The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3CMA Q; 3CCJ Q; 2QEX Q; 1KQS P; 1N8R R; 1Q82 R; 3CC2 Q; 1QVF P; 1NJI R; 3CC4 Q; 3CCV Q; 3CCM Q; 3CPW P; 3CCR Q; 3CCQ Q; 1VQ7 Q; 3CC7 Q; 1VQN Q; 3CXC P; 3G6E Q; 1VQ4 Q; 3CCS Q; 1KC8 R; 3G4S Q; 1VQL Q; 1S72 Q; 1K8A R; 3CCE Q; 3I56 Q; 1YIJ Q; 3I55 Q; 1VQM Q; 1YHQ Q; 1Q86 R; 1K73 R; 1M1K R; 1K9M R; 2OTJ Q; 3OW2 P; 1VQ6 Q; 1VQO Q; 1VQP Q; 3CCU Q; 1QVG P; 3CCL Q; 1KD1 R; 1VQ5 Q; 1YJN Q; 1M90 R; 1JJ2 P; 1VQ8 Q; 1Q7Y R; 1W2B P; 2QA4 Q; 1YIT Q; 1YJ9 Q; 1VQ9 Q; 1VQK Q; 1YI2 Q; 1Q81 R; 1YJW Q; 2OTL Q; 3G71 Q; 3CME Q; 3CD6 Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QEX T; 3A8O B; 5KYN A; 2V8J A; 2QAS A; 2EKH A; 2GGR A; 1R77 A; 2GFU A; 3REB B; 3NTI A; 2E64 A; 4TVR A; 2YLB A; 2YRD A; 2KE9 A; 1H64 1; 1MND A; 4JLI A; 1OZ3 A; 2A36 A; 2LJ3 A; 4M75 B; 4JUV A; 2DL8 A; 2HSE B; 3EG1 A; 2LC4 A; 3FB9 A; 3JB9 G; 2LNH B; 3CCS T; 3M0P A; 2L3S A; 3LLR A; 3G6E T; 3CC7 Q; 4RTV A; 2YUP A; 3JCM P; 1X6G A; 3M0U A; 4F16 A; 3QJY A; 2F5T X; 3H41 A; 1PKS A; 2M0O A; 3FLG A; 2MK5 A; 3VKI A; 2KDS A; 1EX4 A; 3FEO A; 2CZ6 B; 3M55 A; 3CME Q; 1IO6 A; 2WAC A; 3L1A A; 1NYF A; 1K1Z A; 4JRP A; 2DFU A; 4QQ6 A; 2ZAE A; 3OYL A; 4C8Q B; 4WTO B; 4QW2 A; 1IZ6 A; 5GAO q; 4R55 A; 1SHG A; 2DIG A; 1NEB A; 1IXD A; 2ZGW A; 1VQP Q; 1QP3 A; 5GAM g; 1D1B A; 1KD1 U; 3LW5 E; 4CRI A; 4XU3 A; 2M51 A; 2DIL A; 3CC4 Q; 1KHI A; 1Y0M A; 3P8D A; 4DEX A; 4IIM A; 1ZX6 A; 1YWP A; 3GNF B; 1PRM C; 1VQM A; 1RAG B; 2SEM A; 1RI0 A; 2HL5 C; 3OYA A; 1PM3 A; 2DVE A; 1M8M A; 1NLP C; 2RB6 A; 2AK5 A; 4E47 A; 3M57 A; 1ZLM A; 1RLP C; 2EJF A; 4OGE A; 5IXF A; 3CC7 A; 3QBY A; 2JT4 A; 1VQL Q; 2O4X B; 4M7A F; 1BB9 A; 1N8R U; 2CYZ B; 4IIO A; 3TVT A; 3I55 Q; 1K4U S; 2I2L A; 3IQL A; 1VQ6 Q; 3V7C A; 5CIU A; 3HFN A; 1MMG A; 1VQK T; 1RLQ C; 4RTX A; 4E7H A; 2YUN A; 4OMF B; 2DTH A; 2ZPH B; 2MYS A; 4D8K A; 4AT1 B; 1SSF A; 3GP8 