The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3I56 Q; 3CCM Q; 1Q82 R; 1K9M R; 1VQ9 Q; 1QVG P; 3CC7 Q; 3CCV Q; 1YHQ Q; 1NJI R; 3CCJ Q; 1VQ6 Q; 1M1K R; 1QVF P; 3CD6 Q; 1YIJ Q; 2OTL Q; 3CPW P; 3CCR Q; 3CMA Q; 1Q81 R; 3I55 Q; 1K73 R; 1Q7Y R; 1VQ4 Q; 1YJW Q; 1S72 Q; 3CCE Q; 1VQL Q; 1VQO Q; 3CXC P; 1KQS P; 1VQK Q; 3CC4 Q; 3CCQ Q; 1YJ9 Q; 1KD1 R; 3CCU Q; 2OTJ Q; 1VQM Q; 2QA4 Q; 3G6E Q; 1YI2 Q; 1N8R R; 1VQP Q; 3G71 Q; 3OW2 P; 1M90 R; 1VQ5 Q; 1YIT Q; 3CC2 Q; 1VQ7 Q; 1VQN Q; 2QEX Q; 1JJ2 P; 1YJN Q; 1VQ8 Q; 3G4S Q; 3CCS Q; 1Q86 R; 1KC8 R; 3CME Q; 1W2B P; 3CCL Q; 1K8A R; #chains in the Genus database with same CATH topology 1YN8 A; 2B86 A; 3OW2 S; 2MMP A; 2AKK A; 4A63 B; 1IGU A; 1V29 B; 2KRN A; 5I11 A; 4JZ4 A; 2K79 A; 3PTA A; 1H92 A; 1KD1 R; 5GAM d; 2QA4 Q; 2V26 A; 1PKT A; 3BW1 A; 4M7A D; 3M53 A; 2QEX A; 3CC2 A; 1UG1 A; 2DBK A; 2HQH A; 4RG8 A; 4XU2 A; 4C0D B; 3VS6 A; 1MV0 B; 3I56 A; 1QVG P; 2KT8 A; 1JQQ A; 1NPR A; 2RQT A; 4C92 G; 1X01 A; 1SKU B; 2BZX A; 2CZ0 B; 4M75 G; 2WSE E; 1VQ7 T; 4E7S A; 3IQL A; 4OMN A; 4D8D A; 3GF5 A; 2O4X A; 2DVJ A; 2W0Z A; 1TU0 B; 1RI9 A; 4M7A F; 1RI0 A; 1IZ6 A; 2FHD A; 1QVG A; 4JRK A; 2JW4 A; 5IHI A; 1VQL T; 1ZSZ A; 3CCJ A; 2O88 A; 2VGN A; 3VU3 C; 4C5I A; 3EFO A; 3OBW A; 1ZA1 B; 4ZN3 A; 3AHU A; 1QW1 A; 4JUV A; 3VRZ A; 2V8I A; 1TXQ A; 4BB7 A; 2CH4 W; 1WQW A; 1VQ5 A; 1QWF A; 3RER A; 3MJX A; 5CVI A; 1HJD A; 4DEY A; 3CBO A; 2YWW A; 2DE0 X; 5LJ5 h; 3JCM g; 3EG9 B; 2I0N A; 1VQL Q; 3H41 A; 2YRD A; 1GFC A; 3OS1 A; 2VV5 A; 5KYX B; 2D6F A; 1MV3 A; 3VS7 A; 1M8V A; 3FDR A; 4LUE A; 5KYU B; 2CZ6 B; 1X43 A; 2KMT A; 4M7D D; 3C94 A; 4RTU A; 1KC8 C; 2A08 A; 5KYY A; 4Z89 A; 3L2R A; 3U23 A; 3OA6 A; 2PQW A; 1RAC B; 1C6V X; 3JRZ A; 1EFN A; 1YJ9 A; 2XDD A; 3CEY A; 2RJF A; 2W10 A; 4GLM A; 1FMK A; 1PG5 B; 3CBM A; 2X4W A; 2M1H A; 2KDS A; 3TEE A; 2V1R A; 2ZGW A; 3CCS A; 4M7D F; 3WXM B; 4OGE A; 