The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MEAIAKVDFKATADDELSFKRGDILKVLNEESDQNWYKAELNGKDGFIPKNYIEMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Molecular and cellular analysis of Grb2 SH3 domain mutants: interaction with Sos and dynamin.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Complex (adaptor protein/peptide)
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
GRB2
|
| total genus |
10
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3VS6 A; 1T3S A; 2F2W A; 4J9D A; 2RN8 A; 2CT4 A; 1SEM A; 2O2O A; 2EKH A; 4OMP A; 2K3B A; 1PHT A; 1AWJ A; 1QKW A; 2W10 A; 2RQV A; 1FMK A; 1SRM A; 1G83 A; 2JT4 A; 4Z88 A; 2KT1 A; 1TUD A; 4LNP A; 5IHK A; 1U5S A; 2FRW A; 3PVL A; 1K9A A; 1KFZ A; 1X27 A; 1WYX A; 2VWF A; 3PE0 A; 4HVU A; 4LUD A; 5IHI A; 1QLY A; 1W70 A; 1WDX A; 2O9V A; 2GTJ A; 4AFS C; 4RTY A; 1AZE A; 3LH5 A; 4HCK A; 2ESW A; 5FWB A; 3I5R A; 1I1J A; 1OPL A; 3H0H A; 1YWO A; 1WI7 A; 1UE9 A; 2W0Z A; 2HEQ A; 2M51 A; 5IH2 A; 4HVW A; 1HJD A; 2FEI A; 2YDL A; 4J9E A; 2GTO A; 3M0R A; 3NHN A; 2M0Y A; 2RPN A; 1YNZ A; 1J3T A; 2PZ1 A; 4RTX A; 2LX7 A; 3O5Z A; 3UA6 A; 2ENM A; 1ZLM A; 1MV3 A; 2ROL A; 1E6G A; 2IIM A; 2KT8 A; 2LQN A; 4AFU C; 1ABQ A; 2EYY A; 4RTT A; 2KYB A; 1Z9Q A; 2KXD A; 1CSK A; 2KRN A; 2RNA A; 3NGP A; 2LZ6 B; 2O9S A; 4JZ4 A; 2RQR A; 1VA7 A; 2DL5 A; 1SPK A; 2J05 A; 1K0X A; 1ZUY A; 2MIO A; 3UF4 A; 2LQW A; 2EYX A; 2AK5 A; 4M4Z A; 1BBZ A; 3JV3 A; 5ECA A; 2ED1 A; 1JXO A; 2J06 A; 1UFF A; 2DL7 A; 1ZBJ A; 2LCS A; 1U06 A; 4LN2 A; 2YUN A; 1GL5 A; 3M0Q A; 1AWW A; 3VS3 A; 1NEB A; 2XMF A; 4AFQ C; 1BU1 A; 4CC7 A; 2MCN A; 2KXC A; 4Z8A A; 4J9F A; 2KGT A; 1UHC A; 1GFD A; 2O88 A; 2J6O A; 4WCI A; 2FO0 A; 2SRC A; 1K76 A; 1PKT A; 2GGR A; 2J7I A; 1WXU A; 1WX6 A; 2OI3 A; 1RI9 A; 2LJ3 A; 3I5S A; 1PKS A; 3CQT A; 1K1Z A; 2HCK A; 1OV3 A; 2EYZ A; 3TVT A; 1UEC A; 1NEG A; 3TSZ A; 3M0T A; 3TSW A; 2MOX A; 1NLP C; 4KRT A; 2EGC A; 2FPF A; 4K11 A; 2EW3 A; 4D8D A; 3EHR A; 2A08 A; 1W1F