The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
69
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structure length |
69
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Chain Sequence |
KDPKFEAAYDFPGSGSSSELPLKKGDIVFISRDEPSGWSLAKLLDGSKEGWVPTAYMTPYKDTRNTVPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Contractile protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain from S. cerevisiae Myo3
rcsb |
| molecule keywords |
Myosin-3 isoform
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| total genus |
11
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| structure length |
69
|
| sequence length |
69
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-12-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2A36 A; 2FPE A; 2KT1 A; 3H41 A; 2HBW A; 2D1X A; 2LX7 A; 4J9C A; 3U23 A; 2F2V A; 1YWP A; 2DBK A; 1NG2 A; 1SHF A; 1LCK A; 2A37 A; 4JJD A; 3VS6 A; 1B3Q A; 4IIO A; 1GFD A; 4RTW A; 1TUC A; 2PTK A; 1RI9 A; 2CUB A; 3ULR B; 1I0C A; 2RPN A; 2JXB A; 2YUQ A; 1PKS A; 2KRO A; 2LP5 A; 2KNB B; 3TSW A; 1OV3 A; 2FO0 A; 3VS2 A; 2AKK A; 3VS1 A; 4IIM A; 1BB9 A; 3H0H A; 2VKN A; 2O9V A; 1WDX A; 1M3B A; 1QKX A; 2FPD A; 2KEA A; 2MCN A; 3UA6 A; 4Z89 A; 4DEX A; 1RLQ C; 2DA9 A; 2DX1 A; 2KXD A; 4J9E A; 1NEG A; 4F14 A; 2LNH B; 2G6F X; 2L3P A; 4X1V A; 4AG1 C; 1PHT A; 2SRC A; 1KIK A; 2DJQ A; 1ARK A; 2C0O A; 2H8H A; 3RBB B; 3REB B; 2ED1 A; 3O5Z A; 1AWX A; 1W70 A; 2DMO A; 1GCP A; 4AFU C; 2DL8 A; 2O2O A; 4ZNX A; 1AWJ A; 1K4U S; 1ZUU A; 1U06 A; 1G2B A; 1G83 A; 2CH4 W; 2YT6 A; 1K0S A; 2DRK A; 2D0N A; 2DYB A; 1HD3 A; 2OAW A; 1A0N B; 3RNJ A; 3THK A; 3SHW A; 1OPL A; 2VVK A; 1WX6 A; 1Y57 A; 2YSQ A; 5IHK A; 2FRW A; 1PNJ A; 4F16 A; 4RTU A; 1M3C A; 3PE0 A; 2FPF A; 2C0I A; 2DM1 A; 2DL5 A; 1VYV A; 1QWE A; 2O88 A; 1X6B A; 1IO6 A; 3I5R A; 2GTJ A; 3IQL A; 3M0P A; 3M0S A; 