The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VQ8 Q; 3I55 Q; 2QA4 Q; 1K9M R; 1KD1 R; 1KQS P; 1YHQ Q; 3CCE Q; 1Q7Y R; 1VQP Q; 1VQL Q; 1KC8 R; 1VQ6 Q; 3CCJ Q; 1YJN Q; 1YI2 Q; 3G4S Q; 2QEX Q; 1JJ2 P; 1NJI R; 1W2B P; 3OW2 P; 3CC4 Q; 3CC2 Q; 1VQ9 Q; 1K8A R; 3CD6 Q; 3CCL Q; 1S72 Q; 1VQ5 Q; 2OTJ Q; 1VQ7 Q; 3CCM Q; 3G6E Q; 2OTL Q; 3CC7 Q; 3CXC P; 1Q81 R; 1QVF P; 1K73 R; 1VQO Q; 1YIJ Q; 1N8R R; 3CME Q; 3CCR Q; 1QVG P; 3CCU Q; 1YIT Q; 1YJ9 Q; 1VQ4 Q; 3CCV Q; 3CMA Q; 1VQN Q; 1VQM Q; 3CCS Q; 3G71 Q; 3CPW P; 1YJW Q; 1M1K R; 3CCQ Q; 1VQK Q; 1Q82 R; 3I56 Q; 1Q86 R; 1M90 R; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DL5 A; 3OS1 A; 2FB7 A; 1PHT A; 2QDL A; 4Y91 A; 1UGV A; 2F2V A; 3QUI A; 2P4T A; 2JOY A; 4JZ3 A; 1WHJ A; 3A98 A; 4M78 C; 3OY9 A; 3HFN A; 4E7L A; 3N5B B; 1BCO A; 1NLO C; 2LQ8 A; 4DQ2 A; 3H41 A; 3OYL A; 1CKA A; 4DA4 A; 4ESR A; 1X01 A; 2A37 A; 4M78 G; 1M5Q 1; 3GPL A; 2GTO A; 3LH5 A; 2EGC A; 3OSV A; 5KYX A; 1E6G A; 4RTT A; 4EPC A; 2G3R A; 3KBG A; 2C06 A; 3QG1 A; 1M27 C; 1K73 R; 2MOX A; 1N9R A; 2X9H A; 4JJC A; 2FZG B; 4F7U A; 3RKY A; 1BIB A; 3CPW P; 3HPW A; 2HMA A; 1WIE A; 5GAN f; 2LNH B; 4M78 F; 1VQP T; 1HXD A; 4JRQ A; 3M4G A; 2HSP A; 3KXT A; 1VQ9 T; 1J3T A; 1UEB A; 3LLR A; 2OAU A; 1BI2 A; 1Y7X A; 4HVV A; 2M1H A; 1M3A A; 3G71 A; 4LNP A; 1C1A A; 2JVV A; 2YWW A; 2RQR A; 5GAN 3; 3AHU A; 2X4Y A; 3HSB A; 2FG0 A; 4J6Y A; 5KYW A; 1SKU B; 1PM3 A; 1RAI B; 3M55 A; 3CD6 A; 2HEQ A; 2EJ9 A; 4LE9 A; 2EGE A; 3LW5 E; 2JXB A; 4ZTF A; 3JB9 D; 2WAC A; 2ESW A; 2LQN A; 2KR3 A; 2DD4 A; 1K9A A; 3CMA Q; 1PSE A; 4RG2 A; 3QWX X; 4A4H A; 4OGE A; 4FU6 A; 2HQX A; 1VQL Q; 2RD1 A; 3NHN A; 1M90 U; 2JMA A; 2ZPE B; 4XAX B; 3X24 B; 3EGD A; 2R5M A; 3MJX A; 2BIV A; 2VWF A; 4X34 A; 1WXT A; 4XU2 A; 2GQV A; 1D3B B; 1KQ2 A; 2BUD A; 3QBY A; 5LJ3 d; 1UGP B; 4BAC A; 1OEB A; 2DXT A; 4DBQ A; 4QT7 A; 5CIU A; 1SSH A; 2LJ3 A; 3L2Z