The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
66
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structure length |
66
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Chain Sequence |
EPEVPFKVVAQFPYKSDYEDDLNFEKDQEIIVTSVEDAEWYFGEYQDSNGDVIEGIFPKSFVAVQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Contractile protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| publication title |
Saccharomyces cerevisiae SH3 domain structural genomics
rcsb |
| molecule keywords |
Myosin tail region-interacting protein MTI1
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| total genus |
15
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-05-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SHF A; 2LMJ A; 2VWF A; 2HCK A; 5GJV B; 4GBQ A; 2CSQ A; 2CUD A; 1PKS A; 2ECZ A; 1GBR A; 1ZSG A; 1AD5 A; 2PTK A; 1GCQ C; 1TUC A; 2K79 A; 2HEQ A; 4AFZ C; 2F2V A; 3RBB B; 1AZE A; 2RQU A; 1ARK A; 2DLP A; 2P4R A; 1I1J A; 2KRN A; 2LQN A; 2KR3 A; 4RTU A; 2GGR A; 1X6B A; 2JM8 A; 4J9G A; 4ORZ A; 4RTX A; 1NYF A; 2PNI A; 2EGE A; 3H0I A; 3VS7 A; 1YWP A; 3UA6 A; 1JEG A; 2O31 A; 1JXM A; 1X43 A; 2MCN A; 1AVZ C; 1K9A A; 2H8H A; 3KFV A; 2CDT A; 2FPE A; 1ZUU A; 1WDX A; 4LN2 A; 4OMM A; 1V1C A; 1T3S A; 1X2Q A; 2LJ3 A; 3EG3 A; 2FPF A; 3I9Q A; 2RQT A; 2W10 A; 1SRL A; 1U3O A; 5I11 A; 3RNJ A; 2KE9 A; 3EHQ A; 2EYZ A; 2DF6 A; 2KYB A; 1H3H A; 1GCQ A; 1M3C A; 2YUO A; 3VRZ A; 2A36 A; 4M4Z A; 2KRO A; 1H8K A; 3H0F A; 4RUG A; 1ABO A; 2ENM A; 1UDL A; 2LQW A; 4WCI A; 2AK5 A; 1QKW A; 4Z89 A; 2ABL A; 3PE0 A; 1K4U S; 2L3S A; 1WA7 A; 4JJD A; 2GBQ A; 1OV3 A; 1UUE A; 2LCS A; 2GNC A; 1MV3 A; 3EG0 A; 1XOV A; 1RLP C; 4F16 A; 2HSP A; 5GJW B; 2G6F X; 2ROT A; 4K11 A; 2EGA A; 2RF0 A; 1AWW A; 1K1Z A; 1SRM A; 2DRK A; 3VS0 A; 2FRW A; 2NWM A; 1EFN A; 4OMO A; 1CKA A; 4RTZ A; 2D1X A; 2AKL A; 2X3X D; 2JS2 A; 2FPD A; 2YUQ A; 4F14 A; 1YNZ A; 2SEM A; 1M30 A; 2VVK A; 1UJY A; 1NG2 A; 1M3B A; 4D8K A; 2J7I A; 2K7A A; 3H41 A; 1K0X A; 1YN8 A; 1ZLM A; 4IIO A; 4CC2 A; 1SPK A; 