The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
CYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Mus musculus
|
| publication title |
Changing protein backbone topology: Structural and dynamic consequences of the backbone cyclization in SH3 domain
rcsb |
| molecule keywords |
Proto-oncogene C-crk
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| total genus |
6
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-06-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4R0K A; 2KRN A; 4OML A; 2LZ6 B; 1K1Z A; 2DBK A; 2KRO A; 1M8M A; 1H92 A; 1TG0 A; 2KEA A; 2DA9 A; 4HVV A; 1T3L A; 2LQN A; 1UTI A; 2LQW A; 2CT4 A; 2M51 A; 1TUC A; 3EGU A; 1H8K A; 1WYX A; 4RTY A; 1JO8 A; 1NM7 A; 1Z9Q A; 5GJW B; 4HXJ A; 3M0S A; 5FWB A; 2ED0 A; 2RQU A; 2ECZ A; 2D8J A; 4HVW A; 4RTX A; 2SEM A; 2FO0 A; 2CSI A; 2RPN A; 2LMJ A; 2BZ8 A; 4JJB A; 1VA7 A; 2KGT A; 2C0O A; 3FJ5 A; 2J6K A; 1NYG A; 1BU1 A; 1UHF A; 2CDT A; 2K6D A; 4CC3 A; 1QLY A; 1UJY A; 1SSH A; 4ORZ A; 1AOJ A; 2K9G A; 2H8H A; 2EBP A; 2DRM A; 3GBQ A; 1UHC A; 2MOX A; 4X1V A; 1Y57 A; 2JMC A; 4HCK A; 2YUQ A; 2CUB A; 1GCP A; 4HVU A; 2EYY A; 5GJV B; 2J06 A; 4OMO A; 3I5S A; 2JS2 A; 2V1Q A; 1YWP A; 3SEM A; 2DE0 X; 3ULR B; 1GFD A; 2K3B A; 2RQV A; 1SHG A; 2V1R A; 2IIM A; 3M0T A; 3VS6 A; 1YCS B; 1W1F A; 1YN8 A; 2KE9 A; 2LJ1 A; 5IHN A; 3SHW A; 1GL5 A; 1ZLM A; 1WX6 A; 1PNJ A; 2K7A A; 2YUP A; 1H3H A; 1I1J A; 1J3T A; 2AKL A; 1W70 A; 2O2O A; 2DL4 A; 1XOV A; 2DVJ A; 2KBT A; 1TUD A; 1X43 A; 2O88 A; 2D8H A; 1FMK A; 4M4Z A; 1JEG A; 3VS2 A; 2LNH B; 2KXD A; 2EGC A; 1E6H A; 1BB9 A; 3H0H A; 3PVQ A; 1M3A A; 3KFV A; 2F2V A; 2FPD A; 3O5Z A; 3EG3 A; 1A0N B; 1UEC A; 2ABL A; 1N5Z A; 5IXB A; 1PKS A; 1NYF A; 3IQL A; 4OMN A; 1G2B A; 2BZY A; 2YSQ A; 5I11 A; 2MCN A; 2PTK A; 1WFW A; 3LH5 A; 1MV0 B; 1QCF A; 2RF0 A; 2RQT A; 1AZE A; 3REB B; 1UDL A; 1VYU A; 3EG1 A; 1M3C A; 1AEY A; 2EYZ A; 2DL7 A; 1X6G A; 2GTO A; 4Y92 A; 4JJC A; 5HCK A; 2K2M A; 1PKT A; 4AFS C; 1QKW A; 