The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
84
|
structure length |
84
|
Chain Sequence |
GSSGSSGFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Mus musculus
|
| publication title |
Solution structure of the 1st CAP-Gly domain in mouse CLIP-170/restin
rcsb |
| molecule keywords |
Restin
|
| total genus |
7
|
| structure length |
84
|
| sequence length |
84
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01302 | CAP_GLY | CAP-Gly domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | CAP Gly-rich-like domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WHJ A; 1TXQ A; 1WHL A; 2CP7 A; 3RDV A; 2HL5 C; 1LPL A; 3TQ7 P; 3E2U A; 2CP5 A; 2HQH A; 2Z0W A; 2COY A; 1IXD A; 2CP2 A; 1TOV A; 1WHH A; 2E4H A; 2COZ A; 2HKQ B; 2HL3 A; 2M02 A; 2QK0 A; 2E3I A; 2E3H A; 4B6M A; 1WHM A; 1WHK A; 2COW A; 1WHG A; 2HKN A; 2CP3 A; 2CP6 A; 2CP0 A; 2MPX C; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GAN 7; 2G3R A; 1K8A U; 1N8R C; 5KYY B; 1BCM A; 1C1A A; 1Q82 R; 1FXX A; 5FLX E; 3OYM A; 2LDM A; 1KJW A; 1K0S A; 2P0Q A; 2PUK B; 3CC2 Q; 2O01 E; 1OU9 A; 3JCM e; 1Y07 A; 1MNE A; 3UDC A; 3RES A; 1KQ1 A; 3JCM b; 2PTK A; 3SB2 A; 4F16 A; 4LXC A; 3L2W A; 3PE0 A; 3N5B B; 1WHJ A; 2DE0 X; 1Q7Y U; 2GQV A; 2NLU A; 4HCC A; 4F7U F; 3PIP A; 3G4S T; 5GMK m; 5LJ3 h; 3PTA A; 3C0C A; 1UGP B; 4DQ2 A; 3CD6 A; 2LX7 A; 4R56 A; 3CCJ Q; 5EG2 A; 3JCM c; 1M30 A; 1H64 1; 2EQK A; 2DXC A; 2JTE A; 2W10 A; 4J6W A; 2B86 A; 3FDR A; 3UAT A; 4IIM A; 1KD1 C; 2EYX A; 2QXF A; 4M7D A; 2M02 A; 1NJI C; 5FU7 B; 2C06 A; 2RF0 A; 2FPE A; 2J6O A; 3CXC S; 4BY6 C; 1UEB A; 3QHS A; 1WZO A; 2KT1 A; 4C92 F; 1QKW A; 2DTH A; 3OSV A; 2CZ1 B; 1UGR B; 3RDV A; 1Q86 R; 3O8V A; 1PSF A; 2DL5 A; 2MWO A; 4DEX A; 3HSB A; 2V1R A; 1X2K A; 2CZ0 B; 3U23 A; 1RAI B; 3VYH B; 2HQX A; 2LQK A; 4QQD A; 1XQH A; 4E6R A; 2HL3 A; 4D8K A; 4OVA A; 5IHI A; 4ME7 A; 3BDL A; 1VQK A; 2RMO A; 2JVV A; 3QO3 A; 2WSF E; 4IUU A; 2YSQ A; 4F14 A; 4JS5 A; 4DA4 A; 3H41 A; 5KCH A; 1VQ4 Q; 