The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MEAIAKVDFKATADDELSFKRGDILKVLNEESDQNWYKAELNGKDGFIPKNYIEMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Molecular and cellular analysis of Grb2 SH3 domain mutants: interaction with Sos and dynamin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
GRB2
|
| molecule tags |
Complex (adaptor protein/peptide)
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EPD A; 2YT6 A; 3ULR B; 1H3H A; 2F2W A; 1I0C A; 2P4R A; 3H41 A; 1FMK A; 2ED0 A; 2O2O A; 4RTZ A; 3IQL A; 4JZ3 A; 1WA7 A; 2W0Z A; 2DMO A; 4AFZ C; 1X6G A; 1ZUK A; 2PNI A; 4JJB A; 1B07 A; 1E6G A; 1MV0 B; 1WIE A; 2O88 A; 3VS3 A; 1GBQ A; 2FPD A; 2LCS A; 3VS5 A; 4ZNX A; 2RMO A; 1RLP C; 1IO6 A; 2LQN A; 1X6B A; 2ED1 A; 2CSQ A; 1ARK A; 1ABQ A; 2A37 A; 1LCK A; 1ZUU A; 3LH5 A; 2AK5 A; 2VWF A; 1WXU A; 2FRY A; 2KGT A; 2PTK A; 2DL5 A; 5IH2 A; 3C0C A; 4OMP A; 1UHF A; 1PKT A; 1QWF A; 3H0H A; 2KR3 A; 3I9Q A; 2EBP A; 1OOT A; 4QT7 A; 2GGR A; 1X2Q A; 4J9I A; 2ECZ A; 4HCK A; 3NHN A; 3M0U A; 2GTO A; 1NG2 A; 2GQI A; 1SEM A; 1UHC A; 1N5Z A; 4AFQ C; 2RQR A; 1NEB A; 2SRC A; 2CT3 A; 1UGV A; 1AWO A; 1YNZ A; 1NLO C; 3M0S A; 1UG1 A; 4JPB W; 4WCI A; 4F16 A; 2HBW A; 4Z8A A; 1UTI A; 1MV3 A; 1WXB A; 4LN2 A; 3VS6 A; 1TUC A; 1VYV A; 5GJW B; 2EGC A; 1KJW A; 2CUD A; 2RQV A; 1UEC A; 2X3X D; 1WI7 A; 1BBZ A; 2V1Q A; 3RNJ A; 1M3B A; 2LNH B; 2YUP A; 3M0R A; 4CC2 A; 5IXF A; 2L3Q A; 2G6F X; 2L3S A; 1K9A A; 1GFD A; 1OEB A; 3PE0 A; 1ZX6 A; 1T3S A; 1GFC A; 2JW4 A; 3EG0 A; 4LNP A; 2JM8 A; 2F2X A; 2JS2 A; 2JTE A; 4GLM A; 3QWY A; 2FPF A; 2D1X A; 3TSW A; 3M0P A; 1YWP A; 2YDL A; 2JXB A; 4Z88 A; 1RI9 A; 4Z89 A; 1E6H A; 1XOV A; 1CKA A; 2RQW A; 4JJD A; 2NUZ A; 3VS0 A; 4K11 A; 2H8H A; 1UJY A; 2CDT A; 1NYG A; 2BTT A; 3TVT A; 2K3B A; 2V1R A; 1HD3 A; 2CH4 