The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
86
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structure length |
86
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Chain Sequence |
GSMSAEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEAKPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| source organism |
Bos taurus
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| publication title |
Solution structure and ligand-binding site of the SH3 domain of the p85 alpha subunit of phosphatidylinositol 3-kinase.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT SH3 DOMAIN
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| total genus |
6
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| structure length |
86
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| sequence length |
86
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1993-07-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4JPB W; 2LMJ A; 1ZUK A; 2FPD A; 3LH5 A; 2XMF A; 1WXB A; 2PNI A; 2FG0 A; 2LCS A; 2HBW A; 1ZLM A; 1AWX A; 3QWY A; 2LJ3 A; 2X3W D; 2CSI A; 4J9H A; 1Z9Q A; 2CT3 A; 3SEM A; 2LX7 A; 1JXO A; 1Z9Z A; 1VYT A; 4JZ3 A; 1KIK A; 1OPK A; 2KE9 A; 2DF6 A; 4HCK A; 2EW3 A; 3EG3 A; 2CH4 A; 1RI9 A; 4DEY A; 1AWW A; 3ULR B; 1W6X A; 1AEY A; 4RTU A; 2CH4 W; 3H0I A; 3R6N A; 1YN8 A; 2K9G A; 5FWB A; 3I5S A; 1PRL C; 2FRW A; 2KGT A; 2MCN A; 2JTE A; 2O31 A; 2OI3 A; 2J05 A; 1WYX A; 1QKW A; 2EYW A; 2FO0 A; 2EYY A; 5ECA A; 1VYV A; 4M4Z A; 4LE9 A; 2DJQ A; 2DMO A; 1GCQ A; 2EBP A; 3EG1 A; 4RTV A; 1SSH A; 1AZE A; 1CKB A; 2J06 A; 4D8D A; 1OOT A; 2RNA A; 1M3A A; 1PHT A; 4RTY A; 2RQR A; 1M3B A; 1YWP A; 4AFU C; 3M0T A; 3NPF A; 2AZS A; 1E7O A; 1NYG A; 4Z8A A; 2IIM A; 4F14 A; 1FMK A; 2LNH B; 2LJ1 A; 1M8M A; 1GCQ C; 2KBT A; 1FYN A; 2DNU A; 1OPL A; 1WI7 A; 2M51 A; 3RNJ A; 2K79 A; 2JS2 A; 2KRS A; 2SEM A; 2KEA