The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
73
|
structure length |
73
|
Chain Sequence |
GSSGSSGPCCRALYDFEPENEGELGFKEGDIITLTNQIDENWYEGMLHGHSGFFPINYVEILVALPHSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase, signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Solution structures of the SH3 domain of human SH3-containing GRB2-like protein 2
rcsb |
| molecule keywords |
SH3-containing GRB2-like protein 2
|
| total genus |
5
|
| structure length |
73
|
| sequence length |
73
|
| ec nomenclature |
ec
2.3.1.-: |
| pdb deposition date | 2005-12-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DIL A; 1GBQ A; 1JXO A; 2JTE A; 1JQQ A; 3VRY A; 1T0J A; 2J6F A; 4DEX A; 1RI9 A; 2KXD A; 1PRM C; 2AKL A; 3M0U A; 1ZLM A; 2O9V A; 3H0H A; 3A98 A; 1HSQ A; 1UUE A; 2P4R A; 2ECZ A; 2J6K A; 2JM9 A; 2SRC A; 1H8K A; 2LZ6 B; 2FPD A; 1UFF A; 2ABL A; 2FG0 A; 2JMC A; 1QLY A; 1PKT A; 3M0Q A; 4OMO A; 2FRW A; 2D8H A; 4J9F A; 2HSP A; 2DRK A; 2RMO A; 3EHR A; 3UAT A; 2VKN A; 1FYN A; 2PZ1 A; 4Z88 A; 2EPD A; 2JM8 A; 1HJD A; 1KIK A; 1TUD A; 2DE0 X; 2CRE A; 4F17 A; 1BBZ A; 1UG1 A; 2CUB A; 2NWM A; 3U23 A; 4J9D A; 4RTW A; 4ORZ A; 3M0T A; 2EGE A; 4HVV A; 2L2P A; 4J9E A; 1ARK A; 2BZ8 A; 2JS2 A; 2ROT A; 1M3B A; 3TVT A; 4CC7 A; 1UDL A; 2A36 A; 3JV3 A; 2YSQ A; 1M8M A; 3H41 A; 1GFD A; 1ZX6 A; 2LNH B; 1VYT A; 1W70 A; 3EHQ A; 4OMN A; 1VA7 A; 1AD5 A; 1X69 A; 2KYB A; 3RBB B; 1WLP B; 2RQR A; 1WXU A; 3TSZ A; 1U3O A; 3GBQ A; 1J3T A; 1T3S A; 1SEM A; 2GGR A; 2ROL A; 4RTX A; 1OPL A; 2ED0 A; 2D8J A; 1Y0M A; 1M30 A; 1NEG A; 1BB9 A; 1UJY A; 1CSK A; 1UEC A; 1OV3 A; 1WYX A; 4HXJ A; 5L23 A; 4J9C A; 4RTY A; 2EVR A; 3I9Q A; 3EG0 A; 1AWW A; 4LE9 A; 2EYZ A; 1K9A A; 2HDA A; 5IHI A; 1BU1 A; 4J9I A; 3NGP A; 1KSW A; 2KE9 A; 4OML A; 1AWJ A; 2KRO A; 4R0K A; 3LH5 A; 2ESW A; 2OI3 A; 4LUE