The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
TGKELVLVLYDYQEKSPRELTVKKGDILTLLNSTNKDWWKIEVNDRQGFVPAAYLKKLD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A Thermodynamic and Kinetic Analysis of the Folding Pathway of an SH3 Domain Entropically Stabilised by a Redesigned Hydrophobic Core
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN
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| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Gallus gallus
|
| total genus |
8
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| structure length |
59
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| sequence length |
59
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-08-31 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JT4 A; 2K79 A; 4OMN A; 1UJ0 A; 4JPB W; 3NMZ C; 4F14 A; 4CC2 A; 1QCF A; 2OAW A; 2GQI A; 2YUN A; 2DBK A; 2A08 A; 3U23 A; 1GRI A; 5IHI A; 1OOT A; 4J9G A; 4AFS C; 1U06 A; 2RQT A; 3I35 A; 2EPD A; 4RTX A; 1TUD A; 1BU1 A; 2FG0 A; 3I9Q A; 2RQV A; 2CSQ A; 2LZ6 B; 3A98 A; 3VS4 A; 2DE0 X; 2SRC A; 1M3B A; 1GBQ A; 2KYM A; 1H3H A; 2L0A A; 1T0H A; 2KYB A; 2EYZ A; 1YWP A; 3I5S A; 3NGP A; 2HEQ A; 1UHF A; 1WXU A; 1Y57 A; 2D8H A; 1W6X A; 2O9V A; 1YN8 A; 1ABO A; 1G2B A; 4E6R A; 5I22 A; 1E6H A; 2YUP A; 2X3X D; 4OMM A; 1ZLM A; 2JM9 A; 2LJ0 A; 3THK A; 2KT1 A; 1RI9 A; 1NYF A; 1VYU A; 1KJW A; 2NWM A; 2CRE A; 2K3B A; 1SRL A; 1SHF A; 2J6O A; 2RQU A; 1K0X A; 1T3S A; 1W70 A; 3FJ5 A; 1H92 A; 2I0N A; 1X27 A; 3O5Z A; 2L3P A; 4AFQ C; 2JM8 A; 1W1F A; 2DL4 A; 1AZE A; 2O88 A; 2J6F A; 2BZX A; 2JS2 A; 2DL7 A; 2EVR A; 2NUZ A; 2DJQ A; 2J05 A; 1VYT A; 4CC3 A; 3M0P A; 2KXD A; 1GCP A; 5GJW B; 1YNZ A; 1PRM C; 1Y0M A; 3TSW A; 2YDL A; 4HVU A; 5IXB A; 3M0T A; 3JV3 A; 2LX7 A; 1OPK A; 5EC7 A; 1AD5 A; 3IQL A; 2C0T A; 3VS5 A; 1CKB A; 1LCK A; 4R0K A; 3TSZ A; 3VS0 