1NEB A; 4J9I A; 1T0J A; 2RMO A; 2KXD A; 1PKT A; 2DX1 A; 3TVT A; 1WXU A; 1PRL C; 3EG1 A; 4DEY A; 1OPL A; 2JS0 A; 1Z9Q A; 2O9S A; 2L3Q A; 4J9D A; 1I07 A; 3TSW A; 3SEM A; 2X3W D; 2YUN A; 3EG2 A; 4HXJ A; 2RQV A; 1BB9 A; 5HCK A; 2KYM A; 1WFW A; 1OPK A; 2O88 A; 2YT6 A; 2B86 A; 2J6O A; 2F2X A; 1RLQ C; 2HBW A; 1B07 A; 1HJD A; 5IXB A; 4Z88 A; 4F17 A; 4CC7 A; 1E6G A; 2DBM A; 4IIM A; 4GLM A; 1IO6 A; 2LJ1 A; 3NMZ C; 2KBT A; 3UAT A; 1GFD A; 1W1F A; 1U5S A; 4J9H A; 1X69 A; 2J05 A; 2V1Q A; 1WLP B; 2CH4 W; 1X6G A; 4RTW A; 2GTO A; 3VS2 A; 1HSQ A; 1BBZ A; 2EYW A; 2PZ1 A; 1W6X A; 5EC7 A; 1NLO C; 1ZX6 A; 2BTT A; 2OI3 A; 1I0C A; 2CSI A; 2JXB A; 3REA B; 3C0C A; 2E5K A; 3EGU A; 1WXT A; 4LNP A; 1FMK A; 1YCS B; 3LH5 A; 4HVV A; 2K2M A; 2DL4 A; 2DM1 A; 3NHN A; 5I22 A; 1ZUK A; 2EVR A; 3M0U A; 1LCK A; 2RNA A; 2A37 A; 2LZ6 B; 1FYN A; 1RI9 A; 2C0O A; 1KJW A; 1U06 A; 2LX7 A; 2L3P A; 1NYG A; 1KIK A; 4J9B A; 5FWB A; 1OEB A; 1ABQ A; 1SSH A; 3NGP A; 2O2O A; 2O9V A; 1GBQ A; 3I5S A; 1UFF A; 3UF4 A; 1TUD A; 2MOX A; 2W0Z A; 1QWF A; 3M0T A; 2D8H A; 4HCK A; 3CQT A; 2F2W A; 1S1N A; 2ED1 A; 2KT1 A; 1G2B A; 1CKB A; 2EQI A; 3QWX X; 2JMA A; 1PWT A; 4QT7 A; 3ULR B; 1VYU A; 4R0K A; 2J6F A; 2M51 A; 3M0Q A; 2OJ2 A; 2A28 A; 4AFQ C; 2DA9 A; 1N5Z A; 1ZUY A; 4AG2 C; 4Z8A A; 3ZL7 C; 1VYV A; 1WX6 A; 2GQI A; 1UTI A; 2KRM A; 1G83 A; 1M8M A; 1QKX A; 1GL5 A; 4KRT A; 4OML A; 4J9C A; 2K3B A; 1PNJ A; 1K0S A; 4OMQ A; 1BK2 A; 5FW9 A; 2BZ8 A; 2LJ0 A; 4X1V A; 5IH2 A; 2D0N A; 4FSS A; 3M0P A; 4LUE A; 2DNU A; 5IHN A; 1M3A A; 1JXO A; 1UE9 A; 2RQR A; 4J9F A; 1MV0 B; 2IIM A; 4HVW A; 3M0S A; 1AWJ A; 2XMF A; 3VRY A; 2KEA A; 2FRY A; 1RUW A; 1Y0M A; 2V1R A; 1AEY A; 2KNB B; 2EGC A; 1T3L A; 2FEI A; 1WXB A; 4RTV A; 1UG1 A; 1YP5 A; 3I5R A; 1AZG B; 2CT4 A; 3THK A; 2EYX A; 2CUB A; 2DL7 A; 2LP5 A; 2NUZ A; 2K6D A; 1Y57 A; 1QCF A; 2LNH B; 2QDL A; 4RTT A; 2YDL A; 2DRM A; 1GFC A; 1WIE A; 2EKH A; 3EHR A; 2DVJ A; 2AZS A; 3VS5 A; 2YUP A; 1T0H A; 3PVQ A; 1BU1 A; 1SHG A; 1VA7 A; 4ZNX A; 4D8D A; 1B3Q A; 2KGT A; 1GCP