The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QA4 Q; 3CMA Q; 3CD6 Q; 3G4S Q; 1YJ9 Q; 1QVF P; 3I55 Q; 3CME Q; 1YHQ Q; 1Q86 R; 3OW2 P; 1NJI R; 1K8A R; 1Q81 R; 1VQ5 Q; 2OTL Q; 1N8R R; 1M1K R; 3G6E Q; 3CCM Q; 3CC4 Q; 3CXC P; 3CCJ Q; 3CCR Q; 3CCU Q; 1YI2 Q; 2QEX Q; 1YJN Q; 3CC2 Q; 1VQ6 Q; 3CCS Q; 1VQM Q; 1QVG P; 1M90 R; 1VQK Q; 3CCL Q; 3CCE Q; 1VQ4 Q; 1VQL Q; 1YIJ Q; 1S72 Q; 3CC7 Q; 1Q7Y R; 1K73 R; 3G71 Q; 1VQ7 Q; 1Q82 R; 1K9M R; 3I56 Q; 1YJW Q; 1VQP Q; 1KQS P; 1VQ9 Q; 1KD1 R; 1VQ8 Q; 1W2B P; 1KC8 R; 3CPW P; 3CCV Q; 2OTJ Q; 1YIT Q; 1VQN Q; 1JJ2 P; 3CCQ Q; 1VQO Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 2JTF A; 1VQO A; 2A28 A; 1G83 A; 2B8A A; 1M4Z A; 4AFU C; 4ELZ C; 1R77 A; 2F5T X; 3REB B; 3JCM f; 1G8X A; 1KJW A; 4AMC A; 1YJN Q; 1M1G A; 4BE2 A; 1R0B G; 4J6Y A; 5LJ5 d; 5KYU A; 3P8D A; 2BTT A; 4QVC A; 1JJ2 P; 2D8H A; 2OTJ A; 3OBY A; 1WHG A; 2BUD A; 3CC4 T; 5CKF A; 1ZUK A; 4RTW A; 4E7K A; 2HL3 A; 1OU9 A; 4BY6 C; 3JB9 F; 4JUV A; 4PJO B; 1E7O A; 1TUC A; 2DZ9 A; 2COZ A; 4FYW B; 2X4J A; 1RAE B; 2YWW A; 4RCC A; 3QHS A; 2PVG B; 3CCM T; 3QXE B; 4WF2 A; 3FB9 A; 3M0T A; 5CAI A; 2L2P A; 2ZPI B; 3JB9 I; 5KYX A; 4M77 B; 2EAY A; 4FYV B; 4FCY A; 2VB6 A; 5L23 A; 3CCE A; 1WHJ A; 2ATC B; 5FW9 A; 2DEU A; 2O2O A; 1WIE A; 1Q81 C; 4DBF A; 4ZGD B; 4J9D A; 3CCQ Q; 1PSF A; 3JB9 J; 3C94 A; 5LJ3 g; 3VS7 A; 4OMN A; 1ZSZ A; 2LTO A; 2RQW A; 4HCC A; 3V8L A; 3WVD B; 4NL3 A; 2Y4Y A; 5LJ5 h; 3OS5 A; 5IT9 E; 4RG2 A; 2RPN A; 4MZT A; 1K8A C; 1QKW A; 3CCR T; 1V1C A; 2M1H A; 1YI2 T; 4JZ3 A; 3PMT A; 1VQK T; 2CP3 A; 1Y07 A; 3I35 A; 5LJ5 f; 4M7A A; 1ACM B; 2XIC A; 5IXB A; 3V8J A; 1RLQ C; 1WX6 A; 2EJ9 A; 2XDB A; 1VQO T; 2DJZ A; 2EYZ A; 2LCS A; 3URG A; 2LJ1 A; 3OYH A; 5GAO l; 2E70 A; 3VS1 A; 3OYK A; 1TUG B; 4R0K A; 3G4S A; 2D0Q B; 4F17 A; 5CCA A; 1NLO C; 3A5Z B; 2YDL A; 3VS0 A; 3GNG A; 1ARK A; 4NS5 A; 3V7R A; 2HQH A; 2DAQ A; 3ZBD A; 2C0O A; 1VQL A; 2RK1 A; 2OTJ T; 4J9I A; 5IHN A; 1B34 A; 2K2V A; 1VQ9 A; 4XQ3 A; 3DB4 A; 4JJD A; 1YHQ Q; 4PLI A; 5HK3 A; 2WSE E; 3OYI A; 4PJN A; 5FRM A; 1JXM A; 2QYZ A; 1D1B A; 2XI9 A; 5M9O A; 3RDV A; 3OYJ A; 3GP8 A; 1QVF S; 4AG1 C; 2F2W A; 1G5V A; 1YIJ Q; 2AZV A; 1JQQ A; 2RK2 A; 1KC8 C; 3SHW A; 2E4H A; 3MEW A; 4RTY A; 4AG2 C; 3FLG A; 5CKD A; 4EIK A; 1K9M U; 1KD1 U; 1PSE A; 3ZEH A; 3QWX X; 2QA4 Q; 1M1K C; 3CMA Q; 3JB9 H; 4JDS A; 4ZGJ B; 4LXC A; 2Y90 A; 3RUX A; 2LC4 A; 3PMI A; 1Y96 A; 2KRM A; 3CCE T; 5CR2 A; 1AOJ A; 1W70 A; 1G3S A; 3O5Z A; 2DTH A; 1Q95 G; 3E1S A; 3M57 A; 1HD3 A; 1GRI A; 3G71 A; 2V8J A; 1U8R A; 2PZ1 A; 3EG9 A; 5CO7 A; 3A8M B; 5LJ3 d; 3CCV Q; 1VQN Q; 2DNU A; 1E6G A; 1YCS B; 3TVT A; 1OI1 A; 1JU5 C; 2YLB A; 2KMT A; 3WVE B; 3RKW A; 3CCJ Q; 2L0A A; 4C8Q E; 1N27 A; 2D9T A; 4M7A F; 3EFO B; 2RA2 A; 4OMP A; 2EJG A; 4PJO G; 3EGX A; 1NEG A; 5GAN g; 4PJO C; 4RTZ A; 2JTM A; 3OB9 A; 2VKN A; 3G1J A; 3V7S A; 2HKQ B; 4F7U A; 4HVW A; 2R5A A; 2JTE A; 2HQX A; 2EWN A; 3CBP A; 3JCM b; 5GAN 4; 3I55 Q; 2KGT A; 1BK2 A; 1FMK A; 3MPU B; 2ZPB B; 3JV3 A; 5A0D A; 2DXT A; 3G6E A; 4M77 G; 2QEX Q; 4AFQ C; 2RMO A; 3L1A A; 1MMN A; 8AT1 B; 1XNI A; 3HSB A; 2FPF A; 1TH7 A; 3CC7 A; 2GNC A; 3G4S T; 1Q7Y U; 2CUD A; 3EGD A; 2RH2 A; 4IUP A; 2EIF A; 5GAM j; 5KE2 A; 2JUF A; 4NL2 A; 1T0H A; 1RAD B; 2PVO B; 3UDC A; 2CP6 A; 1WNL A; 1M8M A; 1NJI U; 3FJ5 A; 1VQL T; 3JRZ A; 2QDY B; 4DOW A; 4OB1 B; 4EMK B; 4ZTJ A; 1N8R U; 3JCM c; 5I22 A; 1VQ9 T; 4JJN K; 3EH1 A; 1N9R A; 3HRU A; 1QCN A; 4PFP A; 3QZ5 B; 4LDV A; 2BZY A; 2EBP A; 1E6H A; 5LJ3 h; 3OY9 A; 4RTT A; 1AEY A; 2LQ8 A; 4BDZ A; 2RI5 A; 3SD4 A; 4DA4 A; 1AZG B; 1F1B B; 2GTJ A; 1M5Q 1; 4HA8 A; 2E12 A; 2ED0 A; 2ECZ A; 2CP2 A; 2EQU A; 2SEM A; 4A63 B; 5GAM e; 3INZ A; 2QXF A; 5LJ3 f; 2EGA A; 4PLL A; 3VS3 A; 3EGU A; 2CH4 W; 1UGV A; 1QVP A; 5KYY B; 1SEM A; 2H3J A; 2K2M A; 