The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
66
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structure length |
66
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Chain Sequence |
EPEVPFKVVAQFPYKSDYEDDLNFEKDQEIIVTSVEDAEWYFGEYQDSNGDVIEGIFPKSFVAVQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Contractile protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| publication title |
Saccharomyces cerevisiae SH3 domain structural genomics
rcsb |
| molecule keywords |
Myosin tail region-interacting protein MTI1
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| total genus |
15
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CSI A; 2ENM A; 2DLP A; 4ZNX A; 3SHW A; 1GCP A; 1JXO A; 1YNZ A; 5IH2 A; 3EHQ A; 2HSP A; 1PNJ A; 1AZE A; 1GBR A; 1K0S A; 4JJB A; 2JS2 A; 2FRW A; 1Z9Q A; 5EC7 A; 1M8M A; 2CT4 A; 2OAW A; 1SHF A; 1TG0 A; 2KT1 A; 5GJW B; 2K7A A; 1M3A A; 1ZUU A; 2J06 A; 2JTE A; 2LQW A; 3A98 A; 2KRO A; 2V1R A; 2RQT A; 1BK2 A; 4F16 A; 1HSQ A; 2AZS A; 2EGE A; 1EFN A; 2CDT A; 1AWO A; 2FPF A; 2DIL A; 2EPD A; 2DM1 A; 4QT7 A; 2A08 A; 4JJD A; 5IHK A; 2YUO A; 4CC7 A; 1X69 A; 2QDL A; 4M4Z A; 2AKK A; 1NLO C; 2GTO A; 1GCQ A; 3PE0 A; 1X43 A; 2DJQ A; 3M0S A; 2HCK A; 1B07 A; 1NEG A; 4J9F A; 2GNC A; 4E6R A; 5L23 A; 2F2V A; 2MIO A; 3NPF A; 1T0H A; 2FRY A; 2KNB B; 2LP5 A; 2SEM A; 3EG2 A; 1SHG A; 2LX7 A; 1QWE A; 2J05 A; 4DEY A; 2IIM A; 2J6O A; 3UF4 A; 5ECA A; 4JZ3 A; 3EG0 A; 2J6K A; 4LUD A; 4D8D A; 3VRZ A; 3VS7 A; 3KFV A; 5HCK A; 5I22 A; 2W10 A; 2C0O A; 2J7I A; 4ORZ A; 4FSS A; 1OEB A; 4R0K A; 1MV3 A; 4J9D A; 1UEC A; 2RNA A; 2KBT A; 2KT8 A; 1WX6 A; 2JMC A; 1U3O A; 1YWP A; 2RQU A; 2V1Q A; 1YN8 A; 1JXM A; 1ZSG A; 2ABL A; 2EQI A; 5FWB A; 1T3L A; 2D1X A; 2DL3 A; 1U5S A; 1TUC A; 1ZUY A; 1SPK A; 1IO6 A; 1E6H A; 2HEQ A; 1UJY A; 4AG1 C; 2KRM A; 