W; 2CSI A; 1J3T A; 5IHN A; 2DNU A; 2NWM A; 3VS4 A; 2L0A A; 1W1F A; 2KE9 A; 4OMQ A; 1BK2 A; 3EG2 A; 1H8K A; 1PRL C; 5ECA A; 1AZE A; 4F17 A; 2O9S A; 2PZ1 A; 3H0I A; 1M8M A; 2KRO A; 3O5Z A; 2AZV A; 1ZBJ A; 1YCS B; 4GBQ A; 3M0T A; 4RTY A; 1AOJ A; 2F2V A; 2DRM A; 2HSP A; 1BB9 A; 2JMC A; 1K0X A; 1WXT A; 2DL4 A; 2C0I A; 4F14 A; 1W6X A; 1YN8 A; 1M27 C; 3NPF A; 2KT1 A; 3I35 A; 4HXJ A; 3EHR A; 2RN8 A; 1PHT A; 1SRM A; 1WFW A; 2J06 A; 1KSW A; 4AG1 C; 1CKB A; 3VS7 A; 2B86 A; 2J05 A; 5FW9 A; 3UA7 A; 2C0O A; 4M4Z A; 3UAT A; 4RTU A; 2A36 A; 2RQT A; 3KFV A; 2CT4 A; 3A98 A; 4J9H A; 1GRI A; 4LUD A; 3QWX X; 1NEG A; 2FRW A; 2J6K A; 2LP5 A; 1ZUY A; 3M0Q A; 2CUB A; 1GCQ A; 4LUE A; 2BZ8 A; 1UFF A; 2LZ6 B; 2MIO A; 1ZLM A; 3VS1 A; 1U06 A; 1B3Q A; 2YUQ A; 1NYF A; 5HCK A; 1OPK A; 1W70 A; 4CC3 A; 4IIO A; 1AD5 A; 1SPK A; 1A0N B; 1I07 A; 4ORZ A; 2DVJ A; 2EYX A; 4X1V A; 5GJV B; 4CC7 A; 1JQQ A; 1JXM A; 1BU1 A; 1M3C A; 2FG0 A; 2JS0 A; 1SHF A; 1VA7 A; 2VKN A; 4J9G A; 3R6N A; 2K9G A; 3EG3 A; 2DBK A; 2K79 A; 2KXD A; 3UA6 A; 1K76 A; 4J9E A; 1AWW A; 1AEY A; 2DLP A; 1WX6 A; 5L23 A; 1WYX A; 4R0K A; 1U3O A; 2EW3 A; 1H92 A; 1WLP B; 2EGE A; 2KNB B; 3VRZ A; 1E7O A; 2GNC A; 3CQT A; 1JU5 C; 4D8K A; 4Y92 A; 2DA9 A; 2EYZ A; 2HEQ A; 2LJ1 A; 2D8H A; 1RUW A; 2A28 A; 1VYT A; 1X69 A; 2MCN A; 2M51 A; 2RPN A; 2KXC A; 3NMZ C; 1UDL A; 2O9V A; 1JEG A; 2GTJ A; 4CC4 B; 2XMF A; 2BZY A; 5I22 A; 2AKL A; 1PNJ A; 2DJQ A; 2LQW A; 3I5R A; 4AFU C; 1GL5 A; 4HVW A; 2LJ3 A; 2X3W D; 1TG0 A; 4JJC A; 2DBM A; 2ABL A; 3JV3 A; 1Z9Q A; 1GBR A; 2EGA A; 1QCF A; 2JT4 A; 4OMO A; 2KEA A; 4OML A; 1QKW A; 1SSH A; 2A08 A; 2DF6 A; 2JMA A; 5IHI A; 4J9C A; 2FEI A; 1T3L A; 2O31 A; 2CH4 A; 2M0Y A; 2DRK A; 2KRS A; 2LJ0 A; 2LX7 A; 2OJ2 A; 2VVK A; 1KIK A; 1T0J A; 3VRY A; 2L2P A; 2I0N A; 1X2K A; 4J9F