A; 1NPP A; 4KRT A; 3M54 A; 1M1F A; 4L59 A; 4ORZ A; 4M7A A; 4B6M A; 3HSB A; 1EIF A; 2RNA A; 5CKE A; 1VQP A; 4M75 E; 4BY6 B; 4EDU A; 1M3A A; 4LUE A; 2DL7 A; 2L3P A; 3HL8 A; 3Q1J A; 2K3Y A; 2WSF E; 4C5I A; 5KCH A; 4N4G A; 4GLK A; 3C4S A; 3CC7 T; 2LMJ A; 2R5M A; 3HPW A; 3CQT A; 4M7D B; 4DOW A; 2KY9 A; 2W0Z A; 1QVG S; 2NUP B; 1WFW A; 5FU7 C; 2EQK A; 3WVE B; 1U3O A; 3SFM A; 1JO8 A; 3QO3 A; 4CI0 C; 2P0Q A; 1UE9 A; 3M56 A; 3CME T; 2GQI A; 3EAE A; 1BK2 A; 1D09 B; 3QDR B; 1B7T A; 3LWI A; 1RAB B; 2KYB A; 3C12 A; 3CCR A; 2DL5 A; 3L2R A; 1VQL A; 1WHL A; 1Z9Q A; 3LH5 A; 4M77 D; 4C8Q E; 1I4K 1; 3I55 A; 2DA9 A; 1VQP T; 3I9Q A; 1VQ6 A; 4PJO D; 4MMK A; 1AWO A; 2OTJ A; 5KYU B; 3A8H B; 2EKO A; 3UPU A; 1M90 R; 3OBY A; 4XTX A; 4V2S A; 2DK3 A; 2HL3 A; 5HCK A; 2O2O A; 1VUB A; 1OU9 A; 5CK9 A; 5IHK A; 1PSE A; 1VQ7 Q; 3TSW A; 2L5Q A; 3NHN A; 1AWJ A; 3CCE A; 4J9G A; 4RTY A; 5CKF A; 2DER A; 4HCK A; 2IVW A; 3A8L B; 4NL2 A; 5GAN 8; 4F7U E; 3MEA A; 1IHV A; 3H9N A; 2EGA A; 3PT9 A; 1UHF A; 5CKH A; 2EYY A; 3TQ7 P; 3JCM J; 4F17 A; 4Y91 A; 3FC3 A; 6AT1 B; 1D1C A; 1RAE B; 4WCI A; 2ECZ A; 2QQ9 A; 3ASK A; 3P8H A; 1SEM A; 1VQL T; 3S6W A; 1QWF A; 3C94 A; 3JCM c; 3I55 T; 1VQ6 T; 2OTJ T; 4FYX B; 4KGZ B; 4E7L A; 2OAU A; 3JCM V; 1RAF B; 2PTK A; 2K2M A; 2HEQ A; 2QA4 Q; 1DJ7 B; 2HD0 A; 1KQS P; 1MUZ A; 5GAN f; 4J9C A; 3S3M A; 5I2S A; 2FO0 A; 1GBQ A; 1Q82 U; 3CCE T; 3U23 A; 1X01 A; 1RAA B; 5CVI A; 4E7S A; 1KSW A; 3RES A; 4MZT A; 3CCU Q; 1NM7 A; 1VQO A; 1WHK A; 2E6Z A; 5C6S A; 2A37 A; 2HBW A; 5A0G A; 1Q7Y R; 1X27 A; 2CP2 A; 4BB7 A; 1T0H A; 2CKK A; 3JCM b; 2DXB A; 1C0M A; 2BUD A; 1IRE B; 2DRK A; 4FCY A; 3VS0 A; 3CXC P; 1NYG A; 2L3Q A; 1JJ2 A; 3NFC A; 4M7D E; 1W70 A; 4ELZ C; 1YHQ Q; 2DVJ A; 2JMC A; 2LT4 A; 2J6K A; 1EFN A; 2KNB B; 3EFR A; 4DQ2 A; 1Y71 A; 2CUB A; 4KT0 E; 2RN8 A; 4OMO A; 3JCM Q; 2PZ1 A; 8ATC B; 1UGR B; 1N8R R; 4M75 C; 1PC0 A; 