The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QVG P; 3CPW P; 1VQP Q; 3CCV Q; 1VQM Q; 3I56 Q; 1YHQ Q; 1VQ5 Q; 3CME Q; 1Q7Y R; 2QA4 Q; 1YIJ Q; 1YI2 Q; 1K73 R; 1S72 Q; 1K8A R; 3CC7 Q; 3G6E Q; 1VQ7 Q; 1YJ9 Q; 3CXC P; 1KC8 R; 2OTL Q; 1W2B P; 1YJN Q; 1JJ2 P; 1VQN Q; 2QEX Q; 3G71 Q; 3CMA Q; 3CCE Q; 1QVF P; 1VQ6 Q; 1VQO Q; 1Q82 R; 3CCM Q; 1N8R R; 3CCR Q; 1YIT Q; 1VQL Q; 3CC2 Q; 1M90 R; 1KQS P; 3CCS Q; 1K9M R; 3CD6 Q; 1KD1 R; 1VQK Q; 1NJI R; 1VQ4 Q; 1Q86 R; 3CC4 Q; 2OTJ Q; 1YJW Q; 3CCU Q; 3CCQ Q; 1VQ8 Q; 3I55 Q; 3CCL Q; 3OW2 P; 1VQ9 Q; 1M1K R; 3CCJ Q; 1Q81 R; 3G4S Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 1H8K A; 1ZQ1 A; 4EMK A; 3CPW A; 2MI6 A; 4KH0 B; 2Y4Y A; 3RKX A; 1K9M U; 4PJJ A; 2X4Y A; 1JJ2 P; 4M75 G; 5LJ5 j; 3EH1 A; 2CS7 A; 2LQ8 A; 4A4H A; 2L2P A; 1OZ3 A; 4KGZ B; 5GJV B; 2CSI A; 3M58 A; 4VUB A; 1GFD A; 4HCB A; 1AHJ B; 4FYV B; 3MP6 A; 2QQA A; 2X51 A; 3WVE B; 3REB B; 1C1A A; 3BE3 A; 1V1C A; 1Y57 A; 2E65 A; 2COW A; 4DOV A; 1SRM A; 2L89 A; 4PJO F; 3MCA B; 2C0O A; 1VQL Q; 3LH5 A; 1UJ0 A; 5LJ5 d; 1WYX A; 1X69 A; 4D8D A; 4M7D C; 4JDS A; 2QG9 B; 4JJC A; 4M7A C; 3FDR A; 3V7R A; 4E7Z A; 1NJI U; 1RAE B; 2HSE B; 1YJN T; 4J6X A; 1JU5 C; 5IN1 A; 1M90 C; 3CME A; 2HL5 C; 1PWT A; 2A37 A; 1R8O B; 4X9D A; 2FZK B; 5A0G A; 3UA6 A; 1VYT A; 5DM7 R; 2JW4 A; 3OSV A; 3GNF B; 1RLP C; 1ZSZ C; 5GAN g; 1N6A A; 4M78 F; 4RUG A; 2FPE A; 3Q1J A; 2X4J A; 5CQX A; 1WQW A; 1A0N B; 4K11 A; 1BIA A; 2VKN A; 3NTI A; 2A36 A; 4AFZ C; 1EZZ B; 2K57 A; 1SEM A; 6AT1 B; 4M77 A; 1R0B G; 3MEV A; 2DM1 A; 1U1S A; 4X1V A; 3RER A; 1X27 A; 2ZPI B; 3VRZ A; 1T0H A; 1U3O A; 2DNU A; 2FB7 A; 4RMO A; 2EGC A; 1T0J A; 2KEA A; 2EW3 A; 2O4X A; 3VKI A; 4ZTJ A; 4J7I A; 5LJ3 f; 4M75 A; 5HCK A; 2CZ6 B; 1YJW A; 2MYS A; 3IQL A; 2EJF A; 3QWX X; 4RCB A; 3VV0 A; 1VQ6 T; 3GIB A; 2QA4 A; 4Y28 E; 3CC4 Q; 3QDF A; 2JMA A; 1SF9 A; 1DJ7 B; 3CCL T; 4C8Q