The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
107
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structure length |
107
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Chain Sequence |
GSSGSSGVKPPHGFQKKMKLEVVDKRNPMFIRVATVADTDDHRVKVHFDGWNNCYDYWIDADSPDIHPVGWCSKTGHPLQPPLSPLELMEASEHGGCSTPGSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Solution structure of the third mbt domain from human KIAA1798 protein
rcsb |
| molecule keywords |
KIAA1798 protein
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| total genus |
7
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| structure length |
107
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| sequence length |
107
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02820 | MBT | mbt repeat |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2F5K A; 2VYT A; 3MEW A; 3L2W A; 3QII A; 1WGS A; 2B8A A; 3OQ5 A; 2RHI A; 4RG2 A; 4C5G A; 3H8Z A; 2R5A A; 4QQG A; 2X4X A; 2LRQ A; 2XDP A; 3PFS A; 4IUR A; 3OYF A; 5D6X A; 3NTH A; 1KHC A; 2E5Q A; 2RJC A; 3OB9 A; 4QQD A; 2RHY A; 5FRO A; 3DB4 A; 2X35 A; 3OY9 A; 3OYI A; 2LCC A; 4BE1 A; 2RO0 A; 3E9F A; 2IG0 A; 3BDL A; 3FLG A; 3P8H A; 2K3Y A; 4A4E A; 4PLL A; 3GOX A; 2XK0 A; 5C0M A; 5KH6 A; 5J39 A; 4QQ6 A; 2RHX A; 4IUU A; 3OYL A; 4IUQ A; 3OYG A; 2MWP A; 3FC3 A; 3LYI A; 2EQK A; 2QQR A; 4IUT A; 4EDU A; 3S3O A; 2EQU A; 2RI5 A; 2JZ2 A; 4E7L A; 4B9X A; 3LX7 A; 3OS2 A; 2EQJ A; 3OYE A; 2RJF A; 1RI0 A; 3L2R A; 1H3Z A; 2X4Y A; 2RI2 A; 3MET A; 2LVM A; 3LLR A; 3UT1 A; 5KCH A; 2FHD A; 3OYB A; 3EAE A; 1OZ2 A; 2K3X A; 2EFI A; 2BUD A; 3NTK A; 4BD3 A; 5M9O A; 4N4G A; 2X4W A; 3MEU A; 2PQW A; 1N27 A; 3PNW C; 2G3R A; 4IUP A; 4E7K A; 4IUV A; 2RJE A; 2LTO A; 2RI3 A; 2GFA A; 4Z02 A; 4OVA A; 2JTF A; 3OYJ A; 2BIV A; 3OYD A; 2E6N A; 3KUF A; 3L2Q A; 1WJS A; 5KE3 A; 2RJD A; 3LH0 A; 4II1 A; 2M16 A; 2L89 A; 2M0O A; 4N4I A; 4UC4 A; 2D9T A; 3E9G A; 3DLM A; 3ME9 A; 5D6W A; 5J26 A; 4E7J A; 2EQM A; 4Q5W A; 1SSF A; 4ZTJ A; 1OZ3 A; 3UWN A; 3S6W A; 2HQE A; 