The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
AEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural basis for the specific interaction of lysine-containing proline-rich peptides with the N-terminal SH3 domain of c-Crk.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
C-CRK N-TERMINAL SH3 DOMAIN
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| molecule tags |
Complex (oncogene protein/peptide)
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| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
9
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1995-01-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DF6 A; 4RTY A; 1WX6 A; 3JV3 A; 1M3B A; 4GBQ A; 2DLP A; 4HVV A; 1X43 A; 1RUW A; 4RTW A; 2X3W D; 4AFZ C; 1PNJ A; 2EYZ A; 1ABO A; 4JJB A; 2DYB A; 4Z88 A; 2VVK A; 4AG2 C; 4OMO A; 3IQL A; 1M8M A; 2L3Q A; 1TUD A; 2JM8 A; 1NYG A; 3NMZ C; 3M0T A; 1ZLM A; 2P4R A; 4JJC A; 1JO8 A; 1NLO C; 2RMO A; 1U5S A; 4A63 B; 1Y0M A; 1WXT A; 3EG2 A; 1QWF A; 2J6K A; 2FPF A; 1KJW A; 1JXM A; 2K2M A; 4WCI A; 2EQI A; 1YN8 A; 2RPN A; 2HBW A; 2JT4 A; 2A36 A; 1WYX A; 2RN8 A; 2FG0 A; 2FO0 A; 3UA7 A; 1YNZ A; 1NYF A; 2OAW A; 2AKK A; 4CC2 A; 1B07 A; 1QCF A; 2RQV A; 5IXB A; 5IHN A; 2O88 A; 1UHC A; 1H3H A; 2KEA A; 1A0N B; 2OI3 A; 1AVZ C; 1AZG B; 4J9G A; 1RLQ C; 3UA6 A; 4AFS C; 2CH4 A; 4IIM A; 2A37 A; 2J6F A; 4CC3 A; 2YUP A; 2EGC A; 2RNA A; 3CQT A; 1NM7 A; 1UFF A; 1EFN A; 2DL7 A; 1MUZ A; 2L3S A; 2L3P A; 4J9I A; 2HDA A; 2DMO A; 1VYT A; 4AG1 C; 3THK A; 2X3X D; 4ZNX A; 4F16 A; 4JPB W; 3KFV A; 2EVR A; 1OPK A; 2ESW A; 1CKA A; 1E6H A; 3PVQ A; 3QWX X; 1BU1 A; 3VS1 A; 1IO6 A; 2LP5 A; 2EW3 A; 1AOJ A; 1X27 A; 3I5S A; 1V1C A; 3REB B; 2D1X A; 1ZUU A; 5IXF A; 2KBT A; 2DM1 A; 1JQQ A; 2KRS A; 1E6G A; 1SHG A; 2J7I A; 3VS4 A; 1NLP C; 2BZX A; 2MIO A; 2KXC A; 3TVT A; 