The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
GSTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGACHGQTGMFPRNYVTPVNR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution Structure of the C-Terminal SH3 Domain of Grb2 Complexed with a Ligand Peptide: A Ligand Exchange Model of the SH3 Domain
rcsb |
| molecule keywords |
GROWTH FACTOR RECEPTOR-BOUND PROTEIN 2
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
6
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-01-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MUZ A; 1K4U S; 2K2M A; 1PNJ A; 3H41 A; 1OPL A; 4ESR A; 2DL5 A; 1WX6 A; 4Y92 A; 2EPD A; 1ZUU A; 2DL8 A; 4J9G A; 3EG3 A; 2KRO A; 2K79 A; 1FYN A; 1N5Z A; 1WA7 A; 2KNB B; 4RTV A; 4J9I A; 4OMO A; 2L3Q A; 2F2X A; 4RTZ A; 5FWB A; 5EC7 A; 2EYY A; 2DRM A; 4CC4 B; 2OJ2 A; 3ZL7 C; 2CH4 W; 2DL3 A; 2DJQ A; 2FPF A; 2MOX A; 4J9B A; 3M0S A; 3JV3 A; 1PKS A; 3M0P A; 1SSH A; 3U23 A; 2LQW A; 1UHC A; 2J6O A; 2CH4 A; 4CC2 A; 3NGP A; 1CKA A; 2L3S A; 1ARK A; 3GBQ A; 4LUD A; 2D8J A; 2M0Y A; 2EYW A; 1NEG A; 2DBK A; 1OOT A; 2F2W A; 5I22 A; 1Y0M A; 1SPK A; 4Z89 A; 2KT1 A; 2FRW A; 2A28 A; 2CSQ A; 4J9F A; 1W6X A; 4AFS C; 2J7I A; 5HCK A; 2O88 A; 2VWF A; 1K76 A; 1AWJ A; 1NEB A; 2OI3 A; 3EHQ A; 2AKK A; 5L23 A; 2KEA A; 2V1R A; 2EYZ A; 3SEM A; 2KGT A; 1BB9 A; 5I11 A; 3M0Q A; 1MV0 B; 2DL4 A; 1KJW A; 2CUB A; 5IXF A; 2D1X A; 4D8D A; 1ZBJ A; 1VYV A; 4RTW A; 1A0N B; 2KRM A; 3NPF A; 1YN8 A; 1AOJ A; 2CRE A; 3REA B; 1AZG B; 2DL7 A; 1SHF A; 4JZ3 A; 4M4Z A; 2LCS A; 2VKN A; 4CC3 A; 3PVL A; 1GCP A; 1I0C A; 3LH5 A; 2C0O A; 4HCK A; 2PTK A; 3CQT A; 4JJD A; 2GBQ A; 2JW4 A; 1EFN A; 1GFC A; 2X3W D; 1G83 A; 2D0N A; 2CT3 A; 2ESW A; 2CUD A; 3VS6 A; 1JXM A; 2BTT A; 1UJ0 A; 1E6H A; 2YUO A; 2DYB A; 1X2Q A; 4OMQ A; 1NLP C; 1RLP C; 1GCQ A; 4AG1 C; 