2EYW A; 2LJ3 A; 5IXF A; 2KE9 A; 3FJ5 A; 1BK2 A; 1W6X A; 2DIL A; 1AZG B; 4D8D A; 2F2W A; 2DNU A; 2K6D A; 3EG1 A; 1SPK A; 3GBQ A; 4Z8A A; 5I22 A; 1WFW A; 2A28 A; 1E6H A; 3NHN A; 1U3O A; 1QLY A; 2GTO A; 2ENM A; 4JJB A; 1GL5 A; 4OML A; 1H8K A; 1ZLM A; 2IIM A; 3UAT A; 2B86 A; 1M30 A; 1UGV A; 2YUN A; 2C0T A; 4F17 A; 2K2M A; 1WXT A; 1CSK A; 2KR3 A; 1E6G A; 1X6G A; 2AK5 A; 2MIO A; 2XMF A; 2HEQ A; 4AG2 C; 2RQU A; 2J6F A; 3VS5 A; 2J6O A; 4OMN A; 2LJ0 A; 5L23 A; 2EKH A; 1WA7 A; 1ZBJ A; 1WYX A; 4AFS C; 2ECZ A; 2CSI A; 2D8H A; 5EC7 A; 2SEM A; 1UHF A; 2O9S A; 3H0I A; 4RTZ A; 4CC2 A; 1M27 C; 2ABL A; 2KT8 A; 1HJD A; 1Z9Q A; 1NYG A; 2JS2 A; 1VYU A; 4R0K A; 2RMO A; 2DF6 A; 1K1Z A; 2X3X D; 4JZ3 A; 2CDT A; 2HCK A; 2AKL A; 2CUD A; 3TSZ A; 3EGU A; 1EFN A; 4AFZ C; 4JZ4 A; 1OOT A; 2PNI A; 3R6N A; 1YNZ A; 5IHN A; 1JXM A; 4FSS A; 2KXC A; 1M3A A; 4RTV A; 1PWT A; 1GBR A; 1JXO A; 2KBT A; 4LN2 A; 1SRL A; 1UJY A; 1M8M A; 2CH4 A; 4HVV A; 2EPD A; 2JT4 A; 1MV3 A; 2K79 A; 2EGE A; 2CSQ A; 5FWC A; 1GRI A; 4ORZ A; 4EIK A; 3NPF A; 2JM8 A; 2OI3 A; 2BZ8 A; 4GBQ A; 2AZS A; 2YUO A; 5FW9 A; 1WXB A; 3EG2 A; 2EW3 A; 2L0A A; 5HCK A; 3EHR A; 2FG0 A; 1T3S A; 4Y92 A; 1NEB A; 1W1F A; 2VWF A; 2DRM A; 2LQN A; 3VS3 A; 5IXB A; 4D8K A; 4OMP A; 1XOV A; 1NLP C; 2KYB A; 1JEG A; 1NYF A; 4A63 B; 3A98 A; 1WI7 A; 3UF4 A; 1K76 A; 3QWY A; 1KFZ A; 1S1N A; 2J7I A; 4J9F A; 4GLM A; 3LH5 A; 3KFV A; 4M4Z A; 1GCQ C; 4LE9 A; 2AZV A; 2BTT A; 1RLP C; 2KYM A; 3VRY A; 2L2P A; 2MOX A; 2L3S A; 1NLO C; 5FWB A; 4QT7 A; 4OMM A; 2CRE A; 1RUW A; 2W10 A; 4Z88 A; 2QDL A; 3M0U A; 2JW4 A; 2JMC A; 1QWF A; 2EYZ A; 1X69 A; 1Y0M A; 1ZSG A; 2RF0 A; 2KRM A; 1SEM A; 2LCS A; 2RQT A; 1UG1 A; 2JS0 A; 1KJW A; 2X3W D; 1GCQ A; 1YWO A; 4JPB W; 2CT4 A; 1FYN A; 2F2X A; 5I11 A; 1UUE A; 2PZ1 A; 1PKT A; 1JO8 A; 2GQI A; 2V1R A; 5GJV B; 1X27 A; 2M0Y A; 1GBQ A; 2LMJ A; 