The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
DPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVNS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of a regulatory complex involving the Abl SH3 domain, the Crk
SH2 domain, and a Crk-derived phosphopeptide
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Crk
|
| molecule tags |
Protein binding/transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2001-08-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HCK A; 3I9Q A; 2CSQ A; 2DL3 A; 3VS1 A; 2AKK A; 2YUQ A; 1YWP A; 3EG1 A; 4ORZ A; 2VVK A; 1PKT A; 1T0J A; 1NLO C; 3ZL7 C; 4CC3 A; 5FW9 A; 2EGE A; 2H8H A; 3ULR B; 1X27 A; 1WIE A; 3NHN A; 2CDT A; 1X2K A; 3VS6 A; 3REB B; 2JM8 A; 2J6K A; 5I22 A; 2YUO A; 3RBB B; 1AZG B; 1NYG A; 1VYU A; 2PZ1 A; 2LNH B; 2YT6 A; 4R0K A; 2DBM A; 1H8K A; 1UUE A; 1VYV A; 3I5S A; 3VS0 A; 2ECZ A; 1B07 A; 1VYT A; 1M3C A; 3EG0 A; 4F14 A; 2YDL A; 4F16 A; 2X3X D; 2KRM A; 2V1R A; 1ARK A; 2F2W A; 2LX7 A; 1V1C A; 2E5K A; 2F2V A; 3O5Z A; 2K3B A; 2KR3 A; 2DRM A; 2RQT A; 3M0Q A; 3M0R A; 4OMQ A; 4ZNX A; 2DE0 X; 1AZE A; 3UAT A; 1Z9Z A; 2C0T A; 3EHR A; 1OPL A; 3LH5 A; 1J3T A; 2EBP A; 1T3L A; 1YN8 A; 2ED1 A; 2ENM A; 2AZV A; 3M0T A; 1BB9 A; 2D8H A; 4OML A; 1K76 A; 3H41 A; 1NG2 A; 1GRI A; 1M8M A; 2HEQ A; 4Z88 A; 2JXB A; 4RTT A; 1CSK A; 2X3W D; 1BU1 A; 1UGV A; 4DEX A; 2YSQ A; 4GBQ A; 4LUE A; 3VS7 A; 3VS3 A; 2VWF A; 1WLP B; 1K0S A; 4X1V A; 2KRS A; 1RLQ C; 2FEI A; 1SEM A; 3M0S A; 1X43 A; 5FWB A; 2ROL A; 1GL5 A; 2EW3 A; 2M0Y A; 4Z8A A; 2MOX A; 4Z89 A; 1ABQ A; 5IHN A; 4D8D A; 2DRK A; 4FSS A; 2BTT A; 2RQW A; 1UE9 A; 1W70 A; 3PE0 A; 2DLP A; 2DL8 A; 3C0C A; 1OPK A; 2EYY A; 2JMC A; 2DM1 A; 1Z9Q A; 4LE9 A; 5I11 A; 2C0O A; 1XOV A; 1E7O A; 2C0I A; 1WA7 A; 1MUZ A; 1H92 A; 1GBR A; 1K0X A; 1SRL A; 2O2O A; 1T3S A; 1IO6 A; 2RN8 A; 2V1Q A; 2RQV A; 1PNJ A; 4OMP A; 2MIO A; 2ED0 A; 2RQR A; 1I0C A; 4GLM A; 2D1X A; 1WFW A; 2OAW A; 1YWO A; 2DBK A; 4RTW A; 2ABL A; 1LCK A; 1RLP C; 2CT4 A; 1CKB A; 1WDX A; 2DJQ A; 1AWX A; 1ZLM A; 4RTY A; 1WX6 A; 2FO0 A; 1X6G A; 1AD5 A; 2A37 A; 4RTU A; 1QKW A; 2KE9 A; 1U5S A; 3R6N A; 4M4Z A; 1G83 A; 3EG2 A; 2BZX A; 2JT4 A; 1JXM