The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
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Chain Sequence |
MEAIAKVDFKATADDELSFKRGDILKVLNEESDQNWYKAELNGKDGFIPKNYIEMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Molecular and cellular analysis of Grb2 SH3 domain mutants: interaction with Sos and dynamin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
GRB2
|
| molecule tags |
Complex (adaptor protein/peptide)
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3M0S A; 2J6F A; 2IIM A; 2DE0 X; 1QCF A; 2LJ3 A; 1CKB A; 2O9V A; 1WDX A; 2M0Y A; 1T0H A; 3A98 A; 2A08 A; 2D8J A; 2KR3 A; 3M0R A; 1YWP A; 2W10 A; 2JTE A; 5FWB A; 1PRL C; 1NYF A; 1H8K A; 1YP5 A; 2EGC A; 2O2O A; 2E5K A; 1M30 A; 2L3S A; 2W0Z A; 4AFU C; 1K0X A; 1W6X A; 2J06 A; 2DLP A; 1QKX A; 2KXD A; 2CDT A; 1Z9Z A; 2YUP A; 4OMQ A; 1TG0 A; 2DBM A; 4F17 A; 2DJQ A; 2OJ2 A; 2AZV A; 3I35 A; 1T3S A; 5IH2 A; 3SEM A; 1PHT A; 2FEI A; 1BBZ A; 1WI7 A; 2MIO A; 1XOV A; 2EYZ A; 3UAT A; 1SEM A; 1M3C A; 1CKA A; 2K9G A; 2MOX A; 1WYX A; 2HCK A; 1I0C A; 2H8H A; 1V1C A; 1AZG B; 2YSQ A; 2LP5 A; 2K2M A; 2LJ1 A; 1RUW A; 3VS6 A; 1AWW A; 1JQQ A; 4OMP A; 2L2P A; 1PRM C; 2EGE A; 2RNA A; 4J9H A; 3NHN A; 2HEQ A; 1ABO A; 2EYY A; 4RTW A; 2DX1 A; 3VS0 A; 1VYV A; 1JXM A; 3EG3 A; 1JU5 C; 2L0A A; 4HCK A; 4OML A; 1NYG A; 1SHF A; 1PKT A; 1KJW A; 3RBB B; 1K1Z A; 4AG1 C; 2ENM A; 2LX7 A; 3VS5 A; 5L23 A; 5IHN A; 2GNC A; 3H0F A; 3KFV A; 3NPF A; 1UJ0 A; 2SRC A; 1QKW A; 3H41 A; 1KFZ A; 2VKN A; 4LE9 A; 4Z89 A; 5IHI A; 3NMZ C; 3PVQ A; 1TUD A; 4CC7 A; 2C0T A; 2D1X A; 4D8D A; 1YWO A; 4ORZ A; 1B07 A; 1UHF A; 1OEB A; 4LN2 A; 2RQR A; 1H3H A; 2LQW A; 2DF6 A; 3I9Q A; 1X6G A; 4Z88 A; 4AFZ C; 1K9A A; 4HVW A; 2AKL A; 3TSZ A; 2CRE A; 2F2X A; 2EPD A; 2EVR A; 5ECA A; 3VS1 A; 1RLQ C; 2J6O A; 2PNI A; 