A; 1A0N B; 4DEY A; 5L23 A; 1AZG B; 1ZUY A; 3RBB B; 4RTY A; 1X2K A; 3GBQ A; 2CT3 A; 1ZUU A; 2GBQ A; 1VYV A; 2V1R A; 4QT7 A; 4Z89 A; 2W10 A; 2LP5 A; 2RMO A; 2EGC A; 1JXM A; 2KXC A; 2ED1 A; 1SSH A; 2K6D A; 2LMJ A; 2RQR A; 4Y92 A; 2RN8 A; 4CC4 B; 1GFD A; 1OV3 A; 2DIL A; 1J3T A; 2CUD A; 1HSQ A; 4J9E A; 1GL5 A; 2LCS A; 2EGE A; 4AG1 C; 1WFW A; 2KEA A; 3EG1 A; 4RTW A; 1RUW A; 1UTI A; 2LQW A; 3PVL A; 4X1V A; 5IXF A; 2DF6 A; 2AK5 A; 1JQQ A; 4D8K A; 3VS3 A; 3REA B; 1WI7 A; 1YP5 A; 1U3O A; 2VVK A; 4LUD A; 1WYX A; 1H8K A; 2L2P A; 4J9C A; 2CH4 W; 1AWO A; 2FO0 A; 1JU5 C; 2CDT A; 5I11 A; 2AZS A; 1UJY A; 2JW4 A; 3EHR A; 1E6G A; 2DM1 A; 3H0F A; 2BZ8 A; 1K76 A; 3REB B; 1Z9Z A; 5IH2 A; 5GJV B; 2G6F X; 1YWO A; 2DL8 A; 1FMK A; 1WX6 A; 4EIK A; 1M30 A; 3I5R A; 1SHG A; 4OML A; 1S1N A; 2ROL A; 4KRT A; 2L3Q A; 2AKL A; 2DLP A; 3EHQ A; 4A63 B; 2F2X A; 1X2Q A; 5FWC A; 1WXB A; 4ZNX A; 1GCQ A; 4HVW A; 4ESR A; 1PKS A; 2L3S A; 3H0I A; 2RF0 A; 1SPK A; 4M4Z A; 4AFU C; 4Z8A A; 1NEB A; 1NLO C; 1AOJ A; 1EFN A; 2LJ1 A; 4JJC A; 2DRM A; 3EGU A; 1UFF A; 2GTJ A; 2KRN A; 1OPL A; 2VKN A; 2W0Z A; 4F17 A; 1ZX6 A; 1ZUK A; 3KFV A; 2FPF A; 2JTE A; 2HBW A; 1G83 A; 1YCS B; 4RTU A; 2KR3 A; 1CKA A; 1SEM A; 2EKH A; 2X3W D; 2P4R A; 2EBP A; 2RQW A; 2J7I A; 1PRL C; 1AEY A; 1X6B A; 5IHK A; 1AWX A; 4JZ4 A; 5FWB A; 1K9A A; 2DX1 A; 2XMF A; 2ECZ A; 2QDL A; 2CT4 A; 2ED0 A; 4AG2 C; 1M3A A; 5HCK A; 4LN2 A; 1XOV A; 1VA7 A; 1FYN A; 2EW3 A; 2F2W A; 3ULR B; 4RUG A; 3R6N A; 2DBM A; 4J9H A; 4F16 A; 1GFC A; 3PE0 A; 1ZBJ A; 2YUQ A; 2KNB B; 2M51 A; 1PNJ A; 4DEX A; 3EG0 A; 4LNP A; 1BK2 A; 2FRY A; 1NM7 A; 3M0S A; 2O2O A; 3EG2 A; 2A28 A; 2K2M A; 2V1Q A; 2VWF A; 1X69 A; 1ZSG A; 2EQI A; 4JZ3 A; 4RTV A; 1AWW A; 2E5K A; 1KFZ A; 3RNJ A; 4RTT A; 3M0Q A; 2SEM A; 1HJD A; 1GCQ C; 2KBT A; 2CUB A; 1UDL A; 2HSP A; 2KGT A; 4J9D A; 2FRW A; 1MV0 B; 2DYB A; 