The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YIJ Q; 1VQP Q; 3CPW P; 2OTJ Q; 1N8R R; 1VQ8 Q; 1VQ6 Q; 1YJ9 Q; 1W2B P; 1M90 R; 1KD1 R; 1K9M R; 3CC4 Q; 3G6E Q; 1M1K R; 1VQ7 Q; 1VQ4 Q; 3CC7 Q; 1YHQ Q; 3CCL Q; 1VQM Q; 1YJN Q; 1S72 Q; 1VQN Q; 3CCE Q; 3CCU Q; 3CCR Q; 1VQO Q; 3CCM Q; 3CCJ Q; 3G4S Q; 1K73 R; 1KQS P; 1KC8 R; 3I56 Q; 1YJW Q; 1QVG P; 3CME Q; 1YIT Q; 1Q7Y R; 2OTL Q; 2QA4 Q; 2QEX Q; 1Q81 R; 1K8A R; 1NJI R; 3CMA Q; 3OW2 P; 3G71 Q; 3CXC P; 1VQ5 Q; 1QVF P; 3I55 Q; 1JJ2 P; 3CC2 Q; 1VQ9 Q; 1VQL Q; 3CCS Q; 3CCV Q; 1Q86 R; 1YI2 Q; 3CD6 Q; 1VQK Q; 1Q82 R; 3CCQ Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GAN g; 4E7K A; 2J06 A; 2ZPE B; 1NYF A; 1XTD A; 4C8Q C; 1XQH A; 5FRM A; 2JNG A; 3VS2 A; 1X01 A; 2PVD B; 1IRE B; 4C0F A; 2DK3 A; 2EQI A; 5GAN 4; 1SRM A; 1NPP A; 1W2B A; 2CP3 A; 3FJ5 A; 1M3B A; 2G6F X; 2K6D A; 2RO0 A; 3MP8 A; 4FW1 A; 4NL2 A; 1U8R A; 1VQ8 Q; 5GAN e; 2L3R A; 4II1 A; 4M77 C; 4E47 A; 3CCQ T; 2GGR A; 1I8F A; 3OYY A; 2M0O A; 1M1K U; 1VYV A; 1M8M A; 2OTJ A; 1Q7Y R; 4AT1 B; 4E2F B; 1SPK A; 1T0H A; 4ESR A; 3L2V A; 4IIO A; 1VQ7 T; 4ZGJ B; 5GAN h; 2EWN A; 1R0C B; 1D1A A; 2JMC A; 1NEG A; 3O5Z A; 1WHG A; 3QZ5 B; 1K1Z A; 2X3X D; 4A54 A; 5HK3 A; 3AHU A; 4M77 B; 4QKU A; 2KYM A; 1P92 A; 2CUD A; 1G3S A; 3CXC A; 5GAM j; 1S72 Q; 2DD4 A; 1PC0 A; 1M2O A; 4XTW A; 2KQW A; 3QO3 A; 4ZN3 A; 3JCM Q; 1FMW A; 2GQV A; 2P0P A; 1VQO T; 1PKS A; 2ENM A; 2D1X A; 1DJ7 B; 1VQN A; 3M0S A; 1YBY A; 1Y96 B; 3CD6 Q; 3P8D A; 4RG8 A; 2KXD A; 1MGQ A; 1U1T A; 2JOY A; 3VS3 A; 5GMK l; 3EGX B; 2HAX A; 3VS7 A; 1EZZ B; 2V8J A; 2XDP A; 4FSS A; 4LXC A; 1YJW Q; 1TS9 A; 4AFQ C; 1IHW A; 2OX7 A; 4MZM A; 4DOV A; 4XTX A; 2CUB A; 1BYM A; 2B86 A; 3H41 A; 3G4S A; 2OI3 A; 2DL7 A; 2JZ2 A; 4Z88 A; 3A5Z B; 3C95 A; 1K9M C; 4BD3 A; 2AZV A; 1YIJ Q; 1U06 A; 3X26 B; 1VQP Q; 2YDL A; 3I55 A; 1K73 C; 5I2M A; 1M90 U; 4PK4 A; 5CKF A; 3CPF