The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
GSTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGACHGQTGMFPRNYVTPVNR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution Structure of the C-Terminal SH3 Domain of Grb2 Complexed with a Ligand Peptide: A Ligand Exchange Model of the SH3 Domain
rcsb |
| molecule keywords |
GROWTH FACTOR RECEPTOR-BOUND PROTEIN 2
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
6
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-01-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3LH5 A; 1WDX A; 5L23 A; 2LX7 A; 2A36 A; 5I22 A; 2J6F A; 1UEC A; 2KEA A; 2A28 A; 1M3A A; 1U5S A; 2KRM A; 3VRZ A; 1GL5 A; 2J6K A; 2C0O A; 2LJ3 A; 2DMO A; 1AWJ A; 1UHF A; 2ENM A; 3EHR A; 2X3X D; 1NG2 A; 5FWC A; 1QLY A; 3CQT A; 3TSW A; 1BBZ A; 4HVW A; 4OML A; 1WIE A; 4GLM A; 3TVT A; 1B3Q A; 2DYB A; 2DBK A; 3PVQ A; 2P4R A; 2EQI A; 2M51 A; 2RF0 A; 2W10 A; 3FJ5 A; 2EGE A; 2V1R A; 3EG2 A; 4GBQ A; 2F2X A; 2AZV A; 1VYT A; 4Z88 A; 2SEM A; 2BZ8 A; 2YUP A; 1I07 A; 4K11 A; 4KRT A; 4RTT A; 1PKS A; 1KFZ A; 4J9E A; 2GTJ A; 4WCI A; 4D8K A; 1G2B A; 3RBB B; 1A0N B; 2CRE A; 3QWY A; 1WLP B; 2DIL A; 2JMC A; 1VYV A; 4F14 A; 3UAT A; 3H41 A; 2J6O A; 3NGP A; 4J9I A; 2CH4 A; 1YWP A; 1GCQ A; 2FRW A; 4M4Z A; 2ED1 A; 1UJY A; 1X69 A; 1SHF A; 1M30 A; 1X2Q A; 1UHC A; 1GFD A; 1YNZ A; 3JV3 A; 4AFQ C; 1M3C A; 1JXO A; 2GTO A; 3I5R A; 1QWF A; 4JJC A; 2J06 A; 2VKN A; 1YWO A; 2A08 A; 2KRS A; 4AG2 C; 2O88 A; 2H8H A; 1AVZ C; 1PWT A; 1V1C A; 2GBQ A; 3U23 A; 2EYX A; 1UFF A; 4FSS A; 2YSQ A; 1RLP C; 2KNB B; 1FMK A; 2PNI A; 1TUC A; 1JQQ A; 3SHW A; 2AKK A; 2AZS A; 3VS1 A; 1AD5 A; 2DF6 A; 3C0C A; 1YCS B; 4AG1 C; 2GGR A; 2M0Y A; 3VS7 A; 1K9A A; 1QWE A; 2FPD A; 1RUW A; 2CT4 A; 2KXD A; 4CC7 A; 2EYY A; 4F17 A; 2W0Z A; 1W6X A; 4HVV A; 1T3S A; 