The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
61
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structure length |
61
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Chain Sequence |
VTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
SAP couples Fyn to SLAM immune receptors.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SH2 domain protein 1A
|
| molecule tags |
Signaling protein, transferase
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
|
| structure length |
61
|
| sequence length |
61
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2002-06-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2PZ1 A; 1M30 A; 1SSH A; 2FPE A; 1S1N A; 2DBM A; 4LUE A; 2LMJ A; 2ENM A; 3EG3 A; 4EIK A; 2DLP A; 3PE0 A; 2A36 A; 2SRC A; 3H0H A; 1B3Q A; 3H41 A; 2MOX A; 3I35 A; 2FEI A; 1JO8 A; 5EC7 A; 2DRK A; 1GFC A; 2K6D A; 4JJB A; 2DF6 A; 2DBK A; 2EQI A; 2B86 A; 1AWX A; 1HD3 A; 1X6B A; 1GBR A; 1HJD A; 2XMF A; 3UA6 A; 4JZ4 A; 4X1V A; 1X2K A; 2KT8 A; 1X6G A; 1BU1 A; 1XOV A; 4RTY A; 1NEG A; 2DNU A; 1RUW A; 2AZS A; 4WCI A; 3I5S A; 2K79 A; 2E5K A; 2LCS A; 2L3P A; 2CUB A; 1OOT A; 2K9G A; 2A37 A; 2C0I A; 1H8K A; 2LZ6 B; 4QT7 A; 4IIM A; 1M3C A; 4RUG A; 1M3A A; 2DA9 A; 4KRT A; 1GCQ C; 2FRW A; 3EG1 A; 3VS7 A; 1PRL C; 1SHG A; 2KR3 A; 4OML A; 1TUC A; 1TG0 A; 2JMC A; 1NYF A; 1G2B A; 4OMP A; 1LCK A; 1SEM A; 2GTO A; 4AFS C; 2RQV A; 1QWE A; 3PVL A; 2J6K A; 2LNH B; 1ZBJ A; 1AZG B; 1QWF A; 2O2O A; 1ZUY A; 2RQR A; 2DRM A; 2RPN A; 2YSQ A; 3SHW A; 1QCF A; 4AFU C; 2GQI A; 3A98 A; 2RNA A; 1ZLM A; 3THK A; 1KFZ A; 3CQT A; 2K7A A; 1HSQ A; 3VRZ A; 1WXT A; 2OI3 A; 3NMZ C; 2H8H A; 4Y92 A; 2F2W A; 2JTE A; 1RLQ C; 2JM8 A; 2CH4 A; 4DEX A; 2YUO A; 4J9H A; 2K2M A; 2EGA A; 1UJ0 A; 2L0A A; 2HDA A; 1UHC A; 2EGC A; 5IHK A; 2KRM A; 4OMQ A; 1VYU A; 3VRY A; 2CSI A; 