The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VQ9 Q; 3CCJ Q; 3CCS Q; 3OW2 P; 2QA4 Q; 3CCM Q; 1VQO Q; 1VQP Q; 1M1K R; 1S72 Q; 1Q7Y R; 3I56 Q; 3CCL Q; 1Q82 R; 3CC4 Q; 2QEX Q; 1YJ9 Q; 1YHQ Q; 3G71 Q; 1K73 R; 1Q86 R; 3I55 Q; 3CCU Q; 1YJW Q; 1QVF P; 1K9M R; 3G4S Q; 1VQ8 Q; 3CCR Q; 1VQM Q; 1KC8 R; 1VQ5 Q; 1VQN Q; 1KQS P; 1YI2 Q; 3CCQ Q; 3CME Q; 1N8R R; 1NJI R; 1QVG P; 1VQ6 Q; 1KD1 R; 1VQ4 Q; 1JJ2 P; 1VQK Q; 1VQL Q; 3CPW P; 3CD6 Q; 2OTL Q; 1VQ7 Q; 3CCE Q; 1YJN Q; 3CC7 Q; 1M90 R; 3CMA Q; 1YIJ Q; 1Q81 R; 1W2B P; 3CC2 Q; 3CXC P; 2OTJ Q; 1YIT Q; 3G6E Q; 1K8A R; 3CCV Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 4HVU A; 3CPW A; 2DIQ A; 4II1 A; 4PLL A; 4ZN1 A; 2O31 A; 2JOY A; 4DA4 A; 1IO6 A; 5KE2 A; 2HAX A; 2L8D A; 2P84 A; 1NLP C; 1WYX A; 3MHX A; 2K6D A; 4ZGD B; 2QQS A; 4PJO G; 4YTL A; 3SB2 A; 2DKG A; 3VS6 A; 2GFU A; 4RCB A; 1D3B B; 2LMJ A; 5KYX B; 2DF6 A; 2FB7 A; 2LQ8 A; 4JJN K; 5CKF A; 2DM1 A; 4F7U B; 3TEE A; 1WXB A; 4D8K A; 2I2L A; 4C8Q E; 3TSZ A; 2RHX A; 5J26 A; 4J9B A; 3S3O A; 4M7D G; 1FWZ A; 3L2R A; 3CCL T; 2JM9 A; 2D8H A; 4DBQ A; 3OYI A; 3V7C A; 4M77 B; 4D8D A; 1LJO A; 2CDT A; 2DVE A; 2J7I A; 1VQ7 A; 4PJJ A; 1SF9 A; 4C8Q A; 1UGS B; 1PNJ A; 3OSS C; 4L59 A; 3HRT A; 4LDU A; 2EJ9 A; 1N6A A; 2VXE A; 3V8K A; 3X25 B; 4A4F A; 4JS5 A; 4HT9 A; 1AWO A; 4M7A A; 4WCI A; 2AIR B; 4J6Y A; 3T9N A; 5I11 A; 1JBM A; 1QVF P; 3FC3 A; 1PM3 A; 4BE0 A; 1ZBX A; 1K73 U; 4OGE A; 4MMK A; 1U06 A; 4F14 A; 3OS2 A; 1VYV A; 5LJ5 f; 1M4Z A; 1OZ3 A; 4M7D E; 3PGG A; 3CC7 Q; 2A0F B; 1QP3 A; 2EPD A; 4CC4 B; 5IH2 A; 2EQK A; 3A8H B; 3MP8 A; 3D7S B; 2RI5 A; 2MCN A; 2HQE A; 2X4Y A; 4M7D A; 1BB9 A; 3EGD A; 3S3M A; 1GBQ A; 1X6B A; 1Y0M A; 1WA7 A; 3JSC A; 1G83 A; 3EGX A; 1D0X A; 4B6M A; 4L5G A; 3NTH A; 4BY6 B; 4LN2 A; 1PHT A; 1BIA A; 1SG5 A; 2MAM A; 4ESR A; 3SEM A; 1WDX A; 5EG2 A; 3I55 Q; 5FRN A; 5GAN 5; 2MK5 A; 2IG0 A; 3BE3 