The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KELVLVLYDYQEKSPREVTVKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVDDRQGFIPAAYLKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Conformational Strain in the Hydrophobic Core and its Implications for Protein Folding and Design
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Sh3-domain
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| source organism |
Gallus gallus
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| molecule keywords |
SPECTRIN ALPHA CHAIN
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| total genus |
6
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-02-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SHG A; 2AK5 A; 4FSS A; 1UGV A; 1PKT A; 3UA6 A; 2ROT A; 2D8J A; 1WFW A; 1X6B A; 4R0K A; 1W70 A; 2K79 A; 1UE9 A; 2CH4 A; 2EQI A; 2F2V A; 2L0A A; 4AG2 C; 3R6N A; 5HCK A; 2KT8 A; 1NEB A; 3LH5 A; 4F17 A; 2OJ2 A; 3O5Z A; 1BBZ A; 1FMK A; 3VS2 A; 2E5K A; 1JQQ A; 2AKK A; 4JJB A; 4CC3 A; 3M0T A; 2GBQ A; 1UTI A; 2QDL A; 4HVV A; 2O31 A; 2KRO A; 5EC7 A; 2FPF A; 4AFS C; 4F16 A; 3UF4 A; 5GJV B; 1MV0 B; 2P4R A; 2CRE A; 2JM9 A; 1LCK A; 1TUD A; 2J7I A; 2DYB A; 3EGU A; 4DEX A; 4JPB W; 3GBQ A; 2RQU A; 1Z9Q A; 3JV3 A; 4IIM A; 2PNI A; 3U23 A; 2F2W A; 2L3Q A; 1ZLM A; 2FPE A; 2PTK A; 2J6F A; 3M0P A; 3TSZ A; 1AZE A; 1UHC A; 2DMO A; 2JW4 A; 1M3C A; 1QLY A; 5IHI A; 3REB B; 4Z8A A; 1HD3 A; 2O9S A; 5FW9 A; 2JS0 A; 1UDL A; 4CC4 B; 2ROL A; 2KE9 A; 1AZG B; 1K1Z A; 1M27 C; 1WIE A; 2W0Z A; 4HVU A; 1CSK A; 2A36 A; 2DBM A; 1W1F A; 2GGR A; 1SSH A; 1E6H A; 1JEG A; 2KYB A; 3SHW A; 2LJ3 A; 2ED1 A; 3I5S A; 4HCK A; 1SEM A; 2C0I A; 2YT6 A; 1ZUY A; 2RN8 A; 2KNB B; 1UG1 A; 2SRC A; 3KFV A; 1YCS B; 3H41 A; 4AFU C; 1X69 A; 2GQI A; 2YDL A; 1NYF A; 2EVR A; 1A0N B; 1RI9 A; 5I22 A; 2B86 A; 4D8D A; 1YP5 A; 1H3H A; 1V1C A; 3NPF A; 2YSQ A; 2HSP A; 2DL3 A; 1T0J A; 2LJ1 A; 3VS7 A; 2KBT A; 5ECA A; 1X2Q A; 4GBQ A; 1RUW A; 4KRT A; 3H0I A; 4X1V A; 1FYN A; 2LP5 A; 1QKX A; 