A; 1VQ9 Q; 4NL2 A; 5GAN 6; 1JEG A; 2HQH A; 4NL3 A; 5CKF A; 5HY6 A; 5GAN 2; 2EJF A; 1QWE A; 2K79 A; 1WA7 A; 2QA4 T; 1VQL A; 5CKH A; 4J9G A; 4ZN1 A; 1N8R U; 2QXF A; 2EYY A; 2XDP A; 4C92 D; 2RJC A; 3I35 A; 4Z02 A; 2FZC B; 2X35 A; 1GBR A; 4R55 A; 1YCY A; 3G6E Q; 1AT1 B; 3JCM V; 3EFO A; 1YHQ A; 1K4U S; 4E7H A; 1TOV A; 3OYE A; 2VV5 A; 4LN2 A; 1M2V A; 2V1Q A; 1LNX A; 4HCZ A; 2CUB A; 1NYF A; 4M75 B; 1PG5 B; 2RHY A; 3GNG A; 2KT1 A; 5FU7 B; 4BDZ A; 3ZFJ A; 3CC7 T; 4ELZ C; 4AFQ C; 1M3B A; 3TSZ A; 1QWF A; 1Y96 A; 4M7A D; 4PLL A; 1WXB A; 3LH0 A; 2FPF A; 2YUN A; 3NTI A; 4C92 E; 4OB0 B; 2Y4X A; 4DEX A; 2FPE A; 3HRS A; 3OS0 A; 1RUW A; 5CCA A; 5CAI A; 4BI8 B; 3JCM W; 3CCJ A; 3ME9 A; 2KXC A; 4XTU A; 1QVF S; 2HCK A; 3G6E A; 3JV3 A; 2YHT A; 2QQA A; 3CCR A; 2YLC A; 1R77 A; 1OPK A; 1SEM A; 2R5A A; 2RB6 A; 2J6K A; 2L3Q A; 2EIF A; 3UF4 A; 1QVF A; 1WHM A; 4M7A E; 1UGS B; 1M1K R; 1M1K C; 4OVA A; 2C0I A; 2HDA A; 2QA4 Q; 2BKD N; 2ENM A; 3LWH A; 4AMC A; 1FX7 A; 1B34 A; 2VXE A; 3A8H B; 1B07 A; 1NJI R; 1M4Z A; 3QO3 A; 1ZSG A; 1NJI C; 2PNI A; 4D8K A; 1XTD A; 3PFS A; 1OV3 A; 3CCU T; 1ABO A; 4XTW A; 5HK0 A; 1GFC A; 3JRZ A; 5DY9 A; 5GAM h; 4GLM A; 2LZ6 B; 2EFI A; 2RJF A; 1RAF B; 5CR2 A; 2EQI A; 2GFA A; 2Z0W A; 1TH7 A; 4IUQ A; 4JS5 A; 1PKT A; 4II1 A; 5GAN d; 2EBP A; 1WYX A; 3BE3 A; 4PFP A; 2RN8 A; 4LDU A; 1TUC A; 1IHV A; 2QYZ A; 3OS5 A; 3CC7 Q; 2AZV A; 2YXY A; 4JRP A; 3QJ6 A; 3G7Z A; 2KYB A; 2I2L A; 2KNB B; 3ZL7 C; 2P84 A; 2VYT A; 4K11 A; 3LGF A; 3EG9 B; 1U5S A; 2RO0 A; 3FDR A; 2KY9 A; 3KFV A; 4E7Z A; 2RK2 A; 3PGG A; 2K3B A; 2X4X A; 1D1A A; 1RAA B; 2CP2 A; 4M7A A; 1LCK A; 1AWJ A; 2FYK A; 1ZBX A; 2QK0 A; 2X4J A; 2JTE A; 2QQB A; 1VQN T; 2K2M A; 2DF6 A; 1Q82 C; 3QII A; 3EFS A; 2FRW A; 4B9X A; 1A0N B; 2JS2 A; 4A4F A; 4CI0 C; 5I2M A; 4ZNX A; 2P0P A; 4IIO A; 3VS7 A; 4JUV A; 5GMK i; 3TU4 K; 3JB9 J; 2XK0 A; 3UPU A; 3S3N A; 2J06 A; 