The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
LLQAQALYPWRAKKDNHLNFNKNDVITVLEQQDMWWFGEVQGQKGWFPKSYVKLISA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Endocytosis
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Crystal structure of the Second SH3 Domain of ITSN1 bound with a synthetic peptide
rcsb |
| molecule keywords |
Intersectin-1
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| total genus |
13
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-12-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4AFZ C; 5FW9 A; 5IHN A; 2JS0 A; 2DJQ A; 1ZUU A; 2LX7 A; 2MCN A; 1Z9Z A; 2VKN A; 2CSI A; 2GTJ A; 1FMK A; 2K79 A; 4OMO A; 1JEG A; 2YUN A; 1YN8 A; 2GTO A; 2JTE A; 1MUZ A; 2YT6 A; 2D0N A; 2OJ2 A; 2JMC A; 1G2B A; 1T3S A; 1TUC A; 2KBT A; 5I22 A; 3H41 A; 2O31 A; 1YWP A; 2I0N A; 4R0K A; 5FWC A; 3UAT A; 1J3T A; 2J6F A; 1UHC A; 1T0J A; 3TVT A; 2AK5 A; 5IHK A; 1UEC A; 2FG0 A; 1T3L A; 2V1R A; 2JMA A; 1U5S A; 1N5Z A; 2NWM A; 2PTK A; 3VS1 A; 2PZ1 A; 2LP5 A; 1SRM A; 1QCF A; 1SEM A; 1B07 A; 1U06 A; 4OMP A; 2ENM A; 2SRC A; 1PKS A; 2AKL A; 4GLM A; 1WXU A; 3ZL7 C; 2J05 A; 3KFV A; 2JXB A; 3PVQ A; 1E7O A; 2KNB B; 2DMO A; 4ESR A; 4RTT A; 1QKW A; 3NPF A; 1H8K A; 5HCK A; 4RTW A; 2GQI A; 2LQN A; 2FRW A; 3M0Q A; 1KIK A; 1Y57 A; 2L2P A; 1Y0M A; 4CC4 B; 1E6G A; 1PRL C; 3M0S A; 1UE9 A; 4HXJ A; 3R6N A; 1E6H A; 2ROT A; 1ABO A; 1Z9Q A; 3NGP A; 3M0R A; 2RMO A; 2CUB A; 2V1Q A; 4JZ3 A; 1JU5 C; 2K6D A; 2KT8 A; 3PE0 A; 1OOT A; 1HSQ A; 2KRN A; 2NUZ A; 1UHF A; 2K7A A; 3H0F A; 2JM9 A; 2CH4 W; 1YCS B; 1UG1 A; 4F17 A; 2O88 A; 5I11 A; 2D1X A; 2EVR A; 1K76 A; 1X2Q A; 2HBW A; 4CC7 A; 5ECA A; 4RTZ A; 4DEX A; 4OMM A; 2M51 A; 1JXM A; 2C0T A; 1B3Q A; 1AD5 A; 1M3C A; 2B86 A; 1AOJ A; 2EQI A; 2X3W D; 1UDL A; 2DL7 A; 1IO6 A; 3M0P A; 2BZ8 A; 1SHG A; 