The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
DPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVNS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of a regulatory complex involving the Abl SH3 domain, the Crk
SH2 domain, and a Crk-derived phosphopeptide
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Protein binding/transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Crk
|
| total genus |
5
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2001-08-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EYZ A; 2J05 A; 2KYB A; 2A28 A; 4DEY A; 1OPK A; 2HSP A; 2LCS A; 2KBT A; 1WIE A; 2G6F X; 1UDL A; 4JZ4 A; 3M0R A; 2HBW A; 2KT1 A; 1K9A A; 2JS0 A; 1PRM C; 2NWM A; 2RF0 A; 2BZ8 A; 5ECA A; 4AFQ C; 1BU1 A; 2JTE A; 3CQT A; 2CH4 W; 2ROT A; 2DE0 X; 4LE9 A; 1WXU A; 3H41 A; 5HCK A; 1V1C A; 2PTK A; 2DYB A; 2SEM A; 1PKS A; 2JS2 A; 3TVT A; 1M27 C; 1NYF A; 2B86 A; 2CUB A; 2JT4 A; 3IQL A; 2JMC A; 2CT4 A; 1AWO A; 2CUD A; 4EIK A; 1W1F A; 2W0Z A; 4D8D A; 3GBQ A; 2DLP A; 2OAW A; 1OPL A; 1U3O A; 2DRK A; 1LCK A; 3M0P A; 1WA7 A; 3VS4 A; 1GBQ A; 5IHN A; 1ZLM A; 1JU5 C; 2K3B A; 1I1J A; 2EYW A; 2L3S A; 4J9G A; 1X27 A; 2OI3 A; 2OJ2 A; 4J9C A; 2EQI A; 4DEX A; 1HSQ A; 4OMM A; 2F2X A; 2H8H A; 2AKK A; 4F16 A; 2LX7 A; 1GBR A; 5L23 A; 1AOJ A; 3VS3 A; 1OEB A; 1SHF A; 1PHT A; 3EGU A; 4F17 A; 1H3H A; 4RTV A; 1AWJ A; 3PVL A; 3VS5 A; 1RLQ C; 1NLP C; 1ABO A; 2LP5 A; 2O31 A; 1UE9 A; 4Y92 A; 1YNZ A; 2KYM A; 2EVR A; 2HCK A; 1M3B A; 1ZUY A; 2L0A A; 1MUZ A; 2GTJ A; 1QCF A; 2DBK A; 3JV3 A; 2D8J A; 2DL4 A; 1T3S A; 3EHQ A; 3A98 A; 2K6D A; 1NEG A; 1QWF A; 1AD5 A; 3KFV A; 5I11 A; 1T0H A; 3THK A; 2IIM A; 1K0X A; 4JJB A; 5GJW B; 3M0T A; 1UHC A; 2ED1 A; 3PVQ A; 4FSS A; 2K7A A; 4RTY A; 1ZBJ A; 1SPK A; 4AFS C; 1MV0 B; 2GNC A; 1CSK A; 4HXJ A; 2YUQ A; 5FW9 A; 2L2P A; 3VS2 A; 2A08 A; 2KRM A; 1KJW A; 1Z9Z A; 3NMZ C; 1X43 A; 3VS1 A; 2A37 A; 3FJ5 A; 4J9I A; 2LJ3 A; 2X3W D; 2EKH A; 1PWT A; 3PE0 A; 2RQV A; 2BZX A; 1PKT A; 1Y0M A; 4KRT A; 2LJ1 A; 3NPF A; 2KXD A; 2ENM A; 2LZ6 B; 2F2W A; 2FRY A; 2J6O A; 1K4U S; 3EG0 A; 1AVZ C; 1NM7 A; 2DL3 A; 2JXB A; 1N5Z A; 2ABL A; 2EGE A; 3EG2 A; 2JM9 A; 3VS7 A; 1GL5 A; 1SHG A; 2JW4 A; 2FO0 A; 2J06 A; 4JJC A; 1M8M A; 1X2Q A; 2LJ0 A; 1WDX A; 2DMO A; 4QT7 A; 1VYU A; 2M0Y A; 3C0C A; 4OMP A; 4OMQ A; 1IO6 A; 2DM1 A; 2V1R A; 2AZV A; 2KR3 A; 4LNP A; 2DL8 A; 2YSQ A; 2JM8 A; 1K0S A; 2DNU A; 4J9H A; 1SSH A; 1B07 A; 2MOX A; 2DL5 A; 4OML A; 1U06 A; 2HDA A; 2ED0 A; 2KRN A; 2ESW A; 3SEM A; 2QDL A; 2RN8 A; 4IIO A; 4M4Z A; 3UAT A; 3EG3 A; 4K11 A; 4CC2 A; 1I07 A; 2O88 A; 1JXO A; 2DJQ A; 2AK5 A; 4HCK A; 1M3A A; 2ECZ A; 2DF6 A; 4ORZ A; 2HEQ A; 3EG1 A; 1AZE A; 1TUC A; 2GQI A; 1YWO A; 5IXB A; 2LQN A; 1G83 A; 5EC7 A; 2C0I A; 2KRS A; 1WFW A; 2CSI A; 1VYT A; 5IHI A; 2VVK A; 3REA B; 3TSW A; 3UA7 A; 2M51 A; 1AEY A; 1PNJ A; 1UTI A; 1GFC A; 1U5S A; 2CSQ A; 4AFZ C; 4WCI A; 1K76 A; 1QKW A; 2D1X A; 4CC7 A; 1VYV A; 1XOV A; 4RTZ A; 4RTX A; 2KEA A; 1J3T A; 4IIM A; 4JJD A; 2VWF A; 4R0K A; 2KE9 A; 2E5K A; 2KNB B; 1CKB A; 2RQT A; 2J6F A; 1G2B A; 1ZUK A; 1BBZ A; 2RQR A; 2XMF A; 1ZX6 A; 2W10 A; 3RBB B; 4ESR A; 1QWE A; 2L3Q A; 3VS0 A; 1UEC A; 1X2K A; 2AKL A; 4LUE A; 4JPB W; 2LNH B; 2GTO A; 2NUZ A; 1JEG A; 2CDT A; 1PRL C; 2O9S A; 4OMN A; 1WLP B; 4RTU A; 1WYX A; 2K9G A; 3I35 A; 1UJ0 A; 2RPN A; 2EPD A; 5FWC A; 4HVV A; 1SRL A; 2D8H A; 2FRW A; 5GJV B; 4Z8A A; 2O9V A; 2GBQ A; 2BZY A; 1W70 A; 4X1V A; 2K79 A; 1UJY A; 2FEI A; 2RNA A; 3M0Q A; 1QKX A; 2EGC A; 1KIK A; 5I22 A; 2EYX A; 1E6H A; 1BB9 A; 2YT6 A; 1SRM A; 2MCN A; 1NG2 A; 2FPD A; 5IXF A; 2EBP A; 3R6N A; 2FPE A; 4Z88 A; 1SEM A; 1GCP A; 1B3Q A; 1Z9Q A; 1WX6 A; 2AZS A; 1NLO C; 2LQW A; 5IHK A; 3TSZ A; 1JQQ A; 2KGT A; 2DX1 A; 3H0H A; 2DA9 A; 2P4R A; 1ZSG A; 4D8K A; 2KRO A; 1TUD A; 2VKN A; 1W6X A; 1M30 A; 1RUW A; 1T0J A; 1UUE A; 2MIO A; 2RQW A; 3VS6 A; 2X3X D; 1M3C A; 1GCQ A; 4CC4 B; 1H8K A; 4J9B A; 1UG1 A; 2PNI A; 4Z89 A; 3O5Z A; 1K1Z A; 4LN2 A; 2V1Q A; 2DIL A; 1YN8 A; 2O2O A; 4AG2 C; 2YUN A; 1E6G A; 1HD3 A; 2L3P A; 1GFD A; 2DL7 A; 3H0F A; 3I5R A; 4RTW A; 1FMK A; 1YP5 A; 1YWP A; 4AFU C; 2GGR A; 2RMO A; 2ROL A; 3M0S A; 2J6K A; 1FYN A; 2C0O A; 1KFZ A; 4RTT A; 2I0N A; 1HJD A; 3ULR B; 3SHW A; 2YDL A; 1ABQ A; 2D0N A; 1UGV A; 1OOT A; 1T3L A; 4J9E A; 1KSW A; 2CT3 A; 2K2M A; 3NHN A; 3UA6 A; 1E7O A; 1H92 A; 1NEB A; 2EYY A; 3H0I A; 5FWB A; 2SRC