The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
GIDPFTGEAIAKFNFNGDTQVEMSFRKGERITLLRQVDENWYEGRIPGTSRQGIFPITYVDVIKRPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Second SH3 domain of ponsin solved from powder diffraction
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Ponsin
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| total genus |
13
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| structure length |
67
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| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-11-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1OOT A; 1UHF A; 1UJY A; 3PVL A; 4AG2 C; 2RN8 A; 4CC4 B; 2ENM A; 3REB B; 1WXU A; 1IO6 A; 2X3W D; 2K3B A; 4J9C A; 1GCQ A; 3EHR A; 3H0I A; 2YSQ A; 1TUC A; 1TUD A; 3NGP A; 1X6B A; 2AK5 A; 3VS6 A; 1S1N A; 2EQI A; 5IXF A; 1KFZ A; 2YUQ A; 3TSW A; 1WYX A; 3H0F A; 4J9G A; 4K11 A; 4FSS A; 4AG1 C; 3H0H A; 1W70 A; 2L2P A; 2D8H A; 2F2X A; 1VYU A; 3M0R A; 4X1V A; 2KRS A; 2AZS A; 4RTU A; 2EGE A; 2OI3 A; 1H8K A; 1FMK A; 2JT4 A; 4OMN A; 1H3H A; 2V1Q A; 2KGT A; 4M4Z A; 2MCN A; 4OMQ A; 2D0N A; 2AZV A; 3LH5 A; 2A37 A; 1QKX A; 1M3A A; 2J6K A; 4R0K A; 1AWO A; 2DE0 X; 2KXC A; 1GFC A; 2FG0 A; 4OML A; 2O9S A; 2PNI A; 1CKA A; 3SEM A; 4JJD A; 2V1R A; 2FO0 A; 1X6G A; 1YN8 A; 3VS7 A; 1K9A A; 3VS4 A; 2DMO A; 2BZX A; 1I07 A; 2RPN A; 2J6O A; 1YNZ A; 2JM8 A; 2KRM A; 2DL7 A; 1QKW A; 2AKL A; 2YUN A; 2RQR A; 2W10 A; 2KT8 A; 1X2Q A; 1AWJ A; 1SEM A; 1ZSG A; 4OMM A; 3REA B; 4LUE A; 3O5Z A; 1GCQ C; 2K2M A; 3UA6 A; 2FRY A; 2EYY A; 2CT4 A; 4CC7 A; 4LN2 A; 1N5Z A; 1M30 A; 2GBQ A; 2M51 A; 2DF6 A; 3H41 A; 4F17 A; 1JEG A; 2DYB A; 2YUO A; 4ESR A; 5ECA A; 1E7O A; 2FRW A; 2ED1 A; 5GJV B; 4Y92 A; 5FWC A; 1GRI A; 4OMP A; 4AFQ C; 1XOV A; 2CSQ A; 1U3O A; 1SRM A; 2C0T A; 4GBQ A; 2YT6 A; 1KJW A; 1SHF A; 1U06 A; 1ZX6 A; 2I0N A; 2RF0 A; 1PKT A; 1WA7 A; 4HVU A; 5FW9 A; 4F14 A; 2LMJ A; 1WXB A; 4QT7 A; 3VS2 A; 4IIM A; 4DEX A; 1YWP A; 1ZLM A; 2HEQ A; 5FWB A; 5IHN