The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
VTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure and peptide binding of the SH3 domain from human Fyn.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
FYN
|
| total genus |
8
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1996-04-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1U3O A; 1UE9 A; 1AOJ A; 2K6D A; 1BK2 A; 2JT4 A; 1CKB A; 1UJY A; 4J9E A; 3VS6 A; 1AD5 A; 1NYF A; 3EG3 A; 2DA9 A; 1W6X A; 5FWC A; 1G83 A; 1NYG A; 2JMC A; 1A0N B; 4E6R A; 2C0O A; 5IHI A; 4D8D A; 4J9G A; 1OEB A; 4OMP A; 1BB9 A; 3VS2 A; 1AWJ A; 3EGU A; 1UHF A; 4JJB A; 4LNP A; 3C0C A; 1U5S A; 1WIE A; 2IIM A; 4AFZ C; 1JO8 A; 3M0Q A; 2J05 A; 1W70 A; 2LX7 A; 2AK5 A; 1ZUK A; 1Y57 A; 3H0H A; 2L3P A; 2KR3 A; 1H92 A; 2ABL A; 2KRM A; 2O88 A; 1K0S A; 1WYX A; 4LUE A; 4M4Z A; 3VS7 A; 2CSI A; 3VS5 A; 1M3B A; 1JXM A; 5IXF A; 4Z8A A; 3REA B; 2JW4 A; 1YP5 A; 2DBM A; 2GQI A; 2FPF A; 2F2X A; 1RLP C; 3NGP A; 3I9Q A; 4RTX A; 1VYU A; 2EKH A; 4R0K A; 4LN2 A; 1X27 A; 1Z9Z A; 2A37 A; 2MOX A; 2EBP A; 1M8M A; 2KGT A; 3IQL A; 4JZ4 A; 4DEY A; 1GBQ A; 3I5S A; 2KBT A; 2RF0 A; 1OOT A; 1I1J A; 2YUP A; 2ED0 A; 2L3Q A; 4GLM A; 1ZLM A; 1X2Q A; 2YT6 A; 4AFS C; 3LH5 A; 2JXB A; 2JS2 A; 2C0I A; 2EGC A; 3VS0 A; 4AFU C; 1PHT A; 2CUB A; 4JPB W; 1ZBJ A; 5I11 A; 2MIO A; 2CT4 A; 2DMO A; 4HXJ A; 3UF4 A; 1SHG A; 1WFW A; 2BZY A; 2FRY A; 2RQT A; 1PWT A; 2CSQ A; 5EC7 A; 2J7I A; 3QWX X; 2DL5 A; 1BU1 A; 5I22 A; 2YDL A; 1N5Z A; 4OMN A; 1UTI A; 2FEI A; 1K1Z A; 2DLP A; 2C0T A; 2A36 A; 2CRE A; 2K2M A; 2HCK A; 2EYW A; 2KRS A; 2EGE A; 2CH4 W; 1TUD A; 3NMZ C; 3REB B; 3PVL A; 1XOV A; 3UA7 A; 3EG0 A; 1QWE A; 1X43 A; 1GRI A; 1UG1 A; 2RNA A; 1GFC A; 4J9H A; 2KXC A; 2GTO A; 2XMF A; 1QKW A; 2KE9 A; 3M0U A; 2PNI A; 1CKA A; 1UUE A; 2X3X D; 1JQQ A; 1AVZ C; 3EG2 A; 2DX1 A; 4KRT A; 4LUD A; 4DEX A; 1LCK A; 2O9V A; 2J6K A; 2LMJ A; 1WXB A; 2KRO A; 2J06 A; 1T0J A; 2P4R A; 2LQN A; 3UA6 A; 4J9B A; 1B07 A; 1GBR A; 2HEQ A; 4OMQ A; 3ZL7 C; 2GGR A; 1YWO A; 2F2W A; 2KYM A; 2AZS A; 3TVT A; 1QWF A; 1CSK A; 2L2P A; 1QCF A; 3EG1 A; 3GBQ A; 4LE9 A; 2CUD A; 2DYB A; 1X6B A; 