2OAW A; 2HBW A; 2VWF A; 1VYT A; 2HCK A; 1RLP C; 3EHQ A; 3VS6 A; 1YN8 A; 4CC3 A; 1I07 A; 4LNP A; 1ABQ A; 1BBZ A; 1AWJ A; 1YWO A; 1UGV A; 1Y57 A; 3EG2 A; 1WI7 A; 3NHN A; 2ED1 A; 3VS2 A; 4DEY A; 2ECZ A; 2ROT A; 2CT4 A; 2DL4 A; 2DL7 A; 4J9D A; 1WDX A; 1T3L A; 2YDL A; 2K3B A; 1I0C A; 2G6F X; 4LN2 A; 1PWT A; 2LJ0 A; 4J9C A; 2DX1 A; 1H3H A; 2JMA A; 2QDL A; 4GBQ A; 2IIM A; 4J9B A; 1UEC A; 1K4U S; 2VVK A; 4R0K A; 2MCN A; 2O9V A; 2EYW A; 1JXO A; 1WXU A; 2KYM A; 1JXM A; 2DMO A; 2A08 A; 1Z9Z A; 2CDT A; 2BZY A; 1G83 A; 4RTX A; 1AEY A; 2C0T A; 1NLP C; 2KRN A; 2CRE A; 4FSS A; 4J9F A; 3TSW A; 1WYX A; 4AG2 C; 1SHF A; 1WIE A; 1W6X A; 1GCQ A; 2JS0 A; 1GFD A; 2J06 A; 1GL5 A; 1K0S A; 1AVZ C; 2LX7 A; 1T3S A; 2O9S A; 4JJC A; 2A28 A; 2BTT A; 2DL8 A; 1M3B A; 1SPK A; 1ARK A; 1IO6 A; 4RTU A; 1E6G A; 1UHF A; 4RTV A; 2GGR A; 2L2P A; 1UE9 A; 1W70 A; 1ZUK A; 2J05 A; 2RQT A; 2DL5 A; 2JW4 A; 3ZL7 C; 1PHT A; 1N5Z A; 1A0N B; 3RBB B; 2I0N A; 5IHI A; 4JPB W; 2CSQ A; 2J6F A; 1YP5 A; 3O5Z A; 3JV3 A; 2M51 A; 1M27 C; 1YCS B; 2DM1 A; 5IH2 A; 1V1C A; 4HCK A; 1PNJ A; 1WA7 A; 4HVW A; 1Z9Q A; 4J9E A; 1CKB A; 4HVV A; 2PNI A; 1KSW A; 1GRI A; 2W10 A; 1ZUU A; 2CUD A; 1T0J A; 5I22 A; 4AFQ C; 2BZX A; 2LQW A; 2DL3 A; 1X43 A; 2L3Q A; 2KBT A; 3U23 A; 2CT3 A; 3VS0 A; 2KRS A; 1WFW A; 2YUQ A; 1GBQ A; 2AKL A; 1AWW A; 2EYZ A; 4RTT A; 2FG0 A; 2JXB A; 5FWC A; 1T0H A; 2EYX A; 2LQN A; 2RQU A; 1NEB A; 2C0O A; 1KIK A; 2GBQ A; 1UJY A; 1AWO A; 1OV3 A; 4OMM A; 4E6R A; 2V1R A; 2OJ2 A; 2M0Y A; 4Z89 A; 2EVR A; 5HCK A; 4JJD A; 1MUZ A; 2KT1 A; 2RF0 A; 3VS1 A; 2DJQ A; 4RTW A; 5IHN A; 4A63 B; 2KRO A; 1MV0 B; 3M0U A; 1K0X A; 2KXD A; 2EPD A; 2BZ8 A; 1U06 A; 2O88 A; 1AD5 A; 1AOJ A; 2MIO A; 2PTK A; 1GCP A; 3PVQ A; 1NM7 A; 2NUZ A; 5I11 A; 1FYN A; 3I9Q A; 2KYB A; 2KGT A; 2V1Q A; 2X3X D; 1NYG A; 4AG1 C; 1ZSG A; 4OMN A; 3NGP A; 3R6N A; 2GNC A; 2VKN A; 4JZ3 A; 3QWY A; 4Z88 A; 4HXJ A; 1I1J A; 4ZNX A; 2FPF A; 1QLY A; 2AK5 A; 2X3W D; 3KFV A; 2DYB A; 1VA7 A; 2YUP A; 4J9I A; 1M8M A; 5GJV B; 2F2X A; 3H0F A; 2FPD A; 1WLP B; 3NPF A; 2KE9 A; 4F17 A; 1J3T A; 1H92 A; 1BK2 A; 1WXB A; 3TVT A; 2DVJ A; 1YNZ A; 2D0N A; 2NWM A; 3IQL A; 3QWX X; 1K1Z A; 3VS4 A; 2LJ3 A; 1SRM A; 1JEG A; 1SRL A; 5FWB A; 2KNB B; 3VS5 A; 1CSK A; 3M0T A; 1AZE A; 1U3O A; 1QKX A; 2EW3 A; 2DIL A; 2LP5 A; 1K9A A; 2P4R A; 3SEM A; 2KXC A; 2CH4 W; 4Z8A A; 3I5R A; 3UF4 A; 2AZV A; 4OMO A; 2ED0 A; 1BB9 A; 5IXF A; 1VYV A; 1EFN A; 2EBP A; 2ROL A; 2JM9 A; 1NLO C; 2JT4 A; 3RNJ A; 1CKA A; 3VS3 A; 3EHR A; 1B07 A; 1U5S A; 2J6O A; 4ESR A; 3FJ5 A; 5L23 A; 4K11 A; 2J7I A; 1K76 A; 4M4Z A; 3ULR B; 2SEM A; 1UTI A; 1W1F A; 3M0Q A; 2D1X A; 1PKT A; 1RI9 A; 3UA7 A; 3M0R A; 2D8J A; 2RMO A; 2EGE A; 3LH5 A; 2W0Z A; 3M0P A; 2FRY A; 1OEB A; 2GTJ A; 4J9G A; 1E6H A; 2DE0 X; 1QKW A; 3EG0 A; 5GJW B; 4D8D A; 2EKH A; 2EYY A; 1ZX6 A; 4RTZ A; 1X2Q A; 2F2V A; 4CC7 A; 1TUD A; 2FO0 A; 3H0I A; 2D8H A; 2HEQ A; 1JQQ A; 2YT6 A; 4D8K A; 4AFZ C; 1UDL A; 4ORZ A; 1KJW A; 1X27 A; 1E7O A; 2O31 A; 2ABL A; 3EGU A; 1Y0M A; 1WX6 A; 3UAT A; 1NG2 A; 4IIO A; 5ECA A; 1OPK A; 4CC4 B; 1OPL A; 5FW9 A; 3M0S A; 2ESW A; 1UFF A; 1X69 A; 2RN8 A; 3TSZ A; 3REA B; 1JU5 C; 4LE9 A; 4LUD A; 1FMK A; 2JS2 A; 2KEA A; 1PRM C; 1PKS A; 1ABO A; 2YUN A; 2HSP A; 2L3S A; 4GLM A; 4CC2 A; 1MV3 A; 3GBQ A; 4HVU A; 1YWP A; 1UUE A; 2RQW A; 4F16 A; 4F14 A; 3C0C A; 5IXB A; 3REB B; 2AKK A; 2LJ1 A; 1UG1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5KH6 A; 2PZ1 A; 4KBM B; 1S1N A; 4M7A B; 3OW2 A; 5D6X A; 2OTL T; 1VQM T; 2DLP A; 2SRC A; 3CCS T; 2MOX A; 2R57 A; 1R0B G; 3CCV A; 2DRK A; 4JJB A; 2DF6 A; 2E12 A; 4DOW A; 1YIT A; 2EJF A; 2COW A; 5KYX A; 4E47 A; 1X6O A; 4X1V A; 1K8A C; 3PGG A; 1WHM A; 