The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
TGKELVLVLYDYQEKSPRELTIKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFIPAAYLKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Conformational Strain in the Hydrophobic Core and its Implications for Protein Folding and Design
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Sh3-domain
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| source organism |
Gallus gallus
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| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN
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| total genus |
10
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| structure length |
59
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| sequence length |
59
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-08-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3QWY A; 3NHN A; 1UDL A; 1BK2 A; 1YWO A; 1K1Z A; 4OMM A; 2EW3 A; 2H8H A; 2FPF A; 2SEM A; 2BZ8 A; 3JV3 A; 2JMC A; 3FJ5 A; 2DM1 A; 1AZG B; 2YUO A; 1AEY A; 1ZUK A; 1GBR A; 1E6G A; 2KEA A; 1W6X A; 2A28 A; 1WDX A; 2CDT A; 2M0Y A; 2BZY A; 2HDA A; 2LJ1 A; 3PVL A; 4JJB A; 1CKB A; 4RTZ A; 2CSI A; 2DL5 A; 1X2Q A; 1PWT A; 3A98 A; 3RNJ A; 1Y0M A; 2KRS A; 2YUP A; 4J9F A; 2AZS A; 2ABL A; 2L0A A; 3H0F A; 3ULR B; 1MUZ A; 4HXJ A; 2C0I A; 2D0N A; 4JJD A; 1SSH A; 2DL8 A; 2KRO A; 1ZUU A; 4J9H A; 3IQL A; 4HVW A; 1I07 A; 1JXM A; 2KT1 A; 1X6G A; 2V1Q A; 1OOT A; 1PHT A; 2ECZ A; 2XMF A; 3VS1 A; 4AFU C; 2CSQ A; 2K6D A; 2EYW A; 1VA7 A; 1W70 A; 1TUD A; 4LNP A; 2HSP A; 5I22 A; 1NEG A; 4AFS C; 5IH2 A; 2E5K A; 4JPB W; 1AOJ A; 1SPK A; 3M0Q A; 2CH4 W; 2F2V A; 2EYZ A; 4RTX A; 1QKW A; 2F2W A; 1WLP B; 1GL5 A; 1QCF A; 1UUE A; 3VS6 A; 1NEB A; 2I0N A; 3VS4 A; 1BU1 A; 4AFZ C; 2DLP A; 1ARK A; 1G2B A; 2CRE A; 2JS2 A; 3EG1 A; 4CC7 A; 1WI7 A; 1JU5 C; 3I5S A; 