The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
|
sequence length |
84
|
structure length |
84
|
Chain Sequence |
GSSGSSGFRVGERVWVNGNKPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Restin
|
| publication title |
Solution structure of the 1st CAP-Gly domain in mouse CLIP-170/restin
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
7
|
| structure length |
84
|
| sequence length |
84
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01302 | CAP_GLY | CAP-Gly domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | CAP Gly-rich-like domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2E3I A; 1IXD A; 2CP5 A; 2CP7 A; 1TOV A; 2M02 A; 1LPL A; 4B6M A; 2MPX C; 1TXQ A; 1WHJ A; 2HL3 A; 2HL5 C; 2E4H A; 3E2U A; 2Z0W A; 2QK0 A; 3TQ7 P; 2CP6 A; 2E3H A; 3RDV A; 2COW A; 1WHH A; 2CP0 A; 2HKQ B; 1WHL A; 1WHG A; 2CP2 A; 2CP3 A; 2COZ A; 2COY A; 2HKN A; 1WHM A; 1WHK A; 2HQH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2ED1 A; 3QYG B; 3QYH B; 3GBQ A; 4KGZ B; 2L3P A; 2MF2 A; 4DBQ A; 4J9G A; 3V8J A; 4R55 A; 1K8A R; 2C0T A; 2HNI A; 2DIL A; 2L3R A; 3CME T; 4M7D C; 1VA7 A; 3Q1J A; 1M90 R; 5GAM e; 2EBP A; 5GAN h; 2O4X B; 3SWN C; 3I55 A; 2ZPG B; 1OQK A; 2X9H A; 3CQT A; 2RK1 A; 2YLC A; 1RAI B; 5GAN f; 1VQ9 T; 3HRS A; 2JT4 A; 2NUT A; 1OYX A; 2KK4 A; 3CCJ Q; 4ZGE B; 3CCS T; 1FMV A; 1YHQ T; 1OU9 A; 1QWF A; 3L2Q A; 4F7U B; 3OB9 A; 1IB8 A; 3OMG A; 3JCM h; 3EG0 A; 2KYM A; 1QCO A; 3AT1 B; 3OW2 S; 3E1S A; 2RJF A; 2YUN A; 5IT9 E; 1WQW A; 2FZC B; 2ABL A; 1K0S A; 4CC7 A; 1ZBX A; 3JCM f; 5KYY B; 2QDY B; 4J9E A; 4DBR A; 1Q86 R; 1RAD B; 3ZEH A; 4AFQ C; 2KRS A; 4DBH A; 1QVF S; 1VQ7 Q; 1M9S A; 3JB9 I; 3EG9 A; 1VQK A; 2KSS A; 2G3R A; 1Z9Z A; 2BZX A; 1D0X A; 2KYB A; 4XTY A; 4JPB W; 3RUX A; 1KQ1 A; 1BI2 A; 3EGU A; 4KGX B; 1HYO A; 3UF4 A; 4XTW A; 2IG0 A; 2NWM A; 2QQR A; 2H3J A; 4PLL A; 1BU1 A; 1G3W A; 1QVP A; 4MZT A; 2FZK B; 3FJP A; 3CCR A; 4EIK A; 2E64 A; 3DB4 A; 4J8O A; 3V8L A; 3EHR A; 1N6A A; 4RKU E; 2FEI A; 2LC4 