The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
GSSPKAVALYSFAGEESGDLPFRKGDVITILKKSDSQNDWWTGRVNGREGIFPANYVELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Yeast SH3 domain structural genomics
rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical 40.4 kDa protein in PES4-HIS2 intergenic region
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| molecule tags |
Contractile protein
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| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
12
|
| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-03-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DVJ A; 2HEQ A; 1K0S A; 1RLP C; 1W70 A; 2DBK A; 2RQV A; 1X27 A; 1M3C A; 1NLP C; 2VWF A; 1VYU A; 4RUG A; 4OMQ A; 1UDL A; 1QWF A; 3R6N A; 4J9G A; 3EG3 A; 1UHF A; 1GRI A; 2LNH B; 1EFN A; 4JJC A; 2KRM A; 1PNJ A; 2YUP A; 3EHR A; 3QWY A; 4J9C A; 1FMK A; 4IIO A; 2FPF A; 3VS3 A; 4DEX A; 2MOX A; 1ARK A; 1M3B A; 3REB B; 1Y0M A; 3VS1 A; 2KXC A; 2KRS A; 1X2Q A; 2JS0 A; 1SEM A; 2A28 A; 1ABO A; 1QLY A; 1XOV A; 3H0I A; 1Y57 A; 2EGC A; 2A36 A; 1OV3 A; 2QDL A; 2ROL A; 5IXF A; 1WIE A; 2RN8 A; 1A0N B; 2JM9 A; 2A08 A; 2EGA A; 4CC7 A; 4OMO A; 2YUO A; 1T3L A; 1E7O A; 1CKB A; 3NGP A; 2C0I A; 2D0N A; 3I5S A; 3SEM A; 2LJ0 A; 4GBQ A; 2DL7 A; 2KRO A; 1T0J A; 2KE9 A; 3M0R A; 4FSS A; 3VRZ A; 1CKA A; 3ULR B; 1KFZ A; 3NPF A; 3VS7 A; 3REA B; 1K76 A; 2DLP A; 1JEG A; 2DNU A; 2CT4 A; 2JW4 A; 2FRY A; 1AZG B; 2GQI A; 3VS2 A; 2DL5 A; 1GFD A; 1K0X A; 2B86 A; 2LZ6 B; 4Y92 A; 1AWJ A; 2MIO A; 3ZL7 C; 4OMM A; 2KNB B; 2HSP A; 3H41 A; 3M0T A; 5GJV B; 1G2B A; 2K7A A; 3VS0 A; 1UJY A; 2YDL A; 3SHW A; 1T0H A; 1KJW A; 2EYX A; 2EPD A; 2RQU A; 3RNJ A; 2NWM A; 3UF4 A; 1JXM A; 2ABL A; 1SSH A; 2BZY A; 4RTX A; 2KT1 A; 2NUZ A; 2KXD A; 3EG0 A; 1Z9Z A; 3GBQ A; 4RTY A; 1X43 A; 2KGT A; 1JXO A; 1QKW A; 4JZ3 A; 1SHF A; 2GBQ A; 3UA6 A; 3RBB B; 2HDA A; 2K79 A; 1PWT A; 5HCK A; 1N5Z A; 1WX6 A; 2E5K A; 4JJB A; 1YNZ A; 1X2K A; 2V1R A; 1WYX A; 4JZ4 A; 3M0U