2COY A; 1KK7 A; 1Z9Q A; 3EG9 B; 2RQU A; 2KMT A; 2LQ8 A; 2YRD A; 1YIJ Q; 2DJZ A; 3G71 A; 2ZPI B; 5DLQ E; 5GAO m; 4PFO A; 2AKL A; 2E41 A; 5GJW B; 2KAF A; 1VQ8 A; 5GAN j; 4M78 B; 2SRC A; 4LDY A; 1BI1 A; 3A5Z B; 3TCJ A; 4A4K A; 1KG1 A; 3A98 A; 1Y96 A; 1M1K C; 4OMF B; 3CMA T; 3CCV A; 5HCK A; 4C92 C; 1I07 A; 4LDX A; 2K57 A; 5KYU B; 1ZSZ B; 4C8Q B; 3X26 B; 1A0N B; 2F1L A; 5GAM f; 1NPR A; 2JW4 A; 3C95 A; 4HVV A; 4ELY C; 1ZHI A; 2CP7 A; 1AWO A; 3I55 Q; 2GBQ A; 2HD0 A; 4FYW B; 4GY5 A; 4IUP A; 4BUG A; 1Y7X A; 1AHJ B; 1N8R R; 1UGV A; 1S72 A; 4OB0 B; 2YRC A; 2P0K A; 2ZPH B; 3UWN A; 1GXI E; 3BFM A; 5CKD A; 4LD9 K; 1WHL A; 1T0J A; 3L2Q A; 5GMK e; 3A8H B; 3NTK A; 2DBM A; 3G7Z A; 1TOV A; 5KH6 A; 1YBY A; 2OTJ T; 4Y91 A; 2OI3 A; 5LJ5 g; 4GLM A; 3VRZ A; 3CCQ A; 3CME Q; 4LD6 A; 3M0U A; 1QVG P; 4B6M A; 3EG1 A; 1SSH A; 2JZ2 A; 1BI3 A; 1WXB A; 3O5Z A; 5FWB A; 4KUI A; 4J6X A; 5LJ3 g; 5GAN 6; 8ATC B; 2BZX A; 1YI2 T; 1PC0 A; 4DBH A; 1LOJ A; 3I56 A; 4C0G A; 3GNF B; 1WHK A; 5IXB A; 4C8Q E; 1Q81 U; 3KUF A; 1QQJ A; 4KT0 E; 1VQ9 Q; 1U06 A; 2J06 A; 1NJI R; 2MPX C; 3L2U A; 4ZGJ B; 3EFO B; 4PJL A; 5J39 A; 2DM1 A; 4E47 A; 3ZBD A; 2K5I A; 2MYS A; 2XIC A; 2RQW A; 4QKU A; 2YUQ A; 2M9U A; 4OMN A; 1SF9 A; 1X2Q A; 4PFZ A; 2F5K A; 4LE9 A; 2RN8 A; 5FU6 C; 1YWP A; 2SEM A; 3M57 A; 1K8A C; 4FSS A; 2KRO A; 2PVG B; 2ESW A; 3CCU T; 3VJP A; 3UT1 A; 1I5O B; 1AT1 B; 4HXJ A; 3CPW S; 2DX1 A; 1Y57 A; 4C0Z A; 4ESR A; 5I22 A; 3CC4 A; 3ME9 A; 1WFW A; 5D6Y A; 4J5Y A; 2DVE A; 1PNJ A; 2C0T A; 1OI1 A; 3RIR A; 1Q7Y C; 2FO0 A; 1VQ6 T; 2L3P A; 1YJW A; 1JO8 A; 1AWJ A; 1QVF A; 2LCL A; 2LJ1 A; 3E19 A; 3OSS C; 2V1Q A; 2J7I A; 3VU3 C; 2C0I A; 3M0S A; 1BKB A; 4M7D F; 1I0C A; 2JTM A; 1B34 A; 1OUL A; 2D9T A; 4O6J A; 5L23 A; 3OBW A; 4FM4 B; 3RKW A; 3EAE A; 2V26 A; 2HL5 C; 1KQS S; 3OYB A; 3OW2 S; 4J8O A; 3CC2 A; 4X9D A; 2WSC E; 2ZPF B; 4RUG A; 2AT1 B; 4ZTJ A; 3QYG B; 3FJP A; 4FYY B; 3KFV A; 5GMK j; 1JB0 E; 2EQI A; 2A7Y A; 4QQ6 A; 4MZM A; 4JRK A; 2DVJ A; 2EKH A; 4RTU A; 