The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of a Src-homology 3 (SH3) domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
ALPHA-SPECTRIN SH3 DOMAIN
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| molecule tags |
Cytoskeleton
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| source organism |
Gallus gallus
|
| total genus |
11
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1993-05-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DRM A; 2DBM A; 2OAW A; 4J9E A; 3UA6 A; 3ZL7 C; 2YUQ A; 4ZNX A; 1UHF A; 2EGC A; 2HDA A; 3SHW A; 4D8D A; 1VYV A; 3ULR B; 2AZV A; 2W10 A; 2QDL A; 3M0U A; 2GQI A; 1OPL A; 1WXT A; 2EYY A; 1WXU A; 2CT4 A; 2GTO A; 3EHQ A; 4LUE A; 2YUP A; 1SHG A; 4JJD A; 1GBQ A; 1QWE A; 2VKN A; 1X6G A; 2EVR A; 2YUN A; 1I0C A; 1M3A A; 4OML A; 1SRM A; 4QT7 A; 2GTJ A; 1UHC A; 2LQW A; 2J6O A; 1UTI A; 4CC7 A; 3CQT A; 3I5R A; 4Z8A A; 1OPK A; 1SHF A; 4RTZ A; 2KRO A; 1ABO A; 1ZUU A; 1ABQ A; 2SRC A; 2ROT A; 5IHK A; 4DEX A; 1K0S A; 2CSQ A; 2KGT A; 3M0R A; 2BZX A; 2DJQ A; 1AWJ A; 4FSS A; 2LZ6 B; 2RN8 A; 1RI9 A; 1WLP B; 1NLP C; 1QLY A; 1U5S A; 4J9F A; 2FPE A; 2D8J A; 2K6D A; 2EQI A; 1M3C A; 5HCK A; 1FMK A; 3H41 A; 5I11 A; 1NM7 A; 1AWW A; 2ECZ A; 2RF0 A; 1YN8 A; 4AFU C; 1MV0 B; 2KXC A; 3H0F A; 4CC3 A; 5IXB A; 1UJY A; 4RTY A; 1X6B A; 1KIK A; 2ED1 A; 2DNU A; 2CRE A; 2CDT A; 1QKW A; 1GL5 A; 1NYF A; 4LN2 A; 1K0X A; 2DL4 A; 2I0N A; 3UF4 A; 2AKL A; 2JTE A; 2FEI A; 2IIM A; 2DL5 A; 1PHT A; 1GBR A; 2W0Z A; 2RMO A; 3U23 A; 4K11 A; 2LP5 A; 2RQW A; 3REA B; 4D8K A; 1X69 A; 1CKB A; 4J9B A; 3VS1 A; 1WDX A; 4WCI A; 1PRM C; 2J6K A; 2L3P A; 2VWF A; 2FO0 A; 2LJ3 A; 1YNZ A; 2DBK A; 2JS2 A; 2O9S A; 4OMO A; 2JT4 A; 2KRM A; 2HBW A; 1AZG B; 1Z9Z A; 2PNI A; 2MCN A; 3I9Q A; 5I22 A; 1GCQ C; 3VRZ A; 1NYG A; 3RBB B; 3GBQ A; 4RTV A; 1M8M A; 1YCS B; 4Z89 A; 2DM1 A; 2J05 A; 2K79 A; 1FYN A; 1TUC A; 2NUZ A; 2FG0 A; 2F2X A; 2RQU A; 1K76 A; 1X27 A; 2C0O A; 1TG0 A; 2D8H A; 3VS0 A; 1UJ0 A; 1JU5 C; 3M0Q A; 1UUE A; 1WIE A; 3SEM A; 2K3B A; 5EC7 A; 2KT1 A; 1CSK A; 1ZUK A; 2H8H A; 2J06 A; 2KBT A; 2M51 A; 1H92 A; 5FWC A; 4F17 A; 4GLM A; 1H8K A; 2CT3 A; 2HEQ A; 2MOX A; 1AVZ C; 