The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
101
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structure length |
101
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Chain Sequence |
ADRKLCADQECSHPISMAVALQDYMAPDCRFLTIHRGQVVYVFSKLKGRGRLFWGGSVQGDYYGDLAARLGYFPSSIVREDQTLKPGKVDVKTDKWDFYCQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The Extracellular Human Melanoma Inhibitory Activity (Mia) Protein Adopts an SH3 Domain-Like Fold.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
HUMAN MELANOMA INHIBITORY ACTIVITY PROTEIN
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| molecule tags |
Growth factor
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
7
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| structure length |
101
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| sequence length |
101
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-01-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1AD5 A; 1TUC A; 3ULR B; 2O9S A; 2A36 A; 3EG3 A; 2KYB A; 4HCK A; 1S1N A; 1NM7 A; 1YN8 A; 1IO6 A; 2ECZ A; 4OMM A; 2G6F X; 2XMF A; 2DVJ A; 2LJ0 A; 2EYZ A; 3THK A; 1GCP A; 3M0Q A; 1CKA A; 3LH5 A; 1ZUK A; 3ZL7 C; 4ESR A; 1G2B A; 2KBT A; 2AZS A; 3FJ5 A; 2V1R A; 1MV0 B; 5L23 A; 1M3A A; 1ZSG A; 1AZG B; 3RNJ A; 1NG2 A; 1K9A A; 2YDL A; 1UHC A; 1ZUY A; 1ABO A; 1N5Z A; 2FO0 A; 1PNJ A; 5IXF A; 2MIO A; 1MV3 A; 1PRM C; 3UF4 A; 4IIM A; 4AFQ C; 1WX6 A; 4J9H A; 4RTZ A; 1WLP B; 2J7I A; 3VRY A; 1GCQ A; 2DE0 X; 1KJW A; 1B3Q A; 1B07 A; 3TVT A; 2J6F A; 1ARK A; 2BZ8 A; 2K2M A; 1GBR A; 2EBP A; 4J9C A; 2YUN A; 1K1Z A; 2D8H A; 2L3S A; 2DF6 A; 2LJ1 A; 4CC4 B; 2X3X D; 4X1V A; 1ZBJ A; 2JT4 A; 1X27 A; 5I11 A; 1M30 A; 3I9Q A; 3NHN A; 1UDL A; 1FYN A; 1YCS B; 1GFC A; 2K7A A; 1T0H A; 2EYX A; 1UE9 A; 4QT7 A; 2IIM A; 4OML A; 1AWW A; 2CSI A; 4HVW A; 4K11 A; 1U5S A; 1K0S A; 2DM1 A; 1PKS A; 