A; 3CCU Q; 4HCK A; 3M55 A; 4FSX A; 2QQS A; 3V8K A; 1GBR A; 2PNI A; 4C92 C; 4KGZ B; 4C8Q E; 4BI4 A; 2GQI A; 2J6O A; 3A8G B; 2RA2 A; 4Q5W A; 2FPD A; 4UC4 A; 4R56 A; 3RKX A; 3LWI A; 2ECZ A; 1SEM A; 2L3Q A; 1NLO C; 3CC2 A; 1PD0 A; 1AWO A; 2YXY A; 2L0A A; 2YRC A; 4BI8 B; 4A63 B; 3E9F A; 2R5A A; 4J9C A; 8AT1 B; 2XHC A; 1LCK A; 1NJI U; 1WQ7 A; 3NPF A; 2PUK B; 2Y4Y A; 3GNF B; 4E6R A; 1JEG A; 3RBB B; 1D0Z A; 3CC4 Q; 2QYZ A; 2PU9 B; 2X4Y A; 1LJO A; 1IZ6 A; 4OMP A; 1AT1 B; 2FB7 A; 2DER A; 2A0F B; 4KUI A; 4EMK C; 2ATC B; 1CKA A; 3OYC A; 3G1J A; 2DA9 A; 1UFF A; 2K4Y A; 3I35 A; 3CCJ T; 1N9R A; 4F04 B; 4BDY A; 2EYX A; 2EJF A; 1HD3 A; 4DEX A; 2ZZD A; 1GCQ A; 1WHH A; 4YTL A; 4Z02 A; 4M7A G; 3C4S A; 3QDF A; 3O8V A; 1G8X A; 1HXD A; 4GBQ A; 4EMK B; 3RES A; 2I0N A; 3SD4 A; 2EYY A; 4E7S A; 4LUD A; 3EFR A; 1MMG A; 2CH4 A; 3G6E A; 3H9N A; 3PIP A; 1NG2 A; 1WXB A; 2QEX T; 1T3S A; 2A37 A; 3GLX A; 1JO8 A; 4BDZ A; 2CT4 A; 2EFI A; 1WA7 A; 2E70 A; 1VQL T; 5GAN 8; 1M1F A; 1UEC A; 2BE9 B; 4LUE A; 2MOX A; 1MUZ A; 1HJD A; 1YHQ Q; 3JB9 I; 1M27 C; 2RJF A; 2K2V A; 1N5Z A; 4XTV A; 1Y7X A; 2HD0 A; 4JJB A; 4QW2 A; 3G71 Q; 1I81 A; 4PFP A; 4N4G A; 2H3J A; 3CME T; 2RQT A; 3IQL A; 4C92 E; 3CMA T; 3RDV A; 4OB1 B; 2QA4 A; 5LJ3 j; 1X6B A; 3C94 A; 2RQR A; 2DIQ A; 1U1S A; 1I0C A; 3HPW A; 3MPU B; 3DKM A; 3BDL A; 2D6F A; 3WVE B; 2E10 A; 1Q81 C; 3OYB A; 4O6J A; 4IUQ A; 5IXF A; 1ZSZ A; 1YJ9 A; 3GIB A; 4P5N A; 1E6H A; 4AG1 C; 1JU5 C; 5GAM f; 2O9S A; 2EKH A; 2JTF A; 2QQB A; 1VQ9 Q; 3RMS A; 4ELY C; 2A08 A; 1G2B A; 3CPW P; 1PKT A; 4M78 G; 4DEY A; 3HTR A; 1JBM A; 1TU0 B; 2Z0W A; 1KK7 A; 1X2K A; 3LX7 A; 2LNV A; 1RAG B; 1PNJ A; 3OQ5 A; 2DBM A; 1GL5 A; 1IHV A; 2FZK B; 1MND A; 2Y4X A; 3M0U A; 4OGC A; 3UA6 A; 1GFD A; 2CP2 A; 3MP6 A; 3QYG B; 4M75 C; 1F1B B; 4M7D G; 2CZ0 B; 4PJO A; 2C0O A; 1ZBX A; 1VQ8 T; 2DXT A; 4PFZ A; 3MET A; 3EG3 A; 3QBY A; 1H3H A; 2GFU