The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
61
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structure length |
61
|
Chain Sequence |
GLMVEVVESPNHSEVGIKGEVVDETQNTLKIMTEKGLKVVAKRGRTFRVWYKGKIMRIKGD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR Structure of an Archaeal Homologue of Ribonuclease P Protein Rpp29
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical protein AF1917
|
| molecule tags |
Rna binding protein
|
| source organism |
Archaeoglobus fulgidus
|
| total genus |
6
|
| structure length |
61
|
| sequence length |
61
|
| ec nomenclature |
ec
3.1.26.5: Ribonuclease P. |
| pdb deposition date | 2003-05-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribonuclease P/MRP, subunit p29 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1TSF A; 2KI7 A; 1TS9 A; 1OQK A; 1V76 A; 2ZAE A; 1PC0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2LP5 A; 2JT4 A; 2RHI A; 4JJD A; 5GAN e; 3TSZ A; 1AWW A; 4ESR A; 3S3N A; 1KQ2 A; 2KRN A; 3EG9 A; 3JCM d; 5CO7 A; 5LJ5 d; 1NYG A; 3VYH B; 3L2U A; 2DPP B; 5FRO A; 1PRM C; 5I11 A; 1JJ2 P; 4RG8 A; 2O88 A; 3A8O B; 3LGF A; 3QII A; 2XDP A; 3M0P A; 2KXC A; 1WPY A; 1VQ7 A; 3OMC A; 5FW9 A; 3EH2 A; 4FU6 A; 2KGT A; 1Q81 C; 1M3A A; 5I2M A; 4RTX A; 2E3I A; 1UGV A; 4OB3 B; 5DY9 A; 4M78 C; 3CCE T; 4ZTJ A; 1K73 R; 2E6Z A; 3VYG A; 1EFN A; 3A8G B; 1VYV A; 4J6W A; 2M0O A; 3QXE B; 3M0S A; 3HTR A; 3CCR T; 5GMK j; 5IHI A; 4M78 F; 3BDU A; 1GCQ C; 2XHC A; 3G7Z A; 4DBF A; 2J06 A; 2RQT A; 1B34 A; 4C0D B; 1NJI U; 1UEC A; 3MO8 A; 4RTY A; 2KNB B; 1VQM Q; 4HVW A; 1UTI A; 2ZZD A; 3MP1 A; 4LDU A; 4LDY A; 1FMV A; 2RJF A; 2HNI A; 1RI0 A; 3JV3 A; 1V76 A; 1D09 B; 1KQ1 A; 3PNW C; 1QLY A; 4J9D A; 1MMD A; 4M7A B; 2KBT A; 2EKH A; 4OF1 A; 3CME Q; 3A8M B; 2E4H A; 2EYQ A; 2EBP A; 4KGZ B; 5D6W A; 2GFA A; 1WFW A; 2LT4 A; 1YJ9 Q; 1M9S A; 2VB6 A; 4XK8 E; 1N27 A; 1VQO Q; 3I9Q A; 1ZSZ A; 5IHK A; 3CD6 T; 3DLL A; 2M1H A; 2A28 A; 2P4R A; 5GAN 8; 4XTW A; 4AFZ C; 4QKU A; 5GAM d; 4MZM A; 2X9H A; 3CCJ Q; 3QPH A; 