1FMW A; 2V8I A; 4QVD A; 3VS6 A; 3V7R A; 1GCP A; 1U8R A; 3HPW A; 1VQK Q; 1IO6 A; 1SHG A; 1H92 A; 2FL7 A; 3CCJ A; 2HSE B; 3J80 E; 4PJM A; 1YN8 A; 4MMK A; 1E7O A; 1DJ7 B; 1X6G A; 4B9W A; 3JCM h; 3HP9 A; 5CVI A; 4O5V A; 3QBY A; 4M77 D; 4DBR A; 3GLX A; 2CP3 A; 1ZA1 B; 3G71 Q; 3OYF A; 2M0O A; 2E10 A; 4ZNX A; 1LNX A; 3UF4 A; 3E2U A; 3M58 A; 1JEG A; 3H0H A; 2GCX A; 3WVD B; 3EG2 A; 4M77 G; 3SWN B; 3QG1 A; 5AT1 B; 4UC4 A; 1CKA A; 2DEQ A; 4AFZ C; 5C0M A; 2LCC A; 4M75 C; 2EIF A; 3CCV Q; 1JBM A; 2LT1 A; 4JS4 A; 2HAX A; 4BB7 A; 4XU3 A; 3FB9 A; 3EGD B; 4YTL A; 3OYI A; 4M78 D; 2R5A A; 2O4X B; 5FRO A; 4XU1 A; 3OYL A; 3QJ6 A; 5M9O A; 2EGA A; 3CCM T; 5J3B A; 5IHN A; 1VQ4 A; 2ABL A; 4M7A C; 2J05 A; 3OYG A; 3OYY A; 2ENM A; 1AZE A; 4C8Q D; 1K9M U; 2DF6 A; 4JRP A; 2KBT A; 2CT4 A; 2DMO A; 3JCM Q; 2DL8 A; 1NYG A; 4IUR A; 3WXM B; 3OYH A; 2ZZD A; 3A8L B; 3AT1 B; 3S3M A; 2RJC A; 3MP1 A; 4EMH A; 3E9F A; 1ZBJ A; 2DIL A; 3T9N A; 2MOX A; 5CKB A; 1I5L A; 3FLG A; 2HQH A; 2ECZ A; 1W2B A; 2KI7 A; 1T0H A; 1TUC A; 4ORZ A; 2K9G A; 1ZX6 A; 4WF2 A; 4GLK A; 4XQ3 A; 3I55 A; 3EFR A; 4J9C A; 2MF2 A; 1QLY A; 3SHW A; 2CP6 A; 2GF7 A; 3I56 Q; 3C12 A; 3A8M B; 3MEW A; 1NE8 A; 1WQ7 A; 1KC8 U; 2BZ8 A; 2JJ9 A; 2P4R A; 1UJY A; 3OS1 A; 1IHV A; 1ZA2 B; 2F2V A; 4L5G A; 4J83 A; 5GAN f; 2QEX A; 4F7U B; 3CCS T; 2DTO A; 1Q95 G; 2JUF A; 4Y28 E; 5KYX A; 1N27 A; 4BDZ A; 1Q81 C; 2AK5 A; 4M75 G; 1V29 B; 4OMP A; 2DLP A; 2B8A A; 2QDY B; 3M0R A; 1RI0 A; 2V8J A; 1V76 A; 4OMO A; 1BK2 A; 4RG2 A; 3PMI A; 4AFU C; 3JAM E; 3CME A; 4EMK B; 2QA4 A; 3JCM P; 3I5R A; 4N4G A; 4FW1 A; 1UDL A; 1ZLM A; 3OYK A; 4BD3 A; 1WI7 A; 2L3R A; 1UUE A; 3VUZ A; 4M7A G; 2I2L A; 4M77 A; 3CC4 Q; 2J6K A; 1RL2 A; 2KYB A; 2FRW A; 1M90 R; 2KGT A; 4PJO C; 2R57 A; 2VC8 A; 3G1J A; 1C0M A; 2NUP A; 2XMF A; 2K5F A; 3EGU A; 5GMK h; 1YI2 A; 2A36 A; 2AHJ B; 4C92 B; 5I2M A; 1IXD A; 3QDF A; 4C5I A; 1E6H A; 3JCM g; 2YUP A; 1YJW Q; 3CCE Q; 3CXC A; 4Z89 A; 1X6B A; 4PNO A; 1VQP Q; 2A37 A; 2M0Y A; 3DLM A; 4MZP A; 