A; 2A37 A; 3H41 A; 2DMO A; 1X2K A; 4OMO A; 4JJB A; 1X43 A; 1E6H A; 1VYT A; 1WIE A; 2GNC A; 2JMC A; 1B07 A; 2B86 A; 1PRM C; 2HSP A; 2YUQ A; 3SHW A; 4DEY A; 2DE0 X; 3EG2 A; 5IXB A; 1NLO C; 4GBQ A; 3R6N A; 1PRL C; 4AG1 C; 2C0T A; 2KRM A; 4E6R A; 2DNU A; 2DJQ A; 1KJW A; 2DYB A; 1YCS B; 2CUB A; 1AWX A; 3M0U A; 1NG2 A; 4F16 A; 2L3S A; 4AG2 C; 2CT3 A; 4AFZ C; 2D1X A; 1Y57 A; 1H3H A; 1EFN A; 1JQQ A; 2CSQ A; 1ABO A; 1MV0 B; 1T0H A; 2JW4 A; 4F14 A; 4OMQ A; 2KYM A; 1GRI A; 3H0I A; 1ZUU A; 5I22 A; 1OEB A; 2A36 A; 1S1N A; 2L0A A; 3VS2 A; 3RBB B; 1WXT A; 1GCP A; 1GBR A; 2HDA A; 3VS7 A; 2OJ2 A; 3VS0 A; 3VRZ A; 4D8K A; 3RNJ A; 2JTE A; 1B3Q A; 2C0I A; 1AVZ C; 2DM1 A; 1UHF A; 4OMM A; 1I07 A; 1JXM A; 2RQW A; 2PTK A; 1XOV A; 1GCQ A; 1TUC A; 3I9Q A; 5IXF A; 2LJ1 A; 1PNJ A; 1T0J A; 4RTZ A; 4CC2 A; 3REA B; 3GBQ A; 4A63 B; 2DL3 A; 5I11 A; 3ULR B; 2QDL A; 2DL4 A; 2YT6 A; 2KNB B; 4RUG A; 2JXB A; 3UAT A; 2HBW A; 2ABL A; 1QWF A; 4HXJ A; 3VRY A; 1CKB A; 2JM9 A; 2CSI A; 1X6B A; 3EG1 A; 2JS2 A; 1VYV A; 1VYU A; 1JO8 A; 1OPK A; 2EVR A; 3ZL7 C; 2BTT A; 2FPD A; 1SRL A; 4LUE A; 4CC3 A; 2RQT A; 2CUD A; 1M8M A; 1RLQ C; 1E7O A; 3A98 A; 2DLP A; 1TG0 A; 1WFW A; 2L3Q A; 3C0C A; 2AZS A; 2CH4 W; 2CH4 A; 1M3C A; 2OAW A; 2BZY A; 2PNI A; 2I0N A; 1SHG A; 2FPE A; 1MUZ A; 1H8K A; 2KEA A; 4IIM A; 1LCK A; 2DRM A; 2H8H A; 2LJ0 A; 1H92 A; 1X69 A; 2DF6 A; 5GJV B; 2K2M A; 3QWX X; 2YUO A; 3M0S A; 3H0F A; 3VS5 A; 2L2P A; 4J9C A; 2F2X A; 1UDL A; 1M27 C; 3THK A; 3FJ5 A; 2KBT A; 3IQL A; 1BK2 A; 1NM7 A; 2DBK A; 4OML A; 2ECZ A; 4RTW A; 4F17 A; 2EPD A; 1QWE A; 1W6X A; 1JU5 C; 4FSS A; 5FWC A; 1NYG A; 2J6F A; 1IO6 A; 2JS0 A; 2K7A A; 4CC4 B; 2CRE A; 4QT7 A; 2BZ8 A; 2AKK A; 4ZNX A; 2P4R A; 2KRS A; 1Z9Z A; 5IHN A; 3EGU A; 2GBQ A; 3REB B; 1WA7 A; 4X1V A; 1N5Z A; 2VKN A; 4ESR A; 2LP5 A; 1HSQ A; 2K6D A; 1RLP C; 5EC7 A; 1AOJ A; 1JEG A; 1AEY A; 1K4U S; 1M30 A; 2JM8 A; 4JZ3 A; 2CDT A; 2V1Q A; 3UA7 A; 4LE9 A; 2D0N A; 4J9G A; 1UTI A; 2X3X D; 4Y92 