A; 4HVU A; 3RBB B; 2HCK A; 4CC4 B; 2O9V A; 3I5R A; 2V1R A; 2JT4 A; 3M0Q A; 1MV3 A; 2BZY A; 1E6H A; 2O88 A; 1GL5 A; 1X6B A; 2EGA A; 2A36 A; 4OMN A; 4Y92 A; 2K6D A; 1I0C A; 2D1X A; 1WXT A; 3REB B; 2LZ6 B; 1ABQ A; 2KT1 A; 1I07 A; 4JJC A; 5EC7 A; 2H8H A; 2YUP A; 3EG2 A; 1S1N A; 3NGP A; 3UAT A; 2GGR A; 1K4U S; 4LNP A; 2CSQ A; 1T0J A; 1T0H A; 4EIK A; 1ZBJ A; 2JXB A; 1X43 A; 2JS0 A; 2JW4 A; 2O9S A; 4GLM A; 1SHG A; 1U3O A; 2ROL A; 3TSZ A; 1M3C A; 1K1Z A; 1I1J A; 2EYZ A; 2K7A A; 1KSW A; 4OMP A; 1UDL A; 1AZG B; 1H3H A; 3M0P A; 1BK2 A; 2RQW A; 3SHW A; 2YT6 A; 1UE9 A; 2GNC A; 1BU1 A; 2RQV A; 2CUB A; 3EHR A; 2KXC A; 2YUO A; 1LCK A; 2BTT A; 4OML A; 1X27 A; 3UA6 A; 1WXU A; 4IIO A; 2GTJ A; 4K11 A; 4HVW A; 4HVV A; 1SRL A; 4CC7 A; 1VA7 A; 2A08 A; 2F2V A; 4AFZ C; 3ZL7 C; 1CKA A; 1HSQ A; 2W10 A; 3TSW A; 1RUW A; 1RLP C; 2L3S A; 4AFQ C; 3I35 A; 4J9G A; 3REA B; 4AFS C; 4J9C A; 1QCF A; 1SRM A; 5FW9 A; 2RPN A; 4OMQ A; 3GBQ A; 1GRI A; 3PVL A; 3FJ5 A; 4ORZ A; 2KRO A; 1T3S A; 1WX6 A; 5I22 A; 3IQL A; 1PKS A; 2V1Q A; 2VVK A; 2DE0 X; 5IH2 A; 4Z89 A; 2C0I A; 3VRZ A; 1JEG A; 3NMZ C; 1QWF A; 1JQQ A; 1Y57 A; 2EPD A; 3VS2 A; 1U5S A; 2NUZ A; 3VS4 A; 1TG0 A; 3VS1 A; 4JJD A; 3VRY A; 3VS7 A; 2LQN A; 2LJ0 A; 4LUE A; 4ZNX A; 4HXJ A; 1X2Q A; 2DL7 A; 1ARK A; 2J6F A; 2ESW A; 1ZX6 A; 2O2O A; 2VKN A; 2EGC A; 1MUZ A; 1UJ0 A; 1M30 A; 1PRM C; 2DA9 A; 5IHN A; 1UG1 A; 1SPK A; 1XOV A; 2ECZ A; 2HEQ A; 2DRM A; 4IIM A; 1MV0 B; 2RF0 A; 3QWX X; 1GBR A; 2A28 A; 2K3B A; 4X1V A; 1GCP A; 3UF4 A; 2YUQ A; 5IXF A; 2QDL A; 3JV3 A; 2AKK A; 2DBK A; 2DM1 A; 1IO6 A; 4J9D A; 4F16 A; 3I9Q A; 5GJV B; 1CSK A; 1KJW A; 2AZV A; 4J9I A; 2JM8 A; 2AK5 A; 2CT4 A; 1UUE A; 2YDL A; 2YUN A; 3PE0 A; 2L0A A; 1JO8 A; 2KT8 A; 5GJW B; 1OV3 A; 2OAW A; 1NEG A; 1K0S A; 2D8H A; 3VS0 A; 2ENM A; 1TUD A; 1YNZ A; 1WA7 A; 4LN2 A; 1TUC A; 3H0F A; 4RTX A; 2JMC A; 1G83 A; 4CC3 A; 3NHN A; 5IHI