The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3CCV Q; 1VQM Q; 1VQ7 Q; 1Q7Y R; 1Q81 R; 1VQ5 Q; 1W2B P; 3CCR Q; 1YHQ Q; 1Q86 R; 1VQ9 Q; 1S72 Q; 1VQO Q; 1VQP Q; 3CCL Q; 3CCQ Q; 1K73 R; 1M1K R; 1KQS P; 2OTL Q; 3G4S Q; 1JJ2 P; 3G6E Q; 3G71 Q; 1VQ8 Q; 1M90 R; 1VQ6 Q; 1YJ9 Q; 1N8R R; 2QA4 Q; 1KD1 R; 3CXC P; 2OTJ Q; 2QEX Q; 3CME Q; 1QVF P; 3OW2 P; 3CC7 Q; 3CCU Q; 1NJI R; 1YJN Q; 3I55 Q; 3CCJ Q; 3CCS Q; 1YIT Q; 1K9M R; 1YJW Q; 3CCM Q; 3CC4 Q; 1VQL Q; 3CMA Q; 1YIJ Q; 1VQ4 Q; 1VQN Q; 1Q82 R; 1KC8 R; 1VQK Q; 3I56 Q; 3CC2 Q; 3CCE Q; 3CPW P; 3CD6 Q; 1YI2 Q; 1K8A R; 1QVG P; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GMK e; 2MI6 A; 3NTI A; 2ZGW A; 3A8L B; 1I81 A; 2ED0 A; 2JTE A; 2LX7 A; 4EPC A; 3X28 B; 3OYD A; 2NLU A; 2RHU A; 1V76 A; 1UG1 A; 3M9Q A; 1BBZ A; 3FC3 A; 1BI1 A; 4XTY A; 1G5V A; 1NJI R; 2RJC A; 2K3B A; 2D8H A; 2RQT A; 1QCF A; 3VS3 A; 3MP8 A; 8ATC B; 2E41 A; 2HZY A; 2GTO A; 1QLY A; 1VQ4 T; 2VXE A; 1QVG S; 5D7U A; 4OB2 B; 1M4Z A; 1GRI A; 2SEM A; 2CYZ B; 2QTX A; 5IXF A; 3M4G A; 4M7D F; 3VYH B; 2DEU A; 2F1L A; 1YJW Q; 1PKS A; 1BK2 A; 2DBK A; 2EYW A; 4Z88 A; 1YIT T; 2CT3 A; 5GJV B; 1Q7Y R; 3QKJ A; 1SRL A; 4LD6 A; 2DIQ A; 2DL3 A; 1SHG A; 2M0Y A; 1JXO A; 3E9F A; 1G83 A; 4FW2 A; 3VV0 A; 1OX9 A; 3SD4 A; 1K0S A; 2J7I A; 1RI0 A; 2KMT A; 1AZG B; 1AT1 B; 2VWF A; 3JB9 G; 3H6Z A; 1QW1 A; 2RQV A; 2NUP B; 1SKU B; 1AVZ C; 3GNG A; 2DTH A; 3BFM A; 2BZX A; 3WVD B; 4C5H A; 1V1C A; 3QBY A; 4PFO A; 2EQU A; 4KBM B; 2V8I A; 2VVK A; 3QO3 A; 2RI2 A; 3RIR A; 1M1G A; 2JJ9 A; 1WYX A; 4A54 A; 4AFZ C; 1VQM A; 5CKD A; 3M4Y A; 3OSV A; 3BW1 A; 2BE7 D; 5KYX A; 1Q82 R; 3OYA A; 1VQM Q; 4FYW B; 1LPL A; 1TOV A; 4EIK A; 3OYL A; 4M75 G; 1QKX A; 4F7U A; 3L2R A; 3OS2 A; 5CK9 A; 3S3M A; 5KYW A; 3R6O A; 5LJ3 e; 1X27 A; 4FT2 A; 1I8F A; 1WJS A; 2MPX C; 2YUP A; 1IRX A; 4OGC A; 5IHN A; 3EG9 A; 1O9S A; 2YRD A; 1NPR A; 3RER A; 4ANJ A; 3JB9 J; 2CZ6 B; 2O88 A; 4ZNX A; 5LJ5 h; 1VQ9 Q; 4EMK B; 2R5M A; 5GAM e; 2L0A A; 2DD4 A; 3REA B; 1CKA A; 5I21 A; 3OYJ A; 4C92 A; 1WX6 A; 1TUD A; 1WIE A; 4C8Q A; 4MML A; 3JV3 A; 1WQW A; 2EQK A; 2EGC A; 2L3Q A; 2E12 A; 4DOV A; 4C0F A; 3CPF A; 4LDW A; 4J9H A; 4AFU C; 1ZUY A; 2MOX A; 3CC7 T; 3CCU T; 1YJN A; 4X9D A; 2GNC A; 4NL3 A; 1ZSZ A; 1RAB B; 2LJ3 A; 4BUG A; 3QWX X; 4C8Q G; 3JB9 D; 3GLX A; 3A1P A; 1VQK A; 3OYN A; 5KCO A; 2HNI A; 2DK3 A; 1YJN Q; 3CCV A; 4M78 A; 1D09 B; 3GP8 A; 2RK1 A; 4DBH A; 1PD1 A; 3P8H A; 4JJC A; 1VQK Q; 2RF0 A; 3MEA A; 2HQE A; 3CCV Q; 2K3X A; 3LYI A; 1PCX A; 4M7D A; 1HK9 A; 3QZ5 B; 4M78 G; 3HFN A; 3FIF A; 4PJL A; 2FEI A; 3BY7 A; 2FB7 A; 4JJD A; 4OMP A; 4E7K A; 2HKN A; 1G3W A; 1XJW B; 4M75 D; 3CQT A; 1WFW A; 3VS5 A; 2DRK A; 4M77 E; 2DNU A; 5IN1 A; 2QXF A; 2LCS A; 3NMZ C; 2JS2 A; 2DIL A; 3A8O B; 4RMO A; 4WCI A; 1UDL A; 1VQ4 A; 1M90 R; 1PHT A; 4ZGD B; 1UGV A; 1BU1 A; 1H8K A; 1H64 1; 1B34 A; 3QDR B; 2L8D A; 2CSQ A; 2YRV A; 1VQ4 Q; 2F2W A; 3CBM A; 4AT1 B; 4UC4 A; 3I55 T; 4O5V A; 1RI9 A; 4RTZ A; 3OYY A; 2P4T A; 4Z89 A; 3I56 T; 4E7H A; 1BYM A; 4BE0 A; 2LTO A; 1VQP T; 1H3Z A; 3TVT A; 3ZBD A; 5GAN 6; 2DER A; 4RG8 A; 3JCM X; 2OTJ T; 1Q86 U; 1QWF A; 3JCM d; 2PU9 B; 2RA2 A; 1X01 A; 5A0L A; 4R0K A; 2QDY B; 3N5B B; 2HKQ B; 1UHC A; 4C8Q D; 2M02 A; 1JO8 A; 2LQW A; 1QKW A; 1MV0 B; 4J83 A; 1W4S A; 1AEY A; 4JLI A; 3CCR T; 1ZQ1 A; 2D0Q B; 2FVU A; 4M7A C; 4JJN K; 5J39 A; 3G71 T; 3OYF A; 1FYN A; 3G6E A; 3Q1J A; 2CP5 A; 3EHQ A; 5GAN 5; 3FEO A; 1VQL T; 2X4X A; 3DLM A; 5FWB A; 1M9S A; 4OMQ A; 4A4H A; 2JM9 A; 4BDY A; 1QP3 A; 3G6E Q; 5LJ5 e; 3CCE T; 4QKU A; 2AKL A; 4M78 D; 1WDX A; 3RMQ A; 3CCL T; 5GAN 7; 2I0N A; 2PZ1 A; 2E10 A; 2VAS A; 2COW A; 2DXC A; 2YHT A; 4N4I A; 5KE2 A; 2WAC A; 5HKC A; 4K11 A; 1D3B A; 1D1C A; 2JMA A; 2Y90 A; 2FL7 A; 4B9W A; 4N0A A; 1K8A C; 4JZ4 A; 4CRI A; 2XIC A; 5IHI A; 