3VS1 A; 2KR3 A; 1H92 A; 2KRM A; 1M3A A; 2DL4 A; 1X43 A; 2JM8 A; 4RTX A; 2KXC A; 3I35 A; 4HXJ A; 5IHK A; 1M3B A; 2KRS A; 2CH4 W; 2M51 A; 4RTV A; 1PRL C; 2FO0 A; 2K7A A; 1VYV A; 4LN2 A; 1JO8 A; 1ZBJ A; 1B07 A; 2V1R A; 2MCN A; 2HCK A; 2DJQ A; 1BB9 A; 1PKS A; 1MV3 A; 1GCP A; 3UAT A; 1WXU A; 1WDX A; 2EYX A; 1OPK A; 1ZSG A; 2JS2 A; 2CSQ A; 2BZY A; 2JMA A; 5FWC A; 1WXT A; 4F14 A; 3RNJ A; 3NGP A; 1RLQ C; 1I0C A; 4AFQ C; 3PVL A; 2J05 A; 2RQR A; 4A63 B; 2EGC A; 1GBR A; 5GJW B; 5IHN A; 2DX1 A; 1GCQ A; 2BZX A; 2MIO A; 1YWO A; 2FG0 A; 4D8K A; 4LNP A; 1UJY A; 2KEA A; 2VWF A; 1X2K A; 4J9H A; 2KYM A; 2CDT A; 2X3W D; 1HSQ A; 4ZNX A; 4J9G A; 3NMZ C; 2NWM A; 1RLP C; 2X3X D; 1U5S A; 4IIO A; 2D1X A; 4RUG A; 2DA9 A; 5IXF A; 4OML A; 1QCF A; 2CUD A; 3TVT A; 1KSW A; 3UA7 A; 4CC2 A; 1JU5 C; 1K76 A; 1T0H A; 3M0Q A; 5FWB A; 3VS4 A; 2H8H A; 2FRW A; 2RQW A; 1NLO C; 2EYY A; 2BZ8 A; 4EIK A; 2C0T A; 4JJC A; 1K9A A; 1BK2 A; 3M0R A; 4CC7 A; 3VS6 A; 1NYG A; 1S1N A; 1E6G A; 2YUN A; 1QKW A; 2K9G A; 4AFZ C; 2DM1 A; 2ECZ A; 3NHN A; 1NM7 A; 2LNH B; 2V1Q A; 1AVZ C; 1T3L A; 1AD5 A; 2FPD A; 3I9Q A; 3QWY A; 3THK A; 4RTW A; 3VS0 A; 4RTU A; 4OMM A; 1GFC A; 2O88 A; 4OMP A; 1XOV A; 2FEI A; 1UJ0 A; 2JTE A; 2C0O A; 2DL7 A; 1KIK A; 1YWP A; 1AWX A; 4J9I A; 4OMN A; 4AG1 C; 4OMQ A; 1VYT A; 4DEY A; 1YNZ A; 5L23 A; 2YUO A; 1OV3 A; 2LJ0 A; 3PVQ A; 2LZ6 B; 3EHQ A; 4OMO A; 2LX7 A; 1H8K A; 1VA7 A; 2ED0 A; 2EGE A; 1T3S A; 4WCI A; 1VYU A; 2DNU A; 2HDA A; 1Z9Z A; 2SEM A; 3REA B; 2VVK A; 2PZ1 A; 2EGA A; 2JMC A; 3CQT A; 1JXO A; 1GFD A; 2DE0 X; 3H0F A; 1PNJ A; 2L2P A; 1M8M A; 2W10 A; 1Y57 A; 2LQW A; 1NLP C; 3ZL7 C; 1GBQ A; 4JZ4 A; 2I0N A; 2G6F X; 2ABL A; 1UHF A; 2RQT A; 2HEQ A; 2RQV A; 1KFZ A; 2DLP A; 1U06 A; 1K4U S; 4J9B A; 1BU1 A; 2D8H A; 1K0S A; 2O9V A; 1K0X A; 4ORZ A; 3VS5 A; 2RPN A; 2GNC A; 2RF0 A; 1GL5 A; 2A08 A; 2ENM A; 2DRK A; 2DVJ A; 5IXB A; 1HJD A; 2YUP A; 3TSW A; 2EYW A; 2NUZ A; 3EHR A; 2A28 A; 1ARK A; 1WI7 A; 4Y92 A; 1AEY A; 4LUE A; 1IO6 A; 1N5Z A; 2AKL A; 4E6R A; 1UFF A; 1X27 