1M3B A; 1ABO A; 3EHQ A; 3SHW A; 3NGP A; 4QT7 A; 2O2O A; 1E7O A; 5ECA A; 2JTE A; 4A63 B; 1AWO A; 5IHN A; 3CQT A; 1WIE A; 4F14 A; 1T0J A; 5L23 A; 1K9A A; 1SRM A; 3U23 A; 3EGU A; 1X2K A; 2JMA A; 1WXT A; 2O88 A; 1ZSG A; 2LZ6 B; 2A36 A; 2J7I A; 2OAW A; 2GTO A; 5FW9 A; 1H3H A; 1Z9Q A; 2FPD A; 2W10 A; 1SEM A; 3VS3 A; 2L3S A; 1SHG A; 5IXF A; 1YP5 A; 3UA7 A; 1PRM C; 3RBB B; 4R0K A; 1PNJ A; 2QDL A; 1G83 A; 1UE9 A; 2JT4 A; 4JJC A; 2YT6 A; 4J9G A; 1GBQ A; 3EG2 A; 1WX6 A; 2BZX A; 4J9B A; 3UAT A; 1K76 A; 2EGA A; 1TUC A; 2LCS A; 2FEI A; 1UTI A; 1GCP A; 5HCK A; 4WCI A; 1UHC A; 1UEC A; 2K3B A; 2O9V A; 2J6F A; 1MV0 B; 2X3X D; 2O31 A; 2LJ3 A; 2J05 A; 2X3W D; 4GLM A; 1GFD A; 2OJ2 A; 4F16 A; 2C0O A; 1H92 A; 1WXB A; 2DYB A; 1ZLM A; 1ZBJ A; 1T0H A; 2DJQ A; 2FO0 A; 1AZE A; 3R6N A; 1U06 A; 1AWX A; 1UJ0 A; 1NLO C; 4AFQ C; 4LN2 A; 1K4U S; 1B07 A; 2GTJ A; 1KIK A; 2KE9 A; 2M51 A; 5EC7 A; 1OV3 A; 3PVQ A; 1B3Q A; 2A37 A; 1SHF A; 1OEB A; 3THK A; 2DE0 X; 1JO8 A; 2DF6 A; 2DBK A; 2DL7 A; 1HJD A; 1WYX A; 2KNB B; 2NUZ A; 3M0S A; 2W0Z A; 4OMO A; 3VRY A; 3M0P A; 4D8D A; 1PRL C; 1UJY A; 2YSQ A; 4LUD A; 4RTU A; 1AD5 A; 1HSQ A; 4IIM A; 1WFW A; 3REA B; 1ZX6 A; 2LQN A; 2HEQ A; 2GQI A; 2DRK A; 1VYV A; 2O9S A; 2FPE A; 2LX7 A; 2J6O A; 3H41 A; 2K9G A; 2CUB A; 2KGT A; 2K7A A; 1RLP C; 2AKK A; 2KBT A; 4ESR A; 2K79 A; 2L3Q A; 1NG2 A; 2PNI A; 3EG3 A; 2ESW A; 4JZ4 A; 3GBQ A; 4Z89 A; 5IHK A; 2B86 A; 4M4Z A; 2C0T A; 1NYG A; 3VS2 A; 4CC4 B; 1CKA A; 3QWX X; 2HBW A; 2RQV A; 1U3O A; 2CT4 A; 2RN8 A; 3O5Z A; 2L2P A; 2JW4 A; 2AKL A; 1UHF A; 2FRY A; 2K2M A; 1T3S A; 2MIO A; 1NM7 A; 1M3C A; 3VRZ A; 1CSK A; 2DNU A; 2RQR A; 2KXD A; 4LE9 A; 4RTV A; 2DRM A; 1GRI A; 2EYY A; 3KFV A; 3NMZ C; 2OI3 A; 4LUE A; 1TG0 A; 2EYX A; 1OPK A; 1UFF A; 1GCQ A; 2NWM A; 4AG2 C; 2DMO A; 2RQU A; 4RUG A; 1GFC A; 3H0H A; 2CUD A; 2LJ0 A; 2V1R A; 2D1X A; 2KXC A; 1V1C A; 2RMO