The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
76
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structure length |
76
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Chain Sequence |
EGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of the PI3K SH3 domain and analysis of the SH3 family.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT SH3 DOMAIN
|
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
11
|
| structure length |
76
|
| sequence length |
76
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.1.137: Phosphatidylinositol 3-kinase. |
| pdb deposition date | 1994-03-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1AVZ C; 1QWE A; 3THK A; 2RQR A; 4J9H A; 1ZUU A; 2W10 A; 2XMF A; 1J3T A; 2EBP A; 3UA7 A; 5ECA A; 1WIE A; 1NEB A; 1GBQ A; 2HCK A; 1RLP C; 3M0R A; 4HVV A; 2EVR A; 2LZ6 B; 1OPK A; 5EC7 A; 2KT1 A; 2PNI A; 1PRL C; 2GQI A; 2KRN A; 2KRM A; 2ENM A; 3EG3 A; 4OMM A; 2O2O A; 3RNJ A; 4J9I A; 2FEI A; 2K9G A; 1SRL A; 1YN8 A; 2QDL A; 1TG0 A; 2A08 A; 1HSQ A; 1T0J A; 1UTI A; 2VKN A; 4WCI A; 1X2Q A; 2ABL A; 1AWJ A; 2JM9 A; 1GCQ A; 4JZ3 A; 3VS0 A; 4KRT A; 2DRM A; 5FW9 A; 1WDX A; 1GRI A; 2JS0 A; 1G83 A; 2LMJ A; 2NWM A; 2YUO A; 2A37 A; 4D8K A; 4FSS A; 2RQU A; 2DYB A; 2KXD A; 1QCF A; 2OI3 A; 3NHN A; 3ULR B; 1WXU A; 1JU5 C; 2DMO A; 2YDL A; 1NLP C; 3VS4 A; 1FYN A; 2LJ0 A; 1CKB A; 4LUD A; 1AWX A; 2YT6 A; 4LUE A; 1H3H A; 2DL8 A; 4IIM A; 4J9D A; 2P4R A; 1B3Q A; 2J06 A; 2DBM A; 1X6B A; 2FRW A; 2M0Y A; 2JMA A; 4K11 A; 1M8M A; 1A0N B; 1VYT A; 4Z8A A; 1KJW A; 1XOV A; 2EQI A; 3QWX X; 1GFD A; 1BB9 A; 1V1C A; 2EW3 A; 1T3S A; 1Z9Q A; 1AZG B; 5I11 A; 3H0H A; 1U3O A; 4J9G A; 1GCQ C; 2AKL A; 5IH2 A; 1JEG A; 1HJD A; 1ZBJ A; 2CH4 A; 4RTU A; 2L2P A; 2C0T A; 5IHK A; 3EHQ A; 4Z89 A; 2VVK A; 5IXB A; 4RTX A; 2DF6 A; 3NPF A; 2J6K A; 4RTZ A; 1BU1 A; 1EFN A; 2JMC A; 1CKA A; 2A36 A; 2EYY A; 1UDL A; 2KYB A; 2RF0 A; 3C0C A; 1WA7 A; 1JQQ A; 1PKT A; 1GFC A; 3TSW A; 2C0O A; 1VA7 A; 2OJ2 A; 1E6G A; 2RMO A; 4RTT A; 1GCP A; 2CSQ A; 2DBK A; 1X2K A; 2I0N A; 3EGU A; 2EGA A; 1YNZ A; 2K3B A; 3TSZ A; 1YCS B; 1ARK A; 4RTV A; 3U23 A; 2GBQ A; 4X1V A; 3FJ5 A; 2V1R A; 2GGR A; 4LE9 A; 2KRO A; 2F2X A; 1M27 C; 2CSI A; 1AZE A; 1QKW A; 2GNC A; 2D8H A; 2X3W D; 4HXJ A; 2YUQ A; 1AEY A; 1JO8 A; 2MOX A; 2YUP A; 1PKS A; 4J9B A; 3VS1 A; 1X69 A; 2SEM A; 1NLO C; 1ZUY A; 1YWP A; 4A63 B; 2DL4 A; 4AFU C; 2FO0 A; 1RLQ C; 2W0Z A; 2LCS A; 3TVT A; 1NYF A; 4OMQ A; 1SSH A; 2FPE A; 1YWO A; 1SPK A; 2EGC A; 2KRS A; 2KGT A; 2DVJ A; 3NGP A; 4OMO A; 4F14 A; 2EYX A; 3IQL A; 3UAT A; 1UJ0 A; 2J7I A; 3VS6 A; 1PWT A; 1SHG A; 4LNP A; 1ZSG A; 1WLP B; 1VYU A; 2HSP A; 2RQW A; 2LQN A; 2DL5 A; 2X3X D; 3JV3 A; 2KBT A; 2L3S A; 1OOT A; 2D0N A; 1E7O A; 3EHR A; 4OMN A; 2MIO A; 4HCK A; 1QKX A; 1NG2 A; 2ESW A; 1GL5 A; 4JJB A; 2EYZ A; 1I0C A; 4GLM A; 1I07 A; 4RUG A; 5I22 A; 1AD5 A; 3REA B; 1M3B A; 1WYX A; 1Y57 A; 2L3Q A; 3EG0 A; 2A28 A; 2LJ3 A; 2LNH B; 1QLY A; 3M0P A; 1S1N A; 2FG0 A; 4ZNX A; 1VYV A; 1MUZ A; 2LP5 A; 3VS5 A; 3M0U A; 1E6H A; 3H41 A; 3VRZ A; 3M0T A; 2JTE A; 2E5K A; 2NUZ A; 2EKH A; 1X27 A; 1Z9Z A; 2KT8 A; 1AOJ A; 2RQV A; 4J9F A; 2M51 A; 1X6G A; 3I35 A; 1SRM A; 1FMK A; 4JPB W; 3ZL7 C; 3SHW A; 1U06 A; 2RNA A; 3A98 A; 2DX1 A; 2KNB B; 4OMP A; 1M3A A; 2EPD A; 4ORZ A; 2DIL A; 2EGE A; 2LJ1 A; 3PVL A; 2J6F A; 2LQW A; 3NMZ C; 4DEX A; 5GJV B; 4GBQ A; 2ROT A; 1NEG A; 1TUC A; 2J05 A; 2ED1 A; 2CDT A; 2H8H A; 2PZ1 A; 1NYG A; 1WXB A; 1B07 A; 4LN2 A; 2RPN A; 3I5R A; 1T3L A; 2HDA A; 2MCN A; 1MV0 B; 4HVW A; 2JM8 A; 4OML A; 4CC7 A; 4JJC A; 1K76 A; 1PRM C; 2KE9 A; 1W70 A; 2FRY A; 1AWW A; 2C0I A; 2CRE A; 4EIK A; 2ROL A; 2DJQ A; 1UFF A; 4M4Z A; 1KFZ A; 1YP5 A; 