2O9S A; 1T3S A; 4AFU C; 2FRW A; 4A63 B; 1K0S A; 2LP5 A; 1I07 A; 3PVL A; 2P4R A; 1NEB A; 2L2P A; 1PRM C; 2G6F X; 3VS0 A; 1PRL C; 1SRL A; 2OI3 A; 2A28 A; 2JM8 A; 1K4U S; 1AWX A; 1UGV A; 1YWO A; 2GBQ A; 1NEG A; 2BTT A; 2DJQ A; 2J7I A; 3UAT A; 4E6R A; 5EC7 A; 4GBQ A; 3NPF A; 5FWC A; 2L3Q A; 2KT8 A; 2DRK A; 4LNP A; 4Z89 A; 2JW4 A; 1AD5 A; 1WXU A; 4DEY A; 1S1N A; 1WI7 A; 2L0A A; 4D8D A; 1PWT A; 1CKB A; 3UF4 A; 1KFZ A; 2F2X A; 4IIM A; 3M0R A; 1X6B A; 2JMA A; 4GLM A; 4AG2 C; 3VRZ A; 1VYT A; 1ZUY A; 4RTW A; 3M0Q A; 3NGP A; 4DEX A; 4RTV A; 4KRT A; 4LUD A; 2DIL A; 3PE0 A; 4ZNX A; 4AFZ C; 2FEI A; 3EG0 A; 2DL8 A; 1YNZ A; 2AZV A; 1VYV A; 2B86 A; 1UJ0 A; 3H41 A; 3TVT A; 4AFQ C; 1W6X A; 2ENM A; 1WXB A; 2EYX A; 2EKH A; 1U3O A; 1HSQ A; 2KT1 A; 1BBZ A; 2L3P A; 1X2Q A; 2O31 A; 1V1C A; 1SHF A; 3THK A; 1RLP C; 4JZ4 A; 1U5S A; 1OV3 A; 2ROL A; 2KNB B; 2KR3 A; 2JTE A; 4OMM A; 3JV3 A; 2JS0 A; 1RLQ C; 2GQI A; 3C0C A; 2KYM A; 1K0X A; 2A36 A; 1QKX A; 1AZG B; 2OJ2 A; 2DNU A; 1SPK A; 2EVR A; 1ABO A; 4J9H A; 2E5K A; 2KYB A; 1X69 A; 2X3W D; 2LJ3 A; 4RTZ A; 2AKK A; 2AK5 A; 1X2K A; 2FPE A; 2EPD A; 5FW9 A; 5IHI A; 1I0C A; 2RQW A; 4CC4 B; 4ESR A; 4J9I A; 2ED1 A; 1X27 A; 2ROT A; 2I0N A; 2PZ1 A; 5IXF A; 2KRS A; 5IH2 A; 2K79 A; 1RUW A; 2EW3 A; 1AWJ A; 1E7O A; 3VS1 A; 1HD3 A; 3QWX X; 2O9V A; 1MUZ A; 4J9C A; 3UA7 A; 1FYN A; 2ESW A; 1JXM A; 5I22 A; 1CSK A; 1WLP B; 4JZ3 A; 2M0Y A; 1KSW A; 1IO6 A; 5ECA A; 1SRM A; 3M0P A; 2F2W A; 1MV3 A; 3ZL7 C; 1CKA A; 4OMQ A; 3UA6 A; 1NG2 A; 2EGA A; 1EFN A; 1T0H A; 1HJD A; 4LE9 A; 3EHQ A; 3CQT A; 3REA B; 2AZS A; 2VVK A; 3RNJ A; 1GBR A; 1WIE A; 5L23 A; 4EIK A; 2KRM A; 2CT3 A; 1AWW A; 1BK2 A; 1JXO A; 2DLP A; 4CC7 A; 2GTJ A; 1M3B A; 1YP5 A; 2SRC A; 1ABQ A; 2J05 A; 2JXB A; 3VRY A; 1LCK A; 1QWE A; 1B07 A; 1QWF A; 4LUE A; 2VKN A; 2KXC A; 2EQI A; 2DL3 A; 1NLP C; 1KIK A; 1T0J A; 4QT7 A; 1G83 A; 1U06 A; 2RN8 A; 1PHT A; 2NUZ A; 1SEM A; 1OPK A; 3A98 A; 4F17 A; 2YUO A; 2GNC A; 3R6N A; 4LN2 A; 1OPL