2KXC A; 2CRE A; 2RF0 A; 2OAW A; 1H92 A; 1PNJ A; 2EW3 A; 4F14 A; 1W1F A; 2F2X A; 2GGR A; 2DBK A; 2O9V A; 5IHI A; 3O5Z A; 2F2W A; 2DX1 A; 2KR3 A; 2CT3 A; 2RQW A; 3SEM A; 4ORZ A; 1K0S A; 1CKA A; 1A0N B; 3H0I A; 2LJ1 A; 3QWX X; 2YUO A; 2MIO A; 2FO0 A; 1YWO A; 4HCK A; 1X69 A; 2ED0 A; 1TUD A; 2C0O A; 1KFZ A; 1K0X A; 3C0C A; 2ESW A; 1UUE A; 3I5R A; 2L3P A; 1QLY A; 2BTT A; 2K2M A; 2SEM A; 2KT1 A; 2LJ0 A; 3NMZ C; 3EHR A; 1FYN A; 1QWE A; 4K11 A; 4RTY A; 2RQT A; 2YUQ A; 2CDT A; 3EGU A; 3TSW A; 1NLO C; 1I07 A; 1HD3 A; 1X2K A; 3EHQ A; 4LE9 A; 3VS0 A; 2LQW A; 2GNC A; 1EFN A; 2A37 A; 1BB9 A; 1BK2 A; 4J9F A; 3NHN A; 1GBR A; 3REA B; 2EYY A; 1ZUY A; 1ZBJ A; 1NEG A; 1MV3 A; 1WXB A; 1AVZ C; 2QDL A; 1WXT A; 2CSQ A; 2KRO A; 2OI3 A; 3SHW A; 1SSH A; 2W0Z A; 1W6X A; 1SPK A; 1ZLM A; 2ED1 A; 2HCK A; 1WA7 A; 2FEI A; 2M0Y A; 2BZY A; 3RNJ A; 4Z88 A; 4DEY A; 2EGA A; 2YDL A; 4X1V A; 1S1N A; 2LNH B; 2KXD A; 1G83 A; 2EPD A; 2VVK A; 4JJB A; 1JQQ A; 1ARK A; 1HJD A; 2A28 A; 2K9G A; 2EYW A; 2KE9 A; 2YSQ A; 2RPN A; 1H3H A; 2P4R A; 2RQR A; 3VS6 A; 2D8H A; 5GJW B; 1KJW A; 1OPL A; 3FJ5 A; 1VYT A; 4RTV A; 5EC7 A; 1AWW A; 3JV3 A; 1CKB A; 1XOV A; 3UA7 A; 3CQT A; 5L23 A; 4HVW A; 2EKH A; 2IIM A; 2F2V A; 2FPE A; 5IXF A; 4ZNX A; 1WIE A; 2HDA A; 3GBQ A; 4Z8A A; 1UGV A; 2A08 A; 1NYG A; 4AFQ C; 1UTI A; 3H0H A; 1GCQ C; 2KYB A; 2DA9 A; 1K1Z A; 2DRM A; 4HVU A; 3VS7 A; 3THK A; 1W70 A; 1WDX A; 2DIL A; 4AFU C; 4J9D A; 2DVJ A; 1OPK A; 1GBQ A; 2EYX A; 1AZG B; 1AEY A; 1WX6 A; 2JM8 A; 4J9E A; 3REB B; 3VS2 A; 2JT4 A; 2L3Q A; 1RLQ C; 2AKK A; 4J9G A; 2DF6 A; 5IH2 A; 1PHT A; 3VS4 A; 2YUP A; 1UJY A; 4J9C A; 2E5K A; 1GFD A; 4JJD A; 2J7I A; 2CH4 A; 4LN2 A; 2ECZ A; 1QKX A; 4AG1 C; 2DRK A; 2EBP A; 2DL4 A; 2BZX A; 1ABQ A; 2JS2 A; 4OML A; 3QWY A; 2XMF A; 3I9Q A; 2K3B A; 3EG1 A; 2EGE A; 2FPD A; 2HEQ A; 1SHF A; 2LJ3 A; 1ZSG A; 2DYB A; 4F16 A; 1X43 A; 4GBQ A; 3I35 A; 2O9S A; 3UF4 A; 4WCI A; 3TSZ A; 2KRM A; 4JJC A; 1X6G A; 4J9I A; 2DBM A; 2CT4 A; 1WI7 A; 4AG2 C; 1AWJ A; 3VRZ A; 3IQL A; 2DNU A; 1YNZ A; 4JZ4 A; 4RTX A; 4LUE A; 4Y92 A; 3M0T A; 5FWB A; 2J06 A; 2W10 A; 1ZX6 A; 3U23 A; 2DLP A; 1AWX A; 1T0H A; 2X3X D; 1GCQ A; 1GRI A; 1K9A A; 1TG0 A; 4OMN A; 4CC3 A; 2AZS A; 1NG2 A; 4IIM A; 1JO8 A; 1M27 C; 2EYZ A; 3ULR B; 2DE0 X; 4RTU A; 4IIO A; 1CSK A; 1RLP C; 1GCP A; 1BU1 A; 2FRY A; 1GL5 A; 3M0U A; 2J6K A; 2RNA A; 4J9B A; 1KSW A; 5IXB A; 1WYX A; 2PNI A; 2O2O A; 4JPB W; 2RQU A; 1K4U S; 2LZ6 B; 1UFF A; 1X6B A; 1OEB A; 2RQV A; 2ROL A; 1M8M A; 1PRM C; 1U3O A; 2ABL A; 1M3B A; 1SRL A; 1JXO A; 1NEB A; 4RUG A; 1ZUK A; 1NM7 A; 3RBB B; 2VWF A; 2JW4 A; 3UA6 A; 1I1J A; 4E6R A; 4HVV A; 1AZE A; 2KRS A; 2H8H A; 2DL8 A; 2KGT A; 2GBQ A; 4CC2 A; 2CUD A; 1QWF A; 1V1C A; 4M4Z A; 2EGC A; 4LNP A; 2HSP A; 1AWO A; 4FSS A; 2LCS A; 1VYV A; 1PWT A; 5GJV B; 1YP5 A; 1MV0 B; 2G6F X; 1RI9 A; 1GFC A; 3VS3 A; 4OMQ A; 1WLP B; 1UJ0 A; 2L3S A; 2LMJ A; 2DL5 A; 1LCK A; 2DM1 A; 1RUW A; 1PKT A; 4AFS C; 4J9H A; 2FPF A; 1M30 A; 1NLP C; 3EG3 A; 4Z89 A; 2DL3 A; 4A63 B; 1X27 A; 4QT7 A; 4LUD A; 2A36 A; 3I5S A; 3A98 A; 1VYU A; 4EIK A; 2D8J A; 2J6O A; 2MOX A; 2L0A A; 3VS5 A; 2KYM A; 1NYF A; 3PVL A; 1WFW A; 4D8K A; 1I0C A; 2RN8 A; 2KEA A; 4D8D A; 2AZV A; 3VRY A; 1VA7 A; 4KRT A; 2C0I A; 1M3A A; 3LH5 A; 1OV3 A; 3EG2 A; 1BBZ A; 3EG0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2RJF A; 3GIB A; 1YJ9 T; 3SWN B; 5IHN A; 2Y90 A; 1ZBX A; 2JS0 A; 4ZGD B; 3QJ6 A; 3FC3 A; 3CC2 T; 2DTH A; 2JUF A; 1JEG A; 3CCE A; 1WPY A; 4F7U B; 4M75 C; 2OJ2 A; 3CXC S; 2JMC A; 2QK0 A; 2FVU A; 1RAC B; 1FX7 A; 1VQ7 A; 3PTA A; 1XJW B; 2I0N A; 4R0K A; 2CS7 A; 4HT8 A; 1Q86 C; 1J3T A; 2M9U A; 2XHC A; 2P84 A; 