The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
83
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structure length |
83
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Chain Sequence |
AEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Crystal structure of P13K SH3 domain at 20 angstroms resolution.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT
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| total genus |
21
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| structure length |
83
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| sequence length |
83
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1995-08-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DL5 A; 2RPN A; 2JMC A; 2DLP A; 1A0N B; 1PHT A; 1E6H A; 2KE9 A; 1VYT A; 3REA B; 1GCP A; 4EIK A; 3M0Q A; 2OJ2 A; 1QKW A; 2FPD A; 1WDX A; 2CDT A; 2W0Z A; 3PVQ A; 2A08 A; 1ZUK A; 4J9I A; 1GBQ A; 3EG2 A; 1NLO C; 1QWE A; 1RLQ C; 2DA9 A; 2ABL A; 2LJ1 A; 5IHN A; 1WXB A; 2EKH A; 3VS0 A; 1GCQ C; 1SHG A; 1B07 A; 2D1X A; 2DRK A; 2HSP A; 2X3X D; 4Z88 A; 2YUP A; 2KT8 A; 3SHW A; 2E5K A; 5L23 A; 4OMO A; 1WYX A; 1TUD A; 4RTZ A; 1WA7 A; 2DNU A; 3UA7 A; 2KRO A; 1K76 A; 1HJD A; 1UDL A; 1AWX A; 1UJY A; 2RQR A; 2EYZ A; 3ZL7 C; 4CC4 B; 4IIM A; 2A36 A; 1WX6 A; 2VVK A; 3VS6 A; 2C0T A; 1W1F A; 4RUG A; 1HD3 A; 2DL7 A; 2GBQ A; 3TSZ A; 1CKA A; 2M0Y A; 1AOJ A; 1M8M A; 3LH5 A; 2M51 A; 5ECA A; 2JM8 A; 5FWB A; 2RQW A; 1XOV A; 4HVV A; 3SEM A; 5GJW B; 4RTU A; 2KRS A; 2YUO A; 1Z9Z A; 2CUB A; 2CUD A; 2L3Q A; 1E6G A; 1ZUY A; 1I1J A; 2CRE A; 1PRL C; 2BZY A; 1QCF A; 1MUZ A; 1U06 A; 1YN8 A; 2LX7 A; 1U3O A; 1GRI A; 1PKS A; 2YDL A; 2KT1 A; 2IIM A; 1JXM A; 2NUZ A; 1I07 A; 2CT4 A; 1B3Q A; 2G6F X; 2GQI A; 1FMK A; 2FRW A; 3ULR B; 4AFZ C; 4Z8A A; 3M0R A; 1JU5 C; 2J05 A; 4F14 A; 1YWP A; 1SHF A; 4LUD A; 2HDA A; 1M3C A; 2EW3 A; 1UHC A; 3VS1 A; 1VYV A; 4J9D A; 4OMN A; 5IH2 A; 2JT4 A; 1WLP B; 1OOT A; 1NYG A; 4GBQ A; 2A28 A; 1G83 A; 1AVZ C; 2JS0 A; 2ED0 A; 2CSQ A; 3I9Q