A; 2YUP A; 4ZNX A; 4J9D A; 3I5S A; 3UF4 A; 1EFN A; 1A0N B; 4A63 B; 2RQU A; 1JXM A; 2CRE A; 1GCQ C; 2CH4 A; 1Y57 A; 3EHR A; 1S1N A; 1CKA A; 1JO8 A; 4GLM A; 1RI9 A; 3VRY A; 2PZ1 A; 4F14 A; 1UHF A; 2DRM A; 1MV3 A; 2FG0 A; 1TG0 A; 2BTT A; 3QWX X; 3ZL7 C; 2KT8 A; 1VA7 A; 4GBQ A; 5IH2 A; 1UFF A; 3I9Q A; 2DBM A; 1AWW A; 3M0U A; 3VRZ A; 4LUD A; 1WI7 A; 1QLY A; 4J9F A; 1X6G A; 3U23 A; 4HVU A; 1ARK A; 2F2V A; 2YUO A; 3REB B; 2EGA A; 1AWX A; 1NYG A; 1OV3 A; 1WXT A; 3RNJ A; 1ZUU A; 4AG1 C; 2C0T A; 3QWY A; 4E6R A; 4JZ3 A; 3NGP A; 4CC3 A; 1YCS B; 2EW3 A; 3LH5 A; 2FPF A; 4OMO A; 1BK2 A; 2KXC A; 2JMA A; 1GRI A; 2A36 A; 1AZG B; 1X69 A; 2J7I A; 4HVW A; 4RUG A; 1X6B A; 1I0C A; 1WXB A; 1RLP C; 2DVJ A; 2LMJ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2EYZ A; 2J05 A; 2HQX A; 4DEY A; 1OPK A; 2HSP A; 2LVM A; 2KBT A; 3UPU A; 3CME T; 3CPF A; 4C92 C; 1UDL A; 2PVD B; 3CC2 Q; 2CZ6 B; 1WHJ A; 1PRM C; 1Q86 U; 2NWM A; 1VQ6 A; 3R6O A; 4AFQ C; 1TWB A; 1HXD A; 2ROT A; 3QSU A; 1LNX A; 4LE9 A; 4XU3 A; 3CCL A; 2PTK A; 2L3R A; 5KYW A; 1PKS A; 1V29 B; 3TVT A; 1N8R U; 4XU1 A; 3I55 A; 4L5G A; 4QW2 A; 2QQS A; 2P4T A; 4EDU A; 2DZC A; 3GBQ A; 3SWN B; 2DLP A; 1KC8 C; 3CCU Q; 3RKW A; 3CCU T; 1ZBX A; 2E12 A; 1K8A U; 3M0P A; 4M7A E; 1WA7 A; 3VS4 A; 5IHN A; 5CQY A; 5HK0 A; 5A2Q E; 4BAC A; 5GAM f; 4N0A A; 5CKF A; 4PLI A; 2EYW A; 4M7D C; 2L3S A; 2OI3 A; 2V8K A; 5LJ3 f; 5FRM A; 4KGZ B; 4OMM A; 1D3B A; 5FRN A; 2RB6 A; 2OX7 A; 1C1A A; 3RR6 A; 1JJ2 S; 3VS3 A; 1MMG A; 1X75 C; 1KQS A; 2E6Z A; 1AWJ A; 2GFU A; 5KYU B; 2KK4 A; 4JUV A; 1YNZ A; 2KYM A; 2EVR A; 2JTM A; 1SG5 A; 4IKF A; 2RI5 A; 1QCF A; 3JV3 A; 3OSV A; 5KYX A; 3EHQ A; 5LJ5 j; 5GAN j; 4C92 A; 5CIU A; 5FU6 B; 1VQ7 A; 3KFV A; 1T0H A; 2DTO A; 2M1H A; 3EH1 A; 3QO3 A; 3M0T A; 1I4K 1; 2ED1 A; 2L5Q A; 4F7U E; 3JSC A; 5GAN 4; 4MMK A; 1BCM A; 3GOX A; 4E7J A; 2GNC A; 1G8X A; 3CME A; 3EFO B; 2K5F A; 3VS2 A; 1YIT A; 1O75 A; 3S3N A; 3CBM A; 3NMZ C; 2XDB A; 4JLG A; 3FJ5 A; 3HRU A; 4J9I A; 2F5T X; 5DM7 R; 2X3W D; 2QEX A; 3JB9 D; 3SDZ A; 1QP3 A; 1JJ2 P; 2LJ1 A; 2KXD A; 2ENM A; 2LZ6 B; 2F2W A; 3S6W A; 4IUV A; 2QA4 A; 1NM7 A; 1YHQ A; 3DLM A; 5KYY B; 4BE1 A; 2V8J A; 1YCY A; 5D7U A; 5KYU A; 2FO0 A; 1KD1 R; 5CKB A; 4XTW A; 4OB0 B; 3QDF A; 1S72 T; 1VQ4 A; 2V1R A; 4KT0 E; 3FRN A; 4M75 G; 3SD4 A; 2RHZ A; 2YSQ A; 1K73 R; 1K0S A; 2DNU A; 4HCC A; 5D6Y A; 1SSH A; 1VQ5 T; 2DL5 A; 5GAO n; 2HDA A; 4JS4 A; 2QDL A; 4M4Z A; 3KBG A; 5DLQ E; 4CC2 A; 1VQK Q; 2AIR B; 1WPY A; 8AT1 B; 2O88 A; 3G71 A; 2EAY A; 2QAS A; 3RMQ A; 4HKE A; 1W2B S; 4LDU A; 2DF6 A; 3RES A; 3EGX A; 3CCE A; 2HEQ A; 3EG1 A; 2LT1 A; 3MPU B; 4BE0 A; 2LQN A; 3FC3 A; 1BI0 A; 1M90 U; 4JRQ A; 3MCA B; 1VYT A; 2RK1 A; 5IHI A; 2KVQ G; 1YI2 Q; 3QYG B; 1RAH B; 3REA B; 4L6V 5; 2X4Y A; 1AEY A; 3DKM A; 2EIF A; 4IUP A; 2CSQ A; 4OGE A; 5LJ5 d; 1K76 A; 5GAN d; 3PMT A; 3QHS A; 4PJO F; 2QTX A; 2A3L A; 4RTZ A; 4DBR A; 2XIC A; 4RMO A; 4XU2 A; 4JJD A; 3PMI A; 2KE9 A; 4M75 D; 3OYE A; 1VQP A; 4VUB A; 4XTV A; 2RQT A; 2J6F A; 2E70 A; 1X01 A; 1G2B A; 4M7A D; 1ZX6 A; 3CCM A; 2YHT A; 2P84 A; 3LYI A; 2RD1 A; 1X2K A; 2NUP A; 4E7H A; 1D1C A; 1IGU A; 5AYF A; 4LUE A; 1JEG A; 4FM4 B; 2CDT A; 2YRC A; 2CZ1 B; 3EG9 B; 3CCQ A; 3OSS C; 3OYK A; 1WHK A; 5IN1 A; 1W2B P; 2K9G A; 1UJ0 A; 3JCM J; 2NYS A; 1Y7X A; 3C4S A; 2RPN A; 2EPD A; 4HVV A; 1SRL A; 1ZSZ B; 3QG1 A; 3OYG A; 1TSF A; 1U8R A; 5D6W A; 4C92 E; 4MML A; 3CCJ A; 3RIR A; 5EG2 A; 2FEI A; 2RNA A; 3A1P A; 3L2R A; 2H3J A; 5LJ3 e; 2R58 A; 2XG8 D; 5I22 A; 2OTL A; 2X51 A; 1OX9 A; 2MCN A; 1D1B A; 1NG2 A; 3R6N A; 4M78 F; 1Z9Q A; 2MAM A; 3BW1 A; 3G6E A; 3RUX A; 4A53 A; 1ZA1 B; 2E1H A; 3TSZ A; 4AMC A; 3J7A F; 2KGT A; 2R5M A; 3JRZ A; 2DK3 A; 2DA9 A; 1M1K R; 2D6F A; 2OTJ T; 5I2S A; 3I56 Q; 4D8K A; 3V7R A; 1VQ8 T; 1D1A A; 1M30 A; 4M7D E; 2MIO A; 2QXF A; 2VXF A; 3EG9 A; 2EKO A; 2RQW A; 1PD1 A; 1M3C A; 1U1S A; 3OA6 A; 2LCL A; 1IRE B; 4LN2 A; 1YJW T; 5A0G A; 3CCV A; 1MMA A; 1X6O A; 1PC0 A; 3OYY A; 1E6G A; 2JJ9 A; 2L3P A; 2D9T A; 3M5A A; 5LJ5 g; 4YTL A; 1NPP A; 1YIJ T; 2QQR A; 5GAN g; 2HKN A; 2K5L A; 4NL3 A; 4AFU C; 2RMO A; 3P8B B; 3OMC A; 1OYX A; 4BY6 C; 2RHI A; 4DBF A; 4NS5 A; 2LDM A; 1OQK A; 3SHW A; 3CMA Q; 2D0N A; 1UGV A; 3QJY A; 3CC4 A; 3PNW C; 3NHN A; 2M0O A; 3OS2 A; 3LH0 A; 2R5A A; 4PJO C; 3LGF A; 4ZNX A; 1PD0 A; 3HPW A; 4X9C A; 2CRE A; 3DB4 A; 4PJN A; 1GCQ C; 4RG8 A; 2CH4 A; 3OYM A; 3VJP A; 