A; 2D8H A; 3PE0 A; 1RUW A; 2VKN A; 4ZNX A; 1UG1 A; 2F2X A; 3C0C A; 3H0I A; 1VYU A; 1J3T A; 1YCS B; 2EVR A; 2DIL A; 3VS5 A; 2KYB A; 1U5S A; 4IIO A; 2JM8 A; 2P4R A; 3M0T A; 4OMQ A; 2EGC A; 4OML A; 2YUN A; 3VS7 A; 5IXB A; 1ABQ A; 2EBP A; 4HVV A; 4RTW A; 2RNA A; 1S1N A; 1I0C A; 4D8K A; 2FRW A; 1XOV A; 3VS0 A; 2GGR A; 1MV3 A; 2DA9 A; 3EHR A; 2IIM A; 4ORZ A; 2J06 A; 2JS0 A; 2AK5 A; 4KRT A; 1NLP C; 1VYT A; 1KJW A; 2YDL A; 1BBZ A; 1X6B A; 1KFZ A; 1T3L A; 2JXB A; 2EGE A; 1OPL A; 1K0X A; 1AVZ C; 4J9E A; 2VVK A; 1EFN A; 2CT3 A; 1JXO A; 1QKX A; 2FG0 A; 1ZUY A; 1JQQ A; 2RQW A; 3M0R A; 5I11 A; 1SRL A; 3NPF A; 2ED0 A; 4K11 A; 3ZL7 C; 2GNC A; 2KRM A; 2MOX A; 4Z88 A; 1YNZ A; 1HD3 A; 1Z9Z A; 4OMP A; 2D8J A; 5IHI A; 2DVJ A; 2DX1 A; 4E6R A; 4EIK A; 3EG0 A; 2KRN A; 3TSW A; 1X27 A; 1E6H A; 1I1J A; 1FYN A; 3I5R A; 2ED1 A; 1RI9 A; 1A0N B; 4AG1 C; 1M27 C; 1RLQ C; 2G6F X; 4OMN A; 1GCQ C; 4FSS A; 4Z8A A; 2A08 A; 1X43 A; 1X69 A; 5FWB A; 1Y57 A; 4RTT A; 1WA7 A; 2RQT A; 5GJV B; 4X1V A; 2EQI A; 1H8K A; 4DEY A; 4CC2 A; 1BB9 A; 2DL4 A; 1QWF A; 3LH5 A; 2KR3 A; 2BTT A; 1LCK A; 2LQW A; 4RTY A; 3UA6 A; 2GBQ A; 3TSZ A; 2PZ1 A; 2CH4 A; 2L3P A; 3UF4 A; 2PTK A; 1NYF A; 2MCN A; 1M8M A; 2DL3 A; 2YUQ A; 1AWW A; 2VWF A; 5GJW B; 2LP5 A; 1N5Z A; 1M3A A; 1WXU A; 2KYM A; 2J6K A; 1YWP A; 1YN8 A; 1W1F A; 3I9Q A; 4J9C A; 2EPD A; 3REB B; 1FMK A; 1PKT A; 3TVT A; 3I35 A; 2RPN A; 3M0U A; 1M30 A; 2SRC A; 2JM9 A; 2HCK A; 2AZV A; 3SEM A; 1QLY A; 4Y92 A; 2LMJ A; 1QWE A; 2ENM A; 1IO6 A; 5FWC A; 1JEG A; 4J9D A; 1K0S A; 4DEX A; 2ROL A; 4JZ3 A; 4J9I A; 2KT8 A; 2LNH B; 4HVU A; 2DBM A; 4CC3 A; 4F17 A; 2RF0 A; 1PKS A; 1KSW A; 4HCK A; 2ROT A; 4GBQ A; 1UGV A; 1AWJ A; 2EKH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3QWY A; 2XD0 A; 1BK2 A; 1ZSZ B; 3M5A A; 2QI2 A; 2PUO B; 1P92 A; 4C92 G; 1YI2 A; 3SB2 A; 1VQ4 T; 1B34 A; 4FT2 A; 2F5T X; 1UEB A; 