The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
GIDPFTGEAIAKFNFNGDTQVEMSFRKGERITLLRQVDENWYEGRIPGTSRQGIFPITYVDVIKRPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
Ponsin
|
| publication title |
Second SH3 domain of ponsin solved from powder diffraction
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
13
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| structure length |
67
|
| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-11-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GQI A; 4IIO A; 1PHT A; 1G2B A; 2JM8 A; 2JTE A; 2O31 A; 1PWT A; 2KT1 A; 4GLM A; 1NM7 A; 3RBB B; 5FW9 A; 1RI9 A; 1CKA A; 4AG1 C; 2RQT A; 3VRY A; 4Z89 A; 1UHC A; 3I5S A; 1YCS B; 1ZUU A; 1ZLM A; 1X2K A; 2YDL A; 2P4R A; 2FPE A; 1GFC A; 1I07 A; 2CT4 A; 2RQR A; 2J7I A; 2F2X A; 1UE9 A; 2L3Q A; 3PE0 A; 3TVT A; 4QT7 A; 1BB9 A; 1NEG A; 1TUD A; 1E7O A; 1SHG A; 1T3L A; 4AG2 C; 2DIL A; 4AFZ C; 2H8H A; 2MIO A; 3PVL A; 1ABO A; 3VS4 A; 1RLP C; 3NPF A; 1FMK A; 2EQI A; 2BZY A; 2ESW A; 1K0X A; 2L3P A; 3TSZ A; 1K1Z A; 2K7A A; 2YUN A; 1W6X A; 2AK5 A; 4AFU C; 2O2O A; 3SHW A; 2L2P A; 2IIM A; 2CDT A; 3THK A; 1B3Q A; 2KE9 A; 4J9C A; 1M8M A; 2CUB A; 1UDL A; 2YT6 A; 1A0N B; 2B86 A; 2JM9 A; 1UHF A; 2A37 A; 3GBQ A; 1MUZ A; 1CSK A; 1HD3 A; 1JXM A; 2LCS A; 1T3S A; 3NMZ C; 2I0N A; 2KBT A; 1SPK A; 4OML A; 4RTU A; 2CRE A; 4JZ3 A; 5GJW B; 2BTT A; 1PKS A; 1JQQ A; 3I35 A; 1ZSG A; 2KYB A; 1ZUK A; 3EG3 A; 2EYX A; 4D8K A; 1CKB A; 3UA7 A; 2RN8 A; 2X3X D; 1J3T A; 3ZL7 C; 3H0H A; 4OMP A; 1SRM A; 1SSH A; 2DRK A; 2X3W D; 1AD5 A; 3EHR A; 1Z9Z A; 2LJ1 A; 2LJ0 A; 2RQV A; 5IHI A; 2J6K A; 2GTO A; 3EGU A; 1GL5 A; 2NUZ A; 3U23 A; 3VS1 A; 2DL3 A; 2RQW A; 1WI7 A; 1M30 A; 5GJV B; 1OPL A; 2AKK A; 2YSQ A; 1AWW A; 2BZX A; 3VS2 A; 4Y92 A; 4CC3 A; 1NYF A; 5IHK A; 1JXO A; 2DL4 A; 