The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
107
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structure length |
107
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Chain Sequence |
GSSGSSGVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVATVADTDDHRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEASEHGGCSTPGSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
KIAA1798 protein
|
| publication title |
Solution structure of the third mbt domain from human KIAA1798 protein
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Protein binding
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| total genus |
7
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| structure length |
107
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| sequence length |
107
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02820 | MBT | mbt repeat |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5FRO A; 2BUD A; 5IAY A; 1OYX A; 4BAC A; 1WJQ A; 4CRI A; 3QKJ A; 1MHN A; 3OYA A; 3FDR A; 2RHX A; 4A4G A; 4N4H A; 4QQ6 A; 2DIG A; 5C6S A; 4PLI A; 3E9F A; 3PFS A; 4ZTJ A; 2RI5 A; 4A4H A; 3UT1 A; 2EQK A; 3BDL A; 1XNI A; 3OYD A; 3OA6 A; 4FL6 A; 2D9T A; 3OMG A; 2R5M A; 5IN1 A; 3DB4 A; 3QJ6 A; 3Q1J A; 2RHY A; 3OYK A; 4E7L A; 2R58 A; 3OQ5 A; 2M0O A; 2RJD A; 4Q5W A; 3NTI A; 4N4I A; 2X4W A; 2X4Y A; 5CIU A; 4EDU A; 1H3Z A; 3OY9 A; 3FC3 A; 3S6W A; 3S3M A; 2DIQ A; 2DAQ A; 2L3R A; 2RHI A; 3MEV A; 4IUV A; 5C0M A; 1WJS A; 3DLM A; 1OZ3 A; 2G3R A; 3OYH A; 2LDM A; 2XDP A; 2EKO A; 3MP8 A; 3S3O A; 3ME9 A; 2RO0 A; 2XK0 A; 2BKD N; 4C5H A; 5KE3 A; 2RI3 A; 4IUU A; 3OYB A; 3O8V A; 2PQW A; 4IUQ A; 2B8A A; 3L42 A; 3PMI A; 3P8H A; 3KUF A; 3FEO A; 3L2W A; 4ZTF A; 3OB9 A; 2JZ2 A; 1N27 A; 4A4E A; 4II1 A; 4B9X A; 5FRN A; 3P8D A; 2EQJ A; 2L8D A; 4OVA A; 5D6X A; 3SD4 A; 2RJF A; 2F5K A; 1OZ2 A; 2R57 A; 2RJE A; 4BE2 A; 3LLR A; 3ASK A; 5KCH A; 4IUT A; 4A4F A; 4E7I A; 2MWO A; 4QVZ A; 3LGF A; 3MP6 A; 3DB3 A; 4QQD A; 5M9O A; 3FLG A; 1SSF A; 2VYT A; 3H6Z A; 5D6Y A; 2LTO A; 