1M2O A; 2CZ7 B; 2LT4 A; 2O31 A; 3R6O A; 3D7S B; 5LJ3 g; 4LDW A; 4HKE A; 3JCM g; 3V7S A; 2DVJ A; 2J6F A; 2PQW A; 2O9V A; 1G2B A; 1OZ2 A; 1D09 B; 2RH2 A; 1YI2 A; 2V1R A; 4IIM A; 1HJD A; 4RTY A; 5C6S A; 2E4H A; 3CC2 T; 2KI7 A; 5D6W A; 1T3S A; 4PJN A; 3FJP A; 1Q82 U; 2JTM A; 4LDX A; 2AK5 A; 1LPL A; 1RI9 A; 4MDW A; 2DIL A; 2DO3 A; 2LJ0 A; 1ZSZ A; 4AG2 C; 2EVR A; 1JBM A; 4JRK A; 3M58 A; 2RNA A; 4PNO A; 1OUL A; 1YBY A; 5GAO m; 2VAS A; 4HT9 A; 2DIG A; 4M77 C; 2AZS A; 2NYS A; 1OZ3 A; 2L89 A; 1VQ7 A; 1UG1 A; 2ZPF B; 4QQ6 A; 1YJN Q; 2MYS A; 1MMA A; 1UGR B; 3QZ9 B; 4PJM A; 3FB9 A; 3E9F A; 1MV3 A; 4J6W A; 3I5R A; 1VQ4 T; 2OJ2 A; 2A3L A; 4M77 G; 4HCK A; 1WJS A; 3L42 A; 2CRE A; 2HL3 A; 3I56 T; 2D9T A; 5DM7 R; 2QDY B; 4B9W A; 3CCS Q; 3RIR A; 4J9H A; 1I1J A; 2DX1 A; 4QVD A; 1K73 U; 2BE9 B; 1VQ8 Q; 3VS6 A; 1Y57 A; 2LP5 A; 1WHK A; 3Q1J A; 4M77 F; 2NUP B; 4X9C A; 4MZM A; 5GAN 4; 3CC4 Q; 2Y4Y A; 3GLX A; 3EGX B; 3F70 A; 5DLO A; 5LJ3 j; 2J05 A; 4GLK A; 1N9S A; 2OTL T; 2RJE A; 1WHL A; 1IZ6 A; 1YJN A; 3GIB A; 3E1S A; 4XTZ A; 2V8K A; 1VQO A; 2KRO A; 1VQM A; 2LX9 A; 4LUD A; 2B8A A; 3CCS A; 2E3H A; 1NG2 A; 1VQ8 A; 1MGQ A; 2XD0 A; 2FPD A; 3CC4 A; 2EWN A; 1JB0 E; 3CCM A; 2DJQ A; 3MET A; 4J7F A; 2MF2 A; 4E7K A; 3BDU A; 2E70 A; 4FSS A; 3VU3 C; 2CP6 A; 4C5I A; 1GRI A; 5L23 A; 3PMT A; 1BBZ A; 4MMK A; 4BUG A; 3WVE B; 4BY6 B; 1SHF A; 1UJY A; 3S3O A; 3OYC A; 5GAM e; 2ZAE A; 3JCM f; 2E64 A; 4EMK A; 2KQW A; 2JM9 A; 2HQE A; 1U1T A; 2DAQ A; 2DFU A; 1WHH A; 2KE9 A; 1RI0 A; 5FWB A; 3P8D A; 1YWO A; 3QDR B; 2A28 A; 4NOY A; 2QGG A; 3P8B B; 3G71 T; 1AWW A; 4Q5W A; 9ATC B; 3VS0 A; 4M7D C; 1YIT Q; 5HK3 A; 3MEW A; 3NGP A; 3PT9 A; 4M78 B; 1PRL C; 3QYH B; 3GBQ A; 2OTL Q; 3R6N A; 3S6W A; 5KH6 A; 3CD6 T; 1RLQ C; 4OB3 B; 1VYT A; 1YFN A; 1TG0 A; 2RHU A; 2GCX A; 4M7D G; 3U23 A; 2KRS A; 1GL5 A; 2YSQ A; 5KCO A; 3M59 A; 1AVZ C; 1EIF A; 1X75 C; 1K0X A; 