4OGC A; 2YRV A; 2KT8 A; 1M2V A; 1BU1 A; 1XOV A; 4RTY A; 3GOX A; 3MEU A; 3CC7 T; 2K79 A; 1KD1 R; 5LJ5 d; 3PMI A; 4XTX A; 2FHD A; 3S3O A; 2LZ6 B; 1WHK A; 1UGS B; 3S3M A; 1RAE B; 3GNG A; 1IRX A; 1KK7 A; 4RUG A; 1VQ8 Q; 2KI7 A; 1PM3 A; 3JB9 G; 2V8J A; 5AYF A; 1M90 R; 1D3B A; 1IB8 A; 3T9N A; 1TG0 A; 4A54 A; 2JMC A; 1G2B A; 4EMK C; 5GAN h; 4WTO B; 1YJW T; 2RQV A; 4XU0 A; 1RAI B; 3OMG A; 4ATO A; 2YSQ A; 3SHW A; 2GQI A; 3A98 A; 3EGD A; 3JCM J; 3EFO B; 3SDZ A; 4C92 G; 3J81 E; 4BE1 A; 4PJO C; 3JCM P; 3A8H B; 2LQK A; 3EG9 A; 4ZTJ A; 3OMC A; 3VRZ A; 1WXT A; 2VGM A; 3E9F A; 4J6X A; 5GAO q; 5FRM A; 2M9U A; 2JTE A; 2XKO C; 2E3H A; 3MCA B; 2OTL A; 1VQM A; 2K2M A; 2EFI A; 5KCO A; 2D0Q B; 1UHC A; 3CCS A; 3PTA A; 4OMQ A; 4JRQ A; 3M4G A; 4M78 A; 2HBW A; 1VYT A; 3OSS C; 4RG8 A; 1G3S A; 4C8Q G; 4CC3 A; 1I07 A; 4LNP A; 1YI2 T; 1JJ2 P; 1AWJ A; 1NJI R; 2RHX A; 3C95 A; 4PLL A; 3NHN A; 4M77 D; 4DEY A; 5I21 A; 2ECZ A; 2CT4 A; 4XTW A; 3RDV A; 2JZ2 A; 3MP6 A; 3BDU A; 1TU0 B; 2DL7 A; 2MWP A; 4E7J A; 4L6V 5; 4MDX A; 3OYC A; 1EX4 A; 3CBO A; 1PC0 A; 4N0A A; 2YDL A; 2Y4X A; 4BE2 A; 3WVE B; 1BKB A; 1PWT A; 1O9S A; 4J9C A; 4OB1 B; 2JOY A; 3JCM b; 1Q7Y R; 5GAN g; 1UEC A; 4OVA A; 2IG0 A; 4ELZ C; 2DYI A; 2KSS A; 1EIF A; 4DBF A; 2O9V A; 1JXO A; 5GAM h; 4KT0 E; 3CCE Q; 2KYM A; 1JXM A; 2A08 A; 3FJP A; 1YJW A; 4C0Z A; 2BZY A; 1G83 A; 4RTX A; 4X9C A; 1AEY A; 3G71 Q; 5L8R E; 4M77 B; 2KRN A; 1BIA A; 3CXC A; 3M58 A; 4M7D E; 4J9F A; 3VKI A; 1WYX A; 3M54 A; 1KD1 U; 2CKK A; 1WIE A; 3UPU A; 3A8M B; 2YLB A; 1GCQ A; 3QYH B; 1K0S A; 3JB9 I; 2QQ9 A; 1VQN Q; 1Q82 C; 1VQ4 A; 1KQS P; 3CCL Q; 2A28 A; 4FYX B; 1M3B A; 2M0O A; 3ME9 A; 1E6G A; 2QQB A; 1VQ6 Q; 1UB4 A; 2L2P A; 3LX7 A; 3JCM Q; 5GAN e; 4FYV B; 1M90 U; 2J05 A; 5KYU A; 3TEE A; 1VQL T; 2DL5 A; 4M7A A; 1GXI E; 3ZBD A; 4IUR A; 4DBH A; 4BAC A; 4JPB W; 