A; 1WXB A; 3ULR B; 1NG2 A; 3C0C A; 3H0H A; 2DF6 A; 2J6K A; 2DBK A; 2LCS A; 1AWJ A; 2JT4 A; 2MOX A; 4ESR A; 2DIL A; 2K6D A; 3M0U A; 1ZUK A; 2J06 A; 1JXM A; 3IQL A; 1SHF A; 1SPK A; 1X6G A; 2JXB A; 4Z89 A; 4J9D A; 2EYZ A; 2FRY A; 1G2B A; 1OEB A; 2D0N A; 1WYX A; 4Z88 A; 2F2X A; 2L3P A; 2K3B A; 2EW3 A; 3RBB B; 3SEM A; 1KJW A; 1QWF A; 1CKA A; 2BTT A; 3VRY A; 2AZV A; 2XMF A; 4J9E A; 2LMJ A; 2VKN A; 4RTY A; 2O2O A; 1OPL A; 2LQN A; 4LUD A; 5IH2 A; 2OAW A; 4RTT A; 3VS3 A; 4LE9 A; 1GCQ C; 3A98 A; 1QWE A; 1TG0 A; 3EG3 A; 1U3O A; 1PRM C; 2GTO A; 4HVW A; 2M0Y A; 1WX6 A; 2HBW A; 2KRN A; 1J3T A; 1WA7 A; 1PWT A; 4QT7 A; 1SRL A; 2EPD A; 1YN8 A; 3PE0 A; 1UEC A; 1TUC A; 1PHT A; 2RNA A; 2RMO A; 1W6X A; 2GTJ A; 3I5R A; 3M0S A; 1I07 A; 1UUE A; 4GLM A; 4JZ3 A; 2KGT A; 2DRM A; 2CT3 A; 1E7O A; 2EKH A; 1Y0M A; 4J9F A; 3EG0 A; 2CUB A; 2ESW A; 2CSI A; 1ZUU A; 1MUZ A; 2J6O A; 1ABO A; 1AWO A; 3FJ5 A; 1M30 A; 1EFN A; 1ZX6 A; 2KXD A; 2A37 A; 2IIM A; 1AWW A; 2EBP A; 1NEG A; 3EG1 A; 2CT4 A; 2OI3 A; 2DL5 A; 1OOT A; 2AZS A; 1I1J A; 2YUQ A; 2KT1 A; 1SRM A; 2DL8 A; 1G83 A; 1CKB A; 3QWX X; 1B3Q A; 1ABQ A; 4RTZ A; 4J9C A; 2L3S A; 4JJD A; 1GRI A; 3EG2 A; 5I11 A; 4M4Z A; 4K11 A; 1AOJ A; 1WLP B; 2K2M A; 3VRZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2AK5 A; 2HQH A; 5KYW A; 1VQK Q; 2EKO A; 1WFW A; 4M7A F; 4J7I A; 3ZBD A; 4L5G A; 4EPC A; 5HCK A; 1YJW A; 1PD1 A; 4JLG A; 2XDD A; 2ZPF B; 2OJ2 A; 3VS2 A; 5CQX A; 2AKK A; 1IB8 A; 4KGX B; 2CZ1 B; 4XTX A; 1WZO A; 3M0T A; 5CKF A; 3ZEH A; 2YHT A; 5A0D A; 1UTI A; 2K5I A; 4HVV A; 1FWZ A; 1M1F A; 4M7D A; 3BDL A; 3H8Z A; 3PIP A; 1Q82 R; 4AFS C; 1VQ4 T; 4E7H A; 1LCK A; 1TUD A; 5D6W A; 2A7Y A; 4DEX A; 1IRE B; 3ASK A; 3JCM g; 3FC3 A; 3M0P A; 2FYK A; 3AHU A; 1F1B B; 3I55 A; 3G7Z A; 1NBE B; 5IHI A; 3REB B; 2DTI A; 4FT4 A; 1D0Z A; 4M77 E; 5FU7 C; 3SWN A; 2RHZ A; 4CC4 B; 1LNX A; 3G4S T; 4HCZ A; 1AZG B; 2RJF A; 3DKM A; 4HCC A; 1M27 C; 4OGC A; 5GMK h; 3EGD B; 5IN1 A; 2BIV A; 4AMC A; 1M2V B; 1SSH A; 2EJG A; 2KYB A; 1C6V X; 4M75 