A; 1M27 C; 4CC3 A; 2KEA A; 2JS2 A; 3TVT A; 2YUP A; 1ARK A; 2A28 A; 1B3Q A; 1PKS A; 4LUD A; 1X43 A; 2K79 A; 1A0N B; 2J05 A; 4OMO A; 1QWF A; 4JJB A; 4Z88 A; 5IHK A; 2K9G A; 2GGR A; 4LNP A; 1QCF A; 2JM9 A; 4WCI A; 2EPD A; 1PNJ A; 3EG1 A; 2EYX A; 4JZ4 A; 1E6G A; 2KE9 A; 1NYG A; 1JO8 A; 2FPF A; 2DL5 A; 2CT3 A; 2DL4 A; 2EW3 A; 2ESW A; 3C0C A; 1NM7 A; 1X27 A; 2L3P A; 2X3X D; 2EVR A; 1M8M A; 1UGV A; 2CRE A; 1OV3 A; 2GTO A; 4LE9 A; 2F2W A; 1PRL C; 2EGC A; 1UTI A; 2C0O A; 1BU1 A; 1UEC A; 3THK A; 4J9E A; 1OPK A; 3PVQ A; 1SSH A; 1T3S A; 4RTV A; 3ULR B; 1UHC A; 1SPK A; 4RTZ A; 2KR3 A; 3EG0 A; 2RNA A; 2JXB A; 4RTX A; 4Z8A A; 2CUB A; 1FYN A; 1RLQ C; 4ZNX A; 3QWX X; 1AOJ A; 1K76 A; 2KYM A; 1KSW A; 5GJW B; 2LNH B; 1WLP B; 2PZ1 A; 1GL5 A; 3VS5 A; 2KBT A; 2BZ8 A; 1T0J A; 3U23 A; 2RMO A; 2EBP A; 2E5K A; 1ABQ A; 4J9F A; 2G6F X; 3NMZ C; 1K1Z A; 2KRO A; 2ECZ A; 2ROL A; 1BBZ A; 1YP5 A; 3JV3 A; 3M0P A; 1ABO A; 1MUZ A; 2EYZ A; 2DIL A; 4J9I A; 1T0H A; 2LZ6 B; 1K0S A; 2DVJ A; 2EYW A; 2LQW A; 3ZL7 C; 2RQW A; 2LCS A; 3M0U A; 1QLY A; 4J9B A; 1AD5 A; 2DJQ A; 2P4R A; 1G83 A; 3M0T A; 1U5S A; 1ZBJ A; 1Z9Q A; 2GNC A; 1PWT A; 1I1J A; 1NEG A; 2HDA A; 1WXT A; 1AWW A; 4F16 A; 3I35 A; 2DNU A; 3UF4 A; 1K4U S; 3GBQ A; 3VS1 A; 1AZE A; 2FPD A; 1W1F A; 4A63 B; 1TG0 A; 2LJ3 A; 2CUD A; 1JXO A; 1AVZ C; 3VRZ A; 4RUG A; 4AFZ C; 2M0Y A; 3EGU A; 1W6X A; 2O88 A; 3EHQ A; 2W0Z A; 1ZUK A; 2JW4 A; 3QWY A; 4JJC A; 1H92 A; 1WX6 A; 1AWX A; 1NG2 A; 1OEB A; 3UA7 A; 2KYB A; 3NHN A; 1X69 A; 3CQT A; 4J9H A; 1JQQ A; 2DLP A; 3UAT A; 1VYV A; 1UG1 A; 2YDL A; 2EKH A; 1GCP A; 2C0I A; 1HD3 A; 1UUE A; 2AKK A; 3M0Q A; 4GLM A; 1K0X A; 2VVK A; 4J9D A; 1NEB A; 4HVW A; 3EG2 A; 5I11 A; 1AZG B; 3I5S A; 3M0S A; 3TSZ A; 1WI7 A; 2JMC A; 3NPF A; 2DBM A; 2D8J A; 3I9Q A; 1EFN A; 1HJD A; 2F2V A; 1NLO C; 1GBR A; 1PHT A; 2EGA A; 2L3S A; 2RQT A; 2J7I A; 2IIM A; 1WIE A; 4HXJ A; 2MIO A; 1RI9 A; 5HCK A; 2SRC A; 1WDX A; 4IIO A; 5I22 A; 1BB9 A; 1KIK A; 4JZ3 A; 1MV0 B; 1BK2 A; 2KXD A; 2ROT A; 