4M77 D; 5IHK A; 5GAO q; 1YI2 T; 4II1 A; 3MET A; 2QEX A; 3M57 A; 5CVI A; 1YIT A; 1VQ6 T; 1OYX A; 1SEM A; 4FL6 A; 2OTJ Q; 4OF1 A; 4NS5 A; 1U06 A; 2QTX A; 3GP8 A; 3EG9 B; 1M90 R; 3A8O B; 2LRQ A; 4GLM A; 2VC8 A; 4X9D A; 1WQW A; 3QBY A; 2NYS A; 1VQO A; 5FU7 C; 3LX7 A; 3P8D A; 1QKW A; 2DZC A; 3OS1 A; 1OZ3 A; 2LQN A; 2ZPG B; 3E9G A; 1N8R C; 2E12 A; 4HCC A; 3VYH B; 3G4S A; 4HXJ A; 2CZ0 B; 2RJE A; 1Z9Q A; 3NGP A; 5CKF A; 3NTH A; 2EJF A; 2CUB A; 3OBW A; 5KYY A; 3CCV Q; 4JZ3 A; 1JU5 C; 2K6D A; 2G3R A; 3PE0 A; 2K7A A; 3BDL A; 4IUQ A; 5DM7 R; 4KUD K; 2COY A; 1YJN T; 1UG1 A; 2E70 A; 2CKK A; 3V8L A; 3PGG A; 3VKI A; 2BE9 B; 1K76 A; 1X2Q A; 3DKM A; 2OTJ T; 2F5T X; 1OZ2 A; 3C12 A; 4RTZ A; 3INZ A; 4A4F A; 3EFO B; 3RDV A; 3Q1J A; 4PLI A; 2MK5 A; 3LWH A; 3ZBD A; 1D3B B; 1AOJ A; 2A7Y A; 1WZO A; 2DL7 A; 1M5Q 1; 1IO6 A; 1MNE A; 3OYH A; 3CCJ A; 2DBK A; 3A8H B; 4E7H A; 1BI2 A; 1PD0 A; 4KT0 E; 5EG2 A; 3O5Z A; 2CT3 A; 2BE7 D; 2RQW A; 3GNG A; 2VYT A; 1C6V X; 4KGZ B; 3J7A F; 1I8F A; 4PJO C; 2HQH A; 1CKA A; 4M7A C; 4B6M A; 3CCQ A; 2YLB A; 2KK4 A; 3CCL T; 2MAM A; 3CCE Q; 3C0C A; 4M7D B; 1BKB A; 1YJW T; 3QSU A; 3FIF A; 3BFM A; 2BTT A; 3PT9 A; 3X24 B; 2OTL A; 3EHR A; 1FYN A; 4E47 A; 1IXD A; 1VQ7 Q; 3JCM W; 2H3J A; 4KGV B; 3OYE A; 4KUL A; 5KYU B; 3EHQ A; 1QP2 A; 4MDX A; 4J6Y A; 2LQW A; 1YCY A; 4D6W A; 2JJ9 A; 2A37 A; 2JTM A; 4F7U F; 4C92 C; 5GAN 5; 2QEX Q; 2EYY A; 3CME Q; 3JB9 H; 4EMG A; 1YIT Q; 3JAM E; 3EAE A; 2XDB A; 3GLX A; 4JLG A; 4X34 A; 1WXT A; 3L2W A; 1VQO Q; 4M7D G; 2BZY A; 3RNJ A; 4Z88 A; 4DEY A; 2YDL A; 4M75 D; 2VVK A; 4Q5W A; 1ARK A; 1JQQ A; 4RG2 A; 1PC0 A; 3GNF B; 2IPO B; 3CMA A; 2YSQ A; 2RPN A; 5GAN j; 2RQR A; 1RAA B; 2B8A A; 4FSX A; 4M77 A; 5LJ3 h; 1K9M C; 3FJ5 A; 1YIJ A; 2RK1 A; 1CKB A; 3EGD A; 5GMK j; 1MMA A; 1KD1 U; 5L23 A; 3M56 A; 2FPE A; 3JCM