The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
GLMVEVVESPNHSEVGIKGEVVDETQNTLKIMTEKGLKVVAKRGRTFRVWYKGKIMRIKGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Rna binding protein
|
| source organism |
Archaeoglobus fulgidus
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| publication title |
NMR Structure of an Archaeal Homologue of Ribonuclease P Protein Rpp29
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical protein AF1917
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| total genus |
6
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| structure length |
61
|
| sequence length |
61
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| ec nomenclature |
ec
3.1.26.5: Ribonuclease P. |
| pdb deposition date | 2003-05-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribonuclease P/MRP, subunit p29 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1V76 A; 1OQK A; 1PC0 A; 2KI7 A; 1TS9 A; 1TSF A; 2ZAE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GAN 5; 4KH0 B; 1T3L A; 1Y96 B; 3SWN A; 4NOY A; 2BZX A; 2EPD A; 2ZPG B; 3CMA T; 3DLM A; 4FSX A; 3OS5 A; 2QA4 T; 1VQ8 A; 4J8O A; 1WA7 A; 2ZAE A; 5LJ5 j; 2DIQ A; 5GAN 7; 5KYU B; 3OW2 P; 2GGR A; 4MZP A; 1YJ9 A; 2E12 A; 4CC3 A; 3THK A; 4E7H A; 5GAO m; 4MDX A; 3I35 A; 4M7D A; 1YHQ Q; 2BE9 B; 2AKL A; 2DVE A; 1UGS B; 2V8K A; 2DD5 A; 1LJO A; 1KQ2 A; 1VQL A; 3GBQ A; 2XDP A; 1VQN T; 4DBR A; 1UFF A; 1R0B G; 4HCZ A; 5HCK A; 2VVK A; 3H0H A; 3CCQ Q; 2F5K A; 2KRN A; 3N5B B; 2DK3 A; 1WHM A; 2KVQ G; 4B9W A; 1M1F A; 2LQ8 A; 3VS3 A; 2VXE A; 1JXM A; 4IUV A; 1VQ4 A; 2LC4 A; 5GJW B; 2P4R A; 1M30 A; 1KG1 A; 1K8A R; 4KUL A; 1AWO A; 3CPF A; 1SEM A; 3CME A; 5FWC A; 3NTI A; 1NYG A; 2I2L A; 2E64 A; 2JTF A; 4J5Y A; 5GMK e; 1BI1 A; 5GAO n; 3CCJ T; 4R55 A; 2QG9 B; 2J05 A; 1NBE B; 4IUR A; 3M0R A; 3L2U A; 1VQO Q; 4ZGD B; 2B8A A; 3JB9 J; 1U8R A; 2COZ A; 2YUQ A; 2L3R A; 1RAF B; 2K5I A; 3EG1 A; 2LCS A; 1YIJ Q; 3GOX A; 1B07 A; 1X43 A; 1VQM A; 1D0Y A; 2OAW A; 2CSQ A; 1KSW A; 4JDS A; 3LYI A; 1B34 B; 2EFI A; 