3CME T; 3QII A; 1MV0 B; 6AT1 B; 4E7H A; 2V8I A; 4AT1 B; 1VQ8 A; 1PWT A; 3OSV A; 2QTX A; 5EG2 A; 2ZPE B; 4EMH A; 1QWE A; 2M0O A; 5KYN A; 1W4S A; 4E6R A; 2OTL A; 2AKL A; 1PC0 A; 2KY9 A; 4C92 A; 2AZS A; 4L5G A; 3G71 T; 1J3T A; 4ZGE B; 1JXO A; 3MET A; 3C4S A; 5KCH A; 1XQH A; 2BIV A; 2LP5 A; 5GAO p; 2AHJ B; 1IZ6 A; 2JS2 A; 1D3B A; 1TS9 A; 4M7D A; 2RHY A; 1QVF P; 4FSS A; 4QQD A; 3QBY A; 1UGR B; 4F7U F; 1JJ2 A; 4E7L A; 1UG1 A; 2CGH A; 4KH0 B; 1PHT A; 3CBM A; 3CC4 Q; 3OYE A; 2HCK A; 2XG8 D; 2QQS A; 5GAN d; 4XU2 A; 4GLK A; 4HT9 A; 2ROL A; 4N4I A; 1VQP Q; 2DRM A; 3C95 A; 3GF5 A; 4C5H A; 1YJW A; 1RAA B; 1ZLM A; 2FG0 A; 3L42 A; 2M51 A; 1Z9Z A; 1QW1 A; 1VIE A; 2JT4 A; 3G6E T; 4XTZ A; 3QSU A; 3M54 A; 4M75 F; 3MO8 A; 2L3P A; 1BIA A; 5GAN 2; 3CC7 T; 2FRY A; 2XK0 A; 4M7A D; 1OU8 A; 2K5F A; 5KYW B; 2CZ1 B; 3LH5 A; 3L2R A; 3UA6 A; 3EG3 A; 1M27 C; 2PUK B; 1OPL A; 2PTK A; 2KEA A; 3NFC A; 2VVK A; 2YRD A; 2VUB A; 2NLU A; 2E3I A; 1YWP A; 1Q86 U; 4BY6 B; 2HAX A; 4M75 G; 1RAB B; 4MZP A; 2X4X A; 4BB7 A; 4F16 A; 2KR3 A; 2NWM A; 1HXD A; 3GNF B; 4M75 C; 1K0S A; 2LQW A; 4PJJ A; 2EGE A; 2K9G A; 4FU6 A; 2F5K A; 2RJE A; 1H92 A; 4XAX B; 1YIT A; 2EW3 A; 3SWN A; 3L2W A; 4X34 A; 4EMG A; 3CCU Q; 1YI2 Q; 1X6B A; 1ABO A; 1FMV A; 3CC2 Q; 3AHU A; 3DB3 A; 2BKD N; 4C92 F; 2CT3 A; 2RQT A; 1VQ8 T; 1VQ4 Q; 2O9V A; 3DKM A; 1EX4 A; 3X25 B; 1Y0M A; 4IUT A; 1MNE A; 1A0N B; 3J7A F; 2B86 A; 4JS5 A; 4M7D F; 1U06 A; 4J8O A; 5KE3 A; 5IXF A; 2MAM A; 3MEV A; 8ATC B; 1RAF B; 5GJV B; 2E65 A; 4JRI A; 4DOV A; 4RCB A; 5I21 A; 4C5G A; 5GAM g; 3S3O A; 5IN1 A; 2FYK A; 2DD5 A; 2C0T A; 4HCK A; 4L6V 5; 1BB9 A; 4C92 C; 1NLP C; 3A98 A; 2OTJ Q; 3M0S A; 1AD5 A; 1LNX A; 4N0A C; 2CUB A; 4KRT A; 2ZGW A; 2MWP A; 1UDL A; 2VAS A; 3KXT A; 3I9Q A; 1PKS A; 3TEE A; 1M8V A; 1UB4 A; 4J6W A; 3VS6 A; 4JS4 A; 3X24 B; 3E9G A; 1T0J A; 1YJW T; 2QQR A; 4AFZ C; 2DLP A; 4J83 A; 2H3E B; 