2GF7 A; 5KE2 A; 3S3M A; 3MEV A; 5FRM A; 1G5V A; 2EKO A; 3MP6 A; 3NTI A; 5FRN A; 2RHU A; 4C5H A; 3PMI A; 1OI1 A; 5D6Y A; 2LDM A; 3OYN A; 4BDZ A; 3CEY A; 2R5M A; 1MHN A; 2WAC A; 4A4F A; 4E7H A; 4PLI A; 2NLU A; 4GY5 A; 4QW2 A; 4A4G A; 5C6S A; 5IAY A; 3OYA A; 4BAC A; 4IKF A; 3MEA A; 3L2V A; 5CIU A; 3SD4 A; 3ZEH A; 4ZTF A; 3LGL A; 2L8D A; 4B9W A; 2QQS A; 4HCZ A; 2YRV A; 3OA6 A; 3DB3 A; 3H6Z A; 3QJ6 A; 2O4X B; 3M9Q A; 4C5I A; 3OYH A; 1XNI A; 2HQX A; 2R57 A; 2R58 A; 4BE0 A; 2BKD N; 4BE2 A; 3S3N A; 3C4S A; 1OYX A; 4FL6 A; 3OS1 A; 4N4H A; 2P0K A; 3QBY A; 4QVZ A; 3F70 A; 3FDR A; 3L42 A; 2O4X A; 3MO8 A; 2GFU A; 2CKK A; 4FU6 A; 4E7I A; 3OMG A; 3PMT A; 4C5E A; 3L2U A; 4CRI A; 4L59 A; 4LD6 A; 4NS5 A; 2M1H A; 5IN1 A; 3OMC A; 4BDY A; 4A4H A; 3OYM A; 3LGF A; 2DAQ A; 4X34 A; 3Q1J A; 2L3R A; 3OYC A; 3OYK A; 3OS0 A; 1WJQ A; 3O8V A; 3MP1 A; 3FEO A; 3ASK A; 3QKJ A; 2MWO A; 1WJR A; 2RHZ A; 5KCO A; 3P8D A; 2DIG A; 2DIQ A; 3MP8 A; 4PL6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3QZ5 B; 1Q82 C; 1BB9 A; 2DE0 X; 2NUP B; 4GLM A; 5DLQ E; 3L2Z A; 4RG8 A; 4MML A; 1JB0 E; 3LWI A; 1K8A C; 2DL3 A; 3DB4 A; 3OYI A; 3E9F A; 2ZPF B; 5GAN f; 3BDL A; 4C0F A; 4ZGJ B; 5A0D A; 3X26 B; 4IUU A; 2XMF A; 1I0C A; 1VQL A; 3QDF A; 3G4S T; 3CME T; 1VQK Q; 3UF4 A; 1IHV A; 3OBY A; 5GAO n; 2J7I A; 1YJ9 Q; 4PJO E; 3CC4 Q; 1OUL A; 3CCU Q; 2E12 A; 1VUB A; 3SEM A; 3EAE A; 3CCE T; 5GAN e; 3H0F A; 1NG2 A; 5GMK j; 2X4W A; 2BZ8 A; 4PJO F; 2LTO A; 1BK2 A; 1GL5 A; 4C92 D; 3EGD A; 4LNP A; 2YRC A; 1ZX6 A; 2QI2 A; 1S72 A; 5FRM A; 3EG9 B; 1N8R R; 2VWF A; 5IAY A; 3J80 E; 4A4G A; 1R0B G; 1BI3 A; 3J81 E; 2D0Q B; 3JCM b; 2DET A; 2DLP A; 4A4K A; 3M0U A; 4PFZ A; 1G3S A; 3RKW A; 1KD1 R; 1D1A A; 3C4S A; 4FL6 A; 3HPW A; 2BTT A; 2E1H A; 3PGG A; 3JB9 I; 2M02 A; 2I0N A; 2WSF E; 2LP5 A; 2MF2 A; 2BE9 B; 4L59 A; 3CC2 A; 3I9Q A; 4XTY A; 2DIL A; 3URG A; 1VQO A; 2SRC A; 1I07 A; 2DKG A; 5DM7 R; 4C0D B; 2YLB A; 1V29 B; 3HL8 A; 5GAM f; 1ZUK A; 1WHK A; 5LJ3 d; 1VQP T; 2DMO A; 4QQG A; 2YDL A; 4M75 D; 1R8O B; 2JN0 A; 