2G6F X; 2YUQ A; 2F2V A; 4RUG A; 1UTI A; 1X69 A; 4OMM A; 2DBM A; 2EGE A; 1AZE A; 1CKB A; 2YDL A; 2YT6 A; 2LQN A; 2RQW A; 1Y57 A; 4JJC A; 4ORZ A; 3TVT A; 2JMA A; 2LJ0 A; 1OPK A; 4JZ4 A; 1X6G A; 1S1N A; 2A37 A; 4LUE A; 1QKX A; 1W1F A; 2W10 A; 1I07 A; 2B86 A; 2JT4 A; 1NM7 A; 2DNU A; 1HJD A; 1H92 A; 1UJY A; 1Z9Z A; 2RN8 A; 1PKT A; 2O9V A; 2QDL A; 1SRM A; 1UHF A; 4J9H A; 2YUN A; 1T0J A; 2FRY A; 2M51 A; 2YSQ A; 3RNJ A; 4J9C A; 5IHK A; 1GCQ C; 3C0C A; 3NMZ C; 4AFZ C; 1XOV A; 2KYB A; 4LNP A; 2RPN A; 1JXO A; 1U06 A; 2KRS A; 2BZ8 A; 2XMF A; 4J9E A; 1QWE A; 4FSS A; 2GQI A; 1NYF A; 2FO0 A; 1B07 A; 3VS2 A; 3REB B; 2DF6 A; 3I5R A; 4OML A; 3TSZ A; 1JU5 C; 3H0H A; 1UG1 A; 1GFD A; 2LJ1 A; 2ABL A; 4HVV A; 2K7A A; 2EQI A; 1KSW A; 4DEX A; 2LNH B; 2X3X D; 1UFF A; 2E5K A; 1M3A A; 1WDX A; 1QLY A; 4RTX A; 2JM8 A; 1ABO A; 1RUW A; 1UEC A; 2JM9 A; 4RTT A; 5FW9 A; 2L2P A; 2O9S A; 3O5Z A; 4JJB A; 3M0T A; 1K9A A; 1X2K A; 3H0I A; 1GBR A; 1OV3 A; 2ED0 A; 1U3O A; 2JMC A; 2FEI A; 1PRL C; 3VS3 A; 4A63 B; 1VYU A; 2FG0 A; 2K9G A; 2P4R A; 1PRM C; 3UA6 A; 2ENM A; 2DRK A; 2MCN A; 1RI9 A; 3VS4 A; 1IO6 A; 1ZUK A; 3VS5 A; 3UF4 A; 2C0I A; 4IIO A; 3VS0 A; 3EG0 A; 2AZV A; 4CC7 A; 1AD5 A; 4LE9 A; 4ZNX A; 1RLQ C; 2KRN A; 1E7O A; 1T0H A; 1X43 A; 2L3P A; 2RMO A; 2DMO A; 4D8K A; 1KIK A; 4JPB W; 3PE0 A; 1SEM A; 1M3B A; 2FPE A; 2EVR A; 2VVK A; 4F14 A; 1M30 A; 2KT8 A; 2LJ3 A; 4HVW A; 2JS0 A; 1ZX6 A; 3EG1 A; 4HVU A; 5ECA A; 2FPD A; 1TG0 A; 4AFU C; 4GBQ A; 2EKH A; 1AWW A; 3I9Q A; 1WXU A; 1NG2 A; 2EBP A; 1ZSG A; 1X6B A; 3EHR A; 1SRL A; 2RNA A; 2J05 A; 2RF0 A; 2ECZ A; 3VS7 A; 2KE9 A; 2GGR A; 3I5S A; 4EIK A; 1OEB A; 2GTO A; 3M0U A; 1T3S A; 2KR3 A; 2LZ6 B; 4X1V A; 1HSQ A; 2EW3 A; 1KFZ A; 4DEY A; 2KXC A; 5IXB A; 2C0T A; 5FWC A; 1NYG A; 1YP5 A; 5GJW B; 2J6K A; 1WLP B; 1QKW A; 4AFQ C; 1UGV A; 