A; 1YP5 A; 5IHN A; 1I0C A; 2MCN A; 2PNI A; 1NEB A; 2JT4 A; 2AKK A; 1W6X A; 3FJ5 A; 2GTJ A; 2LJ1 A; 2EKH A; 3PVQ A; 5L23 A; 2AK5 A; 2JM8 A; 1K9A A; 3I5R A; 2FG0 A; 2HBW A; 2D8H A; 4Z8A A; 1ZBJ A; 2O9V A; 1UHC A; 2O9S A; 1RUW A; 1I1J A; 4J9E A; 2PTK A; 1WXU A; 4AFZ C; 3I35 A; 2DL8 A; 4A63 B; 1NYG A; 1E6H A; 1GCQ A; 2AZV A; 2DL3 A; 4F14 A; 2EVR A; 1GBR A; 2V1Q A; 2RQW A; 1TUD A; 1UFF A; 2L2P A; 1T3S A; 1ZSG A; 2CRE A; 3M0Q A; 1NG2 A; 5I22 A; 1M30 A; 1VYT A; 1MUZ A; 3JV3 A; 3UAT A; 4EIK A; 1RI9 A; 2J05 A; 2M0Y A; 2CH4 A; 2EYZ A; 4J9F A; 1TUC A; 2DM1 A; 1AOJ A; 4Z88 A; 2K6D A; 1PRL C; 1MV0 B; 2SRC A; 4CC3 A; 1BBZ A; 4IIM A; 1ZLM A; 4F17 A; 1B07 A; 2O2O A; 1X69 A; 2EQI A; 2JMC A; 1Z9Q A; 2C0O A; 1AEY A; 4HVW A; 1JO8 A; 2GNC A; 4WCI A; 1PRM C; 1GFC A; 1WI7 A; 4OML A; 2LP5 A; 1B3Q A; 3VS6 A; 1GBQ A; 2JS2 A; 2CUD A; 1SPK A; 3VS5 A; 1LCK A; 2D1X A; 2KRN A; 1QWE A; 1QKX A; 2DX1 A; 3TSZ A; 1YN8 A; 2JMA A; 2GGR A; 2KYB A; 1E6G A; 1W1F A; 1M8M A; 2YSQ A; 1SRM A; 1J3T A; 3C0C A; 1GL5 A; 2LQW A; 2JXB A; 2DF6 A; 2G6F X; 3NHN A; 1AVZ C; 2BZX A; 1ABQ A; 2CH4 W; 2FO0 A; 4HXJ A; 1QCF A; 2CT3 A; 2J6F A; 1M27 C; 1UUE A; 3LH5 A; 2F2V A; 1S1N A; 1NLO C; 1OOT A; 1CSK A; 1SHG A; 3M0S A; 2I0N A; 1H8K A; 3UA7 A; 5I11 A; 1ZUY A; 2SEM A; 3O5Z A; 4ESR A; 2DYB A; 4RTV A; 1AWO A; 1AD5 A; 2FEI A; 2D8J A; 3NMZ C; 4X1V A; 3I9Q A; 2J06 A; 1MV3 A; 1JQQ A; 2KEA A; 1SRL A; 4J9B A; 4R0K A; 1KIK A; 2BTT A; 4AFQ C; 1ZUU A; 1PHT A; 4RTW A; 1UE9 A; 2CSQ A; 1HSQ A; 5IHI A; 1BK2 A; 2CDT A; 1PKT A; 3H0F A; 3TVT A; 2RQT A; 3PE0 A; 2X3W D; 1GCP A; 2W10 A; 5IH2 A; 1NM7 A; 4CC4 B; 4LE9 A; 2RMO A; 4D8D A; 2J6K A; 2RF0 A; 4LUD A; 2OJ2 A; 3U23 A; 1UGV A; 1HD3 A; 1H3H A; 1OEB A; 1JU5 C; 1YWO A; 2VKN A; 4RTT A; 1AZE A; 2ROT A; 1UTI A; 1UEC A; 2L3S A; 2GTO A; 1ZX6 A; 5FWC A; 3VRY A; 2FPE A; 2LQN A; 4HVU A; 4LUE A; 1G83 A; 4Z89 A; 2DL4 A; 2AKL A; 2K3B A; 1AWW A; 2KYM A; 4HVV A; 1WXT A; 4CC2 A; 3EGU A; 4K11 A; 2DE0 X; 4HCK A; 2RNA A; 3TSW A; 2YUQ A; 4JJD A; 2ED1 