A; 2KT8 A; 2BZX A; 4AG1 C; 2ED0 A; 2K9G A; 3VS3 A; 3O5Z A; 2MIO A; 1UGV A; 4RTY A; 3GBQ A; 1YWO A; 2EBP A; 5IHI A; 3A98 A; 4JJC A; 2CT3 A; 1NLP C; 2DL8 A; 5IXF A; 3QWY A; 1JQQ A; 1PHT A; 4HVU A; 3I35 A; 2M0Y A; 2DBK A; 1NM7 A; 1CSK A; 1WYX A; 2VKN A; 1KSW A; 3VS4 A; 1VYT A; 4J9E A; 4LUD A; 1OOT A; 1SEM A; 1TG0 A; 4DEX A; 1JO8 A; 1K76 A; 1E6H A; 2DYB A; 4A63 B; 1KFZ A; 5L23 A; 2ROL A; 3VS1 A; 1QWE A; 3FJ5 A; 2EPD A; 3NPF A; 2JT4 A; 4JZ3 A; 3U23 A; 4AFU C; 1UJ0 A; 1AWO A; 2FO0 A; 1H92 A; 2YSQ A; 5IHK A; 3IQL A; 2RN8 A; 3R6N A; 3H0H A; 2JM9 A; 1J3T A; 2DE0 X; 2RPN A; 2C0T A; 3SHW A; 2EW3 A; 2D8J A; 2FG0 A; 4EIK A; 1W70 A; 1UHF A; 2HDA A; 3VS6 A; 1M27 C; 2A08 A; 1A0N B; 1E7O A; 1X27 A; 3UA7 A; 2DL3 A; 2DIL A; 2DL5 A; 2CH4 A; 4JJB A; 2DJQ A; 3PVL A; 1AOJ A; 4E6R A; 4JZ4 A; 1JU5 C; 2L0A A; 4CC3 A; 1UHC A; 2JTE A; 2L2P A; 2BZY A; 1QLY A; 2EYY A; 4OMN A; 1MUZ A; 1WI7 A; 2ESW A; 4JPB W; 1PRM C; 3TSZ A; 2OAW A; 4OMP A; 1GRI A; 2J06 A; 1X2K A; 4Y92 A; 4ESR A; 4AFS C; 2AKK A; 1UEC A; 2RQW A; 3M0R A; 2CRE A; 2C0I A; 1HD3 A; 1AWX A; 5ECA A; 4CC4 B; 2KXC A; 2JW4 A; 4LE9 A; 3JV3 A; 3REB B; 2DMO A; 2KRS A; 2AZV A; 2GTJ A; 5FWC A; 1Z9Z A; 2JMC A; 1ZBJ A; 2SRC A; 1NEG A; 2I0N A; 2J6K A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5KCH A; 1SHF A; 4AMC A; 2LMJ A; 5GAN j; 1PKS A; 3RUX A; 1GBR A; 1JBM A; 3BE3 A; 1TTH B; 2DTH A; 2KSS A; 5CR2 A; 3A8O B; 3CXC A; 2F2V A; 2RQU A; 1WJS A; 1YJW T; 1QVF S; 2IPO B; 2L5Q A; 2L89 A; 4RTU A; 2GGR A; 1X6B A; 2FYK A; 4ORZ A; 3PTA A; 2VC8 A; 3VS7 A; 1JEG A; 3UA6 A; 2Y4X A; 5HY6 A; 3R6O A; 4Y28 E; 1FWZ A; 1TSF A; 3A8M B; 2MCN A; 3J81 E; 2DET A; 4E7J A; 5FRM A; 2RJF A; 1WDX A; 2OTJ A; 1OQK A; 2XD0 A; 1WJQ A; 1W4S A; 4E7K A; 1QCN A; 4C92 A; 2JNG A; 4E7L A; 2OTL T; 2EQU A; 2KI7 A; 1N9R A; 5GAN d; 3RNJ A; 1Q81 U; 4F04 B; 3CPW A; 2EYZ A; 2KYB A; 2E41 A; 1H3H A; 1GCQ A; 1M3C A; 2YUO A; 3I56 T; 3VRZ A; 4M4Z A; 3H0F A; 5GAM g; 2AHJ B; 2ENM A; 1UDL A; 5LJ5 f; 5LJ3 j; 3EGX B; 1QKW A; 5FLX E; 1RAB B; 2ABL A; 1H3Z