FW9 A; 4X9D A; 1VQ7 Q; 4FYW B; 3J7A F; 2DL8 A; 3ZEH A; 4M77 A; 1RI0 A; 3CCV T; 2DER A; 3OYD A; 2EJG A; 1PSF A; 2PZ1 A; 2QYZ A; 3CC4 Q; 4ELZ C; 1NYF A; 1SHG A; 1VYT A; 4LNP A; 4VUB A; 2KY9 A; 1QVF P; 2QGG A; 2M0O A; 3GLX A; 2O2O A; 2OTL T; 5KCH A; 4MDW A; 3J81 E; 2OAW A; 1KSW A; 4OMO A; 3SD4 A; 2KEA A; 2CYZ B; 2L5Q A; 3PVQ A; 1IRX A; 1QWF A; 2CGH A; 4PJO F; 1I1J A; 5GAM j; 4C8Q E; 4C5I A; 4ELY C; 3JCM d; 1YJ9 A; 2OJ2 A; 2OAU A; 2X51 A; 1WHM A; 3DLM A; 3H41 A; 2MAM A; 2FPF A; 4C8Q D; 3CME Q; 4J9F A; 1XJW B; 2CT3 A; 2DL4 A; 2X3W D; 2HQE A; 2LT1 A; 3CBM A; 2DBK A; 4F7U A; 3HP9 A; 3OSV A; 2MIO A; 2E65 A; 5KCO A; 1OZ3 A; 1KJW A; 2BE9 B; 1NJI C; 4P5N A; 1VQM Q; 3E9F A; 3G71 Q; 5AT1 B; 2QG9 B; 2QAZ A; 2IVW A; 5IAY A; 4V2S A; 2VKN A; 4HA8 A; 2ZPE B; 1QW1 A; 2AZV A; 3HFN A; 4R55 A; 3OYF A; 2E12 A; 4KH1 B; 3RMS A; 1WJS A; 3SB2 A; 4PJL A; 3J80 E; 3U23 A; 1Y71 A; 5GAO r; 4XU0 A; 3C12 A; 4F17 A; 2B86 A; 4E7J A; 4KUI A; 2PUK B; 1IXD A; 5GAN j; 3CC2 T; 1VYV A; 4YTL A; 3CCS T; 4RTT A; 2RNA A; 3T9N A; 1IGU A; 2F1L A; 2KXC A; 5AYF A; 1O9S A; 2DEQ A; 2RHY A; 2VV5 A; 1M8V A; 2R5M A; 3OW2 P; 2LRQ A; 2R58 A; 1YJ9 Q; 2IG0 A; 4LD6 A; 3CCU T; 1K9M U; 1K8A C; 3HTR A; 5CKD A; 4M7A E; 1Q95 G; 2RQV A; 3C4S A; 3BY7 A; 2DRK A; 1VQK A; 2YLC A; 3TSW A; 5CKF A; 4C92 B; 3KXT A; 2OTJ A; 5D6Y A; 5GAN d; 3I56 A; 1IZ6 A; 1Q81 U; 4J6X A; 3M53 A; 2DET A; 1G83 A; 3L2Q A; 1OPK A; 5IN1 A; 2KNB B; 1BCM A; 4ZTF A; 1K9M R; 3M0S A; 4II1 A; 1LOJ A; 2JXB A; 2KYB A; 2ZPI B; 1VQ4 A; 4J9E A; 3RUX A; 3JAM E; 4M77 B; 3URG A; 3D7S B; 2ZPG B; 1GCQ C; 3VRZ A; 1Q81 R; 1N8R C; 3UWN A; 3OW2 S; 2NYS A; 1KG1 A; 2HKQ B; 2MCN A; 1YWP A; 2CH4 W; 1WXT A; 1WHK A; 2E6N A; 4QVZ A; 1S1N A; 4LDV A; 3FC3 A; 3OMC A; 4OMM A; 1VQ6 Q; 1AZE A; 2HBW A; 3HRU A; 2RJE A; 3H0F A; 3M59 A; 2D6F A; 1NLO C; 1WZO A; 5J3B A; 1D1A A; 4GBQ A; 3DKM A; 5CQY A; 5HK0 A; 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3MEU A; 1C6V X; 2DYB A; 2KI7 A; 2EYW A; 4D8K A; 4DEY A; 4L59 A; 1M1K C; 4B6M A; 2JVV A; 1G3S A; 3G4S Q; 1TUG B; 4F7U F; 2QI2 A; 1JB0 E; 4M77 C; 2HNI A; 4KGX B; 3LH0 A; 5FU7 B; 1PC0 A; 2LX9 A; 4ZN3 A; 4BE0 A; 1WDX A; 3HPW A; 4M78 E; 2V8K A; 3JCM V; 3CCM T; 2COZ A; 2DKG A; 1LNX A; 3GBQ A; 4IIO A; 3GPL A; 4DOV A; 1VQP T; 1QCO A; 3GP8 A; 1I07 A; 4UC4 A; 4JJB A; 3REA B; 4RMO A; 1W6X A; 1JU5 C; 3OMG A; 2K3X A; 2KAF A; 1VQ8 A; 3JRZ A; 2GQI A; 1SF9 A; 2EGE A; 1D09 B; 5HK3 A; 1SSF A; 5GMK j; 2YRC A; 4KH0 B; 2QA4 T; 4NL3 A; 1I5O B; 4PJO A; 2CT4 A; 4DEX A; 4J9G A; 2P0Q A; 5CO7 A; 5FWC A; 1OOT A; 1UTI A; 4Y91 A; 1FX7 A; 2CZ7 B; 4D6W A; 2DD4 A; 1VOM A; 2EKO A; 1TH7 A; 2GGR A; 1ZQ1 A; 3MJX A; 3JB9 G; 2X35 A; 1T0H A; 3H8Z A; 3CCR Q; 2E4H A; 4BY6 C; 3OS0 A; 4MML A; 4QKU A; 2FPE A; 1MGQ A; 5GAO l; 4OB1 B; 3LYI A; 1M2V A; 1ARK A; 2DLP A; 3OY9 A; 4M7D E; 4M75 D; 2HEQ A; 2XHC A; 4FW2 A; 4MDX A; 3TRE A; 5LJ5 f; 4NOY A; 1YHQ T; 4M7D D; 2YXY A; 1IO6 A; 1ZA1 B; 2CS7 A; 2Y4Y A; 1YN8 A; 4L6V 5; 2L3P A; 3X28 B; 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