d; 2K3X A; 3CME T; 3CBO A; 3EFS A; 2XK0 A; 3QPH A; 3VUZ A; 3CCS A; 4J6W A; 5J3B A; 5GAN f; 3X20 B; 4DA4 A; 2COZ A; 4TVR A; 1VQK T; 1GCQ C; 3CD6 T; 1NPR A; 2RD1 A; 3I56 A; 3THK A; 2X9H A; 2DIL A; 1AT1 B; 2EQM A; 3C95 A; 4J9D A; 2VXF A; 4B9W A; 1NE8 A; 1VQ9 Q; 1MGQ A; 5GAN e; 2ZPB B; 3SFM A; 3CCJ Q; 2D0Q B; 3URG A; 4MMK A; 2JT4 A; 2PVG B; 1NZ9 A; 1RLQ C; 4HT9 A; 1TH7 A; 5IH2 A; 3CCR T; 2QQR A; 5GAM d; 1KQ1 A; 5GMK e; 1QVP A; 1OQK A; 3CCQ Q; 1O75 A; 5A0L A; 3QZ9 B; 1W2B A; 1RAF B; 2RHY A; 1BI1 A; 4AG1 C; 2DRK A; 2EBP A; 2HKN A; 2F69 A; 2JS2 A; 2QQS A; 2DXB A; 3QWY A; 3V7R A; 4C8Q E; 3I9Q A; 5FU7 B; 4M75 G; 3EG1 A; 2LT4 A; 4N4I A; 3RKX A; 5KCH A; 3TQ7 P; 3RKW A; 3TEE A; 3OYG A; 3RES A; 2A0F B; 1ZSZ B; 3I35 A; 2BIV A; 2RH2 A; 2O9S A; 3JSC A; 1X6G A; 2DBM A; 1VQ9 T; 2V8J A; 1QVG S; 4RTX A; 4Y92 A; 1WHH A; 5FWB A; 5CKB A; 1AWX A; 1T0H A; 1GRI A; 5HKC A; 1TG0 A; 4PJO D; 4CC3 A; 2AZS A; 2E3H A; 4M7A D; 1JJ2 A; 1KD1 R; 1KK7 A; 1JO8 A; 2DE0 X; 3BDU A; 4IUT A; 1KQS S; 1CSK A; 3R6O A; 2CZ1 B; 3PMI A; 3M0U A; 4BY6 C; 2J6K A; 2YXY A; 5IXB A; 1KSW A; 1IZ6 A; 3BW1 A; 1K73 C; 2R58 A; 5GAO m; 1K4U S; 1IRX A; 1UFF A; 3CC4 T; 2RQV A; 2ROL A; 1PRM C; 1YHQ T; 3E9F A; 1U3O A; 1Q7Y U; 1M3B A; 1YIJ Q; 4R56 A; 1QVF P; 5CCA A; 4RUG A; 4ATO A; 4C92 D; 2QYZ A; 3JB9 F; 3UA6 A; 1VQL T; 1M1F A; 1Q82 C; 5GAN 2; 2A3L A; 1UGS B; 2YWW A; 5KYW A; 2K57 A; 1P92 A; 1V1C A; 4M4Z A; 1TUG B; 1OUL A; 3CCS Q; 3G6E A; 1PWT A; 2FHD A; 2G6F X; 1RI9 A; 1WLP B; 1QVG P; 1ZA1 B; 3JCM h; 3PFS A; 2L3S A; 3I56 Q; 5FRO A; 2LDM A; 1HK9 A; 1U8R A; 2DER A; 2DM1 A; 2E10 A; 1D1C A; 4XU2 A; 4J9H A; 3NTK A; 1M30 A; 3WVD B; 2DL3 A; 2DTO A; 1YJ9 A; 2LTO A; 3RMQ A; 3QUI A; 3I5S A; 4EMK A; 1VQ8 T; 1KQS P; 3VS5 A; 2KYM A; 3L42 A; 5GMK m; 2EJG A; 2PQW A; 2XKO C; 4NOY A; 3QYH B; 4D8K A; 2M0O A; 