2O9V A; 2YUP A; 1QWF A; 3NPF A; 1GL5 A; 1EFN A; 2H8H A; 1K4U S; 2X3W D; 1NLP C; 2NUZ A; 3H0I A; 2ROL A; 1Z9Q A; 3UA7 A; 2MCN A; 2DNU A; 1PHT A; 4OMP A; 2RMO A; 4A63 B; 2GQI A; 4M4Z A; 2KR3 A; 2ED0 A; 3M0R A; 4AG2 C; 1H8K A; 4LE9 A; 2M51 A; 5GJV B; 2K9G A; 3QWX X; 1SSH A; 4JZ3 A; 2SRC A; 1WFW A; 2D1X A; 2KYM A; 4Z89 A; 2QDL A; 2JW4 A; 2EYY A; 3M0S A; 1SHF A; 2E5K A; 3C0C A; 1ZLM A; 1AWO A; 2PNI A; 2M0Y A; 2FRY A; 4RTV A; 1W6X A; 1NEB A; 2D8J A; 1UTI A; 3H0H A; 1OPK A; 2A28 A; 2JS0 A; 2KRO A; 1KIK A; 4RTX A; 1UEC A; 5IHK A; 4JZ4 A; 2A08 A; 2CUD A; 1JXO A; 3VS2 A; 3VS0 A; 1FMK A; 2KNB B; 1ZX6 A; 1Z9Z A; 1PWT A; 3O5Z A; 4RTW A; 3NGP A; 1HJD A; 2LNH B; 1W1F A; 2FPF A; 1TUD A; 1SRM A; 2AKK A; 1GBQ A; 1UJ0 A; 3CQT A; 2RQT A; 2CT4 A; 1GCQ C; 1GFD A; 2CT3 A; 2EQI A; 4LNP A; 1I0C A; 1M27 C; 2ED1 A; 2GNC A; 4CC7 A; 1U3O A; 2PZ1 A; 5FWC A; 3REB B; 4F14 A; 1AEY A; 1YP5 A; 1PRL C; 2FG0 A; 2KRN A; 2AKL A; 4Y92 A; 2CH4 W; 2I0N A; 1RUW A; 3JV3 A; 2O2O A; 4EIK A; 1QCF A; 3SHW A; 1AWX A; 2RNA A; 1YNZ A; 2FRW A; 2DYB A; 2DL3 A; 2JMA A; 4RTY A; 1LCK A; 2EYW A; 1HD3 A; 3KFV A; 4ZNX A; 2YT6 A; 1UHF A; 4AG1 C; 1UFF A; 2FPE A; 2L0A A; 4AFU C; 1X69 A; 1RLQ C; 1X43 A; 2CSQ A; 1K76 A; 2EW3 A; 1UGV A; 1WIE A; 2K3B A; 4D8K A; 4F16 A; 2J06 A; 1T3S A; 2W0Z A; 1M3C A; 1V1C A; 4JPB W; 1JEG A; 1VYT A; 1X2K A; 3RBB B; 1TG0 A; 1HSQ A; 1E7O A; 1QKW A; 1X6B A; 1J3T A; 2K79 A; 1SRL A; 4OMN A; 4DEX A; 1XOV A; 4Z8A A; 2DJQ A; 1OV3 A; 3M0T A; 1Y57 A; 1NEG A; 2BTT A; 1VYU A; 2FEI A; 2ENM A; 1ZUU A; 2A37 A; 4HVU A; 2DL5 A; 1VA7 A; 5IH2 A; 4HXJ A; 1BU1 A; 2EKH A; 5IXB A; 1H3H A; 1BK2 A; 5FW9 A; 3EG2 A; 1ABQ A; 2LZ6 B; 2DBK A; 2DL8 A; 3M0U A; 2CUB A; 2C0I A; 1YWP A; 2W10 A; 3UA6 A; 2ESW A; 3EG1 A; 2PTK A; 4J9E A; 2VKN A; 1AOJ A; 1G83 A; 3I5R A; 2JMC A; 2HSP A; 2LMJ A; 4FSS A; 3VS7 A; 2F2X A; 1WYX A; 4J9B A; 3EG0 A; 1QKX A; 3VS3 A; 1JO8 A; 2LX7 