A; 2AKL A; 2J6K A; 4FSS A; 2D8J A; 2M0Y A; 1Y0M A; 4DEX A; 1B07 A; 2HSP A; 2P4R A; 2JMA A; 2FEI A; 3U23 A; 1K76 A; 1NLO C; 2YSQ A; 1E6G A; 4J9E A; 2DX1 A; 2X3X D; 2F2W A; 1WLP B; 2PZ1 A; 3VS3 A; 4AG1 C; 1W1F A; 2EVR A; 1OEB A; 1PKT A; 4J9B A; 3C0C A; 1H8K A; 1UHC A; 2DLP A; 4RTW A; 2CRE A; 2NWM A; 1NLP C; 2DL5 A; 3M0U A; 3VS6 A; 4RTZ A; 3H0H A; 1N5Z A; 3M0R A; 4AG2 C; 1AWO A; 1YP5 A; 1WFW A; 2DRK A; 2EYX A; 4JZ4 A; 1YWO A; 2ROT A; 1JU5 C; 1ZSG A; 1A0N B; 4QT7 A; 1RLQ C; 5I11 A; 4Z88 A; 2L3Q A; 1EFN A; 4F17 A; 2RQU A; 2SRC A; 2KRM A; 1AD5 A; 1PWT A; 2DL3 A; 2FRY A; 3M0S A; 3H41 A; 4J9F A; 1V1C A; 2B86 A; 4RTT A; 1AVZ C; 4E6R A; 3THK A; 1GBQ A; 2C0T A; 2CUD A; 2J6O A; 1U06 A; 2PTK A; 2W0Z A; 1NM7 A; 1M27 C; 4LUD A; 3VS5 A; 2ED1 A; 1JXM A; 2KR3 A; 1QWE A; 1NG2 A; 1X69 A; 2RN8 A; 1K0X A; 1X2K A; 2EQI A; 1ZUU A; 4WCI A; 2GQI A; 2D0N A; 2RMO A; 1GFD A; 3EGU A; 2FPE A; 2G6F X; 1UJY A; 2DL8 A; 5L23 A; 5HCK A; 1X6G A; 2J7I A; 4OMO A; 1K9A A; 1GFC A; 1YCS B; 1VYU A; 1NYF A; 2K2M A; 2FPF A; 5FWC A; 2RQT A; 2KRN A; 2KNB B; 1BBZ A; 4ESR A; 2A37 A; 2BZ8 A; 2MIO A; 4KRT A; 2DYB A; 1BB9 A; 2CDT A; 2EGE A; 2MOX A; 1UEC A; 1UGV A; 4JJB A; 3UA7 A; 2L2P A; 2ED0 A; 2F2X A; 1QLY A; 2DL4 A; 1PNJ A; 3A98 A; 2DIL A; 1G2B A; 4OMM A; 1ZUY A; 2DVJ A; 1KFZ A; 4CC2 A; 1AWJ A; 5IXB A; 1UFF A; 1W70 A; 1ABO A; 1SHF A; 2BZX A; 1B3Q A; 3EG0 A; 5IHK A; 1H92 A; 2E5K A; 1AOJ A; 2I0N A; 2OJ2 A; 2HDA A; 4A63 B; 2GTO A; 2EKH A; 1QKX A; 3EHQ A; 4R0K A; 1HJD A; 2KXD A; 4GBQ A; 1T3L A; 2LQW A; 3KFV A; 2DBM A; 3TVT A; 1NEB A; 1J3T A; 1WIE A; 1WDX A; 1SEM A; 4D8K A; 2KYB A; 2L3P A; 1UTI A; 1UHF A; 3O5Z A; 3PVQ A; 2LP5 A; 1HD3 A; 2C0O A; 2VWF A; 4RUG A; 3CQT A; 2GBQ A; 2JM9 A; 2KYM A; 2ABL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4FL6 A; 1LPL A; 4JPB W; 1I5L A; 4M77 E; 3L2Z A; 3ZEH A; 3OMC A; 2LCS A; 2HBW A; 3P8D A; 4L6V 5; 3VV0 