1D1B A; 3OYC A; 5HK3 A; 3MP1 A; 1UDL A; 1Q81 C; 1U5S A; 2KAF A; 2LCS A; 4PL6 A; 3ZL7 C; 3QBY A; 5GAN f; 2K3Y A; 5FWB A; 2RI2 A; 4J7I A; 1W70 A; 2CZ1 B; 4M78 F; 5J39 A; 2JM8 A; 4E7L A; 2CSQ A; 4PJO A; 4C92 D; 3H8Z A; 4L59 A; 4M75 D; 4C8Q C; 3M5A A; 5GAN 3; 4LD6 A; 1W6X A; 1KD1 U; 2DAQ A; 1GBQ A; 3CD6 A; 2DER A; 4M78 B; 1Z9Z A; 1X6B A; 1OU9 A; 4HA8 A; 2YUN A; 2D0N A; 2DL3 A; 5GAM f; 2DJZ A; 4JS5 A; 1YJN T; 3SWN C; 3CME T; 3F70 A; 5LL6 S; 3CCL T; 3HPW A; 5C0M A; 2NLU A; 3VS0 A; 2PU9 B; 1YIT A; 1WNL A; 2YDL A; 3C12 A; 4Y92 A; 2HKQ B; 1KC8 R; 4PNO A; 1G3W A; 2LVM A; 3CCU T; 5GAO p; 3MCA B; 1VQN T; 5EC7 A; 5LJ3 d; 1JXM A; 3X20 B; 1Y96 B; 2ZPF B; 4XU1 A; 1PNJ A; 2RJC A; 2JOY A; 4HVV A; 1G83 A; 1SF9 A; 2EPD A; 2YSQ A; 1YJN Q; 5IT9 E; 1VQ6 T; 3CCR T; 2FYK A; 2DYB A; 4J83 A; 5LJ5 e; 2E3H A; 3CCL Q; 1X75 C; 5C6S A; 2ATC B; 1EIF A; 2B8A A; 2MWP A; 2DKG A; 2RH2 A; 4QW2 A; 1WDX A; 4F7U F; 4J6Y A; 3CCU Q; 3S3O A; 1BIB A; 4Y91 A; 2ZPB B; 2E1H A; 2D0Q B; 2DVE A; 3ULR B; 2RI3 A; 1VQN Q; 2DL5 A; 5A2Q E; 2L3S A; 3LH0 A; 4N0A A; 1O75 A; 4F7U B; 1S72 T; 3EAE A; 2LJ3 A; 4N4G A; 1VQ6 Q; 1VQK T; 2XIC A; 3CC4 T; 1X2K A; 5CAI A; 5KYW A; 2VYT A; 3JB9 I; 3FRN A; 1IB8 A; 3URG A; 3S3N A; 1YJW A; 3WVE B; 1GCQ C; 2COZ A; 4C5E A; 1JEG A; 3QYG B; 2MIO A; 2EFI A; 1SRM A; 3QWX X; 3TVT A; 3RKY A; 2FZG B; 3VUZ A; 3EGU A; 4LDW A; 2D8J A; 4KRT A; 1I8F A; 2DFU A; 1XNI A; 1JJ2 S; 3M55 A; 4M78 E; 1VYV A; 4Z88 A; 4N4I A; 1S72 Q; 4QQ6 A; 1M90 U; 1UFF A; 2KEA A; 1IRX A; 4C8Q G; 1VQK Q; 3CC4 Q; 1ABO A; 1U3O A; 3GP8 A; 2NYS A; 3I5S A; 1M8M A; 4NS5 A; 4E2F B; 4ANJ A; 3PGG A; 2X3X D; 3G4S A; 3H0F A; 3DLL A; 3TCJ A; 1BCM A; 2XMF A; 2AIR B; 1YFN A; 4LDU A; 5LJ5 j; 2Y90 A; 2CSI A; 4C0D C; 2DM1 A; 1RAE B; 3PT9 A; 1AWO A; 1GBR A; 3FEO A; 2XD0 A; 1MHN A; 4XU3 A; 3MP6 A; 1ZA2 B; 3QDR B; 4YTL A; 3LGF A; 2DXB A; 4N4H A; 4D8K A; 1Y07 A; 3M0U A; 5FLX E; 