2KRO A; 1M27 C; 2LJ3 A; 3SHW A; 2JMA A; 2H8H A; 3NHN A; 4K11 A; 2PTK A; 4GBQ A; 4OMQ A; 3TVT A; 3VRZ A; 2ROT A; 1V1C A; 2DVJ A; 1I1J A; 2YUO A; 1IO6 A; 1AVZ C; 1JO8 A; 3CQT A; 2BZY A; 1QWE A; 1N5Z A; 2EYY A; 3VS2 A; 1AWJ A; 2GGR A; 4J9B A; 1OEB A; 2EYW A; 1QWF A; 1X6G A; 2DNU A; 2CH4 A; 3EG3 A; 2IIM A; 1UHC A; 3UA6 A; 1RLP C; 3M0U A; 1JXO A; 2OJ2 A; 4AFZ C; 1K0S A; 2DL5 A; 2FPD A; 2ESW A; 1ABQ A; 4D8D A; 2OI3 A; 2MCN A; 1RLQ C; 2RPN A; 2KT8 A; 2EYX A; 4J9F A; 1ARK A; 1T0J A; 2DMO A; 1UUE A; 2A37 A; 5IHN A; 1JEG A; 1QLY A; 2CSI A; 2K9G A; 4LUE A; 3UAT A; 4ORZ A; 1E7O A; 2YT6 A; 2K7A A; 1PKT A; 3UA7 A; 1NLP C; 2GNC A; 2A36 A; 1QKW A; 2FPE A; 2F2V A; 3VS1 A; 1UE9 A; 2LNH B; 1NG2 A; 2JMC A; 1KSW A; 1K1Z A; 4WCI A; 2LQN A; 3H41 A; 4OMP A; 1K4U S; 1UEC A; 2PZ1 A; 2AKK A; 3ZL7 C; 1M3C A; 2MIO A; 4LE9 A; 1BBZ A; 2MOX A; 3NPF A; 2ABL A; 1KIK A; 1X43 A; 2KRM A; 4HVV A; 2FEI A; 2C0I A; 4GLM A; 4HCK A; 4FSS A; 2BTT A; 3VS6 A; 1U5S A; 1HD3 A; 4HXJ A; 1QKX A; 3UF4 A; 1WLP B; 3C0C A; 3VRY A; 4OMO A; 5FW9 A; 5ECA A; 2J6K A; 2EGA A; 1M8M A; 1UG1 A; 2M0Y A; 1UGV A; 2B86 A; 1PWT A; 2DA9 A; 2O9S A; 3M0R A; 1SRM A; 1NEG A; 1TUC A; 1PHT A; 1T3L A; 1CSK A; 1I0C A; 4IIM A; 2J06 A; 1MV3 A; 4JJB A; 2KRS A; 1B3Q A; 1BB9 A; 3QWX X; 1TG0 A; 1NYG A; 4J9I A; 3QWY A; 2D1X A; 4JJD A; 4RTZ A; 4Z88 A; 2RNA A; 1WDX A; 2JXB A; 1Z9Q A; 2C0O A; 3PVQ A; 1MUZ A; 1WXT A; 2KE9 A; 2ENM A; 3VS7 A; 2PNI A; 1GBR A; 2DL3 A; 2DRK A; 1B07 A; 2HDA A; 4IIO A; 2HCK A; 1WIE A; 2GTO A; 3SEM A; 2YSQ A; 4CC7 A; 2O31 A; 2AZV A; 2D8J A; 2D0N A; 2JS0 A; 3LH5 A; 3H0H A; 1WA7 A; 1I07 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1TUG B; 4E7Z A; 1NJI C; 4OB1 B; 3M58 A; 4CC2 A; 1RAD B; 2K5I A; 5GAN 6; 2YUN A; 1TU0 B; 2DBK A; 3OBY A; 3U23 A; 2CP7 A; 5LJ3 j; 5LJ5 h; 2RQT A; 3OMG A; 3A8H B; 1VQO Q; 1KD1 C; 3JCM X; 4KGZ B; 