4LDW A; 2EGC A; 1BI1 A; 3QDF A; 3VU3 C; 2YRV A; 3GOX A; 1OPK A; 1JRI A; 3H0H A; 2HMA A; 2L0A A; 3OS1 A; 2K5I A; 1AWX A; 2EPD A; 1VQ7 T; 3CC2 Q; 1NE8 A; 1BI0 A; 1I81 A; 2Y4X A; 2FPD A; 2VUB A; 4IUV A; 4C0G A; 2YLC A; 2CT3 A; 3LGL A; 2BZ8 A; 1B07 A; 4E7J A; 1KC8 U; 3MJX A; 4B9W A; 5CR2 A; 2GQV A; 1GXI E; 4M75 F; 4RTW A; 3UAT A; 3M0R A; 4ZTF A; 2XD0 A; 3BFM A; 1AOJ A; 4C8Q C; 3EG9 A; 1WJS A; 5GMK l; 1QP2 A; 1WNL A; 3CCJ Q; 3VYG A; 3JCM f; 1QKX A; 2EVR A; 2DKG A; 2VXE A; 2EJ9 A; 4NOY A; 1IRX A; 3CPW P; 1MGQ A; 1T0J A; 3TCJ A; 1WLP B; 3LYI A; 4DBQ A; 1M2O A; 3X28 B; 1N5Z A; 2QDL A; 3C95 A; 2WSE E; 4GLM A; 2QA4 T; 4IUT A; 1FYN A; 1ZUU A; 2D1X A; 3WVD B; 1WPY A; 2O9V A; 4QKU A; 2J7I A; 4M75 A; 2XI9 A; 4BUG A; 4JZ3 A; 2LTO A; 2PNI A; 2RHY A; 2KEA A; 5FLX E; 3L2U A; 4ZGD B; 3FJP A; 4Z88 A; 2XMF A; 2EYX A; 4CC3 A; 4C8Q F; 1WQ7 A; 1ZSZ A; 4M78 D; 1M8V A; 1X43 A; 1A0N B; 2BE9 B; 3TEE A; 2JN0 A; 3E9G A; 2X9H A; 2QXF A; 3CCU T; 2PVG B; 3MKD A; 1WHG A; 5CAI A; 1J3T A; 1LPL A; 1Q82 C; 1SKU B; 4HCC A; 3VV0 A; 4FYV B; 4JDS A; 5LJ3 d; 1O75 A; 5KYY B; 3S3O A; 1VQN Q; 3OYE A; 4OB0 B; 2F2V A; 4KH0 B; 2R5A A; 1YHQ T; 5KH6 A; 2FPE A; 4C8Q A; 4F7U F; 2DTO A; 3VRZ A; 4J6W A; 4CC4 B; 4J9D A; 1RUW A; 3E9F A; 2RD1 A; 3MPU B; 3CCJ A; 2VAS A; 3MEW A; 3OMG A; 4OP0 A; 1TH7 A; 5KCO A; 2RJD A; 3JV3 A; 2JUF A; 3QSU A; 1UGQ B; 3VS6 A; 1N9S A; 4P5N A; 2EIF A; 4IUR A; 2NUZ A; 1BBZ A; 2RK1 A; 4OVA A; 5I22 A; 4UC4 A; 4F7U A; 3OMC A; 4M7D C; 5GAM f; 3CC2 T; 5L8R E; 1KG1 A; 4PJL A; 3M4Y A; 2BKD N; 1HJD A; 4PFO A; 2M9U A; 4RTT A; 5IAY A; 4DOV A; 4DBH A; 4LDY A; 3VS7 A; 1KQ2 A; 4EMH A; 4PJM A; 3MEU A; 2O4X A; 2V1Q A; 4ZTJ A; 1W2B S; 4LN2 A; 2K3X A; 2LVM A; 2K5F A; 3CCJ T; 2BZY A; 3CBP A; 5LJ3 g; 2DAQ A; 1U1T A; 2DXC A; 1CKB A; 4QQD A; 1YNZ A; 4N0A C; 2GF7 A; 2RPN A; 2RHU A; 4C0F A; 3OS2 A; 1VYT A; 1VQN A; 1U8R A; 1N6A A; 4M77 B; 4JRQ A; 4LD6 A; 1K8A R; 4A4F A; 2EFI A; 2I0N A; 4A54 A; 5HKC A; 4M7D F; 4JZ4 A; 2CSI A; 5D6Y A; 4IUU A; 3X26 B; 1ABO A; 1Q86 U; 2IPO B; 1PSF A; 2DMO A; 4ZN3 A; 2V8K A; 2EQU A; 1Y07 A; 4C0Z A; 4JRK A; 2X4W A; 2KSS A; 1JBM A; 4KGV B; 3INZ A; 1OQK A; 2OJ2 A; 3EFO A; 5GAO m; 2K6D A; 1MV0 B; 1C1A A; 4QVD A; 4J9E A; 1Q95 G; 3CCS A; 4PFZ A; 4C92 G; 2RQR A; 2RI2 A; 1VIF A; 2H8H A; 1IB8 A; 4PJO G; 4OMN A; 1IGQ A; 3RIR A; 1ZSG A; 4M7D A; 2MF2 A; 3QXE B; 1E6G A; 1KQ1 A; 4PJJ A; 2A7Y A; 2NUP A; 1WI7 A; 2OTL A; 1OZ2 A; 2HAX A; 3PVQ A; 3CMA Q; 4DBR A; 4L5G A; 4EMK A; 4AFS C; 1VQN T; 2HKN A; 1KC8 R; 2ZPF B; 1ACM B; 2KAF A; 1OUL A; 2F1L A; 2EGE A; 1QVP A; 2QQR A; 1W1F A; 2YSQ A; 3OYD A; 2COZ A; 2L8D A; 2K57 A; 1R0C B; 2PVO B; 4N0A A; 5KYU A; 1UG1 A; 4IKF A; 1TG0 A; 1UB4 A; 1AHJ B; 5LL6 S; 4DEY A; 2AIR B; 1PG5 B; 2E41 A; 3I35 A; 3F70 A; 1OU8 A; 1GCQ C; 3UDC A; 5GAN j; 2LP5 A; 3T9N A; 4PJN A; 3VS1 A; 5IXB A; 1PNJ A; 2RH2 A; 3M59 A; 5CKB A; 4M7A D; 3RR6 A; 4LDX A; 2EAY A; 2HQE A; 5LJ5 h; 2OTL T; 3L2Q A; 2RQW A; 2A3L A; 4A53 A; 1OI1 A; 2YRC A; 1WIE A; 3EGX B; 4ME7 A; 5GMK h; 4JS5 A; 4HCZ A; 3ZFJ A; 4Z89 A; 1VQ4 Q; 3J81 E; 2F2W A; 1IGU A; 5HK0 A; 1WX6 A; 4OMP A; 3RKW A; 4J83 A; 1KQS A; 2X3X D; 1QVF A; 3J7A F; 1VQ5 A; 4FIB A; 3RKY A; 1VQ8 A; 4EPC A; 2JMA A; 1VQK A; 5GAO r; 1E7O A; 3VUB A; 1ZQ1 A; 1D0Y A; 4XU0 A; 1BU1 A; 2C0T A; 4WF2 A; 3OSS C; 5J26 A; 3OS0 A; 3OB9 A; 4MZM A; 2CH4 W; 1Y96 B; 2BTT A; 1UJY A; 2FG0 A; 3OA6 A; 2DD5 A; 3OW2 P; 3CBM A; 4M4Z A; 4BE2 A; 1AT1 B; 4AFQ C; 3CXC A; 2L89 A; 1GCQ A; 3L2Z A; 4IUP A; 4C0D B; 1I5L A; 2DJZ A; 2AZV A; 2RQV A; 4LD9 K; 4Y92 A; 3M9Q A; 4HT9 A; 5D7U A; 2G3R A; 1Q86 C; 2QQB A; 3EG2 A; 2RQT A; 2RHZ A; 3SWN B; 2LCC A; 3MET A; 2NLU A; 2ZZD A; 1AZG B; 4RG2 A; 4L6V 5; 1VQ5 T; 4KGX B; 4N4I A; 3CCL Q; 1VQ8 T; 1M1K U; 2YHT A; 1G8X A; 2YT6 A; 5GAN h; 4LNP A; 2YUQ A; 2DRM A; 2K2V A; 3CMA