G; 1IB8 A; 2QQB A; 5FU7 B; 2JMC A; 4N0A A; 3RR6 A; 3CC7 Q; 3CCV T; 5CK9 A; 1O9S A; 2DD5 A; 2BZX A; 3OYJ A; 1BI1 A; 1JO8 A; 3T9N A; 5GMK e; 2AIR B; 4HXJ A; 1UJY A; 2PTK A; 1K9M R; 2EPD A; 1Q95 G; 4DBF A; 1PD0 A; 3DLM A; 4KUI A; 2QI2 A; 1Y71 A; 2CUB A; 4LDW A; 4QQ6 A; 2V1R A; 3VUZ A; 5FLX E; 1VQ7 Q; 5GAO q; 2VAS A; 3RMS A; 4XTX A; 5HK0 A; 1HSQ A; 1KSW A; 1QP3 A; 2FZC B; 1MV3 A; 3NGP A; 1S1N A; 4PLI A; 2EQK A; 2L3Q A; 3JCM f; 3V7C A; 1O75 A; 4HCK A; 4M77 E; 2VC8 A; 5KYN A; 1NBE B; 1VQO A; 1RAA B; 1AEY A; 2VV5 A; 1YIT A; 3A8G B; 4JJD A; 3MHX A; 4QVZ A; 1ACM B; 1UFF A; 2VGM A; 2HNI A; 1GCQ C; 2KRN A; 4BUG A; 3CMA Q; 1U06 A; 4BI4 A; 1N8R R; 2LP5 A; 1ZUY A; 4JPB W; 1NJI R; 1K0X A; 1LNX A; 2F5T X; 5CKF A; 2LX7 A; 2E1H A; 3OYY A; 4M75 E; 5GAN 4; 4M7D D; 2PZ1 A; 3HL8 A; 2RQU A; 1VQ5 Q; 1YFN A; 3VUB A; 4WCI A; 4M7A D; 3GF5 A; 2KAF A; 1ZLM A; 2MOX A; 1ZBX A; 1BB9 A; 4AT1 B; 5GAN h; 4IIM A; 1QP2 A; 1Q82 C; 1RI9 A; 5FRM A; 3OYF A; 3G71 T; 2LNH B; 2EIF A; 4AFU C; 5GAM g; 5KH6 A; 5CVI A; 1BKB A; 1YJ9 A; 1RL2 A; 4GLM A; 4E6R A; 5GAM e; 3CC2 A; 3GNG A; 2DJQ A; 5IXF A; 4CC7 A; 1OX8 A; 3FLG A; 1GBR A; 5FU7 C; 1GCP A; 3OYC A; 4ZGJ B; 3S6W A; 2DFU A; 4C8Q A; 4F7U F; 3VU3 C; 2K3X A; 5L23 A; 1MMD A; 3LWH A; 2DJZ A; 3BDU A; 2COZ A; 2DEU A; 4LDU A; 5KYW B; 4OP0 A; 2M02 A; 4FU6 A; 1S72 Q; 1QWF A; 4QKU A; 2B86 A; 2D1X A; 2EYQ A; 1HJD A; 3NTK A; 3CD6 Q; 3SFM A; 1SPK A; 2CGH A; 3JCM W; 3GBQ A; 3CCS T; 2LQW A; 4ZGE B; 1VQN A; 1ABO A; 2L5Q A; 4JUV A; 2O4X B; 4E7K A; 5IAY A; 1ZBJ A; 1AWJ A; 3CCU A; 1XQH A; 1M9S A; 4GY5 A; 3GOX A; 1MNE A; 4MZT A; 1QVF P; 2F1L A; 2RHI A; 1SG5 A; 3U23 A; 3NTH A; 2NWM A; 1WDX A; 1YCY A; 5EC7 A; 1VQK T; 1VQ4 T; 1BI3 A; 2F2V A; 1OU8 A; 3X24 B; 2OX7 A; 3RDV A; 2A0F B; 1FXX A; 1K8A R; 3OA6 A; 2QYZ A; 4CC3 A; 2ZAE A; 2EGE A; 1VQ9 A; 1H92 A; 2RMO A; 1PC0 A; 2C06 A; 2YUN A; 4J9D A; 1D1C A; 3EGU A; 