The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
b'GIDPFTGEAIAKFNFNGDTQVEMSFRKGERITLLRQVDENWYEGRIPGTSRQGIFPITYVDVIKRPL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Second SH3 domain of ponsin solved from powder diffraction
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Ponsin
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
13
|
| structure length |
67
|
| sequence length |
67
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-11-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2FPE A; 2ROL A; 2M51 A; 1AWO A; 1PKT A; 4GLM A; 2HSP A; 5L23 A; 3M0U A; 2DBM A; 1AOJ A; 2KXD A; 4R0K A; 2B86 A; 1ZUU A; 1SRL A; 2LNH B; 1JEG A; 1PKS A; 3UF4 A; 3EGU A; 1TUD A; 2RN8 A; 2J7I A; 1GCQ A; 2L0A A; 3VRY A; 2F2X A; 5IXF A; 1PRL C; 2ENM A; 2W0Z A; 3VS6 A; 2RQU A; 3I5R A; 3FJ5 A; 1KFZ A; 1MV3 A; 1U5S A; 1ABO A; 2GGR A; 4JJC A; 1JXO A; 2HBW A; 3VS1 A; 3UA7 A; 1JQQ A; 1SPK A; 2MIO A; 4J9B A; 2C0O A; 2BZ8 A; 4Y92 A; 2LZ6 B; 2ED0 A; 3PVL A; 2LQW A; 1FYN A; 2J05 A; 1RI9 A; 1M27 C; 4Z89 A; 2ED1 A; 1WI7 A; 1BU1 A; 3NMZ C; 4J9I A; 3A98 A; 1K76 A; 1YP5 A; 1PHT A; 1H3H A; 1G83 A; 4AFS C; 1WXB A; 2OAW A; 1ZBJ A; 2JMA A; 2KXC A; 1UDL A; 2EGA A; 2MOX A; 2P4R A; 3REB B; 1YN8 A; 1AVZ C; 2GNC A; 5IXB A; 2F2V A; 3M0T A; 5HCK A; 1UUE A; 2D8H A; 1YWO A; 2RQR A; 3M0S A; 2O2O A; 1QWE A; 2EYX A; 2LX7 A; 1OV3 A; 2DF6 A; 2KYB A; 2FPD A; 1KJW A; 1IO6 A; 4F14 A; 1SHF A; 2FO0 A; 2AZV A; 1ABQ A; 1E6G A; 2D1X A; 1M3C A; 5FW9 A; 3VS5 A; 4D8D A; 3VS4 A; 3LH5 A; 1BK2 A; 2YT6 A; 2RMO A; 2PTK A; 1U06 A; 4CC4 B; 3O5Z A; 1RLQ C; 1HSQ A; 2DVJ A; 1Z9Z A; 3PVQ A; 3TSZ A; 2X3W D; 3IQL A; 1X69 A; 2JXB A; 3VS0 A; 5I11 A; 2DRK A; 3TVT A; 1SEM A; 1N5Z A; 2EPD A; 3KFV A; 3U23 A; 2O9V A; 1WLP B; 2DM1 A; 2ECZ A; 1JXM A; 1NYF A; 3M0P A; 3QWX X; 2BTT A; 2RQV A; 2HEQ A; 4WCI A; 1G2B A; 2X3X D; 1OPK A; 4J9G A; 3VS7 A; 3NHN A; 4KRT A; 2RNA A; 2J6K A; 1WYX A; 2DIL A; 2EQI A; 1TG0 A; 3H0I A; 5ECA A; 4RTU A; 4CC3 A; 1GCP