1WDX A; 4ESR A; 1CSK A; 2G6F X; 2JW4 A; 1K9A A; 1LCK A; 3C0C A; 3TSZ A; 2RQW A; 3UAT A; 1UJ0 A; 1QKX A; 2LJ0 A; 2EVR A; 4Y92 A; 1WLP B; 2OJ2 A; 1G2B A; 1M3C A; 1NLP C; 4LNP A; 2KXD A; 2K2M A; 1M3B A; 1K1Z A; 1PKS A; 1AWJ A; 1NEB A; 2ECZ A; 2RF0 A; 2GGR A; 4DEX A; 1N5Z A; 4D8K A; 1KIK A; 2DRM A; 1GFD A; 1UTI A; 4Z8A A; 2O9S A; 2EYX A; 2CUD A; 3I5R A; 4J9H A; 1AVZ C; 1I1J A; 1ABQ A; 2DNU A; 2FO0 A; 3EHR A; 1AWW A; 4F14 A; 3UA7 A; 4J9I A; 1PHT A; 1TUD A; 1WXU A; 3R6N A; 2C0I A; 3RBB B; 3I5S A; 1H3H A; 3REB B; 1B3Q A; 1WFW A; 1X27 A; 3UA6 A; 2YUN A; 2EW3 A; 2DL4 A; 3H0F A; 2OI3 A; 2EGA A; 3M0U A; 4OMO A; 2DBK A; 4CC4 B; 1MV0 B; 4HVV A; 3NMZ C; 2DA9 A; 3VS5 A; 1ZX6 A; 2KR3 A; 2RQR A; 1Y0M A; 3PVL A; 1PRM C; 3M0R A; 5I11 A; 2JS0 A; 1FYN A; 3VS6 A; 1I07 A; 3M0P A; 1Z9Z A; 2JMA A; 2NWM A; 1UHF A; 1I0C A; 4K11 A; 1AEY A; 2A36 A; 2LNH B; 4AFQ C; 3IQL A; 2KXC A; 4HXJ A; 1AZG B; 2I0N A; 4OMP A; 2F2X A; 4GLM A; 3GBQ A; 2LMJ A; 2BZX A; 2VVK A; 3NHN A; 2DYB A; 2JM8 A; 1J3T A; 3EGU A; 4OMM A; 2KGT A; 3ZL7 C; 2L3Q A; 2VKN A; 2FPE A; 4HCK A; 3VRY A; 1JO8 A; 1G83 A; 3JV3 A; 2CT3 A; 2YUP A; 3EG1 A; 2KRS A; 3TSW A; 2BTT A; 1K4U S; 2DVJ A; 1PKT A; 3EG3 A; 2C0T A; 4J9B A; 4JJC A; 2E5K A; 2PTK A; 2CRE A; 1WXB A; 3VS2 A; 4AFZ C; 1UFF A; 2H8H A; 2AK5 A; 2RMO A; 1YP5 A; 1AOJ A; 1PWT A; 1X6B A; 2DE0 X; 2YUQ A; 1VYT A; 4GBQ A; 1ZLM A; 1CKA A; 2EYY A; 4WCI A; 1AWX A; 2CH4 W; 4AG2 C; 2M51 A; 1ZBJ A; 3VS0 A; 1OPL A; 2GTJ A; 2PNI A; 3U23 A; 1BB9 A; 1RI9 A; 2X3X D; 4RTY A; 4RTV A; 2M0Y A; 4RTX A; 2W0Z A; 2DX1 A; 2K79 A; 4X1V A; 1RUW A; 1W70 A; 2B86 A; 2K9G A; 3VS1 A; 1GL5 A; 2RN8 A; 1H92 A; 2O9V A; 2JT4 A; 1HJD A; 3REA B; 3FJ5 A; 1WA7 A; 3CQT A; 1SRL A; 1NG2 A; 2LQN A; 2XMF A; 4HVW A; 2GBQ A; 2ED0 A; 1UUE A; 3SEM A; 1UDL A; 3LH5 A; 1KFZ A; 2NUZ A; 5IHI A; 1QLY A; 1MUZ A; 1NYF A; 