3LH5 A; 2B86 A; 2KR3 A; 4E6R A; 1K9A A; 2ED0 A; 5IHI A; 3M0S A; 1PHT A; 3VRY A; 1UHF A; 2O31 A; 2DL3 A; 1JXM A; 2YSQ A; 3M0Q A; 4CC2 A; 1UG1 A; 2FPF A; 1NM7 A; 2L0A A; 2RQT A; 2CUB A; 1PNJ A; 4Z88 A; 1M3C A; 2AKK A; 1KIK A; 1UGV A; 2VWF A; 1I1J A; 3H0F A; 2AZS A; 3VS3 A; 2YUN A; 2BZY A; 2CT4 A; 3GBQ A; 1Y0M A; 1M30 A; 1T0H A; 1ZUK A; 4QT7 A; 1CSK A; 4CC3 A; 2DE0 X; 1N5Z A; 1UJY A; 1WX6 A; 1WXT A; 1X43 A; 1WI7 A; 3QWY A; 1LCK A; 1TUD A; 2O9V A; 2O88 A; 5GJW B; 1KSW A; 1MV3 A; 4HVU A; 2DL7 A; 1WFW A; 2JS2 A; 2BTT A; 1UHC A; 2V1Q A; 2AK5 A; 1UUE A; 1ABQ A; 2IIM A; 4AFQ C; 1BBZ A; 4AFZ C; 4F17 A; 1SHF A; 2O9S A; 4F16 A; 1RI9 A; 2CT3 A; 1HD3 A; 4CC4 B; 1IO6 A; 3R6N A; 4AG2 C; 4J9C A; 4IIO A; 2F2V A; 2JT4 A; 3SEM A; 1H8K A; 2ECZ A; 5FWB A; 4D8D A; 2DLP A; 2HEQ A; 1G2B A; 2PTK A; 4Y92 A; 2DA9 A; 2F2W A; 2D8J A; 2G6F X; 2D1X A; 4RTW A; 3VS7 A; 4JJD A; 1SEM A; 2BZX A; 3I5S A; 5IXF A; 4R0K A; 1U5S A; 5IHN A; 1QWF A; 2K7A A; 2RN8 A; 1K0S A; 1K4U S; 1AWO A; 3PVQ A; 5HCK A; 4AFS C; 2L3P A; 5FWC A; 1UE9 A; 1UEC A; 2KEA A; 2KXC A; 1H92 A; 3EG1 A; 2KYM A; 3REB B; 3H0I A; 1W6X A; 2SRC A; 2DM1 A; 2CUD A; 1ABO A; 1OV3 A; 2JXB A; 2GTJ A; 1RUW A; 2EYW A; 2AZV A; 4AG1 C; 3RBB B; 1K0X A; 3VS2 A; 3KFV A; 3CQT A; 1GBR A; 2K2M A; 3UA6 A; 2BZ8 A; 4J9E A; 2JW4 A; 1OPL A; 4RTY A; 1OEB A; 2DNU A; 2OAW A; 1JXO A; 1W1F A; 4JZ4 A; 3O5Z A; 2K6D A; 4ESR A; 2GTO A; 2J6O A; 3PE0 A; 2CH4 W; 3EG2 A; 2DRK A; 4DEY A; 1K1Z A; 1BK2 A; 2FPD A; 3UF4 A; 1ZLM A; 3I9Q A; 5L23 A; 2LX7 A; 1ZX6 A; 2HBW A; 2K79 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1AVZ C; 1QWE A; 3DB3 A; 5HK3 A; 3CXC A; 4BI8 B; 2JUF A; 4J9H A; 2MYS A; 2XMF A; 2EBP A; 1VIE A; 5ECA A; 1NEB A; 2QQB A; 2HCK A; 3M0R A; 2EVR A; 3BE3 A; 2IG0 A; 1FMW A; 2PNI A; 2X4J A; 2GQI A; 3OYM A; 3EG3 A; 3TQ7 P; 2QA4 Q; 2O2O A; 2FEI A; 