3H0F A; 2D8J A; 2J05 A; 5GJW B; 4E6R A; 1ABQ A; 1QCF A; 2GGR A; 1UEC A; 3I5S A; 3C0C A; 1T3L A; 4HXJ A; 5ECA A; 1WLP B; 1JU5 C; 3VS4 A; 2YDL A; 3EG3 A; 3NGP A; 1X43 A; 1WXU A; 1SRM A; 2OJ2 A; 1AVZ C; 2LJ1 A; 4J9D A; 2LQW A; 1MV0 B; 2E5K A; 1UDL A; 2NWM A; 2DE0 X; 3JV3 A; 4KRT A; 1J3T A; 1I1J A; 2EYY A; 4LNP A; 1PRM C; 2DL3 A; 1WIE A; 2ESW A; 1TG0 A; 3SEM A; 1GFC A; 2EQI A; 3PVL A; 3QWX X; 4J9G A; 1AWW A; 2A08 A; 1CKB A; 2RQV A; 1VYT A; 4HVU A; 2KRS A; 2RN8 A; 1AD5 A; 2J06 A; 3EG0 A; 3UA7 A; 1T0H A; 2HDA A; 2RNA A; 1UTI A; 2EGC A; 2BZX A; 2GNC A; 2KGT A; 2EVR A; 5IH2 A; 3VS0 A; 3VS7 A; 1HSQ A; 2P4R A; 2ED0 A; 1E7O A; 2JTE A; 2LZ6 B; 3PVQ A; 2GBQ A; 3VRZ A; 2O31 A; 1B07 A; 2JMA A; 1ZX6 A; 4CC7 A; 4RTT A; 2M51 A; 1ZUK A; 5IHI A; 4LUE A; 3TVT A; 1KSW A; 1AZE A; 3I35 A; 1YN8 A; 1T0J A; 1AOJ A; 1V1C A; 4DEY A; 4HVW A; 1SHG A; 2EYX A; 1OEB A; 2DL4 A; 3CQT A; 4AFQ C; 4JJC A; 2ROL A; 1K9A A; 2K7A A; 1H92 A; 1CKA A; 1UFF A; 2EGA A; 1SSH A; 1H3H A; 1BU1 A; 1YP5 A; 1ABO A; 3EHQ A; 1YCS B; 4K11 A; 4LUD A; 4RTX A; 1UHC A; 2V1Q A; 1U5S A; 2RQR A; 4OMO A; 3REA B; 1UJ0 A; 2CT3 A; 1NM7 A; 1ZUY A; 1OPK A; 1JQQ A; 1UE9 A; 3I9Q A; 1VA7 A; 2W0Z A; 2KRN A; 1N5Z A; 2YUP A; 3M0T A; 2FEI A; 1FMK A; 3NMZ C; 1AWO A; 2HSP A; 2FRY A; 3M0R A; 2DL7 A; 1PRL C; 2DBM A; 1BBZ A; 2ROT A; 2RQW A; 4RTY A; 4RUG A; 4CC3 A; 1AEY A; 2K9G A; 1K0X A; 2BZY A; 2DVJ A; 4HCK A; 1X2K A; 4J9I A; 3ZL7 C; 4CC4 B; 2K3B A; 4ESR A; 4OMQ A; 1X2Q A; 1QKW A; 1Z9Z A; 2EBP A; 2L3Q A; 2I0N A; 1MUZ A; 2J6K A; 2NUZ A; 1I07 A; 2JM9 A; 3M0Q A; 4J9B A; 2DLP A; 4WCI A; 1TUD A; 4J9H A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2FPE A; 2KT1 A; 4AT1 B; 2QA4 A; 3H41 A; 2LX7 A; 5LJ3 j; 3C94 A; 1QMC A; 1SHF A; 3CCR Q; 4JJD A; 3VS6 A; 3CCU A; 4IIO A; 4RTW A; 1TUC A; 1UGS B; 3ULR B; 2JXB A; 4DA4 A; 1PKS A; 4ZN1 A; 1RAG B; 3VS2 