2PVO B; 4M7D G; 4OMP A; 3MHX A; 3RER A; 5CKH A; 2CYZ B; 1M3B A; 5IT9 E; 2ZPF B; 5CVI A; 1HYO A; 1M9S A; 2X4W A; 2JOY A; 4DA4 A; 1YIT A; 3BFM A; 4HVU A; 1MND A; 1YFN A; 2M51 A; 3F70 A; 2MAM A; 2M0O A; 1WIE A; 3RKY A; 1YCS B; 3C0C A; 3CC7 T; 1FXX A; 1AD5 A; 3GNF B; 2ZGW A; 2ZZD A; 1TH7 A; 1JJ2 P; 4A4H A; 1YHQ A; 1KHC A; 5GMK h; 4PJL A; 1VQP Q; 2FZK B; 1ARK A; 2Y4X A; 3M0Q A; 3O5Z A; 1UJY A; 5I22 A; 2AIR B; 1U06 A; 3L2W A; 1YBY A; 5KYN A; 1N8R C; 1QVF S; 4C5H A; 2JTM A; 3G6E Q; 5DLQ E; 5KYX A; 1JXO A; 3A8H B; 3QPH A; 4A4F A; 3CXC S; 1UJ0 A; 2DFU A; 3ZL7 C; 1M4Z A; 2FB7 A; 4ZTF A; 1VYV A; 3EG3 A; 2KQW A; 5HK3 A; 2MIO A; 1QCN A; 1UDL A; 3REA B; 4ANJ A; 2CZ1 B; 4JJN K; 2HQH A; 2EWN A; 2D8J A; 3V8J A; 1X69 A; 2XK0 A; 3TVT A; 1DJ7 B; 1G8X A; 2FYK A; 3MP8 A; 1AVZ C; 1SRL A; 3H9N A; 3TSZ A; 3S6W A; 1X75 C; 3FLG A; 3QJY A; 4M75 B; 1EFN A; 2X3X D; 1NPR A; 3NTK A; 3QG1 A; 2OTJ T; 3GIB A; 2LQK A; 2DM1 A; 2LDM A; 1TSF A; 1TWB A; 1GL5 A; 1WQ7 A; 1M3A A; 2K5F A; 1X2Q A; 5CCA A; 1Q81 U; 3PGG A; 2XU8 A; 1VQ9 Q; 2LQN A; 3FJ5 A; 1OOT A; 3H0F A; 3ZFJ A; 2JW4 A; 4RTT A; 2ED1 A; 2WSC E; 4XTX A; 1JU5 C; 4C0D B; 1WNL A; 3HKS A; 1K0X A; 1M8M A; 1VQK Q; 4C92 A; 1IRE B; 4M75 F; 2X4X A; 2QEX T; 1K9M C; 1XQH A; 3HL8 A; 1YI2 Q; 3G71 Q; 2LT1 A; 2F2V A; 2HL5 C; 4BDZ A; 4N4H A; 1W2B P; 1NEB A; 1K73 U; 5FW9 A; 3ULR B; 3PMT A; 4EDU A; 2E70 A; 2KR3 A; 3L2Z A; 3M0T A; 4OB2 B; 3QWX X; 4KH1 B; 1NJI C; 1RLQ C; 2RF0 A; 3A1P A; 2YUO A; 1E7O A; 4M75 C; 3CCR T; 2JXB A; 3VU3 C; 4M78 A; 1TU0 B; 3CMA Q; 2YUN A; 2FO0 A; 4M7D E; 4M75 D; 4PNO A; 1I07 A; 3MET A; 3UWN A; 4LDW A; 3CPW A; 1VQM T; 1WXU A; 2LRQ A; 4RTW A; 3A98 A; 1N8R R; 3CCL T; 2OJ2 A; 1Y57 A; 5GAM f; 3G4S Q; 5GMK m; 2EQI A; 2COY A; 4ELZ C; 3OSS C; 4J6Y A; 1N9R A; 4C92 G; 1YIT T; 2CSI A; 3M59 A; 3UA6 A; 3CCU A; 1W1F A; 1ABO A; 2DIG A; 4OMF B; 4JZ4 A; 2DA9 A; 4C0D C; 1VQ9 A; 4PFP A; 4BD3 A; 2O2O A; 4FL6 A; 1WFW A; 3QZ9 B; 5CKE A; 3OW2 A; 2L89 A; 1Q7Y C; 1SKU B; 5HK0 A; 3REB B; 4CC2 A; 1GBQ A; 1EZZ B; 4DOV A; 2H3J A; 2LZ6 B; 5EC7 A; 2QTX A; 3OS2 A; 