A; 3S3M A; 3RKX A; 1ZLM A; 3N5B B; 3CCL T; 2K57 A; 4ELY C; 3OW2 S; 1Z9Q A; 2QTV A; 2DTI A; 5LJ3 e; 2CT3 A; 1RAD B; 2CP2 A; 2LX7 A; 2HBP A; 5GAM j; 1GXI E; 2DF6 A; 2F1L A; 1AWW A; 4PLL A; 4XK8 E; 5AYF A; 1K8A U; 3QXE B; 5FWB A; 1PRL C; 2KGT A; 1M9S A; 2Z0W A; 2OAU A; 2J05 A; 1WYX A; 5ECA A; 1VYV A; 4LE9 A; 2FVU A; 2DJQ A; 4KT0 E; 1QP2 A; 3ER0 A; 1KD1 U; 3GP8 A; 5LJ5 h; 3OY9 A; 3VYG A; 5CVI A; 4AT1 B; 4RTV A; 3FEO A; 5GAM f; 1CKB A; 2BE9 B; 2J06 A; 3CCU Q; 1YJ9 Q; 2RQR A; 4C92 A; 4XQ3 A; 1OX9 A; 1M3B A; 3M0T A; 1FMK A; 1M8M A; 1GCQ C; 1OPL A; 2PU9 B; 1KC8 U; 2FL7 A; 3HRU A; 2VC8 A; 2EJF A; 3L42 A; 2K79 A; 1M1G A; 2DD4 A; 4C92 E; 4JRI A; 3RBB B; 1RAH B; 2HCK A; 2O9V A; 3JSC A; 1VQ6 Q; 2O88 A; 1IRX A; 5I2M A; 3EFR A; 3SFM A; 2A36 A; 4C92 F; 2FZC B; 3L2R A; 4OB1 B; 1LNX A; 1WXT A; 2RHU A; 1ABQ A; 3V7C A; 5CO7 A; 3SWN B; 2WSF E; 1S1N A; 3NGP A; 2E65 A; 2QEX A; 2A7Y A; 3AHU A; 3PMI A; 2Y4X A; 4M7A C; 4PFZ A; 4R55 A; 3UWN A; 3E9G A; 1SHG A; 2ROL A; 5GAN g; 1VIE A; 3MEU A; 1C0M A; 2QAS A; 3RIR A; 4F7U B; 2MMP A; 2XU8 A; 1YFN A; 4BAC A; 2O4X B; 1H3H A; 2YRD A; 3SB2 A; 5GAN d; 2GNC A; 2RQV A; 2HKN A; 4DA4 A; 2Y4Y A; 2YUO A; 1BIA A; 4OML A; 3M5A A; 4JS4 A; 4HVW A; 4XTZ A; 2K5F A; 2A08 A; 2RI5 A; 1VQ4 Q; 2QGG A; 3I55 Q; 2QYZ A; 2R5A A; 4FSX A; 1B34 B; 2W10 A; 5A0D A; 2Y90 A; 4OMF B; 3UPU A; 1NZ9 A; 1QVG A; 1VQ8 Q; 4BY6 C; 1SSF A; 3J81 E; 2JZ2 A; 3JAM E; 1M90 C; 5DLQ E; 1QCF A; 2AIR B; 2RPN A; 3EGX B; 3NTH A; 5IN1 A; 3QZ9 B; 1QVP A; 2M02 A; 2DXC A; 2V8I A; 4EMK C; 1GRI A; 3PVL A; 2KAF A; 3KUF A; 1MHN A; 4N4G A; 1T3S A; 3E2U A; 1X75 C; 3NTK A; 2D0Q B; 5IH2 A; 3VRZ A; 3OYA A; 2JNG A; 1OUL A; 3JB9 J; 1JQQ A; 2A3L A; 2XID A; 2NUZ A; 1DJ7 B; 4LXC A; 3VS1 A; 3QII A; 1VQ9 Q; 4LUE A; 4ZNX A; 4EDU A; 4DBR A; 1AHJ B; 2RK1 A; 4FT2 A; 2J6F A; 1TOV A; 2RJD A; 1R8O B; 3JB9 F; 1BYM A; 1Y71 A; 4IIM A; 2RF0 A; 2A28 A; 1SF9 