4IUR A; 3S3N A; 3ZEH A; 3C4S A; 4BE1 A; 3LGL A; 3MEU A; 3PMT A; 3QBY A; 3M9Q A; 3L2Q A; 4E7J A; 5D6W A; 4RG2 A; 3OYI A; 1KHC A; 3E9G A; 3LX7 A; 3OYN A; 3OYE A; 4QW2 A; 3OYL A; 3OYF A; 3OYG A; 3QII A; 4GY5 A; 2M1H A; 4FU6 A; 2LRQ A; 3L2V A; 4E7H A; 3CEY A; 2GFA A; 2R5A A; 4UC4 A; 2P0K A; 2O4X B; 2L89 A; 3MEW A; 2EQU A; 4IKF A; 1WJR A; 3MET A; 2O4X A; 3UWN A; 2FHD A; 3L2U A; 2LVM A; 4BDY A; 2RHU A; 2QQR A; 5KH6 A; 2GFU A; 2JTF A; 2M16 A; 1OI1 A; 2K3X A; 5J26 A; 5KCO A; 3EAE A; 2HQE A; 3F70 A; 4BDZ A; 3OYM A; 3L2R A; 4E7K A; 5J39 A; 2GF7 A; 4N4G A; 4B9W A; 3OYC A; 3OS1 A; 3H8Z A; 4C5G A; 3MEA A; 2X4X A; 3LH0 A; 4HCZ A; 4LD6 A; 3MP1 A; 5KE2 A; 3OS0 A; 4BE0 A; 2IG0 A; 5FRM A; 4IUP A; 2EQM A; 2BIV A; 2MWP A; 2EFI A; 3MO8 A; 4L59 A; 4NS5 A; 4PL6 A; 2HQX A; 2RI2 A; 4C5E A; 2WAC A; 3NTH A; 4QQG A; 2CKK A; 4C5I A; 2YRV A; 1G5V A; 2X35 A; 3NTK A; 2RHZ A; 3OS2 A; 3GOX A; 2E5Q A; 4PLL A; 2RJC A; 2E6N A; 3OYJ A; 2QQS A; 2NLU A; 3OMC A; 2LCC A; 1RI0 A; 3PNW C; 4Z02 A; 3LYI A; 4BD3 A; 2K3Y A; 4X34 A; 1WGS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1I81 A; 4AFQ C; 1X01 A; 4JLG A; 5GAN f; 1ZSZ B; 2NYS A; 4A4G A; 3TSW A; 3QZ5 B; 4ME7 A; 2FVU A; 1YN8 A; 5GAM g; 3JCM e; 1N8R R; 1YI2 Q; 4JS4 A; 2YSQ A; 1M4Z A; 3VS5 A; 1VYU A; 3H0I A; 1QCO A; 4OMQ A; 4EMK A; 2D0Q B; 2DNU A; 1K8A R; 1KJW A; 3I55 A; 5CQY A; 2NUT A; 3TRE A; 3EG9 A; 2LDM A; 4EPC A; 4XTU A; 2RF0 A; 3EG2 A; 3RMQ A; 4AT1 B; 2ZPH B; 1C1A A; 1KQS A; 2RO0 A; 2HEQ A; 4C8Q D; 5KYW A; 2MCN A; 1VQM A; 1ZX6 A; 4X1V A; 4JRI A; 5GMK h; 1WPY A; 4ZTF A; 1Q82 C; 3UA6 A; 3V8J A; 2QG9 B; 4PJJ A; 4RKU E; 3CBP A; 2D8H A; 2NUP B; 5GAN 6; 4X9D A; 3SEM A; 4BE2 A; 4C92 E; 2QDL A; 4E7I A; 4A4F A; 4KH0 B; 4PFZ A; 5DLQ E; 1BYM A; 1OPK A; 1UJ0 A; 3J7A F; 5L8R E; 1ZUY A; 4E6R A; 4CI0 C; 4KT0 E; 4J9G A; 3ZEH A; 1HYO A; 2XKO C; 3PMT A; 3VYG A; 2CP2 A; 3N5B B; 2E5K A; 3NGP A; 4D8K A; 1RAA B; 2HQH A; 2Y90 A; 3QII A; 3L2V A; 2LRQ A; 4E7H A; 3TVT A; 3UDC A; 2IPO B; 1KD1 R; 2LQ8 A; 1QVP A; 2QQR A; 3RUX A; 1Q81 C; 1NM7 A; 1WHH A; 2K3X A; 2ED0 