1SRL A; 5IHN A; 1OEB A; 3NGP A; 2KE9 A; 2L3S A; 1NEG A; 2OJ2 A; 3UAT A; 3EHR A; 2LJ1 A; 3M0P A; 1JXO A; 2L0A A; 1X2K A; 1UFF A; 4RTW A; 1GFC A; 4JJC A; 2KXD A; 1AEY A; 1E6G A; 3H0I A; 1K4U S; 1WXB A; 2EPD A; 1K9A A; 2L3Q A; 3I5S A; 2FPD A; 4LNP A; 4AG1 C; 2JMC A; 2DIL A; 2KNB B; 2SEM A; 4M4Z A; 2JS0 A; 1QWF A; 1X43 A; 2DRK A; 2BZ8 A; 4CC4 B; 3R6N A; 2ABL A; 3NHN A; 2LNH B; 2NWM A; 4J9D A; 2RNA A; 4RTU A; 1CKA A; 2CSI A; 4F14 A; 3NPF A; 1ZSG A; 1NG2 A; 4RUG A; 2KRS A; 3JV3 A; 4HVW A; 1AZE A; 2A36 A; 1EFN A; 1ZUY A; 5IHI A; 1K1Z A; 3EG1 A; 1LCK A; 3VS3 A; 2D0N A; 2K9G A; 4F16 A; 2EGE A; 2MIO A; 2JW4 A; 2HCK A; 2RQR A; 3NMZ C; 4LUD A; 2O9V A; 5FW9 A; 3TVT A; 2E5K A; 4IIM A; 1OOT A; 1BK2 A; 2AKK A; 2YSQ A; 1WI7 A; 4JPB W; 2DF6 A; 2PZ1 A; 5IH2 A; 1Z9Q A; 3M0S A; 2DE0 X; 2X3X D; 1WFW A; 1HSQ A; 1OV3 A; 3THK A; 2ROL A; 1AOJ A; 1E7O A; 2EGA A; 3FJ5 A; 2DL3 A; 2JM9 A; 4Z88 A; 1M3B A; 3TSW A; 1PKT A; 1TUD A; 1U3O A; 2B86 A; 2LQN A; 2LX7 A; 2FRW A; 1JEG A; 1PNJ A; 1BBZ A; 2VVK A; 2EYZ A; 2DL8 A; 1AD5 A; 2EYX A; 4AG2 C; 3EG0 A; 4DEY A; 4OMQ A; 1UE9 A; 1PWT A; 3M0T A; 2RQT A; 1ARK A; 1NLO C; 1HJD A; 4JJB A; 2DL7 A; 2EBP A; 2D1X A; 2GBQ A; 2JM8 A; 3VS2 A; 2L2P A; 3QWY A; 2LJ0 A; 1VA7 A; 2A08 A; 1B3Q A; 4ESR A; 1BU1 A; 2O88 A; 1W70 A; 2A28 A; 1PRL C; 4AFZ C; 1SSH A; 4OMN A; 5ECA A; 2DA9 A; 2KYB A; 1WA7 A; 2CH4 A; 1WX6 A; 1SEM A; 3EG2 A; 2AZS A; 4JZ3 A; 4A63 B; 3EGU A; 4RTT A; 1RLQ C; 2M0Y A; 1UDL A; 1B07 A; 1KJW A; 1KSW A; 3LH5 A; 3C0C A; 2G6F X; 1T0J A; 4LE9 A; 2BTT A; 2CUD A; 4J9H A; 1T3L A; 2F2V A; 4IIO A; 2CH4 W; 2EYW A; 1UEC A; 1T3S A; 1XOV A; 1A0N B; 1E6H A; 1V1C A; 3A98 A; 3PVL A; 3QWX X; 1JQQ A; 2KR3 A; 1ZLM A; 3VS7 A; 2V1Q A; 3UA7 A; 2P4R A; 1M30 A; 1Y0M A; 2RPN A; 1PKS A; 4CC2 A; 3VS6 A; 2X3W D; 1MV3 A; 2GGR A; 1SPK A; 1W1F A; 2LMJ A; 4HXJ A; 1YP5 A; 1WYX A; 2O31 A; 1W6X A; 2FPF A; 3KFV A; 3EG3 A; 1N5Z A; 4EIK A; 4AFS C; 1QCF A; 4E6R A; 1S1N A; 2FRY A; 1GCQ A; 4OMM A; 1GFD A; 1JO8 A; 1I07 A; 1T0H A; 2DLP A; 2O2O A; 2AK5 A; 4HVU A; 1YWP A; 4GBQ A; 4HCK A; 2EW3 A; 2HSP A; 2GNC A; 3VRY A; 1AWO A; 4J9G A; 3VS4 A; 1GRI A; 2ESW A; 2A37 A; 2JXB A; 3PVQ A; 3REB B; 1IO6 