4LN2 A; 1S1N A; 2D0N A; 1HD3 A; 2O31 A; 1K76 A; 2GQI A; 5FW9 A; 2KE9 A; 2EGC A; 1QCF A; 1ABO A; 2MOX A; 1JQQ A; 2ROL A; 4A63 B; 1M27 C; 5IHN A; 1QWF A; 2O2O A; 2EYW A; 2D8J A; 2ESW A; 3H0I A; 2L3P A; 5IXF A; 1YWO A; 3TVT A; 2CSQ A; 1WI7 A; 5FWC A; 2LJ1 A; 2BZY A; 1VA7 A; 4LE9 A; 1X2K A; 2RQV A; 2DRK A; 2DMO A; 1WIE A; 1WYX A; 1ZUK A; 3QWY A; 1E7O A; 1YCS B; 2FEI A; 2VWF A; 3M0T A; 4J9C A; 4IIM A; 1X6G A; 1WXT A; 2ROT A; 1KSW A; 1VYV A; 2FG0 A; 1SRM A; 4OML A; 1QKW A; 2JXB A; 2ED1 A; 4RTW A; 3PVQ A; 1RLP C; 2DL5 A; 2RPN A; 2LZ6 B; 4Z89 A; 2CUB A; 1RLQ C; 1PRL C; 2DL8 A; 1UG1 A; 3RNJ A; 1OPK A; 1T3S A; 2MCN A; 1Y57 A; 1A0N B; 3QWX X; 2LCS A; 2AKL A; 3NGP A; 4RTT A; 2P4R A; 2D8H A; 4HVU A; 2AZV A; 4LUE A; 4OMQ A; 2CH4 A; 4CC3 A; 4J9E A; 1BU1 A; 1NYG A; 1BBZ A; 4RTU A; 2KRN A; 4RTZ A; 1KJW A; 4JZ4 A; 3H0H A; 1XOV A; 2BZ8 A; 2L3S A; 5IXB A; 3VS3 A; 4AFU C; 2J6F A; 1E6G A; 4Z88 A; 1JU5 C; 2KEA A; 1ARK A; 1V1C A; 4J9G A; 1OOT A; 2YT6 A; 1VYU A; 3H41 A; 2HBW A; 2DL7 A; 1H8K A; 1W6X A; 2EYZ A; 4CC2 A; 1UHC A; 4JPB W; 2SRC A; 2YSQ A; 1K0X A; 2JM9 A; 1U06 A; 3I35 A; 3VS4 A; 1GRI A; 2K6D A; 2L0A A; 2L2P A; 1M30 A; 4KRT A; 1OV3 A; 4AFS C; 1GFC A; 3M0Q A; 4F17 A; 3THK A; 1FMK A; 2A28 A; 2EKH A; 3I9Q A; 2YDL A; 4EIK A; 2O88 A; 1JEG A; 1UGV A; 4IIO A; 1GBQ A; 2KYM A; 2LJ3 A; 1CKB A; 1NM7 A; 4RUG A; 2F2W A; 2K3B A; 1X2Q A; 2A37 A; 2DF6 A; 5GJV B; 2DBM A; 1T0J A; 1GCQ C; 1UE9 A; 2PZ1 A; 3O5Z A; 1SEM A; 2FPD A; 3ULR B; 2X3W D; 4OMN A; 2HDA A; 1SSH A; 1AD5 A; 2EBP A; 2KYB A; 1W1F A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2CSI A; 1YHQ Q; 1M1K C; 1KC8 U; 5GAO m; 4C5H A; 1YNZ A; 3ZFJ A; 2HSP A; 1PNJ A; 5GAM d; 2RHX A; 3VJP A; 5LJ3 g; 5DLO A; 1YJW A; 2FRW A; 3VUZ A; 5EC7 A; 5M9O A; 1M8M A; 3AT1 B; 3I56 T; 1VQM T; 5KYW A; 3CME A; 1JJ2 A; 1ZUU A; 1NBE B; 2KRO A; 