T; 1WHJ A; 2MI6 A; 2LQN A; 3RMQ A; 3CME A; 1HSQ A; 1G83 A; 2COY A; 3ULR B; 3QZ5 B; 3NTH A; 3AHU A; 4PNO A; 1W4S A; 1AZE A; 4F7U G; 2RQU A; 2YUO A; 3O8V A; 2HQX A; 1H3H A; 5CKD A; 4D8D A; 1SHF A; 2MMP A; 5LJ5 e; 1ZUK A; 1YWO A; 2KXC A; 3CC4 A; 4X9C A; 3M58 A; 2J05 A; 3LGF A; 5GMK e; 1G5V A; 3BY7 A; 5C0M A; 5KE2 A; 4RG8 A; 4BDY A; 2QDY B; 2EYQ A; 1QKW A; 2DE0 X; 2FEI A; 1M27 C; 1ZA1 B; 3CPW A; 1XOV A; 3RDV A; 5GAN 6; 5KYW B; 2QQS A; 4A4H A; 4GY5 A; 1G3Y A; 4QVZ A; 4RMO A; 3CCV Q; 4KUI A; 4M78 G; 2CGH A; 2A0F B; 4X9D A; 1X69 A; 2KRO A; 2GTO A; 1VYV A; 2EWN A; 4C92 D; 2QAZ A; 3RNJ A; 2LDM A; 2ZPG B; 1BIA A; 2DL4 A; 2G6F X; 1K73 U; 3QHS A; 4F04 B; 3FDR A; 2ROL A; 3V7S A; 3CC4 T; 4E7I A; 2EW3 A; 3CCM Q; 2RJF A; 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1ZHI A; 2JTF A; 3CCV T; 2QQA A; 2FHD A; 2RMO A; 4XTW A; 3GPL A; 4C8Q D; 2K9G A; 5DY9 A; 4HXJ A; 2RI5 A; 1BCM A; 2KK4 A; 2NUT B; 2QA4 A; 3JCM e; 2VC8 A; 2X4Y A; 3H6Z A; 3CCM T; 2P84 A; 2FB7 A; 5LJ3 f; 3PVL A; 1QMC A; 1S72 T; 3NMZ C; 1OX8 A; 4M7A B; 3JB9 F; 5CQY A; 1K73 C; 1G3T A; 5GAN 3; 1F1B B; 1Z9Z A; 2MAM A; 1I1J A; 2BE7 D; 2JTM A; 1KFZ A; 3EG3 A; 1TOV A; 3EHQ A; 3CCU A; 5LJ5 g; 2NYS A; 4R56 A; 3PMI A; 4OMM A; 1LJO A; 2E5K A; 2VVK A; 3TRE A; 1Q81 U; 3OYI A; 1K0S A; 1TS9 A; 3CPF A; 2BZX A; 4M7A G; 1QQJ A; 3GBQ A; 5KYX B; 2AT1 B; 1CSK A; 3G7Z A; 3EFS A; 1YHQ A; 2KMT A; 2CT4 A; 4K11 A; 3LH0 A; 4KBM B; 1UEC A; 2ED1 A; 2LQK A; 1NG2 A; 2P4T A; 3CPW S; 3QWX X; 2AKK A; 1UJ0 A; 2FVU A; 1QW1 A; 1K9M C; 2DXT A; 2GCX A; 2K7A A; 3BDU A; 4C0D C; 1WDX A; 2CP3 A; 2M1H A; 1B34 B; 1MMA A; 2E6N A; 1I5O B; 3JB9 H; 2VKN A; 5FW9 A; 3G71 T; 2XU8 A; 5AT1 B; 4VUB A; 2P0K A; 2DF6 A; 3SWN C; 3R6O A; 1WXB A; 2DEQ A; 2RJE A; 3CC2 A; 2BIV A; 2EQM A; 4DBF A; 1UGS B; 2RK2 A; 4B9X A; 3G4S Q; 1D3B B; 1GBR A; 3QUI A; 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