3IQL A; 3G71 Q; 4JRK A; 2EYY A; 1Q81 U; 1QCO A; 1QW1 A; 3LYI A; 5GAM e; 2EYX A; 2XKO C; 2RQU A; 4RTW A; 2X4Y A; 5A0L A; 1K9M R; 1VQ9 Q; 4ZN3 A; 1OU8 A; 4X1V A; 4F04 B; 2DXT A; 1WXU A; 3QG1 A; 3HSB A; 4ZGE B; 1M3C A; 2RJE A; 3FB9 A; 4M78 A; 3VS5 A; 2AT1 B; 4C92 E; 5KE3 A; 1D09 B; 2RJD A; 1VQK A; 3TSZ A; 2MYS A; 2EYQ A; 2OX7 A; 3RR6 A; 4ZTJ A; 1N8R C; 1OZ3 A; 2LNV A; 1YJ9 A; 1Y96 A; 4C92 F; 3CC4 A; 1M2V B; 3CCU A; 3M54 A; 5KE2 A; 3KFV A; 3V7S A; 3U23 A; 3BY7 A; 5D6Y A; 2DJQ A; 3CPW P; 5CK9 A; 4A4F A; 2EJG A; 2QA4 T; 1X75 C; 1WHL A; 1X2K A; 1YFN A; 1ZUU A; 1K8A U; 3VYG A; 1QWE A; 1IRX A; 3QXE B; 1M2O A; 1N9R A; 3L2V A; 1KD1 C; 5CKE A; 3PIP A; 2HKQ B; 1N9S A; 1VYV A; 2LC4 A; 2O01 E; 2C06 A; 1C1A A; 1HSQ A; 4J6W A; 4C5I A; 4FW1 A; 2KI7 A; 2C0I A; 1OYX A; 4ZN1 A; 3OBW A; 2JS2 A; 3VS6 A; 3VS1 A; 2E6Z A; 1NM7 A; 2QGG A; 4NS5 A; 1TS9 A; 4BDY A; 2DER A; 3RUX A; 2YHT A; 5KYX A; 1YIT T; 3JCM g; 1D0Y A; 1BI1 A; 1VYU A; 2VGM A; 2ECZ A; 1D0X A; 2DXB A; 3CPW A; 1FXX A; 2CS7 A; 3VYH B; 1N5Z A; 1QVG P; 4E2F B; 3E2U A; 3G6E Q; 4JLG A; 2L3Q A; 2FB7 A; 2FRY A; 2DTH A; 2IG0 A; 2WSE E; 5LJ5 d; 2CH4 W; 3RDV A; 4QQ6 A; 4IUQ A; 1VIF A; 5CQX A; 2NUT A; 1K9M C; 4M78 C; 4IUT A; 3OS2 A; 3SFM A; 2RQT A; 4KH1 B; 1TUD A; 4XTV A; 4C92 G; 3MET A; 2LVM A; 4PJN A; 2KEA A; 2DTI A; 1AOJ A; 4JLI A; 1JXM A; 2BZY A; 3QYG B; 2K2V A; 2NYS A; 3NTK A; 1M2V A; 4RCB A; 2KQW A; 3G71 A; 4XTW A; 3JCM h; 1RAG B; 4F16 A; 2ROT A; 4J9C A; 1ACM B; 2E10 A; 5CR2 A; 3VUZ A; 2IIM A; 5EG2 A; 1M1K R; 2HSP A; 1NLP C; 1VQ4 Q; 1CSK A; 4XTZ A; 2KT8 A; 1QVG A; 4OP0 A; 1VQ9 A; 2QK0 A; 2DX1 A; 2EKO A; 4C5H A; 1JJ2 A; 2CSQ A; 5LJ5 j; 3AHU A; 2DK3 A; 1SRL A; 1WZO A; 2A37 A; 3LWH A; 4C0G A; 2KY9 A; 4M78 D; 1KG1 A; 1RUW A; 1FMV A; 2XG8 D; 4M7A B; 2O4X B; 5EC7 A; 2R57 A; 5GJW B; 2VGN A; 5GAN 3; 2BKD N; 2P0K A; 1IGQ A; 2QAS A; 3HFO A; 3DKM A; 5CO7 A; 2JW4 A; 2V8I A; 3BFM A; 3N5B B; 5IXF A; 1JRI A; 1K0S A; 1M1F A; 2CT4 A; 1VQM Q; 1B34 B; 2DZC A; 4J9B A; 3TSW A; 2OAW A; 4M75 G; 4AFZ C; 3GIB A; 1Z9Z A; 1K9A A; 