4XAX B; 4PJL A; 3ZFJ A; 2DXT A; 2HKN A; 1YN8 A; 2QA4 A; 2Z0W A; 1T0J A; 1X2Q A; 2JM9 A; 4J7F A; 3L2U A; 4A4K A; 5IAY A; 2F5K A; 2DD5 A; 2P0K A; 4PJJ A; 2G3R A; 3QDR B; 1RAE B; 5J39 A; 3P8D A; 3QII A; 1Q7Y U; 1IRE B; 3QZ5 B; 2OI3 A; 3OYI A; 3QUI A; 1XQH A; 4N4H A; 3EH2 A; 2EKO A; 4OGE A; 2E70 A; 2EQJ A; 2YT6 A; 4E7K A; 4IIM A; 1NJI C; 3E2U A; 3MP8 A; 3RER A; 2FB7 A; 1VQP T; 3WVD B; 4M7A A; 1VYT A; 2CZ1 B; 1M1G A; 3S3M A; 1Q81 R; 1XOV A; 3QWX X; 1MHN A; 1V1C A; 1WJQ A; 1T3S A; 1TTH B; 1AZG B; 1YJN A; 1SG5 A; 3PTA A; 4V2S A; 3N5B B; 3QYG B; 5IHK A; 3EHQ A; 3CCS A; 3HFN A; 4E7L A; 3OYK A; 2Y4X A; 3NPF A; 2VYT A; 2KDS A; 4RTZ A; 1UDL A; 4FSX A; 3G71 Q; 2FZK B; 4LDV A; 4O6J A; 1JQQ A; 2C0O A; 2MAM A; 2YRV A; 1VQM Q; 2RMO A; 5CR2 A; 4RTT A; 1VQ4 Q; 4C0D C; 2E65 A; 1VQM A; 2I0N A; 3EGU A; 2EGA A; 5A2Q E; 3M53 A; 1VQ4 A; 3TSZ A; 3UDC A; 1YCS B; 4E7I A; 1ARK A; 3HTR A; 3U23 A; 4RG2 A; 4BAC A; 5I21 A; 3OYE A; 4X1V A; 3FJ5 A; 2KRO A; 3CCR Q; 3EFO A; 2RJE A; 4DBR A; 2QA4 T; 3FRN A; 3FJP A; 1AZE A; 1QKW A; 2GNC A; 2X3W D; 4HXJ A; 1BI1 A; 1TWB A; 2MOX A; 1PKS A; 2L3R A; 1RAF B; 1X69 A; 1ZUY A; 4E7S A; 1M8V A; 4C0F A; 2DL4 A; 4AFU C; 5GAO l; 4CRI A; 1RLQ C; 2LCS A; 1NYF A; 3M55 A; 2FPE A; 4UC4 A; 3NGP A; 3CC7 Q; 4BE0 A; 2RHU A; 2F1L A; 3GP8 A; 3CC7 A; 2AIR B; 3JCM h; 5GMK j; 3RUX A; 1S72 Q; 2E5Q A; 2J7I A; 1PWT A; 2AHJ B; 4FT4 A; 1SHG A; 4LNP A; 4C0G A; 3QHS A; 1M1F A; 1KD1 C; 2HSP A; 2RQW A; 3OS1 A; 2LQN A; 2DL5 A; 1SKU B; 1B34 A; 1UEB A; 1F1B B; 2D0N A; 2PQW A; 4OMN A; 2PUK B; 4MDX A; 4HCK A; 1NPR A; 3X24 B; 1Q7Y R; 3A8H B; 1N9S A; 5CKD A; 5CQX A; 3M4Y A; 5I22 A; 4J6X A; 1WGS A; 3AHU A; 3ME9 A; 1M3B A; 1KC8 C; 1Y57 A; 1Q86 C; 3EG0 A; 5LL6 S; 2LNH B; 1NJI U; 1LNX A; 1S1N A; 5GMK i; 2FG0 A; 1VYV A; 4IUR A; 2RHZ A; 1E6H A; 3JCM b; 1NBE B; 3M0T A; 4LD6 A; 2JTE A; 