4OML A; 3JCM Q; 1RAC B; 5D6W A; 3A1P A; 2OJ2 A; 3OYN A; 2HBP A; 2MIO A; 3OA6 A; 2M9U A; 3IQL A; 3N5B B; 3LWI A; 3TRE A; 2RHU A; 2OI3 A; 1Q81 U; 3JSC A; 4JRQ A; 1IB8 A; 2KXD A; 3CCE Q; 2ZPF B; 1RL2 A; 4RKU E; 4MDW A; 1SKU B; 3OSS C; 1LCK A; 2XU8 A; 4M78 A; 4BI8 B; 4CC2 A; 1OZ3 A; 4ESR A; 2X3W D; 1I0C A; 1LOJ A; 4N4G A; 2X9H A; 5KYU B; 2RF0 A; 4M75 D; 2KRN A; 2C06 A; 2DKG A; 3HFO A; 1K8A U; 4FSX A; 1BI1 A; 3NTH A; 3CCR A; 3NGP A; 1I4K 1; 2DYI A; 1YIT T; 1TU0 B; 4OB0 B; 5KCO A; 4OP0 A; 2QQB A; 4J7F A; 1VYT A; 4F04 B; 2CSQ A; 1N6A A; 3NTK A; 3R6N A; 1O9S A; 2BE9 B; 3SDZ A; 2ROT A; 1BIB A; 1C6V X; 3SFM A; 4KH1 B; 2CZ6 B; 4OGC A; 5KYX B; 1Y7X A; 2EFI A; 1EFN A; 3HL8 A; 1V29 B; 1IGU A; 2EKO A; 3EFS A; 1B7T A; 2DBM A; 7AT1 B; 2P84 A; 1GFC A; 3VYH B; 4DBR A; 3G4S Q; 3HTR A; 1WI7 A; 3S3N A; 4D8K A; 1UEC A; 4OF1 A; 2CZ7 B; 5GAM d; 2HSP A; 1PRM C; 2K3Y A; 2JVV A; 4QQG A; 3UT1 A; 4C92 D; 1ZSZ B; 1H3Z A; 1YP5 A; 2R58 A; 4O6J A; 2QAZ A; 4PFZ A; 1K9M R; 1WQW A; 2D8J A; 2QGG A; 4PJO E; 4LNP A; 5GAO n; 1BU1 A; 4XU3 A; 1KC8 U; 4J7I A; 3U23 A; 1M2O A; 3LX7 A; 1M3A A; 1UUE A; 3MEA A; 1WZO A; 1KHI A; 4DEY A; 1M30 A; 4M77 E; 5GAO m; 4E7J A; 3JB9 G; 3M9Q A; 4M7A B; 1VYU A; 4BI3 A; 1IHW A; 4ME7 A; 2RM4 A; 2MI6 A; 2RQU A; 3QDR B; 2JMA A; 1AWO A; 4PNO A; 3JCM V; 1K9A A; 3HP9 A; 4RTX A; 2VXE A; 2OAW A; 4LD9 K; 3EG0 A; 3ME9 A; 1QQJ A; 2ENM A; 1XOV A; 1TXQ A; 2L3S A; 2LQN A; 4PJL A; 4E7Z A; 2DK3 A; 4KBM B; 3Q1J A; 4RTU A; 3E9F A; 2E5Q A; 2X3X D; 1KSW A; 1TG0 A; 2IIM A; 3JAM E; 1B34 B; 4A54 A; 5GAM h; 3QO3 A; 4GY5 A; 3OYY A; 2JMC A; 5J26 A; 3L2V A; 1QVF A; 3QYG B; 1JBM A; 3OMC A; 3UAT A; 5GMK i; 2XHC A; 4EPC A; 2DM1 A; 3HRS A; 1G3Y A; 1M90 R; 1SRM A; 2A7Y A; 1D0Y A; 5J39 A; 2YUQ A; 1Q7Y R; 3GIB A; 3P8B B; 1AZE A; 3M55 A; 2RJD A; 1RI9 A; 3VUZ A; 2RB6 A; 2EVR A; 3LW5 E; 2YRC A; 3CPF A; 5GAM f; 3H0I A; 3MKD A; 4E47 A; 1M3B