4ELZ C; 2FZG B; 1QVG S; 1VQN Q; 2K2M A; 1VQO T; 3I5S A; 5GAN e; 1VYU A; 3PT9 A; 4A4F A; 1VYT A; 1G3T A; 1QP3 A; 2DKG A; 4TVR A; 1RAD B; 3VUB A; 2AIR B; 5GAM h; 2F69 A; 2LP5 A; 3HKS A; 4F7U E; 3NTI A; 2NUT B; 1KHC A; 1QW1 A; 4QVZ A; 1TSF A; 4DBF A; 2FZC B; 3DKM A; 1EX4 A; 1TU0 B; 1B3Q A; 2P0P A; 5L8R E; 3X24 B; 1NEG A; 2VB6 A; 3R6O A; 2IIM A; 4HKE A; 3G4S Q; 1D0X A; 4HT9 A; 4AG2 C; 3P8D A; 5HY6 A; 5GAN d; 1JJ2 S; 1IGU A; 4JLI A; 2D6F A; 3OYD A; 1HK9 A; 5A2Q E; 1VQ6 A; 3QSU A; 4E7L A; 2BE9 B; 2VYT A; 1W4S A; 4IUQ A; 4RKU E; 3BE3 A; 4C92 E; 1VQ5 A; 2DYB A; 4PJO D; 2YDL A; 5A0L A; 5KE3 A; 2M16 A; 4AFS C; 2EAY A; 4M4Z A; 4IKF A; 1OV3 A; 1K73 U; 3CCL A; 1YP5 A; 2RI2 A; 2RD1 A; 4PJO G; 1TXQ A; 2CH4 A; 2DD4 A; 2QAZ A; 4PLL A; 4M75 A; 3V8J A; 3H9N A; 1TH7 A; 2GFU A; 4FT4 A; 1X69 A; 1M2V B; 1R8O B; 3SEM A; 1ZBX A; 3RNJ A; 5FU6 B; 1MMN A; 1QWE A; 1NM7 A; 1QCO A; 4Q5W A; 4IUV A; 4ZGD B; 1SRM A; 2MWP A; 3PVQ A; 1PM3 A; 3EG3 A; 5KYN A; 3LWI A; 2DZ9 A; 1TG0 A; 4JDS A; 2E70 A; 5KYW B; 4J9F A; 5IAY A; 4M7A A; 1QMC A; 4FYX B; 2COZ A; 3JB9 J; 1PKS A; 2LNH B; 5IT9 E; 4D6W A; 3VS2 A; 1ABO A; 1FWZ A; 2XI9 A; 2E65 A; 2CT3 A; 2YRV A; 1K9M C; 2FVU A; 1D3B B; 1PWT A; 3CPF A; 2O2O A; 5KCO A; 1AZG B; 3KXT A; 1Z9Z A; 2YXY A; 2RO0 A; 3L42 A; 1UHC A; 2HBP A; 2ZGW A; 2A08 A; 1PKT A; 5J26 A; 1Q82 U; 2EKO A; 3NFC A; 3I9Q A; 3CMA Q; 1MMA A; 4LDU A; 2M1H A; 2HSP A; 2BZY A; 3M4Y A; 2RQT A; 5EC7 A; 3X28 B; 3CBM A; 5IN1 A; 1BI2 A; 2FYK A; 4PJN A; 2KT8 A; 1H3H A; 1UJ0 A; 1EIF A; 1VQ7 T; 2QAS A; 4E7S A; 4FU6 A; 1JU5 C; 2FPD A; 1XNI A; 3EGX A; 4P5N A; 1O75 A; 3EHQ A; 2JT4 A; 2DK3 A; 3QKJ A; 2QEX Q; 1KC8 C; 3CC7 T; 2LVM A; 5GAM g; 3S3N A; 3CPW A; 1MGQ A; 2E6Z A; 2LC4 A; 2EWN A; 4BI3 A; 3QII A; 1GBQ A; 4FSX A; 1CKB A; 2QA4 Q; 1VQL T; 4RG8 A; 2ZCF B; 4HCZ A; 3G6E T; 2VGN A; 1OX8 A; 3HL8 A; 4M7D B; 4M77 F; 3ASK A; 2KNB B; 1FMV A; 4JPB W; 4QW2 A; 1TUD A; 1OZ3 A; 3CCR T; 2DYI A; 5CIU A; 3X25 B; 1MUZ A; 3H8Z A; 3HHT B; 1WA7 A; 3CBO A; 1NPP A; 