The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YIJ Q; 1N8R R; 1K73 R; 3CC2 Q; 1QVF P; 1Q7Y R; 1VQ9 Q; 2OTL Q; 3G6E Q; 1M90 R; 1VQO Q; 1QVG P; 3CXC P; 3G4S Q; 1K8A R; 1JJ2 P; 1VQ8 Q; 3CCM Q; 1YI2 Q; 1YJ9 Q; 1YHQ Q; 1Q82 R; 1K9M R; 1YIT Q; 1VQP Q; 1M1K R; 3G71 Q; 2QEX Q; 1KD1 R; 1VQK Q; 1KC8 R; 3CC4 Q; 3CME Q; 1S72 Q; 3CCE Q; 2QA4 Q; 3I55 Q; 1VQ7 Q; 3CC7 Q; 2OTJ Q; 1Q81 R; 1VQL Q; 3CCJ Q; 1VQ6 Q; 3CMA Q; 3CCQ Q; 3CCS Q; 1VQ4 Q; 3I56 Q; 3CCR Q; 3CD6 Q; 3OW2 P; 1NJI R; 1KQS P; 1VQ5 Q; 3CPW P; 3CCL Q; 1VQN Q; 1Q86 R; 1W2B P; 1YJN Q; 3CCV Q; 1YJW Q; 1VQM Q; 3CCU Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 4HT9 A; 2P84 A; 1QKW A; 3SEM A; 3M0U A; 1OX9 A; 2D9T A; 2CYZ B; 2HKN A; 2GF7 A; 5GAN e; 3EFR A; 4DA4 A; 3A8H B; 3M53 A; 3C95 A; 5EG2 A; 1JQQ A; 1CSK A; 2KE9 A; 5LL6 S; 2F2V A; 4OB2 B; 5I22 A; 3TCJ A; 1LCK A; 5LJ3 e; 1GRI A; 3EAE A; 2JJ9 A; 3ZEH A; 1VQ5 Q; 4M75 F; 3CCV Q; 1YJW Q; 2ZPG B; 2O4X A; 1TU0 B; 2LQW A; 2RI2 A; 4J9B A; 4M77 B; 1N6A A; 2I0N A; 1ZA2 B; 5HK3 A; 1QMC A; 1ZSG A; 4A63 B; 1M8M A; 4BE0 A; 1VQ9 A; 3HTR A; 2QEX Q; 3R6N A; 4M75 E; 3RKW A; 3LGL A; 2COW A; 4EMK C; 2WSC E; 3EH1 A; 3L2Q A; 2RD1 A; 2CKK A; 4TVR A; 3H0I A; 5KH6 A; 3A98 A; 3LYI A; 2M16 A; 1VQ6 A; 1U8R A; 2COZ A; 3S3N A; 1RAD B; 2F2X A; 5CKB A; 4R55 A; 4CC3 A; 4M7A A; 1NBE B; 4XTU A; 4CRI A; 5KE3 A; 3EG9 A; 3CBO A; 2L3R A; 3OB9 A; 1GBQ A; 1PD0 A; 4HCB A; 2WAC A; 2EQU A; 2JM9 A; 5GAN h; 4QKU A; 4PJO C; 3MEA A; 2OTJ A; 1B34 A; 3OA6 A; 3FRN A; 1Q95 G; 4E7L A; 4QQ6 A; 5LJ3 h; 4L6V 5; 4LXC A; 1WHG A; 1U1S A; 1W1F A; 1JO8 A; 3VRZ A; 2COY A; 3E9G A; 2X4Y A; 1PKT A; 2EJG A; 4DBR A; 4F14 A; 3OW2 A; 4D6W A; 4KH0 B; 8ATC B; 2FPD A; 3TSZ A; 2DZ9 A; 1JEG A; 1WHH A; 1RAF B; 4AG1 C; 2XK0 A; 1G83 A; 3VS0 A; 3EGD A; 1BBZ A; 1TG0 A; 4WTO B; 2P0P A; 1WHJ A; 2F5K A; 5FU6 C; 2LC4 A; 1ZLM A; 2PUO B; 2HL5 C; 2MI6 A; 3G71 T; 4BD3 