3EG3 A; 3IQL A; 1HSQ A; 2CH4 W; 1GBQ A; 1M3C A; 2BTT A; 2OJ2 A; 1Y57 A; 2HCK A; 2RQV A; 2GQI A; 1MV3 A; 2DX1 A; 3RNJ A; 3VRY A; 1T3L A; 2O31 A; 1RUW A; 2SEM A; 2DRM A; 5IHI A; 4EIK A; 2HBW A; 1NLP C; 2ED0 A; 3I5R A; 4AFS C; 4DEY A; 2L0A A; 2D1X A; 2JMA A; 1Z9Z A; 1ZUY A; 1LCK A; 4AFU C; 1E6H A; 1CSK A; 1VYT A; 3KFV A; 1UE9 A; 2XMF A; 4HVV A; 1AEY A; 2J6F A; 4KRT A; 1RLP C; 2B86 A; 2DBK A; 2FPE A; 2BZY A; 2GTJ A; 1YCS B; 2PTK A; 2CSI A; 1PRM C; 2CDT A; 1NYF A; 4ORZ A; 5IH2 A; 1OPL A; 1J3T A; 1X2K A; 4RTW A; 2O2O A; 1UJ0 A; 3RBB B; 2NUZ A; 2FEI A; 1V1C A; 2LX7 A; 4D8K A; 2LJ1 A; 5IXB A; 1M3B A; 2A36 A; 1GFD A; 5L23 A; 4E6R A; 2RQU A; 2K7A A; 4CC2 A; 2KRN A; 1B07 A; 2H8H A; 2CH4 A; 2MOX A; 1ZUU A; 2QDL A; 3FJ5 A; 2VKN A; 2NWM A; 2O9V A; 4RTY A; 4JPB W; 1UFF A; 2L3Q A; 1VA7 A; 4RTT A; 3VS3 A; 1WFW A; 2DM1 A; 2DL8 A; 2DA9 A; 1QWE A; 2JTE A; 4D8D A; 1I0C A; 2ABL A; 2LJ0 A; 2KNB B; 2VWF A; 2JS0 A; 2DL3 A; 2DRK A; 2HSP A; 2OAW A; 4HCK A; 3PE0 A; 2A08 A; 1UDL A; 2KT1 A; 3VS0 A; 1Y0M A; 1CKB A; 1SRL A; 1JU5 C; 1YWO A; 1SHG A; 1G2B A; 2K6D A; 5EC7 A; 2LP5 A; 4Z89 A; 1JXM A; 2J06 A; 3R6N A; 2LQN A; 3SHW A; 3A98 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4AG2 C; 2RN8 A; 3EG9 A; 4MDW A; 4PK4 A; 2K3B A; 4M7D C; 1S72 A; 1YJ9 T; 4PLI A; 3CCS A; 1TUD A; 1X6B A; 2VC8 A; 1WJS A; 3G71 T; 2EQI A; 2E65 A; 1KFZ A; 3OYJ A; 2YUQ A; 1YJ9 Q; 4O6J A; 4AG1 C; 3MKD A; 2LCL A; 3L2R A; 1VQM A; 3JB9 J; 1C1A A; 4XTZ A; 5CQY A; 2L2P A; 1Q81 R; 4KUD K; 1VYU A; 3ASK A; 1OU8 A; 2QXF A; 4FSX A; 4MZP A; 5DLQ E; 3NTK A; 3QBY A; 3OYH A; 1SF9 A; 1W4S A; 2OI3 A; 4RG8 A; 2M9U A; 2JT4 A; 4WF2 A; 4UC4 A; 1KQS P; 1H3H A; 2YWW A; 1RAI B; 2EJF A; 5LJ3 f; 4C92 B; 2KGT A; 2QEX A; 5DY9 A; 4F7U E; 4BI8 B; 1YJW A; 2DPP B; 4OMQ A; 4M7D E; 2D0N A; 3LH5 A; 3VKI A; 1QKX A; 5IN1 A; 1G8X A; 2HNI A; 3BDU A; 1M90 R; 2LC4 A; 2FG0 A; 2PUK B; 2PNI A; 1CKA A; 4F7U G; 4M7D G; 3HP9 A; 1HXD A; 3PMT A; 2E70 A; 2HAX A; 2DMO A; 2RPN A; 3CC4 A; 1YNZ A; 2JN0 A; 