A; 1GFC A; 5IHK A; 1B3Q A; 1Z9Z A; 1GRI A; 2LCS A; 2RMO A; 2DM1 A; 4OMP A; 2LJ0 A; 4JJD A; 2DL5 A; 2CRE A; 2JT4 A; 4FSS A; 4AG1 C; 1OOT A; 1JU5 C; 2VWF A; 3VS4 A; 2CUD A; 4IIO A; 1NLO C; 1ZUK A; 3I9Q A; 4D8K A; 2CH4 W; 2HCK A; 2YUN A; 4J9B A; 3VS3 A; 1JQQ A; 2HSP A; 2MIO A; 2FPF A; 1AVZ C; 1GBQ A; 2HEQ A; 3NHN A; 2LX7 A; 3M0U A; 2FRY A; 2A37 A; 4JPB W; 1M30 A; 2CH4 A; 1M27 C; 1RI9 A; 1UG1 A; 2PNI A; 3H0F A; 1KJW A; 2CSQ A; 4RUG A; 1WXT A; 4Z88 A; 1ZBJ A; 1ZSG A; 2J6F A; 2EYW A; 2L3S A; 1WDX A; 1GCQ A; 4J9E A; 4Z8A A; 4J9G A; 1ARK A; 4F14 A; 1Y0M A; 4CC2 A; 2RNA A; 2DYB A; 1OEB A; 2XMF A; 4F16 A; 1K76 A; 2D1X A; 3EG2 A; 3QWY A; 3TSZ A; 2EGE A; 2RQR A; 2NWM A; 2JM9 A; 2X3X D; 4RTU A; 3I35 A; 3U23 A; 2DF6 A; 3VS7 A; 2OAW A; 1E6G A; 2GGR A; 3NMZ C; 3H0I A; 2DX1 A; 2FG0 A; 1AWO A; 3EHR A; 3RBB B; 4J9F A; 3VS5 A; 1UFF A; 2W0Z A; 1ZX6 A; 3I5R A; 4RTT A; 1UUE A; 4K11 A; 3TSW A; 2HBW A; 1K9A A; 2BZX A; 2DMO A; 2HDA A; 1GCQ C; 2QDL A; 2W10 A; 2YT6 A; 4J9D A; 2J6O A; 2DBM A; 1ZUU A; 2A08 A; 2C0I A; 2C0T A; 1UE9 A; 1WA7 A; 2D0N A; 2YDL A; 4WCI A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KQ1 A; 2DBK A; 2IVW A; 2A7Y A; 3GNF B; 4DBF A; 1BKB A; 3VYH B; 1R0B G; 1T3L A; 3J80 E; 1YIT Q; 3HSB A; 2RI2 A; 1BI3 A; 3PNW C; 3P8D A; 1YJW Q; 2F5T X; 5CQX A; 3SDZ A; 1H8K A; 1NM7 A; 1Z9Q A; 3VUZ A; 4M75 D; 3OS1 A; 2EJF A; 4GLK A; 3JCM J; 5GAN 7; 4JJB A; 4ELY C; 3VKI A; 5GAN j; 1U8R A; 2K6D A; 2Y4X A; 4ATO A; 5GAN e; 5FU7 C; 1SSH A; 3M5A A; 3PGG A; 2YRD A; 2R5M A; 4NL2 A; 4ORZ A; 4PJO F; 3QJY A; 1WGS A; 3OYI A; 2DRM A; 3GBQ A; 1YJW A; 2M1H A; 1UHC A; 4B9W A; 1KC8 C; 4XTV A; 5GMK j; 4BE2 A; 3RER A; 1YIJ Q; 1QQJ A; 5GJV B; 3I5S A; 2JS2 A; 3M55 A; 1YWP A; 2RQV A; 1YHQ A; 1SHG A; 2D6F A; 3VS6 A; 2MI6 A; 1W1F A; 1GL5 A; 2KE9 A; 1WX6 A; 5GAM h; 3EG9 A; 2JNG A; 5GAM g; 2FZK B; 1OYX A; 3O8V A; 2DL4 A; 1RL2 A; 4M75 G; 3JCM W; 2E70 A; 2QQS A; 2KXD A; 3H0H A; 1YIJ A; 3CBP A; 2FPD A; 3V7R A; 3X25 B; 3OB9 A; 