1AHJ B; 2NUZ A; 3HP9 A; 1AOJ A; 2RA2 A; 3G71 T; 3FIF A; 4PJO C; 3C95 A; 2E3I A; 1I5L A; 1VQM T; 3DB4 A; 1VQ4 T; 3RDV A; 3ZL7 C; 2RNA A; 2DEQ A; 5KYU B; 3L1A A; 4FL6 A; 2FL7 A; 2RI2 A; 3JCM X; 3EGD B; 2DIL A; 2MWP A; 5L8R E; 2LX9 A; 3VKI A; 1VOM A; 3CCR T; 2EGE A; 3JCM d; 5LJ5 h; 2J6F A; 1D09 B; 4DEX A; 3JCM e; 4M75 B; 2E1H A; 4C92 D; 1QVF A; 5GAN h; 2DEU A; 2PZ1 A; 2WAC A; 4ATO A; 4LN2 A; 2RO0 A; 2RPN A; 3CMA Q; 2JM8 A; 4OML A; 2QAS A; 1K76 A; 1BYM A; 3CMA A; 2VUB A; 1PRM C; 4J83 A; 3CC7 T; 1W70 A; 2CRE A; 2DJQ A; 3E1S A; 4M4Z A; 1S72 T; 3MEU A; 1KFZ A; 4YTL A; 3HHT B; 4M7A D; 1C0M A; 1PHT A; 1MMD A; 2O31 A; 2ZZD A; 3JAM E; 3CPW A; 1M1K C; 2L0A A; 5CKF A; 4J7I A; 1M3C A; 1FWZ A; 1G8X A; 3RR6 A; 5GMK m; 3OYA A; 3CBM A; 3VS3 A; 2YUN A; 1KD1 U; 1T0H A; 3A5Z B; 4EPC A; 1K73 C; 4MZM A; 3LLR A; 1M2V A; 3QJY A; 4N0A C; 4CC3 A; 1W4S A; 2V8I A; 1UJY A; 4IUV A; 5KH6 A; 4KGZ B; 4C5G A; 3CME Q; 4F7U B; 5GAO r; 3LWH A; 1N27 A; 3EGX B; 5D6Y A; 1KQS A; 3G7Z A; 1KC8 U; 2OTL Q; 1Q86 U; 1UHC A; 2AK5 A; 1Y96 B; 1ABQ A; 1X01 A; 5A0G A; 2JOY A; 2OTL A; 3EG9 B; 1NJI R; 1WQ7 A; 4O5V A; 1SHF A; 4FW1 A; 1YI2 Q; 1RI9 A; 2CT3 A; 5GAN d; 1YI2 A; 2X51 A; 1HD3 A; 3GIB A; 4FU6 A; 1W2B S; 3V8J A; 1VQN Q; 2MK5 A; 1FXX A; 2ECZ A; 3G6E Q; 2NUT A; 4TVR A; 2F69 A; 1VQ5 A; 4EMK C; 4Y92 A; 1VQN A; 3L2Z A; 3G6E A; 2G6F X; 4Y91 A; 2DIG A; 3SFM A; 3OYL A; 2RN8 A; 3M9Q A; 2XDB A; 3TRE A; 2HSE B; 3RMQ A; 1RI0 A; 1VQ9 Q; 4ZGJ B; 3CMA T; 5DM7 R; 2L3P A; 1UE9 A; 4JRK A; 1VQ9 A; 2E6Z A; 4RCB A; 5J3B A; 3EG1 A; 2DO3 A; 3REB B; 3H0I A; 3VV0 A; 7AT1 B; 2P0Q A; 4E47 A; 3VYG A; 2DM1 A; 1JJ2 S; 3Q1J A; 2GTJ A; 1ACM B; 2EYW A; 3GOX A; 2AZV A; 1UGP B; 4ELZ C; 1OQK A; 4C92 G; 4X9D A; 1K0X A; 1UGR B; 3JB9 G; 2EQM A; 3GLX A; 1GBR A; 3OA6 A; 1OZ3 A; 2K2M A; 3UA6 A; 4BI4 A; 3J81 E; 1G3W A; 2IVW A; 1VQL Q; 4C8Q