A; 2FG0 A; 1PWT A; 2JM9 A; 1M30 A; 4J9H A; 1NEG A; 1S1N A; 1H3H A; 5FWC A; 1G2B A; 4F17 A; 4OMO A; 1E6G A; 2PTK A; 2K6D A; 4JJB A; 4AG1 C; 2KGT A; 1CKA A; 2KYM A; 1Y57 A; 2L3P A; 2L3Q A; 2DF6 A; 4IIM A; 2EQI A; 1JEG A; 2L0A A; 1TG0 A; 5IHK A; 1WXT A; 2HSP A; 3KFV A; 1SPK A; 1KSW A; 2SRC A; 1U3O A; 3TSZ A; 2FRY A; 4CC7 A; 2LJ0 A; 2A28 A; 2KNB B; 1NYF A; 4K11 A; 3M0U A; 1YP5 A; 3UA6 A; 2EYZ A; 1FMK A; 2D8J A; 3EG3 A; 4IIO A; 5GJW B; 4J9C A; 1HD3 A; 1K4U S; 2O9S A; 2P4R A; 4JZ4 A; 3JV3 A; 2B86 A; 4J9G A; 1UHC A; 1E6H A; 1AWW A; 4D8K A; 4RTX A; 5GJV B; 4J9F A; 1NLP C; 2CSI A; 2JW4 A; 2FRW A; 2EKH A; 2GGR A; 1AOJ A; 2K79 A; 3CQT A; 4HXJ A; 2JS2 A; 3THK A; 2RPN A; 1JO8 A; 5IH2 A; 2CH4 A; 1VA7 A; 2DL4 A; 2PNI A; 1WXB A; 1RI9 A; 4JJC A; 1YCS B; 1Y0M A; 1UFF A; 1K9A A; 1T0H A; 2G6F X; 2L2P A; 2RF0 A; 4E6R A; 2FPE A; 1X69 A; 1B3Q A; 4HCK A; 2D0N A; 2GBQ A; 4JJD A; 2CT3 A; 3H0F A; 1WYX A; 5ECA A; 1ZUK A; 1EFN A; 2HDA A; 4WCI A; 1ZUU A; 4LUD A; 1NEB A; 3I5R A; 1KFZ A; 1MV3 A; 1ZUY A; 2OJ2 A; 2GTO A; 1I07 A; 1M3A A; 3SEM A; 5IXB A; 4J9I A; 3TVT A; 1HSQ A; 3SHW A; 1ABO A; 4ESR A; 2CUB A; 1JXO A; 2J06 A; 4LN2 A; 1QLY A; 2KXD A; 2W0Z A; 1WI7 A; 5EC7 A; 3U23 A; 1SHG A; 3A98 A; 4EIK A; 1ZBJ A; 4AFZ C; 4JPB W; 5IXF A; 2KEA A; 3NGP A; 3PVL A; 3NPF A; 4CC4 B; 2JTE A; 1FYN A; 2RNA A; 1QCF A; 3NMZ C; 2YUN A; 2LJ1 A; 2O88 A; 3UA7 A; 1UJ0 A; 4RTZ A; 2KT1 A; 2AK5 A; 3UF4 A; 2HBW A; 2EYX A; 1HJD A; 1M3B A; 1SHF A; 2A08 A; 1AWJ A; 2JS0 A; 1UDL A; 2ROT A; 1AEY A; 3QWY A; 2BZY A; 5HCK A; 2CRE A; 4AFU C; 1UJY A; 1OEB A; 3REA B; 1QWE A; 2K9G A; 3VRY A; 2DX1 A; 1PRM C; 2MCN A; 1X6B A; 1QKX A; 2LJ3 A; 4J9B A; 2NWM A; 2KRN A; 2M51 A; 2LQW A; 2KBT A; 1NM7 A; 2NUZ A; 2CH4 W; 2O31 A; 4AFQ C; 3H0I A; 4HVW A; 1MV0 B; 2DVJ A; 2SEM A; 2EVR A; 3VS2 A; 2AKL A; 2I0N A; 1OV3 A; 4Y92 A; 2KXC A; 1KIK A; 3PVQ A; 2YUP A; 1KJW A; 1WXU A; 2EPD A; 4JZ3 A; 1GFC A; 3VRZ A; 3M0P A; 4QT7 A; 4A63 B; 2VKN A; 1N5Z A; 1UEC A; 3RNJ A; 1PHT A; 2CUD A; 3TSW A; 1AVZ C; 4J9E A; 2GQI A; 2O9V A; 1ZX6 A; 1W6X A; 2RQU A; 3EGU A; 1PRL C; 3GBQ A; 2A36 A; 2EYW A; 4KRT A; 3VS4 A; 2K7A A; 2LMJ A; 2KYB A; 2DNU A; 4OMM A; 2LQN A; 4LNP