A; 2DL7 A; 3ZL7 C; 1GCQ C; 1S1N A; 2FPE A; 1JO8 A; 4RTT A; 3PVL A; 2ESW A; 3EGU A; 1M3A A; 5EC7 A; 3REB B; 2AKK A; 3FJ5 A; 1YP5 A; 4DEY A; 3UF4 A; 4JZ4 A; 1V1C A; 2C0T A; 2DX1 A; 2W10 A; 4IIM A; 4ESR A; 2RNA A; 2DE0 X; 1FYN A; 2AZS A; 1AWJ A; 1QKX A; 1CSK A; 1QLY A; 1GCP A; 2RF0 A; 2D0N A; 1Y57 A; 4OMN A; 2EYW A; 3TSZ A; 5FWB A; 4RTV A; 1ZSG A; 2QDL A; 2DM1 A; 2J6F A; 2K2M A; 2SEM A; 1PRM C; 3PVQ A; 1VYU A; 3SEM A; 1AZG B; 1M30 A; 4RTW A; 2ROT A; 5I11 A; 5IXB A; 2IIM A; 3EG1 A; 1KFZ A; 4E6R A; 2J7I A; 1HJD A; 2DL3 A; 1MUZ A; 2KBT A; 4DEX A; 2HDA A; 1K4U S; 1AVZ C; 1RLQ C; 3H0F A; 2E5K A; 4J9D A; 1G83 A; 2KRM A; 3VS2 A; 1OV3 A; 2K6D A; 2MOX A; 1EFN A; 1HSQ A; 1K1Z A; 4RUG A; 1UUE A; 4RTX A; 1K0S A; 2K7A A; 2LMJ A; 1ABO A; 1QWE A; 2RQU A; 1NM7 A; 5IHK A; 4AG2 C; 2KYB A; 1G2B A; 2J6O A; 2FO0 A; 3EHQ A; 4AFS C; 2EVR A; 2L3P A; 1SRL A; 1PKS A; 2EQI A; 2EYY A; 5FWC A; 4HVV A; 1UE9 A; 1U5S A; 1T0H A; 2ENM A; 1NLP C; 2YSQ A; 3REA B; 2YUN A; 1AWX A; 2KYM A; 4D8D A; 3THK A; 1X43 A; 2YUO A; 2EKH A; 4HVU A; 2DIL A; 2KRN A; 1JXO A; 2ROL A; 2DYB A; 2OAW A; 3RBB B; 3I5S A; 3SHW A; 1I1J A; 4A63 B; 1YWO A; 2CRE A; 2BZX A; 1SHG A; 1OPL A; 1WDX A; 4FSS A; 2HCK A; 4LE9 A; 1TUD A; 4J9B A; 1Y0M A; 2KT8 A; 4OMM A; 2D8J A; 2JM9 A; 4EIK A; 4KRT A; 2DL8 A; 1Z9Z A; 2GBQ A; 1UJ0 A; 3U23 A; 2OI3 A; 1PWT A; 1X27 A; 3NGP A; 3GBQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2YT6 A; 3ULR B; 3A1P A; 5KCH A; 3H41 A; 4C0Z A; 2ED0 A; 1VQL Q; 1AHJ B; 2QGG A; 1WA7 A; 1ZSZ C; 2W0Z A; 5GAN h; 2VGM A; 1E6G A; 3CC7 Q; 3R6O A; 3JCM h; 1VQN T; 4XQ3 A; 4XU1 A; 1IO6 A; 4M7A D; 2WAC A; 2ZAE A; 4C8Q G; 3EGD A; 2KK4 A; 2DIG A; 3QII A; 4PFZ A; 1K8A R; 4M78 G; 2AK5 A; 1WXU A; 1VQ6 A; 5CKD A; 1YI2 A; 3C0C A; 4BDZ A; 1YIT A; 4OP0 A; 4A54 A; 1QWF A; 1LNX