B; 4QKU A; 5A0L A; 3ZEH A; 3PIO A; 1M1K U; 2GTO A; 4M77 B; 2QYZ A; 3MKD A; 2CH4 W; 2DYI A; 3CME T; 4DQ2 A; 1IGU A; 4M7A G; 1BK2 A; 3SDZ A; 2FPD A; 4XTZ A; 2MI6 A; 3VYH B; 1KD1 R; 5DLO A; 4BB7 A; 1M9S A; 1ZLM A; 1K73 U; 2XKO C; 2OTL T; 1I5O B; 2X9H A; 1ZX6 A; 2HBW A; 3V7C A; 2P0P A; 3LYI A; 2L5Q A; 2RQR A; 2X4X A; 1YI2 T; 3L2R A; 2COZ A; 4M78 A; 1ZUU A; 4JRI A; 4IKF A; 4XTU A; 4Q5W A; 1RLP C; 1KC8 R; 4HVV A; 3VUB A; 4C8Q C; 1Q86 R; 2MPX C; 4OB3 B; 5KYY B; 5GAM h; 1VQ5 T; 1VQN T; 2CZ0 B; 1PRL C; 4OMF B; 3G6E T; 4F7U A; 2ENM A; 4FYX B; 1TUG B; 3RNJ A; 4OGC A; 1D3B B; 4WCI A; 2L8D A; 4OF1 A; 1AWJ A; 8AT1 B; 1GCQ A; 3SWN B; 4Y28 E; 3VS0 A; 1VQ9 T; 1LOJ A; 1GRI A; 1ZSZ B; 2NWM A; 2COW A; 1WHM A; 3OS5 A; 4FSS A; 2DYB A; 3BW1 A; 2QGF B; 3NHN A; 2CGH A; 3CPF A; 1WXU A; 3OYB A; 2YDL A; 1QVF P; 1NLP C; 3VS4 A; 2VAS A; 5FU6 C; 2HL3 A; 4LUE A; 1H3H A; 1B3Q A; 2DBM A; 1X6B A; 4K11 A; 1A0N B; 2RK2 A; 2A0F B; 2DXC A; 5CKH A; 1GFD A; 4HCZ A; 1RAG B; 1WPY A; 5AT1 B; 1Z9Q A; 1ZSZ C; 2DXU A; 1VQL T; 4M7D B; 4WF2 A; 2RI3 A; 5IH2 A; 1JEG A; 1HJD A; 4DBF A; 5EG2 A; 1WHJ A; 5KYX A; 5LJ5 j; 3CPW P; 2VVK A; 5GAM d; 4RTX A; 2DF6 A; 2XG8 D; 2EYY A; 2JMC A; 2K5I A; 4PFO A; 5GAN j; 5GAN 5; 2EJ9 A; 1M90 C; 2HQE A; 3CCV Q; 5KE3 A; 1M1K R; 3LGL A; 3EH1 A; 3GF5 A; 2D0Q B; 3TSW A; 1VA7 A; 1QCO A; 3A1P A; 1E6G A; 1QCN A; 1GCP A; 2CSQ A; 2DBK A; 4JLG A; 2PUO B; 2K3B A; 1K73 R; 1LPL A; 4HT8 A; 4E7Z A; 1KQS P; 1D0Y A; 2V1R A; 3MP6 A; 2GGR A; 4LE9 A; 5D7U A; 4M7A E; 1EX4 A; 1WHL A; 4QVZ A; 2CSI A; 1MNE A; 2YUP A; 4J9B A; 2CZ6 B; 2SEM A; 1NLO C; 1YWP A; 3OSV A; 3C12 A; 4NOY A; 3CCU Q; 2CP2 A; 3OYC A; 3L2W A; 2M16 A; 3F70 A; 4RMO A; 2K5F A; 3TVT A; 2E64 A; 3CCU A; 5HK0 A; 2D9T A; 3NTH A; 2H3E B; 5AYF A; 4M75 D; 3M56 A; 1BCM A; 5I2M A; 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