2LT1 A; 4L6V 5; 1UE9 A; 1OV3 A; 2KYB A; 3RKX A; 4M75 E; 5IH2 A; 4FYV B; 2CP3 A; 2MYS A; 3VJP A; 1YNZ A; 4R55 A; 1KQ1 A; 1MMA A; 1FMV A; 2H3E B; 5I2M A; 4J6Y A; 1K8A U; 2E1H A; 1UEC A; 1KQS A; 5FWC A; 4Y91 A; 2FZK B; 4RTX A; 4PJJ A; 4F7U E; 2ED1 A; 3FRN A; 1AZE A; 1KQS P; 3LH0 A; 2QI2 A; 4PKC C; 4E6R A; 1I5L A; 2KBT A; 2BTT A; 3M0S A; 1NYF A; 2X4Y A; 2LCC A; 1M2O A; 2GFA A; 2EQI A; 5J26 A; 5FLX E; 4RUG A; 1U06 A; 3EG3 A; 1I0C A; 5GJW B; 4BB7 A; 3EH2 A; 3OMC A; 2KRO A; 2AIR B; 1K4U S; 4V2S A; 2EQM A; 4LDY A; 2D9T A; 4C92 E; 2JOY A; 2L3R A; 4C8Q E; 4OVA A; 3G7Z A; 4RTY A; 4N4H A; 2OTL T; 2JVV A; 2FRY A; 3QJ6 A; 2P0Q A; 5KYX B; 1EX4 A; 4D6W A; 1VIE A; 2MWP A; 2LQ8 A; 4J9E A; 3UAT A; 3VS4 A; 4F7U B; 2JS0 A; 2P0P A; 5KYW B; 3E19 A; 3M58 A; 1NJI C; 2ESW A; 3OYC A; 2XU8 A; 3EG9 B; 4M78 E; 5KYU A; 2CZ7 B; 1TSF A; 5LJ3 d; 3VS2 A; 3MPU B; 5GMK j; 2DVE A; 2RJF A; 2KT8 A; 2J6O A; 4JRK A; 5A0D A; 2W0Z A; 1ABO A; 3OS1 A; 4KGX B; 2A08 A; 3KXT A; 1WJQ A; 3I55 A; 2QAZ A; 4M7D E; 3M54 A; 2AZV A; 4X34 A; 9ATC B; 2KSS A; 5GAM d; 2VV5 A; 5GAO p; 3JB9 I; 2GCX A; 1HYO A; 3I55 Q; 4GBQ A; 2QQB A; 1GBR A; 2YWW A; 1ACM B; 2VYT A; 2DE0 X; 1SSH A; 3HPW A; 3RMS A; 2K4Y A; 2DJZ A; 1ZSZ B; 2EJG A; 1X75 C; 4AMC A; 1I4K 1; 2LP5 A; 4ELZ C; 1BIA A; 1LVK A; 2O9S A; 3L1A A; 2X3X D; 2DL5 A; 1X2Q A; 1YJ9 T; 1Q7Y U; 3JB9 F; 3R6N A; 3G71 A; 1D0X A; 2QEX T; 1GBQ A; 2X3W D; 5CO7 A; 2JNG A; 3KFV A; 2DZ9 A; 1RLQ C; 3NTH A; 3JCM P; 3OY9 A; 2CDT A; 3JCM Q; 4M7D B; 3G71 Q; 1JQQ A; 2RQW A; 3SB2 A; 1GCQ A; 2ATC B; 1UFF A; 4IIM A; 3CCE A; 2COY A; 4XU3 A; 1YI2 A; 1QVP A; 1UEB A; 3EFO A; 3M59 A; 3CCL A; 3JCM c; 4RTW A; 2ABL A; 3OYI A; 2EAY A; 3LX7 A; 3CCE Q; 2EBP A; 2J05 A; 1YI2 Q; 2XG8 D; 4IUR A; 5CKH A; 4AFS C; 3CCL Q; 2A36 A; 3OYK A; 4JJB A; 1M2V B; 1U1S A; 2O9V A; 1K9A A; 2EQJ A; 2VB6 A; 1YIJ T; 1B34 B; 2DD5 A; 4VUB A; 2JXB A; 3U23 A; 3G1J