1J3T A; 3RNJ A; 2C0I A; 3EHR A; 1ZLM A; 2DRK A; 2DVJ A; 1QWF A; 2ABL A; 4EIK A; 1GL5 A; 2KE9 A; 2JM9 A; 2CH4 A; 1U06 A; 1PWT A; 2CSQ A; 4LNP A; 3QWY A; 1JO8 A; 2RQU A; 2RF0 A; 1GRI A; 2PTK A; 1TUC A; 1ZUK A; 4GBQ A; 4J9E A; 3H0H A; 2KEA A; 1UG1 A; 4JJD A; 4JZ3 A; 2K6D A; 2JS0 A; 2XMF A; 2RMO A; 2ROT A; 5I11 A; 4J9F A; 3VS4 A; 1NLO C; 4E6R A; 2A28 A; 2D0N A; 1GCQ A; 1NEB A; 1IO6 A; 2FPE A; 1WFW A; 1UEC A; 2KYM A; 5IHK A; 1U5S A; 2DRM A; 1AOJ A; 2GGR A; 1ZUU A; 1T3L A; 3EG1 A; 1K76 A; 1NG2 A; 1PKS A; 2ED0 A; 4FSS A; 2DM1 A; 3QWX X; 3M0Q A; 2KXC A; 1E7O A; 4AFQ C; 3VRY A; 2DL8 A; 3REA B; 3O5Z A; 2DL3 A; 2G6F X; 2EYW A; 2GQI A; 2OI3 A; 2J05 A; 3UA7 A; 1X6B A; 1QLY A; 1SPK A; 3THK A; 4WCI A; 2YT6 A; 2JMA A; 4CC3 A; 2YUQ A; 1AWJ A; 2MCN A; 3EG0 A; 4JPB W; 1N5Z A; 1YCS B; 2RQV A; 2CUB A; 4J9G A; 1OOT A; 1ABQ A; 2L3Q A; 2YDL A; 1MV0 B; 4HXJ A; 2GTO A; 1SRL A; 2LMJ A; 2JT4 A; 2O88 A; 1B3Q A; 1VYU A; 1GFD A; 2KRO A; 1OV3 A; 3GBQ A; 1YN8 A; 1W70 A; 4AFS C; 3REB B; 2FRY A; 5FWC A; 3VS2 A; 2KGT A; 1X2K A; 3LH5 A; 2YUO A; 1HJD A; 1X43 A; 3VS7 A; 2D8H A; 2LJ0 A; 3M0P A; 1K0S A; 1ZX6 A; 3EHQ A; 1S1N A; 3M0U A; 2ROL A; 2BZX A; 2YUN A; 1M27 C; 4JZ4 A; 1AVZ C; 2KRS A; 2DBK A; 3I5S A; 1YNZ A; 2JXB A; 4Z8A A; 1ZUY A; 2B86 A; 1AWO A; 1X27 A; 4HVV A; 1GCQ C; 1Z9Q A; 4KRT A; 2F2V A; 2LNH B; 2NWM A; 4AG2 C; 1BU1 A; 4K11 A; 1NM7 A; 2J6K A; 2KYB A; 2SEM A; 2LZ6 B; 2ED1 A; 1GBQ A; 3TVT A; 2CSI A; 1MV3 A; 3IQL A; 1ARK A; 3UF4 A; 5IXF A; 1GCP A; 1Y57 A; 4J9D A; 4M4Z A; 4JJB A; 1JXO A; 4RTV A; 2DA9 A; 2RPN A; 2DL5 A; 4RTU A; 4IIM A; 3CQT A; 2EW3 A; 2CT3 A; 2KT8 A; 5GJW B; 1M3B A; 2AKK A; 4F14 A; 4LUE A; 5HCK A; 2EYX A; 2JM8 A; 1GFC A; 4RTY A; 3TSW A; 1KIK A; 2V1Q A; 2CH4 W; 1OPL A; 2GTJ A; 1JEG A; 5I22 A; 1H92 A; 1G83 A; 1HSQ A; 1WXU A; 4IIO A; 2JW4 