3A98 A; 2OTL A; 1YI2 T; 5CKE A; 1D1A A; 2JN0 A; 2LQK A; 3MJX A; 2B8A A; 2KYM A; 2X4W A; 1H3H A; 2M9U A; 1G8X A; 1YWP A; 4KH0 B; 4M78 F; 2DZ9 A; 4E7H A; 1Y57 A; 3WXM B; 3JCM Q; 3G6E A; 1YN8 A; 1D0Y A; 4E6R A; 1XQH A; 4OMM A; 2JM9 A; 3OS1 A; 2FVU A; 3THK A; 3JCM f; 4EMK A; 2KT1 A; 1RI9 A; 2XDB A; 3VYG A; 1G3S A; 2RQU A; 3A8M B; 1K0X A; 3CC7 Q; 1T3S A; 2FHD A; 3O5Z A; 3E9F A; 4AFQ C; 2JM8 A; 3QZ9 B; 3GP8 A; 3ME9 A; 1G5V A; 2KVQ G; 2J6F A; 1YJ9 A; 2BUD A; 2JTM A; 1HK9 A; 1W4S A; 3CCS Q; 3MHX A; 2KK4 A; 3MEA A; 2QK0 A; 1PRM C; 2YDL A; 1RI0 A; 2X35 A; 2LX7 A; 4MDW A; 2FZK B; 2R58 A; 4PJO A; 5GAM j; 4EMG A; 1A0N B; 5D7U A; 2MWP A; 3CCJ T; 2XK0 A; 1WPY A; 2CT3 A; 4QVC A; 2V1R A; 3RKW A; 1RAE B; 4M7D B; 4Z89 A; 2RJD A; 2BE7 D; 2H3E B; 1OZ3 A; 2QEX A; 4KGV B; 2RMO A; 5GMK l; 4Y28 E; 4TVR A; 2ED1 A; 2K6D A; 3L2W A; 1S72 T; 3CPW S; 4HKE A; 1VQ8 T; 4M75 F; 3CCM Q; 2DIL A; 2HAX A; 3CCU Q; 4C5I A; 4J9E A; 1GL5 A; 2QQ9 A; 1WFW A; 4L6V 5; 4RTW A; 1KC8 U; 1UTI A; 2LQW A; 4WTO B; 4F7U G; 5IXF A; 4EMK C; 3FRN A; 3MP1 A; 2AK5 A; 4JS5 A; 3GPL A; 1NJI U; 1JQQ A; 3KBG A; 3Q1J A; 5A0G A; 1H8K A; 1WZO A; 2VV5 A; 1JU5 C; 1VQM A; 4DBH A; 1UJY A; 1IRE B; 3EFR A; 1E6G A; 3T9N A; 4IUU A; 2BZ8 A; 1RAH B; 5FU7 C; 1SSF A; 3DB3 A; 1KD1 U; 3X26 B; 5GJV B; 3RDV A; 3CCL A; 2Y4Y A; 3NTK A; 4J5Y A; 1VIE A; 3GLX A; 5FRO A; 2OTL T; 4C0F A; 1YWO A; 1JJ2 P; 3I5R A; 3I56 A; 1M1F A; 5CKH A; 1S1N A; 2LVM A; 2L3Q A; 1N6A A; 3PNW C; 2AKL A; 2P4T A; 3FLG A; 2DLP A; 4J6X A; 3EHQ A; 4PJO C; 3G6E T; 4F04 B; 4PLL A; 1Q82 R; 1VQN Q; 5FWC A; 4ZNX A; 1GCQ A; 2E64 A; 2D6F A; 2CZ6 B; 3CBM A; 2WSC E; 1KQ2 A; 3CC4 A; 2RF0 A; 2DER A; 3NFC A; 2V26 A; 5CAI A; 2GCX A; 1AOJ A; 3PFS A; 5KYY A; 1BKB A; 3OS2 A; 1LPL A; 1NPP A; 4OB3 B; 2HSE B; 2GTJ A; 3HTR A; 3HKS A; 3M53 A; 2X9H A; 1OQK A; 1FXX A; 1ZX6 A; 3CCE T; 4C8Q G; 1G3T A; 