A; 1OEB A; 2F2V A; 1OOT A; 1T3L A; 2C0T A; 2KE9 A; 2GTO A; 2KEA A; 2ROT A; 4R0K A; 5IHN A; 2D0N A; 2HBW A; 2RF0 A; 1W70 A; 1CKB A; 2FPD A; 5IHI A; 2CH4 A; 4CC2 A; 2GTJ A; 2RN8 A; 2EPD A; 2LQN A; 1QWE A; 4GLM A; 1NYG A; 1BBZ A; 2DRK A; 3QWY A; 3M0P A; 3EGU A; 1KSW A; 2DLP A; 1KFZ A; 1WXB A; 2HEQ A; 2F2W A; 2JS2 A; 2BZY A; 2JXB A; 2O31 A; 2L3P A; 2RQU A; 2VWF A; 1T0J A; 2LJ3 A; 2OJ2 A; 4F17 A; 4DEY A; 2KRM A; 5GJW B; 2EVR A; 4D8D A; 4J9G A; 3EHQ A; 2JM9 A; 2KT8 A; 1NLO C; 1AZE A; 2DIL A; 3H0F A; 1K0X A; 2LCS A; 4CC3 A; 2OAW A; 1A0N B; 1OPL A; 5EC7 A; 2JM8 A; 2AZV A; 3VS4 A; 2DMO A; 2J05 A; 4WCI A; 2C0O A; 5ECA A; 2GGR A; 3VS1 A; 1VYV A; 2JTE A; 1RLP C; 2DX1 A; 2CDT A; 1X6G A; 2P4R A; 1MUZ A; 1RI9 A; 3I35 A; 4LUD A; 2B86 A; 3SEM A; 4HVV A; 1M3B A; 3PVL A; 4OMO A; 3IQL A; 2RPN A; 1M8M A; 2KT1 A; 1U06 A; 3NMZ C; 2KRS A; 1UUE A; 1E6H A; 4J9D A; 4OMQ A; 2KGT A; 1AWJ A; 2MOX A; 1SEM A; 1UG1 A; 2RQW A; 5FWB A; 4LN2 A; 2EGE A; 1H92 A; 2J6O A; 2VVK A; 1YWO A; 3PVQ A; 1JXM A; 2LQW A; 1E6G A; 1I1J A; 2RQV A; 2KXD A; 2ABL A; 4AFZ C; 4JJD A; 4KRT A; 5HCK A; 2DL4 A; 1JU5 C; 1WDX A; 3TSW A; 3TSZ A; 3UAT A; 2O88 A; 1JQQ A; 2OI3 A; 4JJB A; 1I07 A; 2YSQ A; 1WI7 A; 2LP5 A; 1SHG A; 2RQR A; 3U23 A; 4J9I A; 1GRI A; 1X2Q A; 3VS6 A; 1QLY A; 1PKT A; 2YUO A; 3GBQ A; 4LUE A; 2K6D A; 2AK5 A; 4J9F A; 2YUQ A; 2SEM A; 2HDA A; 2KXC A; 2L3Q A; 1AVZ C; 1NYF A; 4GBQ A; 2DBM A; 1CSK A; 4RUG A; 2J6K A; 2NWM A; 1BB9 A; 4IIO A; 4JJC A; 2L2P A; 3REA B; 4AFS C; 1WXT A; 2BZX A; 2DRM A; 1WA7 A; 2EGC A; 4RTU A; 4ORZ A; 3VRZ A; 3PE0 A; 4E6R A; 2DL7 A; 5I22 A; 2GBQ A; 1WXU A; 2EGA A; 3R6N A; 4Z88 A; 3EHR A; 2DA9 A; 3I5S A; 2HCK A; 3A98 A; 2V1Q A; 2CRE A; 4RTT A; 1Y0M A; 1SPK A; 3VS5 A; 3H41 A; 1UJY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KVQ G; 3S6W A; 3QZ9 B; 5FU6 B; 2JZ2 A; 1QVF A; 3M9Q A; 4B9X A; 1QMC A; 2A36 A; 1Q81 U; 3EG3 