4BI8 B; 4EMK B; 4JS4 A; 4QVD A; 2EGE A; 1XQH A; 2LRQ A; 2QA4 A; 5KYN A; 4EMH A; 2YWW A; 2DM1 A; 2GFA A; 2KQW A; 2BUD A; 5GAN f; 1H64 1; 2YUO A; 2JNG A; 1X69 A; 2XIC A; 1Y7X A; 3ZBD A; 2RD1 A; 5L8R E; 4C0D B; 3DLM A; 4RCB A; 3JCM g; 4PLL A; 3JB9 I; 4BD3 A; 1QVG P; 1IRX A; 1ZA1 B; 1NEG A; 4QQ6 A; 4E6R A; 2F2V A; 1K73 U; 1T0H A; 3CC2 T; 3EG2 A; 1Y07 A; 1YJN Q; 2HKN A; 3CCL A; 2HL3 A; 5ECA A; 2E6Z A; 5LJ5 h; 4BE1 A; 5HCK A; 2RJE A; 3PGG A; 1UGS B; 2ZCF B; 2J7I A; 2X4X A; 2DVE A; 3TCJ A; 1OEB A; 2KBT A; 4FYV B; 1WX6 A; 2JMC A; 4KT0 E; 2QTX A; 2RQU A; 1MGQ A; 1JXM A; 1ZSG A; 2ABL A; 3CBM A; 2VGN A; 1KD1 C; 1I5O B; 1EX4 A; 2DL3 A; 1TUC A; 1ZUY A; 3FB9 A; 4XU2 A; 2HEQ A; 1UJY A; 2NUP B; 2BE9 B; 1WDX A; 2VXE A; 4M75 A; 2E6N A; 1CSK A; 5GAN e; 4ZTF A; 2XU8 A; 4BY6 C; 3I55 T; 2RQW A; 4C8Q B; 1UJ0 A; 1QKX A; 2LJ0 A; 4LD9 K; 1QP3 A; 2EVR A; 3L2Z A; 2P84 A; 3UT1 A; 2OJ2 A; 3TQ7 P; 3LGF A; 1G2B A; 1NLP C; 4A4F A; 2KXD A; 1Q86 C; 2BE7 D; 1VQP T; 3A8M B; 5I21 A; 1AWJ A; 1NEB A; 2DZC A; 1KIK A; 1TH7 A; 4V2S A; 4TVR A; 3J80 E; 5HY6 A; 2Y90 A; 1QVG S; 1UTI A; 4B6M A; 4IUP A; 2X4Y A; 2FZK B; 2QG9 B; 1TTH B; 2CUD A; 2A7Y A; 1I1J A; 2DXT A; 3MEV A; 1FXX A; 2YRC A; 1B34 A; 4F14 A; 2MK5 A; 4FW1 A; 4J9I A; 1PHT A; 1YJW T; 3OYB A; 1MMD A; 2EJG A; 3EAE A; 3RBB B; 3HFN A; 4HCB A; 2A0F B; 3HPW A; 4M75 G; 4AT1 B; 5GMK e; 4FU6 A; 1X27 A; 4DBQ A; 1Q82 C; 1RAH B; 1TUG B; 3CME T; 2YUN A; 2EW3 A; 2OI3 A; 4UC4 A; 5LJ3 h; 3M0U A; 1D1C A; 2DBK A; 4CC4 B; 1MV0 B; 3VS5 A; 3JCM b; 2KR3 A; 1PM3 A; 2E1H A; 2RQR A; 5FU6 C; 4DOV A; 4LDY A; 5GAN 4; 2QA4 T; 5GAO r; 3EGD A; 2JS0 A; 2RO0 A; 1LPL A; 1FYN A; 3OYK A; 1GXI E; 1I07 A; 2JMA A; 1YIJ Q; 2NWM A; 1UHF A; 1NJI R; 3CCS A; 3A5Z B; 2A36 A; 2M0O A; 2RHY A; 2LNV A; 2I0N A; 2LTO A; 1WZO A; 3O8V A; 2F2X A; 4GLM A; 3URG A; 4F7U E; 2VVK A; 3RER A; 