A; 2QAZ A; 2RPN A; 4LNP A; 3TQ7 P; 1ZX6 A; 2ZPI B; 3AT1 B; 3JSC A; 1NG2 A; 4FW2 A; 1X43 A; 2CSI A; 3HRS A; 3QPH A; 5GAO n; 2K79 A; 3G4S A; 1KC8 R; 4JLI A; 4JJN K; 4IUP A; 2YUQ A; 2X35 A; 5LJ3 f; 2JS0 A; 2XIC A; 4KGZ B; 2FPE A; 3LH0 A; 3OYN A; 1WJQ A; 4M4Z A; 5GAM e; 2LJ3 A; 5A0G A; 1M90 U; 2LNV A; 4OB1 B; 4QVZ A; 3M5A A; 4HA8 A; 3WVD B; 1YIJ A; 1EIF A; 2LCS A; 2E6N A; 1OZ2 A; 1ARK A; 3EH2 A; 1KD1 C; 2OTL T; 2BUD A; 5LJ5 j; 2DYB A; 1KHI A; 1I8F A; 3OSS C; 2QQA A; 5CQX A; 2DFU A; 4MDW A; 1K73 C; 2ESW A; 3ME9 A; 3JCM c; 3OYF A; 1K8A C; 4OGE A; 2DKG A; 4OMQ A; 2HD0 A; 1I0C A; 1PSE A; 1JRI A; 3CPF A; 2K3Y A; 3IQL A; 5M9O A; 1QVP A; 3G6E T; 2EWN A; 1PNJ A; 1SSF A; 2HBP A; 4M77 C; 5FW9 A; 4XK8 E; 3JB9 J; 1WLP B; 2E6Z A; 1YN8 A; 5DM7 R; 2K57 A; 4IIM A; 4JRK A; 1NJI R; 1X2Q A; 1YNZ A; 2G6F X; 4LN2 A; 4ZNX A; 4LD9 K; 3CXC S; 1PHT A; 1Q7Y R; 2DJQ A; 3CD6 T; 3I35 A; 5FRO A; 8AT1 B; 4JDS A; 1YJN T; 2FEI A; 1SHF A; 2VV5 A; 2ZPB B; 3CCV T; 4N0A C; 4ATO A; 2J05 A; 2QA4 Q; 5GAM h; 1ZSZ A; 3E9F A; 3HRU A; 1VQP A; 1PKS A; 1S72 A; 5GAO l; 3REB B; 4NL3 A; 2QEX T; 4FIB A; 3CC7 A; 2FRY A; 2KMT A; 3JB9 I; 4R0K A; 1D3B B; 2J7I A; 1VQO Q; 3TU4 K; 3QJY A; 2VKN A; 4MZM A; 2DM1 A; 2EYX A; 1RLQ C; 3X24 B; 1JU5 C; 2DER A; 1GCP A; 1MND A; 1N27 A; 1OX8 A; 3J7A F; 2FZK B; 1AZG B; 1B07 A; 5FWB A; 2J06 A; 2QXF A; 1SRM A; 2BZX A; 2EW3 A; 3MP6 A; 1EX4 A; 1RAA B; 4ME7 A; 3OS0 A; 1YI2 Q; 3L2Z A; 2LQ8 A; 5CK9 A; 3MEU A; 3BFM A; 3PIP A; 4PK4 A; 2A7Y A; 4PJO D; 3CCQ Q; 5GAN 5; 4M7D D; 3ULR B; 4C5E A; 5GAN 6; 5GJV B; 1WGS A; 3I5R A; 1PC0 A; 3EGU A; 4GLM A; 2E5K A; 1WFW A; 2RI3 A; 2J6O A; 1X27 A; 1FWZ A; 2HEQ A; 4ANJ A; 5GMK j; 2LQN A; 2FZG B; 1Q81 U; 2QDY B; 4QW2 A; 1MGQ A; 5CIU A; 5FRM A; 4A53 A; 1VQL A; 3VS3 A; 1N8R U; 2LP5 A; 4M7A G; 4J9G A; 4C8Q D; 1WDX A; 5FU7 C; 1AZE A; 3H8Z A; 2SRC A; 3RKY A; 3S6W A; 2JNG A; 1NEB A; 5AYF A; 