A; 4QKU A; 2KR3 A; 3CCJ Q; 4QT7 A; 3OS0 A; 1X2Q A; 4J9I A; 4M77 E; 2ECZ A; 4HCK A; 3NHN A; 2GTO A; 3GIB A; 4DQ2 A; 4M7A F; 5GAN g; 4BUG A; 4JJN K; 2B8A A; 4L5G A; 1SEM A; 3CCJ T; 2MAM A; 2FZC B; 2FL7 A; 1Q86 U; 5IT9 E; 4AFQ C; 4Z02 A; 1OU8 A; 1NEB A; 3JCM g; 2O4X A; 1AWO A; 1KQ2 A; 2QTX A; 2DXC A; 5KYY A; 1M1G A; 3UT1 A; 1Y96 A; 3PNW C; 4PJO B; 2NUT B; 1B7T A; 1KC8 R; 5GJW B; 1KJW A; 4RMO A; 1BI1 A; 5D6W A; 2KVQ G; 1IGU A; 2QQ9 A; 4NOY A; 1FMW A; 1OU9 A; 3RNJ A; 3EFR A; 3M0R A; 3TEE A; 4CC2 A; 2G6F X; 1GFD A; 4FT2 A; 1ZX6 A; 1T3S A; 3L2W A; 3MP1 A; 4XTX A; 5GMK j; 5C0M A; 1YHQ A; 2HL5 C; 2D1X A; 5FRN A; 2VGN A; 1VQM Q; 3SWN A; 3VJP A; 2HNI A; 2YDL A; 2DZC A; 4Z88 A; 3CXC A; 2YHT A; 3EFO A; 2CS7 A; 3X28 B; 2DXU A; 2K5L A; 1WNL A; 3MEV A; 1Q81 C; 1XOV A; 1VQO Q; 3VS0 A; 2H8H A; 2X35 A; 2CDT A; 2WSE E; 3RMS A; 3TVT A; 4MZT A; 2OTL T; 2K3B A; 1YFN A; 1VQO T; 1V29 B; 5AYF A; 2RHZ A; 1M90 U; 2BKD N; 3J7A F; 5GAO m; 2MPX C; 1H64 1; 1D1C A; 2PVO B; 4OB2 B; 3ZBD A; 1PSF A; 3EG2 A; 5D6X A; 3JRZ A; 2PQW A; 1R0C B; 4F17 A; 3BW1 A; 1D0Z A; 2O9S A; 3JB9 H; 1M9S A; 1YIJ Q; 4O5V A; 1M8M A; 2AZV A; 1Q82 C; 1VQ9 Q; 4GBQ A; 3M0T A; 4C5I A; 2DRM A; 1MMG A; 2I2L A; 1HK9 A; 4F7U F; 3CD6 Q; 1IRE B; 1W6X A; 2H3E B; 1BCO A; 4HXJ A; 3G71 T; 4C92 B; 2QAS A; 3EHR A; 2RN8 A; 5GMK e; 2J06 A; 3OQ5 A; 3CD6 T; 4FSX A; 1VQ7 A; 1LJO A; 3OYG A; 3JB9 G; 4M4Z A; 4TVR A; 2RJF A; 1F1B B; 2RJE A; 3EG9 B; 4RTU A; 3CCS T; 4N4G A; 1VUB A; 2CT4 A; 1VOM A; 5KYN A; 2J6K A; 4JRQ A; 5HK3 A; 1VQ7 T; 3QSU A; 1GCQ A; 1N8R R; 4C0D B; 1QVF S; 3CC4 A; 1UFF A; 3VS1 A; 2EQJ A; 4XTZ A; 3CCE Q; 1M4Z A; 3LGF A; 3RR6 A; 1OPK A; 1W70 A; 4B6M A; 1N9R A; 2COY A; 4BY6 C; 3JAM E; 4RKU E; 5FRO A; 4C8Q D; 2LX9 A; 1M1K C; 1QVG A; 5LJ5 d; 2D9T A; 4KUD K; 1M3C A; 2M1H A; 4J9G