1B3Q A; 4RUG A; 2DIL A; 1YN8 A; 1VYV A; 2KYB A; 4RTT A; 1UDL A; 2SRC A; 2DRM A; 1UEC A; 2V1Q A; 1PKS A; 1SRM A; 5GJV B; 2VKN A; 1WXT A; 1NEG A; 2YUQ A; 1EFN A; 1OV3 A; 2RPN A; 4D8K A; 1PKT A; 1ZUU A; 1X6G A; 2HSP A; 4HVW A; 1IO6 A; 1S1N A; 1BBZ A; 2CDT A; 2ED1 A; 2RQR A; 2VVK A; 2EW3 A; 1WLP B; 2GTJ A; 3VS3 A; 2YUN A; 3VS4 A; 2PTK A; 2FPE A; 2SEM A; 2EYX A; 2CT3 A; 2DBK A; 1KIK A; 2RQU A; 1ZX6 A; 2JTE A; 3CQT A; 1FYN A; 2VWF A; 4AFQ C; 4JZ3 A; 1T0H A; 1ZUY A; 2K3B A; 2KEA A; 4JJC A; 4ZNX A; 1GFD A; 4Z88 A; 2EGA A; 3NHN A; 2JM8 A; 3VRY A; 2E5K A; 2HBW A; 3RNJ A; 1FMK A; 5L23 A; 1K0X A; 1AZG B; 1M30 A; 3SHW A; 3JV3 A; 2ECZ A; 2DE0 X; 4A63 B; 2EQI A; 4AG1 C; 1WX6 A; 3SEM A; 1WI7 A; 2ESW A; 1PRL C; 1I07 A; 2K79 A; 2LNH B; 4ORZ A; 2K9G A; 4ESR A; 1J3T A; 2DL3 A; 2G6F X; 1ARK A; 2LCS A; 5IHK A; 2OI3 A; 2EYZ A; 3H0F A; 1M3C A; 3RBB B; 2FRW A; 4OML A; 1NLP C; 2KT8 A; 3PVQ A; 1M3A A; 2AZV A; 3M0P A; 2KNB B; 2DL7 A; 1PRM C; 3ULR B; 2LJ0 A; 1JU5 C; 2A08 A; 1H8K A; 2FO0 A; 3I5R A; 4F17 A; 3UAT A; 1G2B A; 2LJ3 A; 2ROL A; 1HJD A; 3M0R A; 1H3H A; 1UGV A; 1MV0 B; 1SSH A; 1QKX A; 1M27 C; 2KT1 A; 4FSS A; 2EPD A; 2ENM A; 4RTU A; 1ABQ A; 2J6F A; 4RTZ A; 2EVR A; 2FPD A; 1X69 A; 1GCQ C; 1SRL A; 1GCQ A; 2H8H A; 2D1X A; 3PE0 A; 1KSW A; 3R6N A; 2JM9 A; 2O2O A; 1OPK A; 1AWO A; 4J9I A; 2DL4 A; 4QT7 A; 3O5Z A; 4JJD A; 2W0Z A; 1U06 A; 1Y0M A; 1GCP A; 1RI9 A; 2GBQ A; 4CC4 B; 2L3S A; 1NLO C; 1TUC A; 5GJW B; 3VS1 A; 4J9F A; 5ECA A; 2O31 A; 2D0N A; 4CC3 A; 2BZ8 A; 2NWM A; 4RTV A; 4HVU A; 2LJ1 A; 2JS0 A; 1T3S A; 1PNJ A; 1MUZ A; 1E7O A; 1E6H A; 1X2K A; 5HCK A; 2BZX A; 2D8H A; 3TSZ A; 1K9A A; 2QDL A; 2YSQ A; 2V1R A; 1QLY A; 1WXU A; 2X3W D; 2DRK A; 2F2V A; 1VYT A; 1JXO A; 2BTT A; 3EHQ A; 4OMO A; 5IHN A; 2KRN A; 1WDX A; 3QWY A; 1AZE A; 2GNC A; 1TG0 A; 2RQV A; 1GL5 A; 2OJ2 A; 4F14 A; 4AG2 C; 1SEM A; 2OAW A; 1HSQ A; 4K11 A; 1OPL A; 2PZ1 A; 1W1F A; 1ABO A; 4EIK A; 4RTY A; 2DF6 A; 2RQW A; 1UHC A; 2DL8 A; 3A98 A; 4RTW A; 1YCS B; 2DNU A; 3H41 A; 4CC2 A; 1SPK A; 4GBQ A; 2A28 A; 2DJQ A; 2DVJ A; 1NEB A; 2EYY A; 1JEG A; 5FWB A; 1K4U S; 2YUO A; 4IIO A; 4CC7 A; 4OMM A; 1AWX A; 1Z9Q A; 