A; 3CCE A; 1BCO A; 3H0I A; 3LLR A; 4BE2 A; 1J3T A; 4Y28 E; 4J6X A; 1EIF A; 1I81 A; 4F14 A; 3JAM E; 2RHX A; 2QTV A; 4KT0 E; 1M2V B; 2M1H A; 2F5T X; 1NZ9 A; 2HQE A; 3LX7 A; 5CCA A; 3JCM V; 1WQ7 A; 1M3B A; 2CKK A; 5CR2 A; 2J6F A; 2CYZ B; 2VXE A; 1AT1 B; 1OX8 A; 4PJN A; 3QO3 A; 2O2O A; 2VYT A; 4BD3 A; 2EYW A; 2JMC A; 3NTK A; 2JM8 A; 3LGF A; 2E41 A; 1UEC A; 3VJP A; 1BI0 A; 1TG0 A; 4M78 F; 3M57 A; 4J7F A; 1G83 A; 3M4G A; 4J6Y A; 2EGC A; 3M56 A; 5LJ5 h; 3WXM B; 3E9F A; 3LH5 A; 5IXB A; 1R8O B; 3EFS A; 2KRN A; 2DA9 A; 8AT1 B; 2QXF A; 2YLB A; 2K5F A; 2XDP A; 1ZHI A; 3MJX A; 1KQS P; 1VQ5 Q; 2M16 A; 4TVR A; 3TVT A; 3G7Z A; 1H3H A; 4IIO A; 3JCM J; 4OB3 B; 3LWH A; 3CC7 T; 2VXF A; 1XQH A; 3G6E T; 1VQM Q; 1M1G A; 1WNL A; 2LRQ A; 2RF0 A; 1YJW A; 1KC8 R; 1MGQ A; 2DXC A; 3EFR A; 5LJ3 e; 4PKC C; 1Y7X A; 5KYU B; 3CCV Q; 4J5Y A; 2P4T A; 2QGF B; 3CCQ A; 2RHY A; 2YUP A; 2M0Y A; 1PG5 B; 3NTI A; 1LPL A; 5KYN A; 1D1B A; 1O9S A; 3HRU A; 2EKH A; 3EFO B; 4KRT A; 4V2S A; 5FU7 C; 1S1N A; 3I56 Q; 3CMA Q; 2RQT A; 2O01 E; 2ZPI B; 5A0L A; 1K0X A; 3PE0 A; 2E5K A; 2OTL A; 2DXB A; 2LT4 A; 3BE3 A; 4QW2 A; 1X6B A; 2KXD A; 2EKO A; 3PMI A; 2ZAE A; 1FWZ A; 1G3T A; 3SFM A; 2MAM A; 3ZBD A; 4R56 A; 4E7I A; 2GNC A; 5KE2 A; 3GF5 A; 2DF6 A; 4LDX A; 3JCM b; 1RUW A; 5EC7 A; 1YIT T; 1X43 A; 3G1J A; 4FSS A; 4DEX A; 1YIJ A; 2KRO A; 4RCB A; 3I55 T; 1W2B P; 4KGV B; 1UHC A; 4AT1 B; 2E70 A; 2DJZ A; 1WA7 A; 5GAN d; 2FPF A; 2O4X A; 4OMP A; 3CXC A; 4EMH A; 3PTA A; 4A4F A; 1ABO A; 2E5Q A; 2K5I A; 5DM7 R; 2ROT A; 2PVO B; 1UGP B; 2DVJ A; 3MP6 A; 4LDY A; 3JCM d; 1SPK A; 4M77 B; 2LT1 A; 1S72 A; 1KHI A; 1YJ9 A; 3QJ6 A; 5CKH A; 1RI9 A; 3G71 A; 1BK2 A; 5KYX B; 3QBY A; 5J3B A; 1VQK T; 1OOT A; 4J7I A; 3QHS A; 4NOY A; 4FW1 A; 5CO7 A; 1N27 A; 2DAQ A; 1Y07 A; 5CKB A; 2P0K A; 2YRC A; 1K4U S; 3D7S B; 2DYB A; 4FU6 A; 2DJQ A; 3IQL A; 3CEY A; 4C8Q G; 2CZ6 B; 2FB7 A; 1VQP T; 4C8Q D; 1XTD A; 1CSK A; 5GAN 5; 2XKO C; 3U23 A; 3CCR T; 4NL3 A; 1M8M A; 4RG2 A; 4CI0 C; 3EHQ A; 1HD3 A; 