A; 3FJ5 A; 2DNU A; 2EBP A; 4A63 B; 4GLM A; 1AZE A; 3PE0 A; 1NEG A; 2FPD A; 3VS3 A; 1I07 A; 4RTT A; 5GJV B; 2RQW A; 1OPK A; 2BTT A; 2RQT A; 1G2B A; 1ZSG A; 4OMM A; 1K4U S; 2LQN A; 1X69 A; 1AD5 A; 2OAW A; 2CT4 A; 2LCS A; 2EQI A; 2K7A A; 1GBR A; 1I1J A; 4QT7 A; 2FPF A; 2EKH A; 4D8K A; 2FRW A; 2DIL A; 2FG0 A; 1RLP C; 1EFN A; 1M3A A; 4F16 A; 2FO0 A; 1E6H A; 4RTZ A; 2X3W D; 1HD3 A; 1CSK A; 2L3P A; 4OMO A; 1A0N B; 2KBT A; 2HDA A; 1E6G A; 1X2Q A; 1BB9 A; 4Y92 A; 3M0T A; 1U3O A; 3R6N A; 3ULR B; 1BK2 A; 2CUD A; 2A37 A; 1VA7 A; 2X3X D; 4CC4 B; 1WX6 A; 2DL7 A; 1SSH A; 2BZY A; 2VVK A; 3UA6 A; 4HVU A; 1RI9 A; 1ZBJ A; 2ECZ A; 4J9B A; 1WLP B; 1Y0M A; 2DL4 A; 2F2W A; 2O9S A; 4RUG A; 4DEY A; 2KT1 A; 2O31 A; 4OMN A; 1VYT A; 2GBQ A; 2AZS A; 2NUZ A; 4RTX A; 1UGV A; 1FMK A; 3NGP A; 2I0N A; 1W1F A; 1KSW A; 3EG2 A; 2AK5 A; 1UHC A; 2EGA A; 5IXB A; 1UDL A; 1AEY A; 2KRM A; 3C0C A; 2BZ8 A; 2PZ1 A; 1UTI A; 1UE9 A; 4J9I A; 4ESR A; 3EGU A; 2C0O A; 2ESW A; 3JV3 A; 2M51 A; 2HBW A; 2QDL A; 2A36 A; 2V1R A; 1UFF A; 4LUD A; 1T0J A; 2KRN A; 3I5R A; 3ZL7 C; 2JMC A; 1UUE A; 2RN8 A; 1AWX A; 5EC7 A; 4J9C A; 2KNB B; 4R0K A; 2DYB A; 2JS2 A; 1MUZ A; 1WA7 A; 2K79 A; 1SRM A; 2J7I A; 1WXT A; 4X1V A; 1SHG A; 1UJY A; 2K3B A; 1NLP C; 2HSP A; 1PNJ A; 1WXB A; 4ZNX A; 2DMO A; 4JJC A; 1WIE A; 3VRZ A; 3SHW A; 1LCK A; 3PVL A; 4DEX A; 3H0I A; 1FYN A; 1QWE A; 2VWF A; 3U23 A; 4CC2 A; 5FW9 A; 2P4R A; 1M8M A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2IIM A; 2DE0 X; 2QI2 A; 2LJ3 A; 1RAG B; 3OYB A; 3FRN A; 4J6Y A; 3LGL A; 2F5T X; 3G4S Q; 1MMN A; 4DBF A; 1NZ9 A; 1P92 A; 1UGS B; 2X4W A; 4GY5 A; 2KR3 A; 3M0R A; 3CXC A; 3S6W A; 3JCM X; 1PRL C; 2PVG B; 3JCM g; 4BDZ A; 2HKQ B; 3X20 B; 2E5K A; 1MHN A; 3CCV A; 3QII A; 2RH2 A; 4OGE A; 3VJP A; 1M90 R; 1X75 C; 2J06 A; 2DLP A; 2KXD