A; 4M78 D; 2K9G A; 3SWN B; 2MMP A; 5D7U A; 2ZPH B; 4OB3 B; 1OX8 A; 4J9E A; 3L2U A; 3M59 A; 4Q5W A; 3MEA A; 2EJF A; 2QQB A; 1U3O A; 4EMK B; 4C8Q F; 2DVE A; 1WLP B; 2EGE A; 2EAY A; 4FM4 B; 1HXD A; 3F70 A; 4OF1 A; 3BDU A; 3VUB A; 2EYZ A; 3FJP A; 4M7A B; 2G3R A; 5GAN 2; 4NS5 A; 2ATC B; 3MPU B; 3VU3 C; 1K9M C; 3OYL A; 1UDL A; 2DJZ A; 4QQ6 A; 4JDS A; 3CC2 Q; 2HQX A; 3CCR T; 1WHM A; 3CEY A; 3JCM W; 4J83 A; 2DJQ A; 2XK0 A; 1P92 A; 2X3W D; 1WQW A; 2DBM A; 2ABL A; 2BUD A; 1Z9Q A; 4E7H A; 1GBR A; 2X4J A; 1BYM A; 2EGA A; 1KQ1 A; 4LXC A; 2KEA A; 4OML A; 5LJ5 j; 2O31 A; 1OYX A; 1Q95 G; 5LJ3 f; 2AIR B; 1I5O B; 5A0G A; 3M56 A; 4HA8 A; 3VRY A; 3ZL7 C; 2EKO A; 1S1N A; 1D3B B; 4M7D D; 2QA4 A; 1LOJ A; 5EC7 A; 3REB B; 1WJQ A; 4HCB A; 2JNG A; 5CVI A; 1IRX A; 3HHT B; 4IIM A; 3E2U A; 2DE0 X; 4XTY A; 5DLQ E; 1QLY A; 1ACM B; 1KHI A; 4M78 A; 5FWB A; 1ZSG A; 2DM1 A; 7AT1 B; 1PRM C; 4M7D F; 3I56 A; 4RTW A; 1JJ2 S; 1U1S A; 1BI3 A; 2J7I A; 4KUI A; 1WPY A; 2CZ6 B; 4IKF A; 1RL2 A; 1S72 T; 4QW2 A; 1RLQ C; 3OYN A; 4J9D A; 3CCQ T; 3CXC S; 3I56 T; 2K6D A; 3CCV A; 3I55 Q; 1K0S A; 2A3L A; 1VIE A; 2E6N A; 3TRE A; 5LJ3 h; 1NM7 A; 3SD4 A; 4B9W A; 4AG2 C; 3JB9 D; 2CP7 A; 2KYB A; 1KC8 C; 4MDX A; 3OSS C; 2FO0 A; 2EVR A; 2L3P A; 3I55 T; 1UE9 A; 1U5S A; 2YSQ A; 3CCV T; 1KQS P; 3L2Z A; 1TSF A; 4ZN1 A; 2EKH A; 3J81 E; 4QVD A; 4JUV A; 1G5V A; 3G6E Q; 3SHW A; 4RCB A; 4A63 B; 1YWO A; 1YJ9 Q; 4M7A G; 2DFU A; 4EMH A; 2BZX A; 1SHG A; 2P4T A; 4FSS A; 3G4S Q; 3HSB A; 3G6E T; 2HCK A; 1W2B P; 3VYG A; 1VQ5 A; 3GNF B; 3VKI A; 1Y0M A; 2VYT A; 2XD0 A; 2KT8 A; 1PCX A; 1FX7 A; 3EGX A; 4FIB A; 3BY7 A; 4M77 F; 5LJ3 g; 1VQ4 Q; 3GBQ A; 3TCJ A; 3PMT A; 5GAN 4; 1UGP B; 1H3H A; 2Y4X A; 2F2W A; 2QQR A; 3OMG A; 2P4R A; 1FMK A; 2NUP A; 4RTZ A; 4JZ3 A; 1VQ4 T; 1YJW T; 3L2Q A; 1C6V