A; 1ZHI A; 1AD5 A; 1SSF A; 3CCM A; 3CCL A; 2JM9 A; 4HKE A; 4NL3 A; 3CCQ Q; 2DTI A; 4F17 A; 4M75 B; 5GAM g; 1IXD A; 2JS0 A; 2DL5 A; 4OP0 A; 1OX9 A; 4D8K A; 1UHC A; 5CKB A; 2QAS A; 1SSH A; 3OYJ A; 2RPN A; 2LTO A; 4M7A C; 3CPW A; 1S72 T; 3OYG A; 3CC7 A; 1J3T A; 1OZ2 A; 2OTL T; 3OYF A; 2L3P A; 3L2U A; 1FWZ A; 2LT4 A; 5KYX A; 3M56 A; 2CP6 A; 4KH0 B; 1O75 A; 1RAA B; 2HL3 A; 3WXM B; 3CD6 T; 5GAM e; 5DY9 A; 2J6F A; 3L1A A; 3GP8 A; 4R0K A; 4M7A B; 4RTW A; 4IUP A; 4BB7 A; 4C5H A; 1B3Q A; 1X2Q A; 2D8J A; 4MMK A; 2BIV A; 1X6G A; 4F7U F; 2COW A; 1OPK A; 5GAM h; 1YJW T; 3LYI A; 5C0M A; 3S3O A; 2DL8 A; 2E6Z A; 1KD1 C; 2J6K A; 3EG9 B; 2VVK A; 2X4J A; 3SDZ A; 3DLM A; 1M1K R; 5KYU A; 1YIJ T; 4N4H A; 1VQP T; 3S3M A; 1KQS S; 1QVG P; 4RTY A; 4M7D A; 3A8L B; 2Y90 A; 1QVF P; 3M4Y A; 1LOJ A; 4BI3 A; 4J9F A; 1I07 A; 4AG2 C; 4F14 A; 3I56 A; 1I4K 1; 1WHJ A; 2DIL A; 3EG1 A; 1SF9 A; 2KDS A; 2JJ9 A; 3A98 A; 1I1J A; 2EQM A; 4MZP A; 2BZY A; 2V8K A; 2CP7 A; 4JJN K; 2DXC A; 3QHS A; 3A8M B; 2CGH A; 2P84 A; 1X27 A; 2CZ1 B; 1HYO A; 4M78 C; 3OYL A; 3EFO B; 2EW3 A; 2QDL A; 1D3B B; 2EKO A; 2E6N A; 2KEA A; 4J83 A; 3NFC A; 3VJP A; 2A7Y A; 4C8Q G; 1YWP A; 5KYN A; 2HQH A; 2DPP B; 1BI1 A; 3H6Z A; 4LN2 A; 2LQW A; 1Z9Z A; 3QUI A; 4EMG A; 1N9S A; 3KFV A; 3H0I A; 2FEI A; 5LJ3 f; 2JUF A; 4A4E A; 4M78 B; 4J6Y A; 3UAT A; 3CC4 T; 4RTT A; 4RMO A; 3SEM A; 3E2U A; 4AFS C; 3PGG A; 5CQY A; 1WNL A; 4M77 G; 4WF2 A; 4AFZ C; 1WGS A; 5A0G A; 1AHJ B; 3OBW A; 1QVG A; 3QJ6 A; 1MHN A; 1M90 R; 5LJ5 d; 2NUZ A; 1QVF A; 4PJM A; 4RTV A; 3OS5 A; 3JCM J; 3H0H A; 1VQK A; 4LE9 A; 1AZE A; 2E5K A; 3REB B; 3CCJ Q; 2BZ8 A; 2LVM A; 5L23 A; 3V8J A; 2RHI A; 2JVV A; 1YJN T; 1GRI A; 3CCR T; 2HMA A; 1H8K A; 3JCM d; 1RAF B; 3OMG A; 3OBY A; 1VQ5 T; 1HK9 A; 2XID A; 2DZC A; 4FYX B; 1UE9 A; 2YSQ A; 4FYV B; 1OX8 A; 3QYH B; 4RCB A; 4C5G A; 1NLP C; 4X9D A; 1VQN Q; 3LH0 A; 4DQ2 A; 