A; 5ECA A; 3IQL A; 2LJ3 A; 1RLQ C; 2DRK A; 3CQT A; 4AG2 C; 4M4Z A; 2EYW A; 2K9G A; 1BB9 A; 2LX7 A; 2C0T A; 4OMP A; 3THK A; 2XMF A; 2LCS A; 1U3O A; 2J6O A; 2P4R A; 2L3Q A; 1I07 A; 2DJQ A; 1VA7 A; 4J9H A; 4F16 A; 3QWX X; 2ECZ A; 2DRM A; 1X6G A; 1M3A A; 2CSI A; 4AFS C; 4J9D A; 2X3X D; 2YUN A; 2EBP A; 4LNP A; 1FYN A; 2KT8 A; 5IXB A; 2DA9 A; 2DIL A; 2VVK A; 1OPK A; 2EGE A; 1H92 A; 1VYV A; 2F2X A; 1U5S A; 1OPL A; 2L3P A; 1PKS A; 2A37 A; 3PVL A; 1X6B A; 4RTZ A; 4E6R A; 2LMJ A; 2YT6 A; 2FRW A; 2L0A A; 2H8H A; 1IO6 A; 2HCK A; 3KFV A; 2ESW A; 2KBT A; 4ORZ A; 2AZS A; 1V1C A; 1WLP B; 2OI3 A; 2FPD A; 2OAW A; 1K1Z A; 5GJW B; 1TG0 A; 5EC7 A; 2F2W A; 1WXB A; 2O31 A; 2W0Z A; 2ENM A; 4GLM A; 1NEG A; 1ZUK A; 4OMN A; 4LN2 A; 1BU1 A; 1AWX A; 1UJ0 A; 1U06 A; 1WDX A; 1UG1 A; 2EW3 A; 4KRT A; 4JPB W; 2IIM A; 2RQR A; 3EG2 A; 3EHQ A; 1YWP A; 2PZ1 A; 2K2M A; 3VS4 A; 2DBM A; 2ED0 A; 2J7I A; 1K4U S; 4AFU C; 1NYF A; 4QT7 A; 2O88 A; 4J9I A; 5FWB A; 2RPN A; 1YCS B; 4RTU A; 2BZ8 A; 1WA7 A; 3A98 A; 4ZNX A; 5FW9 A; 4DEY A; 4D8K A; 2JTE A; 2CUB A; 5IHK A; 2KR3 A; 1KSW A; 4AG1 C; 2M51 A; 3EG1 A; 1GCQ C; 3M0P A; 2EYY A; 2DMO A; 3H0H A; 1HJD A; 1WFW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DVJ A; 3CCV T; 5CKH A; 3BW1 A; 3JCM e; 4MDW A; 5GMK e; 5GAM h; 1KC8 R; 3NTK A; 4C8Q B; 1NJI R; 1YIJ Q; 2DBK A; 4BI8 B; 1NLP C; 4RUG A; 2QEX A; 3EGX B; 1QWF A; 4J9G A; 3H6Z A; 1UHF A; 2IPO B; 4NOY A; 1RAI B; 2QQS A; 4JJC A; 4Y28 E; 4JLG A; 3QWY A; 4J9C A; 2DEU A; 1WPY A; 3CC7 T; 1Q86 R; 2HSE B; 4C92 C; 3OYB A; 4A4H A; 1YJN A; 1ZA2 B; 2OTL Q; 2HL5 C; 3LWI A; 1TSF A; 1QVG S; 4BDZ A; 5A2Q E; 2KRS A; 3OYL A; 3I55 Q; 5LJ5 f; 3L1A A; 1X2Q A; 2A28 A; 3JCM h; 5GMK h; 2MWP A; 3JCM d; 4M7A A; 1ABO A; 1QLY A; 1VQP A; 1Y57 A; 4EMH A; 5IXF A; 4HCZ A; 2K5L A; 2A08 A; 3OYK A; 4OMO A; 4J6W A; 1E7O A; 4J8O A; 3NGP A; 3M56 A; 2JN0 A; 3SEM A; 1N27 A; 4GBQ A; 2DL7 A; 5GAN 3; 1T0J A; 4KT0 E; 3FJP A; 3ME9 A; 3OYM A; 1VQ6 A; 3NPF A; 1YJW A; 4BI4 A; 4FSX A; 3REA B; 2F69 