1TUD A; 2A36 A; 2EGA A; 4RTY A; 1AVZ C; 2I0N A; 1M3C A; 4K11 A; 1QWF A; 3RBB B; 1ZUY A; 1ZLM A; 1K0X A; 3H0F A; 1FMK A; 2K3B A; 4E6R A; 1K1Z A; 1BBZ A; 2KXD A; 2JXB A; 2AK5 A; 1WI7 A; 1G2B A; 2DX1 A; 2IIM A; 1YWP A; 1LCK A; 3UAT A; 4LN2 A; 2DM1 A; 2O2O A; 1UE9 A; 2LMJ A; 1JO8 A; 2BZY A; 2DA9 A; 1K0S A; 1E6G A; 3IQL A; 1J3T A; 1H8K A; 2CSI A; 1V1C A; 2W0Z A; 3KFV A; 2NWM A; 3VS1 A; 1YWO A; 1NLO C; 5IHI A; 2DLP A; 2H8H A; 3NHN A; 1WXB A; 1T3L A; 1U5S A; 2GTJ A; 1QCF A; 2DVJ A; 2L0A A; 1BK2 A; 3UA7 A; 1MV3 A; 2SRC A; 1B3Q A; 4WCI A; 2PZ1 A; 2CT4 A; 2J6F A; 2RQT A; 2YUP A; 1WXT A; 1GBQ A; 2DIL A; 1WYX A; 3A98 A; 3FJ5 A; 3TSW A; 2DE0 X; 2HCK A; 3QWX X; 3EGU A; 3EG2 A; 2ED1 A; 5IHN A; 2JS2 A; 1W70 A; 3PVQ A; 2HSP A; 2K6D A; 2LP5 A; 2D8H A; 3VRY A; 2SEM A; 2EYX A; 2RQR A; 4F17 A; 1WFW A; 2A08 A; 2LX7 A; 2GNC A; 1H3H A; 4OMP A; 2AZS A; 2O31 A; 4HXJ A; 1GL5 A; 2HEQ A; 2OAW A; 2JTE A; 1Z9Q A; 2RQU A; 1ABQ A; 2KYM A; 1M27 C; 1TUC A; 2AKL A; 3M0R A; 2ROT A; 1AEY A; 2KBT A; 1PWT A; 4Z88 A; 5IH2 A; 3I35 A; 4R0K A; 3SHW A; 1VYT A; 4AG2 C; 1JEG A; 4J9D A; 1WIE A; 1I1J A; 4GLM A; 2PNI A; 1UUE A; 1X27 A; 4RTU A; 3R6N A; 1AWO A; 2MIO A; 1PHT A; 1YCS B; 2J06 A; 1BU1 A; 1GRI A; 1VA7 A; 2RQV A; 3THK A; 5GJV B; 2BZX A; 4QT7 A; 2V1Q A; 3QWY A; 1JQQ A; 1SHG A; 4KRT A; 2EGC A; 4F16 A; 1YNZ A; 2HDA A; 1M8M A; 1HD3 A; 1UDL A; 1CSK A; 4IIM A; 1AWX A; 2CDT A; 2NUZ A; 4Z8A A; 2ROL A; 4OMN A; 3ULR B; 2HBW A; 3VRZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1MUZ A; 3Q1J A; 5J39 A; 2DIQ A; 5FRO A; 4ELY C; 4ESR A; 1WX6 A; 1AT1 B; 4KBM B; 5FLX E; 1ZUU A; 5A0G A; 1ACM B; 1FYN A; 2HKN A; 2XID A; 1B7T A; 2QYZ A; 4HA8 A; 3OS5 A; 4M7D A; 4OB1 B; 4PJO C; 2EYY A; 2EFI A; 3VU3 C; 4CC4 B; 3CCL A; 3GOX A; 2EQM A; 3ZL7 C; 2CH4 W; 2YRD A; 4LD9 K; 1TTH B; 1VQ5 Q; 3X24 