A; 2BZX A; 1V1C A; 4GLM A; 1CKA A; 4J9I A; 5L23 A; 2EGE A; 2EYW A; 3U23 A; 2RQU A; 1GBQ A; 2V1R A; 1AWO A; 3EG3 A; 3NMZ C; 1X6G A; 2AZV A; 3NPF A; 5FW9 A; 3SEM A; 2GQI A; 2F2V A; 4ORZ A; 1M3B A; 1KIK A; 1GCQ C; 2KRO A; 2X3W D; 1BB9 A; 1YP5 A; 3KFV A; 2FRY A; 4JJD A; 2D8J A; 4HVV A; 1AD5 A; 2J6K A; 1HD3 A; 1G2B A; 1UUE A; 1QKX A; 2L3P A; 2YUP A; 1X2Q A; 1SHF A; 2D8H A; 1U3O A; 2FG0 A; 2JMA A; 1UG1 A; 2RMO A; 1SSH A; 2DVJ A; 1ZSG A; 1T3L A; 1UGV A; 4J9B A; 5HCK A; 2DL8 A; 1FYN A; 1UJ0 A; 2KR3 A; 1YN8 A; 4DEX A; 4JJC A; 1GFC A; 1M3A A; 1WLP B; 3EHQ A; 2A28 A; 2DRK A; 3I35 A; 3PVQ A; 1UJY A; 3M0P A; 1PWT A; 4RTV A; 5GJW B; 2VVK A; 2DA9 A; 2EBP A; 2E5K A; 1RUW A; 2KE9 A; 3EG0 A; 2EGA A; 4OMN A; 1QCF A; 2DBM A; 3QWY A; 2O31 A; 4EIK A; 1AZG B; 4RTU A; 1OOT A; 2LNH B; 1WXB A; 4Z89 A; 4JPB W; 4IIO A; 2LMJ A; 3VS4 A; 2SEM A; 2ED0 A; 2K9G A; 1NYF A; 2EQI A; 1I0C A; 2RF0 A; 2DIL A; 2ROT A; 2AKL A; 4J9H A; 1ARK A; 1K0S A; 1ZUK A; 4R0K A; 2K79 A; 1YWP A; 2YSQ A; 2G6F X; 2NWM A; 2NUZ A; 2C0O A; 1ZX6 A; 1Y0M A; 1A0N B; 1KSW A; 2DX1 A; 3VS1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3VS6 A; 3HP9 A; 4OMF B; 1I5O B; 1QVP A; 4E7S A; 2CT4 A; 1VQN Q; 5HY6 A; 4A4H A; 4L6V 5; 1QKW A; 3DKM A; 1YJN Q; 4FL6 A; 3FLG A; 1U1S A; 3JB9 F; 4C92 A; 3H6Z A; 3MP1 A; 4C0D C; 4Z88 A; 3PIP A; 4LD9 K; 1ZA2 B; 2KT1 A; 3CC4 Q; 1K8A R; 2DAQ A; 3MPU B; 4M7D D; 2MF2 A; 5EG2 A; 1JJ2 S; 5IHI A; 1JJ2 A; 4RTY A; 1UGQ B; 1EX4 A; 3G4S A; 3I5R A; 3OS2 A; 1I1J A; 4FSX A; 1VQ7 Q; 1YWO A; 4C5I A; 2M51 A; 2OAU A; 1N6A A; 4HVW A; 2HKN A; 1TXQ A; 5CO7 A; 1HJD A; 4J9E A; 1W2B S; 2LDM A; 2QA4 T; 1W2B A; 4DOW A; 3T9N A; 1M2O A; 2L5Q A; 3JCM Q; 1Q7Y R; 2OTL T; 3QYH B; 4LDY A; 3O5Z A; 1VQP A; 4FU6 A; 1RAE B; 1ZLM A; 2ROL A; 3VYH B; 2L89 A; 3QHS A; 2KT8 A; 3S6W A; 3TU4 K; 2KYB A; 2KXD A; 2KQW A; 2KRN A; 3NGP A; 3P8B B; 1SF9 A; 2PVG B; 1MMN A; 1YJ9 T; 4JZ4 A; 1VA7 A; 4M78 C; 4M77 C; 3G1J A; 2RJE A; 1VQL T; 5C0M A; 2MIO A; 2LQW A; 