2VKN A; 4EIK A; 2E5K A; 1UGV A; 2KT8 A; 4KRT A; 4QT7 A; 1TG0 A; 5GJV B; 3H41 A; 1KFZ A; 2M0Y A; 2GBQ A; 5I22 A; 4RTZ A; 5L23 A; 1JEG A; 1QLY A; 2GTO A; 3I9Q A; 2KXD A; 2H8H A; 2CH4 W; 2PZ1 A; 5IHK A; 1Z9Z A; 2DVJ A; 1JU5 C; 2ROT A; 2KT1 A; 3RNJ A; 4JZ4 A; 2AKL A; 1I0C A; 3RBB B; 1ZBJ A; 3EG1 A; 1WXB A; 4CC4 B; 4D8D A; 1YCS B; 2GTJ A; 1X2K A; 4D8K A; 1I1J A; 4ORZ A; 1NEB A; 2LJ1 A; 2QDL A; 1ARK A; 4K11 A; 1K4U S; 1XOV A; 3TSZ A; 1FMK A; 2L2P A; 1K9A A; 1QKW A; 2PTK A; 1Y57 A; 2AZS A; 3REA B; 1M3A A; 2MOX A; 2CT3 A; 3C0C A; 1AZE A; 1K76 A; 1ABQ A; 2F2W A; 2JS0 A; 1MV3 A; 1UDL A; 1SSH A; 2DIL A; 2DNU A; 2RQT A; 1WXU A; 2YUQ A; 2KRO A; 2F2X A; 3VS3 A; 1GRI A; 1W6X A; 2J6O A; 4LN2 A; 1G83 A; 2EYY A; 3M0Q A; 1OEB A; 1PKT A; 2IIM A; 5IHI A; 2BZ8 A; 2JMC A; 3SEM A; 4RTU A; 1PRL C; 2RQR A; 3H0F A; 3EG0 A; 1HSQ A; 1W70 A; 2C0I A; 2NWM A; 4RUG A; 1T0H A; 1AWX A; 2B86 A; 2FRY A; 2V1Q A; 3VS5 A; 1K0S A; 1MV0 B; 1GBQ A; 1SEM A; 2LQW A; 4OML A; 4M4Z A; 4LE9 A; 1AD5 A; 2EYW A; 1GCQ A; 1H92 A; 2KR3 A; 2LJ0 A; 2YDL A; 1GFC A; 2M51 A; 4J9E A; 1I07 A; 2KYB A; 3NGP A; 4J9D A; 1GCP A; 1SHF A; 2K9G A; 2EGA A; 4OMQ A; 2LNH B; 1X69 A; 1ZX6 A; 2ROL A; 2W10 A; 2EGE A; 2O9S A; 4HVW A; 2KE9 A; 3VS7 A; 1X6B A; 4F14 A; 2DL3 A; 4LUD A; 2BZY A; 2KRN A; 2CUB A; 4CC7 A; 2NUZ A; 3M0R A; 4JZ3 A; 1HJD A; 5ECA A; 2C0O A; 1TUC A; 2O2O A; 2K7A A; 1CKB A; 2ABL A; 4J9H A; 1UTI A; 5IH2 A; 4DEY A; 3NPF A; 1M27 C; 1U06 A; 3U23 A; 3VRY A; 2O31 A; 2C0T A; 4LNP A; 4RTX A; 4RTV A; 1VA7 A; 2ECZ A; 2SRC A; 1SPK A; 1UHF A; 3EHQ A; 1KIK A; 1SRL A; 2FRW A; 3NHN A; 2FEI A; 1X6G A; 1Z9Q A; 2GNC A; 2KYM A; 1N5Z A; 2DL5 A; 2DBM A; 1SRM A; 1QKX A; 2DE0 X; 2RQW A; 2J05 A; 1OPL A; 1PRM C; 2EPD A; 2PNI A; 2K6D A; 3VS2 A; 2XMF A; 2F2V A; 2W0Z A; 4HCK A; 3I35 A; 2CSQ A; 2FPE A; 2MCN A; 2GQI A; 4IIO A; 4J9B