1U8R A; 1ZUY A; 2ED1 A; 1YWP A; 1VIE A; 5CQX A; 1OQK A; 1W6X A; 2NUT B; 3VS4 A; 1X43 A; 3LWI A; 1X27 A; 4KGX B; 3OYD A; 4M7D F; 2RQW A; 2L2P A; 2VB6 A; 5IAY A; 2RJD A; 3H0F A; 4PFZ A; 4BY6 C; 3O8V A; 3E19 A; 4JJN K; 3C95 A; 1I0C A; 3PTA A; 5IXB A; 5A0D A; 2FRY A; 3WXM B; 4EIK A; 5GMK h; 2MWO A; 2LNV A; 2M0Y A; 1VQ6 Q; 2DVE A; 1NPR A; 3VS1 A; 3SWN C; 4ME7 A; 4DBH A; 2K4Y A; 1BYM A; 2KXD A; 3BDL A; 1H3Z A; 3CMA T; 1PC0 A; 2CZ0 B; 3AT1 B; 3G71 Q; 4WF2 A; 1XOV A; 1GCQ C; 2EQM A; 1JRI A; 2KEA A; 4ORZ A; 4LXC A; 1VQL T; 2CGH A; 2RQV A; 1I5O B; 4FYY B; 2J6O A; 1G83 A; 1M1K U; 1QQJ A; 2SRC A; 2A08 A; 3CD6 Q; 1G3W A; 4QQD A; 3H0H A; 5EC7 A; 5KE3 A; 3OBY A; 4J7I A; 4C8Q C; 1NJI U; 3X25 B; 1K73 C; 3HFO A; 1D1B A; 1YHQ T; 8ATC B; 1VQ6 A; 1Z9Q A; 2RA2 A; 5KYX B; 1Q86 R; 1Q86 C; 1VIF A; 4V2S A; 1WJR A; 4R56 A; 1X6O A; 1XNI A; 4C8Q G; 2LVM A; 5CKD A; 2PVO B; 4QVZ A; 1AEY A; 4ZGE B; 2HAX A; 4FW1 A; 3QPH A; 8AT1 B; 4DOV A; 4MDX A; 3SB2 A; 3TVT A; 3OYN A; 2MK5 A; 1IO6 A; 2O9S A; 1N27 A; 1ZA1 B; 2DRM A; 4C8Q F; 3A8G B; 2JNG A; 2BE7 D; 4FIB A; 4D8D A; 2YT6 A; 2KRN A; 2QEX Q; 3G6E T; 1OU8 A; 3CCR T; 2JTF A; 2DYB A; 1GBQ A; 1AWX A; 1QVF P; 4J9B A; 3HP9 A; 4M75 D; 1PSF A; 1BI0 A; 1W2B S; 2QI2 A; 3G4S A; 3OYY A; 1I4K 1; 4AFU C; 2RPN A; 1UGQ B; 4FYW B; 2MAM A; 3M0Q A; 1QMC A; 5FRM A; 1W1F A; 2KVQ G; 4A53 A; 2KT8 A; 1RAD B; 2E1H A; 4J9C A; 5GAN 7; 1OOT A; 2LQW A; 3GNF B; 1W2B A; 1KQS S; 3PMI A; 2GBQ A; 4EDU A; 2RHX A; 3PE0 A; 1D0X A; 2I0N A; 1KSW A; 1VYV A; 1AWO A; 2QEX A; 1UHF A; 4M75 E; 3JCM d; 1VUB A; 1YHQ Q; 2M02 A; 1KC8 R; 2CSQ A; 1KQS A; 1D3B A; 3EGU A; 1KC8 C; 4HCC A; 1YN8 A; 4BDY A; 2DD5 A; 1VQ5 Q; 2F2W A; 1RAE B; 2P4R A; 2PVD B; 2A7Y A; 4F7U G; 2F1L A; 1BK2 A; 1QLY A; 4J8O A; 4PKC C; 5FLX E; 1UE9 A; 2C0T A; 4E6R A; 3C12 A; 2O88 A; 2DJZ A; 4A4E A; 4N0A A; 3CBM A; 2Y90 A; 2DK3 A; 3JCM X; 2CT4 A; 4OMF B; 2DEQ A; 3CCJ Q; 2F2X A; 3VKI A; 3CME A; 4WCI A; 3V8L A; 1K1Z A; 3C94 A; 4F7U F; 1HSQ A; 5A2Q E; 1OPL A; 3O5Z A; 1TU0 B; 2COW A; 2HL5 C; 1N6A A; 4BE1 A; 4KBM B; 5J3B A; 1FMW A; 3CCR Q; 1UEC A; 4HXJ A; 1JXM A; 5D6Y A; 4PJJ A; 1I07 A; 4PJO D; 4RTW A; 4A4G A; 3I55 Q; 2YRD A; 3VS5 A; 1K76 A; 1VQ5 A; 2XDB A; 1PKS A; 4IUR A; 3ASK A; 2ZCF B; 2EJG A; 5LJ5 d; 3HL8 A; 2MI6 A; 2CP5 A; 4M75 A; 1T0H A; 2CT3 A; 1VQP A; 4RTX A; 1Y96 B; 5I2S A; 1V76 A; 5GMK e; 2E12 A; 2DL3 A; 2EQU A; 4Z8A A; 4PJO E; 1Z9Z A; 4E7I A; 2JZ2 A; 3JB9 I; 1TXQ A; 3M56 A; 2QAZ A; 1HD3 A; 2KAF A; 1RAB B; 4JLI A; 3SD4 A; 1W4S A; 5LJ3 h; 3I55 A; 1WQ7 A; 2QAS A; 2CP3 A; 1TSF A; 1VQK Q; 1UB4 A; 3EFR A; 1PD0 A; 3FJ5 A; 2DTI A; 3CCE Q; 1QKW A; 3EG2 A; 4ZGD B; 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5ECA A; 5KYU B; 4C92 C; 4CC7 A; 1PD1 A; 4ZTJ A; 1ZA2 B; 3BFM A; 2K2V A; 2MCN A; 2RI3 A; 2M16 A; 4RKU E; 3T9N A; 2YUQ A; 2X4W A; 1RAH B; 4C92 G; 3V8J A; 3C0C A; 2X3W D; 3QZ5 B; 1WHG A; 5GAN h; 2OTJ A; 2ZPH B; 3REA B; 2JUF A; 3X28 B; 5CO7 A; 2QQ9 A; 5GAM g; 4M7A C; 1R0B G; 4FYX B; 1VQO Q; 4XU1 A; 4C92 F; 1NEG A; 3OYB A; 5AT1 B; 2EQK A; 1VQM Q; 1V29 B; 2LQK A; 3MO8 A; 3IQL A; 4X1V A; 2AT1 B; 2XU8 A; 1K0S A; 5LJ5 g; 2RMO A; 5IHN A; 5M9O A; 4PJL A; 4M7A G; 3PNW C; 2JN0 A; 2DZC A; 2MIO A; 1U06 A; 4E2F B; 1Q86 U; 1M1G A; 3ER0 A; 4L6V 5; 4M78 D; 3TQ7 P; 1WI7 A; 4WTO B; 1YIT T; 3CCM Q; 3TCJ A; 1PWT A; 2AKK A; 1E7O A; 2MPX C; 2NUP A; 3JAM E; 5D6X A; 3EGX A; 1M1F A; 3EG1 A; 4B6M A; 4M7A F; 4TVR A; 4M7D B; 1JQQ A; 2NUZ A; 5KYN A; 2KSS A; 2PZ1 A; 1BB9 A; 3DLM A; 1GXI E; 5GAO n; 1IRE B; 2KK4 A; 3UA7 A; 3CCV A; 1DJ7 B; 3A8O B; 3OMC A; 3OYG A; 1ZUU A; 2VVK A; 1X6G A; 1ZSZ C; 5LJ3 e; 1N5Z A; 1TWB A; 4N4I A; 5GAO l; 2XID A; 3L2Q A; 3OW2 S; 3S3M A; 1WQW A; 1F1B B; 3CXC S; 3OYJ A; 4AFZ C; 1KD1 R; 1KJW A; 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