3FB9 A; 1KQS P; 5KYW B; 1NJI C; 4MZT A; 1M2V A; 3CCE Q; 1BBZ A; 2EAY A; 3JV3 A; 5GAO n; 4KUL A; 1WJQ A; 4KGV B; 3HRU A; 4C8Q B; 4HCB A; 4QVZ A; 4BE0 A; 2QAZ A; 2XHC A; 2E6Z A; 5GAO r; 1YJW T; 1BU1 A; 2MCN A; 4BDZ A; 4BB7 A; 3CCQ A; 4J9F A; 2KGT A; 2ZZD A; 3OYC A; 2J6O A; 4WCI A; 4WF2 A; 3OYG A; 4DBF A; 4QQG A; 4M7D G; 1M1F A; 2OI3 A; 4GLK A; 5DY9 A; 4ME7 A; 4MDW A; 2RK1 A; 4A54 A; 3GF5 A; 4FIB A; 2COZ A; 1NLP C; 4M75 D; 4IUU A; 2JTM A; 2FPF A; 4KGX B; 4OB0 B; 1FWZ A; 2A08 A; 2A37 A; 1N8R C; 1VQ4 A; 1OZ2 A; 4HCC A; 2JJ9 A; 1X2K A; 2NUP A; 4OMO A; 5HK3 A; 3X25 B; 1YIJ A; 5AT1 B; 5GAM j; 2YUQ A; 1X75 C; 1LNX A; 3OYB A; 4A4G A; 4C8Q F; 4KBM B; 2DE0 X; 5IXB A; 1NLO C; 2LQK A; 5LJ5 d; 2XDP A; 1BIA A; 1VQ9 Q; 1PRL C; 4AG1 C; 5GAN h; 3A5Z B; 2M16 A; 2DER A; 3JSC A; 2DJQ A; 2DYB A; 3E9G A; 3P8D A; 2CUB A; 3CXC S; 3M0U A; 1HXD A; 3KXT A; 2CP5 A; 4BY6 C; 3CXC A; 3C4S A; 3SWN B; 1Y57 A; 1EFN A; 3C12 A; 2E70 A; 1VQM Q; 5LJ5 g; 4OMQ A; 1XTD A; 3FRN A; 4KT0 E; 3HHT B; 3OS1 A; 1K73 U; 1OEB A; 2A36 A; 1S1N A; 2L0A A; 1WXT A; 2CP2 A; 1VQK T; 1GBR A; 3VS0 A; 1YHQ A; 2FZC B; 2RK2 A; 4PJO G; 2DM1 A; 3LWH A; 2ZPF B; 1WZO A; 4E7L A; 3L2U A; 5IXF A; 3OYA A; 1QP3 A; 4RTZ A; 1M9S A; 4IUT A; 3REA B; 3TEE A; 1SSF A; 2COW A; 4RUG A; 3CPW S; 3UAT A; 1QWF A; 3CPW A; 2AHJ B; 1Q95 G; 4M78 A; 1PM3 A; 4X34 A; 3EG1 A; 2JS2 A; 4C0D B; 4Y28 E; 2BTT A; 4OB3 B; 2RB6 A; 2CUD A; 3BW1 A; 5CVI A; 4PJM A; 4KH1 B; 3SB2 A; 1RLQ C; 8AT1 B; 1TG0 A; 3TQ7 P; 1WFW A; 2R5A A; 3OYN A; 3EFO A; 4PJN A; 2CH4 W; 1VQ5 T; 1M3C A; 2BZY A; 2PNI A; 1VIF A; 3D7S B; 4XTX A; 5DLO A; 2FHD A; 2CYZ B; 1IGU A; 2X4X A; 2CZ1 B; 4TVR A; 1KD1 C; 4XQ3 A; 2K2M A; 1RAA B; 3CCV Q; 3CD6 A; 1D0Y A; 2WSF E; 2QA4 Q; 1M27 C; 2K5L A; 5KYX A; 3FJ5 A; 1RAH B; 2OTJ Q; 1OU9 A; 5GAM e; 2ECZ A; 3RUX A; 5D7U A; 1QWE A; 1NJI U; 2VUB A; 3V8J A; 4R56 A; 5KYY A; 5FWC A; 4ZN3 A; 2NUT B; 2J6F A; 1IO6 A; 1VQ6 Q; 4N4G A; 4QT7 A; 4J7I A; 1Y71 A; 2IG0 A; 3OMG A; 4KGZ B; 