3THK A; 1X2K A; 2F2V A; 2AK5 A; 2GNC A; 1WI7 A; 3O5Z A; 3IQL A; 2LMJ A; 2FEI A; 3H0I A; 2D8H A; 2K9G A; 2JMA A; 4RTX A; 1GRI A; 1MV3 A; 2MOX A; 2LJ0 A; 4DEX A; 2JXB A; 1CKB A; 1I0C A; 2VVK A; 2RQU A; 4LE9 A; 3UA7 A; 1IO6 A; 2LQW A; 2D1X A; 1GFC A; 2JM8 A; 4Z89 A; 1K4U S; 5I11 A; 1X27 A; 2KYB A; 1M27 C; 4Y92 A; 2BZY A; 2I0N A; 3RNJ A; 4J9C A; 4LN2 A; 1NLP C; 3M0S A; 3VS6 A; 1ZSG A; 1H92 A; 1NEB A; 3VS5 A; 2GQI A; 2LQN A; 1WXB A; 2ROT A; 1BB9 A; 1NYF A; 3NMZ C; 1EFN A; 1W1F A; 1JO8 A; 2ABL A; 2KBT A; 1SEM A; 1UJ0 A; 1XOV A; 4JZ4 A; 2EGA A; 4DEY A; 4AFZ C; 1MV0 B; 2V1Q A; 1I1J A; 2C0T A; 4HCK A; 1QCF A; 3QWX X; 1PRM C; 1ZUY A; 1SRM A; 3M0P A; 1VYU A; 1U06 A; 1GBQ A; 1NYG A; 2HCK A; 2KGT A; 4RTZ A; 2VWF A; 1JEG A; 1QKW A; 2O9V A; 1X6B A; 2LP5 A; 3VS4 A; 1WX6 A; 1ARK A; 2O9S A; 3M0U A; 2C0I A; 1LCK A; 4EIK A; 1BU1 A; 1UE9 A; 2XMF A; 3EG1 A; 1H3H A; 2FG0 A; 3A98 A; 2RQR A; 4CC3 A; 1AEY A; 1NLO C; 4J9D A; 1UDL A; 1QKX A; 2L3S A; 4LUD A; 2O31 A; 2KXC A; 2EGC A; 1NEG A; 2MIO A; 2LNH B; 1Y0M A; 1SPK A; 4LNP A; 4HXJ A; 2HDA A; 2HBW A; 1KSW A; 4RTU A; 2FRY A; 2OAW A; 2X3W D; 1PHT A; 3UA6 A; 4J9H A; 2LZ6 B; 1U3O A; 1T0J A; 1S1N A; 5EC7 A; 2KR3 A; 4D8D A; 3EHQ A; 3EG3 A; 3H0F A; 2BTT A; 3PE0 A; 2QDL A; 1E6H A; 5IHN A; 1TUD A; 3NHN A; 3M0T A; 3VS2 A; 2K6D A; 3ULR B; 3VS3 A; 2KRN A; 3I35 A; 2EW3 A; 2JTE A; 3KFV A; 2KYM A; 4IIO A; 2CSI A; 3VRY A; 1GCP A; 2LCS A; 1T0H A; 4JPB W; 1H8K A; 2DA9 A; 4RTW A; 2JS0 A; 3UF4 A; 1HJD A; 2RNA A; 1ZLM A; 3REA B; 5HCK A; 1JU5 C; 1ABO A; 2OI3 A; 3EG0 A; 4RUG A; 2D8J A; 2EPD A; 2DL3 A; 3PVL A; 3EGU A; 5IHI A; 4LUE A; 4JJD A; 1YP5 A; 2ESW A; 2JT4 A; 2O2O A; 4HVU A; 3H0H A; 4JZ3 A; 3M0R A; 1AWX A; 2KRO A; 5GJV B; 1K76 A; 4AFU C; 4QT7 A; 2RMO A; 2YUQ A; 4Z8A A; 2HSP A; 1T3L A; 2EKH A; 4J9G A; 1PKT A; 1PNJ A; 1Z9Z A; 