A; 2K2M A; 1I1J A; 1NEB A; 1J3T A; 1UGV A; 3O5Z A; 2YT6 A; 2JMA A; 2F2W A; 1HD3 A; 2YUO A; 1Y57 A; 4RTX A; 5IXF A; 1BB9 A; 1RLP C; 2V1R A; 2KRN A; 1G83 A; 1X2Q A; 2J6F A; 3RNJ A; 1H3H A; 4OMP A; 2OI3 A; 1MUZ A; 2PTK A; 1ZX6 A; 4HVV A; 3TSZ A; 2J7I A; 4Y92 A; 2XMF A; 5GJV B; 5GJW B; 4X1V A; 1VYT A; 2C0T A; 5L23 A; 3VS5 A; 1YWO A; 1ZBJ A; 2ED0 A; 1UG1 A; 3PE0 A; 1KFZ A; 2YDL A; 1U06 A; 2CUB A; 2DVJ A; 2KYM A; 2KEA A; 3I35 A; 1M27 C; 2KT8 A; 1JXM A; 2DMO A; 1AWX A; 2K7A A; 2RQV A; 4J9C A; 4R0K A; 2LCS A; 1G2B A; 4KRT A; 1GCP A; 2DYB A; 1RUW A; 2C0I A; 2EKH A; 2ENM A; 2DX1 A; 3H0H A; 1VYU A; 4AFQ C; 5FWB A; 4ORZ A; 4JZ4 A; 3IQL A; 4J9I A; 1QKX A; 2BZY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DBM A; 4J9E A; 2X4J A; 1ZSZ B; 2EGC A; 2HDA A; 2Z0W A; 1G3S A; 4M77 G; 2QDL A; 4LDU A; 1WQW A; 2RI3 A; 2ZPI B; 1VQ8 Q; 1WXT A; 1R0C B; 5KYY B; 5A0L A; 3RIR A; 4C92 E; 1QWE A; 2VKN A; 2QDY B; 4ZGJ B; 1M3A A; 4OML A; 1N8R C; 3QZ5 B; 5LL6 S; 4B6M A; 1WHG A; 4CC7 A; 5CKE A; 3I5R A; 2EJF A; 2NUT A; 5GAN 5; 2DXC A; 2HKN A; 2KRO A; 1ABO A; 4PJO F; 2E65 A; 2ROT A; 4DEX A; 2YLC A; 3X24 B; 3M0R A; 2RB6 A; 3I55 T; 4FU6 A; 3MKD A; 5CKB A; 1NLP C; 2LTO A; 1OQK A; 3DKM A; 2DXU A; 4GLK A; 1PD0 A; 3H41 A; 3MP1 A; 4JRI A; 2EIF A; 2E3I A; 2CS7 A; 1TTH B; 2RHX A; 4AFU C; 3AT1 B; 2C06 A; 3E9F A; 1VQ9 T; 4EMK C; 1FMV A; 3H0F A; 3GPL A; 3OS5 A; 2DIQ A; 1UJY A; 1X6B A; 3I55 A; 1VQ6 T; 4J6W A; 4LDV A; 4IUT A; 2CRE A; 2D9T A; 2CDT A; 3TQ7 P; 1QKW A; 3UT1 A; 1UGQ B; 1KQ1 A; 2R5M A; 4OMF B; 5C0M A; 3OYL A; 2VXF A; 2IIM A; 1PHT A; 4FW2 A; 2CP2 A; 1VQ9 A; 4D8K A; 3QYG B; 1XTD A; 1RAF B; 2BE9 B; 4DQ2 A; 4J9B A; 4NL3 A; 1VQ6 A; 3QYH B; 2J6K A; 2FHD A; 2HSE B; 2QAZ A; 3NTK A; 2JT4 A; 4PFP A; 2KRM A; 3JCM d; 4F7U E; 2RA2 A; 2OTL A; 2JTM A; 3OS1 A; 4A4K A; 3RBB B; 2COY A; 2DIG A; 1M8M A; 1YCS B; 3M56 A; 2DM1 A; 2V8J A; 3VV0 A; 3I55 Q; 3BDL A; 2WSF E; 2FG0 A; 2XG8 D; 2D8H A; 1KC8 R; 1P92 A; 1QQJ A; 2LT4 A; 3OS2 A; 1CSK A; 3MP8 A; 1NJI U; 2J06 A; 5FWC A; 4M7A B; 1VQ9 Q; 1H8K A; 2CT3 A; 2HEQ A; 2MOX A; 1VQ6 Q; 1SRL A; 2OAU A; 2L3S A; 5CKF A; 5A0D A; 2P0K A; 1M9S A; 8ATC B; 2RK1 A; 4HT9 A; 2LJ1 A; 3M0P A; 1TOV A; 2OTL Q; 1VQ5 A; 3V8L A; 1BI3 A; 1Y7X A; 1VQO T; 1GFC A; 5GAM h; 1AEY A; 1E6G A; 4XTZ A; 2M16 A; 1K4U S; 1WHH A; 1WXB A; 2EPD A; 3I5S A; 4C92 B; 2QTX A; 4GY5 A; 3CPW S; 4PL6 A; 2KNB B; 2SEM A; 1QWF A; 2BZ8 A; 4ATO A; 5KYX A; 2LNH B; 2NWM A; 1VQO A; 2ZPB B; 2KQW A; 4HCC A; 1QVF P; 3PGG A; 4KGX B; 3QO3 A; 4PLI A; 4RUG A; 4LD6 A; 5IHI A; 4J6X A; 1LCK A; 3WVE B; 2K9G A; 4JLI A; 1IGQ A; 3EGX A; 4F16 A; 3CC4 T; 2EGE A; 1SKU B; 2HCK A; 3X26 B; 3CCQ T; 4BY6 B; 2ZZD A; 1Q82 C; 4LUD A; 3JB9 D; 2O9V A; 3TEE A; 4JRK A; 2VGN A; 2GFU A; 3HRS A; 5DM7 R; 2KI7 A; 2E5K A; 1G3W A; 4JRP A; 2YSQ A; 4JPB W; 2PZ1 A; 2HZY A; 5KYW B; 2RI2 A; 1Q81 R; 1OX8 A; 5CAI A; 1WFW A; 1HSQ A; 3JB9 G; 4NL2 A; 2MI6 A; 1ZQ1 A; 3VUB A; 3FJ5 A; 2XIC A; 5J39 A; 2DL3 A; 4F04 B; 2JM9 A; 5I21 A; 1D3B B; 1TWB A; 2MYS A; 2AIR B; 3TSW A; 1TS9 A; 3CCQ A; 2I2L A; 2DPP B; 2FZK B; 2RHY A; 3FEO A; 4AMC A; 3CCJ A; 1K8A U; 1JEG A; 2O4X B; 4MDX A; 2VVK A; 3JCM b; 4OB3 B; 1W2B P; 3CC7 T; 1VQO Q; 5KE3 A; 2RD1 A; 3L1A A; 5GMK m; 3S3O A; 4Q5W A; 1WNL A; 4PNO A; 1VQM T; 3EH1 A; 2ZPF B; 1PWT A; 2V26 A; 4BB7 A; 4JJB A; 2DL7 A; 1PCX A; 3DB3 A; 4F7U B; 2F1L A; 1G3Y A; 3QWY A; 2KDS A; 1M1K U; 1VA7 A; 1B3Q A; 3CCU A; 4ESR A; 1BU1 A; 2K3Y A; 2PQW A; 1SSH A; 4TVR A; 3RKX A; 1WA7 A; 1Y96 A; 2HMA A; 3JB9 J; 1KQS P; 1SEM A; 3FB9 A; 3EG9 A; 1R0B G; 4RTT A; 1KSW A; 4OP0 A; 3UPU A; 3I56 T; 3TCJ A; 3CCR T; 2CUD A; 2F2V A; 4RMO A; 4IIO A; 3CCQ Q; 2EYW A; 1BI2 A; 4MZM A; 4C8Q F; 3RKY A; 3GNF B; 3CCJ Q; 1XOV A; 1IXD A; 1WZO A; 4EMK B; 2P4R A; 2BKD N; 1Y0M A; 2RPN A; 4KUI A; 3ASK A; 4CC2 A; 3A8L B; 3OW2 A; 1PM3 A; 2DD4 A; 4M75 C; 3CCR A; 1WYX A; 1RAH B; 3QZ9 B; 3OYI A; 4E6R A; 1S1N A; 1IRE B; 2FRY A; 1GCQ A; 4FYY B; 3CCU Q; 4XK8 E; 3EAE A; 5CQX A; 5FRM A; 3OW2 S; 1H64 1; 2O2O A; 3CC7 Q; 2HD0 A; 1YWP A; 4HCK A; 2GNC A; 1AWO A; 2E10 A; 1D1C A; 1I1J A; 1TXQ A; 4JUV A; 3HP9 A; 3EH2 A; 3OYG A; 1VQP T; 4C5H A; 4PJM A; 4IUQ A; 5GAO n; 4J5Y A; 3JCM V; 5FRO A; 2V1R A; 2PUK B; 1G83 A; 1V29 B; 1YJ9 T; 3CCR Q; 5KH6 A; 3L2Z A; 4HVV A; 1N6A A; 3TSZ A; 2VC8 A; 2J7I A; 1I5L A; 2XMF A; 1VQP A; 4X1V A; 3UDC A; 2HQE A; 4X9D A; 2XHC A; 5GAM d; 