2HL3 A; 2G3R A; 3A8O B; 4ZTJ A; 3V8K A; 4J9I A; 4MDX A; 4BE2 A; 1RAE B; 2KNB B; 1N9R A; 2QGG A; 4X34 A; 1K0X A; 1E7O A; 1QVG S; 3MET A; 3BDU A; 4ORZ A; 3CMA A; 4PLI A; 1AD5 A; 2MMP A; 3NFC A; 2V8J A; 3H0F A; 4JRI A; 1D09 B; 5I2S A; 2BKD N; 1ZBX A; 1VQ9 T; 3QII A; 2DL7 A; 2PZ1 A; 2JTF A; 2BE7 D; 1SG5 A; 3PGG A; 3X28 B; 4MMK A; 1VQ6 T; 2V26 A; 2E3H A; 3JCM P; 1Y96 A; 2X4W A; 3JAM E; 1M1K C; 4OMP A; 1ZSZ C; 5CQY A; 2AZS A; 2RQT A; 2QQB A; 3VUZ A; 1D1C A; 5GAN 3; 4RTV A; 2CZ1 B; 2O01 E; 1VQN Q; 1XJW B; 3VS2 A; 1AEY A; 1N9S A; 2CP3 A; 4PFZ A; 2EAY A; 5HK0 A; 4E6R A; 4A4E A; 3MKD A; 3OS2 A; 4M77 D; 4ZN1 A; 2J6K A; 4IUV A; 1WPY A; 4WCI A; 3OY9 A; 3CCE Q; 1F1B B; 5D6X A; 2W0Z A; 4J5Y A; 3NTI A; 4E47 A; 2HMA A; 2DE0 X; 4E7Z A; 2K5F A; 4CC4 B; 3JCM d; 5KYW A; 2X3W D; 2YSQ A; 3LGF A; 4QVC A; 4FYX B; 2GNC A; 4OB0 B; 2QA4 T; 1QVF P; 1QP3 A; 2DF6 A; 2DMO A; 4KGX B; 3CCR T; 4C5H A; 3LWH A; 3E1S A; 1CKA A; 2OJ2 A; 4FU6 A; 2L89 A; 2D1X A; 1C6V X; 1ABQ A; 2KAF A; 3EFO B; 4A4H A; 2NUZ A; 1RL2 A; 3MCA B; 5GAO q; 4RKU E; 4BE1 A; 2DVE A; 4PJJ A; 3SD4 A; 5DY9 A; 4F16 A; 4E7H A; 3REA B; 4EMK A; 2H3J A; 1H92 A; 3QDF A; 3RUX A; 3JCM V; 2FG0 A; 1WQW A; 1CKB A; 2DXB A; 2A3L A; 4PL6 A; 2DEU A; 4XQ3 A; 4C0G A; 4FT2 A; 4M78 B; 4M78 F; 4RTT A; 2LT4 A; 1YI2 T; 1XNI A; 5KE2 A; 2CH4 W; 5IAY A; 4K11 A; 4E7S A; 3DB4 A; 2HBW A; 3M56 A; 1R0C B; 5GMK i; 1VQ4 A; 4PJO A; 2EVR A; 1PSF A; 4M78 E; 1ZQ1 A; 4C92 B; 2YXY A; 3CCU A; 3EHQ A; 2VVK A; 4MZP A; 3EHR A; 5A0D A; 1YIJ T; 4ZN3 A; 4HT8 A; 1IB8 A; 2O88 A; 2RJE A; 2EGE A; 1D1A A; 4GBQ A; 1TH7 A; 2MYS A; 3CC4 A; 4A54 A; 1KQS A; 2AKL A; 2FB7 A; 3L2V A; 3OYD A; 4V2S A; 4B9W A; 2B8A A; 3PMI A; 1M90 C; 3QSU A; 2CP2 A; 3CXC A; 1VQM A; 2PNI A; 1Q82 C; 1HJD A; 2VXE A; 4XU3 A; 1VQ8 A; 3CCM A; 2FPF A; 4C8Q A; 1WXU A; 1I4K 1; 2M0Y A; 4J9D A; 3CCS Q; 2YUN A; 4NL2 A; 1Z9Q A; 2EYW A; 2ZAE A; 1IXD A; 