A; 4J8O A; 2GBQ A; 5GMK i; 1VQ6 T; 4F7U G; 2LCS A; 5IAY A; 1QVP A; 4FT4 A; 4OP0 A; 5KYW A; 4DOV A; 4TVR A; 4XQ3 A; 2G6F X; 4A4G A; 2ROT A; 1OYX A; 3X24 B; 1G3W A; 1AWW A; 1VQ5 Q; 2DD4 A; 3JCM X; 1IRX A; 5GMK m; 4OMO A; 4XU2 A; 1FMV A; 2PQW A; 3EH2 A; 3HHT B; 2HL5 C; 3WVD B; 1UJY A; 1UB4 A; 3CC4 Q; 1ZLM A; 4RG8 A; 4C92 C; 2RI2 A; 1RAI B; 5CKF A; 5LJ3 d; 2LT1 A; 1SPK A; 3LH0 A; 3BDU A; 1BIB A; 2KXD A; 4XTU A; 2DX1 A; 5HKC A; 1BYM A; 3BY7 A; 3EG1 A; 4ME7 A; 2EJF A; 1M2V A; 5KYY B; 2YRD A; 2X3W D; 3EFO A; 1Y7X A; 2YUN A; 4HXJ A; 1N8R U; 3ASK A; 2COZ A; 1NZ9 A; 2P84 A; 1OPK A; 2V8J A; 4EMH A; 2HL3 A; 2B86 A; 2KVQ G; 2LNV A; 1HJD A; 2CZ6 B; 4L59 A; 1TWB A; 4EMK C; 4F17 A; 5A0G A; 4IIM A; 2RHX A; 2E70 A; 1IO6 A; 2KBT A; 3UAT A; 3L2U A; 1W1F A; 1MMN A; 3JCM d; 4J9H A; 1X69 A; 4E7S A; 2AIR B; 2G3R A; 1IHW A; 2F1L A; 5CK9 A; 4C0G A; 2HD0 A; 5GMK h; 5EC7 A; 2BTT A; 4JLG A; 4KH0 B; 1KD1 R; 3PFS A; 3UT1 A; 1FMK A; 2LVM A; 3G6E A; 4LD9 K; 3GP8 A; 2DZ9 A; 3NHN A; 2WAC A; 1ZUK A; 1UGP B; 2KMT A; 4M78 E; 2RNA A; 2A37 A; 3GPL A; 2DK3 A; 2YHT A; 2LX7 A; 3GIB A; 2D6F A; 1TU0 B; 2HKN A; 1NYG A; 1VQ9 Q; 1KIK A; 4J9B A; 3OYN A; 1SSH A; 2QQB A; 3H8Z A; 3G4S Q; 2GFU A; 2LQ8 A; 1YJ9 Q; 4M7D F; 4J5Y A; 3I5S A; 1UFF A; 3MEV A; 1KQS P; 2MOX A; 3ME9 A; 2W0Z A; 1RAD B; 2ZGW A; 4HCK A; 2F2W A; 2COW A; 3CCL T; 1G2B A; 3QWX X; 4DBQ A; 4BI8 B; 1PWT A; 2F5T X; 4M77 D; 2M51 A; 3M0Q A; 2DXC A; 3CC4 T; 4AG2 C; 4C8Q E; 2M0O A; 3ZL7 C; 2KRM A; 2AT1 B; 3LGL A; 4LDV A; 2CZ7 B; 4OML A; 5J26 A; 1Q7Y U; 2VUB A; 4M77 B; 4OB1 B; 2KAF A; 3QG1 A; 4OMQ A; 5LL6 S; 1VOM A; 4PNO A; 4C0D C; 5IH2 A; 1Q95 G; 2I2L A; 4FSS A; 5GAN h; 1TS9 A; 4M7A G; 2DNU A; 2FHD A; 1BI0 A; 1TXQ A; 2E6N A; 4HVW A; 4PKC C; 1N9S A; 2XMF A; 4M77 F; 3VRY A; 3VU3 C; 3J80 E; 2V8I A; 3X25 B; 2NLU A; 2X4Y A; 3MPU B; 3CCU A; 2EYX A; 1YHQ T; 3JB9 I; 1QCF A; 1VQK Q; 2DER A; 1JJ2 A; 2QDL A; 4M7A D; 2YDL A; 4JDS A; 2WSC E; 2MK5 A; 4PJO E; 2DVJ A; 3VS5 A; 1BU1 A; 1NJI R; 1B3Q A; 2KGT A; 2KT8 A; 2PVG B; 1W2B P; 