A; 3NTH A; 2XK0 A; 1WPY A; 2CDT A; 1Z9Z A; 1VQ4 Q; 3AHU A; 4MDW A; 3CCL Q; 1Y96 B; 2DBM A; 3HFO A; 1VQL A; 3UT1 A; 3VYG A; 3CCJ Q; 3CC2 T; 1M1K U; 1K73 C; 1W2B A; 2E6N A; 2EJG A; 2WSC E; 3MP1 A; 1PHT A; 2FYK A; 1JRI A; 4M78 D; 4MMK A; 2FEI A; 1BBZ A; 4WTO B; 3QXE B; 5HK0 A; 2K9G A; 5CCA A; 4FYY B; 1C6V X; 6AT1 B; 2H8H A; 2YSQ A; 1YJ9 Q; 2K2M A; 2DET A; 2ZPF B; 3RMS A; 1AWW A; 2L2P A; 4J9H A; 1N6A A; 1MMG A; 1PCX A; 3JB9 D; 2ZPB B; 1RAE B; 1RAH B; 3EG9 A; 5D6W A; 2DX1 A; 3CBM A; 3EG3 A; 2L0A A; 2RHU A; 4PJO B; 1SHF A; 3I55 A; 4ME7 A; 4XU3 A; 4ZN3 A; 5GAN h; 1IRE B; 4BE0 A; 2LRQ A; 2NUT A; 3VS5 A; 5L23 A; 2RM4 A; 1B34 A; 2GNC A; 1ZA2 B; 3H0F A; 1UJ0 A; 1WQW A; 1QKW A; 1YJN T; 3PVQ A; 1M1G A; 1WNL A; 1IHV A; 1SKU B; 1YWO A; 4MZM A; 2VGN A; 2RQR A; 3MP6 A; 1I81 A; 4M75 A; 1X6G A; 3SWN C; 4Z88 A; 3CME T; 1SG5 A; 5D6Y A; 4C92 F; 5LL6 S; 4LXC A; 5LJ3 j; 1YJW T; 2EPD A; 4M7D B; 2EVR A; 5J39 A; 3VS1 A; 2WSE E; 1K8A C; 3P8B B; 3RNJ A; 2MI6 A; 2KK4 A; 3MO8 A; 2O01 E; 2V8J A; 5FLX E; 3OSS C; 1IGU A; 2PVO B; 3QJY A; 2QA4 Q; 3EGD B; 3CCU Q; 1QWF A; 1VQ7 T; 2ABL A; 2CH4 A; 2LCL A; 2X4X A; 2YLC A; 1PWT A; 3J81 E; 2EYQ A; 2CSQ A; 4X9D A; 3QYH B; 1O75 A; 5GAM d; 2MF2 A; 3QWY A; 4C92 E; 3CCE A; 1KK7 A; 1RAC B; 4IUT A; 4M7A B; 4C8Q B; 1EX4 A; 1I5L A; 1R0C B; 1UG1 A; 5KH6 A; 5LJ5 f; 2CP6 A; 2AT1 B; 1VQP Q; 2JS0 A; 2RMO A; 4GLK A; 2ROT A; 5GAM e; 5I11 A; 5GMK e; 3VS4 A; 3G4S T; 5LJ5 e; 2D0N A; 1WFW A; 5KYX B; 2RHY A; 3QSU A; 1VQ8 Q; 4XTZ A; 1VQ5 Q; 2EKO A; 2KI7 A; 2RJC A; 2KXC A; 1Q7Y R; 4AFQ C; 5GAM g; 2DL8 A; 3EGX A; 3O5Z A; 3GP8 A; 2D0Q B; 2KSS A; 4BD3 A; 3WVD B; 2GQI A; 4D6W A; 2OI3 A; 5LJ5 g; 4AT1 B; 2J05 A; 1VQ4 T; 1X6B A; 3HKS A; 3EFR A; 3CCL T; 2CZ6 B; 4BI3 A; 1D1A A; 4WCI A; 3CCJ T; 4CC3 A; 4JPB W; 1N5Z A; 1U1S A; 1G3Y A; 2EQJ A; 4KGZ B; 1M8V A; 1PD1 A; 1KG1 A; 2E64 A; 1OX9 A; 2CUB A; 5KYN A; 3V7C A; 2EQU A; 4DQ2 A; 2YDL A; 1MV0 B; 2LMJ A; 3UWN A; 2VYT A; 1YJ9 T; 4BDY A; 1LVK A; 1YN8 A; 3BW1 A; 1W70 A; 3CC4 Q; 4AFS C; 1M5Q 1; 2FRY A; 2XDP A; 4QW2 A; 1YHQ Q; 4QVD A; 2KGT A; 1X2K A; 5FU6 B; 1X43 A; 4J5Y A; 1S1N A; 1AVZ C; 2DBK A; 1M1F A; 3QZ9 B; 4HVV A; 4KRT A; 2F2V A; 3CMA A; 3HPW A; 1KD1 C; 3TVT A; 3QJ6 A; 1KHC A; 3UF4 A; 1MMD A; 4M77 C; 4M75 F; 4QQD A; 2AIR B; 4J9D A; 4BB7 A; 4JJB A; 1NBE B; 5GAN 7; 1YI2 A; 2R58 A; 4YTL A; 4BY6 C; 5GAN f; 4RTU A; 1NPR A; 3CQT A; 2CT3 A; 2XI9 A; 4A4H A; 2ZPI B; 1N8R U; 4JJN K; 5GAN e; 2EYX A; 2JM8 A; 1GFC A; 3CCU T; 2QA4 T; 4J83 A; 3ZBD A; 1VQN A; 3QO3 A; 1JEG A; 3NTK A; 4M75 E; 3V8J A; 2JOY A; 2DD5 A; 1Q86 R; 4KT0 E; 2EBP A; 4A53 A; 3P8H A; 2PVD B; 5GAN g; 3VS3 A; 2FPD A; 1M2V B; 4RTT A; 2RQW A; 2HQX A; 1OPK A; 1ZA1 B; 1VQP T; 1G2B A; 1PSF A; 1VUB A; 2LDM A; 2NUP A; 3E2U A; 3S3O A; 1K4U S; 2LQN A; 4MDX A; 1TH7 A; 4KGX B; 1KC8 C; 4IUV A; 5DY9 A; 1VQ8 T; 3QPH A; 1M3A A; 1VQ5 T; 5FRO A; 2OTJ A; 5FU7 C; 2L3P A; 1HK9 A; 1D0Z A; 1LPL A; 4OMO A; 4C92 B; 3MPU B; 1SSF A; 1X2Q A; 2HD0 A; 2X51 A; 1NJI C; 1U3O A; 2A37 A; 1VA7 A; 2X3X D; 5GAO p; 4N0A C; 1N8R C; 2RO0 A; 2VVK A; 1VQ6 Q; 1RI9 A; 2VUB A; 3CD6 A; 3BY7 A; 3MEA A; 1VQO Q; 2R57 A; 1WLP B; 3JSC A; 4OVA A; 3UPU A; 4HCB A; 4RUG A; 2O31 A; 1TSF A; 3JCM h; 3VU3 C; 2GQV A; 3OYK A; 4NL3 A; 2NLU A; 4RTX A; 4XTU A; 1W1F A; 1KSW A; 3CC4 T; 2E3I A; 3RDV A; 5HKC A; 1YHQ T; 5LJ3 h; 1UDL A; 1AEY A; 5KE2 A; 2E65 A; 1UTI A; 3MEV A; 4ELY C; 4ESR A; 1VOM A; 4IUP A; 2MK5 A; 1Q82 U; 3JV3 A; 4O6J A; 4OB2 B; 2QDY B; 2QDL A; 1JJ2 P; 4JUV A; 1EIF A; 4LUD A; 4LDY A; 1T0J A; 2EAY A; 3I5R A; 2EFI A; 2FL7 A; 3OS5 A; 1QMC A; 2MWO A; 3M5A A; 4J9C A; 4R0K A; 2QTX A; 1SRM A; 2EQM A; 1K9M U; 1WXT A; 4X1V A; 3HRT A; 2KY9 A; 2X9H A; 3CPF A; 1PNJ A; 5CKD A; 3CCS A; 4JRP A; 1WIE A; 2Y4Y A; 3SHW A; 4XTW A; 3PVL A; 3LLR A; 1Q81 C; 2G3R A; 2RJD A; 4X34 A; 2F69 A; 1WHM A; 3HP9 A; 1KHI A; 2J6F A; 3EFO A; 1I5O B; 1G3T A; 4XK8 E; 4LD6 A; 3HL8 A; 3CCR A; 3PIO A; 2A08 A; 1WHG A; 3EG9 B; 3PGG A; 2M16 A; 1AHJ B; 4A54 A; 1YJN A; 2W10 A; 1NYF A; 1H8K A; 2MYS A; 1ZBX A; 1Q82 C; 1B34 B; 3M54 A; 1W6X A; 1PD0 A; 4KH0 B; 1VQ9 Q; 2Y4X A; 1OU8 A; 4JRI A; 4OGC A; 4FIB A; 2QAZ A; 1QVP A; 2AZV A; 1IZ6 A; 3I35 A; 1YJW A; 1WZO A; 3V8K A; 4M75 B; 1XOV A; 1SEM A; 3CBP A; 1VIE A; 4ZGD B; 1M3C A; 2LQK A; 1K9M C; 2MOX A; 2P0Q A; 1V1C A; 1UB4 A; 1YIT A; 3VS6 A; 5KYY A; 2CKK A; 2XDB A; 2RNA A; 4XQ3 A; 2D9T A; 3GIB A; 2PU9 B; 1MNE A; 2DYI A; 2V8K A; 4QQG A; 4RTW A; 1BI0 A; 3VS0 A; 4HCK A; 1JXM A; 1VIF A; 1VQ6 T; 1NYG A; 1FX7 A; 4PJO C; 1VQO T; 5CKH A; 3RBB B; 1BI2 A; 2LX7 A; 2M1H A; 4JRK A; 4WF2 A; 5IHN A; 4M78 A; 5A0G A; 3NPF A; 3SFM A; 2SRC A; 2XG8 D; 1QCO A; 3GNF B; 4HT8 A; 2VKN A; 2P0K A; 3ZEH A; 4FM4 B; 5GAM h; 5IHI A; 4C8Q E; 4CC7 A; 2D1X A; 4C0F A; 4D8D A; 3OBY A; 1B07 A; 9ATC B; 1VQM A; 2DEU A; 2LT4 A; 1H3H A; 2DF6 A; 2RA2 A; 4AFZ C; 4BI4 A; 2COZ A; 2F1L A; 1YIJ A; 3QYG B; 2AKL A; 1VQ4 A; 4C5H A; 4EMK A; 5D6X A; 5ECA A; 4M7D C; 1RLQ C; 2PNI A; 3CCJ A; 2QG9 B; 4J6X A; 5CKF A; 4FL6 A; 3EGX B; 2DRK A; 3HFN A; 3JCM f; 3TQ7 P; 5KYW B; 1QCN A; 3CCM Q; 1C0M A; 2KE9 A; 5GAO q; 4JS4 A; 1U06 A; 2FZK B; 2ZZD A; 3TU4 K; 1OUL A; 1PSE A; 5LJ3 f; 2QAS A; 4JLI A; 4LNP A; 3OBW A; 1YJ9 A; 2KQW A; 2RF0 A; 2HQE A; 2MAM A; 3G71 Q; 1W4S A; 1GRI A; 2P0P A; 5LJ3 e; 2LT1 A; 5KYU B; 3OA6 A; 4M7A C; 2BE7 D; 3VUZ A; 5CK9 A; 2A3L A; 2LVM A; 4PK4 A; 5GAO n; 2CZ7 B; 1NLO C; 3NFC A; 5I21 A; 4FW1 A; 1Q95 G; 1UEC A; 2KYM A; 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