A; 1ZUU A; 3G6E Q; 2D1X A; 1QP3 A; 3MEU A; 4P5N A; 2NUT A; 5A0G A; 1Y96 B; 4JJC A; 2CP5 A; 3CC7 Q; 2H8H A; 2DX1 A; 3GLX A; 4A4G A; 3DLL A; 2WSC E; 4LUD A; 2KVQ G; 4R56 A; 3QJY A; 1X69 A; 2DL5 A; 2DD4 A; 2DXC A; 1FYN A; 3I5R A; 1JB0 E; 2W10 A; 2ZCF B; 5AT1 B; 2BZX A; 2GQV A; 1LVK A; 2I2L A; 4KUI A; 3OYB A; 3BW1 A; 3NMZ C; 3L2Q A; 2VXF A; 3TSW A; 1OX8 A; 3MCA B; 2DO3 A; 2DL8 A; 3BE3 A; 3EGX B; 1RAI B; 3HHT B; 2DEQ A; 2J7I A; 2X51 A; 3CME A; 1UGP B; 3GOX A; 3CCL T; 4F7U B; 2HBW A; 3NHN A; 4FW2 A; 1ZBJ A; 2LZ6 B; 2QQ9 A; 2MCN A; 3JB9 D; 1D1C A; 2FB7 A; 4QKU A; 4CC7 A; 4WTO B; 2EGC A; 4E2F B; 3ZFJ A; 4J5Y A; 3RMQ A; 3RKX A; 3I5S A; 2EJF A; 2JM8 A; 2O9S A; 5GAO r; 4QW2 A; 1QCF A; 2QG9 B; 2CSI A; 2AK5 A; 1JO8 A; 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4JJB A; 3MJX A; 5L8R E; 2RHX A; 3C12 A; 3CD6 A; 1VQ5 Q; 1M1F A; 1RAG B; 2G6F X; 1WHK A; 1K9M C; 5FU6 B; 1NE8 A; 1VQM A; 4A53 A; 1BYM A; 2MF2 A; 1NM7 A; 2AT1 B; 2RN8 A; 2FRW A; 1VOM A; 1VQ6 A; 1M2V A; 4Z02 A; 4HT8 A; 2GBQ A; 1R0C B; 3O8V A; 1FXX A; 2BE7 D; 2DPP B; 5CQY A; 1U1S A; 4PJM A; 1MHN A; 5HY6 A; 3PT9 A; 5CIU A; 1NPP A; 1PG5 B; 3PVL A; 2K4Y A; 2FZC B; 4X9C A; 3BDU A; 1WPY A; 4WCI A; 3GPL A; 3CPW S; 4QVD A; 3CCM Q; 4FT4 A; 3M0R A; 3SWN B; 4F7U G; 2QEX A; 2EKH A; 4XTY A; 3I56 T; 4XTX A; 5A0L A; 4BUG A; 2EPD A; 2KRS A; 1NZ9 A; 3UA7 A; 5GAN 5; 1YCY A; 4IUR A; 1UE9 A; 1W2B P; 5CKB A; 5ECA A; 1Q82 U; 2V26 A; 3VV0 A; 1TTH B; 2DVE A; 4C8Q F; 3QZ9 B; 4CI0 C; 3RR6 A; 4IUU A; 3J81 E; 5FLX E; 4IIM A; 2DVJ A; 2DIL A; 1M90 C; 2XDD A; 1X6O A; 1G2B A; 1Q7Y C; 2M16 A; 4ELY C; 3D7S B; 3A8L B; 2IPO B; 4OB2 B; 4A4F A; 2RI3 A; 1UEB A; 3M4Y A; 2YT6 A; 4MMK A; 1WYX A; 1X43 A; 1UGQ B; 5IHK A; 2EQM A; 2HKN A; 2JW4 A; 4C0G A; 1GCQ A; 2QAS A; 5DM7 R; 1B07 A; 1BBZ A; 4IUV A; 2HEQ A; 3FJP A; 3CCR Q; 1PNJ A; 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