X; 5FU7 B; 4NL2 A; 2DTO A; 2DMO A; 4AFZ C; 1RI0 A; 1VIF A; 1ZUK A; 2PNI A; 3SFM A; 1B34 B; 5KH6 A; 4B9X A; 3NFC A; 3ZEH A; 1N27 A; 2HQH A; 4O6J A; 5GAO r; 4HKE A; 3PMI A; 4M77 C; 1KG1 A; 2GF7 A; 1GBQ A; 2FPD A; 3H8Z A; 3VS5 A; 2EJG A; 1IHV A; 2NLU A; 3AHU A; 4C8Q B; 2DEQ A; 2ED1 A; 2RM4 A; 3A8L B; 2CSQ A; 3D7S B; 1ARK A; 1ABQ A; 1OQK A; 4M78 B; 3LH5 A; 2PVD B; 2ZPB B; 1MHN A; 2FRY A; 4OVA A; 5IH2 A; 3HFN A; 3NTH A; 2ZCF B; 1PKT A; 4IUR A; 1VQP Q; 2EBP A; 2R58 A; 4EPC A; 1QVG S; 4II1 A; 2E1H A; 4BDY A; 2KI7 A; 2XDD A; 1VQP T; 2E64 A; 2E3I A; 3CCL A; 1N5Z A; 2RQR A; 4ZTF A; 2CT3 A; 3QDR B; 3M55 A; 3LYI A; 3ZFJ A; 2HAX A; 1NLO C; 3M0S A; 1WHG A; 3UDC A; 5CKE A; 4WCI A; 1MV3 A; 1WJS A; 1WXB A; 4LN2 A; 3CME Q; 3VS6 A; 2FHD A; 1N8R C; 4F7U G; 1PG5 B; 2RJD A; 4PJO A; 2NUT A; 4JRP A; 2FB7 A; 4M75 C; 4KH1 B; 2HQE A; 1VQK Q; 5IXF A; 2IPO B; 3QZ5 B; 3OSV A; 3HP9 A; 1TXQ A; 3CMA Q; 2GFA A; 2JM8 A; 2JTE A; 2HBP A; 3OB9 A; 4GLM A; 1NJI U; 5GAN 8; 2DEU A; 3JCM b; 1PD0 A; 1WQ7 A; 3PFS A; 2DTI A; 3J80 E; 4C0G A; 3OYK A; 1RI9 A; 1C0M A; 2E5Q A; 3CCU A; 3QBY A; 4ELZ C; 1E6H A; 3OYF A; 2RQW A; 1CKA A; 2NUZ A; 4JS5 A; 4M7D B; 4FYY B; 1UJY A; 4PJJ A; 9ATC B; 2NUP B; 5FU6 C; 4FU6 A; 4QQD A; 3PT9 A; 3QG1 A; 1VQN A; 2DNU A; 5GMK i; 3OBY A; 3CCU T; 4OMQ A; 1BK2 A; 1TUG B; 2JZ2 A; 3UPU A; 1QP3 A; 3X25 B; 4MDW A; 1VQL T; 3CBP A; 2PU9 B; 2KRO A; 1NZ9 A; 4HT9 A; 3O5Z A; 2DER A; 1UB4 A; 1YCS B; 4PFO A; 2L3R A; 3RDV A; 2MYS A; 1K0X A; 1WXT A; 2C0I A; 3CC7 T; 4C5G A; 1YN8 A; 1QW1 A; 3OA6 A; 4DOV A; 3CCJ A; 1WFW A; 5CCA A; 1ZA2 B; 2E6Z A; 1KSW A; 4J8O A; 4AG1 C; 3OYJ A; 4C92 A; 1MMA A; 3UA7 A; 2C0O A; 2CGH A; 1RAC B; 4A4H A; 1ZSZ A; 4IUU A; 1N6A A; 1XQH A; 1GRI A; 4LUD A; 4J7I A; 2OAU A; 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