5GAM f; 3P8H A; 4F7U F; 4RMO A; 4M7D F; 2YUN A; 1OYX A; 3HRU A; 2W10 A; 3RER A; 2KT8 A; 3OBY A; 1X2Q A; 4YTL A; 2LRQ A; 4WTO B; 1YBY A; 1H3Z A; 3O5Z A; 2K2M A; 5CKB A; 2FRY A; 4KGZ B; 4ZTJ A; 2RK1 A; 4ANJ A; 4LN2 A; 2K5I A; 1M30 A; 1Q86 R; 2GBQ A; 1VQK A; 1BI2 A; 2DYB A; 4ESR A; 1Y96 B; 3T9N A; 1M4Z A; 2ED1 A; 2FRW A; 2JOY A; 1BI1 A; 4Y92 A; 5FWC A; 3SD4 A; 3I56 A; 2CZ7 B; 2DK3 A; 1YHQ T; 2CSQ A; 1QP2 A; 2C0T A; 1KJW A; 4J7F A; 4ZTF A; 2EFI A; 2HL3 A; 3ZEH A; 1WA7 A; 2RHU A; 1UGR B; 1YHQ Q; 2E64 A; 4MDX A; 1YWP A; 4ELY C; 1ZLM A; 2HEQ A; 1M27 C; 2CGH A; 4CC3 A; 4AMC A; 4CRI A; 1Q7Y C; 2LQ8 A; 1YI2 A; 4C5H A; 4IKF A; 1OI1 A; 2K79 A; 1FMW A; 4J6X A; 1OZ2 A; 2ZPB B; 1VQ9 T; 5IHK A; 2DXC A; 1SSF A; 2E41 A; 3QYG B; 5GAN 8; 1QCF A; 5D7U A; 2XDD A; 3MEV A; 2MI6 A; 2BKD N; 2YHT A; 1PNJ A; 4A54 A; 3EG1 A; 5LJ5 h; 2KE9 A; 2D0Q B; 2FPF A; 4KGV B; 1QMC A; 2COY A; 4IUP A; 1UEB A; 2ESW A; 3C0C A; 3R6O A; 4DQ2 A; 3G6E T; 2EVR A; 1M8M A; 1D0Z A; 3OS0 A; 1BCO A; 1OV3 A; 4LE9 A; 1M1K C; 1S72 Q; 2EGC A; 4FW2 A; 3CCS Q; 5DM7 R; 1BI0 A; 3ER0 A; 2X4W A; 3GNF B; 2QQS A; 2VGM A; 1X75 C; 4J9E A; 1OPK A; 2GCX A; 4FYX B; 4X9C A; 3OYB A; 2LTO A; 4RTZ A; 3EG0 A; 3V8J A; 4RTX A; 1KD1 C; 2CUB A; 5A2Q E; 4E7Z A; 2MWP A; 1QVF P; 4TVR A; 3MPU B; 2LNH B; 2WSF E; 4R55 A; 1NPP A; 1TS9 A; 1MMD A; 2P0K A; 2QEX T; 3LWI A; 3U23 A; 3OYG A; 3MCA B; 4E7J A; 2EIF A; 2E5K A; 3BDL A; 3CCV T; 3CEY A; 1AT1 B; 2YRD A; 2YRC A; 1LNX A; 3NMZ C; 3HKS A; 2AHJ B; 5GAN 3; 1VQ7 A; 2ECZ A; 2QEX Q; 2YRV A; 1RAE B; 1YJW Q; 4M77 B; 1MUZ A; 1ZHI A; 2EYZ A; 2CKK A; 4EMG A; 3LH0 A; 2XKO C; 2AIR B; 3EFS A; 2EYW A; 3QKJ A; 3NFC A; 1QLY A; 3CCM A; 2QGF B; 2X9H A; 4OVA A; 4KH0 B; 3FLG A; 1G5V A; 3OYF A; 2R5A A; 1U5S A; 1XNI A; 5A0L A; 1U1T A; 2GQV A; 2H3J A; 1Z9Q A; 1I1J A; 4C0G A; 1G3Y A; 1VQO A; 3J81 E; 4FYV B; 4NOY A; 4QQG A; 5LJ5 f; 2MWO A; 5KYY B; 3X28 B; 1AHJ B; 2DNU A; 2KY9 A; 3A8G B; 4FL6 A; 3V7S A; 3CXC A; 1AZE A; 3OYA A; 1G3W A; 4QVC A; 4C92 D; 4A63 B; 3PMI