A; 1JQQ A; 2DL5 A; 4HVV A; 4DEY A; 2JMA A; 1TUD A; 1UTI A; 1GCQ A; 4CC2 A; 2IIM A; 1UHF A; 2QDL A; 1PKS A; 1SRM A; 2DL7 A; 1GFD A; 2F2X A; 2GTJ A; 2K2M A; 4HVU A; 2GNC A; 2J7I A; 1GBQ A; 1QWF A; 5L23 A; 2DYB A; 2J6O A; 4AFS C; 1ZSG A; 2RMO A; 2LZ6 B; 5IHI A; 3I35 A; 1A0N B; 3QWX X; 3VS5 A; 3IQL A; 2ESW A; 4RUG A; 1I1J A; 2EGC A; 2FPD A; 1GCP A; 1BBZ A; 1AWO A; 1OOT A; 2KRO A; 2AZS A; 3FJ5 A; 1SSH A; 1K1Z A; 3H0H A; 2W10 A; 4AG2 C; 2EGA A; 1RUW A; 2J6F A; 1UG1 A; 4OMN A; 2LP5 A; 2L3S A; 4J9D A; 2BZ8 A; 2DIL A; 4RTV A; 1BK2 A; 3EHQ A; 1TUC A; 2DA9 A; 2FPF A; 1W1F A; 1GCQ C; 2XMF A; 2OI3 A; 1U06 A; 1X2Q A; 2J05 A; 2DMO A; 1JU5 C; 2LCS A; 1M27 C; 1YNZ A; 2KT8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2HCK A; 3BE3 A; 3I9Q A; 4A4E A; 3SWN A; 2DZ9 A; 2QTV A; 1JJ2 S; 1X6O A; 2FL7 A; 1YWP A; 3EG1 A; 5LJ5 j; 1NJI C; 2RI5 A; 2LT1 A; 2OTJ A; 1NLO C; 4CC3 A; 1M1F A; 2LVM A; 5CKH A; 5CIU A; 3MET A; 1VQL A; 1X2K A; 3PGG A; 2G3R A; 4LDW A; 3A1P A; 3VS6 A; 5HK3 A; 2YRV A; 3MEW A; 1IB8 A; 2YUO A; 2VB6 A; 3MHX A; 2PZ1 A; 2HQE A; 2HZY A; 2LNH B; 5HK0 A; 2VGN A; 1S72 Q; 1FWZ A; 1QVP A; 1VYV A; 3I5S A; 2ZPG B; 3HTR A; 2YRC A; 3CCS T; 2XG8 D; 3VS0 A; 1R0C B; 1O9S A; 4C5I A; 2D0Q B; 4F16 A; 2X3X D; 3JCM b; 3L2R A; 4EDU A; 3MP8 A; 2F2W A; 4MZP A; 1KG1 A; 1V1C A; 2E5K A; 2F2V A; 3O5Z A; 3TU4 K; 1NPP A; 4OP0 A; 4RCC A; 4J5Y A; 2C0T A; 1OZ3 A; 3AHU A; 1RAE B; 4E7S A; 4PLI A; 2ENM A; 2AZV A; 2D8H A; 3VUZ A; 3G6E A; 1GRI A; 3HPW A; 1Y07 A; 3QBY A; 4RTT A; 5KYY B; 2X3W D; 5FU7 B; 4LUE A; 2RHU A; 3JB9 H; 3VS3 A; 2XI9 A; 1WLP B; 1ZQ1 A; 3BY7 A; 2V8K A; 3CCE A; 2DIG A; 2FEI A; 1SEM A; 1VQ8 T; 4ANJ A; 3QZ5 B; 3PIO A; 3CC7 T; 1ABQ A; 1V76 A; 2PQW A; 1VQK T; 2R5A A; 2RM4 A; 1K9M U; 2XK0 A; 1ACM B; 4E2F B; 5CAI A; 1DJ7 B; 2RQW A; 3EGX B; 3PE0 A; 2CZ1 B; 2DL8 A; 5D6X A; 2COZ A; 2DM1 A; 1XOV A; 4BE2 A; 3CMA Q; 5CVI A; 1H92 A; 3EG9 A; 4II1 A; 4FM4 B; 1VQO Q; 4ELZ C; 3QG1 A; 1I0C A; 1VQP Q; 4Y28 E; 2QQS A; 2D1X A; 3UT1 A; 1UGQ B; 4RTW A; 4MDX A; 1LCK A; 2CT4 A; 1C6V X; 1WDX A; 2DJQ A; 2M1H A; 3OYA A; 3WVD B; 3FLG A; 4ME7 A; 3OMC A; 3CCV T; 2DAQ A; 3M57 A; 3A5Z B; 3VYH B; 3CCU A; 3R6N A; 1VQK