2RJD A; 2FHD A; 2MWP A; 4HCZ A; 4JUV A; 1NJI R; 3QG1 A; 4HT8 A; 3THK A; 1VOM A; 2L89 A; 5LJ3 g; 2EJG A; 2EGA A; 4OMQ A; 4N4I A; 1WQW A; 5CAI A; 4JLI A; 1R0B G; 3JRZ A; 4XTU A; 2OAW A; 4JRQ A; 2F2X A; 3BDU A; 4RTZ A; 3ASK A; 3PVL A; 4QQG A; 3QPH A; 2KK4 A; 3CME Q; 3FIF A; 4JRI A; 2M02 A; 3CMA Q; 1N6A A; 1G3Y A; 2O9V A; 4TVR A; 2ROL A; 1VQO A; 4DA4 A; 5LJ3 e; 4NS5 A; 3M57 A; 2DXB A; 4QT7 A; 3M0Q A; 2CZ6 B; 4C92 G; 1VQ9 T; 4E7I A; 2FRY A; 3EHR A; 1GCP A; 4M77 A; 1Y0M A; 3CBO A; 1TG0 A; 3TQ7 P; 2ED0 A; 3QJY A; 2RB6 A; 2K5F A; 5LJ3 h; 5D6X A; 2XMF A; 2M16 A; 3QWY A; 1PRL C; 1PSF A; 2B8A A; 2OJ2 A; 3BE3 A; 1KQ1 A; 2L2P A; 2FPE A; 1D1B A; 2RI2 A; 2DM1 A; 1N8R C; 4PNO A; 4HCB A; 2RK1 A; 4LDY A; 2VV5 A; 5GMK m; 2LX9 A; 2QG9 B; 3PE0 A; 1KC8 C; 3CBM A; 1ZA2 B; 3EGX A; 2HSP A; 1K9M U; 1B34 B; 4B6M A; 1Y57 A; 4JJD A; 2C0I A; 1C6V X; 4LDW A; 2FYK A; 4B9W A; 1K73 U; 4HVW A; 1RL2 A; 1TUG B; 2RMO A; 4ZGE B; 3V8L A; 2KT8 A; 4OMF B; 5GAO n; 2DRK A; 2VKN A; 2P0K A; 1AWX A; 2QXF A; 4RTX A; 2F2V A; 2WAC A; 4C8Q B; 4ME7 A; 3MP1 A; 3MCA B; 2AHJ B; 5I2S A; 3TCJ A; 2DVE A; 1VQ6 A; 5GMK i; 4ANJ A; 4BE2 A; 1Q86 C; 5GAO q; 3OS1 A; 3SHW A; 4LDX A; 3ME9 A; 2KR3 A; 2M1H A; 2DYI A; 2FVU A; 2MMP A; 2NUT B; 4QVC A; 1RAE B; 1BIB A; 3SWN C; 5GMK j; 4R55 A; 1KIK A; 1E6G A; 1QP3 A; 4ZTJ A; 1OUL A; 2CT3 A; 2LNH B; 2CZ7 B; 1QW1 A; 2OTL Q; 5KCO A; 1X75 C; 4V2S A; 1M3A A; 2LCS A; 3CXC S; 2A36 A; 1VQM A; 3CCE A; 3NTH A; 2A28 A; 3INZ A; 1WJS A; 1OPL A; 2VB6 A; 2QGG A; 3EH1 A; 2LDM A; 1S1N A; 3LH5 A; 1TUD A; 2KI7 A; 4QVD A; 1Y71 A; 4DBR A; 2CP5 A; 2LJ3 A; 3MJX A; 4F7U E; 1M2V B; 3CCV A; 4QVZ A; 1QCF A; 3OYM A; 3RIR A; 4OB2 B; 4DBF A; 3JCM c; 1AWW A; 3RR6 A; 1PSE A; 4PJL A; 3LWH A; 2BE7 D; 1WHK A; 2K3Y A; 2KYB A; 1WZO A; 3ZEH A; 4BY6 C; 2YUQ A; 3M4G A; 3ZL7 C; 2DZ9 A; 2E4H A; 1VQL A; 2RJE A; 2L3S A; 4EIK A; 1K8A C; 1VA7 A; 4EMK A; 3M0R