4HT9 A; 2KR3 A; 1YJ9 T; 1SEM A; 5GAN f; 1X75 C; 2X3W D; 1YJN A; 3OSV A; 4XQ3 A; 2EBP A; 3CPW P; 3RMS A; 4M78 D; 1VQP A; 1UB4 A; 5IHK A; 1PSE A; 3J7A F; 1GXI E; 4KUI A; 2XMF A; 3CCV A; 1XOV A; 1FYN A; 2F2W A; 3ULR B; 1H64 1; 1Q82 C; 4C0D C; 3A8L B; 2YUQ A; 4C5G A; 1PNJ A; 4DEX A; 3BDU A; 4PFZ A; 3EG0 A; 5EG2 A; 3OYB A; 2QEX T; 4N4G A; 1NM7 A; 2QAZ A; 4PLI A; 2A28 A; 2HQE A; 2K2M A; 3LWI A; 5CK9 A; 1WHH A; 3RNJ A; 2EQJ A; 1HYO A; 5GAO q; 4RTT A; 3G71 A; 2M16 A; 3M0Q A; 1HJD A; 1GCQ C; 2CUB A; 2RI2 A; 4J6W A; 1VQO A; 2DYB A; 4QQD A; 1OX8 A; 3A8O B; 4LDV A; 3SHW A; 4D6W A; 4OMF B; 2XKO C; 4BI4 A; 4K11 A; 4BY6 C; 4GBQ A; 4M7D F; 2QXF A; 2ROT A; 4PJJ A; 2DVJ A; 1I1J A; 1VQM T; 2MMP A; 3C95 A; 1IO6 A; 1AVZ C; 3CQT A; 3CC2 A; 2EIF A; 2RJE A; 3OS0 A; 3CCL T; 1C1A A; 5D6X A; 2BE9 B; 3H8Z A; 4PJM A; 4ME7 A; 3I56 T; 3EG3 A; 4M75 D; 1UHC A; 1RLP C; 1S72 Q; 3M0U A; 1JXO A; 3CC7 A; 1VQ8 Q; 5CKB A; 1O75 A; 1ABQ A; 3OYG A; 3QKJ A; 2DXB A; 3QII A; 4J9F A; 3CC4 T; 1VQ6 Q; 3QZ5 B; 2FB7 A; 2A37 A; 4LDY A; 1JEG A; 2CSI A; 3UAT A; 4MMK A; 4M7A F; 2YRV A; 2K7A A; 6AT1 B; 1QP2 A; 1FX7 A; 1VQK A; 2FPE A; 3FJP A; 1WHM A; 4DBQ A; 1QVP A; 2PUK B; 2HD0 A; 2PVG B; 3FEO A; 2OTL Q; 4FL6 A; 5AT1 B; 1YJN T; 2P84 A; 3DB4 A; 2Y90 A; 2MIO A; 4V2S A; 1JJ2 A; 3OYY A; 2C06 A; 3P8D A; 1VQP T; 2K2V A; 3ER0 A; 2ABL A; 1KQS S; 2KRM A; 2QYZ A; 3OYM A; 2FEI A; 1SG5 A; 4GLM A; 4PJO E; 3G7Z A; 3CCV T; 4M77 C; 1QKX A; 3UF4 A; 1WLP B; 5FW9 A; 1OX9 A; 2JJ9 A; 2D9T A; 3CCU A; 2LRQ A; 3LX7 A; 1UGQ B; 4KT0 E; 2RHU A; 3L2Z A; 1Q82 U; 2DXC A; 1M8M A; 1UG1 A; 4LD6 A; 4M7D E; 3CCE Q; 2A7Y A; 3M0R A; 2P0K A; 1YIJ Q; 3V7R A; 2QGF B; 5KE3 A; 3WVE B; 4IIM A; 5LJ3 e; 4JJB A; 4NS5 A; 1YJ9 Q; 1M90 R; 2ZCF B; 3EFO A; 3G71 T; 3OYN A; 1VQO T; 1DJ7 B; 2RJF A; 3HRU A; 1MUZ A; 2DTO A; 2Z0W A; 4FU6 A; 4XU3 A; 2XDP A; 3E19 A; 2HCK A; 2GTO