A; 4MZT A; 2FZC B; 1ZSZ A; 4Z89 A; 1PSF A; 2NYS A; 3QZ9 B; 1R0C B; 1CKB A; 3RUX A; 5GAO l; 2DZ9 A; 1VOM A; 1S72 Q; 1C6V X; 3C4S A; 2QDY B; 2VC8 A; 3QHS A; 4E7Z A; 1TSF A; 3CCL A; 3RKY A; 2KXC A; 3FDR A; 2RI3 A; 2YWW A; 2E6N A; 3E9F A; 1RAG B; 4CC7 A; 2CP6 A; 4AFU C; 3MP6 A; 3JV3 A; 3DKM A; 3M4Y A; 3EFO A; 3QPH A; 2GTO A; 1TOV A; 3QDF A; 1U8R A; 2IVW A; 3CC7 T; 1ZA1 B; 1RLP C; 5FU7 C; 1Q7Y U; 2OAU A; 1WHL A; 1E7O A; 2E3H A; 1OX8 A; 2JJ9 A; 2M0O A; 3EG0 A; 3CCQ Q; 3OS1 A; 1VQK A; 5LJ5 j; 2YRD A; 1PCX A; 2NUP A; 3RKW A; 3CCU T; 2HKQ B; 2EKO A; 1Q81 C; 3QJ6 A; 3TVT A; 1UGP B; 1VQ9 Q; 3UT1 A; 4N4G A; 1JO8 A; 4JLI A; 4LDV A; 1NZ9 A; 4PFP A; 2RK2 A; 5KCO A; 3SFM A; 4WF2 A; 1IGU A; 3G4S T; 2KE9 A; 1V76 A; 3ZBD A; 3LX7 A; 3FB9 A; 3I55 T; 3OMC A; 2K9G A; 1G3Y A; 2F1L A; 4CRI A; 1QVF A; 2L3P A; 2DL8 A; 4JRP A; 2DE0 X; 3QJY A; 4QQD A; 5GAM e; 2SEM A; 1UGR B; 1XOV A; 2BZY A; 1XJW B; 1CKA A; 3BFM A; 3H9N A; 1UEB A; 4Y92 A; 5IAY A; 2ZPE B; 2FVU A; 2RM4 A; 3CCR Q; 2SRC A; 2PVO B; 1MMD A; 1U1S A; 3QWY A; 1OPL A; 3V8L A; 3AT1 B; 2DVJ A; 3CC2 Q; 1QQJ A; 3MKD A; 4DOV A; 1OOT A; 2M02 A; 3TU4 K; 3C0C A; 5KYY B; 3OW2 P; 1K8A U; 1G3W A; 2RQV A; 3RMQ A; 1K1Z A; 3KUF A; 4RKU E; 4JRK A; 1YJW Q; 2P0P A; 3PE0 A; 3IQL A; 5CKE A; 3ZEH A; 3CQT A; 2BIV A; 4M75 D; 3NHN A; 2V8K A; 1NJI U; 1RI0 A; 4FSS A; 4JRI A; 1WHK A; 3QWX X; 3CC7 A; 3JCM Q; 5GAO m; 1R77 A; 1H3Z A; 1OEB A; 2E5K A; 2QDL A; 1NLO C; 1RL2 A; 2AKK A; 3O5Z A; 4FW2 A; 4C0F A; 2RHY A; 2RHI A; 1M27 C; 3PVQ A; 1VQ9 T; 1H92 A; 5CCA A; 3CCU A; 2WSC E; 4AFS C; 4KGZ B; 2Y90 A; 2L3Q A; 3JCM W; 2XI9 A; 4CI0 C; 2CZ0 B; 3M0P A; 4E6R A; 1E6H A; 4NL2 A; 2EYW A; 1KSW A; 2ECZ A; 1RI9 A; 5D6X A; 2JTE A; 2JMC A; 1ZA2 B; 3I55 A; 4FL6 A; 3INZ A; 2ZZD A; 3FIF A; 1VIE A; 1KC8 C; 4J9C A; 2FRW A; 1N8R R; 3CPF A; 1PC0 A; 3EG3 A; 4KBM B; 3JB9 I; 1GRI A; 3CCR T; 1M90 C; 2LP5 A; 3HSB A; 