3M0P A; 3A98 A; 1GFD A; 3SEM A; 3IQL A; 2K9G A; 1LCK A; 2EGE A; 5L23 A; 2FO0 A; 4JJB A; 5IHN A; 2O9S A; 2DM1 A; 2KXD A; 3UF4 A; 4CC7 A; 2ECZ A; 2LMJ A; 1AWO A; 2PTK A; 1N5Z A; 1JEG A; 3REA B; 2DJQ A; 1E6H A; 4LUE A; 1WA7 A; 1WIE A; 1E6G A; 1UEC A; 1IO6 A; 2JXB A; 1VA7 A; 4J9D A; 4AFS C; 2JW4 A; 1PRM C; 2AZV A; 2V1R A; 2CSI A; 4R0K A; 2OAW A; 2SEM A; 4JZ4 A; 2M51 A; 4OMQ A; 3RNJ A; 1WXB A; 2ENM A; 1M3C A; 1FYN A; 1H3H A; 1WDX A; 2CSQ A; 2EKH A; 1M3A A; 3R6N A; 2HCK A; 2RMO A; 2RPN A; 1WLP B; 1UFF A; 1K76 A; 1YWP A; 2E5K A; 4JPB W; 2LQW A; 3M0R A; 1NLP C; 2C0I A; 4D8D A; 1W1F A; 5I22 A; 2DVJ A; 1BK2 A; 3REB B; 3VS5 A; 1JO8 A; 4RTZ A; 1YN8 A; 3JV3 A; 2DLP A; 4F14 A; 2DBM A; 2FRY A; 2V1Q A; 3QWX X; 1UJ0 A; 3QWY A; 1KFZ A; 1I1J A; 2L0A A; 1U5S A; 2DF6 A; 2J6F A; 5FWC A; 3O5Z A; 1WXT A; 2JMC A; 2QDL A; 2HSP A; 4KRT A; 1VYV A; 1QWF A; 3FJ5 A; 2JS0 A; 1RUW A; 1GRI A; 3VRZ A; 2EW3 A; 2KGT A; 1B07 A; 1K9A A; 4IIM A; 4LUD A; 4OMM A; 4RTX A; 2LJ3 A; 2W0Z A; 1WXU A; 2DE0 X; 2KNB B; 2OI3 A; 2AKL A; 1UGV A; 1W70 A; 1GBR A; 1T0H A; 2OJ2 A; 1K0S A; 3EG2 A; 3VS3 A; 1WFW A; 2RF0 A; 2ED1 A; 2KR3 A; 1AEY A; 2KRS A; 2RQU A; 3UAT A; 2KEA A; 3H0F A; 2EPD A; 4HXJ A; 4F17 A; 1T0J A; 3VS0 A; 2K6D A; 1TG0 A; 2D1X A; 4RTT A; 2J05 A; 2G6F X; 2NWM A; 2AZS A; 2A08 A; 1KSW A; 4ESR A; 2CH4 A; 4J9G A; 2DBK A; 1XOV A; 3I9Q A; 3H41 A; 1H8K A; 2DYB A; 1M27 C; 3VS6 A; 1MV0 B; 1HJD A; 1K4U S; 4JJD A; 4RUG A; 2J06 A; 1OOT A; 1YNZ A; 2DRM A; 2YUO A; 1PRL C; 2XMF A; 2JMA A; 2LZ6 B; 1ZX6 A; 1ZBJ A; 2EGA A; 1TUC A; 4LN2 A; 3H0I A; 4GBQ A; 4LE9 A; 1AWJ A; 2GNC A; 1MV3 A; 1JU5 C; 2O88 A; 4M4Z A; 2GGR A; 2LX7 A; 2W10 A; 4CC4 B; 4WCI A; 2KT8 A; 2RNA A; 4RTV A; 1AOJ A; 2HEQ A; 3M0U A; 2YUQ A; 2KRM A; 4J9F A; 4Z88 A; 2FPD A; 4DEX A; 3KFV A; 1ARK A; 2O9V A; 2JT4 A; 4HCK A; 