1KQ2 A; 2KK4 A; 1YJ9 Q; 1ZQ1 A; 1VQL Q; 2RA2 A; 3JB9 H; 4M7A E; 5EC7 A; 2JZ2 A; 1RAD B; 1AOJ A; 1AEY A; 3ME9 A; 3E1S A; 1S72 T; 3I55 T; 2CDT A; 1VQO T; 2VV5 A; 3EG9 B; 3ZBD A; 1MMA A; 4Y92 A; 2M02 A; 4WTO B; 2BZX A; 3J81 E; 1VQN T; 1C6V X; 4XTZ A; 4RCB A; 1RL2 A; 3U23 A; 5GAN 8; 1AWO A; 3BDU A; 1YJN T; 1N27 A; 1WHM A; 2QK0 A; 1WHK A; 3NPF A; 1N8R R; 5FLX E; 1YI2 A; 2DXU A; 1IRX A; 3CC4 T; 1GCQ C; 3JCM f; 2KRO A; 2FRY A; 2MI6 A; 4JJD A; 4NL2 A; 4HVV A; 2DFU A; 1YIT T; 5CCA A; 2RHI A; 4OB1 B; 7AT1 B; 1D0X A; 1Y7X A; 3CCS A; 3EGX B; 3S3O A; 1LJO A; 1X2Q A; 1SHF A; 4EDU A; 1U3O A; 1Q86 U; 2LTO A; 1VQ7 T; 3CCM Q; 2RJC A; 1SSH A; 4QKU A; 2DTH A; 3ER0 A; 1UGV A; 1SKU B; 2DL8 A; 3MKD A; 2KR3 A; 3R6O A; 4DEX A; 2E3H A; 1TSF A; 2XDD A; 3EHQ A; 2A28 A; 2E3I A; 5GJW B; 2VVK A; 3RKX A; 5A2Q E; 3CPF A; 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3LW5 E; 1VQ9 T; 4IKF A; 3SDZ A; 2HQE A; 2E41 A; 3I56 T; 2RNA A; 3M58 A; 2LQ8 A; 4MML A; 2LZ6 B; 2RO0 A; 2ZPI B; 2YRD A; 2KMT A; 4QW2 A; 1D1B A; 5GAN 7; 1K0X A; 4C92 E; 1WHL A; 5GAN 5; 2EYX A; 1FMV A; 1VQM T; 3G6E A; 5FRO A; 5D6W A; 1JXO A; 1B7T A; 5GAN f; 3L2W A; 2RD1 A; 1M8V A; 2P0Q A; 2LCS A; 1RAF B; 2YLB A; 4C8Q E; 2YUN A; 3OBY A; 3M0Q A; 1AWW A; 1NEB A; 4AFQ C; 4CC7 A; 1WJS A; 3QKJ A; 4PLL A; 1I5L A; 1YCY A; 1GFD A; 1NPP A; 1K76 A; 3VJP A; 2J7I A; 4FT4 A; 4NL3 A; 1BI3 A; 1LOJ A; 1RI9 A; 3I5S A; 1PKS A; 1Y96 B; 3CCJ A; 1ZSZ B; 2HMA A; 4ZN1 A; 4DQ2 A; 1D1C A; 3TVT A; 3JCM P; 4N4I A; 4E47 A; 3EGD B; 3TSW A; 4JRQ A; 2EGC A; 5DM7 R; 2RJD A; 3M57 A; 3JB9 J; 1B34 B; 3OYH A; 2EW3 A; 2JVV A; 3ZFJ A; 2DMO A; 3OW2 P; 1QQJ A; 3V8K A; 4JJB A; 2OX7 A; 1HK9 A; 1MMG A; 2E10 A; 5LJ3 d; 4MDX A; 3CCL A; 5D6X A; 5KCO A; 3MP8 A; 4CI0 C; 3H9N A; 3CME Q; 3EG2 A; 1YIT Q; 1QVF P; 3JCM W; 4GBQ A; 1K8A U; 4M7D B; 4C8Q A; 4YTL A; 2FL7 A; 4E6R A; 2QAS A; 4JRP A; 1P92 A; 2X35 A; 3G71 Q; 3FEO A; 1IRE B; 1AWX A; 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