1OUL A; 4J9G A; 1QVG P; 3WXM B; 4F7U B; 2VGM A; 3G71 A; 1MV3 A; 2QI2 A; 2YRC A; 1V76 A; 2YDL A; 2X9H A; 3P8B B; 4E7I A; 3J7A F; 3CCE Q; 3JSC A; 2M16 A; 2D1X A; 4RTY A; 2EKO A; 3A8O B; 3A5Z B; 5GAN 8; 2LJ0 A; 1F1B B; 4HXJ A; 3C94 A; 3M0U A; 2A0F B; 1ZBJ A; 2O88 A; 4XTW A; 1GCQ C; 1YJN Q; 2RQT A; 4J9F A; 1XNI A; 1M1G A; 4ELY C; 2DBK A; 5EG2 A; 4C92 F; 5DY9 A; 1M3C A; 1Q86 U; 2QGF B; 4Y92 A; 4M78 B; 2RI2 A; 4XU1 A; 1R77 A; 1M1K U; 3G4S A; 3FC3 A; 4AT1 B; 1XOV A; 4JLG A; 2G6F X; 1MMG A; 1K9M R; 1AWW A; 2XI9 A; 2H3E B; 1YNZ A; 2KRM A; 2JZ2 A; 1GFD A; 3I56 Q; 1RUW A; 4C0Z A; 2K9G A; 2DL3 A; 2SRC A; 2DXB A; 2DE0 X; 4OB3 B; 2DZC A; 3L2Q A; 1Y7X A; 1PC0 A; 4J83 A; 2XDB A; 1KC8 U; 2NWM A; 2CP2 A; 2M9U A; 1ZUU A; 2DRK A; 1TOV A; 3L2R A; 1IGU A; 2M1H A; 4JRP A; 1ZLM A; 1NPP A; 4M78 F; 2DL7 A; 1TUG B; 1JJ2 A; 5AT1 B; 3BW1 A; 1WPY A; 3UDC A; 4PFZ A; 1Y96 A; 2D0N A; 4BY6 B; 4FSS A; 1KC8 R; 2XG8 D; 4OMO A; 3J80 E; 1VYT A; 4LN2 A; 4RTZ A; 4AFS C; 2R5M A; 1V1C A; 3H6Z A; 4HCC A; 3VS5 A; 4FW2 A; 4PK4 A; 3FJP A; 2DLP A; 3VRZ A; 1WXT A; 3LWH A; 4TVR A; 2PUK B; 2RJC A; 2PNI A; 4J9B A; 2KXD A; 4MZT A; 5KYU A; 4RG2 A; 1MGQ A; 1X2K A; 4Z8A A; 1LVK A; 2KE9 A; 2DNU A; 1IHW A; 2KT1 A; 3MP6 A; 4Z88 A; 2QAS A; 2QGG A; 3I55 Q; 3UPU A; 2F69 A; 2EW3 A; 1VQ7 T; 1Q7Y R; 4M78 D; 1I8F A; 2A28 A; 4RMO A; 1AWX A; 4XTV A; 1NLO C; 3MJX A; 2EQK A; 2ZPI B; 1HSQ A; 4C92 E; 1RAB B; 5CKF A; 2VWF A; 4M4Z A; 1ZBX A; 1QVP A; 2E3H A; 1PSE A; 4E7Z A; 3VYH B; 5FRM A; 4QW2 A; 5J39 A; 3OYE A; 5LJ3 d; 4E47 A; 2FZG B; 2GTJ A; 2J7I A; 1BCO A; 3TCJ A; 3MEU A; 1BIB A; 2E6N A; 2A37 A; 5J26 A; 2ATC B; 3OBW A; 1GXI E; 3OYF A; 4IUP A; 2BZY A; 4OB1 B; 2AT1 B; 4RTX A; 4R0K A; 1BYM A; 3EG2 A; 4BY6 C; 1GRI A; 4A53 A; 2LQW A; 2LCL A; 2XKO C; 6AT1 B; 4CC7 A; 2AZV A; 1S72 A; 1YWO A; 2K6D A; 2YUP A; 1VOM A; 4BE2 A; 1G3Y A; 4E7L A; 4M78 E; 4HVV A; 3KFV A; 4ESR A; 1WHK A; 3KUF A; 1NM7 A; 3TSW A; 1B34 A; 1TG0 A; 1UE9 A; 3IQL A; 3JCM J; 2J06 A; 5CO7 A; 4M7A B; 2LNH B; 5C6S A; 2RI5 A; 2JMC A; 2RO0 A; 3X26 B; 3LH0 A; 4A54 A; 3EG9 