A; 5FW9 A; 2RQU A; 1WIE A; 3A98 A; 2DL4 A; 2V1R A; 2LX7 A; 1ZUY A; 2K3B A; 1UUE A; 2DX1 A; 2LCS A; 4FSS A; 2SEM A; 4HXJ A; 2VWF A; 1ZUK A; 4GLM A; 2DJQ A; 1KSW A; 1WDX A; 4JJD A; 5GJW B; 1AWW A; 5FWC A; 3GBQ A; 1WFW A; 1LCK A; 2L0A A; 1PWT A; 1WA7 A; 3R6N A; 4LUE A; 1VYV A; 2AZV A; 2DL8 A; 4HVU A; 1HD3 A; 3QWY A; 1GFD A; 3VS0 A; 1GL5 A; 1NEG A; 4F17 A; 4AFU C; 1YWO A; 2DA9 A; 4AFQ C; 1T0J A; 2CT4 A; 3H0I A; 1U3O A; 4DEX A; 1PHT A; 1M30 A; 1WLP B; 1PKS A; 2CSI A; 1CSK A; 1OOT A; 2LZ6 B; 4R0K A; 1AEY A; 3TSW A; 1BK2 A; 3EG3 A; 2ED1 A; 2JM9 A; 2DRK A; 2YUN A; 4X1V A; 2D8J A; 1AWJ A; 2OJ2 A; 3UF4 A; 1T3S A; 1RLP C; 4OMP A; 5EC7 A; 2RF0 A; 1YWP A; 2JS2 A; 4J9C A; 3LH5 A; 2FPD A; 1T3L A; 1AWO A; 2CUD A; 2BTT A; 1E7O A; 1NG2 A; 1RI9 A; 1UEC A; 2JTE A; 3PE0 A; 5FWB A; 1QWE A; 2ENM A; 1H8K A; 1VYU A; 2CDT A; 1FYN A; 2KGT A; 2D8H A; 3UAT A; 1K1Z A; 2G6F X; 4ESR A; 2DBK A; 1OV3 A; 1WI7 A; 2A28 A; 5HCK A; 3EGU A; 2K79 A; 2LMJ A; 2JW4 A; 1G2B A; 3VRZ A; 1X2Q A; 2EBP A; 1M3C A; 1W1F A; 3EHR A; 1UJY A; 1UE9 A; 3SHW A; 3I5R A; 2HEQ A; 1JXO A; 3ZL7 C; 4Z89 A; 1GCQ C; 2LJ3 A; 4OMN A; 1B3Q A; 2AK5 A; 2CRE A; 4OMM A; 1BB9 A; 3O5Z A; 2EYX A; 1S1N A; 1ZSG A; 2EKH A; 1J3T A; 3ULR B; 2JXB A; 3M0P A; 3H0H A; 3FJ5 A; 2J06 A; 2KNB B; 2YSQ A; 2A08 A; 2ED0 A; 1BBZ A; 4RTT A; 2YT6 A; 1UJ0 A; 2HSP A; 2YUO A; 1GBR A; 2HCK A; 1YP5 A; 3PVL A; 1UG1 A; 4Z8A A; 2GGR A; 4Y92 A; 2JMA A; 2O9V A; 3M0S A; 4J9F A; 2D0N A; 3VS6 A; 2LQN A; 1K0X A; 4E6R A; 2DRM A; 3M0U A; 2I0N A; 5I11 A; 2KRM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DF6 A; 1WX6 A; 3JV3 A; 2DLP A; 3QZ5 B; 2CZ7 B; 4PLI A; 2ZAE A; 1PNJ A; 1KG1 A; 3VU3 C; 3IQL A; 2YHT A; 1X6O A; 1R0C B; 3QPH A; 1NYG A; 2E3I A; 2QEX T; 3NMZ C; 3M0T A; 2DAQ A; 5KE3 A; 3EGX B; 4HA8 A; 2RMO A; 2NLU A; 1R0B G; 1WXT A; 3OW2 P; 2J6K A; 1VQP