A; 3SHW A; 3P8H A; 3M55 A; 4HCK A; 1ZA2 B; 4CRI A; 1HK9 A; 4E7K A; 1ZUY A; 3NTK A; 2SRC A; 1VQ9 A; 3ME9 A; 4JDS A; 4AFU C; 1X69 A; 1NYF A; 4HT9 A; 3L2Q A; 4KH0 B; 2B86 A; 3QUI A; 3CMA A; 1D3B B; 2K4Y A; 1V1C A; 3NPF A; 3LW5 E; 2ZZD A; 3C12 A; 5ECA A; 1HXD A; 3GNF B; 3V8K A; 1RUW A; 5KYU B; 3FIF A; 1WHJ A; 1QKX A; 2NUP B; 3RDV A; 1H92 A; 4RTX A; 4IUU A; 2CGH A; 7AT1 B; 4C5H A; 2KRS A; 2RHX A; 4FT2 A; 4RTV A; 4LN2 A; 1ZBJ A; 2ZCF B; 2COY A; 2MCN A; 4C8Q C; 3G4S Q; 2COZ A; 1WXU A; 3N5B B; 1ZA1 B; 2EYX A; 3T9N A; 2XID A; 2LT4 A; 1WQ7 A; 1LPL A; 2JMA A; 4E47 A; 3M56 A; 4JUV A; 3V8L A; 3NGP A; 1RLQ C; 1I0C A; 3S6W A; 4BI3 A; 1X01 A; 2YRV A; 1NPP A; 2JZ2 A; 1ZQ1 A; 2FG0 A; 1UGQ B; 3CCU T; 4LNP A; 4GY5 A; 2V8K A; 1Q81 R; 2RI3 A; 4J9H A; 1V76 A; 4C92 B; 4XU3 A; 1QP3 A; 4RMO A; 1U5S A; 4EMH A; 3MHX A; 3OYD A; 1K8A R; 2DA9 A; 3QSU A; 2CUD A; 5CR2 A; 4XU0 A; 3TVT A; 4PJJ A; 5KH6 A; 2XIC A; 1T0H A; 1VQP A; 1VQ5 T; 1P92 A; 2RQW A; 1FX7 A; 2BZ8 A; 4EIK A; 2C0T A; 2WAC A; 4JJC A; 4EDU A; 3EH1 A; 3M0R A; 5GAO q; 2P0Q A; 2X9H A; 4PJO B; 1S1N A; 4M7D G; 4QVC A; 2K9G A; 2JUF A; 3G6E A; 4M7D D; 1MMD A; 3CD6 Q; 4OB1 B; 1T3L A; 2YWW A; 4BE2 A; 2QDY B; 2QYZ A; 4R56 A; 2FEI A; 1PC0 A; 2DXT A; 2QI2 A; 2MWP A; 3RKW A; 3QPH A; 4AG1 C; 4OMQ A; 1WNL A; 4OB3 B; 2YUO A; 1BI1 A; 4QW2 A; 1WHM A; 2RA2 A; 4E7L A; 3MO8 A; 2LX7 A; 1IHW A; 4FL6 A; 3R6O A; 2EGE A; 4NOY A; 1VQM A; 1Y96 A; 2DNU A; 1Z9Z A; 3REA B; 2PZ1 A; 2JMC A; 3CQT A; 3L2Z A; 1JXO A; 3L1A A; 2DE0 X; 3H0F A; 3SD4 A; 1YHQ Q; 1QP2 A; 1EIF A; 2CZ6 B; 4J6X A; 4M75 G; 3J81 E; 4E2F B; 3CBP A; 4M75 D; 1B34 B; 3OS0 A; 3DLL A; 1PCX A; 4FW2 A; 1UHF A; 1VQ5 Q; 4A53 A; 2RQV A; 2WSE E; 3VUB A; 2D8H A; 3EFS A; 3PFS A; 2O9V A; 3WXM B; 1QCN A; 4BI4 A; 2CS7 A; 1JB0 E; 2RF0 A; 3URG A; 1HJD A; 2DVJ A; 5KYN A; 3O8V A; 5IXB A; 3QYG B; 3CMA T; 3BDU A; 3CPW S; 1MND A; 2EYW A; 3CCJ Q; 1RAG B; 4XTU A; 3OW2 S; 1NJI C; 1Y07 A; 3LYI A; 3CME Q; 2DTH A; 3MP6 A; 2CKK A; 4BUG A; 2CP7 A; 1VQL T; 1QVG S; 4C0F A; 4J6Y A; 2MMP A; 