1VQM A; 2RJD A; 1HXD A; 1AHJ B; 4PFP A; 4OMM A; 2ZPG B; 1M2V A; 1UHF A; 1OPK A; 2CKK A; 2KSS A; 1QCO A; 3SEM A; 2K5L A; 4PFO A; 5KYU B; 1NJI C; 2QQ9 A; 4FW1 A; 2EYX A; 2L3R A; 1WHJ A; 1JXM A; 3OYE A; 2VYT A; 3OYA A; 3CCL T; 3CME A; 2GF7 A; 4OB0 B; 1W70 A; 3M55 A; 2JTE A; 1SEM A; 1Q86 R; 1YJ9 A; 4OB2 B; 3HFO A; 1HJD A; 1OQK A; 1CSK A; 1BI2 A; 1Y0M A; 1SRM A; 1VQO A; 3RER A; 2R5A A; 1KJW A; 5GMK m; 2VXF A; 1Z9Z A; 3EG0 A; 2F5T X; 2YRV A; 1VQN T; 1M3B A; 2HDA A; 3CCJ A; 2FRY A; 2RK2 A; 5C6S A; 3L2V A; 3MJX A; 2Y4X A; 4XTX A; 4C92 E; 1GRI A; 4JZ4 A; 4XTU A; 3WVD B; 4LXC A; 4BDY A; 2CZ6 B; 4ORZ A; 4C8Q C; 2XIC A; 2R57 A; 3CCV T; 2AKK A; 1WHM A; 4B9X A; 2KK4 A; 2AIR B; 4OMP A; 2NWM A; 1BCM A; 4C92 A; 2OTL T; 3V8L A; 2A0F B; 4FL6 A; 5GJV B; 2F2W A; 3M5A A; 1ZSZ C; 1OOT A; 2PZ1 A; 4J9F A; 3HFN A; 1WDX A; 4DA4 A; 4C92 G; 2Y4Y A; 3R6N A; 1OYX A; 4Y91 A; 1ZA2 B; 4N0A C; 2VV5 A; 4ZGD B; 4IUT A; 2DBK A; 1D1B A; 1QP3 A; 4PJO B; 4HCB A; 2K4Y A; 3P8D A; 4MMK A; 2DXB A; 2CDT A; 2IIM A; 3PMT A; 1Y07 A; 2RHZ A; 5GAN 2; 3I55 Q; 4N4H A; 1D0X A; 5EG2 A; 2PVO B; 3AHU A; 5KCO A; 1FX7 A; 2KI7 A; 3JRZ A; 3CPW P; 2A7Y A; 3NTK A; 4VUB A; 1QVF A; 3OSS C; 1R0C B; 1AT1 B; 3EGX B; 1RAG B; 4AT1 B; 4ZN3 A; 5GAN f; 4J7I A; 4KH0 B; 4RMO A; 5GMK e; 1VQP T; 3SWN C; 3JAM E; 5KYX A; 1TSF A; 3O5Z A; 1KC8 R; 3GPL A; 3CBP A; 2CUB A; 1PCX A; 2D0N A; 1OU9 A; 3PMI A; 3OYF A; 4J5Y A; 1IZ6 A; 4QT7 A; 3JB9 D; 4NL3 A; 3EFO A; 2RQV A; 1N8R C; 3HRS A; 2HL5 C; 3HHT B; 1Y96 B; 2K6D A; 1FWZ A; 3HKS A; 1RAA B; 4R55 A; 1K9M C; 2LCL A; 5LJ3 f; 3I55 A; 1SPK A; 2PUK B; 3LGL A; 4PK4 A; 4ZTF A; 1BU1 A; 1G83 A; 4QW2 A; 3CPF A; 1LVK A; 2RD1 A; 2B86 A; 2NUZ A; 3VV0 A; 4CC3 A; 3OYD A; 5KYY A; 1RI9 A; 2F2V A; 1M90 U; 1FMK A; 1QVG A; 2WSF E; 2CH4 W; 3OMG A; 1QWF A; 1YN8 A; 1NPP A; 4C92 F; 1KHC A; 1U06 A; 1K8A R; 4RTT A; 4J9H A; 4V2S A; 2PNI A; 3BDL A; 3JB9 J; 4HCZ A; 3ZBD A; 4CC4 B; 2C0T A; 5D6X A; 2KDS A; 1MMN A; 2VXE A; 3UPU A; 4Z88 A; 3PIP A; 4A4E A; 1YHQ Q; 1Y71 A; 4BE2 A; 3OYH A; 4AG2 C; 2JUF A; 