2CSQ A; 1YP5 A; 1DJ7 B; 2EKO A; 3LW5 E; 2M51 A; 1RAG B; 4FIB A; 1YCS B; 2DM1 A; 1QP3 A; 4NL2 A; 1YI2 A; 1V1C A; 1PNJ A; 3UWN A; 5IN1 A; 1WPY A; 2P0Q A; 1TWB A; 4C8Q B; 4J9E A; 1KSW A; 3D7S B; 2DL3 A; 1TS9 A; 1ACM B; 2L3Q A; 2A7Y A; 1FWZ A; 1ZSZ C; 4QKU A; 1AWW A; 1YJ9 A; 5FU6 B; 1N6A A; 1M1G A; 1ZQ1 A; 2FG0 A; 2JXB A; 5FWC A; 1T0H A; 4BD3 A; 3OYM A; 3OBY A; 2C06 A; 2QYZ A; 1NJI U; 3EH1 A; 1RAF B; 4FW2 A; 4Y91 A; 4BE0 A; 4J5Y A; 4C5H A; 4QQG A; 2OJ2 A; 2YRD A; 2K2V A; 4JJD A; 1MUZ A; 2YLC A; 5LJ3 d; 3EFO A; 2LNV A; 5GAN 4; 2DPP B; 3AHU A; 3CCM A; 1UGR B; 5GAN 6; 1N27 A; 2KXD A; 4EDU A; 1D09 B; 2QEX A; 2XID A; 3HHT B; 5J39 A; 4PFZ A; 3P8H A; 1Q7Y U; 2O88 A; 3SWN C; 5GAM e; 2JNG A; 1AOJ A; 1QQJ A; 2PTK A; 4LDX A; 1FYN A; 1BI0 A; 3G4S Q; 1XNI A; 2LT1 A; 3I9Q A; 1TXQ A; 2RI3 A; 1VQ7 Q; 2QQA A; 3CME Q; 1G3Y A; 2X3X D; 2O4X B; 1NYG A; 4M75 E; 5GAN j; 1ZSG A; 4RCB A; 1VQ9 T; 3NGP A; 3R6N A; 2GNC A; 3OYL A; 5LJ5 h; 4ZNX A; 2FPF A; 1QLY A; 2AK5 A; 2X3W D; 5EG2 A; 1PSF A; 1U1S A; 5HY6 A; 2AT1 B; 2YUP A; 4JS5 A; 5GAO m; 2KE9 A; 1V76 A; 2ATC B; 3A1P A; 1WJS A; 1YNZ A; 1QCO A; 3VS4 A; 4PJM A; 1SRL A; 1G3W A; 2DET A; 4QVZ A; 1CSK A; 1LOJ A; 4LXC A; 2DXC A; 3V8L A; 2R58 A; 3I5R A; 3BFM A; 2AZV A; 2COZ A; 4RG2 A; 3PFS A; 2EBP A; 4M77 A; 2JT4 A; 3OSV A; 4WF2 A; 3CC4 Q; 5GAN 2; 1B07 A; 2LCC A; 2LTO A; 1U5S A; 4ESR A; 1FXX A; 3FJ5 A; 2DIQ A; 9ATC B; 3OYB A; 4FCY A; 4M4Z A; 3ULR B; 2SEM A; 1UTI A; 3HSB A; 1W1F A; 3ASK A; 3OYJ A; 1PKT A; 1OU8 A; 1RI9 A; 1ZBX A; 1O75 A; 1IHW A; 1R8O B; 2W0Z A; 1OEB A; 5GJW B; 2EYY A; 4RTZ A; 1K9M U; 4PJL A; 4M78 G; 5LJ5 g; 1VQ9 A; 2HZY A; 2KAF A; 5A2Q E; 1C0M A; 4AFZ C; 1KJW A; 2QQS A; 2HL5 C; 2ABL A; 2EJ9 A; 1JJ2 S; 2E70 A; 4C8Q A; 2KMT A; 3M4Y A; 4X9D A; 3UAT A; 3CBP A; 4R55 A; 5CKD A; 2VGN A; 4RMO A; 4PJO D; 4FW1 A; 4C5E A; 3TSZ A; 