A; 3I35 A; 2DL5 A; 2YUQ A; 1OPL A; 2CT3 A; 2YUO A; 2CUD A; 4IIO A; 1XOV A; 3R6N A; 4OMN A; 2YUN A; 4J9H A; 1BBZ A; 1KSW A; 2J6F A; 2O9S A; 4FSS A; 2ESW A; 2JW4 A; 2VKN A; 1M30 A; 4AFZ C; 1GRI A; 4D8K A; 2RPN A; 4AG1 C; 2L2P A; 4J9C A; 4HVU A; 1ZSG A; 4RTV A; 1VYU A; 1LCK A; 2LMJ A; 3THK A; 3VS3 A; 1VA7 A; 4CC2 A; 1J3T A; 2K9G A; 3ZL7 C; 1V1C A; 1B3Q A; 2ABL A; 1AWW A; 3C0C A; 4A63 B; 1RUW A; 2GTJ A; 3H41 A; 2EYW A; 2ROT A; 1W70 A; 3I9Q A; 4HVW A; 1X6G A; 1UE9 A; 2IIM A; 1GBR A; 1X27 A; 2KRM A; 2EYZ A; 1QKW A; 4DEX A; 1M3B A; 2DRM A; 2KT1 A; 2KE9 A; 3REA B; 1UJ0 A; 4LE9 A; 2PNI A; 1TUC A; 4RTX A; 2KYM A; 4HCK A; 4EIK A; 4AFQ C; 1VYT A; 2A08 A; 1S1N A; 1QCF A; 1SHG A; 3H0H A; 1WX6 A; 4RTY A; 4J9D A; 1YNZ A; 4OML A; 3VS2 A; 1K0S A; 4OMM A; 1SSH A; 2DMO A; 2JM8 A; 2SRC A; 1Y0M A; 2JMC A; 4F16 A; 2FRW A; 2H8H A; 1YCS B; 2JTE A; 2SEM A; 2DX1 A; 2VWF A; 1UFF A; 2AZS A; 2KBT A; 2LP5 A; 2NWM A; 3H0F A; 1UEC A; 2EGE A; 4OMQ A; 4ORZ A; 1GL5 A; 1I0C A; 1MUZ A; 1K0X A; 2K6D A; 3RBB B; 2CSI A; 2JS0 A; 2AKL A; 1WDX A; 2RQW A; 4M4Z A; 2DA9 A; 2K2M A; 2KT8 A; 3VRZ A; 3CQT A; 2M0Y A; 1VYV A; 2L3S A; 4JJD A; 4Z8A A; 4JZ4 A; 2PZ1 A; 1MV0 B; 1NEB A; 1T0H A; 1CSK A; 1ZLM A; 2CT4 A; 1ZUY A; 2NUZ A; 2RQT A; 2YUP A; 2KR3 A; 3RNJ A; 4OMP A; 2DJQ A; 1NLP C; 2GBQ A; 1K9A A; 4AG2 C; 1SRM A; 2OI3 A; 5IH2 A; 1WFW A; 1K1Z A; 1E7O A; 1T0J A; 1UTI A; 1U3O A; 2G6F X; 1NYG A; 2EYY A; 4RTW A; 1CKB A; 2K79 A; 2KEA A; 3SEM A; 3I5S A; 4X1V A; 2RF0 A; 1A0N B; 2CUB A; 4HVV A; 4HXJ A; 1QKX A; 2CDT A; 1ZX6 A; 2D8J A; 1AZG B; 4Z88 A; 1JU5 C; 2E5K A; 2EW3 A; 3M0Q A; 1AZE A; 2DL4 A; 1QLY A; 2CH4 A; 2GTO A; 2BZX A; 3ULR B; 2KRO A; 4JZ3 A; 3EG2 A; 1FMK A; 4RTZ A; 5IHK A; 2I0N A; 1T3L A; 2XMF A; 2V1Q A; 2DBK A; 3GBQ A; 3UA6 A; 3EHR A; 2D0N A; 1WXU A; 2JS2 A; 1AEY A; 2KNB B; 3NGP A; 1CKA A; 1GBQ A; 1NLO C; 3UAT A; 1UHF A; 1HD3 A; 4AFU C; 4JJB A; 4OMO A; 2K7A A; 5FWB A; 3NPF A; 5IHN A; 1PNJ A; 2MCN A; 1WIE A; 2J6O A; 4ESR A; 2GQI A; 