A; 1Q82 U; 4OP0 A; 1AWO A; 2E3H A; 2RPN A; 3M55 A; 1UB4 A; 4EMG A; 3VUZ A; 2AT1 B; 2LMJ A; 4A63 B; 1XNI A; 5LJ3 j; 1QVF A; 2HDA A; 2CZ0 B; 1U1T A; 3WXM B; 4BI4 A; 3VS7 A; 1K9M C; 2M0O A; 2WSC E; 1QVF P; 5IT9 E; 3LGL A; 5CCA A; 4E7S A; 3M0T A; 2COZ A; 2F2V A; 2QGF B; 2I2L A; 1I5O B; 1F1B B; 1VQ6 A; 2ZPG B; 5GAM j; 2JTF A; 2QA4 A; 4F17 A; 2YSQ A; 3JCM J; 4J6X A; 4GLK A; 4M77 G; 2KRM A; 1VQ6 Q; 1N8R R; 2QA4 Q; 4C0D B; 3DLL A; 1EFN A; 3HTR A; 3DB3 A; 2M16 A; 4XU1 A; 2CP6 A; 2YLC A; 1ZUU A; 2D6F A; 1JXM A; 2AKK A; 2VC8 A; 4IUT A; 1OEB A; 3EGX B; 1WNL A; 2X4J A; 4L5G A; 4B6M A; 1OYX A; 1VQN T; 2AK5 A; 3DKM A; 1YJW A; 3CD6 T; 3EG2 A; 4J7I A; 3HFO A; 1KQS S; 2RI5 A; 4AG1 C; 2MIO A; 1Z9Q A; 2MAM A; 2RI3 A; 5LJ5 d; 1QQJ A; 4ZGE B; 2E6N A; 1D3B B; 3M56 A; 1B3Q A; 1BCO A; 2M9U A; 3CME T; 1ZLM A; 4XU2 A; 3KUF A; 4B9X A; 2FRW A; 3ASK A; 1Z9Z A; 2D8J A; 2LNV A; 7AT1 B; 2W10 A; 2H8H A; 1FX7 A; 1M90 C; 3CCM A; 3HKS A; 1TH7 A; 3TEE A; 1TUG B; 2RMO A; 5GMK m; 3RUX A; 2L5Q A; 4QVZ A; 2JN0 A; 1OX8 A; 1ZBX A; 2QQS A; 3CCM Q; 1W2B A; 4IKF A; 5LJ3 f; 3G4S A; 2G3R A; 5CKF A; 1P92 A; 1PSE A; 1OU8 A; 1KC8 R; 4FCY A; 1OPL A; 3HHT B; 5KCH A; 4LDU A; 1W2B P; 1NM7 A; 2RQU A; 4KUD K; 1YFN A; 5CQY A; 5L23 A; 4M7A F; 3G4S Q; 4GLM A; 4E7L A; 3SHW A; 3C95 A; 5IHK A; 3O8V A; 4IUV A; 3L2U A; 4CC3 A; 2EPD A; 1WHM A; 5GAM f; 3V7R A; 2YRC A; 3VS1 A; 2A37 A; 4Z02 A; 3HRU A; 1YJ9 A; 2OX7 A; 1JJ2 A; 2XKO C; 3OYG A; 2FPF A; 2X51 A; 3SWN C; 2QEX A; 4M77 D; 5HY6 A; 2R5A A; 4IUP A; 5FRO A; 2B8A A; 4BE2 A; 1C0M A; 3CC2 T; 4E47 A; 1JJ2 P; 1N5Z A; 3ZEH A; 1YJ9 Q; 1VQ7 T; 1YHQ T; 1M3C A; 4ZTF A; 3BDL A; 1OUL A; 1SF9 A; 2QEX Q; 2EFI A; 5FRM A; 4FYX B; 1VQ9 A; 3A5Z B; 1QP2 A; 1WHL A; 2L3P A; 4M4Z A; 2NUT A; 4NOY A; 3V8L A; 3D7S B; 1BIB A; 2EJ9 A; 4F7U G; 5HK3 A; 1VYV A; 3NPF A; 3HRT A; 2LT4 A; 2CUD A; 2DZC A; 5L8R E; 2E65 A; 5KYU B; 4A4F A; 1YIJ A; 4PJO F; 1N9S A; 1K9M R; 3CPW A; 1BI0 A; 2RH2 A; 4M75 C; 2A0F B; 3OYM A; 4R56 A; 3QII A; 4XK8 E; 4JZ3 A; 4NL2 A; 3CPW P; 3THK A; 1YIJ Q; 4O6J A; 3JB9 H; 2XID A; 4PK4 A; 4BY6 B; 5GAO r; 2EYX A; 1YCY A; 2R58 A; 1SPK A; 2MK5 A; 4RCC A; 1IGU A; 2EYY A; 4C0Z A; 5DY9 A; 2F5T X; 4C92 G; 4ORZ A; 1Y07 A; 2RD1 A; 2D0N A; 2QYZ A; 4FIB A; 3SFM A; 3RKW A; 3GF5 A; 4JUV A; 3V7S A; 2V1R A; 2YT6 A; 1OZ2 A; 4MMK A; 2DTI A; 1OU9 A; 3M0P A; 2QQA A; 1Q81 C; 1X69 A; 2RJE A; 5CR2 A; 2HEQ A; 2G6F X; 5FU7 B; 2F5K A; 3LH5 A; 3VS6 A; 4F14 A; 5GAN d; 3CCQ T; 1X6B A; 2DJQ A; 4DA4 A; 2ENM A; 3E2U A; 1XQH A; 2ZAE A; 2A28 A; 1V29 B; 3PGG A; 3M0Q A; 1QMC A; 3PFS A; 2EWN A; 3CMA T; 2K2V A; 3CXC A; 5GAN 3; 2RB6 A; 3P8B B; 4CI0 C; 1VQN A; 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4MZM A; 2JM8 A; 2DL8 A; 3TRE A; 2KGT A; 4WTO B; 4MDX A; 1JEG A; 2LJ0 A; 1PKT A; 4PJO C; 1MHN A; 1N9R A; 2K9G A; 4FW1 A; 1WA7 A; 5DLQ E; 3CC7 A; 1Q81 R; 3CCU A; 4LE9 A; 4XAX B; 3M53 A; 4FT4 A; 1H3H A; 2O01 E; 2YUO A; 2PUO B; 2RK2 A; 2KNB B; 3A8M B; 8AT1 B; 1JJ2 S; 5ECA A; 2L3S A; 4DBF A; 3CC7 Q; 4Z8A A; 3CCU Q; 5KYN A; 1R77 A; 2FHD A; 3GNF B; 3T9N A; 2CH4 W; 2O4X A; 3MEW A; 5AT1 B; 2C0I A; 4FM4 B; 2GQI A; 2ZZD A; 3OBW A; 1B7T A; 4LDV A; 2B86 A; 4PLL A; 5KE3 A; 4MZT A; 3URG A; 2J06 A; 1AWW A; 4JRI A; 2D1X A; 3FJP A; 2R57 A; 3C4S A; 2XK0 A; 4IUQ A; 2DA9 A; 2GBQ A; 1BKB A; 3UT1 A; 3M0R A; 1W6X A; 3RBB B; 1S1N A; 5A0G A; 2WSE E; 3MO8 A; 1T0H A; 3CCQ A; 3PVQ A; 3P8D A; 1R0B G; 1ARK A; 2KAF A; 4BE1 A; 3QHS A; 1AWJ A; 3CPW S; 3CCQ Q; 1JRI A; 1N8R C; 1KHC A; 3LWH A; 1KD1 C; 4ZN3 A; 1B07 A; 1KQ2 A; 3H8Z A; 4M77 F; 2FYK A; 2DKG A; 5GAN f; 3OA6 A; 4ME7 A; 1LNX A; 5FU6 C; 1X43 A; 5GMK h; 2K79 A; 3QDF A; 1IB8 A; 1CKB A; 2NUT B; 1QWE A; 2F2X A; 1N8R U; 2DLP A; 4D8K A; 1WHJ A; 1NEG A; 1ZX6 A; 3UPU A; 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