4OMN A; 2ROL A; 4OMQ A; 4CC2 A; 1X6G A; 1K0X A; 1CSK A; 2PZ1 A; 5IXB A; 2EVR A; 1K1Z A; 2RQT A; 2ECZ A; 3VS0 A; 1RLQ C; 2K7A A; 2KT8 A; 1N5Z A; 1AWO A; 2CSQ A; 2FPF A; 4IIM A; 2K79 A; 4J9B A; 2DL4 A; 3REB B; 1SHG A; 3ZL7 C; 1ZUK A; 4R0K A; 2K3B A; 3GBQ A; 2DJQ A; 4OMO A; 1UG1 A; 3NPF A; 1WXU A; 2D0N A; 5IHK A; 2L2P A; 1KJW A; 4ORZ A; 2DBM A; 1J3T A; 3I5S A; 1NM7 A; 2ED0 A; 1Y57 A; 1Z9Q A; 2SRC A; 3SEM A; 1VA7 A; 2FO0 A; 2K2M A; 1WXT A; 4E6R A; 2G6F X; 1MUZ A; 1SRL A; 1W70 A; 2PTK A; 1WFW A; 3TSZ A; 2JS2 A; 2NWM A; 2RPN A; 2YT6 A; 4AFS C; 2J05 A; 5GJW B; 2YUN A; 2EYW A; 2L3Q A; 1M3B A; 4X1V A; 1HD3 A; 4F16 A; 1AZG B; 1SSH A; 1OV3 A; 1OEB A; 1M8M A; 2CDT A; 2IIM A; 1ZX6 A; 2DRK A; 1AZE A; 1CKA A; 2DLP A; 1ZUU A; 1YN8 A; 2YDL A; 1ZBJ A; 2CT3 A; 1K0S A; 2HEQ A; 1FYN A; 1PRL C; 4RTV A; 2DRM A; 4CC4 B; 2DL7 A; 2DVJ A; 1AOJ A; 2DX1 A; 2RQW A; 2A37 A; 2L0A A; 2RQV A; 2MCN A; 1TG0 A; 4ESR A; 2DL5 A; 5IXF A; 1OPK A; 3R6N A; 1GBR A; 2JM9 A; 2DE0 X; 2FPE A; 2CUB A; 4OMP A; 2B86 A; 1ABQ A; 2OJ2 A; 1UUE A; 1OPL A; 1WYX A; 1UGV A; 1JXM A; 4A63 B; 1AWW A; 3I9Q A; 2DM1 A; 1UTI A; 4OMM A; 1HSQ A; 2KE9 A; 1GCQ C; 1E6G A; 5FWB A; 5IH2 A; 2DL8 A; 2F2W A; 4ZNX A; 1WA7 A; 2AKL A; 2EBP A; 5FW9 A; 1RI9 A; 2YUO A; 2DNU A; 2CUD A; 4J9F A; 2JW4 A; 2BZX A; 2E5K A; 1B07 A; 2J7I A; 2L3P A; 4JJB A; 2EYZ A; 2KT1 A; 1KIK A; 4RTY A; 5ECA A; 1X43 A; 2LJ1 A; 1G83 A; 1BK2 A; 2RN8 A; 1OOT A; 2NUZ A; 2CH4 W; 3M0Q A; 1E7O A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1WDX A; 5L23 A; 1OQK A; 5HY6 A; 1HK9 A; 2VXE A; 4J7F A; 2P84 A; 2KEA A; 5D7U A; 4Y91 A; 1ZSZ B; 2JTM A; 4MMK A; 3TRE A; 4C0D B; 2RHI A; 1FMW A; 2DMO A; 5CK9 A; 4FW2 A; 1VQK Q; 4XAX B; 3EHR A; 1BYM A; 1WGS A; 1NG2 A; 2QTX A; 5FWC A; 5DM7 R; 3CQT A; 5FRM A; 2KI7 A; 3M55 A; 3TSW A; 2E12 A; 4M7D C; 1VQL