The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
83
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structure length |
83
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Chain Sequence |
AEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of P13K SH3 domain at 20 angstroms resolution.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT
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| molecule tags |
Phosphotransferase
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
21
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| structure length |
83
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| sequence length |
83
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1995-08-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LMJ A; 2NUZ A; 4ORZ A; 4LUE A; 4E6R A; 1BB9 A; 1WA7 A; 1K0X A; 3EG3 A; 1BBZ A; 2JTE A; 2KXD A; 1OOT A; 3VS0 A; 5L23 A; 1WIE A; 1GCQ A; 1X6G A; 2AK5 A; 2DL3 A; 3EGU A; 3I9Q A; 2FPF A; 2DVJ A; 1AWX A; 1RUW A; 2P4R A; 1AD5 A; 1VYU A; 3PVL A; 1WXB A; 2RQV A; 4AFU C; 4DEY A; 1AWJ A; 4RTZ A; 2KT8 A; 1LCK A; 2KT1 A; 2ROT A; 4HCK A; 3VRZ A; 1J3T A; 1T0J A; 2RPN A; 3C0C A; 4F17 A; 2CH4 W; 2M51 A; 2DL5 A; 1AEY A; 2K7A A; 2K9G A; 1QKW A; 2V1Q A; 2J6F A; 4Z89 A; 1VYT A; 1RI9 A; 2OAW A; 2LJ3 A; 1K4U S; 2CSQ A; 4JJB A; 2EYZ A; 1SEM A; 1KSW A; 2ENM A; 4CC7 A; 2F2X A; 3NPF A; 1AWO A; 4J9I A; 1E6H A; 2RF0 A; 2F2V A; 4J9C A; 4Z88 A; 2GBQ A; 5I22 A; 5GJW B; 4CC3 A; 2JM9 A; 1ZUK A; 1CKA A; 4JPB W; 1IO6 A; 4F14 A; 5IH2 A; 2K6D A; 3H41 A; 4AFS C; 2JMC A; 2DLP A; 1SHG A; 2SRC A; 2FPD A; 1N5Z A; 4LN2 A; 2H8H A; 1ZUY A; 2DL7 A; 1H92 A; 3UA6 A; 2VWF A; 4K11 A; 4HVU A; 2BZX A; 2MIO A; 2J6O A; 2RMO A; 2CSI A; 1X43 A; 1CKB A; 1NM7 A; 3M0P A; 3M0T A; 4IIM A; 3UAT A; 2YT6 A; 3JV3 A; 2ED0 A; 1MUZ A; 1JEG A; 2CDT A; 1GRI A; 1T0H A; 2KYB A; 3QWY A; 2FO0 A; 2KNB B; 2EYW A; 2AZS A; 2D0N A; 3O5Z A; 1MV0 B; 1X2K A; 1AZG B; 5IHK A; 1X6B A; 2LQW A; 1ZX6 A; 1BK2 A; 1TUD A; 2HSP A; 1YWP A; 2YSQ A; 1Z9Z A; 1W70 A; 3U23 A; 2AKK A; 4JZ4 A; 2YUP A; 2GNC A; 1UJ0 A; 1T3S A; 2JMA A; 2OJ2 A; 1ZUU A; 2A28 A; 1UUE A; 3VS3 A; 1WYX A; 2LQN A; 3FJ5 A; 1WXT A; 1JXM A; 1WXU A; 1ZBJ A; 1UGV A; 2KYM A; 4J9G A; 3VS1 