Q; 3JB9 I; 2FG0 A; 1PWT A; 3JCM X; 1M30 A; 2YHT A; 2HKN A; 4B6M A; 5C0M A; 3LGL A; 4OMO A; 1RAG B; 2K6D A; 5FLX E; 1D0Z A; 1AT1 B; 9ATC B; 3LYI A; 5LJ3 d; 4XTW A; 3ZEH A; 3L2V A; 2KGT A; 5GAM f; 5GAO p; 2VYT A; 2KYM A; 1Y57 A; 2L3Q A; 4BY6 B; 1Q82 C; 4IIM A; 5GAO l; 3OS0 A; 1JEG A; 2L0A A; 1TG0 A; 3KFV A; 2QAZ A; 4ZN1 A; 3P8D A; 1N8R C; 2FRY A; 2QGG A; 3CXC A; 2KNB B; 1NYF A; 4CRI A; 2EYZ A; 2D8J A; 4EMK C; 2JTM A; 2O9S A; 2Y4X A; 4JZ4 A; 5FU7 C; 2NYS A; 3JV3 A; 4FT2 A; 3M53 A; 4WF2 A; 3QO3 A; 1YJN T; 4J9F A; 2CSI A; 2JW4 A; 5GAN 5; 2FRW A; 4FL6 A; 1PD0 A; 2WAC A; 1SSF A; 1TSF A; 2QEX T; 3THK A; 2K3Y A; 2QA4 T; 2ZPF B; 5GMK l; 3CD6 A; 2QI2 A; 1RI9 A; 1OX8 A; 4M78 C; 1BCO A; 2MWO A; 2WSE E; 1Y96 B; 1W2B A; 2ZPB B; 2JZ2 A; 4A4K A; 5ECA A; 4PJL A; 4O6J A; 1C0M A; 1ZUU A; 2COW A; 3OBY A; 5GAM d; 3CCR T; 1D1C A; 5KYX A; 4AMC A; 1BI0 A; 1PCX A; 2OAU A; 2ZPH B; 3SEM A; 3CME A; 4BI8 B; 3SHW A; 3LW5 E; 2CUB A; 2J06 A; 3EGD A; 2VXF A; 1QLY A; 2RI2 A; 4MZM A; 1ZSZ A; 2W0Z A; 2M02 A; 3CCM T; 3EFO A; 1Q81 U; 3S6W A; 3A98 A; 1ZBJ A; 4YTL A; 2KEA A; 4LDU A; 3C94 A; 1IXD A; 1KQS A; 3A8G B; 4EPC A; 1IRE B; 3NPF A; 4DOW A; 2JTE A; 3ZBD A; 2QEX Q; 2VGM A; 2RNA A; 2EJ9 A; 3X24 B; 3NMZ C; 2QA4 Q; 2YUN A; 3TRE A; 2DO3 A; 1UJ0 A; 4RTZ A; 4BB7 A; 2EIF A; 1GXI E; 7AT1 B; 5LJ5 e; 1AWJ A; 1WHG A; 1AEY A; 3QWY A; 2BZY A; 4J7F A; 4DBR A; 2CRE A; 2HBP A; 1UJY A; 5LL6 S; 2K4Y A; 3OYI A; 3A8M B; 3RMS A; 4C5G A; 1K73 C; 2L5Q A; 3GF5 A; 2RD1 A; 4BY6 C; 1X6B A; 2LC4 A; 2ZZD A; 3OBW A; 1VQN A; 2NWM A; 1EX4 A; 4FCY A; 2LQW A; 2X4W A; 2CH4 W; 3OYB A; 4M78 G; 3VU3 C; 3H0I A; 2RB6 A; 5IN1 A; 4E7I A; 2YLB A; 1M90 C; 5GAN e; 2QQ9 A; 2EVR A; 1JRI A; 3WVE B; 2KXC A; 2QQR A; 2JUF A; 2LTO A; 3JCM Q; 4QT7 A; 2D9T A; 2CS7 A; 1C1A A; 3PMI A; 3HKS A; 4PJO A; 2GQI A; 3SWN B; 1ZX6 A; 1FMV A; 1W6X A; 2RQU A; 2DEU A; 4QW2 A; 1WHK A; 3VS4 A; 2MPX C; 1VQ5 A; 2LMJ A; 3OYE A; 2LQN A; 2JMA A; 2LQK A; 2XD0 A; 1NJI U; 4OGC A; 3HL8 A; 4NOY A; 4BDY A; 2GTJ A; 4HVU A; 2K2M A; 1VQ4 T; 1GBQ A; 4HA8 A; 3H6Z A; 3EFS A; 2J6O A; 2Z0W A; 3MJX A; 2RMO A; 1BIB A; 4XTX A; 5IHI A; 3I35 A; 3FRN A; 1A0N B; 1YJ9 A; 3IQL A; 1VQ9 A; 4RUG