A; 2LRQ A; 3CCR T; 4JLI A; 5GAN f; 1JEG A; 4C8Q C; 2LCL A; 2CT4 A; 5D6W A; 2JW4 A; 2FZG B; 5KYY B; 4M77 E; 1GFD A; 4A53 A; 1NZ9 A; 4KBM B; 2DK3 A; 3ZL7 C; 2HL3 A; 1U8R A; 3CCL T; 2EJ9 A; 3PMI A; 2DER A; 2QXF A; 3PIO A; 2GF7 A; 1G2B A; 3JCM c; 3CD6 A; 2CP0 A; 2K7A A; 4UC4 A; 3VS0 A; 5KYW A; 3G7Z A; 3SWN B; 3SHW A; 3S3M A; 2HQH A; 2QGG A; 2EPD A; 2NWM A; 5DY9 A; 1JBM A; 2DZ9 A; 4M7D A; 2QAS A; 3E9F A; 2ABL A; 2XU8 A; 4C92 D; 2WSE E; 2LX9 A; 1I8F A; 4RCC A; 1Z9Z A; 2RJE A; 3GBQ A; 4RTY A; 1JXO A; 4JZ3 A; 1SHF A; 3RBB B; 2FB7 A; 1VQ7 Q; 2Y4Y A; 4M7A G; 1S72 Q; 1N5Z A; 2A0F B; 3OYH A; 5KYN A; 5KYX B; 1N9S A; 3S3O A; 3M0U A; 4II1 A; 4E7I A; 2DFU A; 3M55 A; 4EMK B; 3QDR B; 4IUT A; 1NBE B; 4LDV A; 1KQS S; 2OTL T; 2YLB A; 3TCJ A; 1FXX A; 4C8Q D; 2GQV A; 5L23 A; 2JM8 A; 3OA6 A; 3I55 T; 2D8H A; 5LL6 S; 3RIR A; 1ZBJ A; 3SWN C; 2O9V A; 1MMN A; 1MNE A; 1UHC A; 3MP6 A; 1VQ8 T; 4PJJ A; 2MAM A; 3M54 A; 3QHS A; 1KD1 C; 3I35 A; 4OMF B; 1XNI A; 2DL8 A; 5LJ3 e; 4DA4 A; 2HKN A; 2DEQ A; 2AZV A; 4F14 A; 5CCA A; 1GBR A; 2E4H A; 2RQW A; 3QYH B; 4P5N A; 3CPW P; 2DJZ A; 2CRE A; 1QVG A; 4M7D G; 2M0O A; 2BKD N; 2CP3 A; 2M1H A; 1RI0 A; 3QPH A; 2M0Y A; 2D0Q B; 5LJ3 j; 5A0L A; 1Q82 C; 5AYF A; 4J9F A; 1B34 A; 1TUC A; 1YJN T; 2K6D A; 1MV0 B; 3L2W A; 1BBZ A; 5LJ3 d; 4EMK C; 4LDX A; 2EQM A; 1B07 A; 2O2O A; 4J83 A; 2JMC A; 1Z9Q A; 3EGD A; 4OVA A; 2LQ8 A; 3RKW A; 3CXC P; 3OMG A; 4AT1 B; 4OML A; 3SB2 A; 4EPC A; 1B3Q A; 3VS6 A; 2JS2 A; 2CUD A; 2CP2 A; 1SF9 A; 3CCM A; 1M2O A; 1WHM A; 2L8D A; 2OTJ A; 2KRN A; 5A0G A; 1QWE A; 3HP9 A; 3TSZ A; 1VQ6 T; 5GMK m; 1E6G A; 1Q86 C; 5GAN 2; 1WJQ A; 1U1S A; 4M7A B; 2G6F X; 3NHN A; 2QI2 A; 1ABQ A; 2CH4 W; 3VUZ A; 2QTX A; 3OSV A; 2FL7 A; 2VGN A; 1WNL A; 2F2V A; 1AT1 B; 3CD6 T; 3A8H B; 2EJF A; 4V2S A; 5GAN j; 2P84 A; 3EFS A; 3L2R A; 4Q5W A; 2FZK B; 4RTV A; 4BE0 A; 5GAN d; 1EZZ B; 2R57 A; 2HQX A; 4E7S A; 2M9U A; 4X1V A; 1G3Y A; 1KHC A; 1OQK A; 3I9Q A; 3CCS Q; 3WVD B; 2E5Q A; 4XTZ A; 2KEA A; 2VXE A; 2M02 A; 1SRL