A; 4LNP A; 1ZLM A; 1M30 A; 3H0I A; 1JO8 A; 1G2B A; 1GFC A; 1SPK A; 3REB B; 1RLP C; 1VYV A; 1H3H A; 1I07 A; 4HXJ A; 2J7I A; 3M0Q A; 3CQT A; 1AZE A; 2X3W D; 1K0S A; 1I1J A; 1SHF A; 2BTT A; 4KRT A; 1AVZ C; 2DM1 A; 2DX1 A; 1ABO A; 5IHI A; 1WFW A; 2EYX A; 2RQW A; 1SRL A; 4J9F A; 4EIK A; 2AKL A; 2LCS A; 2RN8 A; 1NG2 A; 2B86 A; 2GTO A; 1K9A A; 4OMP A; 2L3Q A; 1KFZ A; 2K3B A; 1PKT A; 1QKX A; 1WX6 A; 4F16 A; 1X27 A; 1VA7 A; 2LP5 A; 4Z8A A; 2DRM A; 1AWW A; 1YN8 A; 2IIM A; 1K76 A; 5EC7 A; 1GL5 A; 2KRM A; 5IHN A; 3THK A; 1WDX A; 1NYF A; 2NWM A; 1YWO A; 4X1V A; 2J05 A; 4OML A; 1B3Q A; 4J9D A; 1YNZ A; 2YUN A; 1UHF A; 4RTW A; 2HDA A; 3R6N A; 3ULR B; 3TVT A; 2FEI A; 2CT4 A; 2EYY A; 1UJY A; 2CUD A; 4ESR A; 2DRK A; 1NLP C; 1NEB A; 1QCF A; 1V1C A; 1SRM A; 3IQL A; 4RTV A; 2HEQ A; 2XMF A; 2J6K A; 2LJ1 A; 1JU5 C; 4FSS A; 4OMQ A; 5FW9 A; 1G83 A; 2JW4 A; 3I5S A; 3H0F A; 1H8K A; 4JZ3 A; 1TUC A; 4A63 B; 1WI7 A; 4JJD A; 2DBM A; 2KXC A; 4R0K A; 2DJQ A; 2EVR A; 3PVQ A; 2HBW A; 2EGE A; 1QLY A; 2BZY A; 2KBT A; 1KIK A; 2GQI A; 1T3L A; 3M0S A; 3TSZ A; 1OEB A; 1UHC A; 2JXB A; 2AZV A; 3VRY A; 1M3C A; 2J06 A; 2KRN A; 1SSH A; 4OMN A; 5FWB A; 2W10 A; 3NMZ C; 1QWE A; 2ECZ A; 2EW3 A; 2A36 A; 2DL8 A; 2A37 A; 2CT3 A; 2O9V A; 3NGP A; 4RTT A; 3NHN A; 3I5R A; 3VS5 A; 2D8J A; 3I35 A; 4DEX A; 1CSK A; 2O31 A; 4J9H A; 4ZNX A; 3UA7 A; 1GFD A; 1B07 A; 1MV3 A; 4QT7 A; 2L3S A; 4OMM A; 2LNH B; 2L0A A; 2O88 A; 1FMK A; 2VKN A; 1HD3 A; 1UDL A; 2D8H A; 1U5S A; 2LJ0 A; 2VVK A; 1PRL C; 1HJD A; 1W6X A; 3EHR A; 5FWC A; 4AFQ C; 1E6G A; 4CC2 A; 2JS0 A; 2DYB A; 2DE0 X; 4M4Z A; 2F2W A; 5GJV B; 2KRO A; 3VS7 A; 1NEG A; 1U3O A; 1OPL A; 2KRS A; 1A0N B; 3UF4 A; 2SEM A; 1KJW A; 1Z9Q A; 1GBQ A; 1GCQ C; 1NLO C; 5HCK A; 4D8D A; 1ARK A; 1GBR A; 1K1Z A; 1I0C A; 4LE9 A; 2CRE A; 4J9B A; 1M8M A; 2PNI A; 1QWF A; 1XOV A; 1X2Q A; 1PRM C; 2HCK A; 2PTK A; 2RQT A; 1YP5 A; 1FYN A; 5ECA A; 2W0Z A; 3VS6 A; 2JS2 A; 2L2P A; 2EPD A; 3M0U A; 2K79 A; 1M3B A; 3RNJ A; 2E5K A; 2PZ1 A; 2C0T A; 2DMO A; 2A08 A; 1UTI A; 2GTJ A; 3EG1 A; 3SHW A; 5IXB A; 4RTX A; 1M27 C; 2I0N A; 1S1N A; 2MCN A; 2FRW A; 2D1X A; 1NYG A; 2O2O A; 4GLM A; 2GGR A; 1EFN A; 1M3A A; 3QWX X; 2DBK A; 2FRY A; 2CH4 A; 1RLQ C; 1JQQ A; 1UFF A; 2O9S A; 