7AT1 B; 4UC4 A; 2QEX A; 2QDY B; 5IHN A; 4F7U G; 1Q7Y R; 3X26 B; 2OTJ A; 1G3T A; 3OYG A; 2GF7 A; 2ZPE B; 1YJN Q; 1Y96 A; 4YTL A; 3EH2 A; 4BAC A; 2HAX A; 1PNJ A; 3QG1 A; 3CCE T; 3PMT A; 1I4K 1; 4OGE A; 3DLL A; 2HCK A; 4HVU A; 3SWN B; 2AHJ B; 4DA4 A; 2CP5 A; 4OF1 A; 1PHT A; 3HPW A; 2DL7 A; 1VQL A; 2CH4 A; 3E19 A; 5CKH A; 2CT3 A; 3M0P A; 1VYU A; 3CC7 T; 2AKK A; 2H3J A; 4M78 E; 3OYI A; 4L6V 5; 2ZGW A; 1UHF A; 1JJ2 A; 1ZUK A; 4PJL A; 3MJX A; 2RI3 A; 1JXM A; 2EFI A; 2HEQ A; 2EAY A; 3A98 A; 4C92 C; 1TU0 B; 2XD0 A; 3JB9 D; 4N4I A; 4KH1 B; 5GAN d; 3L2U A; 4FCY A; 4A4G A; 3ME9 A; 3BFM A; 3I5S A; 1CKB A; 4DBR A; 4BE1 A; 4FSS A; 4QW2 A; 4A53 A; 1YHQ A; 4RCC A; 1D1A A; 2IIM A; 4PJO B; 1KQ2 A; 2BUD A; 1M2O A; 2DZC A; 4M77 F; 1KC8 U; 3DB4 A; 1VYV A; 2EYX A; 2RI5 A; 2XDD A; 1OUL A; 2LNV A; 4LDV A; 1SSF A; 2CZ0 B; 5KE3 A; 2LJ0 A; 4ZN3 A; 5CO7 A; 1VQ6 Q; 4MZP A; 1Z9Q A; 1GFC A; 3OS2 A; 5C0M A; 4JRP A; 1LPL A; 1ZHI A; 3HSB A; 1RAI B; 2LC4 A; 3CCL Q; 5LJ5 f; 4HVV A; 3TSZ A; 4PFP A; 4M75 F; 1OQK A; 1GBQ A; 4Y91 A; 3CCV Q; 1BCO A; 2ESW A; 1ARK A; 2OTL T; 2JTE A; 1IZ6 A; 1KQ1 A; 4HKE A; 3DKM A; 1LJO A; 1WQ7 A; 2J6K A; 2X3W D; 2E5Q A; 2RK2 A; 4M78 B; 2M9U A; 1W6X A; 2VWF A; 2QK0 A; 4KUL A; 2C0T A; 4F7U A; 1K73 U; 1I81 A; 1IO6 A; 1GCQ A; 2CP3 A; 1Z9Z A; 3L2V A; 5LJ3 g; 3V8L A; 3EGD B; 2K6D A; 3SWN C; 4IUR A; 1KIK A; 1CSK A; 3CC4 A; 2RH2 A; 1QMC A; 2F5K A; 3JCM P; 5LJ3 e; 2QGF B; 1JJ2 S; 2WSE E; 5C6S A; 3EHQ A; 2D8H A; 1Q86 R; 2FRY A; 2YUO A; 4MDW A; 1MGQ A; 4R55 A; 5GAO p; 1VQ8 T; 3QYH B; 2QXF A; 1PKS A; 1D3B A; 4RTX A; 4A54 A; 1TSF A; 1KJW A; 2A7Y A; 2DIQ A; 1WFW A; 3LGL A; 4OB0 B; 2PQW A; 3REA B; 1NE8 A; 2LCC A; 3JRZ A; 3E9F A; 4JRI A; 1W1F A; 2V26 A; 2GQI A; 2ROT A; 5I11 A; 3M0T A; 3SEM A; 4RTT A; 1KHC A; 3OSS C; 4JLI A; 5IHI A; 2YSQ A; 2EJ9 A; 1B34 B; 3OMG A; 1VQ7 A; 3P8H A; 4OMP A; 2ZPH B; 4OVA A; 3KXT A; 2ED1 A; 