1KJW A; 2DM1 A; 1UJ0 A; 2B86 A; 1RLQ C; 1T3L A; 1V1C A; 1K76 A; 1SHF A; 4F16 A; 4Y92 A; 2KXD A; 3THK A; 5IXB A; 2J6O A; 1YNZ A; 3M0T A; 2RN8 A; 4IIM A; 1HD3 A; 2L0A A; 2AKK A; 2ROT A; 3KFV A; 4HVV A; 1UFF A; 2LZ6 B; 4J9C A; 2LQW A; 3U23 A; 2LP5 A; 5IH2 A; 1NM7 A; 2RMO A; 2MCN A; 1I0C A; 2HDA A; 1NG2 A; 3I35 A; 3M0S A; 2FG0 A; 1WA7 A; 1MV3 A; 1YWP A; 2CH4 A; 1KFZ A; 1AWW A; 4HCK A; 3FJ5 A; 4Z89 A; 2K7A A; 4J9D A; 3NPF A; 2W10 A; 3EHR A; 2I0N A; 2D8J A; 1VA7 A; 1RUW A; 2JMA A; 3TSW A; 3VRZ A; 1E6G A; 2M51 A; 1AEY A; 2M0Y A; 4WCI A; 2NUZ A; 1ZSG A; 2AKL A; 4X1V A; 3H0I A; 5FW9 A; 2O9S A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4GLK A; 1AOJ A; 4BY6 C; 2JT4 A; 2E4H A; 3WVD B; 2QAS A; 5KYU B; 2YRD A; 1AD5 A; 3G4S Q; 2QG9 B; 1RI0 A; 5FWC A; 2JMC A; 2JUF A; 1A0N B; 3C12 A; 4RG2 A; 2DIQ A; 3RKX A; 4D8D A; 3WVE B; 3CCR T; 2DD5 A; 5IAY A; 1UB4 A; 3EGU A; 3C0C A; 4N0A C; 1VQN A; 2YLB A; 4JRK A; 4GY5 A; 3P8B B; 2J05 A; 5FRO A; 1Q82 U; 1QCN A; 3EGX B; 2KR3 A; 1WQ7 A; 4V2S A; 3CC7 T; 4L6V 5; 3JCM d; 3DLL A; 5LJ3 h; 3CMA T; 2DEQ A; 1H64 1; 2DBM A; 2GQI A; 3OW2 P; 2FPF A; 1RLP C; 4A4E A; 1ZBX A; 3JB9 H; 3J80 E; 4R0K A; 3PTA A; 4C0G A; 1R0B G; 2ZPG B; 1KHC A; 3CBO A; 1GBQ A; 2DTH A; 1N6A A; 5CCA A; 3C94 A; 2QGG A; 1KQ2 A; 4PK4 A; 1VQN Q; 3VUZ A; 2R5A A; 1JB0 E; 2JXB A; 1I8F A; 4AFU C; 4JPB W; 4EMK B; 5I11 A; 3JCM Q; 5GAO r; 1ZA2 B; 2E5Q A; 4HXJ A; 3VYG A; 3UDC A; 3QHS A; 1WFW A; 2V26 A; 2FRY A; 2QQ9 A; 1KC8 R; 4KT0 E; 1LNX A; 2RQT A; 3BDL A; 1QVP A; 5M9O A; 3HSB A; 5EC7 A; 1KC8 U; 3VJP A; 3NTI A; 4LD6 A; 4C5G A; 1BU1 A; 1S72 T; 4J6W A; 4F7U G; 1HYO A; 4PFZ A; 3M58 A; 2DLP A; 1Q7Y R; 3FB9 A; 5L8R E; 5GMK m; 2QYZ A; 5KE3 A; 3CCQ T; 2K5F A; 1Q7Y U; 4WTO B; 1TUD A; 3NMZ C; 3PVL A; 1XOV A; 3OSV A; 5GAO q; 1D1A A; 2RNA A; 1Q86 C; 2KXC A; 2BE7 D; 2XMF A; 2QAZ A; 3M0U A; 1JQQ A; 1AVZ C; 4A4K A; 4F7U F; 5CVI A; 2X4Y A; 2IPO B; 2RI2 A; 1PD0 A; 3EGX A; 3CCE A; 1LCK A; 2O9V A; 2J6K A; 2WSF E; 3OYI A; 4MDX A; 2J06 A; 3CCU A; 3H9N A; 2HEQ A; 4PJM A; 4OMQ A; 4R55 A; 2DVE A; 3MO8 A; 1YWO A; 2F2W A; 2KYM A; 3TVT A; 3JB9 D; 2X9H A; 3CCL Q; 4OB3 B; 4N4I A; 2XDB