A; 1GCQ C; 2KRS A; 2YXY A; 3M0Q A; 2E3H A; 2DEU A; 3H8Z A; 4CC4 B; 4LD6 A; 2EFI A; 1K9A A; 4ESR A; 3M5A A; 3P8B B; 3GBQ A; 1VUB A; 4C5I A; 1JJ2 S; 4C92 D; 2HNI A; 3QPH A; 1RI0 A; 1N6A A; 3LYI A; 2K3Y A; 1VOM A; 2E10 A; 1B3Q A; 4HVV A; 3AHU A; 4BAC A; 4HXJ A; 1HD3 A; 4M77 G; 5GAO r; 3JAM E; 2F2W A; 4QQ6 A; 1CSK A; 5EC7 A; 1M3A A; 2E70 A; 3OW2 P; 3PFS A; 2PTK A; 4Y28 E; 2KRO A; 3QYH B; 4DBH A; 3X24 B; 4EMK C; 3I5R A; 1GL5 A; 1V1C A; 4E7L A; 2LP5 A; 2IIM A; 4C0Z A; 1VQ5 Q; 1Q7Y R; 2RHI A; 4IUV A; 1WJS A; 2MI6 A; 4AG2 C; 3RER A; 3RR6 A; 4BUG A; 2EKO A; 2BKD N; 2DTO A; 4LDV A; 5GAN 3; 1WXT A; 4F14 A; 2OTJ Q; 1UGV A; 4B9X A; 2E1H A; 1N5Z A; 2HZY A; 1OZ2 A; 2D0N A; 1FWZ A; 3I55 T; 1IZ6 A; 3HRU A; 3CC4 A; 4QQD A; 3LW5 E; 5FU7 B; 1GCP A; 2CGH A; 5GAM f; 1I8F A; 3C4S A; 1NZ9 A; 3PIO A; 2LQN A; 1QKW A; 1VQM T; 3CME A; 1FXX A; 1IGQ A; 3LX7 A; 3E9G A; 2ZPF B; 2EYZ A; 2XG8 D; 4VUB A; 1Z9Q A; 4J83 A; 2M1H A; 4QVC A; 4FW2 A; 1N8R C; 2CP0 A; 1WJR A; 3QHS A; 3CXC S; 4Z89 A; 1I0C A; 2JTF A; 3HFO A; 5J26 A; 1PRL C; 2K2M A; 1QW1 A; 2OX7 A; 3AT1 B; 1K8A C; 2V8J A; 1PSF A; 4TVR A; 1X43 A; 1T3S A; 2D6F A; 5GAN 4; 3QSU A; 3T9N A; 1UGR B; 1X69 A; 2AKK A; 2HL5 C; 2BIV A; 1JU5 C; 2LJ0 A; 4N0A A; 4D6W A; 2DYI A; 4L6V 5; 4MZT A; 1W2B A; 2LCC A; 1OOT A; 2O2O A; 3A98 A; 5KYY B; 1VQ4 Q; 1AVZ C; 1YIJ Q; 2ROT A; 3ZFJ A; 5IAY A; 1TUC A; 4R55 A; 2EJF A; 1MV0 B; 1QCN A; 1SEM A; 4C0D B; 2DLP A; 4FYV B; 3VS4 A; 3X26 B; 1X6G A; 4XU2 A; 2ESW A; 3KFV A; 2DL4 A; 4EDU A; 5CR2 A; 1KD1 C; 1T3L A; 3GLX A; 1VQ7 A; 1K0X A; 3NPF A; 3PE0 A; 4C5H A; 1YJW T; 3A5Z B; 1IRX A; 1M2O A; 2O01 E; 1UGP B; 2F5T X; 3PVQ A; 5LJ5 h; 2MAM A; 1M3C A; 1B07 A; 3VRY A; 4RTW A; 1U06 A; 4J9D A; 3UA7 A; 2ZGW A; 3JCM J; 4HT8 A; 1ZBX A; 4OB0 B; 3LGF A; 3DB3 A; 2E64 A; 1JEG A; 1QVG S; 5LJ5 f; 2K3B A; 1AT1 B; 1CKB A; 2LT4 A; 4BE1 A; 1BI3 A; 2K6D A; 3OYI A; 1AZG B; 1KHC A; 1ZUK A; 3PIP A; 2GTJ A; 3RES A; 3EG3 A; 1LOJ A; 2HMA A; 3C95 A; 1NYG A; 1AEY A; 4NOY A; 4C8Q G; 4NL3 A; 2HBW A; 3CC4 T; 1Q7Y C; 3I9Q A; 1S72 A; 1Y7X A; 2RPN A; 