4A4H A; 2JUF A; 2JW4 A; 4QW2 A; 4OB1 B; 2YHT A; 1S72 A; 2LRQ A; 1N27 A; 4C92 F; 2YSQ A; 4XU3 A; 5LJ3 e; 4M78 B; 1YNZ A; 2DEQ A; 4FT2 A; 5C6S A; 2YXY A; 2NUT A; 1PKS A; 1YJW T; 2OTL Q; 3OYG A; 3SDZ A; 2EGC A; 4BB7 A; 4J9G A; 3OS0 A; 4IIM A; 2E4H A; 2E1H A; 3MEA A; 3CCE T; 2EBP A; 2COZ A; 2AK5 A; 2COY A; 4X9C A; 1X6G A; 2ATC B; 2DNU A; 3CCQ A; 1KD1 R; 1VYT A; 3H6Z A; 4J7F A; 3OYE A; 1X75 C; 4NOY A; 3WXM B; 2CUD A; 3G6E Q; 1TUC A; 5GAN e; 5A2Q E; 1VQ9 A; 4C92 G; 4KH0 B; 2PVD B; 2F5T X; 2MPX C; 3M58 A; 1QKW A; 3LH0 A; 2I0N A; 2GTJ A; 4J9E A; 3HRS A; 2K3Y A; 3OW2 A; 3I56 T; 2DXU A; 2K5I A; 4ZNX A; 1NPR A; 1IHW A; 2GBQ A; 1MMA A; 5FU6 B; 1HK9 A; 2DTI A; 1U3O A; 1YHQ T; 4C8Q B; 3CD6 Q; 2D8J A; 3EFS A; 2HEQ A; 4J83 A; 3JCM e; 2DYI A; 1GCP A; 1JEG A; 4M7A B; 2LT1 A; 2PVG B; 2HSE B; 2VV5 A; 4LXC A; 4FYY B; 1Y71 A; 2EQJ A; 2E5Q A; 2JXB A; 4OMQ A; 1MND A; 4C92 E; 4E7S A; 1AWJ A; 1DJ7 B; 1UGV A; 3CCR A; 1UGQ B; 2J06 A; 3EFR A; 3JB9 F; 1WI7 A; 2DFU A; 4IUU A; 2WSE E; 1G3S A; 5CKB A; 3CXC P; 4IUV A; 4E2F B; 2MI6 A; 3JRZ A; 4C92 A; 5FW9 A; 2IIM A; 3UDC A; 4M7D B; 4R55 A; 2KY9 A; 4B9X A; 5KYW A; 4RTY A; 2A28 A; 4M75 C; 4MDX A; 3RMS A; 2G3R A; 3E2U A; 5LL6 S; 1YJW A; 2KRS A; 3KXT A; 4J6W A; 1UG1 A; 3EGX B; 1OPK A; 1SPK A; 1AWW A; 2JS0 A; 2K3X A; 1K76 A; 4K11 A; 3V8J A; 4M75 F; 2JM8 A; 2DO3 A; 2VKN A; 2MIO A; 2V1Q A; 1IHV A; 1M1K R; 3CCM Q; 4A4G A; 5HK0 A; 4FYX B; 1E6G A; 1YN8 A; 3G6E T; 1Q82 R; 2QGF B; 2DBK A; 5GMK j; 4OGC A; 5GAO r; 1OX9 A; 1ZSZ B; 2CH4 W; 5C0M A; 1RAC B; 4J6X A; 3JCM J; 4GLM A; 3EG1 A; 1AEY A; 3FJP A; 3F70 A; 2EQU A; 1M2V A; 4Y91 A; 3CD6 T; 1JB0 E; 3Q1J A; 4BI8 B; 1W1F A; 4XQ3 A; 1QCO A; 3VYH B; 3RKX A; 5HKC A; 2QEX Q; 2QXF A; 3I56 A; 1YHQ A; 4EMG A; 2NWM A; 2CKK A; 1KQS P; 2GCX A; 2P0K A; 3EFO B; 2ZPH B; 1KHI A; 3LW5 E; 4WTO B; 4PKC C; 2RD1 A; 1YIJ Q; 1O75 A; 1IXD A; 4QVC A; 4LDW A; 2ABL A; 