A; 3SWN C; 1S72 A; 3EFO B; 3H0H A; 2FZC B; 3QYH B; 3UA6 A; 1RLQ C; 2DAQ A; 1ZSZ C; 3N5B B; 1N9R A; 2DX1 A; 1K73 U; 2PVD B; 3JCM e; 1NEG A; 2LNH B; 3INZ A; 4XTW A; 3OA6 A; 2RO0 A; 3CPW A; 2OAU A; 3REB B; 3L2R A; 3QDR B; 3OB9 A; 4XK8 E; 1WJR A; 1YJN A; 1M9S A; 3I55 Q; 2ZZD A; 2EIF A; 3FDR A; 4MDW A; 2LNV A; 5D6W A; 2KMT A; 4Y91 A; 3SFM A; 4ZNX A; 4JLI A; 1SG5 A; 1AWJ A; 4KGX B; 1G2B A; 2DRK A; 5CKF A; 1VQO T; 3GP8 A; 2K5I A; 1OPL A; 4A4E A; 4X9C A; 1VQN Q; 4KH1 B; 4BE1 A; 2MYS A; 2FRW A; 4M77 F; 2KAF A; 2RD1 A; 4RTU A; 1QVG A; 3FIF A; 1OI1 A; 3V8L A; 4LDV A; 2O88 A; 1D0Z A; 3CCM Q; 1TS9 A; 1X6B A; 1VQP Q; 2GTJ A; 1KC8 U; 3M0S A; 5IXF A; 1YIT A; 3CCQ T; 2FB7 A; 1BK2 A; 3URG A; 3QJY A; 2DIL A; 1AZG B; 1Y7X A; 2ZPI B; 4D8D A; 2F2W A; 1VQ7 A; 1IB8 A; 2M9U A; 2DXT A; 5CKE A; 2VGM A; 2Z0W A; 5CKH A; 4QQD A; 1RAB B; 3EFR A; 3RKX A; 1E6H A; 5DM7 R; 5HK0 A; 1WQW A; 1QLY A; 1D0X A; 1AT1 B; 2GTO A; 3BDU A; 2ENM A; 3EFS A; 3UAT A; 1M30 A; 4C0D C; 3QSU A; 5GMK i; 2XID A; 2KR3 A; 2HAX A; 2NUT B; 2LCC A; 2MIO A; 4AG2 C; 2DPP B; 1RAE B; 2RQU A; 4OMN A; 3MP6 A; 2DKG A; 3CPF A; 1KG1 A; 1Q95 G; 4J7I A; 2KK4 A; 4E7S A; 2RK2 A; 5DLQ E; 3V7S A; 2FZG B; 4C0F A; 2OTJ A; 1OU9 A; 2KT8 A; 1BCO A; 1VYU A; 4J8O A; 4R0K A; 3CCS Q; 1KD1 R; 2K4Y A; 3QZ5 B; 4LDW A; 2H3J A; 1QP3 A; 2BE7 D; 3JB9 J; 2CDT A; 2P0K A; 1Q7Y C; 2QTV A; 4M75 B; 1ZQ1 A; 2X4Y A; 3OYA A; 3R6N A; 4A4H A; 1BI1 A; 1KQ1 A; 4JS5 A; 1JXM A; 2KXC A; 1M3A A; 3CPW P; 1WHG A; 2KBT A; 1Q86 C; 2EPD A; 2K57 A; 4GLK A; 4ZTF A; 1Q82 C; 4OGC A; 5FU6 B; 2Y4Y A; 2CSQ A; 2CS7 A; 5FWC A; 4DBQ A; 1GRI A; 3MPU B; 2JM8 A; 2RI3 A; 1GXI E; 3PIP A; 3P8D A; 2E64 A; 3EG2 A; 1OUL A; 2Y4X A; 2COY A; 3LX7 A; 4NS5 A; 5A0G A; 2VWF A; 4ME7 A; 4E7I A; 3QG1 A; 2JTF A; 4QVZ A; 5IXB A; 3MET A; 4L59 A; 4OP0 A; 3A1P A; 3HSB A; 3G71 A; 5CKB A; 3OMC A; 2QDY B; 2KYB