4M78 B; 3V7S A; 1ZQ1 A; 4C5G A; 2DET A; 2Y4Y A; 4ZGJ B; 5KE2 A; 2FPF A; 1SSH A; 3CME T; 1SHG A; 4N0A C; 4M7D B; 4J7F A; 2EWN A; 4M75 B; 4MDX A; 4C0F A; 2XIC A; 1JXO A; 1W4S A; 3OBY A; 2E12 A; 3RMS A; 1NLP C; 3MKD A; 2JUF A; 3V7R A; 1R8O B; 2M51 A; 1UGQ B; 4KUI A; 2A7Y A; 4JZ4 A; 1JJ2 P; 5KYU B; 2V26 A; 5HK0 A; 1OX8 A; 1TXQ A; 1D1C A; 4HT9 A; 2LQK A; 3OQ5 A; 2M0O A; 2HKN A; 3VUZ A; 3OY9 A; 3JB9 I; 2ZPE B; 2DIQ A; 1SHF A; 3FB9 A; 5CAI A; 1K9M R; 5CQX A; 1D3B A; 3E1S A; 1HJD A; 1ABO A; 4FSX A; 3V8L A; 2QQA A; 5D7U A; 3TU4 K; 1JRI A; 4C92 G; 1D1A A; 1PKT A; 1UDL A; 2C06 A; 4PFP A; 1OEB A; 2EQJ A; 4M7A B; 2AKL A; 1XTD A; 1VQ7 T; 1BI0 A; 4JJD A; 2CZ7 B; 4QVZ A; 3G1J A; 1MV3 A; 2KNB B; 4PKC C; 2PVG B; 1EX4 A; 1VQK Q; 2LTO A; 1RAI B; 2PUK B; 2EGC A; 3QXE B; 2QEX A; 2DL7 A; 4KGZ B; 4E7J A; 1Y96 A; 2EQI A; 5LJ3 h; 1WDX A; 2GGR A; 3CC7 Q; 1WHJ A; 1IRE B; 2B86 A; 2CZ0 B; 5HY6 A; 5IHN A; 4HKE A; 3CEY A; 2YUO A; 1NPR A; 1B7T A; 3EFS A; 1X2K A; 4RG8 A; 2LVM A; 3M54 A; 1FMV A; 4LUD A; 5KH6 A; 4ELY C; 1O75 A; 3JRZ A; 1OI1 A; 4XAX B; 2A37 A; 2DXB A; 5DY9 A; 1UE9 A; 1UGS B; 1RAH B; 1QVF A; 2KQW A; 5DLO A; 3OS0 A; 2E65 A; 4BE0 A; 1GXI E; 2HSE B; 5ECA A; 4PJO A; 3CXC P; 4M78 F; 3CQT A; 3OYJ A; 3CCS Q; 3PNW C; 1ZBJ A; 3HP9 A; 2FPD A; 1WGS A; 1VQ6 Q; 3WXM B; 2X4J A; 1XOV A; 1OYX A; 2VWF A; 1S72 T; 2DVJ A; 3CCU A; 4M7D F; 4M75 F; 5CKH A; 2KSS A; 4J9H A; 4OB3 B; 4DOV A; 2W10 A; 4ZTJ A; 1U5S A; 3UT1 A; 2RQV A; 1BI1 A; 3DB4 A; 4BY6 B; 2P84 A; 1SG5 A; 3VS6 A; 1AZE A; 4EMG A; 2RJD A; 3D7S B; 2BZY A; 1BIA A; 2ZPI B; 1YI2 A; 2MK5 A; 2G3R A; 2XDP A; 3OBW A; 4OMN A; 3MP8 A; 3CCL Q; 3EGD A; 3EFR A; 3KBG A; 3SWN A; 4MDW A; 2LT1 A; 3L2W A; 3EGU A; 1JQQ A; 4O5V A; 4E7S A; 2L2P A; 1PG5 B; 1YCS B; 2MWO A; 3GNF B; 3FLG A; 2CYZ B; 3BY7 A; 1R0C B; 2JNG A; 5GMK e; 4OGC A; 3QBY A; 5GMK l; 2E41 A; 2EKH A; 1K4U S; 4UC4 A; 2CRE A; 1UHF A; 2GFA A; 2P0K A; 1WZO A; 3EFO B; 3UWN A; 3ER0 A; 4F7U A; 3CCQ A; 5KYX A; 4ORZ A; 4BDY A; 3A8G B; 5CKD A; 2EGE A; 3J81 E; 4D8D A; 1WLP B; 1QVG P; 1OUL A; 1DJ7 B; 