A; 1Y96 A; 4HVW A; 5KYW A; 4OB3 B; 2LT4 A; 3TVT A; 1PD1 A; 2JN0 A; 3PVQ A; 5J39 A; 2RF0 A; 4RCC A; 2ATC B; 4GBQ A; 2AZV A; 2CP5 A; 2SEM A; 2BZ8 A; 2YUP A; 4K11 A; 1Q86 U; 1M90 R; 1AT1 B; 1PKS A; 3MEA A; 4J9E A; 3OYL A; 2GTJ A; 1QVG S; 2FB7 A; 1WQ7 A; 3CCQ Q; 1YJ9 T; 2DO3 A; 4F04 B; 3G6E A; 1I5L A; 4F14 A; 3NGP A; 4FYX B; 3CPF A; 4FU6 A; 3MP1 A; 1YBY A; 4FIB A; 1GCQ A; 1UJY A; 3CCM Q; 1OX9 A; 1SHF A; 3HTR A; 1UEB A; 2VXF A; 4C8Q A; 5D6X A; 2QI2 A; 4BY6 C; 4AFQ C; 1M3C A; 3OY9 A; 1JXO A; 3BE3 A; 3I5R A; 1VQ7 A; 2ZAE A; 3CPW S; 1M2O A; 2J06 A; 4AG2 C; 3CCR T; 3CCJ Q; 4N0A A; 1M4Z A; 3CC2 Q; 2QEX T; 5CKH A; 2PVO B; 1QVG A; 4IUU A; 3KBG A; 2XG8 D; 2LCC A; 1WNL A; 3M59 A; 3SHW A; 2K5L A; 4LDU A; 2AHJ B; 2DF6 A; 3BW1 A; 2M0Y A; 5FU7 C; 5KYY A; 3DLM A; 1BCO A; 4BD3 A; 3G4S A; 4IUQ A; 1Y07 A; 2EYY A; 4GY5 A; 3NTI A; 1TS9 A; 4HVV A; 1MMA A; 4IUR A; 3CCL A; 4E7J A; 3G71 T; 1M1K C; 1X2K A; 2C06 A; 1VQ8 A; 5IN1 A; 4EMG A; 2FEI A; 2D8H A; 3JB9 H; 2K9G A; 4BB7 A; 2K2V A; 4M7D A; 1EX4 A; 3HL8 A; 3OYE A; 2AIR B; 3OS2 A; 3Q1J A; 4JRI A; 1CKB A; 2RQU A; 1LOJ A; 1Q7Y C; 3UA7 A; 1G3W A; 3JCM P; 1M5Q 1; 3RMS A; 2LDM A; 4M77 D; 2OTJ Q; 3M56 A; 4J9C A; 4N4H A; 1M2V B; 2LVM A; 4M77 C; 2PVD B; 3L42 A; 4UC4 A; 4OP0 A; 4X9C A; 2K57 A; 2EIF A; 4QVD A; 4PJJ A; 2G3R A; 1RAE B; 2QA4 T; 4M7A F; 2KBT A; 3EGD A; 1XOV A; 1I1J A; 3JCM d; 1X75 C; 4HCK A; 3LW5 E; 3OSV A; 3V7R A; 4BE2 A; 3QBY A; 2HCK A; 2KGT A; 4RTZ A; 3HHT B; 1JEG A; 1KG1 A; 1QKW A; 5KYU B; 3VUB A; 1VQ9 T; 2NUT A; 3ER0 A; 1VQM Q; 4E7K A; 2QGF B; 3VS4 A; 5IAY A; 2RI5 A; 4LDX A; 3PMT A; 4BI3 A; 3CC4 T; 1C6V X; 3M0U A; 2C0I A; 4OGC A; 4EIK A; 1UE9 A; 3PIO A; 3JCM b; 2FG0 A; 1W2B P; 4CC3 A; 3WVE B; 1YHQ T; 2H3E B; 2O31 A; 3S3M A; 1K8A C; 4PFZ A; 1SG5 A; 2KXC A; 1D0Z A; 2EGC A; 4IUP A; 3X28 B; 5I21 A; 