4KUI A; 3SD4 A; 1YWP A; 4JPB W; 4PLI A; 4BAC A; 4JS4 A; 1MHN A; 4JLI A; 1W2B P; 4M7A E; 2L89 A; 2KQW A; 2CP5 A; 5GAN h; 1YIT T; 1X69 A; 2BE9 B; 2FZK B; 4E7S A; 3HSB A; 1BBZ A; 3WVE B; 3QHS A; 1ZUK A; 2SRC A; 2E12 A; 1RAD B; 2ATC B; 2E64 A; 2W10 A; 4M7A A; 1KD1 U; 2MCN A; 3J7A F; 1QVG S; 3CMA Q; 1M90 C; 3QSU A; 1PRL C; 1UGP B; 2O31 A; 1UEB A; 3M0Q A; 4GLM A; 1UG1 A; 1BK2 A; 1WYX A; 2MOX A; 1YHQ A; 4M7A G; 4M75 C; 5LJ3 h; 2ENM A; 4JLG A; 5LJ3 g; 2P0P A; 4JJN K; 7AT1 B; 5D6Y A; 1IB8 A; 4NL2 A; 4O6J A; 4Z89 A; 3JCM P; 2CZ7 B; 4M78 D; 2DAQ A; 3Q1J A; 2LVM A; 3QUI A; 4BI8 B; 3J81 E; 1C0M A; 3CC2 T; 3LLR A; 1WA7 A; 2LMJ A; 2GTJ A; 5KYU A; 1H92 A; 2VVK A; 4J6X A; 3RNJ A; 2YUO A; 3OYK A; 1I1J A; 2E41 A; 4BY6 C; 3M0T A; 3CMA A; 2KT1 A; 2DJQ A; 3C4S A; 4NOY A; 3QJY A; 1AEY A; 1XTD A; 2GGR A; 4JDS A; 1IHW A; 3FJ5 A; 3D7S B; 2XD0 A; 2CT3 A; 2LNH B; 4XQ3 A; 1WNL A; 3H6Z A; 1IGU A; 1WGS A; 3VKI A; 4M7D G; 4C0D C; 1PNJ A; 3CC4 T; 3V8J A; 2RQW A; 2MK5 A; 4QQ6 A; 4ZNX A; 3QDF A; 1ZBX A; 1VQ9 T; 1RAH B; 1NM7 A; 1YWO A; 3MCA B; 1B3Q A; 1RAE B; 3PFS A; 2MWO A; 3OS2 A; 3OQ5 A; 4XU3 A; 2CSI A; 5CKD A; 1ABO A; 1D0Y A; 2K5F A; 4DQ2 A; 2D8H A; 3OYM A; 4XU2 A; 2LJ0 A; 2J6F A; 2VGM A; 1M4Z A; 2C0O A; 2OJ2 A; 1WIE A; 3CC7 Q; 1TUG B; 1MMA A; 2DL5 A; 4FIB A; 3OW2 S; 4AMC A; 4M77 C; 4E6R A; 2RF0 A; 1I81 A; 3CCQ T; 3CCM Q; 3FB9 A; 3VU3 C; 3FRN A; 4C0F A; 2YXY A; 4M7A F; 1JO8 A; 2C0I A; 1WHK A; 3M4G A; 1D3B B; 4JS5 A; 1BI0 A; 3M57 A; 2ABL A; 2DE0 X; 3QDR B; 1UDL A; 1AWJ A; 5I22 A; 4OGC A; 2LQW A; 3VS2 A; 2CZ0 B; 5LJ5 g; 1KQS S; 5LJ5 j; 1TS9 A; 2E3H A; 4J7F A; 2HQH A; 4PJO A; 1Q7Y U; 2FG0 A; 2DEQ A; 2F69 A; 4PJN A; 3KUF A; 4FYW B; 1JBM A; 1M27 C; 2AKL A; 4X9D A; 4PL6 A; 2ZPF B; 1EIF A; 5CK9 A; 3CC7 A; 4F17 A; 4J8O A; 1S72 T; 4XTZ A; 3EGX A; 2EQK A; 2ED1 A; 3NHN A; 3CCM A; 2QTV A; 1HSQ A; 2J6K A; 2FB7 A; 3UDC A; 4A4H A; 1GBR A; 4KUL A; 4C8Q D; 4ELZ C; 1BIB A; 9ATC B; 2HAX A; 2ZGW A; 2EJG A; 2YUN A; 3OB9 A; 2EWN A; 1BB9 A; 1C6V X; 5GAN 3; 3VS3 A; 1WX6 A; 2M02 A; 3M9Q A; 