1M90 C; 5GAN g; 1IHW A; 1VQ5 A; 4KH1 B; 4PJO G; 4XU0 A; 4M7A G; 2M1H A; 2JN0 A; 1PSE A; 1VQ4 A; 1OV3 A; 3EG2 A; 1BBZ A; 4C5G A; 3CEY A; 4DBQ A; 4BB7 A; 1VIF A; 1QMC A; 1Z9Z A; 4OMO A; 1ZA2 B; 1YN8 A; 4FCY A; 1Q81 U; 1H64 1; 1WJS A; 2JTF A; 1VQN T; 1TUC A; 5LJ5 h; 2RJC A; 4C92 G; 3H41 A; 1SKU B; 1Q7Y R; 2COW A; 5D7U A; 3UAT A; 1Q95 G; 1R8O B; 2QQB A; 3QJY A; 2J6F A; 2K5L A; 4J7I A; 1TU0 B; 1T3L A; 2V1R A; 1QCO A; 4O6J A; 1N5Z A; 2NLU A; 2NUT A; 3RR6 A; 2WSE E; 3VS1 A; 3OSV A; 2O4X A; 2JNG A; 4FYY B; 3LGF A; 5LJ3 j; 3X26 B; 1NJI U; 4WF2 A; 3QO3 A; 4OMP A; 2P4T A; 2ENM A; 2AKL A; 4OVA A; 2E5Q A; 1YJN A; 1RAG B; 8ATC B; 1H8K A; 4WTO B; 5L8R E; 2MI6 A; 2GQI A; 3M0Q A; 2RM4 A; 4PJM A; 1Y57 A; 3CBP A; 1Y0M A; 2DEQ A; 1E6G A; 1M2V B; 1PRL C; 5LJ3 f; 3JCM V; 1VQM A; 3KXT A; 3R6N A; 2ZGW A; 1E6H A; 2ROT A; 2D6F A; 1ABO A; 3G6E Q; 4XAX B; 1M1K U; 4PJL A; 5CK9 A; 2RMO A; 1C1A A; 2M02 A; 2VAS A; 1RAB B; 2V1Q A; 1IGQ A; 1HSQ A; 2NUZ A; 4HA8 A; 2QQ9 A; 2YRC A; 4E7K A; 2KQW A; 1YCS B; 1VQP Q; 5LJ3 e; 1SF9 A; 3FJP A; 3NFC A; 5I11 A; 2X4Y A; 4X9C A; 5GAO l; 2KY9 A; 1G3T A; 3JRZ A; 1Y7X A; 5KYY B; 3AT1 B; 4DEX A; 2HKQ B; 2M51 A; 1R0C B; 4L6V 5; 3CPF A; 3S3O A; 3HTR A; 3H9N A; 3OYJ A; 1Q81 R; 2DFU A; 3OYN A; 1YJW A; 3M0P A; 1M8V A; 1SHG A; 1VQ5 Q; 2XIC A; 1VIE A; 2P0K A; 1PNJ A; 2LQ8 A; 2ZPE B; 5D6Y A; 4C8Q F; 3CC7 Q; 4PFZ A; 1VQ4 Q; 5KYX A; 2PU9 B; 2F2W A; 4M77 E; 3SEM A; 4IUV A; 4ORZ A; 4FM4 B; 5M9O A; 1TOV A; 2XID A; 3QWX X; 2MIO A; 4ME7 A; 1TUD A; 3OW2 A; 4QW2 A; 2C0O A; 4KBM B; 4BY6 B; 1NJI R; 1K0X A; 4M78 A; 1VQP T; 2ESW A; 2L3P A; 2KSS A; 2K2M A; 5GAO p; 2SEM A; 3NMZ C; 3BE3 A; 3X28 B; 4QVC A; 2RQT A; 1BIB A; 3OMC A; 2YUQ A; 3EGU A; 3TU4 K; 5GMK l; 1RAD B; 3TSW A; 1PCX A; 4E7L A; 1KC8 U; 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