B; 3FDR A; 5FU6 C; 1OU8 A; 1W2B A; 1SG5 A; 2JUF A; 2DYI A; 4ZGE B; 1W70 A; 4K11 A; 3I55 A; 2PVG B; 4AG2 C; 3CCM A; 2O4X B; 2AZS A; 2JJ9 A; 1QP3 A; 3CXC P; 2E1H A; 4CI0 C; 2K79 A; 2EQM A; 1BI3 A; 1WHJ A; 2KSS A; 4GLK A; 2BZ8 A; 5GAN d; 1T3S A; 2KYB A; 4AG1 C; 2J6K A; 2EQJ A; 4M7A F; 2RQW A; 3QKJ A; 2PZ1 A; 4DBF A; 3OYH A; 2QK0 A; 5GAN 4; 2X3W D; 4ZN1 A; 2KAF A; 1MNE A; 1Q95 G; 2EBP A; 2QQR A; 2CP0 A; 4AFU C; 2LNV A; 3OA6 A; 5LJ3 f; 3HRU A; 1CKA A; 1NZ9 A; 3VYG A; 3SB2 A; 1KJW A; 2OX7 A; 4ZTJ A; 4RCC A; 3OYI A; 2O9S A; 3MCA B; 5CKD A; 1C0M A; 3TQ7 P; 1RAC B; 2YLC A; 3PT9 A; 4IIO A; 4Z89 A; 3SHW A; 2D0Q B; 1OI1 A; 3P8D A; 1Q81 C; 1RLP C; 3V7C A; 3JAM E; 1M8V A; 3UT1 A; 5GAO q; 1D1A A; 2VUB A; 5ECA A; 4M75 A; 1YP5 A; 4J6W A; 4M7A C; 1ZSG A; 1N5Z A; 4XTY A; 4BI3 A; 1M27 C; 4M7A D; 3OYL A; 3X24 B; 4FU6 A; 2JS2 A; 4KGX B; 2VAS A; 1QVG A; 4PL6 A; 1AOJ A; 5IAY A; 1PNJ A; 2CT3 A; 5A2Q E; 4M77 C; 4DEX A; 4E2F B; 3QXE B; 8AT1 B; 4MDW A; 1SHF A; 3OSV A; 1H3Z A; 2X51 A; 1FX7 A; 4XU3 A; 3UAT A; 1U1S A; 3X20 B; 1TXQ A; 3CC2 Q; 2AK5 A; 2IIM A; 2C0O A; 3JCM d; 1Q82 U; 1K73 C; 4ZGJ B; 1RAG B; 3PE0 A; 1SF9 A; 1ZSZ B; 1N9S A; 3A8M B; 1SSF A; 5HY6 A; 5LL6 S; 4JJD A; 3CCQ A; 1YWP A; 5GAN f; 2DXU A; 4KGZ B; 4C5E A; 1S1N A; 3OYD A; 4X9D A; 3CC4 Q; 4EIK A; 3OMC A; 3OB9 A; 4A63 B; 5DLO A; 5CK9 A; 2E5Q A; 3QYG B; 4M75 G; 3OW2 S; 1D0Z A; 2JNG A; 1MHN A; 4O6J A; 4ZNX A; 2PTK A; 3MPU B; 4A4K A; 2G3R A; 1WHL A; 3S3N A; 1H92 A; 1IXD A; 4J9D A; 1M2O A; 2EAY A; 2EKH A; 4FYX B; 3CCV Q; 2EQU A; 1R0C B; 3C12 A; 2ABL A; 1VQO A; 1GCQ A; 4J9I A; 2DET A; 4HT8 A; 2NUP B; 2DTO A; 3LGL A; 2CRE A; 2K3B A; 3X28 B; 3X25 B; 5GAM d; 1YIJ A; 2DZ9 A; 4PJM A; 2MI6 A; 5GAM h; 3CQT A; 1IGQ A; 4PFO A; 5IHI A; 4FT4 A; 4PJO B; 2GCX A; 4HVW A; 1AT1 B; 4Y91 A; 1VQ8 T; 1VQ6 Q; 3PIP A; 2L3S A; 1K9A A; 3M56 A; 5FLX E; 2ENM A; 1WHG A; 3U23 A; 2JT4 A; 2NUZ A; 1YJ9 T; 1IO6 A; 1EIF A; 3QUI A; 1ZSZ C; 2EYX A; 3CCM T; 5FWB A; 3C4S A; 2ZCF B; 3CEY A; 3WVD B; 3EG0 A; 4EMK B; 1VQP A; 2VYT A; 2RQU A; 1AHJ B; 3JCM f; 1OPK A; 1VQL