2DYB A; 2AKK A; 2LQN A; 2DLP A; 1KIK A; 2EKH A; 2C0I A; 1H92 A; 1UHC A; 2FEI A; 5FWC A; 2W10 A; 1NG2 A; 1X43 A; 1X2Q A; 1K4U S; 1H8K A; 4ZNX A; 1OOT A; 2KRN A; 4GBQ A; 2CRE A; 2LJ0 A; 5EC7 A; 2VVK A; 2K3B A; 2DNU A; 2CSQ A; 1UJY A; 5GJW B; 2HCK A; 4QT7 A; 3QWY A; 2HDA A; 1PRM C; 4E6R A; 2A37 A; 1B07 A; 2BZY A; 2FPF A; 4DEY A; 3JV3 A; 1RLP C; 2LJ3 A; 1M8M A; 4LUE A; 4RUG A; 1GFD A; 2O88 A; 2AK5 A; 2A28 A; 1M3A A; 1GFC A; 1AWJ A; 5I22 A; 3EG1 A; 1W6X A; 2JT4 A; 2J06 A; 2DL7 A; 1PWT A; 2L3P A; 3M0R A; 4K11 A; 2V1R A; 1BB9 A; 5IHI A; 1YWP A; 2FRY A; 4J9F A; 2FG0 A; 1GCQ C; 1HJD A; 1AWX A; 3PE0 A; 1Z9Q A; 4JPB W; 4IIM A; 2DL3 A; 3EG0 A; 1EFN A; 2YSQ A; 3EG3 A; 2DL8 A; 2QDL A; 1UG1 A; 1QWF A; 2YDL A; 1X6B A; 4LNP A; 1WXT A; 5GJV B; 1UGV A; 2EBP A; 2DE0 X; 1X2K A; 1W1F A; 1Y57 A; 1ARK A; 4CC7 A; 2EVR A; 2L3Q A; 3EHQ A; 2EGC A; 2O31 A; 1JO8 A; 2LCS A; 1NEG A; 4RTT A; 1ZUK A; 2KGT A; 1AD5 A; 2LJ1 A; 3SHW A; 2F2W A; 4LUD A; 1OEB A; 3TSW A; 2JM9 A; 1T3S A; 1NM7 A; 2OJ2 A; 1WA7 A; 1I07 A; 1I1J A; 4LN2 A; 2CH4 W; 2C0T A; 4J9E A; 4F17 A; 2KRS A; 1E6H A; 2A36 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VQ7 A; 4JJN K; 2ZPG B; 4JDS A; 2LTO A; 1YJN A; 1PKT A; 2HSP A; 2RI2 A; 2P0P A; 2DBM A; 2YRD A; 3RKW A; 1G5V A; 2KXD A; 1N6A A; 1SRL A; 3JRZ A; 1WZO A; 1JEG A; 3EGU A; 1IRX A; 4LD9 K; 2RN8 A; 9ATC B; 2F2X A; 2MK5 A; 3QO3 A; 1PRL C; 5GAO n; 1QCN A; 3EFO B; 3RMS A; 1VQM T; 3FJ5 A; 3JB9 G; 1U5S A; 1JXO A; 1RAA B; 4FU6 A; 4XTU A; 3M4G A; 1BYM A; 3H8Z A; 2GQV A; 2NUT A; 4M78 A; 5FU6 B; 4M75 A; 2CYZ B; 2BZ8 A; 2O01 E; 2ED0 A; 2AT1 B; 1FYN A; 1RI9 A; 1ZQ1 A; 1YHQ A; 2VB6 A; 4J8O A; 1Y7X A; 3X20 B; 1YI2 A; 5DM7 R; 1WXB A; 2CP0 A; 2JMA A; 2R58 A; 1UDL A; 1YN8 A; 3QUI A; 2ZAE A; 1AVZ C; 5KYW A; 1N27 A; 1UUE A; 1G3T A; 3PIO A; 1P92 A; 2CGH A; 2ATC B; 3RIR A; 3PMT A; 4WTO B; 1W2B S; 1OV3 A; 5KE3 A; 2RHY A; 3EFS A; 3CBP A; 5C6S A; 2LQK A; 5LJ5 f; 3WVD B; 3UPU A; 1Q86 U; 1SHF A; 4C5E A; 2E70 A; 1ABQ A; 3CCQ Q; 4D8D A; 3J80 E; 3LX7 A; 3HRU A; 4FSX A; 2F5T X; 3NTI A; 4KH0 B; 4C92 E; 2PTK A; 1B7T A; 1SG5 A; 3KXT A; 1WQW A; 3OYF A; 1K9M C; 2DVJ A; 3TSZ A; 5KCO A; 2M16 A; 3IQL A; 1X69 A; 1D0Z A; 1UGS B; 4GLK A; 3TVT A; 1TUG B; 2EPD A; 4ZTF A; 4IUT A; 3FB9 A; 1BI0 A; 4X9D A; 3QKJ A; 1VQ4 T; 3CCV Q; 2XHC A; 2QEX A; 2RM4 A; 2BTT A; 1VQK Q; 2EQJ A; 1KG1 A; 3EAE A; 3H9N A; 1BCM A; 4C8Q D; 4C8Q F; 4DBH A; 1VQO Q; 4KRT A; 3SFM A; 2EQI A; 3VYG A; 5D6Y A; 4M75 B; 1KD1 U; 5LJ5 d; 2K4Y A; 1YJ9 T; 5KYY A; 1GCP A; 3SWN A; 2YWW A; 2ZZD A; 1YIJ Q; 3CCE A; 1Q82 C; 1OX8 A; 4OGC A; 1OZ3 A; 2I2L A; 2CT3 A; 5GAM j; 1MNE A; 3BDL A; 2WSC E; 3CC7 T; 4IIO A; 3R6N A; 4OMN A; 1BBZ A; 2J6F A; 2GF7 A; 2ESW A; 1VIF A; 1KC8 R; 2E10 A; 1KQ2 A; 4PK4 A; 3EGX A; 1O75 A; 1BCO A; 4CC2 A; 1J3T A; 2ZPF B; 5LJ3 f; 4FW2 A; 1V1C A; 3QZ5 B; 5GMK e; 3A8G B; 4N0A C; 1RUW A; 4F7U F; 4HVW A; 4IUU A; 3M4Y A; 3UT1 A; 4B6M A; 2CP3 A; 3LW5 E; 1X6G A; 3CCL T; 3X26 B; 3RKY A; 3CXC P; 3QII A; 1VQ8 T; 3JAM E; 4HCK A; 3PTA A; 2LNV A; 3OMC A; 1BI2 A; 1QCF A; 2JN0 A; 2RHU A; 2EJG A; 3S3O A; 1D3B B; 4J9D A; 4OML A; 5CO7 A; 3CCM A; 3HKS A; 2HMA A; 1ACM B; 1PG5 B; 2RHI A; 2JM8 A; 5HK0 A; 1YCS B; 3EGD B; 2RJE A; 3OYG A; 4PFP A; 2LC4 A; 4LDW A; 2KBT A; 2G3R A; 2XU8 A; 4OMQ A; 1GL5 A; 2EQM A; 4JRI A; 1K0X A; 4LD6 A; 1YJN Q; 3QHS A; 1I81 A; 3FDR A; 2AKL A; 4XU2 A; 2F1L A; 3BE3 A; 2RQW A; 2K2M A; 2KT8 A; 1AT1 B; 4MZM A; 1YJW T; 5LJ3 d; 4J7I A; 3CQT A; 2L3S A; 2RHX A; 4JJD A; 4Z8A A; 5M9O A; 4JZ4 A; 1VQ6 A; 1Y07 A; 1NEB A; 1T0H A; 2HD0 A; 2CT4 A; 2DKG A; 1ZUY A; 2NUZ A; 4C8Q C; 5FRM A; 2YUP A; 3RNJ A; 3M54 A; 4M7D G; 4E7L A; 1NLP C; 1UGP B; 5GAN 7; 1IRE B; 2AHJ B; 3J81 E; 3M58 A; 1M90 R; 3S3N A; 2OI3 A; 4KGV B; 5IH2 A; 1T0J A; 3OSV A; 1M1K U; 1I5O B; 1CKB A; 3OB9 A; 2COY A; 2FZC B; 3M55 A; 3OBY A; 3JB9 H; 3NTK A; 2X9H A; 3JCM Q; 2RF0 A; 1A0N B; 4HVV A; 4IUR A; 3ME9 A; 3VUB A; 4M78 F; 4A4H A; 1M2O A; 2D8J A; 4PFZ A; 2L8D A; 2E5K A; 1TSF A; 3F70 A; 