1CKA A; 4M75 B; 2HAX A; 4GLM A; 4LDV A; 4FYV B; 1OU8 A; 2PZ1 A; 4F14 A; 1TH7 A; 1UHF A; 1QVG S; 2WSE E; 2QI2 A; 1M2V B; 4HCB A; 4XTX A; 2KQW A; 4CI0 C; 1SF9 A; 3ZL7 C; 2KT8 A; 2VAS A; 4BDZ A; 1JBM A; 2LNV A; 2X4X A; 3I9Q A; 4A4K A; 4EMK A; 2NUT A; 4M77 G; 3S3O A; 2VUB A; 1FMW A; 3V8K A; 2ZPI B; 4KBM B; 1WI7 A; 4C8Q G; 4J9F A; 1X6G A; 3DB3 A; 3FJP A; 1XQH A; 1ARK A; 3RNJ A; 1VQL Q; 2VGN A; 1LPL A; 1YCS B; 1UB4 A; 2L89 A; 3GP8 A; 4OMO A; 1BK2 A; 4HT9 A; 1VQO A; 2OTJ A; 1I0C A; 1RLP C; 4ZN3 A; 9ATC B; 2LMJ A; 3HRT A; 2LCS A; 2G6F X; 1RAF B; 2KT1 A; 2V8I A; 3HKS A; 2JS0 A; 5FU7 B; 2RF0 A; 3G4S A; 2JTE A; 4KUL A; 3CQT A; 2CH4 W; 1EIF A; 3D7S B; 4M78 C; 3JCM f; 1QVG P; 3H41 A; 5KCH A; 1V1C A; 2SEM A; 1BI1 A; 4C92 D; 4PJO A; 1ZA2 B; 2LRQ A; 2QGG A; 3JAM E; 2JNG A; 4FYY B; 4J7I A; 3PIP A; 2DXB A; 3IQL A; 5CR2 A; 4OGC A; 4RKU E; 4D8D A; 2OAW A; 1VQ6 Q; 1OPL A; 1K9M U; 3TQ7 P; 3EGD B; 2MPX C; 2KMT A; 3OMG A; 1JU5 C; 2K3B A; 3CCL T; 4PK4 A; 7AT1 B; 2DTI A; 2OJ2 A; 4J9C A; 2EQI A; 4DEX A; 3I55 Q; 3EFR A; 2AKK A; 4F16 A; 2MWP A; 1Q86 C; 4XTY A; 2YWW A; 5L23 A; 3NFC A; 1AOJ A; 2PVO B; 4LDY A; 1YJ9 Q; 1OEB A; 1SHF A; 4BI4 A; 4RTV A; 4M7D D; 4JRK A; 1RLQ C; 1ABO A; 1N8R C; 4Y92 A; 2HBP A; 4J8O A; 3L1A A; 1FMV A; 1RL2 A; 1MUZ A; 4EPC A; 2DBK A; 3A8H B; 3X25 B; 3A8M B; 3OYH A; 3CC7 T; 2WSF E; 2O4X A; 1MMD A; 2K6D A; 2PQW A; 1NJI U; 1K8A C; 1NEG A; 2OAU A; 3URG A; 4ME7 A; 4N0A C; 2HMA A; 4XTU A; 1WQ7 A; 1Q82 U; 4FSS A; 4PFZ A; 2RJF A; 1QQJ A; 5L8R E; 3HP9 A; 1SPK A; 2EJF A; 3HSB A; 5LJ3 h; 1MV0 B; 4E7S A; 2EFI A; 2YUQ A; 3DLL A; 2LQ8 A; 3EFS A; 2KRM A; 2E3I A; 1KJW A; 1Z9Z A; 4OB3 B; 1VQ7 T; 4E47 A; 3M9Q A; 1M8V A; 3HTR A; 3MEA A; 4XK8 E; 3LLR A; 1HYO A; 3EAE A; 1PWT A; 1PKT A; 4KRT A; 2FRY A; 2MK5 A; 3CME Q; 3EG0 A; 2DL3 A; 1NBE B; 2JXB A; 1YIT T; 4LDW A; 2EGE A; 2JTF A; 3EG2 A; 2JM9 A; 3VS7 A; 1GL5 A; 2ZPH B; 2J06 A; 2WSC E; 1PG5 B; 1WZO A; 2QEX Q; 2QEX T; 2LJ0 A; 2QTV A; 5DLO A; 3A8G B; 4OMQ A; 3SWN C; 5FRO A; 2BUD A; 2YRV A; 3M58 A; 1KC8 R; 4ZGE B; 2QA4 T; 1YHQ Q; 1YHQ T; 2QGF B; 4OML A; 1VQ9 A; 2COW A; 1G3Y A; 4A54 A; 2ESW A; 2RN8 A; 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