1OX8 A; 2RMO A; 2E70 A; 4NOY A; 2PVD B; 3VS2 A; 3MP8 A; 2CS7 A; 2FZC B; 1YP5 A; 4KUD K; 4A4G A; 4IUV A; 3HSB A; 2QDL A; 1KC8 U; 4HCZ A; 4FYW B; 2KI7 A; 3LYI A; 1IGQ A; 4JDS A; 2GFA A; 1QLY A; 2O31 A; 3Q1J A; 1VQ8 A; 4RKU E; 1WX6 A; 5GJV B; 1IHW A; 3SD4 A; 1TUD A; 2XU8 A; 2DL7 A; 2DYI A; 3DB3 A; 5D6Y A; 3OYN A; 1JB0 E; 3EGD B; 2D1X A; 2PVO B; 1I4K 1; 1YNZ A; 3GNF B; 5LJ3 f; 2EVR A; 1NYF A; 1VQO A; 3MHX A; 2CUD A; 4IIO A; 3QDF A; 2RD1 A; 1YWP A; 1AD5 A; 4PJJ A; 1KQS S; 2MI6 A; 2QYZ A; 3PFS A; 3GLX A; 3BY7 A; 3HP9 A; 3V8J A; 1TUG B; 1MMD A; 4M7A A; 3CC7 A; 4R55 A; 1UEB A; 3QHS A; 4ZGE B; 2VKN A; 2DO3 A; 4O6J A; 2FO0 A; 1O9S A; 4E7J A; 2VC8 A; 1PD0 A; 1FXX A; 2EYX A; 2KRS A; 3UF4 A; 4Z8A A; 2GFU A; 3M0R A; 1LOJ A; 4LUD A; 4C8Q D; 2DIG A; 2O9S A; 3CQT A; 3CCQ T; 3M0S A; 1YIJ A; 1K73 C; 1KHC A; 2CT3 A; 3G6E T; 3GBQ A; 1WQ7 A; 5GAO l; 2DL4 A; 1WHM A; 2PUO B; 1K0S A; 3V7S A; 2F69 A; 4ME7 A; 1K9A A; 3E9F A; 1SEM A; 1CSK A; 2CUB A; 2O2O A; 3DLM A; 4AFZ C; 2YHT A; 3L2Z A; 4RUG A; 2YUO A; 3CMA A; 1VQ4 A; 4AT1 B; 2CP3 A; 4HT8 A; 4BAC A; 3FJP A; 2AK5 A; 2CZ7 B; 4OF1 A; 3CCQ Q; 1KJW A; 2HEQ A; 3G6E Q; 4BI8 B; 4M78 C; 1YI2 A; 4F16 A; 4X9D A; 2CRE A; 5GAO m; 3JCM P; 2LNH B; 1BU1 A; 1Y57 A; 2RHU A; 3FC3 A; 3V8K A; 4Y28 E; 2JMC A; 1ARK A; 1UGQ B; 4XTX A; 1ZX6 A; 4M7D A; 2DXC A; 2EJF A; 1N9R A; 1MUZ A; 1BI2 A; 2ESW A; 1NLO C; 3QWY A; 2CGH A; 4FL6 A; 1MGQ A; 1K4U S; 5GAN 7; 2KXD A; 1W2B P; 3TU4 K; 4J9G A; 1HK9 A; 3CCM A; 3VS1 A; 1M3C A; 2OAU A; 1K73 R; 4HCC A; 2KR3 A; 2QEX T; 3CC2 T; 1UGP B; 1Z9Q A; 2WAC A; 3V7R A; 1QMC A; 3O8V A; 1N8R R; 2EKH A; 3NGP A; 3I56 T; 2BZY A; 1W2B A; 2GQI A; 2O01 E; 2KY9 A; 4XK8 E; 3H0I A; 2LX7 A; 2DXT A; 2ZPE B; 4C92 A; 2BZ8 A; 4B9X A; 2EQK A; 2AHJ B; 3RDV A; 4M75 A; 3J80 E; 1V76 A; 2P84 A; 2F2W A; 3DKM A; 1EZZ B; 3CPW S; 2FPD A; 2K7A A; 1VA7 A; 3L42 A; 3JB9 F; 2XHC A; 2H3E B; 3CC2 