2ABL A; 5LJ3 h; 3EAE A; 3OA6 A; 5IXB A; 1NYF A; 3CC2 Q; 2LX9 A; 4OMN A; 1QCO A; 4V2S A; 4C8Q A; 2RF0 A; 2RQT A; 1VQ4 T; 2CZ6 B; 3ME9 A; 1M3C A; 1VQ5 T; 1V29 B; 1AEY A; 2FYK A; 2EYZ A; 5D6X A; 3L2Q A; 4IUP A; 5CVI A; 3QUI A; 1VQ8 T; 1G5V A; 2K2M A; 3G7Z A; 2O9S A; 2OTJ A; 4A63 B; 4J83 A; 1N8R C; 5FU6 B; 2HZY A; 2F69 A; 2L2P A; 2G6F X; 2CP2 A; 2OI3 A; 2EWN A; 2JM8 A; 1UGV A; 1M2V A; 2XIC A; 2EYQ A; 1VQ6 T; 4E6R A; 5LL6 S; 3A5Z B; 4GBQ A; 3RKX A; 4LNP A; 3HRT A; 2RHX A; 1RAC B; 2JW4 A; 1AD5 A; 1PCX A; 1MMA A; 2CZ0 B; 1WI7 A; 2L0A A; 2RA2 A; 4HKE A; 4D8D A; 5IN1 A; 5KE2 A; 4M78 C; 2BUD A; 4KH1 B; 2F2X A; 1QVF S; 2MMP A; 1X6B A; 4AG2 C; 1VYT A; 4KRT A; 4LUD A; 3CC4 A; 3L2V A; 5GAM f; 2JJ9 A; 3L2U A; 3EG0 A; 1YNZ A; 3X26 B; 4ELZ C; 1VYV A; 2B86 A; 4X34 A; 1P92 A; 3GOX A; 3HRU A; 2LCC A; 1I81 A; 2DEQ A; 1V76 A; 4FCY A; 1FX7 A; 2LTO A; 3I56 T; 2GFA A; 3S3N A; 1EIF A; 4LD6 A; 1WZO A; 2CP3 A; 1Q81 U; 2XHC A; 2O31 A; 4O6J A; 3QO3 A; 2KVQ G; 1H64 1; 3HKS A; 2RI3 A; 4JZ4 A; 1U5S A; 3OYF A; 5KYU A; 3P8B B; 2KR3 A; 2JTE A; 3LH0 A; 4ZTJ A; 3CCE Q; 4R56 A; 3JV3 A; 4EPC A; 1YCY A; 4DOV A; 3E1S A; 4J7I A; 3L2W A; 1NE8 A; 3CD6 A; 3ASK A; 2A36 A; 4MZP A; 1WPY A; 4J6W A; 5IT9 E; 2R5A A; 1VQN T; 2K4Y A; 2DER A; 3TQ7 P; 4C92 B; 2FHD A; 4C5G A; 4ZGD B; 1X69 A; 1KQS P; 1VQL Q; 1EX4 A; 4F7U G; 5IHI A; 1I0C A; 4CC4 B; 4ESR A; 2RHZ A; 2DPP B; 2ED1 A; 4QW2 A; 3I55 T; 2PZ1 A; 1N8R R; 4JDS A; 2KRS A; 5IH2 A; 3VU3 C; 2K79 A; 2DD5 A; 2ZGW A; 1RUW A; 3CCM Q; 4RMO A; 1M90 U; 2KMT A; 3FJP A; 2I2L A; 1B34 B; 2RHU A; 3UDC A; 1WLP B; 1IO6 A; 5KYY B; 3M0P A; 3A8O B; 5KYX A; 2COZ A; 4OMQ A; 3CCJ Q; 2NUT B; 1TXQ A; 5FLX E; 3BDU A; 2X4X A; 2QQB A; 1EFN A; 2DVE A; 1T0H A; 1HJD A; 2HNI A; 4CI0 C; 1HK9 A; 5L23 A; 2RJC A; 4EIK A; 3MJX A; 5A2Q E; 1BK2 A; 1JXO A; 4B9X A; 2DD4 A; 4ZN1 A; 4PLI A; 1W2B P; 1YJN T; 3R6O A; 1ABQ A; 2DK3 A; 3RMS A; 2FZG B; 4X9D A; 4M75 C; 3VRY A; 1S72 Q; 1MMD A; 4Y91 A; 1Q86 U; 1I4K 1; 2YWW A; 8AT1 