2QDL A; 2K2M A; 4RUG A; 2RQR A; 1GCP A; 2KGT A; 2RNA A; 2EGC A; 4RTY A; 2M0Y A; 1ZSG A; 2YUO A; 1Y57 A; 2FG0 A; 5IXF A; 2DA9 A; 4AFZ C; 1X69 A; 2DF6 A; 1UEC A; 2CUB A; 3REA B; 2DIL A; 3TSW A; 2KE9 A; 2EBP A; 2FPE A; 4RTU A; 1UE9 A; 2ESW A; 5I11 A; 2KEA A; 2LZ6 B; 3ZL7 C; 3SEM A; 2OI3 A; 4D8K A; 3KFV A; 1WLP B; 2C0I A; 3EG0 A; 3RBB B; 4J9E A; 2DL4 A; 1AOJ A; 2EGA A; 1YCS B; 4WCI A; 1E7O A; 1HSQ A; 2DNU A; 1BU1 A; 2L3P A; 3H0H A; 1W1F A; 3M0R A; 4AG2 C; 1TG0 A; 2G6F X; 1Y0M A; 2LX7 A; 2JM8 A; 3VS2 A; 2X3X D; 4Y92 A; 2ABL A; 2YUQ A; 3PE0 A; 4CC4 B; 1ABQ A; 2BZ8 A; 2ROL A; 1PWT A; 1JXO A; 2KR3 A; 1UG1 A; 3GBQ A; 2ED1 A; 2EKH A; 2MOX A; 3EG2 A; 4IIO A; 3LH5 A; 2RQU A; 1PHT A; 2YDL A; 1PNJ A; 4HVV A; 4HVW A; 4LUD A; 2EQI A; 4OMO A; 4JJC A; 3A98 A; 2JT4 A; 2V1R A; 1OPK A; 2C0O A; 1PKS A; 4GBQ A; 3EHQ A; 4AG1 C; 1U06 A; 3VS4 A; 1OV3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3SFM A; 4C92 B; 2LMJ A; 2NUZ A; 1VQ6 A; 2K3Y A; 3HRT A; 2VC8 A; 3H8Z A; 3EG3 A; 4M7A E; 1WJQ A; 1MND A; 1Q82 U; 1GCQ A; 2HKN A; 3I55 T; 1RAF B; 3I9Q A; 3HL8 A; 3A8L B; 4M75 A; 4MDW A; 4MZT A; 1K73 U; 2P4R A; 4M77 C; 5GAN 2; 3MEU A; 1WXB A; 1VQN A; 3URG A; 4PJO A; 4AFU C; 4RTZ A; 5D6Y A; 2KT1 A; 2EQU A; 2ZPH B; 1S72 A; 1KC8 R; 2DXC A; 2VAS A; 1YJN A; 4F17 A; 2CH4 W; 2PVD B; 2K9G A; 2V1Q A; 1W2B P; 2COZ A; 2RJF A; 1QCN A; 1G5V A; 4EDU A; 4IKF A; 4FT4 A; 2F2X A; 4C92 G; 5CK9 A; 4J6X A; 5FU7 B; 2I2L A; 2RK2 A; 2RF0 A; 4J9I A; 4J9C A; 4Z88 A; 4E47 A; 2ZPE B; 5GAN 4; 4L6V 5; 1VQP A; 5GJW B; 1CKA A; 1IB8 A; 3X28 B; 3CCQ A; 1VQK T; 1SHG A; 1D3B B; 1N5Z A; 2LT4 A; 3JCM b; 2DXB A; 3WXM B; 4JS4 A; 3OW2 P; 3QPH A; 1H92 A; 1XJW B; 1PG5 B; 3CCR A; 4K11 A; 1VQ5 T; 3SDZ A; 5KYY A; 2VGN A; 2FZK B; 2E5Q A; 2XU8 A; 1VQM Q; 3HSB A; 2YT6 A; 3RES A; 1TSF A; 4MML A; 2ED0 A; 3OYM A; 1JEG A; 2QQ9 A; 1XNI A; 5GAN g; 3BDL A; 4ME7 A; 3BW1 A; 1PC0 A; 3H9N A; 2QGG A; 3M53 A; 3P8H A; 2EYW A; 2AT1 B; 4N0A C; 1I5O B; 4OGE A; 1NJI C; 3EAE A; 2KVQ G; 2LQW A; 1BK2 A; 1TUD A; 1QVF P; 1YWP A; 4QVD A; 2JTF A; 5LJ5 j; 2YSQ A; 1Z9Z A; 3U23 A; 1QVG S; 1UJ0 A; 1PM3 A; 3I55 Q; 1T3S A; 1ZUU A; 3QBY A; 1Q82 R; 2EWN A; 5J3B A; 3MKD A; 4M78 D; 1O9S A; 2QDY B; 1WXU A; 3JB9 J; 3QYG B; 4LDW A; 