4Y92 A; 1U5S A; 3KXT A; 3ZL7 C; 1QCO A; 2KBT A; 1WJR A; 1V1C A; 3MJX A; 4UC4 A; 3RDV A; 2D0Q B; 2L3S A; 2DX1 A; 1OQK A; 5I21 A; 1VQP T; 3T9N A; 3OW2 P; 4HVV A; 5GAN 7; 1S72 T; 2XG8 D; 3KFV A; 3TRE A; 1UTI A; 1HK9 A; 2D6F A; 3CC7 T; 1P92 A; 1J3T A; 3G6E Q; 2ED0 A; 3FLG A; 4DEX A; 3JRZ A; 2L8D A; 1I5L A; 2KT1 A; 4PFP A; 3EG1 A; 2KY9 A; 3FC3 A; 1ZBJ A; 4Z8A A; 3VV0 A; 1M8V A; 3CD6 Q; 2DAQ A; 1YJN Q; 1VQ7 A; 3X20 B; 4M75 B; 3O8V A; 3Q1J A; 2EBP A; 3FJP A; 2DBM A; 2RHI A; 3QYH B; 4LUE A; 1MHN A; 1H3H A; 2O9S A; 2PTK A; 1VQK A; 1VQN T; 4OP0 A; 5KYX B; 2MF2 A; 2WSF E; 1K1Z A; 2O2O A; 2HAX A; 5L23 A; 2FZC B; 2XDB A; 2JTM A; 3C4S A; 3H9N A; 3L2R A; 4M77 A; 3MP1 A; 4FT4 A; 3CCE T; 2HQX A; 2HZY A; 3JCM Q; 1UE9 A; 2KRS A; 4CI0 C; 3A1P A; 3I56 A; 1BK2 A; 1MV0 B; 5IHN A; 1D1B A; 3HL8 A; 4KH1 B; 3LLR A; 2DD4 A; 5CVI A; 2PVG B; 4JRQ A; 5GAN d; 1OI1 A; 1W4S A; 4RTX A; 2FL7 A; 2CUD A; 3OYY A; 3H0H A; 3SWN C; 4M7A F; 1YIT A; 4N0A A; 2VGM A; 1M30 A; 2LRQ A; 3H6Z A; 5LJ3 d; 1D0Z A; 1UEB A; 1Q86 C; 4N4H A; 1VQL T; 2PQW A; 2E1H A; 2NUP B; 2LCC A; 4M7D C; 1QVG A; 4M7A E; 2KSS A; 4AFQ C; 3CC2 A; 1KC8 U; 2RQR A; 1BIB A; 4JZ3 A; 3RR6 A; 3TEE A; 1W2B S; 2DXT A; 3WVE B; 4C92 C; 1PWT A; 4A4G A; 1R8O B; 1UJY A; 2RQU A; 2K6D A; 1N8R C; 1Y71 A; 2GBQ A; 3M0R A; 4QQD A; 3MP8 A; 4RCC A; 2YUO A; 1LVK A; 1M1K R; 1PD1 A; 5A0L A; 2JS2 A; 4FW1 A; 4C8Q C; 1IGU A; 1MMN A; 3GP8 A; 1DJ7 B; 2QYZ A; 3RKX A; 2XD0 A; 2VYT A; 1AWX A; 2L3P A; 4F7U A; 2YHT A; 1HSQ A; 1A0N B; 2V8I A; 1X69 A; 1T3L A; 1N5Z A; 2XI9 A; 4J9C A; 1K76 A; 1YWP A; 2QTX A; 4PJL A; 4C5G A; 3SDZ A; 4XU2 A; 3GOX A; 2ED1 A; 1PRL C; 1NJI U; 2RQW A; 2SEM A; 4KRT A; 3CCJ A; 3GNF B; 1Q7Y U; 1HXD A; 1VQ9 Q; 2HQH A; 3R6O A; 1AWO A; 2DK3 A; 2VXF A; 3CCS T; 1YHQ A; 2YLC A; 3JCM W; 3PMT A; 5FWC A; 2E12 A; 1I1J A; 5KYU B; 2AHJ B; 1TS9 A; 4Z02 A; 1VQ6 Q; 4QT7 A; 2DIQ A; 4PJO G; 1JJ2 