Q; 3CCJ T; 1SG5 A; 3OYB A; 3C0C A; 1SSF A; 3SDZ A; 3I56 Q; 2K5I A; 4M77 B; 1AT1 B; 4BI3 A; 1VQ5 T; 3CXC A; 2QQB A; 1WXB A; 3HRT A; 4J6X A; 2EAY A; 3HKS A; 1NYG A; 1C1A A; 5GAN d; 1NJI U; 2HKN A; 2L0A A; 2D8H A; 5CK9 A; 4M78 G; 1X27 A; 2OI3 A; 1YHQ A; 2KYM A; 3J7A F; 2DD5 A; 1PHT A; 5AT1 B; 2RA2 A; 3NFC A; 2CP0 A; 3EH2 A; 4F17 A; 2EQU A; 2A3L A; 4ELZ C; 1ZUY A; 2LX9 A; 2LNV A; 1YJ9 T; 3CCV A; 2E4H A; 4J6W A; 5GAN 5; 4AFS C; 2OTL A; 1ZSG A; 1KSW A; 3OMG A; 4A4E A; 3OYH A; 4FYX B; 2VGM A; 1K0X A; 1B34 B; 4V2S A; 2MYS A; 3CCS T; 2J05 A; 2QI2 A; 2CP5 A; 2ZAE A; 2COW A; 4R0K A; 4OMO A; 1F1B B; 2GTO A; 3P8D A; 2DXU A; 3PMT A; 2EYW A; 2H8H A; 2KYB A; 2R5M A; 1SHF A; 4PJM A; 5FRM A; 1VYT A; 2DJQ A; 2JN0 A; 4OMF B; 4FYY B; 8ATC B; 1PD1 A; 1K8A U; 2GBQ A; 4KGX B; 3X28 B; 1ZUU A; 5EG2 A; 3O5Z A; 1VQ7 Q; 4F7U G; 3CD6 T; 3CCS Q; 1K73 U; 1XJW B; 1NM7 A; 3INZ A; 3RKX A; 4DBF A; 1Q82 C; 1UE9 A; 1OPL A; 2JTE A; 4M77 E; 1UTI A; 3JCM X; 1AZE A; 2EQM A; 3M59 A; 2OX7 A; 1N8R U; 2M0Y A; 1UUE A; 3X25 B; 1YIT T; 1QVG S; 2VUB A; 2BE9 B; 1TH7 A; 2HAX A; 2K4Y A; 3A8L B; 1G5V A; 5DLO A; 3REA B; 3OB9 A; 4PJN A; 2KNB B; 4PFP A; 4OML A; 3EGD A; 2MOX A; 1M30 A; 5HK0 A; 4FSS A; 3CD6 Q; 2FVU A; 1YBY A; 1Q7Y C; 1M5Q 1; 4FT4 A; 5CKE A; 2RQR A; 2FB7 A; 3L2W A; 1TTH B; 1GFD A; 4M78 D; 4A53 A; 2BIV A; 4QQD A; 2P4T A; 1YIT Q; 3QPH A; 3PVQ A; 2CP2 A; 1Q86 C; 1IRE B; 3UDC A; 2P0P A; 1M2V B; 2K9G A; 3NTH A; 2DNU A; 1M4Z A; 1OV3 A; 2ECZ A; 2E10 A; 3A5Z B; 4IIM A; 4P5N A; 2Z0W A; 4D6W A; 1IHV A; 3MEV A; 5KE2 A; 3OYM A; 1IO6 A; 2EJG A; 1YJW T; 2RHZ A; 1Q82 R; 2NWM A; 2QTV A; 2DTO A; 2RHI A; 4A4H A; 1T3L A; 1MND A; 5ECA A; 3HTR A; 3PIO A; 3N5B B; 4BUG A; 2ED0 A; 2GTJ A; 1NEB A; 4RTT A; 3SB2 A; 1FMW A; 3UPU A; 1WHK A; 5A0D A; 3WVD B; 1UGV A; 1WXT A; 3QUI A; 1T0H A; 2AZV A; 1Q7Y R; 1YJW Q; 4FCY A; 5GAN g; 1E6G A; 3TQ7 P; 4C8Q A; 2RJD A; 3G4S