1GBR A; 3CME T; 2KEA A; 3G71 A; 5LJ3 h; 5J26 A; 5GAN 6; 3JCM J; 2HDA A; 1YIJ T; 4JJB A; 1CKB A; 5I2S A; 2DL5 A; 4NL3 A; 4XTU A; 3VYG A; 4M7D B; 3OQ5 A; 4KGZ B; 2ZPG B; 4TVR A; 2YUP A; 2A7Y A; 2EJG A; 1MUZ A; 2CP6 A; 4RCC A; 3CMA Q; 2DEQ A; 2HQH A; 1YHQ A; 5D6W A; 1BYM A; 1WNL A; 4PNO A; 3M54 A; 1SSH A; 3V8L A; 1ZUU A; 4J9H A; 3IQL A; 4HVW A; 1I07 A; 5GAN h; 1D3B A; 2KT1 A; 1VQL A; 2K57 A; 2XMF A; 5GAN 7; 4HCB A; 3X26 B; 3OYN A; 2CSQ A; 1VA7 A; 1QVF A; 1N6A A; 3VJP A; 4LNP A; 2CYZ B; 2YRD A; 1RAE B; 4JPB W; 4LXC A; 3M0Q A; 3CC2 A; 1WHM A; 2L89 A; 4OB0 B; 1Q86 R; 2F2W A; 3CMA T; 2H3J A; 4PFZ A; 1Q81 R; 1WLP B; 4BE1 A; 4MDX A; 5FU6 B; 2JUF A; 2I0N A; 1VQ6 Q; 4PJO F; 1VQP A; 3E9G A; 1KD1 U; 2JS2 A; 1K73 U; 1I5O B; 4NL2 A; 1JU5 C; 1M3B A; 1ABO A; 4QKU A; 3CCM T; 1C1A A; 1NJI R; 4M7A F; 1W2B A; 3CCL A; 7AT1 B; 2VC8 A; 4QT7 A; 2O2O A; 1E7O A; 4C5I A; 2CP0 A; 2ZGW A; 1W2B P; 3JB9 J; 5FRN A; 1M90 R; 4C92 F; 1D09 B; 1VQ6 T; 5L23 A; 3LLR A; 2RM4 A; 1SRM A; 2OX7 A; 3JB9 F; 1IB8 A; 3P8D A; 3QYH B; 1WJQ A; 3A8L B; 1VQ5 T; 1LPL A; 3I55 A; 2O88 A; 2LZ6 B; 3CXC A; 5I2M A; 1QW1 A; 2A36 A; 2OAW A; 2GTO A; 2W10 A; 3RMS A; 2RHU A; 1N8R C; 1SHG A; 3UA7 A; 3LGF A; 3CXC P; 3JCM V; 2QK0 A; 3A8G B; 4RG8 A; 1LJO A; 3UAT A; 3V7S A; 4LDY A; 5CO7 A; 1AT1 B; 2DTH A; 2EGA A; 2LCS A; 2FEI A; 1UTI A; 4JDS A; 1GXI E; 2PVG B; 3P8H A; 4A4E A; 2J6F A; 2X3X D; 3HP9 A; 1TUG B; 5CKH A; 1Y96 A; 1OQK A; 2C0O A; 3S3O A; 4DBQ A; 5DLO A; 3FB9 A; 3LW5 E; 3PMT A; 2VAS A; 4PJO C; 4FW1 A; 1AWX A; 1MMN A; 3J7A F; 4J8O A; 2YLC A; 3MP1 A; 5KYU A; 4AFQ C; 4LN2 A; 1KQS A; 2PVD B; 1K4U S; 3JCM c; 4M7A C; 5KYX B; 2VXE A; 4ZGD B; 2HMA A; 5CK9 A; 3M58 A; 1KQS P; 1OV3 A; 4M75 A; 3PVQ A; 1B3Q A; 1EX4 A; 4OB2 B; 1OEB A; 4C92 C; 3M0S A; 4FYY B; 2W0Z A; 3VRY A; 3M0P A; 4FL6 A; 4HA8 A; 1NPP A; 4RTU A; 4BY6 B; 1V76 A; 1AD5 A; 1FXX A; 2FB7 A; 1Q7Y C; 