4QW2 A; 2K9G A; 4XTZ A; 2MF2 A; 1UGV A; 3OMG A; 4RTY A; 1YWO A; 3KBG A; 2EBP A; 4M7A B; 2LC4 A; 3CD6 A; 3M53 A; 1VQM T; 3QBY A; 1R8O B; 1S72 A; 2CP2 A; 1PM3 A; 3I35 A; 4WF2 A; 1NM7 A; 1CSK A; 3V8L A; 3GLX A; 3FDR A; 3CCV Q; 1KSW A; 4M7A F; 1WJR A; 3VS4 A; 1ACM B; 1OX9 A; 4BAC A; 3HRU A; 1VYT A; 4J9E A; 4F7U A; 4LUD A; 5M9O A; 1K9M C; 2XG8 D; 4ELY C; 4DEX A; 1RAF B; 5KYY A; 5J3B A; 4X9D A; 4XK8 E; 1NE8 A; 5LJ3 h; 3OW2 P; 1YJ9 T; 3VUZ A; 2ROL A; 2V26 A; 3L1A A; 3M58 A; 5D6Y A; 2EPD A; 2JT4 A; 4AFU C; 3RKW A; 1YIT A; 3S3N A; 2YSQ A; 3R6N A; 3M59 A; 3C95 A; 2YLB A; 3WXM B; 1YBY A; 3OYE A; 1K8A R; 1J3T A; 4MZP A; 3VYH B; 5A0D A; 4BDZ A; 2D8J A; 2VXF A; 2HDA A; 3DLM A; 3UA7 A; 1JRI A; 3FLG A; 3E19 A; 2JVV A; 3CCM T; 1AOJ A; 3J7A F; 3JCM h; 1UHC A; 2JTE A; 1PD0 A; 2NUP A; 2L2P A; 1OUL A; 3HL8 A; 1QLY A; 1I8F A; 3OYC A; 2HBP A; 3TCJ A; 2ESW A; 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2KY9 A; 1M4Z A; 3I56 Q; 3RKX A; 4M7A A; 1K4U S; 2L3S A; 2M9U A; 2LX9 A; 1EX4 A; 1KQS S; 1MMG A; 1WNL A; 3JCM Q; 1RAA B; 1AT1 B; 4WTO B; 2MI6 A; 3MCA B; 2M1H A; 3EG0 A; 1YJN T; 1RLP C; 2A3L A; 1Q81 R; 2PVO B; 2EIF A; 2QA4 T; 4J6Y A; 3RDV A; 4K11 A; 2K5L A; 1B34 B; 2E10 A; 2DRK A; 2DTO A; 2FRW A; 3QKJ A; 4LD6 A; 5GAO r; 2DEU A; 1EFN A; 4OGE A; 2JUF A; 3G71 T; 1U8R A; 2FPD A; 1YCY A; 1YNZ A; 2SEM A; 2D0Q B; 3OSV A; 3CC2 A; 4D8K A; 1Q82 U; 3P8B B; 1YN8 A; 5J39 A; 2JN0 A; 1G3Y A; 3JSC A; 3M9Q A; 2P0Q A; 2WSE E; 4CC2 A; 1Y71 A; 2MWO A; 2RMO A; 2RI5 A; 4IUP A; 4BI3 A; 1WXU A; 4A53 A; 3JAM E; 1PRL C; 4DEY A; 2JS0 A; 2O9S A; 3A8G B; 2L3Q A; 4GY5 A; 4J9D A; 1VQP Q; 3TSW A; 4FL6 A; 3C94 A; 2GQV A; 2RQV A; 3QII A; 3CME Q; 5D6W A; 3RKY A; 2RHI A; 1M1K U; 2FZK B; 2O88 A; 2YT6 A; 3RIR A; 3SDZ A; 4FT2 A; 4M7A C; 1B07 A; 3QYG B; 2HQX A; 5IXB A; 3EFS A; 2OX7 A; 4CC7 A; 1LNX A; 1W2B S; 3CCE T; 4NL3 A; 1GFD A; 2BUD A; 1U5S A; 3HP9 A; 3LWI A; 3CMA A; 4Z02 A; 5GAN 7; 1YIJ T; 1SKU B; 3VYG A; 2GTO A; 1Q7Y C; 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