1K73 R; 5KYW B; 1ZLM A; 5CKH A; 3H0I A; 1JO8 A; 1GFC A; 1YJ9 A; 3OYG A; 3REB B; 4HXJ A; 3KBG A; 1LPL A; 3MO8 A; 5KYX B; 5FRO A; 2BTT A; 4EMK B; 4ZGD B; 3DB4 A; 3OYK A; 5KE2 A; 4O5V A; 4FW2 A; 2EYX A; 4J9F A; 4M77 A; 3EH2 A; 5LJ3 e; 1ZA1 B; 3OYD A; 5DY9 A; 1K9A A; 3LYI A; 2HKQ B; 2DET A; 1WX6 A; 5M9O A; 4LDX A; 1VQK Q; 1VQ5 A; 3QKJ A; 3QDR B; 2Z0W A; 3CMA A; 4X9D A; 1K76 A; 5IHN A; 1D0Y A; 3SWN B; 4J83 A; 3BE3 A; 1NYF A; 1YWO A; 2J05 A; 2DIQ A; 1R0C B; 1O75 A; 3JCM W; 4E7S A; 4C92 D; 3ZEH A; 3TVT A; 3M59 A; 4BUG A; 2EYY A; 3HTR A; 4KGX B; 1V1C A; 1R8O B; 2HEQ A; 2LJ1 A; 4KBM B; 1G83 A; 3HRS A; 5GMK h; 3OYY A; 4PL6 A; 1VQO T; 5HY6 A; 1WI7 A; 3V8J A; 4E7Z A; 4M7D C; 2QQS A; 3JCM Q; 5HKC A; 2RHI A; 2DBM A; 3CCV T; 3LW5 E; 4N0A A; 4V2S A; 1KIK A; 2GQI A; 5GAO n; 1T3L A; 3FRN A; 2Y4Y A; 3CCM A; 2MF2 A; 2XG8 D; 1SSH A; 5GAO p; 4WF2 A; 5LJ5 d; 5FWB A; 1QWE A; 2ECZ A; 3HKS A; 3NTH A; 2QG9 B; 2DYI A; 1RAH B; 1JRI A; 2O9V A; 1OU9 A; 4RTT A; 3VS5 A; 2O31 A; 2CS7 A; 2CP2 A; 3EG9 B; 2E41 A; 1Q95 G; 1K8A U; 2RM4 A; 1PCX A; 2VKN A; 3CBO A; 2FHD A; 8AT1 B; 2D8H A; 2LJ0 A; 5LJ3 j; 3OYJ A; 3LGF A; 5D6X A; 3INZ A; 1TOV A; 4M75 F; 2KAF A; 1A0N B; 2DJZ A; 4PJO F; 1KJW A; 2Y4X A; 1NLO C; 1GBR A; 4X34 A; 4ZTF A; 2CRE A; 4C8Q B; 1M1K U; 3CCU T; 5GAO m; 1M8M A; 1SG5 A; 2PNI A; 4M7A C; 1M2V A; 1VQ8 A; 1MMN A; 1R77 A; 1YP5 A; 5ECA A; 2R57 A; 1YFN A; 4JLG A; 3VS6 A; 1Y96 B; 3EGD A; 2CZ6 B; 4XAX B; 2K79 A; 4PNO A; 1WJR A; 4XTY A; 4CI0 C; 5GAO l; 2DMO A; 3CCV A; 2GTJ A; 3MP6 A; 3EG1 A; 1VQO Q; 3HHT B; 1M27 C; 4Y28 E; 2OTL T; 2I0N A; 1S1N A; 3JB9 F; 2O2O A; 1BCM A; 2RJC A; 2E3I A; 1FXX A; 3QWX X; 2DBK A; 2QYZ A; 2DD5 A; 4HCZ A; 4PLI A; 3I56 T; 3G6E T; 5A0L A; 1K9M U; 1GCP A; 4B9X A; 2RNA A; 1KQS P; 1KK7 A; 4C8Q G; 2FG0 A; 5IXF A; 1RAI B; 1X69 A; 2CUB A; 3TSW A; 1OU8 A; 2KE9 A; 4M7D A; 4PLL A; 5A2Q E; 4B6M A; 4DBF A; 2GFA A; 2RHU A; 3RUX A; 1KC8 C; 5GAN f; 1RAA B; 2RH2 A; 5CQY A; 1BI0 A; 4D8K A; 2LTO A; 2C0I A; 3PFS A; 1K8A R; 3RBB B; 3GIB A; 4QVZ A; 2HMA A; 3R6O A; 2PVO B; 3P8D A; 3PMI A; 1YCS B; 3JCM c; 1E7O A; 3OSV A; 1BU1 A; 2CP0 A; 2L3P A; 3JCM P; 2AIR B; 2LQ8 A; 4BDY A; 1VQ9 A; 3CCJ Q; 2XD0 A; 4J6Y A; 2JUF A; 2CGH A; 1N9S A; 1YHQ A; 3RMS A; 2BZ8 