4IIM A; 4M78 E; 2LQN A; 2A0F B; 3CBP A; 2JTM A; 2H3E B; 3EG9 B; 1EIF A; 2LX7 A; 3DB4 A; 2F69 A; 4PFO A; 2K7A A; 3VUZ A; 3G4S Q; 1NE8 A; 2O4X B; 3D7S B; 3MJX A; 5GAO p; 3EG3 A; 2ESW A; 3JCM g; 4HT9 A; 4M4Z A; 2ZPB B; 4C0Z A; 4GLK A; 3QWX X; 1N27 A; 4D6W A; 3FDR A; 3O5Z A; 3G4S T; 4EMH A; 1UHF A; 3VV0 A; 2FZG B; 3CCJ A; 2DNU A; 1OZ2 A; 2WAC A; 2QG9 B; 4M75 G; 1GRI A; 1VQO A; 3NMZ C; 3OW2 A; 3OA6 A; 2EYX A; 2RJE A; 2NUP B; 3MP8 A; 3PNW C; 2XG8 D; 4J83 A; 5GMK j; 3OW2 P; 4FT4 A; 2CUD A; 2IVW A; 2V1R A; 1MND A; 3WVD B; 8AT1 B; 2P0P A; 5DY9 A; 2I2L A; 2D9T A; 5A2Q E; 2RMO A; 1YJ9 T; 1FWZ A; 3PE0 A; 2VKN A; 4ZNX A; 2F5K A; 3H0I A; 3L2W A; 1VYU A; 3V7C A; 3M9Q A; 1XTD A; 4IUV A; 2EVR A; 4C5E A; 2EFI A; 4E7S A; 2P4R A; 3OYF A; 1R8O B; 1KQ1 A; 2ATC B; 1ABQ A; 4PFP A; 3GOX A; 4HVV A; 3HHT B; 3RIR A; 3CD6 Q; 1S1N A; 4D8K A; 1XOV A; 3X28 B; 1OZ3 A; 2J06 A; 3QXE B; 4E7K A; 1VQN Q; 2YDL A; 1BBZ A; 4BDZ A; 3CC7 Q; 4PJO D; 5KH6 A; 1X6B A; 1I4K 1; 1T3L A; 2JXB A; 1R77 A; 4II1 A; 4C0G A; 5J3B A; 1OPL A; 3GNG A; 2LQ8 A; 1EFN A; 4M7A D; 1IRE B; 1JXO A; 1BKB A; 3CPW S; 3CD6 T; 4X34 A; 2E3I A; 4M75 F; 1M9S A; 3ZL7 C; 1C6V X; 4Z88 A; 3EH1 A; 1VQN T; 4XK8 E; 3CC7 T; 1YNZ A; 3X25 B; 4IUP A; 4EIK A; 4XU0 A; 2KRN A; 1WQW A; 3FIF A; 3I5R A; 4M7A B; 1KK7 A; 3DKM A; 3L1A A; 5M9O A; 3S3N A; 1A0N B; 2DZ9 A; 2G6F X; 2COZ A; 1GCQ C; 1WZO A; 1D0Y A; 2QQ9 A; 1X01 A; 4RMO A; 2RQT A; 4C92 B; 5GJV B; 2PU9 B; 1H8K A; 1M2V B; 4DEY A; 4CC2 A; 2LVM A; 3LH5 A; 2KR3 A; 3M57 A; 1LCK A; 5A0D A; 2GBQ A; 1YCY A; 2PTK A; 4XTW A; 3OYB A; 2MCN A; 1M3A A; 1WXU A; 1YWP A; 1Q7Y U; 2EPD A; 1RAC B; 3M59 A; 2NUT A; 3CCQ A; 2FZC B; 2BE7 D; 1PKT A; 5LJ5 h; 2E65 A; 2AZV A; 4MDW A; 4JLI A; 1QLY A; 2AT1 B; 1NZ9 A; 4ZN3 A; 2QQS A; 1JEG A; 1OUL A; 2MWP A; 4M75 C; 4VUB A; 2LNH B; 1YJN Q; 2DBM A; 2MMP A; 4CC3 A; 4M77 E; 2RF0 A; 2QAZ A; 3TEE A; 3PT9 A; 