2FPD A; 1D0Y A; 3ASK A; 1YI2 T; 3CCE T; 1I07 A; 1ZSZ B; 3H0F A; 1NM7 A; 5GAO l; 3CCL Q; 3RR6 A; 1QMC A; 1QP2 A; 3CD6 A; 4D8D A; 1P92 A; 4X9D A; 4JRI A; 3OYD A; 1M3A A; 2V26 A; 4C8Q A; 1K9M R; 5I2S A; 4QVZ A; 3A8G B; 4LDW A; 4O5V A; 4FW2 A; 4LE9 A; 3L2Z A; 1OI1 A; 3DB3 A; 3OYM A; 4KUI A; 2M9U A; 3OS1 A; 1Q7Y R; 2LX9 A; 3EGD A; 3VS0 A; 1MV3 A; 3E19 A; 1OX9 A; 1AEY A; 4C0G A; 5M9O A; 1GXI E; 1N8R U; 2AK5 A; 1I1J A; 2V8I A; 2NLU A; 3R6N A; 1VQL A; 2K2M A; 2K2V A; 2RQV A; 2DL3 A; 2HBP A; 2DBK A; 4C8Q E; 1I5L A; 2DK3 A; 2CH4 A; 3J81 E; 2DIQ A; 2SRC A; 3M58 A; 1K76 A; 4MML A; 1FX7 A; 2XHC A; 3TSZ A; 1SG5 A; 1CKB A; 4J9B A; 5LJ5 d; 2NUP A; 1JU5 C; 3FJ5 A; 7AT1 B; 3CC4 A; 3RNJ A; 1QWE A; 2KR3 A; 4E7H A; 1FMK A; 2QEX A; 2QK0 A; 5DLO A; 3PNW C; 4WCI A; 3QG1 A; 1WXT A; 1XNI A; 2CP0 A; 2M0O A; 1YWP A; 4AFU C; 1RI0 A; 2P4R A; 4B9X A; 1BB9 A; 1NYF A; 2JZ2 A; 2VAS A; 3GP8 A; 1E7O A; 4PLI A; 1IXD A; 2KRM A; 1VQ6 Q; 5GAM j; 3CCQ T; 4KH0 B; 1QLY A; 4C0Z A; 4CC4 B; 2QG9 B; 1D1A A; 1VIE A; 3CCM Q; 5KYU A; 1XOV A; 2MIO A; 3V8K A; 3CPF A; 3ER0 A; 3H0H A; 2VVK A; 2CT3 A; 1KG1 A; 2D9T A; 1NYG A; 3P8B B; 3GOX A; 3OSV A; 4VUB A; 4JDS A; 2E3I A; 1PM3 A; 2CP7 A; 1N9S A; 4C92 F; 1NLO C; 3CPW P; 3KFV A; 2LZ6 B; 1LOJ A; 2PU9 B; 1KHC A; 1RAC B; 1ABQ A; 3BY7 A; 3MEW A; 1FXX A; 2RQU A; 4NL2 A; 1YIJ T; 4UC4 A; 2CGH A; 2HMA A; 1KQS S; 2V8K A; 2VV5 A; 3NPF A; 2X4X A; 2BE9 B; 1YHQ Q; 3MP1 A; 2FVU A; 3M0U A; 2EGE A; 4R0K A; 5L8R E; 4IUV A; 4BAC A; 3REB B; 2Y4Y A; 2QAS A; 1VQN A; 2LP5 A; 1U3O A; 3CC2 A; 3VUB A; 2OTJ Q; 1PNJ A; 1Q95 G; 5DY9 A; 1K73 U; 1BIB A; 2L5Q A; 2RN8 A; 1X2Q A; 4KH1 B; 2LJ0 A; 5GMK l; 5GAN 8; 1I5O B; 4KUD K; 1ACM B; 1X69 A; 3OA6 A; 1GRI A; 3CCU A; 2FPE A; 2OAW A; 1D09 B; 1S72 T; 4PJL A; 3A8M B; 1YJ9 T; 2DLP A; 2PZ1 A; 3KXT A; 2YRD A; 2FL7 A; 2DBM A; 3JB9 D; 4M78 G; 2HD0 A; 5AYF A; 2CP3 A; 3OS5 A; 4DA4 A; 1T3S A; 3PT9 A; 4F04 B; 3HFO A; 5I22 A; 5LJ5 e; 1QP3 A; 3H6Z A; 2CP6 A; 1N8R C; 2F1L A; 3VYH B; 1W2B S; 4ATO A; 3VKI A; 