2LNH B; 1SPK A; 4LNP A; 2DXC A; 2RA2 A; 1N6A A; 2HDA A; 2HBW A; 1K9M C; 4M7A G; 2MWO A; 2JZ2 A; 2NYS A; 5CQX A; 2DD5 A; 2DD4 A; 2OAW A; 2L89 A; 1U3O A; 1B7T A; 3EHQ A; 3OYY A; 3JCM J; 3EG3 A; 2BTT A; 2QDL A; 4M77 A; 4EMK B; 3OYI A; 2XIC A; 2MWP A; 2VB6 A; 2V26 A; 1VQL Q; 5A0L A; 3FRN A; 3DB3 A; 5GAM j; 2KYM A; 5KYX A; 1YJN T; 3ZBD A; 5KE2 A; 1T0H A; 2PUK B; 1VQN T; 1OX8 A; 3DB4 A; 4EDU A; 2R5M A; 1KK7 A; 1H8K A; 4J7I A; 5FU6 B; 3UF4 A; 2JS0 A; 2YLC A; 1KD1 C; 1HJD A; 2CGH A; 5GAM f; 3EG0 A; 4VUB A; 2HZY A; 4RUG A; 2DL3 A; 3V8K A; 1S72 T; 3T9N A; 1TOV A; 1YP5 A; 2Z0W A; 5I2M A; 2JT4 A; 4M75 C; 3M0R A; 5GMK i; 2WSC E; 1ZBX A; 5CR2 A; 2RMO A; 2F69 A; 3ZFJ A; 3C94 A; 2KY9 A; 1PKT A; 1NJI U; 4OMN A; 4OMQ A; 4A4K A; 1X6G A; 2VV5 A; 1M1K R; 2JOY A; 1N5Z A; 3CC7 A; 2CSQ A; 3AHU A; 3M58 A; 4ZN3 A; 5HK3 A; 2D0N A; 3OYA A; 1VQK T; 2DBM A; 3G4S Q; 2MK5 A; 3SEM A; 3EGX B; 1D0Y A; 2RK1 A; 2G6F X; 1MUZ A; 3E9F A; 1WFW A; 1VQ8 Q; 2DIQ A; 2NWM A; 2J05 A; 3UWN A; 5GAO r; 1VIF A; 2JNG A; 4XTV A; 5A2Q E; 5I2S A; 1B34 B; 1YN8 A; 2YDL A; 3C4S A; 4DBR A; 1BIB A; 2L8D A; 1K0S A; 1IZ6 A; 1FYN A; 3FIF A; 1PRL C; 5IT9 E; 5GMK l; 3M57 A; 1AOJ A; 4HCB A; 1WHH A; 2ZPH B; 2ZPF B; 1TG0 A; 4OMF B; 3CCM T; 1VQO A; 4R55 A; 5FLX E; 3LLR A; 3HPW A; 2COW A; 3PNW C; 4M75 A; 1O9S A; 1OPL A; 4JJN K; 3CCS A; 1YI2 A; 2LCL A; 1Q82 U; 5KCH A; 1LJO A; 1SKU B; 4XTY A; 3GPL A; 6AT1 B; 1VQP T; 3CCJ T; 2DTH A; 4C0F A; 2KE9 A; 1D3B A; 1E6G A; 3A8L B; 1VQ4 Q; 2HQE A; 2P0Q A; 4ZNX A; 2ZPE B; 2QQR A; 1OUL A; 1K8A R; 3E2U A; 1KQ1 A; 5FW9 A; 1RI9 A; 2BZX A; 4M7A B; 3OYF A; 2J7I A; 2OAU A; 1ZA2 B; 1M90 C; 2EYZ A; 3X25 B; 2IVW A; 1X43 A; 1RAB B; 2GCX A; 3QKJ A; 1YIJ A; 1WHL A; 1BK2 A; 1OOT A; 2ZPG B; 5AYF A; 5D6Y A; 5CVI A; 1FMV A; 3ASK A; 4M7A D; 3JB9 D; 4KUL A; 1U5S A; 4PJO C; 3VRZ A; 