A; 2KRM A; 3M0S A; 4LNP A; 1T0J A; 2BZX A; 2H8H A; 2PZ1 A; 4Z89 A; 1ZUU A; 3NPF A; 4HVW A; 1YNZ A; 3IQL A; 4GLM A; 1BB9 A; 4DEY A; 2HEQ A; 1K0X A; 5I11 A; 2O9S A; 2QDL A; 4KRT A; 3H0F A; 3EGU A; 1ABO A; 2EYW A; 1AWW A; 1X2Q A; 4AG2 C; 4LN2 A; 2CSI A; 5IHI A; 2EYY A; 2LJ0 A; 1NG2 A; 1H3H A; 1WXU A; 3U23 A; 1BK2 A; 1GCQ A; 1JXO A; 1X6G A; 2LP5 A; 1T0H A; 2KYB A; 1VA7 A; 2EVR A; 2K2M A; 4FSS A; 4IIO A; 5I22 A; 2LMJ A; 4CC2 A; 2O88 A; 1Y57 A; 2JM9 A; 3JV3 A; 1MV3 A; 1KIK A; 3GBQ A; 2RQT A; 2FRY A; 3EHR A; 4LUE A; 2MCN A; 4ESR A; 2NWM A; 5IHK A; 1YCS B; 1EFN A; 5EC7 A; 2FPF A; 2GNC A; 1N5Z A; 2KYM A; 2YUQ A; 3UA6 A; 1BBZ A; 3THK A; 4WCI A; 2ROT A; 4JPB W; 1M3A A; 2A37 A; 3VS5 A; 1I0C A; 1UJ0 A; 1AWO A; 3EG1 A; 2AZS A; 1SPK A; 2K7A A; 3C0C A; 1UE9 A; 4LE9 A; 1AWJ A; 2GGR A; 3NMZ C; 1YP5 A; 1RLP C; 2PTK A; 2KGT A; 1PWT A; 1UEC A; 4Y92 A; 1K9A A; 3VS2 A; 5IXB A; 3I35 A; 2EGE A; 2EBP A; 1TG0 A; 2K3B A; 4J9B A; 3I5R A; 2YT6 A; 2K79 A; 2PNI A; 1KFZ A; 2KXD A; 1ARK A; 1U5S A; 1X2K A; 2L2P A; 3FJ5 A; 1AZE A; 2DBK A; 4OMM A; 1UGV A; 2JW4 A; 2LQN A; 1RUW A; 1ZX6 A; 2ED1 A; 2KEA A; 2AKK A; 4RTX A; 1UHF A; 1X69 A; 2I0N A; 2SRC A; 1V1C A; 2L3P A; 4JJD A; 3VRZ A; 2F2X A; 2ECZ A; 1M27 C; 2RF0 A; 2VWF A; 1X6B A; 4AG1 C; 2DVJ A; 1SEM A; 1GL5 A; 1ZBJ A; 3VRY A; 4ZNX A; 4F16 A; 1S1N A; 3R6N A; 2DL3 A; 4AFS C; 1M30 A; 1IO6 A; 2JMA A; 1KJW A; 2FO0 A; 1NEB A; 4RTV A; 2J6O A; 2F2V A; 4F17 A; 2P4R A; 3CQT A; 3PVL A; 2DYB A; 2MIO A; 2LJ3 A; 2AK5 A; 1YWO A; 1WIE A; 1NEG A; 3M0P A; 4X1V A; 2FG0 A; 2J06 A; 2DF6 A; 1CSK A; 2BTT A; 2V1R A; 3O5Z A; 3H0I A; 2CT3 A; 1Y0M A; 1HSQ A; 4JZ3 A; 4CC7 A; 4HVU A; 2EQI A; 1ZLM A; 1PKT A; 4RTY A; 2L3S A; 2O2O A; 2V1Q A; 1PNJ A; 1OPK A; 5FW9 A; 2C0O A; 2DX1 A; 3QWX X; 1RI9 A; 3QWY A; 4D8K A; 2CH4 A; 3H0H A; 1T3L A; 2JTE A; 4RTT A; 1K1Z A; 2K9G A; 2GTJ A; 4K11 A; 2HCK A; 2KR3 A; 2J6K A; 4QT7 A; 3NHN A; 5FWC A; 5GJV B; 2GTO A; 2MOX A; 4E6R A; 1M3B A; 2O31 A; 2VKN A; 2W10 A; 3RNJ A; 2YUN A; 3VS3 A; 3H41 A; 1QLY A; 3M0T A; 