2DFU A; 3SB2 A; 3E19 A; 2D8H A; 4Y28 E; 4QT7 A; 2O9S A; 1GCQ A; 2X35 A; 2QGF B; 1I4K 1; 3EGX A; 1PCX A; 3EH2 A; 4JS5 A; 1UFF A; 5KH6 A; 3JCM X; 5LJ3 g; 1LCK A; 3OYE A; 2KT1 A; 1OX9 A; 1RAH B; 2KXD A; 2HNI A; 5KCH A; 2DYB A; 4AFS C; 3G6E A; 2LQW A; 1YI2 Q; 1M1K C; 1KJW A; 5M9O A; 1PD0 A; 1HJD A; 1IRE B; 4BI3 A; 3CCQ T; 2CZ7 B; 2CSI A; 5IXB A; 2HMA A; 1WJS A; 1D3B A; 4FM4 B; 4II1 A; 5L8R E; 2D9T A; 2RK2 A; 4Q5W A; 1VQ8 Q; 4RTY A; 1G83 A; 2KYM A; 4J6Y A; 2CZ6 B; 2F2X A; 1KQ2 A; 3HKS A; 4OMQ A; 5GMK e; 2YUO A; 1G2B A; 2PU9 B; 3OYA A; 2MOX A; 4IKF A; 4EMK A; 3MEA A; 1YIJ T; 4KUL A; 2OI3 A; 2QQS A; 4M78 E; 1VQ4 A; 5LJ3 h; 3HP9 A; 1LVK A; 4BE0 A; 1PD1 A; 1C0M A; 1M5Q 1; 2MI6 A; 3CMA Q; 3HRS A; 4M78 F; 4Y91 A; 2ZPB B; 2GFU A; 1K73 R; 3GP8 A; 1UTI A; 3PMT A; 1ZQ1 A; 3OYC A; 1O75 A; 3Q1J A; 3OYK A; 3HTR A; 3NMZ C; 1GCQ C; 1IHW A; 2P84 A; 1Y07 A; 2V1R A; 1D0Z A; 3OSV A; 1MND A; 4GLK A; 5GMK m; 1SSH A; 2AKL A; 2R5A A; 2RF0 A; 2K7A A; 2MIO A; 4HVU A; 9ATC B; 3CPW S; 3OYF A; 3I35 A; 3BDU A; 2FEI A; 1ZA1 B; 1M4Z A; 1VQM A; 2QEX T; 3BE3 A; 2P4R A; 1EZZ B; 2RK1 A; 1PHT A; 3OYL A; 3CCV Q; 3CCM Q; 3SWN A; 2HAX A; 1BIA A; 3CXC P; 1WQW A; 4MZM A; 1M8M A; 1OPL A; 2PVD B; 1XJW B; 2FHD A; 2DBM A; 1BBZ A; 3LW5 E; 5FU7 B; 3KBG A; 4E7K A; 2EGC A; 2RI3 A; 3CCL Q; 2JTF A; 1TOV A; 3QZ9 B; 3LH0 A; 4EMK C; 1Q7Y U; 2PVO B; 4M75 B; 1K76 A; 1UGR B; 2E41 A; 3UWN A; 1G3T A; 2KXC A; 4RTU A; 2CRE A; 3S3M A; 5CCA A; 4M78 G; 2RHU A; 1YI2 A; 2FO0 A; 1QVG S; 4Z8A A; 2JTM A; 5GAN 6; 1KQS A; 2NLU A; 4QW2 A; 5FU6 C; 1PNJ A; 1Y0M A; 2AHJ B; 2XHC A; 2FPE A; 2AIR B; 5CIU A; 3WXM B; 4AG2 C; 2KRM A; 1NJI R; 2SEM A; 1YJN T; 2YRV A; 1VQ5 T; 4OB2 B; 2JVV A; 1VQ8 A; 1H92 A; 1K73 C; 1WHH A; 1WDX A; 2QQA A; 1SHG A; 2OTL T; 4OB0 B; 3CME Q; 1VQ6 A; 3GF5 A; 2DVJ A; 2LCL A; 4EIK A; 1K4U S; 4E7I A; 1U8R A; 3CCE Q; 1ZSZ A; 2GTJ A; 2K3B A; 5GAN 5; 2RHZ A; 3A98 A; 1VQ7 A; 3V8J A; 1NEG A; 5GAN 4; 1VQO Q; 1SPK A; 1I5O B; 2VUB A; 2DNU A; 2MCN A; 3MEW A; 3JCM d; 2VXF A; 3CMA A; 3QII A; 3SWN C; 3UA7 