T; 3E2U A; 1JXM A; 2XG8 D; 2EQI A; 5I2S A; 3QO3 A; 1YN8 A; 1V29 B; 2HBW A; 3X24 B; 1NJI C; 1WYX A; 3OW2 S; 1SSF A; 1ZSZ B; 1YNZ A; 4CC2 A; 3CME A; 1B07 A; 2RQV A; 4RCB A; 2O88 A; 1H3H A; 1O9S A; 5GAN j; 3UA6 A; 4IUQ A; 4LDX A; 3PGG A; 3MEA A; 4IIM A; 2A37 A; 5FU6 C; 3CCU T; 4CC3 A; 4M78 F; 5KYU A; 5KH6 A; 1Q7Y C; 2COY A; 1MUZ A; 2RJF A; 3A5Z B; 4J9I A; 3MEU A; 1VQ8 Q; 4QQ6 A; 4LDU A; 3HL8 A; 1MMG A; 3GNG A; 1OPK A; 1NE8 A; 2ESW A; 2ZPE B; 2FVU A; 7AT1 B; 3PVQ A; 4BDY A; 1ZA1 B; 4FM4 B; 3RIR A; 3NFC A; 3A1P A; 4XQ3 A; 2QI2 A; 4J6X A; 1YIJ T; 2BE9 B; 1QQJ A; 2YXY A; 3CBM A; 5IXF A; 2E6N A; 3CXC P; 4KGX B; 4JLG A; 2KRS A; 1E6G A; 3QDR B; 3LX7 A; 2J7I A; 2JVV A; 2QTX A; 3WXM B; 3CMA A; 1NLP C; 5CKB A; 2MWO A; 2KXC A; 4PJJ A; 3CXC S; 3MP8 A; 4EIK A; 1UGV A; 1ZHI A; 1RAF B; 2DIQ A; 1JEG A; 2E5Q A; 4O5V A; 4QVD A; 2GTO A; 3I9Q A; 1YI2 Q; 4JRP A; 2HQH A; 2CH4 W; 2OTJ T; 3C4S A; 1VQ5 T; 2JN0 A; 2VV5 A; 2GCX A; 1JU5 C; 1KC8 R; 2KT1 A; 3CC4 T; 3RNJ A; 1I0C A; 3PMT A; 3RBB B; 2R57 A; 1WXB A; 3P8D A; 1RL2 A; 5GAN 2; 5GMK e; 2X4J A; 1VQL T; 2LJ1 A; 3FRN A; 4M7A A; 2L3R A; 4ZGE B; 1FMK A; 1K9A A; 2EKO A; 2PTK A; 3G4S Q; 1MMA A; 1N9S A; 2KDS A; 5KYW B; 1VQO A; 3CCE A; 1K9M R; 2MOX A; 1AZE A; 1YHQ T; 1YJ9 T; 2B8A A; 2PVD B; 2F2W A; 3JCM V; 2JS0 A; 1MV3 A; 1XQH A; 1K73 C; 4C92 B; 1BI3 A; 2CP7 A; 1N8R U; 2NUP A; 2RQT A; 1WXU A; 2HAX A; 2YUQ A; 3CCJ Q; 2QTV A; 4KGZ B; 2BUD A; 4GY5 A; 3VS3 A; 4FT2 A; 3L2V A; 2QGG A; 3TRE A; 1G83 A; 3QYG B; 4M78 D; 1YJN T; 3JSC A; 2IIM A; 3G6E A; 2E41 A; 1PD0 A; 4N4G A; 2C06 A; 4M75 C; 3A8H B; 4ELZ C; 4DOW A; 4E7Z A; 2DK3 A; 3RR6 A; 1HSQ A; 2BIV A; 2B86 A; 2EAY A; 2VGM A; 1UB4 A; 1SEM A; 5GMK j; 4LE9 A; 3VYG A; 1Q82 U; 2EYW A; 4B9X A; 1GCQ A; 2KR3 A; 3CCM Q; 1I07 A; 2KYB A; 2P0Q A; 1X01 A; 3OYY A; 3V8K A; 2ZGW A; 1RAG B; 1M90 C; 