4WF2 A; 4RCC A; 4MZT A; 3E1S A; 1IXD A; 4OGE A; 2K5I A; 1UFF A; 1Y96 A; 2NYS A; 1OI1 A; 2QK0 A; 1MGQ A; 1WXT A; 1MNE A; 1G5V A; 3ZEH A; 2EJF A; 2FZG B; 2KRS A; 4HVV A; 4JUV A; 3ZL7 C; 2OTJ T; 2ZPI B; 3OS5 A; 4L59 A; 1Q7Y C; 3DKM A; 2QAS A; 2L3S A; 3AT1 B; 3E9F A; 2LTO A; 2DTH A; 2W0Z A; 2X4J A; 1ZX6 A; 4JRI A; 2PUO B; 4FW2 A; 3RDV A; 2MPX C; 2DX1 A; 1AZE A; 2KYB A; 2RMO A; 3MKD A; 3PT9 A; 5LJ3 e; 3HP9 A; 3EH1 A; 1AOJ A; 2BKD N; 3JCM W; 3GF5 A; 2KR3 A; 2F2X A; 3ULR B; 5A2Q E; 3H41 A; 2QEX T; 1WJQ A; 1MUZ A; 2DJZ A; 2LRQ A; 4E7L A; 1RLP C; 5GMK h; 2JTF A; 3JCM X; 3L1A A; 1PD0 A; 2FPD A; 4CI0 C; 1VIF A; 1GFC A; 4QVD A; 4F7U B; 1PKS A; 4IUU A; 5GAM g; 3TRE A; 5GAM j; 2DYI A; 3QWX X; 1YI2 Q; 1X6O A; 1YCY A; 3GIB A; 2BIV A; 1VQL Q; 4N4I A; 5EC7 A; 3M0R A; 2LQK A; 4PJO F; 3VS4 A; 2KEA A; 4PLL A; 3JCM J; 1NG2 A; 4E2F B; 1AVZ C; 2GTO A; 2BZ8 A; 5HKC A; 4IIO A; 1K73 C; 3MP6 A; 3OA6 A; 2B8A A; 3VUZ A; 2DO3 A; 2FEI A; 5C0M A; 2LCC A; 1I8F A; 1M1G A; 1TUC A; 2LX9 A; 1VQ5 Q; 1NPR A; 5ECA A; 4B9W A; 2JXB A; 2CP2 A; 4M4Z A; 1PD1 A; 4O5V A; 4OMQ A; 3MET A; 2E6N A; 3QBY A; 2M16 A; 1YCS B; 4KBM B; 2DFU A; 3OYC A; 5GMK i; 3LW5 E; 2DER A; 4FYV B; 2P84 A; 1YJW T; 1YI2 A; 3OSV A; 1JRI A; 1VOM A; 4AFS C; 1VQL A; 3PIO A; 3GNF B; 2A36 A; 1RAI B; 1TUD A; 1PKT A; 4CC7 A; 3OYB A; 3I56 Q; 3PVL A; 3CQT A; 2HSE B; 4EMK B; 3F70 A; 1WI7 A; 2FYK A; 4M7D B; 3M4Y A; 4K11 A; 2QQR A; 5FU7 B; 3DB4 A; 3TCJ A; 3GLX A; 3KXT A; 2ZCF B; 1N6A A; 3LYI A; 2LJ1 A; 4J9G A; 3CXC P; 1T3S A; 2DZ9 A; 1OX9 A; 4OMF B; 1VQ5 A; 5LJ5 e; 1R77 A; 4ME7 A; 1XQH A; 3G6E Q; 1NE8 A; 4CRI A; 3CCU Q; 2CP0 A; 2YUQ A; 2KY9 A; 3VS0 A; 3QJ6 A; 1LJO A; 2JM8 A; 3H0F A; 3SB2 A; 4KT0 E; 2CGH A; 3QYG B; 3GNG A; 1N5Z A; 3EG1 A; 2MF2 A; 4PKC C; 2MAM A; 3HL8 A; 4MDW A; 3X24 B; 3SFM A; 3M54 A; 2K3B A; 2P4T A; 2BZY A; 3S3O A; 1YJN T; 3LWI A; 3I56 A; 2EQM A; 3CCS Q; 1ABQ A; 5KCH A; 2X4Y A; 1G8X A; 1TOV A; 2RPN A; 1W1F A; 2GQV A; 3E19 A; 4FYX B; 1VQ4 Q; 1UHC A; 2DIQ A; 3OBW A; 1K1Z A; 1Q86 C; 3M59 A; 4M75 D; 3TEE A; 