2LTO A; 2V8K A; 2VGM A; 1VQM A; 3HTR A; 1W2B P; 4PJO A; 2FPF A; 4OGE A; 3ER0 A; 1OEB A; 1BIB A; 3FRN A; 1EFN A; 4NS5 A; 1YI2 Q; 2XDD A; 1JRI A; 1KD1 R; 2BTT A; 1LVK A; 1KQS A; 4KGV B; 3C4S A; 3OW2 A; 3JCM V; 1X43 A; 1M1G A; 3SDZ A; 1BYM A; 3M0T A; 3MP6 A; 4IUT A; 2BE7 D; 2CP2 A; 1WXU A; 3RKY A; 5IHK A; 2LJ3 A; 4E7I A; 3CCS A; 2CRE A; 4Z02 A; 2RH2 A; 5LJ5 e; 2FRY A; 2K79 A; 2WSE E; 3THK A; 3OYE A; 4PL6 A; 5FU7 C; 2EPD A; 2LRQ A; 1WNL A; 3L1A A; 2XD0 A; 2GTJ A; 4EIK A; 3AHU A; 2GGR A; 1M3B A; 1M9S A; 5LJ3 e; 2MI6 A; 4ZTF A; 1ZSG A; 1RLP C; 2XKO C; 2VUB A; 2DIG A; 2QYZ A; 4WCI A; 3CCU Q; 4M77 C; 5CKF A; 1WPY A; 5HK3 A; 1OOT A; 1Y96 B; 4DBQ A; 3J81 E; 1MV3 A; 4C5G A; 3VS3 A; 2RNA A; 4M7D E; 3E1S A; 1RAA B; 2K5L A; 3OMG A; 3GP8 A; 3PMT A; 3X20 B; 3UA6 A; 2K3X A; 4RMO A; 3A8O B; 3CCE A; 3M0Q A; 3GNG A; 1VQP A; 1VQN A; 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5LJ5 j; 1WGS A; 2XHC A; 3EFS A; 1GCQ C; 1CSK A; 1UG1 A; 3TU4 K; 2JS0 A; 2OX7 A; 2DIQ A; 2RJE A; 3MCA B; 2LQN A; 3DB4 A; 5LJ3 j; 2CH4 W; 1YCY A; 1Q82 C; 2DPP B; 2DXT A; 3M56 A; 5GAN 2; 2D8H A; 1SSF A; 2CZ6 B; 2RHX A; 2Y90 A; 1QCF A; 4M78 G; 1N5Z A; 1UGQ B; 3JB9 D; 3CCM Q; 2D0Q B; 2OAU A; 1NZ9 A; 1K8A R; 2D0N A; 2NUZ A; 1ZUU A; 4JJB A; 1S72 T; 3NGP A; 1FYN A; 2JNG A; 5CKH A; 3MKD A; 3OQ5 A; 1R0C B; 1OU8 A; 2RHZ A; 3JRZ A; 5KYY A; 4OF1 A; 2MAM A; 4C8Q G; 1XJW B; 1BU1 A; 2D1X A; 1P92 A; 3CBP A; 4R55 A; 1HD3 A; 1WDX A; 3EH1 A; 1B34 B; 4OB1 B; 1G2B A; 2JS2 A; 3UPU A; 4E7J A; 2Y4X A; 1OZ2 A; 2AZS A; 2EYQ A; 3P8B B; 2L89 A; 3CCQ T; 5CKE A; 1Q7Y R; 1QVG A; 4VUB A; 4BY6 B; 4PJO F; 4BE1 A; 3CMA A; 3FIF A; 4A4H A; 3HFO A; 6AT1 B; 3OS0 A; 1NBE B; 1TUG B; 2CGH A; 1GFC A; 3BY7 A; 3QZ5 B; 1VQM Q; 1F1B B; 4N4I A; 5D6X A; 1I4K 1; 4C5E A; 3VKI A; 4J9G A; 1PG5 B; 4AMC A; 4EPC A; 5IH2 A; 4LDW A; 1VA7 A; 3BW1 A; 3QZ9 B; 2OAW A; 2F2X A; 2RA2 A; 4DOV A; 1VQ7 A; 2IVW A; 2JXB A; 4HA8 A; 2X3X D; 4OMQ A; 3H6Z A; 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