A; 3PGG A; 3BY7 A; 4LE9 A; 2CUD A; 2E6Z A; 1QP3 A; 1X6B A; 2LNV A; 2PUK B; 4JLI A; 2LDM A; 4M75 G; 5GAM e; 4FW1 A; 2RHU A; 2DRM A; 3QZ5 B; 3OYJ A; 1YHQ T; 2HKQ B; 4CI0 C; 1IXD A; 1SRM A; 5GJV B; 1M5Q 1; 2CP6 A; 4DBF A; 2DXU A; 2YUQ A; 1M1K R; 3RUX A; 2LC4 A; 4BB7 A; 5LJ5 f; 4ANJ A; 1PKT A; 1ZUU A; 4C92 B; 4HVW A; 3CCE Q; 2RQR A; 2YRV A; 3JRZ A; 3FRN A; 2GTJ A; 1OU9 A; 5GMK j; 5I2S A; 2MWO A; 2ZPB B; 3CCU Q; 2OTL T; 2CT3 A; 1C1A A; 3OS0 A; 1D1C A; 4M75 F; 3I56 T; 4XQ3 A; 2JTE A; 1UGP B; 1FYN A; 2VWF A; 3OY9 A; 3AT1 B; 2EGA A; 4PJO G; 1VQL T; 2JJ9 A; 2VXF A; 3D7S B; 5D6W A; 1YIJ A; 2CYZ B; 1ZSZ C; 1RAE B; 4QVZ A; 1MNE A; 4EMH A; 4VUB A; 2DO3 A; 5GAM h; 2L3R A; 4QVD A; 3CPW A; 4EMG A; 3P8H A; 5GAO m; 4BE2 A; 3BFM A; 4IUQ A; 3LYI A; 1I07 A; 2ZPH B; 4YTL A; 3CXC P; 2DL3 A; 2G6F X; 2E41 A; 1ARK A; 4XK8 E; 2RJE A; 4PJO F; 5GAN d; 4M7A C; 3EFO B; 4OML A; 4D6W A; 1NLP C; 5LJ5 d; 1YI2 A; 1KC8 C; 1WHL A; 2AZV A; 1VQ7 T; 3M0P A; 2KNB B; 2DL7 A; 1PRM C; 2XD0 A; 3QSU A; 2RJD A; 1JU5 C; 1VQK T; 3BE3 A; 2A08 A; 4NL2 A; 1LJO A; 5A2Q E; 2FO0 A; 3I5R A; 5D7U A; 2LJ3 A; 3JCM g; 2KQW A; 3M0R A; 1UGV A; 2K5I A; 1QVF P; 1QKX A; 1TUG B; 3SWN B; 2XI9 A; 2EPD A; 4RTU A; 2MPX C; 3QUI A; 4UC4 A; 1I5O B; 2E3I A; 2ZCF B; 3PE0 A; 4C92 A; 1VQ6 Q; 4JJN K; 4JJD A; 3QPH A; 2KMT A; 1U06 A; 1Y0M A; 2RK2 A; 2GBQ A; 4PLL A; 4B9W A; 1YI2 Q; 1EIF A; 2L3S A; 4F7U B; 2FZC B; 5GJW B; 5ECA A; 4CC3 A; 4IUP A; 2NWM A; 5GAO p; 2RK1 A; 3JCM b; 3CPW S; 5CQX A; 5GAN 8; 2LJ1 A; 3JCM X; 1T3S A; 1MUZ A; 1E6H A; 1G3W A; 5HCK A; 2BZX A; 2D8H A; 3CEY A; 3CBM A; 3OMG A; 1G3T A; 1QLY A; 1WXU A; 3SB2 A; 2F2V A; 3G71 Q; 1JXO A; 4II1 A; 4C8Q C; 1K9M R; 4XAX B; 2HQX A; 4F14 A; 4AG2 C; 4N4H A; 1BCM A; 1AT1 B; 1YIT A; 1M1K C; 1HSQ A; 1JBM A; 1NBE B; 1OPL A; 1VQ8 T; 4XTW A; 4EIK A; 4C0D C; 1QVG S; 1G3S A; 4FYX B; 4CC2 A; 3H41 A; 4GBQ A; 3BW1 A; 3M54 A; 3QG1 A; 5FWB A; 1W2B P; 2ZZD A; 4IIO A; 1TSF A; 4OMM A; 3KBG A; 2E70 A; 3OSS C; 1AWX A; 3CCV A; 4A4G A; 1T3L A; 2X4W A; 4M75 B; 4F16 A; 2KXD A; 3THK A; 2RN8 A; 1RAI B; 1BI2 A; 1R77 A; 2L0A A; 1VQP A; 3CC2 Q; 1D3B B; 2ROT A; 3KFV A; 3INZ A; 3SD4 A; 4DBH