3H6Z A; 4LD6 A; 2DXU A; 1PD1 A; 3CCQ T; 4QKU A; 3VS7 A; 2D6F A; 2DL3 A; 1Q81 C; 4C8Q B; 4J6W A; 4ZN3 A; 3QII A; 4LUD A; 4F7U B; 1VQN A; 3M0R A; 4JZ3 A; 4M78 C; 5GAN 6; 2C0O A; 3ZFJ A; 2RHZ A; 2KVQ G; 1UTI A; 2CP6 A; 2L89 A; 5GMK l; 1M27 C; 3U23 A; 3F70 A; 2O31 A; 4HCC A; 2C0T A; 3MET A; 4RTV A; 2KK4 A; 3DKM A; 1YIJ Q; 2DZ9 A; 3EHQ A; 5GAO q; 3CCL T; 3CD6 T; 1TH7 A; 3GPL A; 3DLM A; 1VQ9 Q; 2KYM A; 1QVF A; 2J05 A; 1SG5 A; 2QQA A; 2HQX A; 5GAM h; 3VS2 A; 3V7C A; 4M7D C; 2XIC A; 3FC3 A; 1M1G A; 2MCN A; 3MO8 A; 1NJI U; 3OYF A; 1RI0 A; 4OB0 B; 5IT9 E; 1U8R A; 2OTJ Q; 1WIE A; 5HK3 A; 4M75 A; 1KHI A; 4ZTJ A; 1UUE A; 4M77 B; 4FSS A; 2ZZD A; 4HXJ A; 2EFI A; 2VWF A; 1ZUK A; 4GLM A; 1WDX A; 1AWW A; 3OMC A; 4HCB A; 5GMK i; 1LJO A; 2JTF A; 3GF5 A; 4M78 E; 1ZSZ C; 3E1S A; 4LXC A; 4II1 A; 1FXX A; 5GAO l; 3G4S A; 1Q86 U; 5LJ5 f; 2P84 A; 1S72 T; 3BDU A; 4C8Q F; 3CCR Q; 1WHJ A; 4OF1 A; 2DA9 A; 2PVO B; 3MKD A; 1WQ7 A; 4AFQ C; 3H0I A; 4F7U F; 4JRQ A; 1RAI B; 2HKQ B; 2HSE B; 4B9W A; 1M30 A; 3CCJ A; 1LVK A; 4R0K A; 2DEQ A; 3G71 Q; 4X1V A; 2RA2 A; 4Y91 A; 4E47 A; 5GAN g; 3C12 A; 4JS5 A; 1RLP C; 2LRQ A; 2RF0 A; 4LD9 K; 1YWP A; 2JS2 A; 4J9C A; 2K5L A; 1M2V A; 2GFU A; 1B7T A; 2CUD A; 4C5I A; 3GIB A; 1RAB B; 2XU8 A; 4C5E A; 4BD3 A; 1FWZ A; 2VUB A; 3I55 T; 4E7S A; 1D0Y A; 3TU4 K; 2ENM A; 6AT1 B; 1N6A A; 3UWN A; 3CCM A; 2CDT A; 1FYN A; 2IVW A; 5D7U A; 2D8H A; 3L2Z A; 4ESR A; 1BCM A; 5EG2 A; 3P8B B; 4JUV A; 1EIF A; 5AT1 B; 3EGU A; 3QG1 A; 2JW4 A; 3CCQ Q; 4M7D A; 2MF2 A; 2EBP A; 4O6J A; 1M3C A; 1UE9 A; 2CZ6 B; 1VQM Q; 3SHW A; 1VQ6 Q; 2Y4Y A; 2QA4 Q; 2LJ3 A; 2QQB A; 4MZP A; 2P0K A; 2EYX A; 3R6O A; 3X26 B; 2XDD A; 3X25 B; 4BE2 A; 1J3T A; 2JXB A; 3H0H A; 2J06 A; 4PL6 A; 1QVG A; 2KI7 A; 3RES A; 1BBZ A; 1BI0 A; 4FYX B; 2HSP A; 2HCK A; 3OB9 A; 4C8Q D; 1VQ9 A; 2EJG A; 1YIT Q; 1UGQ B; 