4JRQ A; 3JCM h; 2R57 A; 1IZ6 A; 3EGU A; 2KGT A; 2VKN A; 2FPE A; 3NTK A; 3CCL T; 1RAB B; 1JB0 E; 3JV3 A; 2QQR A; 2YUP A; 1XJW B; 2KRS A; 4J9B A; 1M2V B; 1WHJ A; 2RMO A; 5LJ5 j; 4EMK C; 1YJ9 Q; 2LQK A; 2YUQ A; 3OYN A; 3EH1 A; 1M90 R; 1BI2 A; 5CQX A; 3JAM E; 4AG2 C; 2EIF A; 4PJJ A; 2PNI A; 1EZZ B; 2HQE A; 3MCA B; 5GAO l; 3OW2 S; 1X6O A; 4PJO E; 3CPF A; 2X3X D; 4RTY A; 1IGQ A; 5FRN A; 4PNO A; 1S72 A; 3LYI A; 4X1V A; 1QVG A; 1W70 A; 3CC4 Q; 2RN8 A; 4FYX B; 3TRE A; 1WA7 A; 3CQT A; 4KUL A; 4ATO A; 4EPC A; 1D3B B; 3H9N A; 2M1H A; 1MUZ A; 4LN2 A; 1M1K U; 4OGC A; 1S1N A; 1HD3 A; 4E7L A; 2GQI A; 3GLX A; 2DYI A; 3EFR A; 2RJC A; 3LH0 A; 3D7S B; 2HAX A; 5LJ5 d; 1VQ5 Q; 1IGU A; 2CP3 A; 2YRV A; 1QWF A; 4EMK A; 1M2O A; 2RH2 A; 2QQA A; 2E12 A; 1W2B S; 1M8V A; 1KC8 C; 4WF2 A; 4RKU E; 4DBH A; 4LD6 A; 1K73 R; 1WIE A; 1ZUK A; 4ME7 A; 2FEI A; 3CCR Q; 3CCQ A; 1KSW A; 3MEU A; 1LVK A; 2WSC E; 1Q7Y R; 1OI1 A; 2FG0 A; 2JXB A; 2NUT B; 5KCH A; 2DL5 A; 1G3W A; 1WHM A; 3P8B B; 3QDR B; 5HKC A; 1K9M U; 4M77 E; 4Z89 A; 1TOV A; 4A4K A; 4R56 A; 1UG1 A; 3NTH A; 2VGM A; 1YIT Q; 4J83 A; 2L5Q A; 1T3S A; 2CZ7 B; 2MCN A; 2AKL A; 3NGP A; 1VQ7 T; 2DPP B; 2O01 E; 4R55 A; 2I2L A; 4A54 A; 2PVG B; 1NYG A; 1BBZ A; 4Q5W A; 3JB9 D; 3PMI A; 2AIR B; 4OB1 B; 3M55 A; 2KRN A; 1RAC B; 3L1A A; 5FU7 B; 1D09 B; 3OW2 A; 1KD1 U; 3H0H A; 4QW2 A; 2L3S A; 1E6G A; 2XI9 A; 3CCE Q; 2KEA A; 1MMN A; 1ARK A; 4J9G A; 4XU3 A; 2CZ6 B; 2C06 A; 5LJ3 d; 5CKH A; 2HBW A; 5D6W A; 3CC7 Q; 3PFS A; 4A4E A; 2QK0 A; 5HK3 A; 4C0Z A; 1KQS P; 4M7A B; 2XG8 D; 4JPB W; 2SRC A; 1OYX A; 3P8H A; 1K0X A; 1U06 A; 1S72 T; 1Q86 U; 3I35 A; 2OTJ Q; 4MDW A; 1OU8 A; 4KRT A; 4AFS C; 3G6E Q; 3HRS A; 2QTV A; 4M7D C; 2A28 A; 1BI0 A; 3S3M A; 3RES A; 1W2B A; 1JRI A; 1GBQ A; 4J6Y A; 2LCC A; 2LJ3 A; 4DOW A; 3JCM d; 4M7D D; 3OSS C; 2R5M A; 2PZ1 A; 3ULR B; 1VQ8 