1NJI U; 2J7I A; 1TH7 A; 1SPK A; 4ZGD B; 3OYC A; 1K9M C; 2KT8 A; 2EW3 A; 2QEX T; 3MEA A; 1U3O A; 2X4X A; 2OTL Q; 2EQM A; 2K79 A; 4L59 A; 3C12 A; 2FL7 A; 3DKM A; 2DXT A; 4PJO C; 1UEB A; 3A8L B; 3LH5 A; 1G5V A; 2QAS A; 1WHM A; 4JJC A; 2QQS A; 3EGX B; 2QK0 A; 4K11 A; 1E7O A; 4GLK A; 3CPW S; 1YHQ Q; 2BE9 B; 3QKJ A; 2EAY A; 2PVD B; 4F04 B; 1VA7 A; 1N9S A; 1BU1 A; 3THK A; 3QG1 A; 2DK3 A; 2ZZD A; 1ACM B; 5GAN h; 2FZC B; 3RKX A; 4BI8 B; 3OA6 A; 2OAU A; 2DJZ A; 3Q1J A; 3QWX X; 1R0B G; 1KQ2 A; 1M30 A; 2QQ9 A; 4Q5W A; 1UB4 A; 1D09 B; 2YDL A; 2LX9 A; 3G6E Q; 1NEB A; 3R6O A; 1VQN Q; 2F1L A; 3CCU T; 1RAB B; 3SWN C; 2JS0 A; 4JDS A; 2XD0 A; 4IIM A; 2RI3 A; 3CD6 Q; 4LXC A; 1BBZ A; 2OJ2 A; 3FEO A; 1N9R A; 2DD5 A; 1NPP A; 3JCM g; 3O5Z A; 1G2B A; 1TG0 A; 5GAN 8; 1LCK A; 2KXC A; 2CZ1 B; 1WA7 A; 2OTJ A; 2VB6 A; 5GAO l; 4M78 E; 3EHR A; 3GF5 A; 1YI2 T; 1IXD A; 1NE8 A; 2LX7 A; 1YJ9 A; 5FWB A; 5I2S A; 3EG0 A; 1VYT A; 4M7D E; 4M75 E; 1F1B B; 2C0T A; 2GQI A; 3KXT A; 2DF6 A; 5CKB A; 1M8V A; 4JZ3 A; 2DL3 A; 4FU6 A; 2O88 A; 3MEW A; 5I11 A; 4OMP A; 2EYQ A; 3CMA A; 3OSS C; 1OV3 A; 5L23 A; 3MHX A; 4M77 A; 2VUB A; 3FJP A; 4BDZ A; 3HRT A; 3RIR A; 3RNJ A; 1YCY A; 1QLY A; 4WCI A; 4CC7 A; 3A1P A; 4EMK B; 2RK2 A; 1G3S A; 3NTH A; 2FRY A; 5A0L A; 2VXE A; 2RA2 A; 1A0N B; 2E6N A; 3CCQ T; 4M78 D; 4DEX A; 1QP3 A; 2DA9 A; 3ZBD A; 1X2Q A; 2EYW A; 2NUT B; 3EG9 B; 4BD3 A; 4X34 A; 5IXF A; 3M53 A; 5KYW B; 4M7D D; 1EFN A; 5GAN 5; 4M75 D; 4MZM A; 2L3S A; 2EYY A; 4DBF A; 1LVK A; 1U1T A; 1RL2 A; 4JPB W; 4M7A E; 4HVU A; 3JCM Q; 3OYD A; 4KH1 B; 2EBP A; 1MUZ A; 2DX1 A; 2D9T A; 2GTO A; 3OMG A; 5IN1 A; 1I07 A; 2V8I A; 3REA B; 2R58 A; 1I5L A; 5CIU A; 3VKI A; 2I2L A; 2DAQ A; 1G83 A; 3L1A A; 4A53 A; 1IB8 A; 2JVV A; 1YJW A; 2B8A A; 3CC2 A; 1BCM A; 2F69 A; 2ATC B; 4FSS A; 5A0D A; 3P8D A; 4MMK A; 2R57 A; 5CKF A; 4YTL A; 4IUT A; 5EG2 A; 2BZX A; 1SSF A; 1FMW A; 1H8K A; 5GAN j; 4M7A D; 5LJ5 e; 3M9Q A; 1VQ5 T; 3OYL A; 3TCJ A; 4QW2 A; 5GAM h; 1D0Y A; 1IO6 A; 4AFS C; 4IKF A; 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