T; 1Q81 R; 1WYX A; 1KQS S; 4YTL A; 2JVV A; 2MWO A; 4F7U A; 2OTL Q; 4C5I A; 1TTH B; 5LJ5 d; 1G5V A; 3CCS Q; 4M7D C; 4LDV A; 4AFZ C; 4AFQ C; 3G6E A; 2QQA A; 2QQB A; 4PKC C; 2FPD A; 1VQ5 Q; 1U3O A; 2L3P A; 2CT4 A; 2V8I A; 4JRK A; 2RJD A; 1Q86 C; 1SSH A; 4WCI A; 1RI0 A; 1UHF A; 3M54 A; 1VQ4 T; 1M1K C; 1SHG A; 3EAE A; 2A7Y A; 1PCX A; 3CME T; 4JS5 A; 3S3O A; 2MCN A; 1Z9Q A; 3OYN A; 1NG2 A; 3CD6 Q; 1JJ2 S; 1G3S A; 1TS9 A; 4Y28 E; 4KT0 E; 2GQV A; 3VS6 A; 2LTO A; 2HCK A; 1YJW Q; 2BIV A; 3RMS A; 2Z0W A; 2PQW A; 4E7J A; 3CCV A; 2PU9 B; 2DXT A; 1VA7 A; 3QHS A; 1K73 R; 3TU4 K; 3JCM Q; 4QVD A; 3NPF A; 4D8D A; 4R56 A; 4N4I A; 2RMO A; 2QA4 Q; 4PJO C; 2CP3 A; 3E9F A; 2R57 A; 1KC8 C; 4OB0 B; 1GCP A; 4PJO D; 4C0G A; 2AHJ B; 2DD4 A; 1SRM A; 2GFA A; 5LJ3 j; 1GFC A; 1QQJ A; 3M5A A; 1VQ6 A; 4J7F A; 4QQD A; 4OMQ A; 4IIM A; 3L42 A; 2ED0 A; 3S3M A; 1QMC A; 2QXF A; 4EMK C; 1I1J A; 1Y07 A; 2K2M A; 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4F14 A; 3RES A; 1M1K R; 3BY7 A; 2CZ0 B; 3I9Q A; 4JPB W; 5D6W A; 4BDY A; 5CAI A; 1XTD A; 3OMG A; 3VUZ A; 1VQP T; 1NJI U; 3QII A; 1KFZ A; 5IXF A; 1ZA1 B; 1G3W A; 3E19 A; 2QQS A; 4QVC A; 3J81 E; 1JBM A; 4C8Q C; 2MPX C; 3NFC A; 5KCH A; 3G6E T; 1VIF A; 5IHN A; 4C8Q D; 3NTH A; 3JCM X; 1PKS A; 1C1A A; 2W10 A; 3OYB A; 4M7A A; 2D6F A; 3RDV A; 1VUB A; 3M4Y A; 3CCJ A; 1M90 U; 2NYS A; 2V8J A; 4XK8 E; 3CCE A; 3VS0 A; 2FRY A; 3EG9 A; 1O75 A; 2VGN A; 4DOW A; 1TUD A; 1QP2 A; 3HRS A; 2A3L A; 2EYW A; 5LJ3 e; 4LUE A; 3HHT B; 1BU1 A; 1NLP C; 4NL3 A; 2XIC A; 4B6M A; 1RL2 A; 2RHZ A; 3TEE A; 3MO8 A; 2O4X A; 1YJN A; 4XQ3 A; 2RNA A; 2BUD A; 2D8H A; 1LPL A; 2RQR A; 1H8K A; 5FU6 B; 2OTJ Q; 1G83 A; 2EYZ A; 5L8R E; 7AT1 B; 3DLL A; 3HSB A; 2DTH A; 1QVG S; 5FRO A; 4DBH A; 2QTV A; 3H0I A; 3Q1J A; 4F7U E; 5GJV B; 3CC7 A; 2RK2 A; 1WLP B; 2F2X A; 3I56 A; 4PJJ A; 1MV0 B; 3CCU T; 1NYF A; 1UTI A; 2GF7 A; 1I5O B; 2HD0 A; 1AWJ A; 4WF2 A; 3EHQ A; 1VQL Q; 2IG0 A; 1VQ9 T; 4MMK A; 5LJ3 h; 2KGT A; 1SPK A; 3JV3 A; 2DEQ A; 2QEX Q; 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