A; 2ZPE B; 3HFO A; 2MPX C; 2KK4 A; 3VYG A; 2LJ0 A; 1BIA A; 3OS1 A; 3THK A; 4F7U G; 2CKK A; 3FJP A; 5GAN 8; 9ATC B; 3HRT A; 5EG2 A; 5KYN A; 1ZUK A; 2KBT A; 2V1R A; 1B34 B; 4PKC C; 2EKO A; 1AZG B; 1TU0 B; 4C0Z A; 5CR2 A; 1RAG B; 1R77 A; 2NLU A; 2YDL A; 2RJD A; 2KAF A; 1N5Z A; 4M77 B; 1WX6 A; 5HY6 A; 3G7Z A; 3OSS C; 4RTZ A; 2J7I A; 2QQ9 A; 1GCQ A; 2DE0 X; 2DXB A; 5A2Q E; 1LNX A; 3GLX A; 2XD0 A; 4KUL A; 3CME Q; 3PIP A; 1TWB A; 1ARK A; 5CQX A; 1M90 C; 4M78 G; 2BZ8 A; 1GBR A; 5GAO m; 4M7A D; 4J9C A; 5CKF A; 3CCQ T; 1I4K 1; 2D8H A; 2XU8 A; 3GNG A; 2GCX A; 4X1V A; 2CP5 A; 2CS7 A; 4PJO B; 3WVE B; 4P5N A; 1TUG B; 1UDL A; 3JCM V; 4ELY C; 3OMC A; 4BE1 A; 1T0H A; 1UE9 A; 4OML A; 4C5E A; 1U5S A; 2YUP A; 4BE2 A; 5CKE A; 1QVF S; 3HHT B; 2PVD B; 1NPR A; 1VIF A; 4C92 B; 5GAM g; 1ZSZ A; 4QVD A; 1PG5 B; 3H0I A; 5KYX B; 1KQS A; 5LL6 S; 3MPU B; 3UA7 A; 2DNU A; 4WF2 A; 4ZN3 A; 4M78 E; 2ED0 A; 4OF1 A; 3MCA B; 1H3Z A; 4LD9 K; 3CME A; 3QYH B; 1JRI A; 4FT4 A; 2K9G A; 4J8O A; 4JZ3 A; 3MHX A; 5GAN 5; 1VIE A; 1WFW A; 1VQ6 Q; 4DQ2 A; 2E65 A; 4BDZ A; 4PNO A; 1S72 T; 2XIC A; 3EH2 A; 2FRY A; 4RTV A; 3CCU T; 1D0Z A; 3I55 Q; 2DK3 A; 1NEB A; 2D8J A; 4PJO G; 1W2B A; 1OPK A; 2JS0 A; 1OUL A; 5FU6 C; 4A4G A; 3JCM J; 5IHK A; 2A08 A; 1KD1 U; 4QQG A; 5FRN A; 1FMK A; 2KNB B; 1ZX6 A; 2BE9 B; 3M53 A; 4O6J A; 1MHN A; 1TXQ A; 1WJR A; 1EZZ B; 4KUI A; 4M75 F; 3GF5 A; 2FPF A; 4IUU A; 2AKK A; 1SRM A; 3FIF A; 2L3R A; 3V8L A; 2E64 A; 3MJX A; 4M77 C; 2CT3 A; 1M27 C; 4OGC A; 3R6O A; 2ED1 A; 3A8M B; 2GNC A; 1VQ8 T; 1VQ6 A; 1U3O A; 2PZ1 A; 1AEY A; 3OYI A; 2CP3 A; 1UGR B; 2FG0 A; 1QCO A; 2CH4 W; 1RUW A; 3I55 A; 1QCF A; 3SHW A; 3DLL A; 4ZGE B; 1YNZ A; 1K73 U; 3OW2 A; 3JRZ A; 3G71 T; 2DYB A; 5DLO A; 2JMA A; 4R55 A; 4RTY A; 1RAD B; 2EYW A; 3M4G A; 2EWN A; 4PJO C; 3A8L B; 2K2V A; 2FPE A; 1TTH B; 1X69 A; 1RLQ C; 2EW3 A; 4F16 A; 3OBY A; 3S3M A; 4X9D A; 2DXT A; 