4Y28 E; 1S72 Q; 4BAC A; 2XIC A; 4LDW A; 4GBQ A; 1UGV A; 1AWJ A; 2EKH A; 3OS2 A; 2OTJ A; 3OMG A; 4QQ6 A; 2HL3 A; 4BI8 B; 1B34 B; 2HZY A; 4B6M A; 3EH2 A; 1O9S A; 3I56 Q; 3E9F A; 3C12 A; 2DD4 A; 1VQM A; 2EW3 A; 4N0A C; 2FPF A; 4AMC A; 3EFR A; 2BZ8 A; 2QXF A; 3JV3 A; 2JMC A; 3MEW A; 1YJN T; 1WHH A; 3RDV A; 1FMV A; 2KY9 A; 3OYG A; 1QMC A; 1W6X A; 1S72 T; 2OTL A; 1WDX A; 3JSC A; 2M0Y A; 1KD1 C; 1K73 C; 3PVL A; 3WVE B; 3CC4 A; 2CSI A; 3RER A; 1X2Q A; 5CVI A; 1SF9 A; 3I56 T; 3QO3 A; 4IUT A; 4QW2 A; 2AZS A; 2ABL A; 3H0F A; 4ZGE B; 3ULR B; 3PIO A; 4JRQ A; 3FLG A; 2D0N A; 4DBF A; 3QJ6 A; 2M0O A; 4LDV A; 2V1Q A; 3MCA B; 1QVG S; 5GAM e; 2K6D A; 2EYW A; 1TUD A; 3Q1J A; 1MGQ A; 2HSP A; 1NEG A; 4AFS C; 1TOV A; 4PJO A; 2E5K A; 3VYH B; 1SPK A; 2QTX A; 2CH4 W; 2EYZ A; 4C8Q B; 2X4W A; 2CZ1 B; 1UUE A; 3EAE A; 1IZ6 A; 2DXT A; 1Y07 A; 1BU1 A; 1VIF A; 2WSC E; 5FLX E; 1HXD A; 1RAB B; 4F7U B; 1WI7 A; 1C0M A; 3I5S A; 3SHW A; 3NGP A; 3H9N A; 8ATC B; 2DER A; 5ECA A; 1WHG A; 1X6O A; 1QVG A; 5LJ3 d; 2JTE A; 1YI2 Q; 1AWO A; 2R58 A; 4PLI A; 2CZ7 B; 1QVG P; 1SG5 A; 2KVQ G; 3U23 A; 4QVZ A; 3EGU A; 2JMA A; 4OB3 B; 1ZSG A; 3OYY A; 4M78 A; 2J7I A; 3L2U A; 2FPD A; 2DEU A; 3VS3 A; 2CZ0 B; 3OYI A; 1YP5 A; 1YI2 T; 1PM3 A; 3OYM A; 4MMK A; 4R0K A; 1N8R R; 1YHQ Q; 2QDL A; 2JOY A; 2DPP B; 1VQL Q; 2YT6 A; 1WX6 A; 4J9B A; 2V8J A; 4M75 D; 2CP3 A; 2MK5 A; 5CCA A; 1WJS A; 1M1K C; 3T9N A; 1HK9 A; 3MKD A; 2O01 E; 3CC2 Q; 1UHC A; 1UEC A; 4R55 A; 2MAM A; 1YHQ T; 2O31 A; 1QVF S; 5KYU B; 3OYH A; 3H6Z A; 1VQL T; 1MMG A; 1PSF A; 4M77 D; 1ZBJ A; 1T0H A; 1VQP Q; 4JRK A; 2XKO C; 5FRM A; 1NLO C; 5GMK h; 3CCL Q; 1G5V A; 3CC2 T; 3L2R A; 2KE9 A; 4OF1 A; 2M51 A; 1OYX A; 5EC7 A; 2XDP A; 3QHS A; 3OYA A; 3L2V A; 2A37 A; 3FRN A; 1W2B S; 4M78 G; 3THK A; 2DE0 X; 1YIT A; 2DBK A; 2DL7 A; 1HJD A; 4FCY A; 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