B; 1M1F A; 3JV3 A; 2CP2 A; 1UHC A; 3VKI A; 1OX8 A; 1BI1 A; 2L3S A; 3QJY A; 4LUD A; 2D8J A; 3CPF A; 4J8O A; 2VGM A; 4AT1 B; 3CCU Q; 2A28 A; 1W6X A; 2LQK A; 4OMF B; 3V7C A; 3CCV Q; 1NE8 A; 3OS0 A; 1AWJ A; 2OI3 A; 2AKK A; 2KVQ G; 1K8A U; 4YTL A; 3SEM A; 1V29 B; 3MP6 A; 2X35 A; 2CP7 A; 3C94 A; 2YXY A; 1FX7 A; 3PMT A; 2CUB A; 2DTH A; 2RO0 A; 4FM4 B; 1ZBJ A; 3ZEH A; 2NUT A; 3X28 B; 4II1 A; 1VQ6 A; 3QYH B; 1M8V A; 1VYV A; 1VQ7 A; 3CCS Q; 3NPF A; 2EQK A; 1VQP Q; 3F70 A; 5KH6 A; 2VB6 A; 2X4J A; 1QCO A; 4FW1 A; 1AZG B; 2DL7 A; 2LCS A; 1K73 R; 4CC3 A; 2Y4X A; 2L5Q A; 1N9S A; 1YJ9 A; 2PTK A; 2QTX A; 3OQ5 A; 1KG1 A; 2OX7 A; 2RJD A; 4PJM A; 5I2S A; 3CCE T; 2KQW A; 1QVG S; 4KUD K; 2XDP A; 2E1H A; 2D0N A; 3RR6 A; 2ESW A; 1QVF A; 1BI0 A; 1NLP C; 4AG1 C; 2G6F X; 1G3T A; 4CI0 C; 1OZ2 A; 5J26 A; 1X69 A; 3CCQ Q; 1K73 C; 2OTJ A; 1EIF A; 1AZE A; 3QHS A; 4C8Q D; 4QVZ A; 1Q7Y C; 2YDL A; 2RQW A; 1JJ2 A; 2JMA A; 3LWH A; 5J3B A; 3SWN A; 3HKS A; 1YI2 T; 1W1F A; 2W10 A; 1I07 A; 2KSS A; 1UJY A; 7AT1 B; 2PUK B; 5CKB A; 1IRE B; 4JRI A; 2JUF A; 3CMA T; 3M5A A; 2B8A A; 3RIR A; 4J9C A; 2ZZD A; 3QJ6 A; 2JJ9 A; 2LRQ A; 1WHM A; 1XOV A; 2RPN A; 3CCM Q; 2HQH A; 3G6E Q; 1YBY A; 1U06 A; 1Y71 A; 5KYU A; 2XMF A; 4J9E A; 3WVD B; 4FSS A; 2GQI A; 3CXC P; 2R57 A; 3RUX A; 3JB9 I; 2DF6 A; 5LL6 S; 5CCA A; 2ATC B; 3H0H A; 5KYW B; 5CAI A; 2FYK A; 1X6O A; 1LOJ A; 1VQ4 T; 2DKG A; 5GAN 8; 3TRE A; 2LNH B; 2X3X D; 3BDU A; 4PJO D; 2MAM A; 2QQ9 A; 1QLY A; 1VQ9 Q; 3N5B B; 1ABO A; 4FYX B; 1B34 B; 5CIU A; 4DBQ A; 4C8Q B; 3GLX A; 3O5Z A; 2GF7 A; 2F1L A; 3HRT A; 5L8R E; 3SFM A; 2DXU A; 2JMC A; 3M9Q A; 3VS3 A; 2HL3 A; 1VYU A; 2K9G A; 5CKD A; 1PRM C; 2HNI A; 4F7U E; 4C92 D; 2AT1 B; 3CME Q; 3CPW P; 1Q82 R; 2DFU A; 2AIR B; 1IO6 A; 4HCZ A; 3VS0 A; 2ZPI B; 5D7U A; 1RAC B; 4EMH A; 4LE9 A; 1YIJ Q; 