3JCM Q; 2O01 E; 2RQR A; 3M53 A; 4QQD A; 3OYH A; 3INZ A; 4PJO C; 1UGP B; 4EMG A; 2EQJ A; 1TUD A; 1PRL C; 4E7J A; 3G7Z A; 1X43 A; 3G71 Q; 1M3C A; 4XTU A; 3EHR A; 2HBW A; 4C92 G; 1KQS A; 4LUD A; 3LLR A; 5KYX B; 3GP8 A; 3JCM g; 2E3I A; 5GAN 2; 1BU1 A; 2ZPB B; 3H9N A; 2DX1 A; 2LTO A; 4J9B A; 4OMM A; 4HVW A; 3JCM e; 4Y92 A; 3MP8 A; 5HK3 A; 4JZ3 A; 4KUD K; 2JZ2 A; 2E6N A; 2MF2 A; 2PVO B; 4J7F A; 1HK9 A; 1N8R C; 5FU6 B; 1VQP A; 1VQ5 A; 4F7U E; 1NJI C; 1LCK A; 1TUC A; 1YI2 A; 4LNP A; 5FWC A; 1G3Y A; 3I5R A; 3MKD A; 4C92 D; 2DMO A; 2R58 A; 1IXD A; 1W4S A; 2KXC A; 4M78 C; 4PNO A; 2QTV A; 3THK A; 2M16 A; 4ME7 A; 1TTH B; 1D09 B; 1WIE A; 2KMT A; 3UWN A; 1KC8 R; 1W2B S; 4C8Q F; 3HKS A; 3PMI A; 3M0S A; 2CDT A; 2DVJ A; 3SB2 A; 2K7A A; 3CCS Q; 3CBP A; 1KD1 R; 1NYG A; 3M4G A; 3V7S A; 2BE7 D; 3HTR A; 2QAZ A; 3SHW A; 2R57 A; 2RHU A; 2DXC A; 3KUF A; 2JNG A; 2K79 A; 2J06 A; 2QTX A; 3NFC A; 4A4F A; 2FRW A; 3OYD A; 2YRD A; 3I35 A; 3TRE A; 1ZA2 B; 1GXI E; 1QKX A; 2O9V A; 5GJW B; 1R77 A; 2NUT B; 4D8K A; 4XTV A; 1RAG B; 1S72 A; 1VQK Q; 1VQ4 Q; 1M2V A; 3S3N A; 2D6F A; 2NUP A; 3ZFJ A; 3CCQ T; 1AT1 B; 2DD4 A; 3C0C A; 4ZN1 A; 3FC3 A; 4A63 B; 3JCM b; 3CPW S; 3CD6 A; 2ABL A; 1WX6 A; 1K73 R; 5LJ3 h; 1M90 U; 1M5Q 1; 4F16 A; 2JS2 A; 1OI1 A; 2JN0 A; 1OV3 A; 3HRS A; 1TS9 A; 2DRM A; 4M7A F; 2KE9 A; 2YLC A; 4PFZ A; 4IKF A; 2A28 A; 4JRQ A; 2EQI A; 2DTH A; 3I55 T; 5A0D A; 2E6Z A; 2GFU A; 5HKC A; 3S3O A; 2JJ9 A; 3ZBD A; 4XK8 E; 3EGX B; 5I2S A; 3CQT A; 3CCE Q; 2FG0 A; 3M54 A; 3J81 E; 2RHZ A; 3EG2 A; 2JVV A; 3WVD B; 2OAW A; 5FU6 C; 1WHM A; 2DL5 A; 4L5G A; 1K8A C; 1UG1 A; 1JBM A; 1D3B B; 4J6W A; 2X4X A; 4D6W A; 2KDS A; 4OMF B; 2RD1 A; 3VJP A; 4BDZ A; 2XIC A; 3CXC P; 1AZG B; 5AYF A; 3PNW C; 2DXB A; 1QVF A; 3V8J A; 2FVU A; 1KQS P; 4IUV A; 2HMA A; 2EGA A; 3EG9 B; 1YJN A; 1WHL A; 1YP5 A; 4J9I A; 3FRN A; 1KK7 A; 3JCM h; 1Q7Y C; 4EDU A; 4PJO