A; 2YUQ A; 1M2O A; 2G3R A; 4ZN1 A; 2DM1 A; 1D3B B; 1CSK A; 4F7U G; 3CCU A; 2AZV A; 3D7S B; 2KK4 A; 2JM8 A; 1YJ9 A; 1JB0 E; 2AK5 A; 3OYJ A; 2JJ9 A; 1PC0 A; 2YUN A; 3URG A; 1JJ2 A; 1WHM A; 2D6F A; 4FU6 A; 3VS0 A; 3C4S A; 1KQS S; 3UT1 A; 3LYI A; 4LN2 A; 2L5Q A; 1KHI A; 2JUF A; 4JLG A; 5KYW A; 4CC3 A; 3NHN A; 2E3H A; 2HL3 A; 5IHI A; 2CZ7 B; 2DO3 A; 4FSS A; 1M1K C; 2D8J A; 1VQ6 A; 3M4G A; 2ZPF B; 1B07 A; 2B8A A; 2P84 A; 3VUB A; 3U23 A; 2QQB A; 2YSQ A; 4J9E A; 1WLP B; 3CCM T; 3VS3 A; 4IUQ A; 1RAF B; 2EVR A; 3FB9 A; 3RER A; 1OEB A; 2X4W A; 2GFA A; 1H8K A; 1WJQ A; 3OYY A; 4RTW A; 3JCM f; 2CRE A; 3PIO A; 2HSE B; 2PVG B; 3RUX A; 3M0R A; 1AWO A; 3HP9 A; 3I56 T; 2ROT A; 4QVC A; 4MZM A; 3CCL Q; 1FMV A; 4QT7 A; 1D0Y A; 3ZFJ A; 3P8B B; 3F70 A; 4PJL A; 1QW1 A; 3OW2 P; 9ATC B; 1G3S A; 3QKJ A; 1HXD A; 2QGF B; 3HKS A; 1V1C A; 3MKD A; 4ZN3 A; 4RTT A; 1AVZ C; 1WJS A; 3MP8 A; 3DB3 A; 2XKO C; 3FDR A; 1QCN A; 1MMA A; 4NOY A; 4C8Q F; 4M7D A; 3G4S Q; 3QDF A; 1YJ9 T; 2JTM A; 3EH1 A; 1Q82 C; 2KR3 A; 1VQ4 A; 1QWE A; 1F1B B; 3I55 A; 1NG2 A; 2DIQ A; 3JCM X; 4NL2 A; 2KQW A; 5GAN e; 2EQI A; 4ELZ C; 1VQ8 A; 1ZUU A; 4FYV B; 5A0L A; 4M7D E; 2RMO A; 4JLI A; 4BUG A; 2ZPI B; 4HT8 A; 4HCB A; 1UJY A; 4C0Z A; 5HCK A; 1Q82 R; 2HQX A; 1X6G A; 4OMO A; 1ZSZ A; 1GFC A; 1NYF A; 2K2M A; 2FPF A; 2FZG B; 5GMK i; 5KH6 A; 2KRN A; 1AT1 B; 2A37 A; 2MIO A; 7AT1 B; 4JS5 A; 1Y96 A; 1UEC A; 2F2X A; 1QLY A; 2A0F B; 1K73 R; 2DIL A; 4CRI A; 4L59 A; 3JCM W; 1KK7 A; 4J5Y A; 4PJO F; 1VQ9 A; 1NJI C; 3TRE A; 2HAX A; 3LGL A; 1W2B S; 1W70 A; 1FX7 A; 1SHF A; 2YLB A; 5L8R E; 3CXC P; 3FIF A; 2I0N A; 5I2S A; 1VQK Q; 2O01 E; 2GTO A; 4VUB A; 4C8Q G; 2QK0 A; 4R0K A; 3WVE B; 4BY6 B; 2CYZ B; 4LDV A; 1J3T A; 1M1F A; 3ASK A; 4FM4 B; 1YIT Q; 3FC3 A; 5GAN 2; 5KCH A; 2L3P A; 3MEA A; 4GLK A; 3KBG A; 6AT1 B; 1BI3 A; 1VQ4 T; 2LQ8 A; 3G6E Q; 5GMK j; 4E7J A; 2NUP B; 3OYK A; 2FPD