4F7U E; 3OYY A; 2AKL A; 5A0G A; 2GCX A; 5M9O A; 4PFO A; 2RK1 A; 1X27 A; 1WXB A; 5GAN 6; 1MMN A; 2AHJ B; 3NTI A; 2DF6 A; 2COW A; 4FSX A; 2MOX A; 2Y90 A; 2A0F B; 2DIQ A; 3M53 A; 3CPW P; 2J06 A; 2HL3 A; 3CCV A; 4J9D A; 3LGF A; 3OYK A; 2D0N A; 3HSB A; 2WSF E; 1WYX A; 3OW2 P; 2P0P A; 2ZPH B; 2L3P A; 3JB9 G; 3CCR Q; 2XK0 A; 1KJW A; 2QTX A; 1QVG P; 3S3M A; 1D1C A; 1Q82 U; 2BTT A; 3OYC A; 4J9E A; 3D7S B; 3C94 A; 2DIG A; 2LQN A; 2QA4 A; 5IH2 A; 4RTT A; 1GCQ C; 1QWE A; 1TG0 A; 1YIT A; 5CVI A; 3S3O A; 2M0O A; 4M7A C; 2EPD A; 4MZM A; 1OI1 A; 2EIF A; 5J26 A; 1PHT A; 3G71 A; 4XU1 A; 3M0S A; 9ATC B; 4QKU A; 1N8R C; 2KGT A; 3EG9 B; 3TQ7 P; 4EMG A; 4C8Q A; 2EKH A; 3EFO B; 2CUB A; 1IZ6 A; 3A8M B; 4A4F A; 2CSI A; 1MUZ A; 3G6E T; 3OYM A; 1ABO A; 3FJ5 A; 2VB6 A; 3MP8 A; 4E7J A; 5GAO r; 3BFM A; 2RI5 A; 5LJ5 d; 3EG1 A; 2ZPB B; 4OVA A; 2DL8 A; 4PJN A; 4LDU A; 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4FYV B; 2YSQ A; 2HSP A; 2DL3 A; 1H3Z A; 3VS7 A; 1YJN A; 1YIT T; 2KBT A; 4J7F A; 4MDW A; 2DZ9 A; 4J8O A; 3H0I A; 3MP1 A; 4KGV B; 5GAM d; 4DBQ A; 1FYN A; 2DXC A; 3VS1 A; 3OYN A; 2DL4 A; 2E10 A; 2JM8 A; 1BIB A; 4M7D B; 2FL7 A; 3I35 A; 4HXJ A; 3CCS Q; 3CCE Q; 1KK7 A; 1M3B A; 3OYF A; 2CH4 W; 4WTO B; 4JS4 A; 2E6Z A; 4VUB A; 4C8Q G; 1B07 A; 3M4G A; 2HCK A; 3Q1J A; 3CC4 A; 3CCL Q; 4B9W A; 4JJN K; 2DJQ A; 4DBH A; 2CP6 A; 2C06 A; 4QVZ A; 2VAS A; 2F5T X; 1MV3 A; 3M59 A; 1WJR A; 5GAM j; 3I56 A; 3UAT A; 1WJS A; 2RJD A; 2A3L A; 1OPK A; 1N6A A; 2BZY A; 4BDZ A; 4IUR A; 3CC2 T; 4F14 A; 3RNJ A; 4RCC A; 5HKC A; 3M4Y A; 1S72 T; 4Z02 A; 5CQY A; 3SWN B; 3MPU B; 4AFQ C; 3PVL A; 4ZGD B; 4M78 D; 5GAN 8; 2R58 A; 3HTR A; 1HYO A; 5GJW B; 1RAD B; 4M77 C; 5IHN A; 5HK3 A; 5C0M A; 2DX1 A; 2XDP A; 1GCQ A; 2VYT A; 4C92 E; 1YWO A; 4D8K A; 1UJY A; 3FRN A; 3HRT A; 5GMK i; 2VWF A; 4M7A A; 4MZT A; 1PG5 B; 4M75 B; 4YTL A; 2HQX A; 3OYB A; 2CDT A; 1KD1 C; 1HSQ A; 4ZNX A; 2NWM A; 4IIO A; 2E70 A; 2D1X A; 5D6Y A; 1IGU A; 1SKU B; 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