B; 2DL3 A; 1BIB A; 2BE7 D; 1QMC A; 3CCJ A; 1RAA B; 1WHG A; 1N9R A; 5GAN g; 2OTL Q; 3M56 A; 1SEM A; 4WF2 A; 2YUO A; 3OYN A; 2P84 A; 2CKK A; 4LDW A; 4LN2 A; 3CXC A; 1B3Q A; 1Z9Z A; 4OMP A; 4JJD A; 4AG1 C; 4QVZ A; 3G4S T; 3BFM A; 4L5G A; 2E3H A; 2FVU A; 2HCK A; 2YUN A; 3V7S A; 2HSP A; 3OYL A; 4KBM B; 1GBQ A; 3HFO A; 2HBP A; 3M0U A; 2D9T A; 5KCH A; 1WNL A; 4JPB W; 2QTV A; 2OTL A; 2P4T A; 1UG1 A; 2JVV A; 3H0F A; 1KJW A; 1MNE A; 4RUG A; 1WXT A; 1X6O A; 2XG8 D; 4Z88 A; 2YHT A; 4L6V 5; 1ZSG A; 3QZ5 B; 1K73 R; 2EYW A; 2ZPB B; 2D0Q B; 2MK5 A; 3CCR T; 3JB9 F; 1GCQ A; 3FRN A; 4BI4 A; 2LNV A; 5CAI A; 3G71 A; 4J9G A; 1ARK A; 2V8J A; 3JCM P; 5HY6 A; 4FM4 B; 1PD1 A; 2JZ2 A; 4C8Q G; 3QWY A; 4IUQ A; 5J26 A; 1D0X A; 2JM9 A; 4BY6 C; 2X3X D; 2VAS A; 3U23 A; 1R8O B; 3PMI A; 1N6A A; 2OAW A; 5KYN A; 3NMZ C; 3UPU A; 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3EGD B; 3INZ A; 2FL7 A; 4JRP A; 2XDP A; 1W2B S; 4OMO A; 1VQ7 T; 3CPW A; 3ULR B; 1GFD A; 2EAY A; 1KQ2 A; 1VQ9 Q; 2K5I A; 3KUF A; 2X4J A; 1YCS B; 4OB0 B; 2VV5 A; 4JJN K; 2QA4 A; 4KGZ B; 2DYI A; 4NS5 A; 4F04 B; 2K7A A; 1J3T A; 1VQP T; 1UGP B; 2O2O A; 2DVJ A; 1TUD A; 1X43 A; 1ZHI A; 1FMK A; 2E10 A; 4OP0 A; 4M4Z A; 2H3J A; 1JEG A; 5M9O A; 1IZ6 A; 2GF7 A; 3OMC A; 2EGC A; 1BB9 A; 1M3A A; 1QVF P; 3EG3 A; 2BE9 B; 2GCX A; 1OUL A; 2HAX A; 3OYA A; 1N5Z A; 3CCS T; 1K9M R; 1RAD B; 3JRZ A; 4F7U A; 4N4I A; 3QDF A; 1VQ9 A; 1BCM A; 1G2B A; 1B34 A; 2BZY A; 3KBG A; 2QAS A; 5I11 A; 4F7U E; 3QYG B; 3SWN B; 3LH5 A; 4PFO A; 1VQN Q; 1MV0 B; 3X20 B; 4PFZ A; 2JOY A; 1RAE B; 1AZE A; 4A4G A; 2HD0 A; 4PNO A; 4QVC A; 5KYY A; 3CCU T; 3A8H B; 1VYU A; 4M7A F; 3EG1 A; 5KYW B; 2WAC A; 4IKF A; 2QQ9 A; 2NUT A; 2QEX Q; 1DJ7 B; 2DL7 A; 4Y92 A; 3VYG A; 2F5K A; 4AFS C; 3GP8 A; 2FRW A; 2XD0 A; 1W4S A; 2MAM A; 2GFU A; 1I5O B; 2E41 A; 1U1T A; 3EFO B; 3PVL A; 2P4R A; 2PVO B; 1M9S A; 1HXD A; 3VS0 A; 3OSV A; 1K4U S; 3FC3 A; 1AWX A; 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