1RLQ C; 1E7O A; 1T0H A; 1X43 A; 1PG5 B; 2L3P A; 2RD1 A; 4QQG A; 2M02 A; 4HKE A; 3PE0 A; 1G3Y A; 1VIF A; 2RHY A; 3CC2 A; 3CCL T; 1OQK A; 4F14 A; 3QDR B; 2PU9 B; 2XKO C; 2LJ3 A; 1ZX6 A; 1Q82 C; 3QO3 A; 1OYX A; 5C6S A; 1D0Z A; 1TG0 A; 4EMK A; 1WXU A; 2XHC A; 3EGX A; 4M78 F; 1RAH B; 2J05 A; 1BIA A; 2ECZ A; 2LTO A; 2R5M A; 2DYI A; 1OEB A; 2KR3 A; 4M75 G; 2EW3 A; 1KFZ A; 6AT1 B; 2GCX A; 1D3B B; 2C0T A; 1YP5 A; 1WLP B; 1WJQ A; 5GAO r; 4BE2 A; 1UGV A; 3UWN A; 2A36 A; 1RAE B; 1AVZ C; 3VV0 A; 4MMK A; 2DD4 A; 4C92 A; 1YJN Q; 1VQ6 T; 3CC7 Q; 1VQ7 T; 1FMK A; 4E7L A; 1MHN A; 1KC8 C; 5EG2 A; 1D0Y A; 1K1Z A; 2KXD A; 1UGP B; 2AK5 A; 2PVO B; 3H9N A; 3G4S A; 1NPR A; 3OYN A; 1W2B P; 5GAN 6; 1LCK A; 1KHC A; 3ZBD A; 3LYI A; 2DM1 A; 5C0M A; 4R55 A; 1K0S A; 1U1T A; 1EX4 A; 1G3W A; 2E5Q A; 4OGC A; 3IQL A; 4XTZ A; 1YJ9 T; 1H8K A; 2EQU A; 2CSI A; 5CO7 A; 2W0Z A; 4PLL A; 1NLO C; 4E47 A; 2H8H A; 3NHN A; 1WXB A; 1KQ1 A; 1VQM A; 1LJO A; 2L0A A; 2SRC A; 1B3Q A; 1S72 A; 2CT4 A; 2RQT A; 2YUP A; 1GBQ A; 3GPL A; 4MDW A; 2LDM A; 2HCK A; 4M78 G; 2OTJ T; 1F1B B; 3CXC A; 5IHN A; 4RG2 A; 2MK5 A; 1KQ2 A; 5AYF A; 3UT1 A; 2SEM A; 2EYX A; 4A4K A; 3OYC A; 1ZSZ B; 2NUP A; 3OW2 S; 2RHI A; 2O31 A; 3PIO A; 2HQE A; 2V26 A; 4FYY B; 2RQU A; 1M90 R; 3OYE A; 1TUC A; 1PCX A; 1VQO A; 2BKD N; 4OGE A; 3OYG A; 3M0R A; 4B6M A; 1G5V A; 1RAB B; 3CD6 Q; 1KQS S; 3SHW A; 4AG2 C; 4GLM A; 1WNL A; 2PNI A; 3VJP A; 5IT9 E; 1M2V B; 1IXD A; 1X01 A; 1WPY A; 1KD1 R; 2IPO B; 4QVD A; 2MIO A; 1C0M A; 1YCS B; 1BU1 A; 3GNG A; 5KYX B; 5CKE A; 3CPW A; 3TQ7 P; 4QVC A; 3JB9 J; 5GAN 7; 3QWY A; 1QP3 A; 2E3H A; 2VXF A; 4KRT A; 2EGC A; 1M90 C; 4X9D A; 1YNZ A; 3OMG A; 4KGX B; 4Y28 E; 1I5O B; 1IHV A; 2HBW A; 3G71 A; 2KY9 A; 5CQY A; 1KD1 C; 4BY6 C; 3H41 A; 4BDZ A; 3MKD A; 4FW2 A; 2DIG A; 2K2V A; 2EPD A; 2QA4 Q; 2DL8 A; 