A; 3SEM A; 3S3M A; 2YSQ A; 3EGX A; 5GAN g; 4PKC C; 3CC2 T; 1VQN A; 1WA7 A; 3OW2 A; 4A4E A; 1RAB B; 2V8J A; 9ATC B; 4M78 A; 1XTD A; 1G3Y A; 1NE8 A; 1UJ0 A; 4OMN A; 2DKG A; 3NMZ C; 3CC7 T; 1YIT Q; 4EMH A; 2E6Z A; 2A08 A; 4JUV A; 3VYH B; 2DO3 A; 1GRI A; 3V8L A; 1TS9 A; 3P8H A; 2EPD A; 4RTX A; 2PUO B; 4B6M A; 2LZ6 B; 2JZ2 A; 3P8B B; 3VS4 A; 5I21 A; 1M90 C; 3SWN A; 4JRQ A; 2IVW A; 3M9Q A; 1GBQ A; 4M7D D; 4C8Q B; 3OYJ A; 5GAM e; 2EYZ A; 1ZSZ B; 4IUR A; 4PNO A; 4QW2 A; 4RMO A; 1VQM Q; 1VQK T; 1QVG P; 2M02 A; 2D8H A; 4ELY C; 5GMK h; 3LGF A; 1ABO A; 1LJO A; 2LX9 A; 3CCL Q; 1MMG A; 2CZ0 B; 4BI3 A; 1VYU A; 2CRE A; 1FMV A; 1SRL A; 1SHF A; 1F1B B; 1W70 A; 1BCO A; 1X27 A; 4HCB A; 4JLG A; 3RES A; 3JCM J; 1XNI A; 1D3B A; 2JS2 A; 2DL7 A; 8AT1 B; 5I2S A; 2DJQ A; 3HFN A; 4M7A D; 3CCU T; 1JRI A; 3TSW A; 4VUB A; 3G1J A; 3DKM A; 5HKC A; 1FMW A; 4KBM B; 4PFP A; 4JRP A; 2K5L A; 4QKU A; 3EGD B; 3LYI A; 3TEE A; 1VQL A; 4M75 B; 4BE0 A; 5KCH A; 2C0T A; 3TRE A; 4DEY A; 1WNL A; 2K57 A; 4DOV A; 4HCZ A; 1AZG B; 1X2K A; 1D0Z A; 2G3R A; 2LT1 A; 1ZUU A; 2GBQ A; 3V8K A; 3CBO A; 3VJP A; 1ZQ1 A; 1OI1 A; 3MPU B; 3CCR A; 3SWN C; 1BI0 A; 4FT2 A; 2O01 E; 2LP5 A; 1JXM A; 2KXC A; 1SSH A; 2LMJ A; 4PJL A; 3GF5 A; 5LJ3 h; 5GAN 3; 4C92 B; 2RN8 A; 4CC4 B; 1GFD A; 1WQ7 A; 1BIB A; 1J3T A; 1OU9 A; 2CUD A; 2DZC A; 2LCS A; 1VQN T; 2KEA A; 2NUP A; 3EG1 A; 4OP0 A; 3RMQ A; 3LWH A; 1KC8 C; 3JCM W; 1FWZ A; 4F7U F; 1VQ6 A; 2EKO A; 4JS4 A; 3GOX A; 3JSC A; 1Y96 B; 1WI7 A; 5FRN A; 4R55 A; 2L2P A; 4J9C A; 2COW A; 2L8D A; 2FO0 A; 5HY6 A; 3G71 Q; 1W2B P; 2JW4 A; 2DM1 A; 3H0F A; 1NZ9 A; 1K76 A; 3REB B; 2F69 A; 2MAM A; 4FCY A; 3RR6 A; 2DYI A; 4A4K A; 1FMK A; 1M90 U; 2LTO A; 2YRD A; 4FYV B; 3N5B B; 1WJS A; 4R56 A; 1YJW Q; 7AT1 B; 1OZ2 A; 3A5Z B; 2CP0 A; 3CC2 Q; 3FC3 A; 1RL2 A; 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