1X69 A; 1JU5 C; 1C6V X; 3G6E T; 4JLG A; 1PKS A; 1QP2 A; 1ABO A; 2HSP A; 4O5V A; 2L3S A; 3X20 B; 5CKE A; 4F7U E; 4ZGJ B; 4EMK B; 2MF2 A; 3REB B; 2LJ1 A; 3Q1J A; 3VV0 A; 1UG1 A; 5LJ5 e; 3OBW A; 5IT9 E; 2DEQ A; 4IUT A; 2A36 A; 3O8V A; 1QVG P; 2L3R A; 1D1C A; 3RKW A; 4PJO B; 2QA4 Q; 4QVD A; 2B86 A; 1AWX A; 4JZ4 A; 3CMA Q; 1X2K A; 3EGX B; 1D1A A; 1KQS S; 4C0D C; 2MK5 A; 4IUU A; 3V7C A; 1RUW A; 2AZS A; 1KG1 A; 2PVO B; 2X4J A; 1K9M C; 3FIF A; 2CUB A; 2FZG B; 3NFC A; 4M7A G; 1OOT A; 2WSC E; 1VQ8 T; 4ELY C; 1ZA2 B; 3VJP A; 4QT7 A; 1M1K C; 1C1A A; 1M3A A; 2DA9 A; 3OYA A; 1VUB A; 2FRW A; 2O4X A; 2DO3 A; 3NTH A; 4J6W A; 1Q81 C; 3VS7 A; 1SHG A; 2KR3 A; 3JSC A; 5GAN 5; 5D6W A; 4UC4 A; 1YJN T; 1LCK A; 3OS0 A; 2GTO A; 5AT1 B; 2JUF A; 3PVL A; 1M1F A; 2MWO A; 5I2M A; 1AZG B; 1QCN A; 1QWF A; 2O2O A; 3G6E A; 2OTJ Q; 4VUB A; 4GY5 A; 5GAM f; 3THK A; 3CQT A; 3BE3 A; 3G1J A; 3C94 A; 1WQ7 A; 4C5I A; 2HBP A; 2H8H A; 4LD9 K; 4Y92 A; 1WJQ A; 2X4X A; 4XTZ A; 2FL7 A; 2EGA A; 2F5K A; 5LJ3 h; 2L0A A; 3X24 B; 2EGC A; 1PCX A; 4MMK A; 1D1B A; 2LT4 A; 2RK2 A; 1Y07 A; 2CSI A; 4XAX B; 1BI1 A; 1X75 C; 2HCK A; 1RLP C; 3C4S A; 4C92 E; 3M57 A; 1BBZ A; 4HCZ A; 1YWO A; 1UGV A; 3WXM B; 3X26 B; 4FT2 A; 2K5F A; 4IUP A; 1W4S A; 2XG8 D; 1TTH B; 2X4W A; 1I0C A; 2F1L A; 3CCU Q; 1M4Z A; 5KYW B; 4MML A; 1VQ8 A; 1VQK Q; 4LN2 A; 2LJ0 A; 5D6Y A; 4PJJ A; 1VQO Q; 2RJF A; 2WSF E; 3L42 A; 5KYU B; 1H3Z A; 2QI2 A; 2VB6 A; 1YFN A; 2E6Z A; 1K4U S; 3CCE T; 4C8Q E; 1SF9 A; 3A8O B; 3TU4 K; 5CQX A; 2MCN A; 3KUF A; 4P5N A; 1WXU A; 3G71 T; 1YJN A; 4ZN1 A; 1MMA A; 2CDT A; 4AT1 B; 2VV5 A; 4DBQ A; 4M7D C; 1V29 B; 5A0D A; 2ZZD A; 3PIO A; 1IXD A; 3QSU A; 5GAO l; 1ZSZ B; 2M16 A; 3BY7 A; 4PFO A; 3FDR A; 3CCQ Q; 3S6W A; 3CCL T; 1GL5 A; 2LX7 A; 2BE7 D; 4JJC A; 2HSE B; 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