A; 4J9B A; 4LD9 K; 2BTT A; 1K8A R; 4RTW A; 4ATO A; 1UE9 A; 2CP6 A; 3HRU A; 5KYW B; 5IHI A; 3CPF A; 1KQS A; 5CAI A; 2X4J A; 3PE0 A; 2X3W D; 2DO3 A; 4N4H A; 3M4G A; 1NM7 A; 1O9S A; 4PNO A; 4D8D A; 4PJO E; 5GAN 7; 1H3H A; 4M7D B; 2VKN A; 4RTT A; 1UTI A; 3JB9 F; 3C95 A; 3HSB A; 2GTO A; 1N6A A; 3JSC A; 1G83 A; 2AKL A; 1Y7X A; 1AWW A; 1OZ3 A; 4CC2 A; 1K9M R; 3CCJ A; 1D0Y A; 4ZGJ B; 2YUQ A; 1M90 R; 3IQL A; 2LJ3 A; 4D6W A; 2DRK A; 4J6Y A; 4KGV B; 4M4Z A; 4WF2 A; 4OB3 B; 4JUV A; 3OB9 A; 1BIB A; 1M90 U; 2LX7 A; 4OMP A; 3FEO A; 4C0F A; 3RMQ A; 2QQB A; 4JJN K; 3RES A; 4C5G A; 4JS5 A; 1YI2 Q; 4PLL A; 2LCS A; 1U3O A; 2P0P A; 4J9H A; 1Y96 B; 3QWX X; 4F16 A; 4QW2 A; 3GNF B; 2WSF E; 2ATC B; 2X3X D; 4M7D C; 1WJS A; 2DVE A; 4IKF A; 3X25 B; 1FYN A; 2QQR A; 2KT8 A; 1OYX A; 2DA9 A; 1M1K R; 2V8K A; 2VVK A; 1YJ9 A; 4GY5 A; 1H92 A; 2HQE A; 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3OW2 P; 3H0I A; 4QQ6 A; 2X4W A; 2EGC A; 2A7Y A; 5AT1 B; 5GAO l; 4C8Q F; 1A0N B; 3CCJ T; 1T3L A; 2KMT A; 1G3W A; 1QVF P; 2D0N A; 3TQ7 P; 1RL2 A; 6AT1 B; 5KCO A; 4ZTF A; 1JB0 E; 2KRO A; 2KE9 A; 4PFZ A; 3JCM Q; 2AIR B; 2DLP A; 2P0Q A; 4B9W A; 3RKX A; 2X4Y A; 3OS1 A; 1K0X A; 4M77 G; 2EQJ A; 2JJ9 A; 3X28 B; 2JTF A; 3LGF A; 1IB8 A; 5GJV B; 4NS5 A; 3OYI A; 1TU0 B; 3G71 Q; 3GOX A; 2KDS A; 4M78 E; 3ASK A; 2K3X A; 3EFO A; 3ZFJ A; 1SSF A; 1JXM A; 1C6V X; 3PFS A; 5D6Y A; 3QXE B; 5GAM e; 3UT1 A; 2RO0 A; 2KT1 A; 5J3B A; 1TXQ A; 4N0A A; 1PC0 A; 1QKW A; 2E3I A; 4QQG A; 1BI0 A; 4DQ2 A; 1PG5 B; 3G4S T; 5CVI A; 3FIF A; 3JB9 H; 3HFO A; 2KSS A; 5HCK A; 2HZY A; 3CCU A; 1VQ4 T; 5IAY A; 1X2K A; 1QP3 A; 1PCX A; 4QVZ A; 4CRI A; 1VQ5 A; 4JZ4 A; 2E6Z A; 5GAM j; 3F70 A; 2K4Y A; 2V8J A; 2DIQ A; 2PNI A; 2JZ2 A; 1W6X A; 5KH6 A; 5GAM d; 5LJ3 f; 2EKH A; 3KBG A; 2AK5 A; 3CME A; 2FG0 A; 4E7Z A; 4BB7 A; 4BY6 B; 2HBW A; 2LCC A; 1MMG A; 5GAN g; 1WJR A; 1QMC A; 3DLL A; 5CQX A; 1I1J A; 1R77 A; 2PTK A; 4M75 E; 4AFZ C; 2X4X A; 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