2RJE A; 3OYC A; 4RKU E; 2C0O A; 1OU9 A; 5GAN 8; 4IUV A; 4A4F A; 2LJ3 A; 3OYD A; 1AWJ A; 1SF9 A; 4LXC A; 2ENM A; 2GFU A; 2X3X D; 4J83 A; 1Q81 C; 1FX7 A; 3EGX A; 3MEW A; 2XDD A; 5GAN 2; 2DYB A; 2DBK A; 1LPL A; 2EQI A; 3KXT A; 3KUF A; 2W10 A; 4C92 C; 2Y4Y A; 4M78 C; 5GAM h; 2RI3 A; 3V8J A; 1ZA1 B; 4LDW A; 4RTT A; 4XQ3 A; 3SB2 A; 2IPO B; 1KFZ A; 1U1T A; 2QYZ A; 1HYO A; 4ZN1 A; 3JCM X; 1MMG A; 3CCV T; 2L5Q A; 2CRE A; 1NE8 A; 1WLP B; 2X51 A; 2CP6 A; 2DIL A; 2JMC A; 1VYV A; 4KGZ B; 3EFO A; 1NPR A; 4J9I A; 4AMC A; 4M4Z A; 1MHN A; 5GMK e; 1X69 A; 4FL6 A; 2DZ9 A; 3MPU B; 1VQM T; 1UHC A; 4RMO A; 1Q86 R; 3CMA A; 1OI1 A; 2JJ9 A; 2XDP A; 4XTW A; 3PFS A; 4HCC A; 2Y90 A; 3FJP A; 1QQJ A; 4BAC A; 4JJC A; 1YWO A; 1D1C A; 2A08 A; 2KRS A; 1D1B A; 2O88 A; 2LX9 A; 1V1C A; 2FZC B; 4FSS A; 2KNB B; 3DKM A; 2CP7 A; 2RHX A; 1KC8 U; 2QQ9 A; 4YTL A; 4ANJ A; 3CCE A; 4F7U A; 3CC7 Q; 2K5F A; 4XU1 A; 4PJO A; 1QWE A; 2CT4 A; 2KXD A; 4OVA A; 5GAN g; 1K73 U; 2DTO A; 2W0Z A; 4C8Q C; 4XK8 E; 2GNC A; 2AK5 A; 4HT9 A; 2QQA A; 1K9M U; 4IKF A; 2KSS A; 5A0G A; 4RTX A; 2DEQ A; 2MOX A; 5LJ5 g; 2EJF A; 4FSX A; 5CIU A; 2JXB A; 3JRZ A; 4C92 A; 4RG8 A; 4M78 A; 2LQW A; 1UGS B; 1VQ6 A; 4CI0 C; 1MMD A; 1DJ7 B; 3G7Z A; 2X4X A; 2E6Z A; 2KYB A; 3H9N A; 2I0N A; 5GAO q; 3SD4 A; 4LN2 A; 2XID A; 3M0S A; 4JS4 A; 1VOM A; 3G1J A; 2GF7 A; 4A54 A; 2ROT A; 1BB9 A; 3NMZ C; 3V8L A; 2YLB A; 1W1F A; 3FEO A; 1R0C B; 1JO8 A; 1KHC A; 2ABL A; 2LQK A; 1I8F A; 3QZ5 B; 1YJW A; 2BE7 D; 1SEM A; 2P4T A; 1XQH A; 3VYH B; 1G5V A; 2XU8 A; 4AFZ C; 1RAD B; 1VQO Q; 1MGQ A; 3RES A; 1IRX A; 1C1A A; 2OTL A; 1ZSZ C; 3CBM A; 4D6W A; 4C0D C; 1SRM A; 3M0P A; 1U06 A; 1GBQ A; 4E7I A; 1NYG A; 2DFU A; 1YI2 Q; 3HSB A; 1BI0 A; 1OZ3 A; 2O9V A; 4M7D E; 2EJ9 A; 5GAO p; 4ELY C; 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