A; 4KBM B; 1YIT Q; 2MCN A; 2RJF A; 3I35 A; 4JRI A; 2FG0 A; 4MZP A; 1WA7 A; 4OF1 A; 3CXC A; 2XIC A; 1KFZ A; 1M8V A; 2DIG A; 3RMS A; 5KYW B; 1LOJ A; 4E7I A; 4PFO A; 2LX9 A; 2QTV A; 3EHR A; 2I0N A; 4M77 C; 5FU6 B; 1VA7 A; 1TXQ A; 1OQK A; 5CKE A; 3TSW A; 4F7U A; 1AEY A; 2DTO A; 3M4G A; 5KYN A; 4PJO B; 3GNG A; 5FRN A; 3C95 A; 2XID A; 2O9S A; 4FU6 A; 1U3O A; 1UE9 A; 1U1S A; 3L2W A; 2QQR A; 3G4S T; 1X6O A; 3EG3 A; 2DA9 A; 4F7U E; 1QVF A; 4ATO A; 1W6X A; 2Y90 A; 3JCM c; 1VQP Q; 2FB7 A; 1NYG A; 2M0O A; 1FXX A; 4M75 D; 2C0O A; 3JCM P; 5IHI A; 1WJS A; 4J9G A; 1OEB A; 1RAH B; 2E64 A; 1PG5 B; 3E9F A; 4LNP A; 2PU9 B; 4PLI A; 5GAN e; 4AFZ C; 5LJ5 e; 2XHC A; 1HK9 A; 2HL5 C; 1W70 A; 4RMO A; 3QBY A; 2IVW A; 3H0H A; 2L3P A; 3GIB A; 1RAD B; 3GLX A; 1IRX A; 1H92 A; 2KRM A; 2O88 A; 3NTH A; 5HY6 A; 4LUE A; 4M4Z A; 3VS7 A; 3MPU B; 1MMA A; 1M3B A; 2JZ2 A; 2QTX A; 2NUT B; 1YP5 A; 1VQM A; 4R56 A; 2I2L A; 4PJO D; 5AT1 B; 3L2Q A; 1VYU A; 2EKH A; 4C5I A; 3OYD A; 4M75 A; 4LN2 A; 3CME A; 2MOX A; 1VOM A; 3IQL A; 1M8M A; 3UT1 A; 4PNO A; 2QA4 A; 1RAB B; 1D3B A; 4NL3 A; 1OOT A; 3RKY A; 1K9M C; 1VQN T; 3LWH A; 4J83 A; 4PJN A; 2L3Q A; 3O8V A; 2FVU A; 4M75 E; 1SG5 A; 5GAN h; 4AFS C; 3I55 A; 3URG A; 4X34 A; 1JRI A; 3VS0 A; 5KYW A; 1PHT A; 2VGM A; 1SKU B; 4DOW A; 1VQ9 A; 2MIO A; 1QP2 A; 1SHG A; 1V29 B; 2BZY A; 3E1S A; 1TS9 A; 5CK9 A; 4PJO A; 3QWX X; 1VQM Q; 1Q86 R; 1N5Z A; 1UTI A; 3V7S A; 1Q86 U; 1WHJ A; 3CME Q; 1PCX A; 2LQK A; 4X9C A; 3UWN A; 4ZGD B; 2A36 A; 4QVC A; 4L59 A; 5KYX B; 2QA4 Q; 4BDZ A; 4PJO E; 2O4X B; 2EGE A; 2V8K A; 2X51 A; 3X26 B; 3HHT B; 2MAM A; 3QZ9 B; 1X43 A; 4LDY A; 3CD6 A; 2RHZ A; 1GRI A; 2VXE A; 1GFC A; 1UGQ B; 3I55 Q; 1D0Y A; 1QMC A; 2DXT A; 2K3X A; 3HP9 A; 1WZO A; 3EFR A; 2MI6 A; 3EG2 A; 4Y91 A; 1VQ9 Q; 2YHT A; 2HSE B; 1WXB A; 2KRO A; 1QCO A; 2P4R A; 2LQN A; 3CCL T; 2QQS A; 1D0X A; 1W4S A; 1GBR A; 2MMP A; 4A54 A; 1OYX A; 2HAX A; 2NUT A; 4C92 F; 4FW2 A; 1BI0 A; 2L2P A; 2DD4 A; 4AMC A; 2DYB A; 2G3R A; 1H3Z A; 2DIL A; 1VYV A; 4AT1 B; 2HKN A; 5FRM A; 4RTT A; 2F1L A; 5LJ3 g; 3CD6 Q; 1UEC A; 1N9S A; 2OX7 A; 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