1WNL A; 3OA6 A; 4AMC A; 1AHJ B; 3G1J A; 1WGS A; 3ULR B; 2LT1 A; 3VUZ A; 5I2M A; 4JZ3 A; 4XQ3 A; 6AT1 B; 2V26 A; 3EG2 A; 2H3E B; 4X9C A; 3OYH A; 4RMO A; 3TCJ A; 4ZGD B; 2D0N A; 1Q86 C; 3CD6 T; 4N4G A; 5GAO p; 3NGP A; 3JB9 D; 1GBQ A; 4LDU A; 3JSC A; 3UAT A; 1UHF A; 1JJ2 S; 4JJB A; 5GAN e; 1S72 A; 2QAZ A; 4M77 A; 3GLX A; 3MP6 A; 4FM4 B; 4QW2 A; 4ESR A; 3CMA A; 3TU4 K; 3JCM J; 2GQI A; 2MWO A; 3EFR A; 2DLP A; 4JRK A; 2EKH A; 2IG0 A; 2FEI A; 3V8L A; 2W10 A; 3MEW A; 4KGZ B; 2K3X A; 4BB7 A; 2OTJ Q; 1TXQ A; 2MPX C; 4GBQ A; 2CRE A; 5EC7 A; 2K3B A; 3JB9 J; 4QT7 A; 2XG8 D; 2VUB A; 3JCM b; 1TWB A; 4E6R A; 2EJ9 A; 1BI3 A; 2A37 A; 4C0G A; 2BZY A; 2FPF A; 2K2V A; 4C0Z A; 4UC4 A; 2OTL Q; 3CBM A; 5IN1 A; 1NPP A; 1RI0 A; 3L2Q A; 3VU3 C; 2DEU A; 3MET A; 2O88 A; 5GAN 3; 4Q5W A; 1KD1 C; 5I22 A; 2JT4 A; 2M02 A; 5GAN 4; 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4J6W A; 2COW A; 4Z89 A; 3NMZ C; 3A98 A; 1YP5 A; 2EQU A; 4AFS C; 2YLC A; 2OAW A; 2KXC A; 4II1 A; 3CCU T; 1YIJ A; 2P4R A; 3OS5 A; 3REB B; 2IPO B; 3M57 A; 4NS5 A; 1M1K C; 3FLG A; 2K5F A; 3MPU B; 2DD5 A; 2GNC A; 2MI6 A; 3M0T A; 4XK8 E; 1KQS P; 1IGQ A; 1KK7 A; 2D8H A; 5IAY A; 2FB7 A; 1PD1 A; 2RQR A; 3E9F A; 4IKF A; 4PJL A; 1C6V X; 3CCR A; 2CZ1 B; 3SWN C; 4BE1 A; 1E6G A; 2D1X A; 5FW9 A; 2VGN A; 1M90 U; 3VS4 A; 3JB9 I; 1BK2 A; 3I55 T; 2E1H A; 4MZP A; 4AT1 B; 1Z9Z A; 2CZ0 B; 5LJ5 h; 3QG1 A; 4D6W A; 3DLL A; 2JXB A; 5I11 A; 4M7D D; 4PNO A; 3OMG A; 3KFV A; 3A1P A; 4C92 A; 2EIF A; 3U23 A; 1WLP B; 2B8A A; 2DJZ A; 1JXM A; 4JLI A; 3OYK A; 1GXI E; 4C5G A; 2ZPE B; 5LJ3 g; 1X01 A; 2HEQ A; 1TTH B; 4C8Q B; 4M77 D; 2C06 A; 2XDP A; 1M2V B; 4M77 F; 5EG2 A; 2PUO B; 4J9G A; 2DZ9 A; 3JCM e; 1KHI A; 2ZCF B; 3HTR A; 4JS4 A; 4X34 A; 4CRI A; 4M7A E; 1M1K R; 1IHV A; 2HKN A; 5GAO l; 1N9R A; 3WVE B; 4EPC A; 5GAN 2; 2YUO A; 2XI9 A; 3LYI A; 3OYL A; 4FSS A; 2JW4 A; 2LT4 A; 2KQW A; 3G71 T; 1M30 A; 4D8K A; 2RPN A; 4J5Y A; 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