A; 2RHY A; 2FPD A; 3EAE A; 4OVA A; 1PSF A; 3M5A A; 1KC8 R; 3KXT A; 4AG2 C; 4PLL A; 4BDZ A; 2DD4 A; 3GLX A; 1F1B B; 3QHS A; 3VKI A; 4MML A; 3WXM B; 1K8A C; 4E47 A; 1YHQ A; 2DIL A; 5A0D A; 4M7D A; 2K5F A; 2DA9 A; 5GMK e; 1BI2 A; 3OS1 A; 5LJ5 g; 1W1F A; 1GCQ C; 2XMF A; 1U06 A; 4FU6 A; 1X2Q A; 2J05 A; 3RES A; 4C8Q A; 1JU5 C; 1N9S A; 3G71 A; 2CSQ A; 5LJ5 h; 3VS1 A; 2AKK A; 1QP2 A; 3CCQ Q; 2E70 A; 1VQ4 Q; 1BYM A; 2EGE A; 3ULR B; 2FB7 A; 1WIE A; 3NHN A; 2I2L A; 4RCB A; 3REB B; 2EJG A; 5GAN g; 1AZG B; 1NYG A; 5IAY A; 1WHJ A; 1M1K R; 4JJN K; 3ASK A; 4E7L A; 1VQM A; 4IUP A; 5FU6 C; 2CZ6 B; 2ECZ A; 1VYT A; 4F14 A; 2DZC A; 4M7A E; 5GAN h; 2KRM A; 1QVG A; 1ARK A; 4PL6 A; 3HFN A; 3I56 T; 2K3B A; 4J83 A; 2EWN A; 2RQT A; 4O5V A; 3SWN C; 3EG9 B; 2E12 A; 4ELY C; 4HCC A; 3EHR A; 4XU3 A; 1OPL A; 3G4S A; 3QJY A; 3MEA A; 2DTO A; 4X34 A; 1Q86 R; 2AHJ B; 1NG2 A; 4M7A A; 2MWP A; 2NUT A; 3J7A F; 1XJW B; 1BU1 A; 2EYQ A; 1UGV A; 5GAO m; 4M7A G; 5CQX A; 4F04 B; 2R57 A; 3OYK A; 1G8X A; 2DXT A; 3L1A A; 4KUD K; 4X1V A; 1RLQ C; 5A0L A; 5LJ3 e; 3HSB A; 4QVD A; 2MOX A; 3CXC S; 3OW2 P; 1I8F A; 4QVZ A; 5D6W A; 1VOM A; 1BI1 A; 4QVC A; 4NL2 A; 3I56 Q; 2AIR B; 4FSS A; 3JCM W; 1LOJ A; 3CBP A; 3CPW A; 2FZC B; 3CCJ T; 2FYK A; 2P0K A; 5GMK m; 2IPO B; 3RR6 A; 3S3M A; 1OI1 A; 3LWI A; 2O4X A; 3C0C A; 1OPK A; 2EYY A; 1VQ6 T; 1Q82 U; 1H64 1; 3RDV A; 1S72 A; 1YI2 T; 5GMK h; 3CPW P; 4LE9 A; 2JVV A; 1N8R U; 1MUZ A; 1VQ7 Q; 4F7U E; 2OTL T; 5DLO A; 1K0X A; 2O2O A; 1T3S A; 4HCZ A; 5CCA A; 1PNJ A; 3RKX A; 1QCN A; 2MIO A; 2ED0 A; 4RKU E; 1W2B S; 2OAW A; 1YIT Q; 2V8I A; 3OY9 A; 1RLP C; 2OTJ T; 1CKB A; 1LNX A; 1ZLM A; 1VQL T; 4ZTF A; 1WQW A; 4RTU A; 1QKW A; 4BUG A; 2A3L A; 1YIJ A; 3TEE A; 3PT9 A; 3HRT A; 4MMK A; 4A53 A; 5GAM e; 4PJM A; 4X9D A; 1ZA2 B; 3EG2 A; 2ATC B; 2AT1 B; 2BZX A; 4F7U A; 1JXM A; 4OGE A; 3PFS A; 2YWW A; 5GMK i; 5GAN 2; 1S1N A; 3P8B B; 4DOV A; 3SD4 A; 1G2B A; 1D0Y A; 1E6G A; 1WJR A; 4B9W A; 4AG1 C; 3CCJ Q; 4JJB A; 1PG5 B; 3FDR A; 5GAN j; 3L42 A; 1KQS S; 2F5T X; 2L3P A; 2E3I A; 3CCL Q; 2B8A A; 1ZA1 B; 4M75 E; 2K5I A; 2HD0 A; 1D1A A; 2FZG B; 2SRC A; 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