3EG3 A; 2KRO A; 3GP8 A; 4DBH A; 2DD5 A; 2I2L A; 2E3I A; 2KNB B; 1NJI U; 4RTV A; 4OVA A; 3E2U A; 4C0F A; 4OP0 A; 2A0F B; 5DY9 A; 5EC7 A; 4QQD A; 4OB2 B; 4M7A B; 2VXE A; 4C8Q E; 2DRM A; 1Q86 U; 2PVG B; 3CCR A; 4ELZ C; 2KK4 A; 2DL3 A; 3CC2 T; 2FPF A; 4M7A F; 2MOX A; 3TEE A; 4J9B A; 1VQ5 A; 3M0P A; 3EFR A; 1SSH A; 2XG8 D; 3U23 A; 1OUL A; 1O75 A; 3TU4 K; 1CKA A; 3GBQ A; 2EYW A; 1WQW A; 2F2W A; 1SPK A; 1W2B A; 3A8O B; 2HSE B; 2CSQ A; 2QXF A; 4J9F A; 2J7I A; 2VWF A; 4M77 G; 1NEB A; 2L8D A; 3BFM A; 2KEA A; 2V1R A; 3CCV A; 3LX7 A; 2K5F A; 3QSU A; 2QQS A; 3CBO A; 4Q5W A; 2VUB A; 1TOV A; 1PSF A; 3HTR A; 2LX9 A; 2D1X A; 3JCM g; 4PJO E; 3CCS A; 1YN8 A; 4KH0 B; 1AOJ A; 2EJG A; 2CRE A; 1VQP A; 1K9M C; 4HT9 A; 2O4X A; 4ZN1 A; 4M4Z A; 3EG9 B; 2CP3 A; 3GIB A; 3PVL A; 3E19 A; 4BDY A; 1I0C A; 3G4S T; 4HCK A; 3EFO B; 3EH2 A; 4DOV A; 3ASK A; 1RAF B; 5KE3 A; 4JJD A; 3SD4 A; 1R77 A; 1GFC A; 2X3W D; 1G83 A; 3A8L B; 2LCC A; 1YJW Q; 2LNV A; 4F7U A; 2CT3 A; 3VS6 A; 2CUD A; 2KMT A; 1K9M U; 1JXM A; 1UJ0 A; 4PL6 A; 2H3J A; 3V7R A; 3MEV A; 4L5G A; 2CP6 A; 2V8I A; 1GCQ A; 2YUQ A; 2XIC A; 1VQM T; 4V2S A; 3DLM A; 3L2R A; 3CCQ A; 1S72 T; 3GNF B; 2ZPF B; 4LDU A; 1WJS A; 2CS7 A; 2JTM A; 2X51 A; 3JB9 D; 2LQN A; 2DK3 A; 1K8A R; 2CGH A; 4N0A C; 1X6G A; 2JOY A; 2A37 A; 4XTV A; 4M78 C; 2JT4 A; 1JRI A; 2DNU A; 1H92 A; 3O8V A; 1WHG A; 1I81 A; 3CCJ Q; 2CYZ B; 2DTI A; 3JCM h; 2O9V A; 3PNW C; 1SRM A; 1I5L A; 4LD6 A; 4FT4 A; 2FRY A; 1YIT Q; 4AFZ C; 2XK0 A; 1VQO T; 4LNP A; 1HK9 A; 3CCM A; 1K8A C; 4HCC A; 3G6E A; 2K57 A; 2GQV A; 4M7D F; 4PLI A; 3REB B; 4FT2 A; 2F69 A; 2ABL A; 4JJN K; 3CPW S; 1KSW A; 4DEX A; 1UFF A; 1FWZ A; 2E5K A; 1WDX A; 2X4Y A; 4E7I A; 1VQL Q; 1VQN Q; 4J83 A; 5GAO n; 1RUW A; 2K4Y A; 3T9N A; 1VQ9 A; 1UGQ B; 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