1W2B S; 3RBB B; 1VQK T; 4PLI A; 4C92 C; 1QKW A; 1X6B A; 2PUO B; 1J3T A; 2K79 A; 4DEX A; 4RCC A; 2JN0 A; 2DJQ A; 2DIQ A; 3QXE B; 4PL6 A; 5CKB A; 2FEI A; 3I56 T; 4HVU A; 3M4Y A; 4Y91 A; 2RI2 A; 3RKW A; 1BK2 A; 1HYO A; 3EG2 A; 2EJ9 A; 5GAN h; 2DL8 A; 1Q86 U; 2YRV A; 3NFC A; 1YWP A; 2W10 A; 2ESW A; 1M90 R; 4OGE A; 4M78 D; 3A8G B; 2VV5 A; 4A4K A; 2HAX A; 1VQ7 T; 2EQM A; 4JS4 A; 1AOJ A; 1G83 A; 2HKN A; 1QVP A; 1AT1 B; 4FSS A; 1NPP A; 1NZ9 A; 3QJY A; 4RKU E; 3VS3 A; 5GAN 3; 4JLG A; 4C0D B; 2LX7 A; 3KBG A; 1OEB A; 2F2V A; 1T3L A; 5LJ5 j; 1X01 A; 1YJN T; 2GTO A; 3RES A; 3SFM A; 2KEA A; 1LPL A; 1RAI B; 2GFA A; 5IHN A; 2D0N A; 1N27 A; 3BDU A; 2CH4 A; 1PD0 A; 4C0G A; 2Z0W A; 4CC2 A; 3FB9 A; 3CMA T; 2GTJ A; 3L2U A; 4J5Y A; 1QWE A; 2DRK A; 3QWY A; 5DM7 R; 3QO3 A; 1M1G A; 3CD6 Q; 4ZN1 A; 1V29 B; 4XK8 E; 3SB2 A; 4D6W A; 2JS2 A; 1LJO A; 3OA6 A; 3JCM b; 1T0J A; 1YJW Q; 2DTI A; 3VU3 C; 5GMK j; 2ZPI B; 5GJW B; 1QVF P; 2MK5 A; 4XU1 A; 5FLX E; 3MP1 A; 2JM9 A; 4DBR A; 2K5L A; 3EH1 A; 2E3I A; 2A7Y A; 3H0F A; 1K0X A; 3QZ5 B; 4FYV B; 1QCN A; 4IUT A; 4CC3 A; 4ZTF A; 1A0N B; 1VQN Q; 2FYK A; 2OTL Q; 1OPL A; 5EC7 A; 1TH7 A; 4A53 A; 2JM8 A; 1IRX A; 3OBW A; 5IAY A; 2WAC A; 4WCI A; 4E7I A; 1K8A C; 1BI1 A; 4LUD A; 2B86 A; 4HVV A; 3AT1 B; 2JNG A; 3CD6 A; 4KGV B; 5AYF A; 3NMZ C; 1KQ1 A; 4J9D A; 4OMQ A; 2P84 A; 1AWJ A; 1YJW A; 4FM4 B; 2QDY B; 3CC7 Q; 2EGE A; 4N4H A; 1JXM A; 5GAN g; 1R0B G; 1YIJ T; 3FRN A; 3CCM Q; 3RIR A; 2O01 E; 3JSC A; 2LC4 A; 4KRT A; 1JU5 C; 2EAY A; 1JQQ A; 1I07 A; 2IVW A; 3SWN A; 4B9W A; 2RQR A; 1N8R C; 1VQN A; 2OTL A; 2OTJ T; 4J9I A; 3CCR Q; 3NTK A; 1PKT A; 4LUE A; 1FXX A; 1PC0 A; 2PVO B; 3CCL Q; 1VQK A; 4C0D C; 3X20 B; 4OB1 B; 4JS5 A; 2SEM A; 3CCV Q; 2KXC A; 4PJM A; 5LJ5 d; 2JJ9 A; 1NYF A; 4RUG A; 2CP2 A; 2M02 A; 3A8H B; 1WA7 A; 3FEO A; 3VRZ A; 5GAM j; 3PE0 A; 3WXM B; 2X35 A; 1PSF A; 3CC7 A; 2ZZD A; 3I5S A; 