4R0K A; 2B86 A; 4M4Z A; 4HXJ A; 2YSQ A; 3UF4 A; 1AEY A; 1WI7 A; 1FYN A; 2HBW A; 2DL8 A; 1OPL A; 2RMO A; 1AZG B; 2RN8 A; 2AZV A; 2AKL A; 2JS2 A; 3M0U A; 4JJC A; 4J9C A; 3VS7 A; 2ROL A; 2RQV A; 3PE0 A; 2KNB B; 3RBB B; 2J6F A; 2C0I A; 1KSW A; 4J9F A; 2JXB A; 2D8J A; 2D8H A; 1E7O A; 1WXT A; 2RNA A; 1T3S A; 4JJB A; 2DL4 A; 2RQU A; 2ENM A; 4A63 B; 1W6X A; 3NGP A; 2DM1 A; 1H8K A; 2KBT A; 2LZ6 B; 1OV3 A; 1UUE A; 2CH4 W; 1Z9Q A; 1ABQ A; 1SRM A; 2BZ8 A; 3TSW A; 2L0A A; 1ZSG A; 1SSH A; 2OAW A; 3I5S A; 1QKX A; 4AFU C; 1GFD A; 1LCK A; 3REB B; 2OI3 A; 3EHQ A; 2LQW A; 4OMP A; 4J9E A; 3EG3 A; 4AFQ C; 1NLP C; 2DBM A; 1G2B A; 2LNH B; 2DRM A; 1BU1 A; 2X3W D; 3VS4 A; 1W70 A; 3UAT A; 4HCK A; 2DMO A; 4JZ4 A; 2EPD A; 2DE0 X; 1X43 A; 4D8D A; 1J3T A; 1SRL A; 2DJQ A; 1GBR A; 2D0N A; 1AD5 A; 1QWF A; 1WFW A; 2EGA A; 3TVT A; 1UTI A; 1NYF A; 2DIL A; 2KXC A; 1UG1 A; 2J7I A; 2FPE A; 4J9G A; 2EYX A; 1NM7 A; 2XMF A; 3EG0 A; 4OML A; 1TUC A; 1MV0 B; 2LCS A; 2O9V A; 1K0S A; 3A98 A; 1UFF A; 5IXF A; 5HCK A; 4RTW A; 1VYU A; 2K6D A; 4OMQ A; 1PRM C; 2EGC A; 2KRN A; 1CKB A; 2SEM A; 1JO8 A; 2F2W A; 4J9H A; 4ORZ A; 4CC3 A; 1GFC A; 1X27 A; 4DEX A; 1JQQ A; 2FEI A; 1JEG A; 1OEB A; 3KFV A; 1H92 A; 2ESW A; 1K4U S; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DLP A; 3REA B; 2KE9 A; 1M90 C; 3M59 A; 4ZN3 A; 1WDX A; 2W0Z A; 1YJ9 T; 3PVQ A; 1ZUK A; 1YIT Q; 1RLQ C; 2ABL A; 1VQ9 Q; 4M7D A; 4F7U B; 1WXB A; 1SHG A; 2DRK A; 2CP7 A; 2LX9 A; 2R5A A; 3OYK A; 5KYY B; 1ZSZ B; 1WA7 A; 3CC2 T; 3OSS C; 2KRO A; 1NZ9 A; 2EYZ A; 3RMQ A; 3LH0 A; 1B34 B; 5I21 A; 1WX6 A; 2HNI A; 4LDU A; 2LT1 A; 4RUG A; 3CCS A; 2QG9 B; 2DL7 A; 3ASK A; 3CCJ T; 3CCM A; 1CKA A; 3I56 T; 4C8Q C; 4M7A C; 2BIV A; 2RQW A; 3SEM A; 5GAO m; 5EG2 A; 1VQP Q; 4E7L A; 2QGG A; 3QII A; 2OTJ T; 2DD5 A; 1MNE A; 2CUD A; 3T9N A; 1E6G A; 2DEQ A; 1U3O A; 2EIF A; 1U1S A; 2LCL A; 2CT4 A; 2G6F X; 2GQI A; 1FMK A; 2FRW A; 3ULR B; 5DM7 R; 1RAA B; 4Z8A A; 1OYX A; 4D6W A; 2QK0 A; 1WHH A; 4F14 A; 1R0B G; 1YWP A; 4J7I A; 4Y28 E; 1YIJ A; 2V26 A; 4RG2 A; 2E65 A; 3NTI A; 1KHI A; 2JTF A; 1VQ6 A; 2RI5 A; 4KH0 B; 4IUP A; 1G83 A; 1QVP A; 3QDF A; 1U8R A; 5A0G A; 2KRM A; 1Q81 U; 4BUG A; 2RK2 A; 5CKE A; 2H8H A; 1ZUU A; 1YNZ A; 3IQL A; 4FT4 A; 3OMC A; 1BB9 A; 2DAQ A; 3EG9 B; 2CP5 A; 1TU0 B; 3G1J A; 2O9S A; 5GAN 7; 3EGU A; 4B6M A; 2H3J A; 4X9D A; 1PD0 A; 3OS2 A; 2LJ0 A; 2CP0 A; 1WXU A; 3UDC A; 4PJO C; 1T0H A; 3JCM W; 2O01 E; 1VIE A; 3QZ9 B; 4FSS A; 3EH1 A; 4FSX A; 2LMJ A; 4JLG A; 2P0P A; 4EMH A; 2FHD A; 1VQL Q; 1MV3 A; 1PSE A; 3SWN C; 2FRY A; 3JCM h; 3EHR A; 3QKJ A; 3GNG A; 1MMN A; 1KQ2 A; 2L89 A; 1SSF A; 2EJG A; 2V8J A; 2NUT A; 1YCS B; 1EFN A; 5EC7 A; 2DZ9 A; 4NS5 A; 3UA6 A; 1Y96 B; 2DTH A; 1WZO A; 4C92 D; 3CXC A; 4M7A A; 1OQK A; 3V8J A; 2XDD A; 1KD1 U; 5FRN A; 2DXT A; 2K7A A; 2E10 A; 2QQA A; 1LPL A; 3NMZ C; 5FU6 C; 4EMG A; 3NTH A; 2RHZ A; 5LJ5 e; 3CXC P; 3VUZ A; 1UGS B; 3MJX A; 2VGM A; 3CPW A; 3F70 A; 4J9B A; 1KFZ A; 4M78 C; 2KXD A; 4C92 F; 1U5S A; 3A8O B; 2EQM A; 3FJ5 A; 2P84 A; 4OMM A; 2JW4 A; 4O6J A; 3HTR A; 3JCM c; 2KEA A; 5LJ5 f; 3OYC A; 4RTX A; 1D1C A; 3MEW A; 2L3P A; 1ZA1 B; 3VRZ A; 4JUV A; 4XTY A; 3CCS Q; 3QSU A; 2F2X A; 3FJP A; 5KYW B; 2QTX A; 1M27 C; 2K2V A; 3CCM Q; 3JCM V; 2LVM A; 4QVZ A; 3GP8 A; 1D1A A; 1ZBJ A; 4F16 A; 3AT1 B; 4EDU A; 1IO6 A; 1KJW A; 2E6Z A; 3CXC S; 5FU7 B; 4C0F A; 2QI2 A; 3D7S B; 4E7K A; 3GF5 A; 2P4R A; 3OQ5 A; 3PIP A; 1ZSZ C; 3S6W A; 1YWO A; 5A2Q E; 4FYX B; 4X1V A; 2EJF A; 3V7C A; 2PVD B; 1VQN T; 2HQH A; 3CCR T; 4QQG A; 2J06 A; 1CSK A; 5J26 A; 1M1K C; 1ACM B; 4QW2 A; 1IGQ A; 2V1R A; 3O5Z A; 3CME T; 1P92 A; 2RHX A; 1YIJ Q; 2YRC A; 4CC7 A; 3SWN A; 1YJN A; 4HVU A; 2EQI A; 1VQ6 Q; 4J83 A; 3MET A; 1K8A C; 5KYU B; 1YJW T; 2QAZ A; 2ZPE B; 3FEO A; 2QQB A; 2M9U A; 2GCX A; 1TXQ A; 1BI0 A; 3HRT A; 2CH4 A; 3H0H A; 2JTE A; 2KDS A; 4M75 G; 4OB1 B; 2DO3 A; 2RJC A; 4HT9 A; 2GTJ A; 3MP1 A; 2KR3 A; 2J6K A; 1LOJ A; 4PL6 A; 4GLK A; 2MF2 A; 3NHN A; 2M02 A; 3OMG A; 4DA4 A; 3EGD B; 4HCB A; 3M58 A; 1FWZ A; 2KVQ G; 8ATC B; 1IRE B; 3DB3 A; 1DJ7 B; 2DXC A; 