Q; 2JZ2 A; 1G8X A; 3GOX A; 4C8Q G; 2D9T A; 2EBP A; 1VQL Q; 3A8O B; 2DLP A; 4ZNX A; 3SHW A; 4J6X A; 1GCP A; 4IUU A; 4BE0 A; 1Q82 U; 2V8K A; 1N8R C; 3EHQ A; 5CQY A; 1AZE A; 3M4G A; 2KMT A; 1GBR A; 3OQ5 A; 1EIF A; 3M57 A; 2E5Q A; 1K0S A; 4JJB A; 2H3E B; 1YCY A; 3G7Z A; 3JRZ A; 4X9C A; 1BIB A; 4DA4 A; 4O5V A; 4JRI A; 3X25 B; 2CT4 A; 1K8A R; 1RAG B; 2E64 A; 1SF9 A; 3CCQ T; 2K7A A; 2J06 A; 3VYH B; 2V1R A; 2X35 A; 3JB9 G; 3QSU A; 1BK2 A; 4M7D A; 1EFN A; 2CDT A; 1AWO A; 5CO7 A; 3G71 Q; 2FB7 A; 2Y4Y A; 2LCL A; 4QT7 A; 4F7U F; 2KSS A; 1OZ3 A; 3OS2 A; 1Q81 U; 1M2V A; 1NLO C; 2GTO A; 3G4S Q; 1QW1 A; 2RJF A; 2K3X A; 3M0S A; 1VQ6 Q; 2DD4 A; 2DTH A; 1VQK Q; 2OTL Q; 2E65 A; 2MIO A; 3EFO B; 5D6Y A; 3RMS A; 5C0M A; 1QVF P; 5KE2 A; 2FRY A; 2KNB B; 2LP5 A; 3CCU A; 2MMP A; 2J05 A; 2RK2 A; 1YI2 Q; 2IIM A; 2J6K A; 3VRZ A; 3VS7 A; 4Y91 A; 1G3S A; 2W10 A; 2GF7 A; 3NTI A; 4OB2 B; 2HNI A; 4J9D A; 2F5T X; 4C92 F; 1M1K R; 4PJO F; 1YWP A; 2V1Q A; 4RMO A; 1YN8 A; 2IG0 A; 1YBY A; 1T3L A; 2D1X A; 1SPK A; 2DZ9 A; 4C5G A; 7AT1 B; 3MPU B; 4LDV A; 4M77 B; 3V7S A; 1LCK A; 3C0C A; 3CXC S; 5FRO A; 3FRN A; 4Y92 A; 5A0G A; 1HYO A; 1V76 A; 1YJN A; 1WLP B; 2JTF A; 2HZY A; 3OBW A; 2DXB A; 2R5A A; 2BKD N; 1UGQ B; 1VQM Q; 1BYM A; 3M53 A; 4OF1 A; 5FU7 C; 4NL3 A; 3RUX A; 5GAM f; 4DEX A; 4D8K A; 2XID A; 2P4T A; 5AT1 B; 1WJR A; 3JCM X; 2O9S A; 4J9H A; 1XTD A; 1Y71 A; 2V8I A; 4MDX A; 1KQ2 A; 2DNU A; 4E7J A; 3EHR A; 3OYI A; 4BI4 A; 1OX9 A; 2R58 A; 4M7A C; 1TUD A; 5GAN j; 4FT2 A; 2C0I A; 4N4H A; 1B3Q A; 4EDU A; 4M77 F; 2VC8 A; 3PT9 A; 4M7A D; 3H0F A; 1R0C B; 4FCY A; 1H3Z A; 2FL7 A; 2QXF A; 2PUO B; 2DA9 A; 1ZX6 A; 2EQM A; 3CCV Q; 1N27 A; 1KD1 R; 4M75 C; 2KK4 A; 2E41 A; 3M0P A; 1Z9Z A; 2VUB A; 4CI0 C; 2ZPH B; 1YFN A; 4K11 A; 3OBY A; 1AEY A; 4M75 D; 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