4J9F A; 3VJP A; 2D0N A; 5KYY B; 1M1K R; 1IB8 A; 4C0D B; 3BFM A; 2HNI A; 4E6R A; 5A0L A; 4A4K A; 1MND A; 3M0U A; 2YWW A; 2ZPH B; 3FLG A; 1R8O B; 4RTY A; 1M3B A; 5J26 A; 3M4Y A; 3OS5 A; 1RUW A; 1WJQ A; 1Y71 A; 4AFZ C; 1D1B A; 4JJB A; 4JLI A; 2OAU A; 1UGP B; 1M8M A; 2HL5 C; 2L3Q A; 1QVP A; 5I21 A; 1ZLM A; 5DLQ E; 3CCS Q; 5GMK h; 4JRI A; 4RMO A; 2FPF A; 4J8O A; 5LJ3 e; 2K2M A; 3QBY A; 4WCI A; 3CCR A; 1N27 A; 1KC8 C; 1RAE B; 2RN8 A; 4ZN1 A; 3CC7 T; 5CQX A; 4D6W A; 2FG0 A; 4KGV B; 4C8Q C; 4C92 E; 4M78 G; 1QCF A; 5IXB A; 5IHN A; 3OSS C; 3G71 A; 2KEA A; 2OI3 A; 1AZG B; 4J9G A; 4KH0 B; 1RLQ C; 3SFM A; 2DIG A; 4E2F B; 1N8R C; 3E9F A; 1WHM A; 1TS9 A; 3LGL A; 2RNA A; 1UFF A; 1EFN A; 2DL7 A; 1VQ4 Q; 3EFO B; 5GAN f; 2XDB A; 2L3P A; 2HDA A; 2X3X D; 4ZNX A; 4F16 A; 4JPB W; 2QGF B; 1OX8 A; 3JB9 I; 4EMG A; 2E10 A; 3WVE B; 3VS1 A; 3VUB A; 4FIB A; 3OYG A; 3I56 T; 3CEY A; 5DLO A; 5LJ3 j; 1AOJ A; 1X27 A; 1IGU A; 1G3T A; 2D1X A; 1QCN A; 1ZUU A; 2XI9 A; 3OYH A; 2DM1 A; 4OP0 A; 5C0M A; 3JCM f; 1SHG A; 2H3J A; 3HHT B; 4AT1 B; 3VS4 A; 2D9T A; 2VKN A; 4PFO A; 4PK4 A; 2KT8 A; 3H41 A; 5A0D A; 1QMC A; 4C8Q E; 5L23 A; 4RTZ A; 4UC4 A; 1VQM A; 3J7A F; 1VQ6 A; 3JCM b; 2QA4 A; 1H3Z A; 4F7U E; 5CKE A; 2H8H A; 3M56 A; 3SB2 A; 2KSS A; 2PZ1 A; 5IHK A; 1Z9Z A; 2ROT A; 4NL3 A; 1EZZ B; 2ZPI B; 1WNL A; 1UGR B; 1ZBJ A; 3EG1 A; 4CC4 B; 3RUX A; 3L2R A; 4D8K A; 1IRX A; 3CCV T; 4BDZ A; 1NEB A; 2PUO B; 4J83 A; 5GAM j; 1QKW A; 3OW2 A; 1QCO A; 1Y57 A; 1YIT A; 3OYM A; 1HYO A; 1TWB A; 1M3A A; 4XTY A; 2RJD A; 2HQE A; 3OYL A; 1K76 A; 1KQ2 A; 2DJZ A; 2DXC A; 4IUR A; 2E12 A; 2DFU A; 3OYA A; 1UDL A; 3JAM E; 2IPO B; 2LX9 A; 2DIL A; 1JJ2 P; 1PM3 A; 2KRO A; 3GLX A; 2DXB A; 4QQD A; 3TQ7 P; 5DM7 R; 2LNV A; 2M02 A; 3E19 A; 1W6X A; 4OMF B; 2L8D A; 3M0Q A; 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