1B7T A; 2LX7 A; 4HCC A; 3CXC P; 3A1P A; 3OYJ A; 4M78 A; 1E6H A; 1E6G A; 4XU3 A; 3CBO A; 3CCJ A; 1IO6 A; 2Y4X A; 2P0P A; 2QQA A; 1VQ8 Q; 5CKE A; 1GL5 A; 3JB9 H; 2CS7 A; 3QSU A; 3O5Z A; 1LVK A; 1YN8 A; 1JRI A; 2JOY A; 1PD1 A; 2BE7 D; 4RTX A; 2GFU A; 1SRM A; 1SSF A; 2RHI A; 4GY5 A; 4LDU A; 2WSF E; 2KBT A; 1R0C B; 3ZFJ A; 2DL4 A; 4LUE A; 1VQ7 A; 1GCQ C; 3M0Q A; 3VS5 A; 4J83 A; 2OAU A; 4GBQ A; 5LJ3 j; 1WPY A; 3WVD B; 1LNX A; 2JN0 A; 4OMF B; 1MUZ A; 4OMQ A; 4RG8 A; 2DTO A; 4JJN K; 2FZG B; 2LMJ A; 4MZM A; 1X6O A; 3M53 A; 4OB2 B; 1Q81 R; 3MHX A; 2DMO A; 2V8J A; 4L5G A; 1RLP C; 4HVU A; 4M7A F; 2F2X A; 2CUD A; 3MKD A; 4D8K A; 2C0O A; 3CC4 T; 1UEB A; 2QEX T; 1MMN A; 4LN2 A; 3VS7 A; 5IHK A; 5C0M A; 2DYI A; 2A36 A; 3X25 B; 5GAM g; 1TWB A; 1MHN A; 3G4S T; 2IVW A; 3A8H B; 4JZ4 A; 4N0A C; 3OYF A; 1HJD A; 1TXQ A; 4LD6 A; 1OU8 A; 3QWX X; 4M75 F; 1QVG A; 1B34 A; 1AD5 A; 4M77 C; 4FM4 B; 2DXT A; 1SEM A; 2VUB A; 3ME9 A; 1K73 C; 1ZUU A; 1SHG A; 5GAO m; 5GAO q; 4M7D F; 3SEM A; 4A63 B; 2MWO A; 3I35 A; 2KY9 A; 3E9G A; 4E47 A; 1WX6 A; 4XTV A; 2DEQ A; 4N4G A; 3INZ A; 2RMO A; 2Z0W A; 1YIT Q; 3RKY A; 1M1K U; 4HA8 A; 2ATC B; 1WHH A; 2XID A; 4BDY A; 4C8Q B; 2CP2 A; 2J05 A; 5CKF A; 5IXF A; 3FRN A; 4OMO A; 2L3Q A; 1YBY A; 2RK2 A; 3TU4 K; 1VQ5 A; 4KBM B; 1O75 A; 1TH7 A; 2J06 A; 1U1S A; 5FU6 B; 1Y0M A; 2OI3 A; 3OYB A; 1ZSZ C; 1WIE A; 3EGD B; 1ARK A; 1MMG A; 1IZ6 A; 3M5A A; 1VQM A; 5HY6 A; 4E7S A; 3CC2 T; 3HSB A; 1RAA B; 4J9H A; 1G3Y A; 5HCK A; 8ATC B; 2DL8 A; 2JMA A; 2XU8 A; 2GQV A; 3CCV A; 1VQO Q; 2K57 A; 6AT1 B; 3OYN A; 1PC0 A; 2DER A; 3L2W A; 3CBP A; 3CCU T; 2EYZ A; 5FW9 A; 4FYX B; 2RNA A; 4OML A; 2NUP B; 3OYG A; 2HSE B; 4C5H A; 3I56 A; 3CMA A; 1QQJ A; 2C0I A; 3PIP A; 3QXE B; 1VYT A; 1GFC A; 2HCK A; 1RAH B; 2RHU A; 4HVV A; 1VQP Q; 4JRP A; 4C0F A; 2FYK A; 1NG2 A; 2CP5 A; 1ZBJ A; 4QVC A; 2CZ1 B; 5CVI A; 2YWW A; 3CPW S; 2I2L A; 1JXM A; 2E6Z A; 5FRO A; 5GAO n; 2DTH A; 1KD1 C; 1YI2 Q; 3S3N A; 2R5A A; 3VV0 A; 9ATC B; 1UE9 A; 1C0M A; 2DE0 