A; 2MK5 A; 4XAX B; 4HCC A; 2RQU A; 1PM3 A; 3VKI A; 1Q82 C; 1JQQ A; 1LNX A; 3OY9 A; 2A3L A; 2X9H A; 4XTZ A; 3REA B; 2QGF B; 1G3W A; 2W10 A; 4X9C A; 4Z89 A; 5AT1 B; 3CCS A; 1VUB A; 1G5V A; 4C5E A; 2PVO B; 4C92 B; 2KMT A; 4XU1 A; 2OAU A; 4M75 G; 1Q81 U; 2FRW A; 1M30 A; 5I22 A; 5A0L A; 2F69 A; 1UGQ B; 1Z9Q A; 2R57 A; 3Q1J A; 3I5R A; 4CC3 A; 3CCL Q; 3UWN A; 3SB2 A; 2FZG B; 5GAN 7; 1BK2 A; 1D09 B; 3JCM P; 1ZSG A; 4Y28 E; 3OYE A; 3HFO A; 1JB0 E; 2YWW A; 4XTY A; 2RD1 A; 2EQU A; 3PNW C; 5J26 A; 5I11 A; 4C0D C; 2O88 A; 2RNA A; 5HCK A; 2DF6 A; 2F5T X; 9ATC B; 1YJN Q; 5GAN d; 1MNE A; 3CCR Q; 2DNU A; 2DYB A; 4OB3 B; 2ABL A; 1RUW A; 2V1R A; 4KUL A; 1VQ5 Q; 1VQN T; 2EAY A; 2BKD N; 4NOY A; 4J6X A; 2EYW A; 5IAY A; 5IXB A; 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2NLU A; 5CR2 A; 2XD0 A; 4M7D D; 3U23 A; 3VV0 A; 4OMN A; 4OMO A; 3OB9 A; 3PMI A; 3SFM A; 1BBZ A; 3E19 A; 1KQS P; 1FX7 A; 1YIT Q; 1UGV A; 3G6E T; 1YCY A; 1RAI B; 2DO3 A; 2SEM A; 3ULR B; 1SHG A; 3EFO A; 1SKU B; 2CSI A; 4J7I A; 1D3B A; 1EX4 A; 2RI3 A; 3M59 A; 5KE2 A; 3TSW A; 5GMK e; 3VS4 A; 2QI2 A; 4OGE A; 4N0A A; 4OF1 A; 3OYN A; 2MI6 A; 1K9M R; 2IG0 A; 3QII A; 1QCN A; 4DBQ A; 4BE1 A; 1YI2 A; 4JRP A; 1K73 R; 1AWJ A; 5GMK h; 3DLL A; 4M78 A; 3OW2 S; 3HL8 A; 2YHT A; 2K5I A; 3A8H B; 2YRV A; 1WHM A; 1YCS B; 2QA4 T; 2WSE E; 1IGQ A; 5CQX A; 2QQR A; 1XOV A; 2EYQ A; 4JS5 A; 2PZ1 A; 4LD6 A; 3OS2 A; 3T9N A; 5GAO p; 4PJO C; 1Q7Y C; 4E7H A; 1OU8 A; 1YJ9 T; 3FLG A; 4F7U G; 4OMM A; 2RQV A; 4VUB A; 2ESW A; 1YNZ A; 5HY6 A; 2V8I A; 3MO8 A; 1YHQ A; 4L6V 5; 2MPX C; 1WHL A; 1BCM A; 1JXM A; 3JCM X; 1TUC A; 3LW5 E; 1KQS A; 4J9E A; 3G71 A; 3HSB A; 3JB9 H; 1UHF A; 4FYY B; 2X4X A; 3URG A; 4ELZ C; 1MMA A; 1H3Z A; 6AT1 B; 5IHN A; 4J5Y A; 2HQE A; 1NBE B; 3LGL A; 2HL5 C; 3RKY A; 3RER A; 3MEV A; 3UDC A; 2MIO A; 3FRN A; 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