A; 3FJ5 A; 1E6H A; 1KJW A; 3UF4 A; 1B07 A; 3PE0 A; 4GBQ A; 1GFC A; 2YUQ A; 1UHF A; 1CKA A; 3NHN A; 4Y92 A; 1WI7 A; 1QKX A; 4JJB A; 2C0I A; 2KT1 A; 2B86 A; 5I11 A; 1RLQ C; 2KR3 A; 3IQL A; 1RLP C; 2BZX A; 2PNI A; 1YP5 A; 2KT8 A; 4RUG A; 4CC4 B; 2KRS A; 3PVQ A; 4IIO A; 1YCS B; 1T0H A; 2F2X A; 1AVZ C; 2D0N A; 1I07 A; 2RQV A; 2QDL A; 4F14 A; 1MUZ A; 2F2V A; 4OMP A; 2OJ2 A; 2HBW A; 1NYF A; 2EYY A; 1T3L A; 4JPB W; 1PNJ A; 2D1X A; 4RTU A; 1NYG A; 3H0F A; 5FW9 A; 2KRN A; 4WCI A; 1SRL A; 2MIO A; 2CH4 W; 1SHG A; 4CC3 A; 4Z89 A; 2KBT A; 2O88 A; 3I5S A; 2EYX A; 3TSW A; 2VWF A; 3M0P A; 1IO6 A; 2DM1 A; 1BK2 A; 1GCQ A; 1GBR A; 2DF6 A; 2LCS A; 2DL4 A; 5FWC A; 1NG2 A; 2X3X D; 2KNB B; 2RQW A; 4ZNX A; 1MV3 A; 4AFQ C; 3CQT A; 2K79 A; 2G6F X; 1UJ0 A; 2H8H A; 2M51 A; 3REA B; 2AK5 A; 1OOT A; 2W10 A; 2ED1 A; 3UA7 A; 2AZS A; 2KRM A; 1Y57 A; 2DL8 A; 2J06 A; 3VS4 A; 3KFV A; 1M27 C; 1QKW A; 4F16 A; 2LJ1 A; 1A0N B; 1UE9 A; 3VS1 A; 1AZG B; 4X1V A; 2C0T A; 2I0N A; 2BTT A; 4KRT A; 4AFU C; 5IH2 A; 4RTV A; 2K7A A; 2DX1 A; 2RNA A; 1JEG A; 1ZUY A; 1X2Q A; 2DL7 A; 2RF0 A; 1K0S A; 2FO0 A; 1JU5 C; 4JZ3 A; 2RN8 A; 4HVU A; 1X6G A; 2GBQ A; 1AOJ A; 2A37 A; 3QWX X; 3VS6 A; 1JXM A; 3O5Z A; 4JJC A; 1YNZ A; 3UA6 A; 2J7I A; 4AFZ C; 1WFW A; 1YWO A; 1AZE A; 2EGA A; 2RPN A; 2GNC A; 4A63 B; 2CT3 A; 2L3P A; 1PRL C; 1UHC A; 1G83 A; 4JZ4 A; 4M4Z A; 5IXB A; 2LMJ A; 5IHN A; 1QWE A; 1YN8 A; 2YUN A; 3ULR B; 3VS7 A; 4AG1 C; 1N5Z A; 2CSI A; 4ESR A; 3NPF A; 4LNP A; 2DJQ A; 2AZV A; 2F2W A; 4D8D A; 1VYU A; 2O2O A; 4HVW A; 4OMM A; 1UGV A; 4AFS C; 2YT6 A; 2XMF A; 1RUW A; 3C0C A; 3VS3 A; 4CC2 A; 3I5R A; 3EGU A; 2KXC A; 2EW3 A; 2DRM A; 4OMQ A; 2DNU A; 2A08 A; 1TUC A; 2LJ3 A; 2DMO A; 2DL3 A; 2NUZ A; 1H92 A; 3THK A; 2CUD A; 1MV0 B; 2ENM A; 2L0A A; 2K6D A; 1YWP A; 2AKK A; 1U5S A; 2JMA A; 4HCK A; 3M0S A; 1B3Q A; 2E5K A; 2YDL A; 1X6B A; 1ABQ A; 2FPF A; 1FMK A; 2YUP A; 2KGT A; 4RTT A; 1S1N A; 3QWY A; 1OPK A; 2EKH A; 2FEI A; 1X43 A; 3R6N A; 1SSH A; 2IIM A; 1WDX A; 4LUD A; 1QWF A; 3I35 A; 1JO8 A; 4J9B A; 1PHT A; 1GRI A; 1Z9Z A; 1TG0 A; 2W0Z A; 3EG3 A; 1GL5 A; 2V1R A; 1WIE A; 1M3C A; 2JW4 A; 1K4U S; 1K1Z A; 2V1Q A; 1H3H A; 1PWT A; 2O31 A; 1UTI A; 4QT7 A; 4Z8A A; 1E6G A; 1EFN A; 1X2K A; 4AG2 C; 2MCN A; 1GCP A; 1X27 A; 3PVL A; 5EC7 A; 2DBK A; 2MOX A; 1WA7 A; 5IHK A; 1NLO C; 4LN2 A; 1CKB A; 4DEY A; 1U06 A; 2EBP A; 4K11 A; 2CSQ A; 5FWB A; 2FRY A; 1ZUK A; 2J6O A; 2K9G A; 2JT4 A; 1K76 A; 2PTK A; 1W6X A; 1W1F A; 2LQW A; 1ABO A; 1SHF A; 1GCQ C; 2DA9 A; 3SHW A; 1AEY A; 2EQI A; 2CT4 A; 5GJV B; 2GTO A; 4D8K A; 4J9G A; 4E6R A; 2DVJ A; 2EGC A; 2J05 A; 2RQT A; 1ZUU A; 1AWX A; 4JJD A; 2C0O A; 3ZL7 C; 5IXF A; 1NM7 A; 1WX6 A; 2DL5 A; 1WXT A; 3M0R A; 1PKS A; 2VVK A; 2JXB A; 2DYB A; 1AWO A; 2L3S A; 3VS0 A; 1Z9Q A; 2CH4 A; 5GJW B; 2RQU A; 4IIM A; 3REB B; 2SEM A; 1QCF A; 2O9S A; 3RNJ A; 3SEM A; 1XOV A; 4GLM A; 2GTJ A; 1V1C A; 2BZY A; 4FSS A; 2HEQ A; 2OAW A; 2K2M A; 3EG1 A; 2JS0 A; 3VRZ A; 1KFZ A; 2HCK A; 1WXB A; 5HCK A; 2LQN A; 3NMZ C; 2DLP A; 2EYW A; 1NEB A; 1SRM A; 2X3W D; 3EG2 A; 3H0I A; 2LP5 A; 5ECA A; 2FPE A; 1ZBJ A; 1G2B A; 2K3B A; 1LCK A; 1I0C A; 1I1J A; 2KYM A; 2LX7 A; 1ZSG A; 4EIK A; 2A28 A; 3VS5 A; 1OEB A; 5I22 A; 2YUO A; 2DBM A; 2M0Y A; 4RTZ A; 3VS2 A; 1HD3 A; 1SPK A; 2LJ0 A; 4J9H A; 1NLP C; 2L3Q A; 1M3A A; 1VYV A; 1K0X A; 2CDT A; 2KEA A; 2GQI A; 1E7O A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GMK j; 2DAQ A; 1AT1 B; 1T0J A; 3SD4 A; 3EG9 B; 6AT1 B; 1Q86 U; 2KXD A; 3CCV Q; 2AKL A; 4NOY A; 3A98 A; 3JCM f; 2PVO B; 4QVC A; 2P4R A; 4OB2 B; 2LZ6 B; 2FPD A; 1UFF A; 2YLC A; 1PCX A; 3CCR Q; 1KD1 C; 4GLK A; 3DLL A; 1QLY A; 4ZGD B; 3CCE Q; 5AYF A; 4E7Z A; 3JCM