3EG1 A; 1OV3 A; 2ROL A; 3NHN A; 2KYM A; 1X27 A; 1OPK A; 2DL5 A; 1GCQ C; 2KXC A; 2EYZ A; 2YUP A; 1GCQ A; 1NG2 A; 2FEI A; 3ULR B; 2M0Y A; 2ED0 A; 2FPF A; 1EFN A; 2K79 A; 2FRW A; 4JJC A; 4A63 B; 1VYU A; 1HSQ A; 2CT3 A; 2CH4 W; 2K3B A; 2D8J A; 2LQN A; 1X69 A; 2A36 A; 1ABQ A; 2EYY A; 1X2Q A; 2DX1 A; 2FG0 A; 3LH5 A; 1PNJ A; 1U06 A; 1S1N A; 1SRL A; 1GCP A; 4E6R A; 1NYG A; 1I0C A; 3M0Q A; 2HBW A; 2ROT A; 3EG0 A; 1AZG B; 1UG1 A; 1UUE A; 4FSS A; 1YP5 A; 4EIK A; 1SEM A; 1ZUY A; 4ORZ A; 2BZ8 A; 2VVK A; 1U3O A; 4HVW A; 5IXF A; 2LNH B; 1BBZ A; 1KJW A; 4J9E A; 3I5R A; 5FWB A; 1X6B A; 4X1V A; 2SRC A; 1PKT A; 2EVR A; 1H92 A; 1RLQ C; 3EHQ A; 1GBQ A; 2MOX A; 2CUD A; 4J9I A; 1Y0M A; 1Z9Q A; 4K11 A; 1QKX A; 1NLO C; 5EC7 A; 1V1C A; 3NGP A; 4J9H A; 5IXB A; 1KIK A; 2A28 A; 1UTI A; 2GBQ A; 1QLY A; 3TSW A; 4OMN A; 4RTY A; 2ABL A; 2EYW A; 4AFQ C; 1YWO A; 4HVU A; 1WX6 A; 2VKN A; 4OMO A; 3CQT A; 2D0N A; 2F2V A; 1OEB A; 1AVZ C; 1NEB A; 4DEY A; 3C0C A; 1UJY A; 4RTW A; 1AZE A; 2C0T A; 4ZNX A; 1WYX A; 3VS7 A; 2HDA A; 3UA6 A; 2VWF A; 5ECA A; 1SHF A; 2KRN A; 4LNP A; 2J6O A; 2PNI A; 4J9B A; 2DNU A; 1Y57 A; 1M3B A; 1QCF A; 1X6G A; 5IH2 A; 2MCN A; 2DL7 A; 2K2M A; 2EBP A; 4Z8A A; 3M0T A; 3M0S A; 2F2W A; 1QWE A; 2DA9 A; 2PZ1 A; 1X43 A; 4F16 A; 2KRO A; 1G83 A; 5HCK A; 2JS2 A; 1QKW A; 4HVV A; 2D8H A; 1BU1 A; 4CC2 A; 2DL8 A; 2GTJ A; 1VYT A; 2EGC A; 1AWX A; 2LP5 A; 3PVQ A; 2L3S A; 5I11 A; 2DMO A; 2C0O A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5HY6 A; 3QHS A; 4PJO B; 2MWO A; 1KG1 A; 5M9O A; 2QK0 A; 1PWT A; 1TH7 A; 3CMA T; 1NE8 A; 1RI9 A; 3CCV A; 4AG1 C; 3VRY A; 4HT8 A; 1MND A; 2DKG A; 2OTL Q; 4KH1 B; 1DJ7 B; 1ZLM A; 2NUP A; 1X2K A; 4BDY A; 4P5N A; 2PVD B; 2P4R A; 4M75 F; 4M78 A; 2E3H A; 4C8Q A; 4RG8 A; 2FPE A; 5FU6 B; 1I07 A; 2CT4 A; 2J7I A; 1HXD A; 1WJQ A; 2XG8 D; 2L3Q A; 3P8H A; 3JCM Q; 2RH2 A; 3PE0 A; 3JCM d; 4F7U F; 1BB9 A; 3NTK A; 2XU8 A; 5DLO A; 1NEG A; 1E7O A; 8AT1 B; 4AFZ C; 3OYD A; 1N27 A; 4D6W A; 3PVL A; 1N8R R; 2DIG A; 2DIQ A; 1YHQ Q; 2RHZ A; 1YJW T; 3CCR A; 4M77 C; 3RKW A; 2BZY A; 3V7S A; 1UB4 A; 1K1Z A; 4M75 E; 2K7A A; 1TU0 B; 2YUN A; 2F1L A; 4X34 A; 4J6Y A; 3GNF B; 1W6X A; 1M4Z A; 4C0G A; 3HTR A; 1FMV A; 4PJO G; 2R58 A; 1VQL T; 1B3Q A; 4JLG A; 3JCM X; 5D7U A; 4PJM A; 1UHF A; 1B7T A; 1MUZ A; 2Z0W A; 3WVE B; 3OYL A; 7AT1 B; 4XU1 A; 2K4Y A; 4J7I A; 5GJW B; 2BTT A; 3SDZ A; 5LJ5 e; 3CCJ T; 1KK7 A; 1XQH A; 1D0Z A; 3CCL T; 1OZ2 A; 1VQK Q; 2E12 A; 1M9S A; 4FSX A; 1CKB A; 2QI2 A; 2X3X D; 3PMI A; 2JTF A; 1V76 A; 5GAO l; 1U1S A; 2BKD N; 4OMP A; 5IAY A; 1SSH A; 1D3B B; 2QQS A; 2FZK B; 1H3Z A; 2DTO A; 3A8M B; 2E5Q A; 2RQV A; 2P0Q A; 3CCQ A; 3EGU A; 1GL5 A; 6AT1 B; 4KH0 B; 4PJJ A; 2DZ9 A; 2DL3 A; 3TCJ A; 1M1F A; 1M30 A; 5CQX A; 1OPL A; 5A2Q E; 3QJY A; 5CQY A; 4M77 B; 3CD6 Q; 4RG2 A; 4Y92 A; 3MHX A; 2WSF E; 3QYH B; 3EG9 A; 2K9G A; 2KQW A; 5L23 A; 2DYI A; 3ME9 A; 1PCX A; 2KXD A; 3SD4 A; 4KGV B; 1S72 A; 4C0F A; 5LJ5 f; 3CC2 A; 4LUE A; 3BY7 A; 1WA7 A; 3QO3 A; 1QVF P; 1E6G A; 1UEC A; 4CRI A; 2IVW A; 2JXB A; 3LLR A; 1C6V X; 4J9D A; 4AFS C; 2EQM A; 2JW4 A; 5FU7 C; 3TRE A; 3J80 E; 3C12 A; 4L59 A; 1Q82 R; 2WAC A; 4R0K A; 2EWN A; 3H6Z A; 3JCM W; 1M3C A; 1OX9 A; 1M3A A; 3EH2 A; 2RMO A; 3G71 Q; 5KCH A; 1WLP B; 1LPL A; 1M90 U; 4J8O A; 1UFF A; 1K76 A; 4M77 G; 1K8A U; 5GAN 4; 2O4X B; 1KC8 R; 2DVJ A; 1BI0 A; 1M2V B; 1XJW B; 2L8D A; 3CC2 T; 5CKH A; 5CCA A; 3SWN C; 2FRY A; 2V1Q A; 3HSB A; 3QWX X; 4MMK A; 2CZ7 B; 2KK4 A; 3QWY A; 2X4Y A; 2E4H A; 2K5I A; 2R5A A; 1WQW A; 5I2M A; 2QQB A; 5FWC A; 1WXT A; 4KRT A; 5GAN j; 1QVG A; 3DLM A; 2JS0 A; 3JSC A; 3OBW A; 2QEX T; 3GNG A; 5KYN A; 2EW3 A; 2QYZ A; 1RAC B; 4E7S A; 1B07 A; 5J3B A; 3G4S T; 4OB2 B; 2KNB B; 5FU7 B; 3HRT A; 2CP6 A; 4C92 C; 2OJ2 A; 4N4H A; 3OA6 A; 1WFW A; 2ED1 A; 1AEY A; 2RQU A; 3L2V A; 2KEA A; 2EPD A; 4F17 A; 3CBO A; 2HQX A; 1BYM A; 2K6D A; 1TG0 A; 2J05 A; 2RJD A; 3OYE A; 1SSF A; 3MEW A; 4J9G A; 2DVE A; 3A8G B; 1YIT A; 1M27 C; 1HJD A; 4RUG A; 2QGG A; 2YUO A; 1RAB B; 4HT9 A; 3SWN B; 3JRZ A; 2HD0 A; 1ZX6 A; 3GF5 A; 4BI4 A; 2HKQ B; 4LE9 A; 1VUB A; 1VQM Q; 3OYF A; 4YTL A; 2GNC A; 1MV3 A; 1Q7Y C; 4MZP A; 5KYY A; 3QG1 A; 3EGD B; 4M7D E; 4ATO A; 2KT8 A; 3WXM B; 1AOJ A; 1VQ6 T; 3EGX A; 1VIF A; 3QYG B; 2M1H A; 3KFV A; 1OX8 A; 4LD9 K; 1YIT T; 4VUB A; 4IUP A; 5CAI A; 2VV5 A; 1OV3 A; 2KYM A; 4C92 B; 1GCQ C; 5I2S A; 2FEI A; 1UEB A; 3ULR B; 2M0Y A; 2ED0 A; 5KYU A; 2K57 A; 1QQJ A; 4PJL A; 3H9N A; 2COZ A; 2LQN A; 4BAC A; 1ABQ A; 2FG0 A; 1U06 A; 1Y96 A; 1VQN T; 1NZ9 A; 5CKF A; 1I8F A; 4E6R A; 3OW2 P; 1NYG A; 3EFO A; 5DM7 R; 1PSE A; 3DLL A; 4M75 B; 1UUE A; 2EJG A; 2NLU A; 3OYJ A; 1IGU A; 1D1B A; 2DTI A; 4NL2 A; 1U3O A; 2EFI A; 4M7D A; 4F7U B; 5IXF A; 2LNH B; 3MJX A; 3TQ7 P; 1XTD A; 2HMA A; 3QKJ A; 3BDU A; 3M55 A; 3MP1 A; 2CS7 A; 4C92 G; 2V26 A; 2XIC A; 2E64 A; 1N8R C; 1V1C A; 3A1P A; 4J9H A; 4ELZ C; 4B6M A; 4A4E A; 1OYX A; 1VQ4 Q; 2EJF A; 3TSW A; 2A3L A; 3MO8 A; 3G1J A; 4AMC A; 3HFN A; 4RTY A; 2ABL A; 3QSU A; 1YWO A; 1WX6 A; 2D0N A; 5IT9 E; 4DEY A; 1UJY A; 4JRQ A; 1TXQ A; 1WZO A; 3VJP A; 4ZGD B; 3VU3 C; 2MI6 A; 4LDW A; 1SHF A; 3CXC A; 2J6O A; 4OB3 B; 4RMO A; 5HK0 A; 4F7U G; 1Y57 A; 1M3B A; 1QCF A; 2DET A; 1OQK A; 4NS5 A; 2DL7 A; 2K2M A; 2EBP A; 3BE3 A; 4M75 D; 5LJ5 d; 3M0T A; 5CKD A; 2RJF A; 2OTJ Q; 1QWE A; 1BI3 A; 3E9F A; 3A8L B; 2WSC E; 5HCK A; 4HVV A; 4XTY A; 1LVK A; 9ATC B; 5CVI A; 1VYT A; 3CC4 Q; 4E7K A; 2XDP A; 1VQ8 Q; 1RAH B; 2L3S A; 2DZC A; 1QCN A; 2QA4 A; 4FYY