5M9O A; 4B6M A; 5CCA A; 3G6E A; 3X26 B; 3CCU A; 1KIK A; 3WXM B; 4JJC A; 1N8R U; 3ME9 A; 5HK0 A; 4J9E A; 2BTT A; 1VQ8 T; 1D3B A; 1QKW A; 1NEB A; 5CKB A; 1K9M U; 2DXC A; 2RNA A; 2EW3 A; 2KT8 A; 1I07 A; 2F1L A; 4OMN A; 4R0K A; 4GY5 A; 3CCS A; 2Y90 A; 4ANJ A; 1VQ4 A; 1HK9 A; 1FXX A; 1M1K R; 4BUG A; 1K76 A; 2C06 A; 4WTO B; 2AK5 A; 1VYU A; 4C5H A; 2XU8 A; 4E7J A; 2DET A; 3CCE Q; 2JJ9 A; 3QWY A; 2DZC A; 2HQX A; 2L0A A; 2ZPH B; 3G71 T; 1M2O A; 2E65 A; 1M5Q 1; 5GAM e; 1Y57 A; 3ZFJ A; 3GP8 A; 2EGC A; 3PVQ A; 3QZ5 B; 3CCR Q; 3QZ9 B; 2JTM A; 2HCK A; 2RI5 A; 1MV0 B; 2KMT A; 1J3T A; 3H8Z A; 4GBQ A; 1VQ6 T; 2DYB A; 4X9C A; 2K3Y A; 2HQE A; 4J9C A; 1CKA A; 3VRY A; 1X27 A; 4M77 D; 3NMZ C; 2YLC A; 3JB9 I; 4C92 C; 1KK7 A; 3FC3 A; 3V8K A; 3M58 A; 2RH2 A; 2X51 A; 1X75 C; 1K8A U; 3FJP A; 2XDB A; 4KRT A; 2RN8 A; 1NLP C; 1QP2 A; 2MIO A; 1ARK A; 3CCE A; 1KC8 C; 1QVF S; 1KSW A; 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1KD1 R; 1JQQ A; 3NTI A; 3G4S A; 2DA9 A; 3NPF A; 4FCY A; 3S3M A; 5HY6 A; 4JRP A; 4EMK A; 2DVJ A; 2FHD A; 4PJO D; 2OTL Q; 4M7D A; 3KBG A; 1T0H A; 3V7R A; 2IPO B; 2WAC A; 1VQM T; 5GAN d; 3OYG A; 2D1X A; 1PM3 A; 5GAO p; 3URG A; 4MML A; 1OU8 A; 4EMH A; 2K79 A; 2VKN A; 1VQN A; 4OML A; 2DRK A; 4L5G A; 2EQI A; 2OAU A; 1ZUY A; 3CXC A; 1UUE A; 3CME T; 5IN1 A; 1U8R A; 3TVT A; 1YJ9 T; 3SWN B; 2FL7 A; 2K7A A; 3E2U A; 4PJL A; 4F7U F; 3VJP A; 1E6H A; 3QO3 A; 2LCS A; 1VQO T; 5LJ3 d; 4M7A C; 3NTH A; 2RQR A; 2OTL A; 1OPL A; 4C0G A; 2DK3 A; 2X3X D; 2DRM A; 2ZAE A; 3CCJ T; 1G2B A; 3TU4 K; 1U5S A; 5GAO n; 1VQP Q; 2H3E B; 1IHV A; 2BE7 D; 2JNG A; 4QVC A; 1M30 A; 1I4K 1; 4X1V A; 4A63 B; 4JJB A; 3A8L B; 2D8J A; 3H9N A; 4LE9 A; 1ZBJ A; 2VGN A; 1KHI A; 4M78 E; 5FWC A; 2DXT A; 2HKQ B; 2ZPE B; 3EG2 A; 1IGQ A; 2HBP A; 4II1 A; 1JU5 C; 5LJ5 h; 2RA2 A; 3A5Z B; 3JCM g; 2RI2 A; 4BI3 A; 5IAY A; 3JB9 F; 1O9S A; 2L2P A; 3DB3 A; 4A4K A; 2K57 A; 1VQK Q; 4EMK C; 1LPL A; 2AZS A; 4LUD A; 2XKO C; 2K2V A; 4LNP A; 2QAZ A; 2KYM A; 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