1XTD A; 1IZ6 A; 2YWW A; 4ANJ A; 3QII A; 4HCZ A; 1MMG A; 5A0G A; 3EG9 B; 3CCM A; 3H6Z A; 1W2B P; 1SPK A; 3VS5 A; 1JJ2 S; 3H41 A; 5CVI A; 1H64 1; 2NUT B; 1TUC A; 2MMP A; 5D6Y A; 2LCL A; 2RJF A; 4F7U F; 2KYB A; 3CCR A; 3G4S Q; 6AT1 B; 1IO6 A; 5HKC A; 4IKF A; 3QSU A; 2DET A; 1N9R A; 1VQL Q; 2BUD A; 3V7S A; 4EMG A; 3CCL A; 4ELZ C; 3AHU A; 2COW A; 2X4Y A; 3M0Q A; 1X75 C; 3CCV A; 3ZL7 C; 1G2B A; 2GF7 A; 1UEB A; 4QW2 A; 1D0X A; 1M5Q 1; 1K9A A; 1UHC A; 4LDV A; 3VKI A; 1ABO A; 4MMK A; 3OYG A; 2MIO A; 2CP7 A; 3UF4 A; 3PTA A; 2BKD N; 5D7U A; 2CZ7 B; 3JCM h; 4HT8 A; 4KGZ B; 3CCS Q; 4M77 A; 4M78 F; 4EDU A; 1KJW A; 3P8H A; 3HPW A; 4A4H A; 2DAQ A; 2MYS A; 4NOY A; 2IPO B; 4XU2 A; 5LJ5 f; 3J7A F; 2L3S A; 2ZPG B; 4JRP A; 3CME T; 2LJ1 A; 3ZEH A; 4CC4 B; 4N4G A; 3G4S A; 2X3X D; 3PMT A; 1WHL A; 2JT4 A; 1X27 A; 5I11 A; 1VQL A; 3X25 B; 3X28 B; 3NHN A; 3X26 B; 3LGL A; 1OZ3 A; 5LJ3 f; 3SWN B; 1Q82 C; 4PFO A; 2EYX A; 2QI2 A; 4QT7 A; 1ZA1 B; 2IIM A; 2RD1 A; 5I21 A; 4PJO A; 1K9M U; 3TCJ A; 3OB9 A; 3MEU A; 2DM1 A; 2VXF A; 3VUZ A; 1QWF A; 5FRO A; 3JCM X; 1NE8 A; 3CBO A; 1EFN A; 3EGX A; 2HD0 A; 2ZPB B; 4BI4 A; 4BI3 A; 1NLP C; 2BIV A; 1K8A R; 2ROL A; 4E7Z A; 1TOV A; 2AHJ B; 4C92 A; 5FRM A; 1Z9Q A; 4C5I A; 2RH2 A; 2RI5 A; 3CCS A; 4A63 B; 2GQI A; 5LJ3 g; 5GAM d; 5KYX A; 2XDP A; 2M51 A; 2RM4 A; 4L59 A; 4PJO F; 2KYM A; 1QQJ A; 1VQO Q; 4AMC A; 2JW4 A; 3OYB A; 3J80 E; 1YIT Q; 1M1K C; 3C0C A; 2HSE B; 4KGX B; 2M0Y A; 2E5Q A; 3T9N A; 1UTI A; 2Y4X A; 2HMA A; 1ZHI A; 3MET A; 1VQ6 T; 2R57 A; 3E1S A; 1Y71 A; 3DB4 A; 3H9N A; 1UEC A; 2HQE A; 1JXO A; 3I55 T; 4QVC A; 4PJN A; 3C95 A; 1EIF A; 1XJW B; 4IUV A; 1Z9Z A; 1N8R R; 3O5Z A; 5IT9 E; 3NGP A; 1BKB A; 1W1F A; 4OB3 B; 2GFU A; 2QYZ A; 2RA2 A; 1GBQ A; 1KHC A; 1RAC B; 3CQT A; 2LT1 A; 2MI6 A; 2NUP A; 4J6W A; 5LJ5 e; 1GFD A; 4LNP A; 4PFP A; 3V7C A; 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