5CR2 A; 1TH7 A; 5LJ3 h; 3ER0 A; 3A8L B; 2KRN A; 2ED1 A; 3SWN B; 1WHM A; 4Q5W A; 1VA7 A; 3BDL A; 1OV3 A; 1V1C A; 3EG9 A; 2JVV A; 2NUP B; 3HFN A; 3VU3 C; 3R6O A; 3DLM A; 3REA B; 9ATC B; 1Z9Z A; 2LNV A; 1JU5 C; 2FZG B; 4GY5 A; 4XTU A; 4FIB A; 4PL6 A; 1ABO A; 3OYD A; 2CP7 A; 3VV0 A; 3JB9 J; 1B07 A; 1BIB A; 3NTI A; 1Q86 R; 3E9G A; 1AWX A; 1VQM Q; 4M75 A; 1VQ6 Q; 2LDM A; 1YCY A; 4RTV A; 3EGU A; 5L8R E; 1YJN Q; 2RQU A; 4BE1 A; 5GAN h; 2QG9 B; 2OTJ Q; 4M77 D; 2P4R A; 2YLC A; 3CBM A; 4C8Q G; 4QT7 A; 3PMI A; 2WSF E; 3G6E A; 1UDL A; 4RTX A; 2WAC A; 4M7A G; 2O2O A; 3CXC A; 1YJ9 Q; 5GAN 2; 1GL5 A; 2KDS A; 2DMO A; 3ULR B; 5GAN 8; 2QEX T; 1N8R C; 4X9D A; 1BI2 A; 3CD6 A; 3VJP A; 1QWE A; 1OU8 A; 2FG0 A; 2O4X A; 2LJ3 A; 1GBR A; 2HSP A; 3X28 B; 2ROL A; 3E19 A; 4EIK A; 3CCS Q; 1YIJ T; 3MP1 A; 1VIF A; 4GLK A; 1QVP A; 2ROT A; 4BDZ A; 4EDU A; 4XTW A; 3GIB A; 2HKN A; 2RN8 A; 3N5B B; 4BE2 A; 1K9M R; 1K0S A; 1G8X A; 2D1X A; 1KC8 R; 4M7A E; 4DBR A; 4KT0 E; 2ENM A; 2V8I A; 3M53 A; 5GAN 4; 3GLX A; 3H0H A; 4HVV A; 1F1B B; 2V1R A; 1M90 R; 2M16 A; 1ABQ A; 2HD0 A; 4KUI A; 1U5S A; 4J5Y A; 2HBP A; 4NS5 A; 4OMN A; 1X69 A; 4IIO A; 5LJ3 d; 1W2B A; 1BI0 A; 4DEX A; 3VKI A; 2LJ1 A; 2EJF A; 2LQN A; 2RI2 A; 1VYU A; 1SRM A; 1R0B G; 1KD1 C; 5AT1 B; 4E7K A; 4QVD A; 4IKF A; 1VQ6 T; 1KQS A; 2OJ2 A; 1VQK T; 1QMC A; 4QQG A; 2QA4 Q; 2QI2 A; 2OTJ T; 4A4K A; 3QBY A; 2DJQ A; 1GCQ C; 2KT1 A; 4XTZ A; 4B9W A; 1BU1 A; 2DTO A; 3QKJ A; 2FHD A; 1VUB A; 5GAM g; 1MV3 A; 2EVR A; 2E3I A; 2DRK A; 1YJ9 T; 3C95 A; 2E6Z A; 1N8R U; 1I8F A; 2A08 A; 3JCM X; 1I5O B; 3MEU A; 2K5F A; 3VYG A; 2IPO B; 1D1A A; 1X01 A; 1Q95 G; 1TXQ A; 3CBO A; 2MYS A; 2QEX A; 2A7Y A; 2M0Y A; 3CCS T; 1SSF A; 1NYF A; 4RTZ A; 2NUT B; 4C0Z A; 4EMK C; 1IRX A; 2EQM A; 2OX7 A; 1M3B A; 5I2S A; 2V26 A; 3OA6 A; 1YIJ A; 1SHG A; 4ZTJ A; 3OBY A; 2K2M A; 4BD3 A; 2KVQ G; 4ZTF A; 5DLO A; 4QVZ A; 1MUZ A; 4RG8 A; 2DXT A; 4AMC A; 2D0N A; 5IXB A; 3EAE A; 2EJG A; 4D6W A; 2YLB A; 1GXI E; 3UWN A; 2FO0 A; 5KYN A; 1KD1 U; 1WHG A; 5IHN A; 2RA2 A; 1WZO A; 5DM7 R; 5CVI A; 1OQK A; 5L23 A; 4XK8 E; 3PIP A; 2EKH A; 3J81 E; 3J80 E; 5CIU A; 4PJL A; 5CO7 A; 4JUV A; 1M1K C; 3NPF A; 2QTX A; 3OYM A; 3H0I A; 1AHJ B; 4J9D A; 5CKH A; 2VVK A; 3UF4 A; 1Q82 C; 2QA4 T; 1NEB A; 4F7U F; 3JB9 H; 1T3S A; 4NL3 A; 4LDY A; 4Z88 A; 3S6W A; 4M77 C; 4C0G A; 7AT1 B; 1VQ6 A; 2MWO A; 1ACM B; 1I07 A; 1BCM A; 1YJN A; 2DL5 A; 1AT1 B; 2EWN A; 2LX9 A; 2OTJ A; 5FRO A; 3LLR A; 4A53 A; 2AHJ B; 2PUK B; 2BE9 B; 1JXO A; 1B3Q A; 1IZ6 A; 2PNI A; 3X20 B; 1YJ9 A; 2C06 A; 3OYC A; 2O9V A; 4Y28 E; 2MOX A; 1GCQ A; 3L2V A; 1VQN Q; 5D7U A; 1QW1 A; 5KYU B; 5LJ3 g; 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4OB3 B; 3TCJ A; 3CEY A; 2KXD A; 3JCM P; 1FXX A; 1BBZ A; 4J9H A; 2H3J A; 1N5Z A; 2CZ6 B; 3ZL7 C; 3VRZ A; 3A8M B; 3CC2 T; 5GJW B; 2LQW A; 1MV0 B; 1M5Q 1; 3G7Z A; 2LC4 A; 2L3R A; 2HL3 A; 1G5V A; 4M75 B; 1AD5 A; 1Q86 U; 2DAQ A; 2VAS A; 4GBQ A; 1A0N B; 2RQW A; 2RK1 A; 4C8Q D; 2F2V A; 2L5Q A; 3TQ7 P; 5DY9 A; 1H3H A; 1MNE A; 3OYL A; 3REB B; 1WJS A; 4LE9 A; 5HK3 A; 5IXF A; 2XMF A; 4FM4 B; 4BAC A; 4PJO D; 1J3T A; 2X4X A; 2O4X B; 2F2W A; 2XKO C; 3THK A; 2M1H A; 2YDL A; 1ZQ1 A; 4X34 A; 1PSE A; 4M7D D; 1X2Q A; 1QLY A; 2YT6 A; 1VQN A; 1K9M U; 1KC8 U; 2P0Q A; 1C1A A; 3FLG A; 2BKD N; 2E64 A; 5GAM j; 5GAM h; 1M90 U; 1UFF A; 2EGA A; 4RCC A; 1YBY A; 1WIE A; 5LJ3 f; 2QTV A; 1WX6 A; 1OYX A; 4N4I A; 4OP0 A; 4E47 A; 1D1B A; 4RTW A; 1NEG A; 4LD6 A; 4AFZ C; 2K79 A; 2R5A A; 1VQ4 Q; 5HY6 A; 1M9S A; 3M55 A; 2EIF A; 2QGG A; 3KFV A; 3CC2 A; 2OTL T; 1R8O B; 3M0R A; 2PZ1 A; 3DB4 A; 2DK3 A; 4N0A C; 2A36 A; 3EGD B; 2CP3 A; 5GAO n; 3MCA B; 1BI1 A; 1WQW A; 2MWP A; 1ZUK A; 5GMK l; 4HCZ A; 5FRM A; 1RAA B; 4FYW B; 2CP5 A; 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