W; 4C8Q A; 1D3B A; 2HSP A; 2QAZ A; 2DJZ A; 3UAT A; 2PZ1 A; 3CC7 Q; 5KYW A; 2BE7 D; 2CZ6 B; 2KAF A; 1WPY A; 2DE0 X; 2CRE A; 1BBZ A; 1KK7 A; 2CUB A; 1WJS A; 1X75 C; 5DM7 R; 2NWM A; 3U23 A; 2FHD A; 1KC8 R; 4ORZ A; 2QEX A; 3PMT A; 1YJN T; 3CEY A; 3JCM g; 4CC7 A; 3OYA A; 3JB9 I; 3X26 B; 4LXC A; 1M8M A; 3D7S B; 3EHQ A; 3RKW A; 3RBB B; 2RQR A; 4YTL A; 2YHT A; 3TSZ A; 4OB1 B; 2X51 A; 2D6F A; 4NS5 A; 1XQH A; 5KYY A; 5KYN A; 4M7A C; 1UB4 A; 1VQ4 A; 1M30 A; 2FB7 A; 2FVU A; 1NEG A; 1Q82 U; 1WYX A; 4HXJ A; 2LNV A; 1FMW A; 3HTR A; 4P5N A; 2EVR A; 3C12 A; 3CMA Q; 1BU1 A; 2HSE B; 5CQX A; 3MEW A; 3NGP A; 4KGX B; 1W4S A; 2DK3 A; 1VQN T; 2KY9 A; 5CCA A; 1K8A U; 4LUE A; 5FU6 B; 2OI3 A; 3L2W A; 3F70 A; 4JS5 A; 1JBM A; 1KJW A; 3EGD A; 3UF4 A; 1B07 A; 4X9D A; 3QBY A; 1IGU A; 4C8Q E; 3JAM E; 2YUQ A; 3HPW A; 1WI7 A; 2XD0 A; 4M7A E; 1QKX A; 4M77 G; 1WHL A; 1VQ9 T; 2XIC A; 1RLQ C; 2KR3 A; 2JOY A; 2QQS A; 4M78 C; 2F5K A; 2Z0W A; 2PNI A; 2E5Q A; 3CC2 Q; 2COW A; 3OYE A; 2KRS A; 2RHI A; 5A2Q E; 1YCS B; 3A8H B; 1JB0 E; 3NTK A; 1N9R A; 2K3X A; 1V29 B; 2F2X A; 4DBQ A; 2GFA A; 2LCC A; 4F14 A; 4M7D D; 4OB3 B; 4OMP A; 1TU0 B; 5I2S A; 2KSS A; 3J80 E; 3CME A; 3KUF A; 3CC4 Q; 2HBW A; 4PJO A; 1BCO A; 5C6S A; 3TCJ A; 1NYF A; 1T3L A; 4JPB W; 1N6A A; 2KRN A; 4OGE A; 3C4S A; 3RER A; 2R5A A; 2V8I A; 2QGF B; 1K8A R; 2CH4 W; 4CC3 A; 1OU8 A; 4IUQ A; 2KBT A; 2DKG A; 1KHI A; 3OYC A; 1GBR A; 2DF6 A; 3GNG A; 3INZ A; 2QEX Q; 1OU9 A; 4IKF A; 3MP1 A; 1RAH B; 4ZNX A; 3CCM T; 1MV3 A; 3FIF A; 1FMV A; 3A8G B; 2O4X B; 2XHC A; 1RAB B; 5CVI A; 3JB9 D; 3X28 B; 5GAN 3; 3REA B; 5HKC A; 3V8K A; 4A4E A; 5GAN 2; 2QA4 A; 2DXB A; 5D6Y A; 3UA7 A; 2V8J A; 3VS4 A; 4BE2 A; 5D6W A; 1VQ4 Q; 1D0Y A; 4KBM B; 4X1V A; 5IH2 A; 2M0O A; 4AFU C; 2DX1 A; 5GAN e; 3V7S A; 2RF0 A; 1X01 A; 1JU5 C; 3L2U A; 1D0Z A; 4J6X A; 1X6G A; 