2YUN A; 2GQV A; 1QLY A; 2B86 A; 3L2U A; 4HXJ A; 2YSQ A; 3UF4 A; 1AEY A; 1WI7 A; 1MHN A; 1D1B A; 1FYN A; 2HBW A; 4M78 A; 2DL8 A; 1OPL A; 2RMO A; 1UGQ B; 3FLG A; 3OW2 S; 4BD3 A; 5GAO r; 4ZTJ A; 1NJI R; 2RQV A; 3PE0 A; 4TVR A; 2KNB B; 4R56 A; 4J9F A; 3M4G A; 2F69 A; 4QQ6 A; 3CBO A; 1M1K R; 2D8H A; 1E7O A; 1WXT A; 3L2V A; 4QVC A; 2DL4 A; 1WHG A; 2ENM A; 4A63 B; 2CP6 A; 1VQK T; 3N5B B; 4XTZ A; 2LZ6 B; 1K8A R; 1OV3 A; 3X26 B; 3TSW A; 3Q1J A; 5KYY A; 2YRV A; 1BYM A; 4E47 A; 1ZSZ A; 2EFI A; 4MMK A; 4BDY A; 1BKB A; 1GFD A; 1LCK A; 1RAG B; 5GMK m; 1LJO A; 3FDR A; 2KY9 A; 4AFQ C; 2DBM A; 1B34 A; 2CZ7 B; 3FB9 A; 1M9S A; 2COZ A; 2LNH B; 2DRM A; 4R55 A; 1VIF A; 5A0D A; 3KBG A; 3UAT A; 3SD4 A; 2DK3 A; 2XID A; 2DD4 A; 1C6V X; 4D8D A; 1J3T A; 2D0N A; 2K3Y A; 1Y07 A; 2L8D A; 2RJD A; 3P8H A; 2EGA A; 3P8D A; 4MDW A; 3CC4 T; 5HY6 A; 1Q82 U; 1TOV A; 2P0Q A; 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2KRS A; 4QKU A; 3JB9 D; 1Z9Z A; 1M2V B; 4MZM A; 5GAM d; 2L3Q A; 1ZUY A; 1I1J A; 4M7D E; 3JB9 J; 1MUZ A; 2RJE A; 5IN1 A; 2GFA A; 1QQJ A; 2IIM A; 1I07 A; 2AHJ B; 5CKD A; 3C12 A; 4M75 F; 5FRO A; 3M0R A; 3TQ7 P; 4ZGJ B; 4AT1 B; 2K3X A; 4DOW A; 1EX4 A; 2J05 A; 3M54 A; 1SHF A; 5GAN d; 3QO3 A; 3CCE A; 1M3C A; 2ZPH B; 3JB9 F; 4C92 G; 3VS1 A; 1VYV A; 2XG8 D; 4J9D A; 4OMN A; 5J3B A; 5IH2 A; 3JSC A; 1OOT A; 2RHU A; 4PFO A; 1NYG A; 4GBQ A; 2COW A; 2A28 A; 1AVZ C; 2JS0 A; 3C95 A; 4RG8 A; 1W4S A; 3RUX A; 1JBM A; 3JCM g; 2PZ1 A; 4AMC A; 4Z89 A; 1ZHI A; 1BI2 A; 4J6W A; 3V7R A; 3L2Z A; 4KRT A; 3H0F A; 2XK0 A; 1AWW A; 4LN2 A; 2CSI A; 4IUV A; 3PTA A; 2EYY A; 2K5I A; 1NG2 A; 1VQO Q; 2ZGW A; 5GAM j; 1H3H A; 3U23 A; 1X6G A; 4M77 A; 2E3H A; 2LP5 A; 8AT1 B; 1VA7 A; 2EVR A; 2K2M A; 6AT1 B; 4IIO A; 1VQL T; 5I22 A; 4N4H A; 2JM9 A; 2XHC A; 1BIB A; 3GBQ A; 4OF1 A; 2ZPB B; 3M4Y A; 2JUF A; 1IHW A; 2E1H A; 2DJZ A; 2MCN A; 3PNW C; 5GAN j; 2HKN A; 2VB6 A; 2NWM A; 4RKU E; 2QGF B; 4M75 B; 1KC8 U; 4QQD A; 2RHI A; 2FPF A; 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