A; 1VQ8 T; 1K9M C; 1M2V A; 4NL3 A; 1IHW A; 4QW2 A; 2YLC A; 2X3W D; 2CSI A; 4J9H A; 2GF7 A; 1NBE B; 3SEM A; 1VYT A; 5KYY B; 3EFO A; 2ZPE B; 1OPK A; 4HCK A; 4ZTF A; 4XU0 A; 2EW3 A; 3EG3 A; 2CH4 A; 4DEY A; 1UGS B; 1W6X A; 3C12 A; 5GMK l; 4QQG A; 3R6N A; 1YN8 A; 3BDU A; 1Y7X A; 2O31 A; 4EPC A; 2OI3 A; 3TCJ A; 2EYQ A; 3CCE Q; 2XIC A; 4PLI A; 3OB9 A; 1VQ9 T; 2X4J A; 2LDM A; 1NJI U; 2R5M A; 2P0Q A; 4J83 A; 4E7L A; 2X35 A; 2HL5 C; 2EBP A; 3EG1 A; 3CCL A; 1SSH A; 1AZE A; 4C0D C; 3HFO A; 3MPU B; 2C06 A; 1OOT A; 2RNA A; 1OU9 A; 1PHT A; 4RTY A; 2XD0 A; 5KYX A; 2LC4 A; 1YWP A; 3CPW A; 1E7O A; 2KY9 A; 4F14 A; 2KBT A; 1FYN A; 5HK3 A; 3G4S A; 4J6X A; 4OF1 A; 1U1T A; 2DXB A; 3T9N A; 2JS2 A; 1WPY A; 2X51 A; 2KEA A; 4C92 D; 5LJ5 j; 4HVU A; 2I2L A; 1TU0 B; 3I5R A; 4ANJ A; 2V1R A; 2JT4 A; 1MMG A; 1MV3 A; 2BZY A; 4IUP A; 5GMK h; 1GL5 A; 4BI8 B; 3A8G B; 2XK0 A; 2EGA A; 1M4Z A; 2CP7 A; 4X9C A; 4Y92 A; 2K6D A; 1I0C A; 4M75 F; 2D1X A; 1G8X A; 1JRI A; 2E4H A; 2KT1 A; 2RJE A; 3OYN A; 3A8H B; 1RAB B; 2H8H A; 2YUP A; 3MHX A; 4KUL A; 3CME T; 1PM3 A; 1K8A R; 2DEQ A; 2JXB A; 3DLM A; 1YHQ T; 3JB9 H; 3GIB A; 2O9S A; 3PGG A; 4XAX B; 2GQV A; 2EJ9 A; 2K2V A; 5A0G A; 1PCX A; 5LJ5 f; 2LT4 A; 1KQS P; 1UDL A; 1AZG B; 1TUG B; 2NLU A; 1UE9 A; 3OBW A; 1D0Z A; 2CUB A; 1LOJ A; 1VQK A; 3SD4 A; 3UA6 A; 4M77 F; 5HKC A; 3CCM Q; 2LX9 A; 3QO3 A; 4HVV A; 1SRL A; 1RI0 A; 2F2V A; 2EAY A; 3ZL7 C; 1QP3 A; 4TVR A; 4UC4 A; 2DYI A; 3TSW A; 1RUW A; 1YIT A; 4GY5 A; 2L3S A; 4FCY A; 1FWZ A; 4RG8 A; 2FHD A; 3G4S T; 4J6Y A; 3REA B; 4J9C A; 1SRM A; 3I56 Q; 3SDZ A; 3G6E A; 3GBQ A; 1U1S A; 4M75 G; 2KRO A; 4MDW A; 1Q7Y R; 4FYY B; 4C8Q C; 1WX6 A; 2HZY A; 1YIJ Q; 1G3W A; 2C0I A; 4Z02 A; 2RI3 A; 2DTO A; 3H6Z A; 4C92 B; 1Y57 A; 2EPD A; 3VS2 A; 4BD3 A; 3V8J A; 3VS7 A; 2LQN A; 4IKF A; 3JB9 D; 1WZO A; 1X2Q A; 1XNI A; 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