1AOJ A; 3A8L B; 3UA6 A; 1YWO A; 2RPN A; 2L3P A; 3QDR B; 3HL8 A; 1UHC A; 4D6W A; 2G3R A; 4M7A D; 3GP8 A; 4N4H A; 3WXM B; 1K73 U; 2I2L A; 3GF5 A; 3G4S T; 1UEB A; 2YUN A; 2VC8 A; 5LJ3 f; 8ATC B; 5KE2 A; 4AG1 C; 3BW1 A; 2H3J A; 4EMK A; 3SB2 A; 4LNP A; 2CGH A; 2F2W A; 1VYU A; 3OYK A; 4QQD A; 4PFP A; 2AT1 B; 3C0C A; 5GAN d; 3VS3 A; 2HQH A; 4DBF A; 1WHM A; 2RI3 A; 3QJY A; 2LJ3 A; 2VYT A; 3DLM A; 4ME7 A; 4O6J A; 4FCY A; 1VQL A; 3I56 A; 2MMP A; 2NUZ A; 1VQ8 T; 2ZZD A; 2OTL A; 2PVD B; 3THK A; 3HKS A; 4XQ3 A; 1QVF A; 4HA8 A; 2CP3 A; 2LTO A; 1BIB A; 3CME Q; 4C0G A; 2ZCF B; 4M78 D; 4HT8 A; 3OYH A; 3DKM A; 2JMA A; 3LLR A; 3CPF A; 2XI9 A; 4F04 B; 1ABQ A; 1PM3 A; 1I81 A; 2VGN A; 1S1N A; 3QWY A; 5IAY A; 1X43 A; 4M7D F; 4CI0 C; 1WDX A; 5DY9 A; 1QWF A; 2MPX C; 3I35 A; 4PJO G; 1Z9Z A; 2K5I A; 4KUL A; 5CR2 A; 3EFO B; 2V1Q A; 4LDV A; 3OB9 A; 2O31 A; 1YIT T; 1QVG S; 2QA4 Q; 3JCM e; 2MOX A; 5IHK A; 4DEY A; 4LN2 A; 1KC8 C; 1U06 A; 1C1A A; 2CSQ A; 5GMK i; 5GAN 7; 4F7U F; 5GAN h; 1TS9 A; 2GFU A; 2PTK A; 1W6X A; 1W1F A; 2KI7 A; 3BDL A; 4FIB A; 1VQ6 T; 1WHJ A; 1LNX A; 2E6Z A; 8AT1 B; 1BI0 A; 1GCQ C; 3JB9 F; 1HK9 A; 2F69 A; 3LWH A; 3CCL T; 1TXQ A; 2CT4 A; 4EMG A; 3L1A A; 2GTO A; 9ATC B; 3CPW S; 3MKD A; 1LJO A; 2P0P A; 4XTX A; 2J05 A; 2RB6 A; 2ZPI B; 3MEU A; 1Q86 C; 3LH0 A; 4XU3 A; 3ZL7 C; 5IXF A; 1VQK A; 4C0D C; 2QXF A; 2DEQ A; 1WXT A; 2VVK A; 2F5T X; 3FJP A; 1V76 A; 2L3R A; 2RQU A; 4C5G A; 2PU9 B; 2VXE A; 4IIM A; 4BE0 A; 2DVE A; 3VUZ A; 2E70 A; 3JCM d; 2M1H A; 2L8D A; 2GTJ A; 5KCH A; 3G6E A; 2BZY A; 3QXE B; 2K2M A; 2JS0 A; 4Y28 E; 3FDR A; 1QVG P; 5J26 A; 5CKE A; 2D9T A; 2EYW A; 2EIF A; 5ECA A; 3QUI A; 1G2B A; 1LCK A; 1I1J A; 2LX7 A; 4EIK A; 1VQL Q; 3I56 Q; 1XTD A; 5I22 A; 2YUO A; 4N0A A; 4X34 A; 2OTL Q; 1KG1 A; 2MF2 A; 2M0Y A; 4XU1 A; 1F1B B; 4E7I A; 2LJ0 A; 2L3Q A; 1VQ7 