A; 3CC7 T; 4M7D A; 2YWW A; 1VOM A; 1W70 A; 1X01 A; 2XDP A; 1W2B A; 1UJ0 A; 1KFZ A; 4HA8 A; 2MMP A; 4F17 A; 3CD6 T; 2E3I A; 1ZA2 B; 3O5Z A; 3CCS A; 1FX7 A; 1YN8 A; 2QXF A; 1QP2 A; 1PG5 B; 5D7U A; 4NL3 A; 2KR3 A; 2M0Y A; 3ZFJ A; 1SKU B; 3EFO B; 2XD0 A; 2K5F A; 4M77 B; 4FSS A; 1AHJ B; 1K1Z A; 1Q95 G; 1SG5 A; 3CCV A; 1UGS B; 1M30 A; 3CCM A; 1U06 A; 1UHF A; 2DD5 A; 1TTH B; 4DBQ A; 4FSX A; 5J26 A; 4PJJ A; 2RA2 A; 3MHX A; 1CKA A; 2HKN A; 1AEY A; 3MP6 A; 1WYX A; 1NJI C; 1BCM A; 5LJ5 f; 3OYN A; 1M1G A; 2J6O A; 3A8H B; 1VQP Q; 4KRT A; 2IPO B; 4OMF B; 1I1J A; 2QG9 B; 3CCL A; 4V2S A; 2QTV A; 1Z9Q A; 5KYW A; 2A3L A; 3LGL A; 3H0I A; 3H0H A; 4HCZ A; 1ZSZ C; 1UGV A; 3TU4 K; 1FMK A; 2H8H A; 3V8L A; 1SRM A; 2HDA A; 2HQX A; 4E7Z A; 3QHS A; 4K11 A; 4N4H A; 2JUF A; 3E1S A; 3F70 A; 3SHW A; 3EG2 A; 3FDR A; 4M4Z A; 2CKK A; 4M7D C; 1RAB B; 2ROL A; 4CC7 A; 2GNC A; 3LGF A; 2KMT A; 1WJQ A; 1UG1 A; 4JRI A; 1X27 A; 4AFQ C; 3LH5 A; 2KAF A; 4C8Q B; 4JJD A; 5I22 A; 3EFS A; 2DIQ A; 3HFN A; 3G4S A; 3CME A; 4ELY C; 2K2M A; 1PWT A; 4FT2 A; 3NPF A; 3P8B B; 1WXB A; 2DA9 A; 1MV0 B; 4C5G A; 4C8Q A; 3VRY A; 2DRK A; 2LRQ A; 3CCE A; 2NUP A; 3OY9 A; 1PC0 A; 2K5L A; 2RO0 A; 2LQN A; 4F7U B; 3EFO A; 1Y71 A; 2F69 A; 4WF2 A; 4MDX A; 4M77 A; 3RMQ A; 2EQU A; 1WX6 A; 2JZ2 A; 4X9C A; 4E7L A; 2LJ3 A; 2J05 A; 1W6X A; 3UT1 A; 4D6W A; 3JB9 J; 4M7D D; 5GAO l; 1MUZ A; 4HCB A; 3V8K A; 2EFI A; 1SF9 A; 2PVG B; 2KRS A; 5GMK i; 3A8M B; 3SDZ A; 2DYI A; 1RLP C; 3CQT A; 4J83 A; 1SHF A; 4PJO G; 3OYJ A; 1QP3 A; 2K4Y A; 1YIT Q; 3GNF B; 2YRD A; 3S6W A; 5L23 A; 2E3H A; 4KUD K; 2CT3 A; 1KC8 R; 2D0N A; 2EAY A; 2GGR A; 1M90 R; 2Y4X A; 1ZUY A; 5FW9 A; 3TVT A; 4PLI A; 4GY5 A; 5C6S A; 4NOY A; 1GFC A; 3VS2 A; 3EG9 A; 2JJ9 A; 4LDV A; 1FWZ A; 3ZEH A; 8ATC B; 2LJ0 A; 4ZTF A; 2D6F A; 1VA7 A; 4JS4 A; 3OA6 A; 1QVF A; 3CXC S; 4FW2 A; 2ZGW A; 5LJ3 j; 4FYX B; 1IB8 A; 1N6A A; 3BW1 A; 1AWW A; 2GQI A; 1Q82 U; 3RES A; 1ABO A; 2RD1 A; 4FT4 A; 4IIO A; 1GXI E; 1VQP A; 4BY6 C; 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