D; 3OB9 A; 4EMK B; 2RJF A; 3RKW A; 2L3S A; 2YUQ A; 3M9Q A; 2CUD A; 1XNI A; 2E4H A; 5GAN 5; 2QQR A; 1PSE A; 2K5I A; 3VS2 A; 2DXT A; 2XU8 A; 4J9F A; 2KR3 A; 2EQM A; 4R0K A; 2P4R A; 4M7D G; 4O6J A; 2L8D A; 1WHH A; 1PSF A; 4M7A G; 1MMN A; 1YIJ Q; 3QYG B; 1VIE A; 3G6E Q; 2FEI A; 4RTZ A; 3JSC A; 4XAX B; 3S3M A; 1YNZ A; 2DKG A; 3MET A; 9ATC B; 1MV0 B; 3FIF A; 2PVG B; 1TUG B; 2BE9 B; 3OYL A; 2LQK A; 4M78 D; 1NLO C; 4R56 A; 2M0Y A; 4KT0 E; 2OTL Q; 3H0I A; 3EAE A; 1AVZ C; 3OYN A; 1UGS B; 1D0X A; 2WSC E; 3EG0 A; 4JJB A; 1UE9 A; 2E12 A; 5DY9 A; 5GAN 6; 1RAB B; 2O2O A; 2DET A; 4LE9 A; 3QJ6 A; 1UGR B; 3QZ9 B; 3CCR T; 1SRL A; 4KGV B; 2NYS A; 5D6X A; 3H6Z A; 5CIU A; 1VQ6 A; 1B07 A; 2EYY A; 1X75 C; 3M57 A; 2KBT A; 4X9C A; 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1WLP B; 3R6O A; 2CH4 W; 3C94 A; 4OML A; 4C8Q E; 3CBM A; 3HFN A; 2BZY A; 2KT1 A; 1UGQ B; 3KBG A; 5GAN j; 1I0C A; 3MEU A; 1QWE A; 2X3X D; 3HRT A; 5GAN 8; 3TCJ A; 3JB9 G; 3M4Y A; 2K3Y A; 1J3T A; 3D7S B; 3JB9 H; 1FMK A; 2XI9 A; 2FZG B; 2K4Y A; 3PTA A; 3PIP A; 4RG8 A; 4C0F A; 2GGR A; 3P8B B; 3JCM X; 4HT8 A; 4FM4 B; 4M77 C; 3CCQ Q; 1MMA A; 1G8X A; 2I0N A; 1WHG A; 1ZA1 B; 4XU3 A; 5GAM h; 3TU4 K; 2GTO A; 3VYH B; 3CCS A; 2RPN A; 1VQM T; 1KC8 C; 1LOJ A; 5A2Q E; 4J9G A; 1C6V X; 4M75 C; 4M7A E; 1KD1 C; 5A0L A; 4WTO B; 1NEG A; 4PKC C; 2RI2 A; 3I55 Q; 2DL4 A; 2FO0 A; 5I22 A; 1MMG A; 4OMQ A; 3CCJ T; 5GAO l; 5LJ5 h; 1UGV A; 5GMK i; 1VQK A; 3OYB A; 1VQ4 A; 3I56 T; 1RAD B; 1WZO A; 1YIJ T; 3G6E T; 3E9G A; 3RKY A; 2DLP A; 2X4W A; 4N0A C; 4FT2 A; 4XTY A; 2F69 A; 4C0Z A; 4BD3 A; 4C8Q B; 5GMK m; 1WXT A; 2YRV A; 4Q5W A; 2HD0 A; 5CR2 A; 1T3L A; 2SEM A; 2JOY A; 1WHJ A; 1WJS A; 4C92 F; 3JAM E; 1Y7X A; 2J6O A; 2MCN A; 1ZSG A; 3UDC A; 1YWP A; 3TSW A; 4J8O A; 2RJD A; 3N5B B; 4OMN A; 2CZ1 B; 2DIG A; 4E47 A; 1UTI A; 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