A; 1N6A A; 1XTD A; 2WSE E; 1M90 C; 5J3B A; 1I81 A; 2E12 A; 3A98 A; 1QVG P; 3UF4 A; 4M7D B; 1K76 A; 1PD1 A; 3QWY A; 1S1N A; 2J7I A; 1N9S A; 1XJW B; 5CKD A; 2FZK B; 5LJ3 g; 4GLM A; 3LH5 A; 2CKK A; 2MPX C; 4LE9 A; 1VQL T; 5GAO q; 3ZFJ A; 2K3Y A; 2L5Q A; 4ZTJ A; 5FWB A; 1HYO A; 3CCJ Q; 2MAM A; 4O5V A; 2CRE A; 4Z88 A; 5GAM d; 3OYF A; 2JW4 A; 1G3Y A; 1X69 A; 3HRS A; 1ZSG A; 2RQT A; 3E19 A; 3G6E Q; 3CBO A; 2L3R A; 4NOY A; 1GCQ A; 4JPB W; 3G7Z A; 5I11 A; 1RAF B; 2CP2 A; 2YRC A; 4EMG A; 3DLL A; 1X27 A; 2M0Y A; 5GJW B; 4E6R A; 5GAN 8; 1ABQ A; 1QCF A; 1UEC A; 2ZGW A; 2QK0 A; 2HKQ B; 4PJO F; 5ECA A; 1BI3 A; 3CD6 A; 4D6W A; 3EG3 A; 5KCO A; 2BIV A; 3M4G A; 2E6Z A; 1RAC B; 1WXU A; 1SRM A; 1AVZ C; 2LJ1 A; 3G4S T; 1K9M R; 4PJO E; 4ELZ C; 2V8J A; 3JV3 A; 3LLR A; 2QEX Q; 2RB6 A; 3DKM A; 4LNP A; 5J26 A; 1WIE A; 3E2U A; 4C92 C; 3HKS A; 3LWI A; 3QJ6 A; 2CP0 A; 4PJO D; 3QWX X; 2QXF A; 1PM3 A; 1CKB A; 2RN8 A; 3M58 A; 4LD6 A; 1NPR A; 5GAM e; 2DEU A; 5CVI A; 2BZX A; 2KGT A; 2XD0 A; 3OYL A; 2YLC A; 1AHJ B; 2RHX A; 2PVO B; 4JRI A; 4FL6 A; 2JTE A; 5LJ3 e; 2LZ6 B; 2QA4 Q; 3MP8 A; 3A8L B; 1YJW T; 3JCM P; 1YJ9 T; 2NUP B; 1O9S A; 2LQK A; 1T0J A; 2YXY A; 1SKU B; 4HVW A; 1KC8 C; 1OEB A; 2EFI A; 4M7A B; 2V26 A; 5C0M A; 1S72 Q; 1D1B A; 5GAO n; 4LXC A; 2CZ6 B; 4FW1 A; 1H92 A; 1CKA A; 2CP5 A; 1UFF A; 1M1F A; 1SSH A; 4XU0 A; 3EGX B; 3CCL T; 4HKE A; 5GAN g; 1IGQ A; 4F7U B; 4RG2 A; 1UHC A; 1I5O B; 2RA2 A; 1N8R C; 2V1Q A; 4OMO A; 2RJE A; 3CCE T; 4GY5 A; 2CT3 A; 3TU4 K; 1V76 A; 5DLO A; 4A53 A; 5FRO A; 2W0Z A; 1N5Z A; 1YJN Q; 1ACM B; 5GAM h; 1AWO A; 4XQ3 A; 2HSP A; 3CEY A; 2QI2 A; 1UGQ B; 4A4K A; 1M1K U; 1PRL C; 2DBM A; 1BBZ A; 2RQW A; 3PFS A; 2RI2 A; 4CC3 A; 2OTL T; 1TTH B; 1MNE A; 1C1A A; 4QVD A; 2BZY A; 1D3B B; 1OQK A; 2DVJ A; 4HCK A; 4J9I A; 5LJ5 d; 4ESR A; 3RKY A; 4HCC A; 2L3Q A; 4OF1 A; 3OYK A; 1ZSZ B; 2J6K A; 3BDL A; 3CXC A; 5I2M A; 3CME T; 2NUZ A; 4KUL A; 2X4X A; 4FT4 A; 3E1S A; 1LVK A; 3L2Z A; 5GAN 3; 4PK4 A; 2QGF B; 2JOY A; 4WCI A; 1OZ2 A; 2A36 A; 4QKU A; 4M75 G; 4PFO A; 1PC0 A; 4J9C A; 1VQO A; 1NE8 A; 2PQW A; 2QTX A; 1NG2 A; 1LCK A; 1B3Q A; 4HCZ A; 2PTK A; 1RI9 A; 2YUQ A; 2HKN A; 1YIT Q; 4OB3 B; 4II1 A; 3TSW A; 2VKN A; 4WTO B; 3CCR T; 1U8R A; 2F5K A; 2KEA A; 3H6Z A; 4X9D A; 4PJM A; 4DBH A; 3FRN A; 2KXD A; 4J9E A; 4FYX B; 2L3P A; 4X1V A; 3SD4 A; 3CCQ A; 5FU7 C; 2O4X A; 2SRC A; 1ARK A; 2EKO A; 3BY7 A; 2H8H A; 1C6V X; 5LJ5 f; 2ED1 A; 4DQ2 A; 2CYZ B; 2DTO A; 2EYQ A; 1R0C B; 2DMO A; 1K8A R; 3V7R A; 4M7D G; 4AFU C; 1Y96 B; 4YTL A; 3KBG A; 1BI2 A; 1K9M U; 2R5A A; 2MF2 A; 5DY9 A; 1YFN A; 3JCM g; 2XG8 D; 1ZUU A; 1G83 A; 3JCM X; 2CH4 W; 1K0S A; 3OSV A; 3I55 T; 2LVM A; 4IUP A; 4IKF A; 4RCC A; 2H3E B; 2YSQ A; 2FYK A; 3RMQ A; 4F16 A; 5CQX A; 4C0D B; 1YHQ A; 3PE0 A; 1M5Q 1; 4JDS A; 1YI2 Q; 2C0I A; 2RK1 A; 1QWE A; 2RM4 A; 3NTI A; 4C8Q F; 3J7A F; 3HTR A; 3PTA A; 1IO6 A; 3I5R A; 1VQN T; 1I5L A; 5A0L A; 3IQL A; 2EYW A; 2KE9 A; 4C8Q E; 4BI3 A; 5A2Q E; 3JB9 H; 3D7S B; 3CCM T; 2KVQ G; 4M78 F; 1VQP T; 2DNU A; 2JZ2 A; 1KHC A; 3EG1 A; 3GIB A; 4HT8 A; 4QVC A; 5D6X A; 1B34 A; 4N4G A; 5LJ5 h; 1WFW A; 2A28 A; 3CC2 Q; 3CXC P; 1U3O A; 4M78 E; 5I21 A; 1W4S A; 3JCM Q; 5GAM j; 2GF7 A; 1UGV A; 3RR6 A; 3CMA Q; 1WXT A; 4OB2 B; 4E2F B; 3UWN A; 4KUI A; 1JBM A; 1XQH A; 1QQJ A; 3I56 Q; 4M78 D; 3ZEH A; 2J6O A; 2MMP A; 1WA7 A; 2QQS A; 2HL5 C; 2COZ A; 3J80 E; 4AFS C; 9ATC B; 2JN0 A; 2SEM A; 2K5F A; 5L8R E; 2O9S A; 3H0I A; 4IUT A; 2AHJ B; 4CC2 A; 2ABL A; 3KUF A; 1HJD A; 1PSE A; 1Z9Q A; 3JCM J; 2R5M A; 1D09 B; 4FT2 A; 2RMO A; 4JZ3 A; 2X51 A; 4Z02 A; 2AKL A; 2HL3 A; 1VQL A; 1NJI R; 4AFZ C; 2E3H A; 1YNZ A; 3HFN A; 5IHN A; 3EGD B; 4B6M A; 1GBR A; 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