S; 1M3B A; 2HKQ B; 5LJ5 h; 1M27 C; 4LDY A; 4M7D G; 2ZGW A; 1TWB A; 2EQK A; 3PIO A; 2K2M A; 2K3X A; 1K4U S; 1YCS B; 2EJ9 A; 2LT1 A; 4M75 C; 1M3C A; 2QK0 A; 3S3O A; 1Y7X A; 2ROT A; 2OTJ Q; 1KFZ A; 1R0B G; 2QG9 B; 1WXB A; 2GQV A; 2R5M A; 1GXI E; 4QQG A; 1BI1 A; 3M0T A; 4ZGD B; 1FMK A; 1IZ6 A; 4LDW A; 5GAM d; 1TOV A; 2Z0W A; 3NTH A; 3JB9 D; 3GBQ A; 1SEM A; 4C8Q G; 1K0S A; 3LW5 E; 4JLG A; 4JRP A; 1WYX A; 3RER A; 4PNO A; 3X25 B; 2KXC A; 4Z88 A; 3OS1 A; 3CME A; 2K2V A; 3CCR Q; 2DYI A; 2QDL A; 1PG5 B; 3GF5 A; 1UGV A; 3V8L A; 1FMV A; 3CCL A; 4FCY A; 5IN1 A; 2RI5 A; 3UPU A; 2CSQ A; 2PUK B; 1Q82 R; 4LDU A; 3UT1 A; 5LJ5 f; 3CCU T; 1TUC A; 1AOJ A; 2EGC A; 3M4Y A; 2ZPE B; 1SRL A; 3CPW S; 2L3Q A; 2L0A A; 3LWI A; 2JOY A; 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3BW1 A; 5D6W A; 2A37 A; 3RMQ A; 2EPD A; 2EYQ A; 2M9U A; 5KYY B; 5LJ5 g; 1QLY A; 2RJD A; 3NPF A; 3SFM A; 4E2F B; 4Y91 A; 1XQH A; 1M5Q 1; 3EGX B; 1UDL A; 4KUL A; 1C0M A; 3RIR A; 4F7U G; 2EGA A; 4RTU A; 3G71 A; 1OU9 A; 1QKX A; 3QHS A; 1YIT T; 3QDR B; 2RB6 A; 1KQS P; 4FYY B; 1WIE A; 2CUB A; 3RES A; 1W2B A; 1RAC B; 2RH2 A; 3M0P A; 2OTJ T; 4J9H A; 1C1A A; 1WHK A; 4FYV B; 4M75 D; 3CXC P; 2GGR A; 3M55 A; 2RJC A; 1D0X A; 2M1H A; 3M59 A; 4LDV A; 2IPO B; 4IUT A; 1GFC A; 3RNJ A; 3CC2 T; 4RG2 A; 2OX7 A; 2PU9 B; 1AWJ A; 3M4G A; 1NE8 A; 3FJ5 A; 2M51 A; 1YWO A; 2Y90 A; 4JPB W; 2F5T X; 3H41 A; 2RK1 A; 4LDX A; 3RBB B; 2E41 A; 5KYW B; 2KI7 A; 4BDZ A; 3QO3 A; 2OTL A; 1YP5 A; 1RI9 A; 5CCA A; 1M2V A; 4BI8 B; 5GAN 2; 4JJB A; 1VQL Q; 1OUL A; 5GAO r; 5AT1 B; 2QTV A; 2L2P A; 2JT4 A; 3M9Q A; 4IIO A; 2XDP A; 3I55 A; 2DET A; 1U06 A; 3FDR A; 4BI3 A; 3HP9 A; 5KCH A; 1AHJ B; 2NUT B; 2Y4X A; 3NTK A; 3EFO A; 5GAO m; 3OYA A; 1LOJ A; 4J7F A; 5J39 A; 1KD1 R; 2P0K A; 3P8B B; 1NLP C; 2HSP A; 3V7C A; 4OMN A; 3G4S T; 5CKE A; 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