A; 2DVE A; 2WSC E; 1JXO A; 3C4S A; 3JCM h; 3EG2 A; 2EAY A; 3G7Z A; 1VQ4 A; 4M78 E; 3DKM A; 3BFM A; 3EH1 A; 2RQU A; 4LUD A; 3CCU Q; 4OMO A; 4C0D C; 2DD4 A; 2QQB A; 3E1S A; 2V1R A; 1OPK A; 2QQR A; 3VUB A; 4A53 A; 3RER A; 1XQH A; 5GAM h; 3TU4 K; 1YIJ A; 3L2W A; 5A0D A; 1M1K R; 3VS4 A; 1OV3 A; 4CRI A; 3JCM d; 4ORZ A; 4D6W A; 1UGS B; 2RHZ A; 5HK0 A; 4LUE A; 2VUB A; 4M77 F; 1BB9 A; 3MHX A; 2JTE A; 1WHL A; 2GCX A; 3MCA B; 2LX9 A; 5LJ3 g; 2DL3 A; 2OTL Q; 2R5A A; 2DVJ A; 1AWX A; 3NFC A; 1VUB A; 5GAM d; 3GOX A; 2BE7 D; 3VYG A; 4M7A A; 3V8L A; 4DEY A; 2DEQ A; 3I56 Q; 3G6E Q; 3MEA A; 4UC4 A; 2K4Y A; 2KQW A; 2O01 E; 1AEY A; 1Q82 C; 2JNG A; 1K9M R; 2J6F A; 4Z89 A; 1VQ6 T; 1NPP A; 1VYT A; 4XU0 A; 4ELZ C; 1K73 C; 1D09 B; 4OP0 A; 3JCM X; 4N4I A; 2ENM A; 2YHT A; 3RMQ A; 2C06 A; 2CP7 A; 4C92 E; 1M5Q 1; 4RG2 A; 3ASK A; 5I22 A; 4PJL A; 2HL5 C; 1SF9 A; 1ZUK A; 4JPB W; 1TU0 B; 1VQN T; 3H41 A; 4AFS C; 3CC7 A; 3H6Z A; 5AT1 B; 3NTI A; 3CC4 A; 3JB9 H; 5GAN 6; 1WHJ A; 1S72 T; 4LN2 A; 3GP8 A; 1ZUY A; 1YJW Q; 4AMC A; 3OS0 A; 3UA6 A; 1YJN T; 3GNG A; 5I2M A; 1BKB A; 2X51 A; 3HPW A; 2MIO A; 4GY5 A; 1CKB A; 4C8Q D; 1M90 U; 1Q7Y R; 3UAT A; 2IG0 A; 3JSC A; 2BE9 B; 2P0P A; 1MUZ A; 2PUO B; 5KYU A; 2CDT A; 1ZBX A; 2KYB A; 3QWY A; 3UPU A; 2KNB B; 1VQP T; 3O5Z A; 2OTJ A; 3CCQ T; 1AZG B; 4JDS A; 5IHK A; 1X6B A; 2HSP A; 3GNF B; 1W70 A; 2R58 A; 3V7S A; 2AKK A; 4NL2 A; 3CCR T; 2DFU A; 2ZCF B; 1UUE A; 3TQ7 P; 2QGF B; 1TS9 A; 1WYX A; 2LQN A; 5LJ5 e; 4BD3 A; 3CD6 T; 3FJ5 A; 4HKE A; 5LJ5 f; 2RHX A; 5GMK e; 1OZ3 A; 2KYM A; 4LNP A; 2HAX A; 1B34 B; 1SPK A; 4FYV B; 3M58 A; 3UDC A; 3G4S A; 4DBQ A; 4Y91 A; 2L3R A; 4LDU A; 1H3H A; 1I07 A; 5J39 A; 3M0Q A; 2MWO A; 3CQT A; 2XKO C; 2X3W D; 3TRE A; 1JBM A; 3G71 A; 3HRU A; 1VQ6 Q; 2DM1 A; 4ATO A; 1Q86 U; 2EQK A; 1ABO A; 3OYC A; 1TUG B; 3OMC A; 2KDS A; 4EIK A; 3S3O A; 2AKL A; 3PGG A; 2RN8 A; 1RAD B; 1NG2 A; 2DAQ A; 1M2O A; 4OMP A; 2L3Q A; 1PKT A; 1QKX A; 1VQN Q; 5CQX A; 4C5G A; 3OS1 A; 3QG1 A; 4BAC A; 1X27 A; 1S72 Q; 1ZQ1 A; 1YJ9 T; 2HQH A; 4J8O A; 4JRK A; 5CO7 A; 3VUZ A; 1YJN Q; 9ATC B; 1YN8 A; 2NUP B; 2IIM A; 2ATC B; 2BUD A; 3OA6 A; 5GAN 5; 2DZC A; 1IXD A; 4ZGE B; 1D1C A; 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