A; 2HKQ B; 2NUP A; 3CPW P; 1YHQ T; 2DXC A; 2KEA A; 3HHT B; 2GQI A; 4PK4 A; 1JQQ A; 2P0K A; 2LRQ A; 4PL6 A; 1Q7Y U; 3SWN A; 4DEX A; 1PRM C; 3CCV A; 3M0U A; 1ZLM A; 1Q82 C; 3AHU A; 3LGF A; 2SRC A; 2ECZ A; 2JM9 A; 5FRM A; 1TUG B; 3SFM A; 2ABL A; 2FG0 A; 4OMF B; 2JMC A; 3N5B B; 4M78 F; 4VUB A; 4J7I A; 2FRW A; 2LQ8 A; 2DRK A; 2RMO A; 3EHR A; 4BD3 A; 2VKN A; 1K8A C; 2RA2 A; 2EPD A; 1YJ9 A; 1U1S A; 1HJD A; 4ZGE B; 3ZEH A; 4MDW A; 3MET A; 1UG1 A; 1IZ6 A; 4LD9 K; 3QKJ A; 1Y7X A; 4J9D A; 1M90 U; 2RJE A; 3SWN C; 2MAM A; 1X6O A; 2BZ8 A; 2MI6 A; 3CCJ Q; 1UDL A; 2YSQ A; 4IUR A; 1GFD A; 3S6W A; 1VYT A; 1W70 A; 3BE3 A; 5KYX B; 1O9S A; 2DFU A; 2QYZ A; 3OYG A; 2K5L A; 4C8Q B; 1D3B B; 2KYB A; 5GAM f; 2DZ9 A; 1Q7Y R; 1WLP B; 3HFN A; 3GBQ A; 4QQG A; 1VQK Q; 4C5H A; 1J3T A; 1T3S A; 5GAO p; 5KYW B; 1SEM A; 2CZ0 B; 2PUK B; 2ROL A; 3PNW C; 4RTX A; 2ED0 A; 2CP2 A; 4J5Y A; 2D8J A; 2GCX A; 4M7A B; 4BAC A; 3G1J A; 2XG8 D; 1BB9 A; 1UJY A; 1WQW A; 3CCS A; 5L23 A; 1B34 A; 1NJI U; 3OS2 A; 2CS7 A; 2DO3 A; 1IRX A; 3G6E Q; 2EYZ A; 1K9A A; 3P8B B; 4M77 A; 1D1B A; 2JVV A; 1I8F A; 2KE9 A; 3JSC A; 2KRO A; 1KQ1 A; 4C92 A; 4AT1 B; 3FJ5 A; 1E6H A; 2E3I A; 4BB7 A; 3P8D A; 1GFC A; 1UHF A; 5GAN j; 4XTV A; 1RAD B; 5KYY B; 3CPW A; 2C0I A; 2L5Q A; 1YJN Q; 2IPO B; 1VQ7 Q; 3IQL A; 1RLP C; 1RAC B; 2BZX A; 4GY5 A; 2KT8 A; 3HRS A; 2XDB A; 1PSF A; 3RKX A; 4FW2 A; 1UGP B; 1UGS B; 3QYH B; 2HKN A; 3MCA B; 2E1H A; 3V8J A; 4B9X A; 5LJ3 e; 1NE8 A; 2RQV A; 3EGD B; 3CCQ T; 1NJI R; 5J39 A; 4JS4 A; 1M8V A; 2OJ2 A; 3OYM A; 1HYO A; 3MPU B; 2DD4 A; 3CC4 A; 1GXI E; 5GAN 5; 1PNJ A; 2D1X A; 3H0F A; 5FW9 A; 2K4Y A; 3OS1 A; 1YI2 A; 2MIO A; 3OY9 A; 1YJ9 Q; 1SHG A; 3WVE B; 3S3O A; 3A8M B; 2HL3 A; 4IUV A; 1DJ7 B; 2HAX A; 4M77 E; 2HQE A; 3TSW A; 2VWF A; 2LCS A; 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