A; 5LJ3 g; 2A3L A; 1AVZ C; 4OMF B; 1VQK Q; 3H9N A; 2M0Y A; 3EGU A; 1W6X A; 2W0Z A; 2JVV A; 2JW4 A; 1O75 A; 1QW1 A; 4HT9 A; 3A8O B; 3V8K A; 1H92 A; 2HQE A; 3ZFJ A; 1AWX A; 3I55 A; 3CCU T; 1D3B A; 4J9H A; 2DLP A; 1PD1 A; 2EKH A; 1VQ8 T; 1MNE A; 2QA4 A; 2AKK A; 2WSC E; 2VVK A; 4XU2 A; 1VQP A; 3CCU Q; 1D1A A; 4C92 A; 3OY9 A; 1WI7 A; 4XTV A; 2D8J A; 1VQ8 Q; 1YI2 Q; 1HJD A; 2L3S A; 3QUI A; 2QAS A; 5GAM e; 4BE1 A; 2RQT A; 3CCJ A; 3LW5 E; 3CBP A; 1KQ1 A; 2HMA A; 1RI9 A; 4L59 A; 2SRC A; 4IUQ A; 5I22 A; 3RIR A; 4QQD A; 4ZN3 A; 3OW2 S; 3SWN B; 2EJ9 A; 4KUL A; 1BK2 A; 2ROT A; 2CH4 W; 2OJ2 A; 2HCK A; 3L42 A; 4NL3 A; 1T3L A; 2O31 A; 2SEM A; 3C4S A; 4B9W A; 5IHI A; 3CD6 T; 4IUU A; 4JLI A; 1KG1 A; 2ED0 A; 3OYY A; 2D1X A; 2JMA A; 4BUG A; 4AFU C; 4F7U A; 3CD6 Q; 2CP5 A; 4EMK B; 4M7D A; 1Y96 A; 1SG5 A; 2Z0W A; 2OTL T; 1R8O B; 3KFV A; 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1PSE A; 2EQU A; 2AZV A; 2QGG A; 3CCJ Q; 1VUB A; 2J6K A; 4BI4 A; 2RI5 A; 4E7K A; 1I5L A; 3GF5 A; 1AWO A; 3A5Z B; 1GFC A; 3RMQ A; 3SEM A; 4JJD A; 3PIP A; 2V1R A; 2FO0 A; 1PD0 A; 2BZX A; 3E9G A; 1I07 A; 3OYD A; 2J6O A; 2CP7 A; 2DL7 A; 1QKW A; 4RCB A; 5KYY A; 2RQR A; 5GAO m; 2DEQ A; 5CKD A; 1K73 R; 1SEM A; 4PJL A; 3CC7 T; 4OMM A; 4C92 C; 3V8L A; 5CKH A; 2RK2 A; 3A8H B; 1N5Z A; 3EGX A; 2DFU A; 2QQ9 A; 2MAM A; 1JB0 E; 3CC7 Q; 1JEG A; 5FRM A; 4ZN1 A; 5ECA A; 5KE3 A; 4DOV A; 5M9O A; 1IRE B; 3JCM b; 3QII A; 4OB2 B; 1PCX A; 4JDS A; 3EFO B; 5HK0 A; 3GNG A; 4AFQ C; 2YLB A; 1U3O A; 1SRM A; 4GBQ A; 2Y4X A; 2ZGW A; 1N8R R; 1SHF A; 1U06 A; 1K8A C; 2MK5 A; 5GAM h; 2X35 A; 2DET A; 4XU3 A; 1PKT A; 1N6A A; 4QT7 A; 3VS2 A; 3OYE A; 5GAO q; 4C92 E; 5IHN A; 3A8M B; 2GF7 A; 2K5L A; 2K4Y A; 3OSV A; 5L8R E; 6AT1 B; 2KEA A; 2JS2 A; 3TVT A; 2YUP A; 2WAC A; 1B3Q A; 4LUD A; 1A0N B; 1X43 A; 2J05 A; 2D6F A; 4C92 G; 4LNP A; 2PU9 B; 1ZQ1 A; 4E7L A; 3RUX A; 1R0B G; 2JTM A; 4WCI A; 4V2S A; 3SWN A; 1NJI U; 2K3X A; 3LGL A; 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