B; 1ZA1 B; 3VYG A; 1PHT A; 2JTE A; 2VUB A; 1CKA A; 2RQT A; 3CPW S; 1JJ2 A; 4C5G A; 3E1S A; 3I55 T; 3PFS A; 4ZTF A; 3JAM E; 2RJC A; 3CCU Q; 4CI0 C; 1D3B A; 4OB1 B; 3TVT A; 1UGR B; 3CC7 T; 1TUD A; 3UWN A; 2BE7 D; 2LQ8 A; 2MIO A; 1RLP C; 2FVU A; 3NPF A; 4BY6 B; 4FW2 A; 3SB2 A; 1K0X A; 4M77 A; 2JJ9 A; 3LGF A; 3MP8 A; 3TSZ A; 2MMP A; 2K3X A; 4M7A E; 3M53 A; 2QA4 T; 1QVG P; 4LDX A; 4AFU C; 5GAN 5; 2RD1 A; 1BCO A; 3SHW A; 2L2P A; 5GAN e; 2IIM A; 2CDT A; 3THK A; 2CP0 A; 4EMH A; 5GAN 8; 4M78 F; 4C8Q F; 1VQP Q; 2B86 A; 5FRN A; 2A37 A; 3GBQ A; 1N9S A; 4PKC C; 2IPO B; 1HD3 A; 2OTL A; 3S3N A; 4LDU A; 3NMZ C; 2KI7 A; 2M9U A; 4Q5W A; 1R77 A; 2V8J A; 1PKS A; 1Q86 U; 1Q7Y R; 1KC8 C; 4II1 A; 4EMG A; 1ZSG A; 3QII A; 3FJP A; 2RJE A; 3EG3 A; 4D8K A; 2LDM A; 4M78 E; 4C8Q E; 3ZL7 C; 2XDD A; 4BE1 A; 3H0H A; 3J7A F; 3MCA B; 5KE3 A; 2O4X A; 4DBQ A; 1Z9Z A; 4M7A A; 1Q81 C; 1M2V A; 1B34 B; 2J6K A; 4XU2 A; 5LJ3 j; 2Y4Y A; 1JBM A; 2GTO A; 1O9S A; 3U23 A; 5GAN f; 3VS1 A; 3JB9 I; 3LH0 A; 2DXU A; 1VQO Q; 5GAM e; 5LJ5 h; 1NYF A; 3CCE Q; 1JXO A; 2OX7 A; 5GMK l; 2OTL T; 4OGE A; 4KBM B; 2P0P A; 1IB8 A; 2RHY A; 2EGE A; 2MAM A; 2XKO C; 2YHT A; 4JJB A; 5KYX A; 3AHU A; 2E3I A; 3UF4 A; 5IN1 A; 4CC7 A; 4DBR A; 3G6E Q; 4ANJ A; 1AWO A; 1VQ5 Q; 1N5Z A; 3REA B; 2VGM A; 1TTH B; 5GAO m; 1WIE A; 1VQL A; 2KAF A; 1G3W A; 3EH1 A; 1YHQ T; 5GMK i; 2SEM A; 3CPF A; 4JZ4 A; 3CCS Q; 2VB6 A; 2M51 A; 4OMQ A; 3E9G A; 3FRN A; 3PTA A; 4QW2 A; 1WXB A; 2H3E B; 4HCZ A; 2ENM A; 4OF1 A; 1H3H A; 1WDX A; 2CSQ A; 2LCL A; 3CCJ A; 3FEO A; 4LXC A; 3RER A; 3CCL A; 5GAN 3; 1D0Y A; 5GAM f; 3WVD B; 4PFZ A; 2E5K A; 1IHW A; 1ZA2 B; 2C0I A; 4D8D A; 1EX4 A; 3DKM A; 1D09 B; 1SKU B; 4RTZ A; 3CD6 A; 1YN8 A; 2DBM A; 3OYK A; 3SWN A; 1ZHI A; 1N6A A; 1I1J A; 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