T; 1PSE A; 1Y0M A; 2FRW A; 5LJ3 j; 1U8R A; 4FT2 A; 2P4R A; 4KUL A; 1Q86 R; 3BFM A; 1R8O B; 3CME Q; 1P92 A; 2KSS A; 3SWN A; 1RAB B; 4J9H A; 2NUP A; 4EMK B; 4BY6 C; 3JAM E; 2ABL A; 5GAM g; 1Q81 R; 1MMG A; 3E9G A; 2I2L A; 3R6O A; 3JB9 J; 3PE0 A; 1KG1 A; 1N9S A; 1JU5 C; 2CDT A; 3JCM h; 3TSZ A; 1QCN A; 2R5A A; 2FPF A; 2NUZ A; 3G4S Q; 1M3A A; 3HRS A; 2C0O A; 1DJ7 B; 2KVQ G; 2A0F B; 5GAO q; 2DIQ A; 2YXY A; 2NUT B; 4UC4 A; 1AWW A; 4DA4 A; 3CCR Q; 3OS5 A; 5HY6 A; 4ZGD B; 4IUR A; 4QQG A; 5A0L A; 4MMK A; 1VQ8 T; 3TSW A; 4M77 C; 1M9S A; 1D1C A; 2XID A; 1SPK A; 4RMO A; 1QVP A; 2A36 A; 3VKI A; 1WHG A; 3UT1 A; 3OBY A; 3VYG A; 3M0Q A; 4J9C A; 4PFZ A; 4ZTF A; 4J7F A; 2K3B A; 1M1F A; 1VQO T; 5IAY A; 3VV0 A; 1U06 A; 5GMK h; 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1VQ4 Q; 2EYY A; 1A0N B; 4FYV B; 4JRP A; 2XDP A; 1H3Z A; 1WJR A; 4J9I A; 2OTJ A; 1YI2 Q; 3CCM T; 1OOT A; 2X35 A; 5L8R E; 1VIF A; 1UHF A; 2AT1 B; 2RJE A; 3GIB A; 1GCP A; 4E47 A; 2BKD N; 3OYF A; 1AWX A; 3G7Z A; 1RAA B; 1E7O A; 1C0M A; 3JCM b; 5LJ3 g; 3EG9 A; 1PC0 A; 2LQN A; 4HKE A; 5KYX A; 1AEY A; 2QG9 B; 4JLI A; 4PJO F; 1H64 1; 5KYU A; 2GF7 A; 3JCM Q; 2XG8 D; 2DZC A; 4EPC A; 2L8D A; 1QCO A; 4IUQ A; 4PJO B; 2IIM A; 1NBE B; 2JMA A; 1AVZ C; 4KUI A; 3KBG A; 1I1J A; 2FPE A; 3RR6 A; 3CCM Q; 2HQE A; 2CP6 A; 1GXI E; 3LWH A; 1FX7 A; 1OQK A; 1B3Q A; 1UJY A; 4BI4 A; 4X34 A; 1VQM A; 3EG0 A; 4XAX B; 4KBM B; 2K6D A; 1OUL A; 1Y71 A; 4OB2 B; 1WYX A; 2DD4 A; 3VYH B; 4XTV A; 1JBM A; 2QQ9 A; 3QZ9 B; 4ESR A; 3KUF A; 1W1F A; 4MZT A; 3MEA A; 3JSC A; 2EWN A; 1NEG A; 2MAM A; 2RI5 A; 4NL3 A; 1YHQ T; 1LNX A; 4OMM A; 3GOX A; 2RQV A; 2A37 A; 4BD3 A; 5FRO A; 4ZTJ A; 5LJ5 f; 2M0O A; 1UB4 A; 4FM4 B; 2DET A; 2E6Z A; 4M78 A; 2ZPG B; 4GLK A; 1M3B A; 2JZ2 A; 2A28 A; 2L3R A; 1G3Y A; 2HL3 A; 1YCS B; 2EQI A; 3M56 A; 4L6V 5; 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