X; 2XDD A; 5IHI A; 2MWP A; 1IRE B; 1WFW A; 3HP9 A; 3OYE A; 3VS2 A; 3CCJ T; 2O88 A; 1SSH A; 3OBY A; 3OYL A; 4FL6 A; 2L8D A; 4PK4 A; 2K79 A; 4AFS C; 1D3B A; 2DX1 A; 2EFI A; 2COZ A; 2OX7 A; 4LXC A; 2MOX A; 1HK9 A; 1PHT A; 5LJ3 g; 2RJC A; 4HVW A; 2DO3 A; 1G5V A; 1C1A A; 4PNO A; 3A8L B; 2MK5 A; 5FWB A; 1UTI A; 2DNU A; 2M51 A; 4XTU A; 1VQ7 T; 1RAG B; 2E10 A; 3M0S A; 4C92 G; 5GAM h; 2RO0 A; 4J9C A; 5GMK m; 1LJO A; 2X4Y A; 1TTH B; 1XJW B; 2KT1 A; 1NBE B; 5KCH A; 1GBR A; 1M1F A; 1RAE B; 5GAM f; 1GFD A; 1NEB A; 1Q86 U; 3GPL A; 2JJ9 A; 1G8X A; 4JS5 A; 3M4Y A; 1U06 A; 1R0B G; 4F17 A; 1M1K C; 3C4S A; 1WHG A; 5J39 A; 3CXC S; 2D1X A; 2COY A; 3L1A A; 4C92 A; 3OYK A; 4BY6 B; 1MMA A; 5IN1 A; 3CCL A; 4J6W A; 4BI3 A; 2RHZ A; 1YFN A; 4ZN3 A; 2XIC A; 2LCC A; 3OBW A; 3OMC A; 1OPK A; 3UT1 A; 4EMK A; 3UAT A; 4WTO B; 4KUL A; 1TSF A; 2X3W D; 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2FHD A; 3X26 B; 2OTJ A; 2QDL A; 2RJD A; 3H9N A; 1NPR A; 3JCM c; 1Y57 A; 4M75 G; 1AWO A; 4QVD A; 4XU0 A; 4M7A A; 4HT9 A; 2OTL T; 2RI5 A; 1KQ2 A; 4OB1 B; 2JTM A; 1OPL A; 3CME Q; 1AZG B; 5CQX A; 1WHJ A; 2MMP A; 4M7D G; 1GBQ A; 2E4H A; 2EYX A; 2A7Y A; 3EG3 A; 4ZTF A; 2VB6 A; 1QW1 A; 4JRK A; 2HZY A; 1RAB B; 4EDU A; 4M75 A; 1VQ9 Q; 4FYW B; 1X01 A; 4C8Q C; 3CCS Q; 1WJR A; 1ZSG A; 5GAM d; 1WI7 A; 2JVV A; 3QKJ A; 4B6M A; 2VGM A; 2RI3 A; 2L89 A; 2EVR A; 1X2K A; 2EWN A; 1WJQ A; 1OZ3 A; 4F7U F; 4P5N A; 2LJ3 A; 4M7D A; 3VYG A; 4RCC A; 4CC3 A; 5FU6 C; 2QQ9 A; 1WHL A; 4ZGD B; 3G4S Q; 3VS4 A; 4AG2 C; 3KBG A; 2X4W A; 3OYI A; 2K6D A; 4DOV A; 2YXY A; 3SWN A; 3SB2 A; 2JM9 A; 1QKW A; 1MND A; 3CCL T; 3NGP A; 4MDW A; 1VQ8 A; 1V29 B; 4A4E A; 1X75 C; 3RDV A; 3G71 T; 1A0N B; 2GQI A; 1UFF A; 5CK9 A; 4AG1 C; 3S3M A; 2F5K A; 4JUV A; 5CIU A; 1TUC A; 3MEA A; 4M78 D; 3AHU A; 1C6V X; 4E7K A; 4M7D E; 3EGX A; 2JNG A; 2R58 A; 3QDF A; 3UPU A; 2V1R A; 1JO8 A; 3M0R A; 2DFU A; 2DL7 A; 2PNI A; 3QZ9 B; 2QGG A; 2WSC E; 2NUZ A; 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