1ZSZ A; 2CUB A; 2DVJ A; 2KEA A; 4MDW A; 2DZ9 A; 1D0Z A; 1YJ9 A; 2DMO A; 2K7A A; 5HK0 A; 2QQ9 A; 4M75 E; 2DD5 A; 3OYH A; 2EKH A; 2ENM A; 2K5L A; 1KC8 C; 5LJ3 h; 3OB9 A; 2X4X A; 4IUR A; 5FWB A; 4KH0 B; 4ORZ A; 1QW1 A; 3ZL7 C; 3EGD B; 4N4G A; 4ZNX A; 1UHF A; 4FCY A; 3L2Q A; 2PUO B; 1U1T A; 1VYV A; 3ULR B; 2AZV A; 4J6Y A; 3M0U A; 2K57 A; 2DTI A; 1XNI A; 5GAM e; 3JCM h; 4A4E A; 4RCB A; 2GTO A; 3OYC A; 2YUP A; 3N5B B; 1SHG A; 1VQP Q; 2XDD A; 2YUN A; 1LVK A; 2GTJ A; 2LQW A; 3OQ5 A; 2J6O A; 4FW1 A; 4M78 F; 1UTI A; 2DEQ A; 4RTZ A; 3KBG A; 4XU0 A; 5IHK A; 1YJ9 Q; 2G3R A; 2BZX A; 2X4Y A; 1AWJ A; 4A54 A; 2RN8 A; 1BI1 A; 3X25 B; 1WLP B; 1QCO A; 2ZAE A; 2FPE A; 2EQI A; 4JLG A; 1FMK A; 3RER A; 2H3J A; 3GIB A; 5I11 A; 1AWW A; 2OTJ T; 3QBY A; 2XDP A; 4XTV A; 1YN8 A; 4NS5 A; 4PFZ A; 3D7S B; 4CC3 A; 5IXB A; 2X35 A; 3G1J A; 3CXC A; 2ED1 A; 2DNU A; 2EAY A; 4M77 F; 4R55 A; 3CMA T; 4XU3 A; 3BFM A; 4LN2 A; 2RJE A; 2K5F A; 2DL4 A; 4NOY A; 2HQX A; 5CKD A; 4RG2 A; 3H9N A; 5FLX E; 2AKL A; 2JTE A; 2A7Y A; 4OGE A; 2QA4 T; 2GFA A; 2RMO A; 4K11 A; 2RQW A; 3REA B; 4LD9 K; 1Q81 C; 3CCE A; 1X69 A; 1JRI A; 5GAO q; 1NE8 A; 5GAO m; 3JSC A; 4PJO C; 1PRM C; 3CMA A; 3C4S A; 2LJ3 A; 1KD1 C; 1PD1 A; 4FL6 A; 4EPC A; 1AZG B; 2VV5 A; 3MJX A; 2QA4 A; 2MCN A; 3MEU A; 1B34 B; 4WTO B; 3HPW A; 3VRZ A; 1AHJ B; 2HNI A; 2DXT A; 4ME7 A; 1VOM A; 3GBQ A; 4M7A A; 4M7A E; 2J05 A; 2NUZ A; 3SDZ A; 2LQ8 A; 2EFI A; 2CYZ B; 2RQU A; 5J3B A; 1TG0 A; 5D7U A; 3VS0 A; 4OVA A; 1UJ0 A; 3OBY A; 3GF5 A; 2KT1 A; 5DLO A; 1U8R A; 2M51 A; 1M2O A; 1H92 A; 2OTJ Q; 2HQH A; 4F17 A; 3G7Z A; 3M5A A; 4GLM A; 4OB2 B; 2EWN A; 4M75 B; 1FWZ A; 2QG9 B; 2YRV A; 3CCE Q; 4ZGD B; 3PNW C; 2EQK A; 2GQV A; 1WHJ A; 2LCL A; 1OEB A; 3NGP A; 4C92 A; 3CMA Q; 1NEG A; 1BCM A; 4ZTF A; 5CK9 A; 4BE0 A; 1WJS A; 2QA4 Q; 1X2K A; 1UFF A; 2MAM A; 3OYD A; 1MMN A; 5GAO r; 1PC0 A; 4ZN1 A; 1RAC B; 2K2V A; 1BIA A; 3CEY A; 2JOY A; 2XDB A; 3H0I A; 2RK2 A; 1H3Z A; 1OZ3 A; 5LJ5 d; 1C1A A; 3CPF A; 1UB4 A; 2L3Q A; 3LX7 A; 2FPD A; 4LNP A; 3DLM A; 4AG1 C; 4BUG A; 2JMC A; 4M7A D; 4XTU A; 4M4Z A; 2JS0 A; 1D0X A; 5GMK i; 2DRK A; 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